KAJIAN VARIASI SUDUT NOZZLE GUIDE VANE TERHADAP KINERJA TURBIN CROSSFLOW (Studi Kasus di Unit Mikrohidro Desa Mojan, Kecamatan Patrang, Kabupaten Jember)

.id/

.id/

ac
nej.

ry.u

libra
/
/
:
p
t

.id/

ac
nej.

ry.u

libra
/
/
:
p
tt

.id/

ac
nej.

ry.u

libra
/
/
:

p
tt

h

ac
nej.

ry.uPage 1

libra
/
/
:
p
tt

h

h

RESPON EKSPLAN KALUS TANAMAN PADI (Oryza
Sativa L.) JAPONICA CV. ILMI PADA PERLAKUAN
TRANSFORMASI GEN MENGGUNAKAN Agrobacterium
Tumefaciens

SKRIPSI

Oleh
Fika Ayu Safitri
NIM 081510501027

.id/

ac
nej.

y.u

r

ibra
l
/
/
:
tp

/
/
c.id
c.id
a
a
.
.
j
j
STUDI AGROTEKNOLOGI
PROGRAM
.une FAKULTAS

.une
y
y
r
r
a
a
PERTANIAN
r
/libr
://lib
:/JEMBER
p
p
UNIVERSITAS
t
t
t
t
h

h
2013

/

c.id

lib
tp://

rary

j.a
.une

/

c.id

://lib

http

rary

j.a
.une

.id/

ac
nej.

y.u

r
ibra
l
/
/
:

tp

ht

/

c.id

://lib
http

rary

j.a
.une

/

c.id

://lib
http

rary

j.a
.une

.id/

.id/

ac
nej.

ry.u

libra
/
/

:
p
t

ry.u

libra
/
/
:
p
tt

y.u

y.u

/

rary

lib
tp://

nej

y.u
brar

li

/

c.id

j.a
.une

rary

://lib
http

/

c.id

j.a
.une

rary

://lib
http

RESPON EKSPLAN /KALUS TANAMAN PADI
/ (Oryza
/
d
d
i
i
.
.
c
c
c.id
a
a
a
Sativa L.) JAPONICA
CV.
ILMI
PADA
PERLAKUAN
.
.
.
j
j
j
e
e
e
y.un GEN MENGGUNAKAN
y.un
y.un
r
r
r
TRANSFORMASI
Agrobacterium
a
a
a
r
r
r
://lib
://lib
://lib
p
p
p
t
t
t
t
t
t
Tumefaciens
h
h
h

.id/

.id/

ac
nej.

ry.u

libra
/
/
:
p
t

/

rary

://lib
http

id/
.ac.

y.u

ht

c.id

j.a
.une

ac
nej.

r
ibra
l
/
/
:
tp

ht

c.id

.id/

ac
nej.

r
ibra
l
/
/
:
tp

ht
j.a
.une

ry.uPage 2

libra
/
/
:
p
tt

.id/

ac
nej.

r
ibra
l
/
/
:
tp

ac
nej.

h

.id/

y.u

tp://

ry.u

h

.id/

ac
nej.

.id/

ac
nej.

libra
/
/
:
p
tt

h

r
ibra
l
/
/
:
tp

.id/

ac
nej.

.id/

ac
nej.

ry.u

libra
/
/
:
p
tt

.id/

ac
nej.

ry.u

libra
/
/
:
p
tt

h

ac
nej.

ry.u

libra
/
/
:
p
tt

h

h

SKRIPSI

.id/

.id/

ac
nej.

y.u

r
ibra
l
/
/
:
tp

y.u

r
ibra
l
/
/
:
tp

/

c.id

j.a
.une

rary

y.u

rary

://lib
http
.id/

.u

ac
nej.

http

y.u

ry.u

libra
/
/
:
p
tt

h

ry.u

libra
/
/
:
p
tt

ry.u

h

/
/
c.id
c.id
a
a
.
.
j
j
PROGRAM
STUDI AGROTEKNOLOGI
.une
.une
y
y
r
r
a
a
FAKULTAS PERTANIAN
r
/libr
://lib
:/JEMBER
p
p
t
t
UNIVERSITAS
t
t
h
h

/

tp:/

ary
/libr

/

c.id

j.a
.une

:/
http

ary
/libr

ac
nej.

libra
/
/
:
p
tt

h

c.id

.id/

ac
nej.

2013

j.a
.une

ac
nej.

.id/

ry.u

h

r
ibra
l
/
/
:
tp

ry.u

libra
/
/
:
p
tt

ac
nej.

libra
/
/
:
p
tt

.id/

ac
nej.

.id/

ry.u

rary

://lib
http

Fika Ayu
h Safitri
NIM 081510501027

.id/

ac
nej.

j.a
.une

.id/

Oleh

.u

rary
b
i
l
/
/
:

.id/

j.a
.une

.id/

ac
nej.

y.u

r
ibra
l
/
/
:
tp

ht

/

c.id

i

j.a
.une

rary

://lib
http

/

c.id

c

rary

ac
nej.

ht

c

j.a
.une

.id/

libra
/
/
:
p
t

y.u

r
ibra
l
/
/
:
tp

ht

://lib
http

tp

ac
nej.

diajukan guna melengkapi tugas akhir dan memenuhi salah satu syarat untuk
menyelesaikan Program Studi Agroteknologi (S1)
dan mencapai
.id/ gelar Sarjana Pertanian .id/

ac
nej.

rary
b
i
l
/
/
:

.id/

ac
nej.

r
ibra
l
/
/
:
tp

ht

lib
tp://

.id/

ac
nej.

/

c.id

://lib
http

rary

j.a
.une

.id/

.id/

ac
nej.

ry.u

libra
/
/
:
p
t

ry.u

libra
/
/
:
p
tt

ry.u

y.u

y.u

/

ry

/

ry

a
/libr
/
:
p
t
t

.id/

ry.u

libra
/
/
:
p
t

r

://lib
http

.id/

.u

://

ry.u

ac
nej.

ry.u

libra
/
/
:
p
tt

tp://

h

: 081510501027

.id/
.id/
.id/
c
c
c
a
a
a
.
.
.
j
j
j
menyatakan dengan sesungguhnya
bahwa Karya Tulis
Ilmiah yang berjudul
.une
.une
.une
y
y
y
r
r
r
a
a
a
r
r
libr
“Respon Eksplan
://lib Kalus Tanaman Padi t(Oryza
://lib Sativa L) Japonica cv. Ilmi
://pada
p
p
p
t
t
t
t
t
h
h
h

nej

libra
/
/
:
p
t

.id/

.u

Nama : Fika Ayu Safitriht
NIM

id/
.ac.

rary

://lib
http

ac
nej.

ry
ry
Saya yang
librabertanda tangan dibawah inili:bra

/

c.id

j.a
.une

.id/

ac
nej.

http

/

c.id

j.a
.une

PERNYATAANary

h
ac
nej.

y.u

ht

c.id

j.a
.une

ac
nej.

r
ibra
l
/
/
:
tp

ht

c.id

.id/

ac
nej.

r
ibra
l
/
/
:
tp

ht

libra
tp://

.id/

ac
nej.

r
ibra
l
/
/
:
tp

j.a
.une

ry.uPage 3

h

.id/

y.u

ac
nej.

libra
/
/
:
p
tt

h

.id/

ac
nej.

.id/

ac
nej.

libra
/
/
:
p
tt

h

r
ibra
l
/
/
:
tp

.id/

ac
nej.

Perlakuan Transformasi Gen Menggunakan Agrobacterium Tumefaciens” adalah

– benar hasil karya sendiri,
dan belum
/
/ kecuali jika disebutkan sumbernya
/
/
.idbenar
c.id
c.id
c.id
a
a
a
.
.
.
j
j
j
pernah diajukan pada
bukan
.uneinstitusi mana pun, serta
.une karya jiplakan. Sayaary.une
y
y
r
r
a
a
r
ibr
/libr
://ljawab
://lib
:/sikap
bertanggung
atas keabsahan danttpkebenaran
isinya sesuai dengan
p
p
t
t
t
t
h
h
h

ac
nej.

y.u

r
ibra
l
/
/
:
tp

ilmiah yang harus dijunjung tinggi.

/

c.id

j.a
.une

rary

lib
tp://

/
d/ tanpa adanya
Demikian pernyataanayang
c.id telah saya buat dengan sebenarnya
ac.i
j.
.une

ry dari pihak manapun bserta
ry bersedia mendapat sanksi
ry
tekanan dan paksaan
ibra
i ra
ibra
l
l
l
/
/
/
/
/
/
:
:
:
ttp
akademik
ini tidak benar.
httpjika ternyata dikemudian harihpernyataan
http
.id/

.id/

ac
nej.

ry.u

libra
/
/
:
p
t

ry.u

libra
/
/
:
p
tt

une

tp

une

ry.
a
r
b
i
://l

y.u

y.u

r
ibra
l
/
/
:
tp

/

ary
/libr

ary
/libr

:/
http

.id/Ayu Safitri
cFika
a
.
j
ne

y.u

r
ibra
l
/
/
:
tp

.id/

ac
nej.

y.u

NIM 081510501027

r
ibra
l
/
/
:
tp

ht

/

c.id

j.a
.une

ry.u

h

ht

c.id

ac
nej.

libra
/
/
:
p
tt

h

ht
j.a
.une

ry.u

ac
nej.

