B1J008039 10.
RINGKASAN
Keanekaragaman genetik merupakan hal penting untuk menjaga kelestarian
jangka panjang bagi sebuah spesies bahkan suatu populasi. Penelitian ini ditujukan
untuk mengungkap keanekaragaman genetik pada populasi Mystus nigriceps di DAS
Serayu. Sejumlah 10 sampel insang dikoleksi sebagai sumber DNA. Genom DNA
diisolasi dengan metode Chelex 5%. Lokus RAPD (Random Amplyfied
Pholymorphic DNA) diamplifikasi dengan teknik PCR (Polymerase Chain Reaction)
sebanyak 45 siklus dengan suhu anneling 45oC. Hasil penelitian menunjukkan dari
10 primer yang digunakan, 3 primer dapat mengamplifikasi marka RAPD. Ukuran
berkisar 931 bp sampai 1482 bp. Heterozigositas lokus RAPD Mystus nigriceps di
DAS Serayu sebesar 38 % (0.38). Dari hasil penelitian dapat disimpulkan bahwa
nilai keanekaragaman genetik M. nigricep di DAS Serayu tergolong rendah.
Kata Kunci : Mystus nigriceps, keanekaragaman genetik, Chelex 5%, DAS Serayu,
PCR, RAPD
bio.unsoed.ac.id
x
SUMMARY
Genetic diversity is important for long-term preservation of a species even a
population. This study aimed to uncover the genetic diversity in the population of
Mystus nigriceps in the Serayu watershed. A number of 10 samples were collected as
a source of gills DNA. Genome DNA was isolated by 5% Chelex method. RAPD
Loci (Random Amplyfied Pholymorphic DNA) were amplified by PCR (Polymerase
Chain Reaction). 3 out of 10 primers could amplify RAPD markers. The fraghmens
ranged from 931 bp to 1482 bp. RAPD loci heterozygosity of M. nigriceps in Serayu
watershed was 38% (0.38). It could be concluded that the value of genetic diversity
in Serayu watershed of M. nigricep wos low.
Keywords: Mystus nigriceps, genetic diversity, Chelex 5%, Serayu watershed, PCR,
RAPD.
bio.unsoed.ac.id
xi
Keanekaragaman genetik merupakan hal penting untuk menjaga kelestarian
jangka panjang bagi sebuah spesies bahkan suatu populasi. Penelitian ini ditujukan
untuk mengungkap keanekaragaman genetik pada populasi Mystus nigriceps di DAS
Serayu. Sejumlah 10 sampel insang dikoleksi sebagai sumber DNA. Genom DNA
diisolasi dengan metode Chelex 5%. Lokus RAPD (Random Amplyfied
Pholymorphic DNA) diamplifikasi dengan teknik PCR (Polymerase Chain Reaction)
sebanyak 45 siklus dengan suhu anneling 45oC. Hasil penelitian menunjukkan dari
10 primer yang digunakan, 3 primer dapat mengamplifikasi marka RAPD. Ukuran
berkisar 931 bp sampai 1482 bp. Heterozigositas lokus RAPD Mystus nigriceps di
DAS Serayu sebesar 38 % (0.38). Dari hasil penelitian dapat disimpulkan bahwa
nilai keanekaragaman genetik M. nigricep di DAS Serayu tergolong rendah.
Kata Kunci : Mystus nigriceps, keanekaragaman genetik, Chelex 5%, DAS Serayu,
PCR, RAPD
bio.unsoed.ac.id
x
SUMMARY
Genetic diversity is important for long-term preservation of a species even a
population. This study aimed to uncover the genetic diversity in the population of
Mystus nigriceps in the Serayu watershed. A number of 10 samples were collected as
a source of gills DNA. Genome DNA was isolated by 5% Chelex method. RAPD
Loci (Random Amplyfied Pholymorphic DNA) were amplified by PCR (Polymerase
Chain Reaction). 3 out of 10 primers could amplify RAPD markers. The fraghmens
ranged from 931 bp to 1482 bp. RAPD loci heterozygosity of M. nigriceps in Serayu
watershed was 38% (0.38). It could be concluded that the value of genetic diversity
in Serayu watershed of M. nigricep wos low.
Keywords: Mystus nigriceps, genetic diversity, Chelex 5%, Serayu watershed, PCR,
RAPD.
bio.unsoed.ac.id
xi