ISOLASI DAN DETEKSI GEN toxR, tdh, dan trh BAKTERI Vibrio parahaemolyticus PADA IKAN BALEDANG (Trichiurus lapturus, Linn) DENGAN METODA POLYMERASE CHAIN REACTION (PCR).
foxR ldtr. da, t h BAKTERI
Vibno pafthaenolrticus PADA IKAN BAL.EDANG{rfl chiurrs
ISOL.ASI DAN DETEKSI GEN
le.pfirflrs, Linn) DEI{GAN METODA POaYI,IFMSE CtfArilr
RFACI/OIJ (PCR)
!;(l{r
PSI
SrrR,IANl FARlllA\I
AS?J
DIAN
FAKULTAS FARMASI
Lfr\lVEr6ITASAND^I.AS
2011
ABSTRAK
Tclah dilakuk0n stuli gen rdR, 7dr, drr /r, prln hkrcri
'rrrn,
Nrahaenolrricrs dti sampel \kan baleda4 yans diperoleh dtui Mnaru Pddms
ftbap isoldi baltcri didalului densan n.nEinolulasi supel d l nr rrdnnr
isola\i selekll.5-.?, /.t pr, ,r,r, (SPll) dan Jnediutu o€rlumbLl'an selckal
'M
CIIROM,\sar Vibno. Hasil isoLasinrnunjukkrn bdwa sampel ikM brledma
ncnld\tl'^Ebaktcti I Panhae,,1:/tzr y g diiodai dcnsa.limbuiny! koloni
berw,ma ungtr Sclanjutnya dilakukan uji penesas dcngm ndal^ !ol\,,1ouv
(:hdin RLtLl n (PcR). ftsil ampliiikasi l,cll didclcksi dcnge loes
elekt Lresa gel dxn dan tiga pulLrh dchpan kultur yang diisolasi nehberikm
Isil dua puluhtujlh kulLu posiil gen rr l dm Lidak salwuo kulturyanc Frsirl
I,
Scbasian besar
rihyah di bumi dilelilingi olcl huho, sehiissa
nnl.,
hdiad malamn banyak lang bffasal dan laul. ltan. kerans,keraieaD. cumi dar
udrng meoprkrn bebefttpa
rr.l,d
rms
cukun diecmari k.rcia r.s.nya yang
le4r dan bcrai/i rinegi Hasil laut lang paling
ditonsl.*i
banyak
ol€h
naslaraldl .dalah ilan LaEm ikan paline nudaa ditcrnlch d,n nrenriliki ienls
yang berag.fr. seleni ikan baled^ng (TiLhhm$
l.ptw^ Lim)
ymg ncnjadi
sabn satu konuditas ckspor lndoncsia (.\drbrnvali. 2003) rkro hrle{lona son!{L
niudah dikenali dari benlukn)-a yans pmj.ng dan pipih.
lke
ini dikcnal dcnge
ilai layr (J,wa). n.l.l
berbrsai macm nma lokal raitu
de
b.ledans (radan3). rajuru Gurawesi seratan). ronu (Amb.n).
Balcdans mcrupakln
Ke
nrnln
nrensko.sumsi
ncnan ilu
lu|ao.l nrla\ neljadi
lnlh.me diu:z.t! y.ns
L€rjadin!! rv$dh
t.r.ltuan.4ri.ns
titc ik.n rrcddo, ylns
pada
(Palabulramtu).
rriur (Mrdun,)
kccil.
tuog lccil
pcrhadd
scrclan
didusa kareno infcksi li6r'o
as^l tahm 1950 di .repxna dxo sdn,cnjrk tll,u. 19!6
multri Fndenrik di neg.tu n€grtu Asia dan Amerika (WonS. 2001r II&a-Kudo.
20Ol). Nlcnurur Nair
./ ,r
pcnycbdd kasus pmdc
m
it
(200r). lndon.sia remlsuk salah slru Eilalah
yanr
d
R^rtct't t' pukthtnal),inu!
isebabkm olch bakl$i
^t
l,h balrcn (ham ncsrlil bcrbcntul blkng
bcngkok. .naerob fakultalil dan bdsifat halolilik.
(Wons?/,t,
1999,
t/ tunktmrlrtin:
Fng lrlt,gen
pnda nmusnr
w.ng,200:lj Nan,.r,1,2007:sujccwa.rdl.2000) lnicksi
dapar rorildi karcn, nMgkonstrmsi
'n,kdim
yrns rerkonrrnrin{si
parogen. nakanan yana diinAak setengal, ma!an!, atau m.krnan
lbh
brkrcrj
yrn!dikon$n$l
tatrF
dinrasal<
(l,ida..r,l..