.id/

d
ac.i
nej. Yang Menyatakan,

.id/

ac
nej.

ry.u

libra
/
/
:
p
tt

h

libra
/
/
:
p
tt

http

ac
nej.

Jember,/ 29 Mei 2013

.id
j.ac

.id/

tp:/

ry.u

libra
/
/
:
p
tt

/

.id
j.ac

.id/

ac
nej.

h

/

r
ibra
l
/
/
:
tp

.id/

ac
nej.

h

ry.
a
r
b
i
://l

/

c.id

j.a
.une

j.
.une

/

ii

c.id

://lib
http

rary

j.a
.une

/

c.id

://lib
http

rary

j.a
.une

.id/

.id/

ac
nej.

ry.u

libra
/
/
:
p
t

ry.u

libra
/
/
:
p
tt

ry.u

y.u

r
ibra
l
/
/
:
tp

y.u

ht
/

rary

lib
tp://

ry.u

libra
/
/
:
p
tt

.id/

/

c.id

j.a
.une

rary

://lib
http
.id/

ry.u

libra
/
/
:
p
tt

h

h

ry.u

h

ry.u

ry.u

libra
/
/
:
p
tt

h

/

y.u

r
ibra
l
/
/
:
tp

ary
/libr

ac
nej.

y.u

r
ibra
l
/
/
:
tp

ht

/

c.id

j.a
.une

.id/

ac
nej.

ht

c.id

ac
nej.

.id/

y.u

ht

.id/

.

ac
nej.

r
ibra
l
/
/
:
tp

:/
http

ry.u

ac
nej.

.id/

y.u

ac
nej.

libra
/
/
:
p
tt

h

.id/

.id/

ac
nej.

libra
/
/
:
p
tt

h
ac
nej.

rary

: Ir. Soetilah Hardjosoedarmo,
MS
id/

ry.u

/

c.id

iii

j.a
.une

rary

://lib
http

/

c.id

j.a
.une

://lib
http

: Dr. Ir. Miswar, M.Si

.

ac
nej.

libra
/
/
:
p
tt

/

c.id

libra
/
/
:
p
tt

Pembimbing Anggota
id/

ry.u

ht

.id/

Pembimbing :

Pembimbing Utama

.id/

ac
nej.

y.u

rary

ac
nej.

ac
nej.

r
ibra
l
/
/
:
tp

j.a
.une

://lib
http
.id/

ry.u

.id/

.u

Oleh library
://

http

/

ac
nej.

ry.u

libra
/
/
:
p
tt

ac
nej.

Fika Ayu Safitri
NIM. 081510501027

c.id

.id/

ac
nej.

h

.id/

ac
nej.

y.u

rary

ac
nej.

h

r
ibra
l
/
/
:
tp

j.a
.une

ary
/libr

.id/

ac
nej.

.i

ry.u

libra
/
/
:
p
tt

ht

j.a
.une

rary

://lib
http
.id/

.i

y.u

r
ibra
l
/
/
:
tp

/

c.id

j.a
.une

ac
nej.

ac
nej.

.id/

libra
/
/
:
p
t

/

RESPON EKSPLAN
KALUS TANAMAN
PADI (Oryza
ry.u
ry.u
ry.u
a
a
a
r
r
r
b
b
b
i
i
i
Sativa
://l L) JAPONICA CV. ILMI
://l PADA PERLAKUAN
://l
http
http
http
TRANSFORMASI GEN MENGGUNAKAN Agrobacterium
Tumefaciens
d/
d/
d/

ac
nej.

libra
/
/
:
p
t

ht

rary

://lib
http

h

lib
tp://

y.u

c.id

.id/

ry.u

r
ibra
l
/
/
:
tp

ac
nej.

r
ibra
l
/
/
:
tp

j.a
.une

ac
nej.

.i

ac
nej.

libra
/
/
:
p
t

/

rary

ry.u

libra
/
/
:
p
t

y.u

c.id

.id/

.id/

ac
nej.

r
ibra
l
/
/
:
tp

j.a
.une

://lib
http

ac
nej.

h

KARYA ILMIAH
ht TERTULIS
(SKRIPSI)

c.id

j.a
.une

ry.uPage 4

.id/

ac
nej.

r
ibra
l
/
/
:
tp

ac
nej.

libra
/
/
:
p
tt

h
.id/

ac
nej.

.id/

ac
nej.

libra
/
/
:
p
tt

h
.id/

tp:/

.id/

ac
nej.

/

c.id

://lib
http

rary

j.a
.une

.id/

.id/

ac
nej.

ry.u

libra
/
/
:
p
t

.id/

ac
nej.

ry.u

libra
/
/
:
p
tt

ry.u

libra
/
/
:
p
tt

h

y.u

r
ibra
l
/
/
:
tp

/

rary

.id/

ac
nej.

y.u

r
ibra
l
/
/
:
tp

y.u

ht

/

c.id

j.a
.une

ac
nej.

r
ibra
l
/
/
:
tp

PENGESAHAN
ht

c.id

lib
tp://

.id/

ac
nej.

ht
j.a
.une

ry.uPage 5

h

.id/

y.u

r
ibra
l
/
/
:
tp

ac
nej.

libra
/
/
:
p
tt

h

.id/

ac
nej.

.id/

ac
nej.

/

c.id

j.a
.une

ary

ary

ary

r
r
r
Skripsi berjudul
://lib “Respon Eksplan Kalus Tanaman
://lib Padi (Oryza Sativa L) Japonica
://lib
http

http

/

c.id

j.a
.une

http

cv. Ilmi pada Perlakuan Transformasi Gen Menggunakan Agrobacterium
telah diuji dan disahkan
oleh Fakultas Pertanian .pada
/
/
/ :
/
.idTumefaciens”
c.id
c id
c.id
a
a
a
.
.
.
j
j
j
e
e
e
y.un
y.un
y.un
r
r
r
a
a
a
r
r
r
://lib: Jumat, 17 Mei 2013 ttp://lib
://lib
Hari, tanggal
p
p
t
t
t
t
h
h
h

ac
nej.

ry.u

libra
/
/
:
p
t

Tempat

: Ruang Sidang Fakultas Pertanian UNEJ

.id/

.id/

ac
nej.

ry.u

libra
/
/
:
p
t

ac
nej.

ry.u

libra
/
/
:
p
tt

h
une

ry.
libra

tp://

une

/

rary

lib
tp://

.id/

ac
nej.

ry.u

libra
/
/
:
p
t

.u

u

tp

.id/

ac
nej.

y.u

r
ibra
l
/
/
:
tp

ary
/libr

.id/

/

ry.u

ry.u

h

/

c.id

:/
http

ary
/libr

ac
nej.

libra
/
/
:
p
tt

h

j.a
.une

.id/

ac
nej.

/
d/ Ir. Jani Januar, M. T.
c.iDr.
c.id
a
a
.
.
j
j
.une NIP. 195901021988031002
.une
y
y
r
r
a
a
r
r
://lib
://lib
p
p
t
t
t
t
h
h

c.id

j.a
.une

.id/

ac
nej.

ry.uIr. Irwan Sadiman, MP. brary.u
a
r
b
i
://l
://li
NIP. 195310071983031001
p
p
t
t
t
t
h
h

libra
/
/
:
p
tt

http

rary

://lib
http

.id/

Dekan,

u

ry.
a
r
b
i
://l

j.a
.une

ac
nej.

.id/ Mengesahkan

ac
nej.

/

c.id

Anggota 3,

.id/

.id/

ry.
a
r
b
i
://l

rary

Ir. Soetilah lHardjosoedarmo,
MS
rary
b
i
/
/
:
p
NIP.
htt 194908141976032001

/

c.id

j.a
.une

://lib
http

ac
nej.

ac
nej.

y.u

ht

c

ry
ibra 2,
l
/
Anggota
/
:
http

ac
nej.

r
ibra
l
/
/
:
tp

ht

j.a
.une

.id/

y.u

Dr. Ir. Miswar, M.Si
/
NIP.
.id196410191990021002

c.id

j.a
.une

.id/

ac
nej.

r
ibra
l
/
/
:
tp

://

http

ry.u

h

.id
j.ac

ry.
libra

ac
nej.

libra
/
/
:
p
tt

h

/ Anggota 1,

.id
j.ac

.id/

Tim Penguji: rary.u

/lib
ttp:/

/

tp:/

.id/

ac
nej.

.id/

ac
nej.

y.u

r
ibra
l
/
/
:
tp

ht

/

iv

c.id

://lib
http

rary

j.a
.une

/

c.id

://lib
http

rary

j.a
.une

Page 6

Fika Ayu Safitri
Program Studi Agroteknologi. Fakultas Pertanian, Universitas Jember

ABSTRACT
The gene of the AtBI-1, Arabidopsis thaliana Bax inhibitor, was introduced into
Japonica cultivars of rice (‘Ilmi’) by Agrobacterium-mediated transformation,
and a large number of transgenic plants were produced. The neomycin
phosphotransferase II (NPTII) gene was used as a selectable marker. The activity
of neomycin phosphotransferase could be successfully detected in transgenic rice
callus. The introduction of the AtBI-1 gene was also proven by PCR using AtBIspecific oligonucleotide primers in regenerated plants. Stable integration and
expression of the AtBI-1 gene in plants were confirmed by GFP analysis.

