21 UIN Syarif Hidayatullah Jakarta
BAB 3 METODOLOGI PENELITIAN
3.1 Waktu dan Tempat Penelitian
Penelitian ini dilaksanakan di Laboratorium Teknologi Gen, Balai Pengkajian Bioteknologi-BPPT Serpong, Tangerang. Waktu pelaksanaan dari
bulan Maret 2013 sampai November 2013.
3.2 Alat dan Bahan 3.2.1 Alat
Alat yang digunakan adalah pipet mikro 0,1-2 l, 2-20 l, 20-200 l, 100-
1000 l [Finnpipette, BIO-RAD, Nichiryo, BenchMate], tip 10 l, 100 l, dan
1000 l [Sorenson], freezer -20
o
C [Angelantoni Scientifica], lemari pendingin 4
o
C [Glacio-TOSHIBA], mesin PCR [TaKaRa BIO-RAD], thermostat shaking
bath [Heto], tabung sentrifugasi 15 ml [Iwaki, Corning, FALCON, BIOLOGIX], tabung mikrosentrifugasi 1,5 ml [Sorenson], tabung mikrosentrifugasi 200
l [Axygen], rak tabung, mesin sentrifugasi [Beckman J2-HS Tomy, timbangan
[Metter], ice maker [HOSHIZAKI], vorteks [Heidolph], magnetic stirrer [Heidolph MR30001], inkubator [memmert], microwave [National], laminar air
flow, heat block [Thermolyne], spatula, gunting , elektroforesis tray [Bio-rad], chamber elektroforesis [Mupid2], comb, gel documentation, spektrofotometer
Nano Drop ND-1000. Alat gelas yang digunakan adalah gelas ukur, labu Erlenmeyer 100 ml 250 ml, gelas Beker 600 ml 1000 ml, tabung
penyimpanan bahan 50 ml, 100 ml, 250 ml 500 ml[Schott-DURAN], R-tube, petri dish, ose, bunsen.
UIN Syarif Hidayatullah Jakarta 3.2.2 Bahan
Bahan yang digunakan dalam penelitian ini adalah DNA Leptospira interrogens yang sudah terisolasi yang diperoleh dari Balai Besar Penelitian
Vektor dan Reservoir Penyakit Salatiga, dan bakteri Eschericia coli DH5-Alpha. Bahan lain yang digunakan CTAB Cetyl Trimetyl Ammonium Bromide 10, TE
Tris-EDTA buffer 1X, SDS Sodium Dodecyl Sulfate 10, proteinase-K 18 mgml, NaCl Natrium Klorida 5M, buffer TAE Tris Acetate EDTA 0,5X,
kloroform, isoamilalkohol, isopropanol, etanol 70, Fenol, Tripton, Yeast Extract, Bacto Agar, Go Taq
Green Master Mix, primer spesifik Leptospira, agarosa, TAE 0,5 x, SYBR
safe, probe, buffer ii-PCR.
3.3 Tahapan Penelitian