FORDA - Jurnal
Tabel 1. Data sampel yang digunakan pada kegiatan ini
No.
1
2
3
4
5
6
7
Populasi
Muara Bungo (Jambi)
Sarolangun (Jambi)
Samboja (Kaltim)
Sanggau (Kalbar)
Berau (Kaltim)
Berau (Kaltim)
Berau (Kaltim)
Jumlah sampel
12
12
12
12
12
12
8
Species
A. malaccencis
A. malaccensis
A. microcarpa
A. malaccensis
A. beccariana
A. microcarpa
A. malaccensis
Tabel 2. Daftar primer yang digunakan dan menghasilkan lokus polimorfik
No
Primer
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
OPA-2
OPA-4
OPA-10
OPA-11
OPA-12
OPA-13
OPA-16
OPA-18
OPA-19
OPA-20
OPD-1
OPD-3
OPD-7
OPG-1
OPG-3
OPG-4
OPG-6
OPG-7
OPG-8
OPG-11
OPG-12
OPG-15
OPG-18
OPG-19
OPQ-3
OPQ-6
Urutan basa
(5` - 3`)
TGCCGAGCTG
AATCGGGCTG
GTGATCGCAG
CAATCGCCGT
TCGGCGATAG
CAGCACCCAC
AGCCAGCGAA
AGGTGACCGT
CAAACGTCGG
GTTGCGATCC
ACCGCGAAG
GTCGCCGTCA
TTGGCACGGG
CTACGGAGGA
GAGCCCTCCA
AGCGTGTCTG
GTGCCTAACC
GAACCTGCGG
TCACGTCCAC
TGCCCGTCGT
CAGCTCACGA
ACTGGGACTC
GGCTCATGTG
GTCAGGGCAA
GGTCACCTCA
GAGCGCCTTG
Jumlah
Jumlah pita polimorfik
2
1
6
6
3
4
5
8
3
2
3
1
2
4
2
3
4
4
3
3
4
2
4
1
2
1
84
Tabel 3. Nilai keragaman genetik di dalam populasi (diagonal) dan antar
populasi (di bawah diagonal) dari 7 populasi Aquilaria sp.
Populasi
1
2
3
4
5
6
7
1
0,285
0,030
0,368
0,322
0,239
0,298
0,305
2
0,240
0,442
0,405
0,254
0,396
0,404
3
4
5
6
7
0,209
0,037
0,494
0,055
0,075
0,228
0,488
0,040
0,660
0,232
0,492
0,476
0,205
0,017
0,180
Keterangan : 1. A. malaccensis (Muara Bungo, Jambi),
2. A. malaccensis (Sorolangun, Jambi),
3. A. microcarpa (Samboja, Kaltim),
4. A. malaccensis (Sanggau, Kalbar),
5. A. beccariana (Berau, Kaltim),
6. A. microcarpa (Berau, Kaltim),
7. A. malaccensis (Berau, Kaltim)
A. malaccensis (Muara Bungo, Jambi)
A. malaccensis (Sarolangun, Jambi)
A. beccariana (Berau, Kaltim)
A. microcarpa (Samboja, Kaltim)
A. malaccensis (Sanggau, Kalbar)
A. microcarpa (Berau, Kaltim)
A. malaccensis (Berau, Kaltim)
0,5
0
Gambar 1. Dendogram hubungan kekerabatan antara 7 populasi Aquilaria spp
berdasarkan jarak genetik Nei's (1978)
No.
1
2
3
4
5
6
7
Populasi
Muara Bungo (Jambi)
Sarolangun (Jambi)
Samboja (Kaltim)
Sanggau (Kalbar)
Berau (Kaltim)
Berau (Kaltim)
Berau (Kaltim)
Jumlah sampel
12
12
12
12
12
12
8
Species
A. malaccencis
A. malaccensis
A. microcarpa
A. malaccensis
A. beccariana
A. microcarpa
A. malaccensis
Tabel 2. Daftar primer yang digunakan dan menghasilkan lokus polimorfik
No
Primer
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
OPA-2
OPA-4
OPA-10
OPA-11
OPA-12
OPA-13
OPA-16
OPA-18
OPA-19
OPA-20
OPD-1
OPD-3
OPD-7
OPG-1
OPG-3
OPG-4
OPG-6
OPG-7
OPG-8
OPG-11
OPG-12
OPG-15
OPG-18
OPG-19
OPQ-3
OPQ-6
Urutan basa
(5` - 3`)
TGCCGAGCTG
AATCGGGCTG
GTGATCGCAG
CAATCGCCGT
TCGGCGATAG
CAGCACCCAC
AGCCAGCGAA
AGGTGACCGT
CAAACGTCGG
GTTGCGATCC
ACCGCGAAG
GTCGCCGTCA
TTGGCACGGG
CTACGGAGGA
GAGCCCTCCA
AGCGTGTCTG
GTGCCTAACC
GAACCTGCGG
TCACGTCCAC
TGCCCGTCGT
CAGCTCACGA
ACTGGGACTC
GGCTCATGTG
GTCAGGGCAA
GGTCACCTCA
GAGCGCCTTG
Jumlah
Jumlah pita polimorfik
2
1
6
6
3
4
5
8
3
2
3
1
2
4
2
3
4
4
3
3
4
2
4
1
2
1
84
Tabel 3. Nilai keragaman genetik di dalam populasi (diagonal) dan antar
populasi (di bawah diagonal) dari 7 populasi Aquilaria sp.
Populasi
1
2
3
4
5
6
7
1
0,285
0,030
0,368
0,322
0,239
0,298
0,305
2
0,240
0,442
0,405
0,254
0,396
0,404
3
4
5
6
7
0,209
0,037
0,494
0,055
0,075
0,228
0,488
0,040
0,660
0,232
0,492
0,476
0,205
0,017
0,180
Keterangan : 1. A. malaccensis (Muara Bungo, Jambi),
2. A. malaccensis (Sorolangun, Jambi),
3. A. microcarpa (Samboja, Kaltim),
4. A. malaccensis (Sanggau, Kalbar),
5. A. beccariana (Berau, Kaltim),
6. A. microcarpa (Berau, Kaltim),
7. A. malaccensis (Berau, Kaltim)
A. malaccensis (Muara Bungo, Jambi)
A. malaccensis (Sarolangun, Jambi)
A. beccariana (Berau, Kaltim)
A. microcarpa (Samboja, Kaltim)
A. malaccensis (Sanggau, Kalbar)
A. microcarpa (Berau, Kaltim)
A. malaccensis (Berau, Kaltim)
0,5
0
Gambar 1. Dendogram hubungan kekerabatan antara 7 populasi Aquilaria spp
berdasarkan jarak genetik Nei's (1978)