Keywords: AtBI-1-GFP, Japonica, Rice.

.id/

.id/

ac
nej.

ry.u

libra
/
/
:
p
t

ry.u

libra
/
/
:
p
tt

ry.u

ry.u

y.u

r
ibra
l
/
/
:
tp

/

y.u

r
ibra
l
/
/
:
tp

:/
http

ary
/libr

ac
nej.

y.u

r
ibra
l
/
/
:
tp

ht

/

c.id

j.a
.une

.id/

ac
nej.

ht

c.id

ary
/libr

.id/

ac
nej.

ht
j.a
.une

ry.u

h

.id/

y.u

r
ibra
l
/
/
:
tp

ac
nej.

libra
/
/
:
p
tt

h

.id/

.id/

ac
nej.

libra
/
/
:
p
tt

h
ac
nej.

ry.u

libra
/
/
:
p
tt

.id/

ac
nej.

libra
/
/
:
p
tt

ac
nej.

h

.id/

ry.u

tp:/

ry.u

h

.id/

ac
nej.

.id/

ac
nej.

libra
/
/
:
p
tt

h

libra
/
/
:
p
t

.id/

ac
nej.

/

v

c.id

://lib
http

rary

j.a
.une

/

c.id

://lib
http

rary

j.a
.une

Page 7

RINGKASAN

Respon Eksplan Kalus Tanaman Padi (Oryza Sativa L) Japonica cv. Ilmi pada
Perlakuan Transformasi Gen Menggunakan Agrobacterium Tumefaciens;
Fika Ayu Safitri; 081510501027; 2013: 39 halaman; Program Studi
Agroteknologi, Fakultas Pertanian, Universitas Jember.

Gen Arabidopsis Bax Inhibitor (AtBI-1) merupakan gen Bax Inhibitor (BI)
yang diisolasi dari tanaman Arabidopsis Thaliana, dengan fungsi dapat
menginduksi protein BAX dalam Program Kematian Sel eukariotik. Mekanisme
gen AtBI-1 dalam mengontrol Program Kematian sel (PCD) yaitu diawali dengan
ekspresi gen UPR (Unfolded Protein) yang diinduksi karena adanya stress pada
Retikulum Endoplasma akibat adanya stress yang menyerang sel. Karena hal
tersebut,AtBI-1 aktif untuk mengontrol sinyal kematian sel. Jika tanaman
mendapatkan stress secara terus menerus, maka UPR tidak akan cukup untuk
mengembalikan keadaan retikulum Endoplasma yang mengakibatkan kematian
sel. Dengan peningkatan jumlah AtB-1 pada sel tanaman, maka diharapkan
terdapat peningkatan kontrol sinyal kematian sel.
Dalam penelitian ini, Gen AtBI-1 dikonstruk pada plasmid pBIN19 untuk
digunakan pada proses transformasi kedalam genom tanaman padi menggunakan
media Agrobacterium tumefaciens. Tujuan dari penelitian ini adalah untuk
mengetahui respon eksplan kalus tanaman Padi (Oryza Sativa L.) jenis Japonica
cv. Ilmi pada perlakuan transformasi gen AtBI-1-GFP menggunakan vektor
Agrobacterium Tumefaciens. Hasil dari penelitian ini diharapkan dapat
memberikan

informasi

tentang

metode

transformasi

gen

menggunakan

Agrobacterium Tumefaciens pada padi (Oryza Sativa L) jenis Japonica cv. Ilmi
kepada pembaca dan terutama kepada peneliti yang tertarik untuk meneliti jenis
padi Japonica cv. Ilmi.
Penelitian ini dilakukan pada bulan oktober 2012 hingga februari 2013 di
Laboratorium Pembiakan Moleculer, Divisi Biosciences Tanaman, Fakultas
Pertanian & Life Science, Universitas Kyungpook, Korea Selatan. Bahan – bahan

vi

.id/

.id/

ac
nej.

ry.u

libra
/
/
:
p
t

ry.u

libra
/
/
:
p
tt

ry.u

ry.uPage 8

h

.id/

y.u

.id/

ac
nej.

y.u

r
ibra
l
/
/
:
tp

ac
nej.

libra
/
/
:
p
tt

h

.id/

ac
nej.

.id/

ac
nej.

libra
/
/
:
p
tt

h

r
ibra
l
/
/
:
tp

.id/

ac
nej.

.id/

ac
nej.

y.u

r
ibra
l
/
/
:
tp

ac
nej.

y.u

r
ibra
l
/
/
:
tp

yang digunakan
antara lain : Benih Padi
ht
ht (Oryza Sativa L.) Japonicaht cv. Ilmi,

Agrobacterium Tumefaciens strain LBA 4404, plasmid pBin-AtBI-1-GFP, Media

d/
d/
d/
id/
LB Broth,
ac.i MS-Basaal (Murashige eSkoog),
ac.i Hormon (2,4 D, Kinetin,
ac.NAA),
ac.i
.
.
.
.
j
j
j
j
e
e
e
y.un
y.un Streptomycin dan Rifapmycin),
y.un
y.un
r
r
r
r
a
a
a
a
r
r
r
r
Antibiotik
(Kanamycin,
PCR
Kit
(Miniprep
lib
lib
lib
lib
tp://
tp://
tp://
tp://
t
t
t
h
h
h
Qiagen). Tahapan penelitian yang dilakukan, antara lain : 1) Konfirmasi gen AtBI1-GFP pada Agrobacterium /Tumefaciens::pBin-AtBI-1-GFP;/ 2) Persiapan
c.id
c.id
a
a
.
.
j
j
Agrobacterium Tumefaciens;
3) Persiapan Eksplan;un4)e Isolasi DNA genomik
une

id/
.ac.

nej

ry.u

libra
/
/
:
p
t

.id/

ac
nej.

ry.
ry.
ry.u
a
a
a
r
r
r
b
b
b
i
i
i
l
tanaman hasil
GFP pada organ daun
://l transformasi dan 5) Persiapan
://visualisasi
://lpadi
http
http
http
transgenik. Hasil transformasi gen AtBI-1-GFP pada kalus padi dapat diketahui

/
/
/ media yang
/
jumlah kalus yang memiliki
kemampuan bertahan .ipada
.iddengan
c.id
c d
c.id
a
a
a
.
.
.
j
j
j
e
mengandung antibiotik
50 ppm denganryhasil
.unkanamycin
.uneyang didapatkan sebesarary.une
y
r
a
a
r
r
libr serta diperkuat dengan panalisis
://lib dilanjutkan dengan analisis
://PCR
://lib
p
p
57%, kemudian
t
t
t
t
t
t
h
h
h

ac
nej.

ry.u

libra
/
/
:
p
t

GFP pada tanaman transgenik.

.id/

.id/

ac
nej.

y.u

r
ibra
l
/
/
:
tp

y.u

r
ibra
l
/
/
:
tp

/

rary

ry.u

rary

://lib
http

ry.u

libra
/
/
:
p
tt

y.u

y.u

/

ary
/libr

ary
/libr

:/
http

y.u

ht

/

c.id

j.a
.une

ac
nej.

r
ibra
l
/
/
:
tp

ht

c.id

.id/

ac
nej.

r
ibra
l
/
/
:
tp

ht
j.a
.une

ry.u

libra
/
/
:
p
tt

.id/

ac
nej.

r
ibra
l
/
/
:
tp

ac
nej.

h

.id/

y.u

r
ibra
l
/
/
:
tp

.id/

ac
nej.

h

.id/

ac
nej.

ry.u

libra
/
/
:
p
tt

.id/

ry.u

h

ac
nej.

h

.id/

ac
nej.

libra
/
/
:
p
tt

.id/

ry.u

h

.id/

ry.u

rary

://lib
http

ac
nej.

libra
/
/
:
p
tt

/

c.id

vii

j.a
.une

rary

://lib
http

/

c.id

j.a
.une

.id/

ry.u

h

libra
/
/
:
p
t

/

c.id

ac
nej.

libra
/
/
:
p
tt

ac
nej.

y.u

r
ibra
l
/
/
:
tp

j.a
.une

.id/

ac
nej.

libra
/
/
:
p
t

/

rary

://lib
http

ac
nej.

ht

c.id

j.a
.une

.id/

tp:/

y.u

ht

c.id

j.a
.une

.id/

ac
nej.

r
ibra
l
/
/
:
tp

ht

lib
tp://

.id/

ac
nej.

/

c.id

://lib
http

rary

j.a
.une

.id/

.id/

ac
nej.

ry.u

libra
/
/
:
p
t

.id/

ac
nej.

ry.u

libra
/
/
:
p
tt

ry.u

libra
/
/
:
p
tt

h

ry.uPage 9

h

.id/

y.u

r
ibra
l
/
/
:
tp

.id/

ac
nej.

y.u

r
ibra
l
/
/
:
tp

.id/

ac
nej.

y.u

r
ibra
l
/
/
:
tp

ht

ac
nej.

libra
/
/
:
p
tt

h

.id/

ac
nej.

.id/

ac
nej.

ac
nej.

y.u

r
ibra
l
/
/
:
tp

SUMMARY
ht

ht

/
d/
d/
d/
c.idResponse of Explants ofj.Calli
cv. “Ilmi” to
ac.i Rice (Oryza Sativa L.)eJaponica
ac.i
ac.i
.
.
j
j
e
e
Gene Transformation
Fika Ayuary.un
y.unUsing Agrobacterium tumefaciens-Mediated;
y.un
r
r
a
a
r
r
/lib
/lib
/libr
Safitri; 081510501027;
2013: 39 pages; tAgrotechnology
Study Program,tpFaculty
/
/
/
:
:
:
p
p
t
ht
ht
ht
of Agriculture,
Jember University.

j.a
.une

rary

lib
tp://

.id/

/
/
/
c.id
c.id
c.id
a
a
a
.
.
.
j
j
j
e Bax Inhibitor (AtBI-1) is .the
egene Bax Inhibitor (BI) .une
Arabidopsis gene
y.un
y un
r
r
a
a
r
r
rary
b
b
b
i
i
i
l
l
l
was isolated
from
Arabidopsis
Thaliana,
the
function
of
this
gene
can
induce
/
/
/
/
/
/
:
:
:
http
http
http

ac
nej.

ry.u

libra
/
/
:
p
t

protein BAX in Program Cell Death. Mechanism of the AtBI-1 gene in controling

/
/ inducing UPR
/
of cell Death (PCD).idis/ began by expression gene .ifor
.idProgram
c
c d
c.id
a
a
a
.
.
.
j
j
j
(Unfolded Protein)rybecause
.une of stress in the endoplasmic
.une reticulum and then theary.une
y
r
a
a
r
librplants get stress continuously,
/libr
://the
://libthe
p
p
AtBI-1hactive
If
t
t
ttp:/ to control cell death signal.
t
t
h
h

ac
nej.

ry.u

libra
/
/
:
p
t

UPR will not be enough to restore the State of the endoplasmic reticulum which

/
/
d/
id/ can increase
of AtB-1 on cells .of
c.idlead to cell death. Increasing
c.inumber
c.plants
c.id
a
a
a
a
.
.
.
j
j
j
j
.une
.une in Reticulum Endoplasmic
.u. ne
.une
y
y
y
y
r
r
r
r
control
of
cell
death
signal
a
a
a
a
r
r
r
libr
://lib
://lib
://lib
p
p
p
tp://
t
t
t
t
t
t
hIn this research, AtBI-1 geneh was constructed on plasmid hpbin19 to
prepared for processing transformation into the genome rice plants using

d/
ac.i

ry

libra
tp://

.id/

.id/

ac
ac
Agrobacterium Tumefaciens.
nej. The purpose of this research
nejis. to know the response

j.
.une

ry.u

ry.u

ry

ra
ra
explants rice//lcallus
ibra (Oryza Sativa L.) Japonica
//libcv. Ilmi on gene transformation
//libof
:
http

:
http

:
http

/

c.id

j.a
.une

AtBI-1-GFP treatment using Agrobacterium Tumefaciens. The results of this study
of transformationd/methods using
/ expected to provide .information
/
dare
id/
c
c.i
c.id
a
a
a
.
.
.
j
j
j
e
e
e
Agrobacterium Tumefaciens
on genome rice (Oryza
y.un
y.un Sativa L.) varieties of
y.un
r
r
r
a
a
a
r
r
r
ib to readers and especially://to
libresearchers who are interested
Japonicattpcv.
://lIlmi
://libin
p
p
t
t
t
t
h
h
h

c.i
ej.a

.un

rary
b
i
l
/
/
:

tp

researching on rice Japonica cv. Ilmi.

.id/

ac
nej.

ry.u

libra
/
/
:
p
t

/
/
This research was done
c.idin October 2012 to March 2013
c.idat the Laboratory
a
nej.

a
nej.

.id/

ac
nej.

u
of Molecular Breeding,
of Agriculture & Lifeary.u
y.u
ary. Division of Biosciences,arFaculty
r

r

//lib

r

//lib

//lib

p:
p: us:
ttp: Material on this research,
Science,
University, SouthhKorea.
httKyungpook
httsuch

seed rice (Oryza Sativa L.) Japonica cv. Ilmi, Agrobacterium Tumefaciens strains

/
/
/
.id/
c.idLBA4404, plasmid pBin-AtBI-1-GFP,
c.id
c(Murashige
c.id
media MS-basal
Skoog),
a
a
a
a
.
.
.
.
j
j
j
j
.une
.une
.une
.une
y
y
y
y
r
r
r
r
a
a
a
a
hormone (2,4liD;
(Streptomycin, Kanamycin,
r Kinetin; NAA), LB Broth, Antibiotic
r
r
libr
:// b
://lib
://lib
p
p
p
tp://
t
t
t
t
t
t
h
h Qiagen).
h
and Rifapmycin
),and PCR kit (Miniprep
/

c.id

tp:/

ary
/libr

j.a
.une

/

c.id

j.a
.une

:/
http

ary
/libr

/

viii

c.id

://lib
http

rary

j.a
.une

/

c.id

://lib
http

rary

j.a
.une

.id/

.id/

ac
nej.

ry.u

libra
/
/
:
p
t

ry.u

libra
/
/
:
p
tt

ry.u

.u 10
ryPage

h

.id/

y.u

.id/

ac
nej.

y.u

r
ibra
l
/
/
:
tp

ac
nej.

libra
/
/
:
p
tt

h

.id/

ac
nej.

.id/

ac
nej.

libra
/
/
:
p
tt

h

r
ibra
l
/
/
:
tp

.id/

ac
nej.

.id/

ac
nej.

y.u

r
ibra
l
/
/
:
tp

ac
nej.

y.u

r
ibra
l
/
/
:
tp

t stages of this research wereh:t 1) Confirmation of the AtBI-1hgene-GFP
t
hThe
in

Agrobacterium

Tumefaciens::pBin-AtBI-1-GFP;

2)

Preparation

of

d/
d/
d/
d/
ac.i Agrobacterium Tumefaciens;
ac.3)i Explant Preparation; 4)ejIsolation
ac.i of DNA plant
ac.i
.
.
.
.
j
j
j
e
e
e
y.un
y.un of GFP visualization transgenic
y.un rice leaves on the organ.
y.un
r
r
r
r
a
a
a
a
r
r
r
r
genomic
5)
Preparation
lib
lib
lib
lib
tp://
tp://
tp://
tp://
t
t
t
h
h
h
The result of transformation can be known by The number of survival explant on
media containing antibiotic kanamycin
50 ppm was 57%, and then
/
/ we used PCR

id/
.ac.

c.id
c.id
a
a
.
.
j
j
ein trasgenic plants.
e
analyze and GFP analyze
y.un
y.un
r
r
a
a
r
r
://lib
://lib
p
p
t
t
t
t
h
h

nej

ry.u

libra
/
/
:
p
t

.id/

.id/

ac
nej.

ry.u

libra
/
/
:
p
t

ry.u

y.u

/

rary

lib
tp://

ry.u

rary

://lib
http

ry.u

libra
/
/
:
p
tt

y.u

y.u

/

ary
/libr

ary
/libr

:/
http

y.u

ht

/

c.id

j.a
.une

ac
nej.

r
ibra
l
/
/
:
tp

ht

c.id

.id/

ac
nej.

r
ibra
l
/
/
:
tp

ht
j.a
.une

ry.u

libra
/
/
:
p
tt

.id/

ac
nej.

r
ibra
l
/
/
:
tp

ac
nej.

h

.id/

y.u

r
ibra
l
/
/
:
tp

.id/

ac
nej.

h

.id/

ac
nej.

ry.u

libra
/
/
:
p
tt

.id/

ry.u

h

ac
nej.

h

.id/

ac
nej.

libra
/
/
:
p
tt

.id/

ry.u

h

.id/

ry.u

rary

://lib
http

ac
nej.

libra
/
/
:
p
tt

/

c.id

ix

j.a
.une

rary

://lib
http

/

c.id

j.a
.une

.id/

ry.u

h

libra
/
/
:
p
t

/

c.id

ac
nej.

libra
/
/
:
p
tt

ac
nej.

y.u

r
ibra
l
/
/
:
tp

j.a
.une

.id/

ac
nej.

libra
/
/
:
p
t

/

rary

://lib
http

ac
nej.

ht

c.id

j.a
.une

.id/

tp:/

y.u

ht

c.id

.id/

ac
nej.

r
ibra
l
/
/
:
tp

ht
j.a
.une

ry.u

libra
/
/
:
p
tt

.id/

ac
nej.

r
ibra
l
/
/
:
tp

ac
nej.

h

.id/

y.u

r
ibra
l
/
/
:
tp

.id/

ry.u

h

.id/

h

ac
nej.

libra
/
/
:
p
tt

h
ac
nej.

ry.u

libra
/
/
:
p
tt

.id/

ac
nej.

libra
/
/
:
p
tt

.id/

ac
nej.

/

c.id

://lib
http

rary

j.a
.une

.id/

.id/

ac
nej.

ry.u

libra
/
/
:
p
t

ry.u

libra
/
/
:
p
tt

ry.u

y.u

y.u

r
ibra
l
/
/
:
tp

ht

.id/

/

.id/

ac
nej.

y.u

r
ibra
l
/
/
:
tp

ac
nej.

y.u

r
ibra
l
/
/
:
tp

KATA PENGANTAR
ht

ht

d/

c.id

d/

d/

Puji Syukur kami panjatkan
ac.i kehadirat Allah SWT,ej.atas
ac.i limpahan rahmat,
ac.i
.
.
j
j
e
e
.un
y.un sehingga penulis dapat
ymenyelesaikan
y.un
r
r
r
a
a
a
r
r
r
nikmat dan /hidayah-Nya
Karya
Ilmiah
lib
/lib
/lib

j.a
.une

rary

lib
tp://

.u 11
ryPage

h

.id/

ac
nej.

ac
nej.

libra
/
/
:
p
tt

h

.id/

ac
nej.

.id/

ac
nej.

libra
/
/
:
p
tt

h

r
ibra
l
/
/
:
tp

.id/

ac
nej.

:/

:/

:/

ttp
http Eksplan Kalus Tanaman Padi
http(Oryza
Tertulish (Skripsi) dengan Judul “Respon

Sativa L) Japonica cv. Ilmi pada
/ Perlakuan Transformasi Gen/ Menggunakan

id/
.ac.

/
c.id
c.id
c.id
a
a
a
.
.
.
j
j
j
e
e untuk menyelesaikan .une
Agrobacterium Tumefaciens”
sebagai salah satu syarat
y.un
y.un
r
r
a
a
r
r
rary
b
b
b
i
i
i
l
l
l
pendidikan
Program
Strata
Satu
(S1)
pada
Program
Studi
Agroteknologi,
Fakultas
/
/
/
/
/
/
:
:
:
http
http
http

nej

ry.u

libra
/
/
:
p
t

Pertanian, Universitas Jember. Dalam proses penulisan skripsi ini penulis

/
/
/ pihak. Pada
/
tidak terlepas dari.ibantuan
dan kerjasama dari berbagai
.idmenyedari
c d
c.id
c.id
a
a
a
.
.
.
j
j
j
e sebesar – besarnya .une
kesempatan ini penulis
.unemenyampaikan terima akasih
.unyang
y
y
r
r
a
r
r
rary
b
b
b
i
i
i
l
l
l
/
/
/
/
/
/
:
:
:
kepada:
http
http
http

ac
nej.

ry.u

libra
/
/
:
p
t

1. Bapak S. Ito Wijiantoro, Mama Sulistyowati, Novwida, dan Yogi yang selalu

/
/
/
.id/ memberikan doa serta dukungan,
c.id baik moriil maupun materiil.
c.id
c.id
a
a
a
.
.
.
j
j
j
ne
.uM.Si
.une Utama, Ir. Soetilahary.une
y
y
r
r
2. Dr. Ir. Miswar,
selaku
Dosen
Pembimbing
a
a
r
r
r
://lib
://lib
://lib
p
p
p
t
t
t
t
t
t
h
h Pembimbing Anggota danh Ir. Irwan
Hardjosoedarmo,
MS selaku Dosen

ac
nej.

y.u

r
ibra
l
/
/
:
tp

d/
ac.i

j.
.une

ry

libra
tp://

Sadiman, MP selaku Dosen Pembimbing Anggota yang telah memberikan

.id/

.id/

c
ac
bimbingan selama penulis
ej.apenyusunan skripsi.
nej. melaksanakan penelitian ndan
ry.u

ry.u

/

c.id

j.a
.une

ry

a MP, Mas Ubed dan lProf.
a
3. Dr. Ir. /Slameto,
libra
/libr
/ ibr Kyung-Min Kim yang
/telah
/
/
:
:
:
p
p
p
t
t
t
ht
ht
ht
membantu proses penelitian yang dilaksanakan oleh penulis.

Universitas
/
d4./ Dr. Ir. Jani Januar, M.c.T.
id/ selaku Dekan Fakultas Pertanian,
id/
.
c
c.id
a
a
a
.
.
.
j
j
j
e
e
e
Jember.
y.un
y.un
y.un
r
r
r
a
a
a
r
r
r
/lib
//lib selaku Ketua Program
5. Ir. tHari
://libPurnomo, M.Si., Ph.D.,ttp:DIC
:/Studi
p
p
t
t
t
h
h
h

c.i
ej.a

.un

rary
b
i
l
/
/
:

tp

Agroteknologi, Fakultas Pertanian, Universitas Jember.

/
/
Pertanian,
.id6./ Ir. Sigit Soeparjono, M.S.,
.id/
c.idPh.D selaku Ketua Jurusan
cBudidaya
c.id
a
a
a
.
.
.
j
j
j
e
.unUniversitas
.une
.une
Fakultas Pertanian,
Jember.
y
y
y
r
r
r
a
a
a
r
ibr
/libr
://ldan
:/Universitas
://lib
p
p
p
t
t
t
t
t
t
7. Pengurus
Staf
di
Fakultas
Pertanian,
Jember.
h
h
h

ac
nej.

ry.u

libra
/
/
:
p
t

8. Pejuang Tingkat Akhir 2008 (Clue, Siska, Bul2, Ayu, Derry, Herlia, Apis,

/
id/ belum berkahir kawan!!
id/
.id/ Asfia, Aida) Perjuangan
c.kita
c.Irwanto,
c.id
Liris dan
a
a
a
.
.
.
j
j
j
.une
.une
.une
y
y
y
r
r
r
a
a
a
SeongKyulibOppa,
terima kasih telah mendengarkan
cerita selama penulisanliini,
r
r
r
://
://lib
:// b
p
p
p
t
t
t
t
t
t
h
h
h

ac
nej.

y.u

r
ibra
l
/
/
:
tp

/

c.id

tp:/

ary
/libr

j.a
.une

/

c.id

j.a
.une

:/
http

ary
/libr

/

x

c.id

://lib
http

rary

j.a
.une

/

c.id

://lib
http

rary

j.a
.une

.id/

.id/

ac
nej.

ry.u

libra
/
/
:
p
t

ry.u

libra
/
/
:
p
tt

ry.u

.u 12
ryPage

h

.id/

y.u

.id/

ac
nej.

y.u

r
ibra
l
/
/
:
tp

ac
nej.

libra
/
/
:
p
tt

h

.id/

ac
nej.

.id/

ac
nej.

libra
/
/
:
p
tt

h

r
ibra
l
/
/
:
tp

.id/

ac
nej.

.id/

ac
nej.

y.u

r
ibra
l
/
/
:
tp

ac
nej.

y.u

r
ibra
l
/
/
:
tp

t yang tidak dapat disebutkan
serta
ht teman- teman agroteknologi h2008
ht satu per
satu, terima kasih atas kebersamaannya.

/
d/
d/
.id/
c.id
Tanaman (Haikal,
Jazil, Via),
ac.i 9. Keluarga Besar Kultur
acJaringan
aNoorita,
ac.i
.
.
.
.
j
j
j
j
e
e
e
e
.un
.un
y.un
yPembiakan
yEonni,
y.un
r
r
r
r
a
a
a
a
r
r
r
r
Keluarga
Lab
Molekuler
(Seulgi
Yejin
Eonni,
Jinheui
lib
lib
lib
lib
tp://
tp://
tp://
tp://
t
t
t
h
h
h
eonni, GyuHo Oppa, GiHo Oppa, HoSeong Oppa, JeongHoon, Ara) serta
id/
.ac.

nej

ry.u

libra
/
/
:
p
t

teman - teman yang tidak /dapat disebutkan satu per satu,
/ terima kasih
d
d
i
i
.
.
ac
j.ac
dukungan dan semangatnya
yang diberikan uselama
nej. proses penelitian
une

.

ry.

rary
b
i
l
berlangsung.
/
/
:
http

libra
/
/
:
p
tt

.id/

ac
nej.

ry.u

libra
/
/
:
p
tt

h

h

10. Semua pihak yang telah membantu penyelesaian penelitian dan penulisan

/
/
/
satu per satu.
.id/ skripsi yang tidak dapat.adisebutkan
c.id
c.id
c.id
a
a
.
.
j
j
j
e
e
Penulis memohon
ini masih terdapat ry.un
.unemaaf apabila dalam penulisan
.unskripsi
y
y
r
r
a
a
a
r
ibr
/libr
://lib
://lpositif
:/untuk
p
p
p
beberapa
kesalahan.
Saran
dan
Kritik
yang
sangat
kami
harapkan
t
t
t
t
t
t
h
h
h

ac
nej.

ry.u

libra
/
/
:
p
t

perbaikan skripsi ini. Akhirnya penulis berharap semoga skripsi ini bermanfaat

/
/
c.idbagi pembaca, Amin.
c.id
a
a
.
.
j
j
.une
.une
y
y
r
r
a
a
r
libr
://lib
p
tp://
t
t
h
Jember, Mei 2013

d/
ac.i

j.
.une

rary

lib
tp://

.id/

ry.u

ry.u

y.u

ary
/libr

/

h

ary
/libr

.id/

ac
nej.

y.u

r
ibra
l
/
/
:
tp

ac
nej.

y.u

r
ibra
l
/
/
:
tp

ht

/

c.id

j.a
.une

:/
http

ry.u

libra
/
/
:
p
tt

ht

c.id

ac
nej.

.id/

ac
nej.

r
ibra
l
/
/
:
tp

.id/

ac
nej.

libra
/
/
:
p
tt

ht
j.a
.une

h

.id/

y.u

ry.u

libra
/
/
:
p
tt

h

.id/

ac
nej.

ac
nej.

.id/

ac
nej.

libra
/
/
:
p
tt

.id/

ry.u

h

r
ibra
l
/
/
:
tp

.id/

.id/

ry.u

rary

ac
nej.

libra
/
/
:
p
tt

/

c.id

xi

j.a
.une

rary

://lib
http

/

c.id

j.a
.une

://lib
http

h

.id/

tp:/

rary

h

libra
/
/
:
p
t

j.a
.une

://lib
http

ry.u

ac
nej.

/

c.id

ac
nej.

libra
/
/
:
p
tt

y.u

ht Penulis

.id/

ry.u

ac
nej.

r
ibra
l
/
/
:
tp

ht

/

rary

.id/

y.u

r
ibra
l
/
/
:
tp

c.id

j.a
.une

://lib
http

ac
nej.

libra
/
/
:
p
t

.id/

ac
nej.

/

c.id

://lib
http

rary

j.a
.une

.id/

.id/

ac
nej.

ry.u

libra
/
/
:
p
t

ry.u

libra
/
/
:
p
tt

ry.u

y.u

.u 13
ryPage

h

.id/

ac
nej.

y.u

r
ibra
l
/
/
:
tp

.id/

.id/

ac
nej.

y.u

r
ibra
l
/
/
:
tp

ht

ac
nej.

libra
/
/
:
p
tt

h

.id/

ac
nej.

.id/

ac
nej.

libra
/
/
:
p
tt

h

r
ibra
l
/
/
:
tp

.id/

ac
nej.

ac
nej.

y.u

r
ibra
l
/
/
:
tp

DAFTAR
ht ISI

ht

/
d/
d/
d/
c.idHALAMAN JUDUL .......................................................................................
i
ac.i
ac.i
ac.i
.
.
.
j
j
j
e
e
e
y.un
y.un
y.un
r
r
r
a
a
a
r
r
r
PERNYATAAN
................................................................................................
ii
://lib
://lib
://lib
http
http
http

j.a
.une

rary

lib
tp://

HALAMAN PEMBIMBING .......................................................................... iii

HALAMAN PENGESAHAN ..........................................................................
iv
/
id/
id/
id/
.
.
.
c
c
c
c.id
a
a
a
a
.
.
.
.
j
j
j
j
e
e
e
e
ABSTRACT .....................................................................................................
v
y.un
y.un
y.un
y.un
r
r
r
r
a
a
a
a
r
r
r
r
lib
RINGKASAN
://lib...................................................................................................
://lib
://libvi
p
p
p
tp://
t
t
t
t
t
t
h
h
h
SUMMARY ...................................................................................................... viii

/
/
/
/
PENGANTAR ......................................................................................
x
.idKATA
c.id
c.id
c.id
a
a
a
.
.
.
j
j
j
e
DAFTAR ISI .....................................................................................................
xii ry.un
.une
.une
y
y
r
r
a
a
a
r
r
br
://lib .............................................................................................
://lib
://lixiv
p
p
p
DAFTAR
TABEL
t
t
t
t
t
t
h
h
h

ac
nej.

ry.u

libra
/
/
:
p
t

DAFTAR GAMBAR ........................................................................................ xv

/
/
/
/
xvi
c.idDAFTAR SINGKATAN j..................................................................................
c.id
c.id
c.id
a
a
a
a
.
.
.
.
j
j
j
.une
.une....................................................................................
.une
.une
y
y
y
y
r
r
r
r
DAFTAR
LAMPIRAN
xvii
a
a
a
a
r
r
r
libr
://lib
://lib
://lib
p
p
p
tp://
t
t
t
t
t
t
h PENDAHULUAN ...............................................................................
h
h
BAB 1.
1
d/
ac.i

j.
.une

rary

lib
tp://

1.1 Latar belakang ..............................................................................

d/
ac.i

.un

rary
b
i
l
/
/
:

.id/

:
:
:
http 1.3.1 Tujuan ..................................................................................
http
http

3

1.3.2 Manfaat ...............................................................................
d/
d/

3

c.i
ej.a

c.i
ej.a

.id/

ac
nej.

n
BAB 2. TINJAUAN.uPUSTAKA
......................................................................
.un

4 .u
y
y
r
r
a
a
r
r
rary
b
b
b
i
i
i
l
l
l
/
/
/
/
/
/
2.1
Padi
Japonica
(Oryza
Sativa.
L.
spp.
Japonica)
cv.Ilmi
...............
4
:
:
:
http
http
http

tp

.id/

ac
nej.

ry.u

libra
/
/
:
p
t

1

1.2 Rumusan n
masalah
.........................................................................
3
j.
j.
j.ac
e
e
e
n
n
u
u
ry.u
ary.
ary.
r
r
b
b
1.3 //Tujuan
3
i
i
libra dan manfaat ......................................................................
l
l
//
//

d/

c.i
ej.a

d/
ac.i

2.2 Kultur jaringan tanaman padi .......................................................

6

2.3 Tranformasi gencdan
id/
.id/ Agrobacterium Tumefaciensc........................

7

a
nej.

a
nej.

.id/

ac
nej.

u
2.4 Arabidopsis
11ary.u
ry.u
ary. Bax Inhibitor (AtBI-1) a.............................................

r
r
libr
://Hipotesis
://lib
://lib13
p
p
p
t
t
t
t
t
t
2.5
.......................................................................................
h
h
h

BAB 3. METODOLOGI .................................................................................. 14

.id/

ac
nej.

u

ry.
libra

tp://

d/

tp:/

ary
/libr

.id/

ac
nej.

.une
.une
y
y
r
r
ry.u
a
a
a
3.2 Alat
dan
bahan
..............................................................................
14
r
r
r
b
b
b
li
li
li
tp://
tp://
tp://
t
t
ht3.3
h
h
Metode pelaksanaan ..................................................................... 14

/

c.id

j.a
.une

d/

.i
.i
3.1 Waktu dan tempat
14
j.ac .........................................................................
j.ac

/

c.id

j.a
.une

:/
http

ary
/libr

/

xii

c.id

://lib
http

rary

j.a
.une

/

c.id

://lib
http

rary

j.a
.une

.id/

.id/

ac
nej.

ry.u

libra
/
/
:
p
t

ry.u

libra
/
/
:
p
tt

ry.u

y.u

y.u

r
ibra
l
/
/
:
tp

ht
d/
ac.i

j.
.une

ary
/libr

tp:/

id/
.ac.

nej

ry.u

libra
/
/
:
p
t

.u 14
ryPage

h

.id/

ac
nej.

3.3.1

.id/

ac
nej.

y.u

r
ibra
l
/
/
:
tp

gen htAtBI-1-GFP pada

Konfirmasi

ac
nej.

libra
/
/
:
p
tt

h

.id/

ac
nej.

.id/

ac
nej.

libra
/
/
:
p
tt

h

r
ibra
l
/
/
:
tp

.id/

ac
nej.

.id/

ac
nej.

y.u

r
ibra
l
/
/
:
tp

Agrobacterium
ht

Tumefaciens::pBin-AtBI-1-GFP ....................................... 14

d/

d/

c.i
c.i ................... 14
a. Kultur
ej.a Agrobacterium:: pBin-AtBI-1-GFP
ej.a

/

c.id

j.a
.une

.un
yb.
y.un
r
r
a
a
r
r
Isolasi
AtBI-1-GFP
dari
Agrobacterium::
pBin- AtBI-/library
ib
ib
l
l
/
/
/
/
:
:
:/
http
http
http 15
1-GFP.............................................................................
c. Analisis PCR
...... 15
/ dan enzim retriksi pBin-AtBI-1-GFP
/

/
c.id
c.id
c.id
a
a
a
.
.
.
j
j
j
e
e
1)e Analisis enzim retriksi pBin-AtBI-1-GFP
............... 15
y.un
y.un
y.un
r
r
r
a
a
a
r
r
r
2) Analisis PCR ...........................................................
://lib
://lib
://lib16
p
p
p
t
t
t
t
t
t
h
h
h
3.3.2 Persiapan Agrobacterium Tumefaciens ................................ 17

.id/

ac
nej.

ry.u

libra
/
/
:
p
t

3.3.3 Persiapan eksplan
17
.id/ .................................................................
.id/

ac
nej.

.id/

ac
nej.

ac
nej.

3.3.4 rProses
18 ry.u
y.u transformasi ..............................................................
ry.u
a
a
r
r
ra
b
b
b
i
i
i
l
l
l
/
/
/
/
/
/
:
:
:
p
p
p
a. Proses infeksi danhCo-cultivasi
.........................................
18
tt
htt
htt
b. Regenerasi tanaman ......................................................... 18

d/
ac.i

y.u

r
ibra
l
/
/
:
tp

nej

u

://li

ry

.id/

ac
nej.

y.u

y.
visualisasi GFP
brarpada organ daun padi

r
ibra
l
/
/
:
tp

i

p://l

htt
ht
transgenik .............................................................................
19

3. 4 Parameter pengamatan ................................................................... 20

.id/

.id/

ac
ac
BAB 4. HASIL DAN PEMBAHASAN
............................................................
21
nej.
nej.

j.
.une

libra
tp://

/

nej

u

y.
3.3.6
brar Persiapan

http
d/
ac.i

/

id
id ............... 18
3.3.5 Isolasi DNA
.ac. genomik tanaman hasil transformasi
.ac.

nej.

ry.u

ry.u

ry

ra
ra
4.1 //Konfirmasi
plasmid .......................................................................
libra
//lib
//lib21

:
http

:
http

:
http

/

c.id

j.a
.une

4.2 Induksi kalus ................................................................................. 23

d/

c.i
ej.a

.un

rary
b
i
l
/
/
:

4.3 Infeksi

dan

Co-cultivasi
d/

c.i
ej.a

kalus

Agrobacterium
d/

dengan

.id/

c.i
ej.a

ac
nej.

Tumefaciens
25
.un ...................................................................................
.un

ry
ry
ry.u
a
a
a
r
r
r
b
b
b
i
i
i
l
l
4.4://Tahapan
regenerasi dan seleksi
://.....................................................
://l 26
http
http
http

tp

4.5 Perkembangan kalus menjadi planlet tak lengkap ........................ 29

.id/

ac
nej.

ry.u

libra
/
/
:
p
t

a
nej.

r

r

r

//lib

d/
ac.i

//lib

5.1 Kesimpulan ..................................................................................... 33

d/

d/

.i
.i
5.2 Saran ...............................................................................................
33
j.ac
j.ac

.id/

ac
nej.

.une
.une
y
y
r
r
ry.u
a
a
a
DAFTAR PUSTAKA
........................................................................................
34
r
r
r
b
b
b
li
li
li
tp://
tp://
tp://
t
t
t
h
h
h
LAMPIRAN ...................................................................................................... 37
/

c.id

tp:/

.id/

ac
nej.

u
4.7 Hasil
GFP ........................................................................
32ary.u
y.u
arAnalisis
ary.
//lib

tp://

j.a
.une

ary
/libr

a
nej.

:
p:
tp:
BAB 5.
DAN SARAN
htKESIMPULAN
htt...........................................................
http 33

nej.

u

ry.
libra

/
/
4.6 Hasil Analisis PCR
31
c.id........................................................................
c.id

/

c.id

j.a
.une

:/
http

ary
/libr

/

xiii

c.id

://lib
http

rary

j.a
.une

/

c.id

://lib
http

rary

j.a
.une

.id/

.id/

ac
nej.

ry.u

libra
/
/
:
p
t

ry.u

libra
/
/
:
p
tt

ry.u

y.u

r
ibra
l
/
/
:
tp

/

rary

y.u

r
ibra
l
/
/
:
tp

ry.u

/

c.id

j.a
.une

y.u

r
ibra
l
/
/
:
tp

ht
/

c.id

j.a
.une

y

ac
nej.

/

c.id

j.a
.une

Halaman

y

y

r
r menggunakan enzim brar
3.1 Susunan /lbahan
ibra yang digunakan pada :/pengujian
ibra
l
li
/
/
:
tp
tp
tp://
t
t
t
h
h
h
retriksi .......................................................................................................... 16
3.2 Susunan bahan yang digunakan
16
/ pada analisis PCR .....................................
/

id/
.ac.

/
c.id
c.id
c.id
a
a
a
.
.
.
j
j
j
e yang digunakan pada proses
e
e
3.3 Tabel komposisi media
transformasi
............. 17
y.un
y.un
y.un
r
r
r
a
a
a
r
r
r
4.1 Total pkalus
3://lib
://lib yang hidup pada mediattpseleksi
://lib dan regenerasi setelah
p
t
t
t
t
h
h
h

nej

libra
/
/
:
p
t

.id/

ac
nej.

DAFTAR
TABEL
ht

c.id

lib
tp://

.id/

ac
nej.

ht
j.a
.une

.u 15
ryPage

h

.id/

y.u

ac
nej.

libra
/
/
:
p
tt

h

.id/

ac
nej.

.id/

ac
nej.

libra
/
/
:
p
tt

h

r
ibra
l
/
/
:
tp

.id/

ac
nej.

minggu pencucian ......................................................................................... 29

/ Perkembangan kalus menjadi
/ planlet tak lengkap (albino
/dan white/
.id4.2
c.id
c.id
c.id
a
a
a
.
.
.
j
j
j
e
e
green) setelah satu
bulan co-cultivation ........................................................
30 ry.un
.un
.une
y
y
r
r
a
a
a
r
r
r
://lib
://lib
://lib
p
p
p
t
t
t
t
t
t
h
h
h

ac
nej.

ry.u

libra
/
/
:
p
t

.id/

.id/

ac
nej.

y.u

r
ibra
l
/
/
:
tp

y.u

r
ibra
l
/
/
:
tp

/

rary

ry.u

rary

://lib
http

ry.u

libra
/
/
:
p
tt

y.u

y.u

/

ary
/libr

ary
/libr

:/
http

y.u

ht

/

c.id

j.a
.une

ac
nej.

r
ibra
l
/
/
:
tp

ht

c.id

.id/

ac
nej.

r
ibra
l
/
/
:
tp

ht
j.a
.une

ry.u

libra
/
/
:
p
tt

.id/

ac
nej.

r
ibra
l
/
/
:
tp

ac
nej.

h

.id/

y.u

r
ibra
l
/
/
:
tp

.id/

ac
nej.

h

.id/

ac
nej.

ry.u

libra
/
/
:
p
tt

.id/

ry.u

h

ac
nej.

h

.id/

ac
nej.

libra
/
/
:
p
tt

.id/

ry.u

h

.id/

ry.u

rary

://lib
http

ac
nej.

libra
/
/
:
p
tt

/

c.id

xiv

j.a
.une

rary

://lib
http

/

c.id

j.a
.une

.id/

ry.u

h

libra
/
/
:
p
t

/

c.id

ac
nej.

libra
/
/
:
p
tt

ac
nej.

y.u

r
ibra
l
/
/
:
tp

j.a
.une

.id/

ac
nej.

libra
/
/
:
p
t

/

rary

://lib
http

ac
nej.

ht

c.id

j.a
.une

.id/

tp:/

y.u

ht

c.id

j.a
.une

.id/

ac
nej.

r
ibra
l
/
/
:
tp

ht

lib
tp://

.id/

ac
nej.

/

c.id

://lib
http

rary

j.a
.une

.id/

.id/

ac
nej.

ry.u

libra
/
/
:
p
t

ry.u

libra
/
/
:
p
tt

ry.u

y.u

ht
/

rary

y.u

r
ibra
l
/
/
:
tp

/

/

c.id

y

y

:/
http

:/
http

2.2 Perbedaan penicle dari ketiga jenis padi .......................................................

5

2.3 Bagian Agrobacterium Tumefaciens
.............................................................
/
/

8

id
.ac.

/

c.id

j.a
.une

Halaman

ar
ar
rar
2.1 Perbedaan
biji ketiga jenis padi....................................................
/libmorfologi
/libr
/libr5

id/
.ac.

id
.ac.

.id/

c
ej dari Agrobacterium Tumefaciens
ej ke sel tanaman .... 9 .unej.a
2.4 Proses transfer T-DNA
n
n
u
u
.
.
ary
rary (BI-1) dalam mengontrol
rkematian
rary
b
b
b
i
i
i
l
l
l
2.5 Mekanisme
AtBI-1
sel
(PCD)
pada
/
/
/
/
/
/
:
:
:
http
http
http

nej

ry.u

y.u

r
ibra
l
/
/
:
tp

j.a
.une

y

ac
nej.

ht

c.id

j.a
.une

:/
http

libra
/
/
:
p
t

.id/

ac
nej.

DAFTAR GAMBAR
ht

c.id

lib
tp://

.id/

ac
nej.

r
ibra
l
/
/
:
tp

j.a
.une

.u 16
ryPage

h

.id/

y.u

ac
nej.

libra
/
/
:
p
tt

h

.id/

ac
nej.

.id/

ac
nej.

libra
/
/
:
p
tt

h

r
ibra
l
/
/
:
tp

.id/

ac
nej.

tingkatan sel .................................................................................................. 12

/ Kalus yang siap digunakan.iuntuk
/ eksplan transformasi ...............................
/
/
18
.id3.1
c d
c.id
c.id
a
a
a
.
.
.
j
j
j
ne sebelum diligasi dengan
ne pBIN- AtBI-14.1 Konstruk plasmid
.upbin19
.ugen
.une
y
y
y
r
r
r
a
a
a
r
r
r
://lib
://lib
://lib21
p
p
p
GFP
...............................................................................................................
t
t
t
t
t
t
h
h
h

ac
nej.

ry.u

libra
/
/
:
p
t

4.2 konstruk plasmid pbin19 setelah diligasi dengan gen pBIN- AtBI-1-GFP

/
/
/
.id/ menjadi pBIN- AtBI-1-GFP
22
c.id..........................................................................
c.id
c.id
a
a
a
.
.
.
j
j
j
ne
.udengan
.une enzim sali dan
.une
y
y
y
r
r
r
4.3 Hasil pemotongan
enzim
retriksi
menggunakan
a
a
a
r
r
r
://lib
://lib
://lib
p
p
p
t
t
t
t
t
t
h ..............................................................................................................
h
h
ecori
23

ac
nej.

y.u

r
ibra
l
/
/
:
tp

4.4 Perkembangan kalus selama 35 hari ............................................................. 24

d/
ac.i

ry

libra
tp://

.id/

ry.u

ry.u

:
http

/

c.id

j.a
.une

ry

a
ra
ra
4.6 Perkembangan
/librregenerasi .............................
//lib kalus pada media seleksi /dan
//lib28
:
http

:
http

4.7 Tipe perkembangan kalus menjadi planlet tak lengkap ................................ 30
31
/ Hasil analisis PCR .........................................................................................
/
d4.8
id/
id/
.
.
c
c
c.id
a
a
a
.
.
.
j
j
j
e
e
4.9 Gambar luminescent
32 .une
y.un daun .............................................................................
y.un
r
r
a
a
r
r
rary
b
b
b
i
i
i
l
l
l
/
/
/
/
/
/
:
:
:
http
http
http

c.i
ej.a

.un

rary
b
i
l
/
/
:

tp

.id/

.id/

ac
nej.

ry.u

libra
/
/
:
p
t

ry.u

libra
/
/
:
p
tt

ry.u

y.u

y.u

/

y.u

:/
http

ary
/libr

ac
nej.

y.u

r
ibra
l
/
/
:
tp

ht

/

c.id

j.a
.une

.id/

ac
nej.

ht

c.id

ary
/libr

h

r
ibra
l
/
/
:
tp

ht
j.a
.une

ry.u

.id/

ac
nej.

r
ibra
l
/
/
:
tp

ac
nej.

libra
/
/
:
p
tt

h
.id/

ac
nej.

.id/

ac
nej.

libra
/
/
:
p
tt

h

r
ibra
l
/
/
:
tp

.id/

ac
nej.

.id/

tp:/

.id/

c
ac
4.5 Tahap Co-cultivasi n........................................................................................
26
ej.a
nej.

j.
.une

/

xv

c.id

://lib
http

rary

j.a
.une

/

c.id

://lib
http

rary

j.a
.une

.id/

.id/

ac
nej.

ry.u

libra
/
/
:
p
t

ry.u

libra
/
/
:
p
tt

ry.u

.u 17
ryPage

h

.id/

y.u

.id/

ac
nej.

y.u

r
ibra
l
/
/
:
tp

ht

ac
nej.

libra
/
/
:
p
tt

h

.id/

ac
nej.

.id/

ac
nej.

libra
/
/
:
p
tt

h

r
ibra
l
/
/
:
tp

.id/

ac
nej.

.id/

ac
nej.

y.u

r
ibra
l
/
/
:
tp

ac
nej.

y.u

r
ibra
l
/
/
:
tp

t
DAFTAR hSINGKATAN

ht

/

d/
d/
ac.i
ac.i
.
.
j
j
e
e
n
PCI
= Pika
Induction
y.uCallus
y.un
r
r
a
a
r
r
://lib
://lib
PIL
http = Pika Infection Liquid http

c.id

j.a
.une

rary

lib
tp://

/
.idPCo

ry.u

libra
/
/
:
p
t

d/
= Pika Co-Cultivation
ac.i
libra
/
/
:
p
tt

h

id/

c.
= Luria-Bertani
ej.a Broth

ac LB
nej.

.id/

.id/

ac
nej.

y.u

r
ibra
l
/
/
:
tp

y.u

r
ibra
l
/
/
:
tp

/

rary

ry.u

ry.u

libra
/
/
:
p
tt

y.u

/

y.u

ary
/libr

:/
http

ary
/libr

ac
nej.

y.u

r
ibra
l
/
/
:
tp

ht

/

c.id

j.a
.une

.id/

ac
nej.

ht

c.id

j.a
.une

ry.u

libra
/
/
:
p
tt

h

r
ibra
l
/
/
:
tp

ht

ac
nej.

.id/

ac
nej.

r
ibra
l
/
/
:
tp

.id/

ac
nej.

.id/

y.u

r
ibra
l
/
/
:
tp

h

h

.id/

ac
nej.

ry.u

.id/

ac
nej.

h

ac
nej.

libra
/
/
:
p
tt

h

libra
/
/
:
p
tt

.id/

ry.u

.id/

ry.u

rary

://lib
http

ac
nej.

libra
/
/
:
p
tt

/

c.id

xvi

j.a
.une

rary

://lib
http

/

c.id

j.a
.une

.id/

ry.u

.id/

tp:/

rary

://lib
http

h

libra
/
/
:
p
t

/

c.id

ac
nej.

libra
/
/
:
p
tt

ac
nej.

y.u

r
ibra
l
/
/
:
tp

j.a
.une

.id/

ry.u

ac
nej.

ht

/

rary

://lib
http

.id/

y.u

r
ibra
l
/
/
:
tp

j.a
.une

.id/

libra
/
/
:
p
t

h

ac
nej.

c.id

ac
nej.

ry.u

libra
/
/
:
p
tt

ht

c.id

j.a
.une

.id/

ac
nej.

.id/

ac
nej.

ht

lib
tp://

.id/

ac
nej.

.un
y
r
ry.u
a
a
r
r
2,4 D
=
2,4
Dichlorophenoxyacetic
acid
b
b
i
i
/l
/l
ttp:/
ttp:/
h
h
NAA
= Naftalen Asam Asetat

tp

ry.u

h

= Murashige and Skoog

.id/

u

.id/

ac
nej.

libra
/
/
:
p
tt

/lib
ttp:/

= Pika Aclimatitation h

MS

ry.
a
r
b
i
://l

.id/

ac
nej.

nej.

= Pika
ry.uSelection and Regenerationrary.u

PSR
PA

rary

://lib
http

= Pika Broth

PB

ac
nej.

/

c.id

j.a
.une

/

c.id

://lib
http

rary

j.a
.une

.id/

.id/

ac
nej.

ry.u

libra
/
/
:
p
t

ry.u

libra
/
/
:
p
tt

y.u

ht
/

rary

lib
tp://

.id/

ac
nej.

y.u

r
ibra
l
/
/
:
tp

/

c.id

j.a
.une

y.u

ht
/

c.id

j.a
.une

y

ac
nej.

r
ibra
l
/
/
:
tp

t
DAFTARhLAMPIRAN

c.id

j.a
.une

.u 18
ryPage

libra
/
/
:
p
tt

.id/

ac
nej.

r
ibra
l
/
/
:
tp

ac
nej.

h

.id/

y.u

/

c.id

j.a
.une

Halaman

y

y

r
rar yang digunakan pada proses
raTransformasi
rar
A. Komposisi
media
......................./lib34
//lib
//lib
/
:
http

:
http

:
http

B. Komposisi media media Murashige-Skoog .................................................. 35
C. Komposisi media LB-Broth ..........................................................................
36
/
/

id/
.ac.

nej

ry.u

libra
/
/
:
p
t

.id

ry.u

libra
/
/
:
p
tt

ry.u

ry.u

ry.u

ry.u

y.u

y.u

/

rary

lib
tp://

.id/

rary

://lib
http

ry.u

ry.u

ry.u

y.u

r
ibra
l
/
/
:
tp

/

y.u

r
ibra
l
/
/
:
tp

:/
http

ary
/libr

ac
nej.

y.u

r
ibra
l
/
/
:
tp

ht

/

c.id

j.a
.une

.id/

ac
nej.

ht

c.id

ary
/libr

.id/

ac
nej.

ht
j.a
.une

ry.u

h

.id/

y.u

ac
nej.

libra
/
/
:
p
tt

h

.id/

.id/

ac
nej.

libra
/
/
:
p
tt

h

r
ibra
l
/
/
:
tp

.id/

ac
nej.

libra
/
/
:
p
tt

ac
nej.

ry.u

h

.id/

ry.u

libra
/
/
:
p
t

ac
nej.

libra
/
/
:
p
tt

h

.id/

.id/

ry.u

h
ac
nej.

rary

://lib
http

ac
nej.

libra
/
/
:
p
tt

/

c.id

xvii

j.a
.une

rary

://lib
http

/

c.id

j.a
.une

.id/

ac
nej.

libra
/
/
:
p
tt

/

c.id

j.a
.une

.id/

ry.u

libra
/
/
:
p
t

/

rary

://lib
http

ac
nej.

y.u

ht

c.id

j.a
.une

ac
nej.

r
ibra
l
/
/
:
tp

ht

c.id

.id/

ac
nej.

r
ibra
l
/
/
:
tp

ht
j.a
.une

ry.u

libra
/
/
:
p
tt

.id/

ac
nej.

r
ibra
l
/
/
:
tp

ac
nej.

h

.id/

y.u

.id/

ac
nej.

h

.id/

r
ibra
l
/
/
:
tp

h

libra
/
/
:
p
tt

h
ac
nej.

ry.u

.id/

ac
nej.

libra
/
/
:
p
tt

ac
nej.

libra
/
/
:
p
tt

h
.id/

ac
nej.

libra
/
/
:
p
t

ac
nej.

libra
/
/
:
p
tt

h

.id/

.id

ac
nej.

.id/

tp:/

ry.u

h

.id/

ac
nej.

.id/

ac
nej.

libra
/
/
:
p
tt

h

r
ibra
l
/
/
:
tp

.id/

ac
nej.

/

c.id

://lib
http

rary

j.a
.une