1998i wong- 2003t Oknda ?r
L
purahacn.Uticu! meDpunyai
1997), densan
.Iur
scjaln yme dirimbulke adalah easho.nreriris yms silirlnla
Battcti
dl,
gc. st sint
yanu brn
Kcbradmn gcn ini ridak bcreilat parogen terhldlp monusia. Nrmun l/
poaht. olftitu\
sen
r/, }!ns
bcnmssunsiaRab rrhadap pnduksi rotsin beruFa Thun.nuhlt
,, yane nctunroduksi r.ksin I".Jll R.tdd
th'noiysin l:tFH) Ti.gkar riulen r lar,rdeud". tidak dipcngmhi olch
jtn\^h tt ptahd.nouti.rs tcrsbur. t.pi sdgxr lcrsmrury r Jr ioks,n Fn3
Ditld
Ht
nen9hxllkankan gen gen viflletr lrarg silahlx rd{)gen }ritu
obsih
(tDl]) dn
Een
dihasilld gemya (Wong, 2001r Sujee{a ./ d/.. 2009) Mekturh ie rrlosen t'
punthulnat!|i ! sbeai bcthrbug dcngd
yang nemberiku respon
le
radap
adanya produlsi gcn klh dan trh.
l-r.,,,/rrrs (Melim.2003)
Peneri(ian mcnsenxi addya gen vnulcn pada baklcri
rclah didcrcksi pada bcberapa ienh
zcracrr,:t,
udang kelong
rd/D,/ dimLlEnla
(/ezttu! inrtit
s),
l. t)aruha.nalJr.us
udans !trrih
(/,r'dcrr
wlsi (t:orhiculd nohkitlh.
Ptnn )
dm lmekitmg (F,,,,J ar.r) (Marlina, cr z/,200?; Mudlris,200t)i A/.renela,
2009).l'ada pcnclnid ini dilakukan del€ksi gcn
nri
dan s€n lnul€n prda ikm
h.lcdlns denslr menBgun.k.n tuetoda tCR. Deng adanya penelnid ini
diharapkd dapar dipcroleh dala mengenai keberadad gc.
bxlj.cti I' para hacno bt icus y lti8 lerdlpa I
pad a sam
pcl
ikd
trn dd sen vnulcn
ba
lcdanr
V. KISIMPI]LAN DAN SAR N
D[i lrsil penelilian dapar dianbil kesimpulan bahwa tada ssl)cl i*an
bdldddg (r /ct,/,J) yme dipcrolch dari Muaro Padans, sunratem Raral
terdapat bakreri
r p.tuhtln.lt1i. !
DaD
patuhden.\ricts yn1 didebksi membcrik iasil
ddal sarupu kultu yuB positilgen /.ll dan gen
dei l8
2T
Lultur
b.ltcri l:
kullur posilirscn tur?. dm
tl.
DGarankan kep&Ll pmehi selanjuhya uDtuk nielakukm idenlinkdsijenis
vibno hin spcni vihrh alsirovicus, vibria.f,lhjtit,s, dM
densan nctode PCR pada sanpel
I
lzrlrruJ.
lliht
thrtoa
RUJUlri_{N
Agus. S., rdillier, C, ,\min, S, Anh, K, SnDlos.. Hly l. Il.
Budinm, 8.. Soemar$no. I,,^bdrl, R., Kasira[.. l,ifa. I lrrky. H M
Mardiastuti, ll.W. Malhild.. L.. Miiam, T., Asnrom., Praliqi, S. Rc(rru. I S..
Robcn. U.. sddjiro., Suhano,.r., Suhar1o.. Suhrd. S., Suiudi., Susid!,,\., T.dia.
II., Miaasati, S.. ddr Usman. C.W.1q91. DLtu,'iiur t/ihohid.xi Kul.*1uan.
Edd rcvhi.Faloltas Kcdol1cmn. Unirc6il6 Indonesia : Jalatu.
Anbtrwati,D.v.S 2008.Sht.li Biolori lrprotluksi lkln luyu tsuptlu,niti
bithirtui.l.a) di reruirh lalohuhdnratu, Kahttldl.n Sukthun J6ro Bdtat.
(skril)si) Bosor: lnslilUl Pcnanian Bogor.
Azyenela, L.2049. Dctctt\i Ct, viruln Btkloi litui rorahulhrlrtitut
Dtri lanplp Plhsj (Catbic la ntaLkiaka. lrr"e) Dah Lah|kita"F 6a"nts akt)
D.4:an Mah.ta Prlyn.ta!.4:hdih R..tti.n lr(tt). (Skripsil I'admg i
Ansuaan,
M.. Marcelinolucas.. Jacquclinel-.Den. N.A.Dhuir.n..
X@ Yiwbe, Ashmtussafa.. Mdziasullara., A.Chowdhury. (i BJ*rishNi.
DovidA.Sach.. I-oEnzvonscidlcin., MahcshK,Puri,. MohamiadAli.ClaircLisechaignlr. John D.C!.mcns.. & ,\vertino Brn€to 2005 Plnd€mic \cruvfs
(OlrK6 and O4:K68) ol
2/zr,?,,,//r,r AssocidGd trilh Dimhe! in
'/irrm
Moambiquesprerd ol lhe Ptudcnlic imo Lhe Africa Coniiient. .tt)u ul Ol
Clihical Mi.rabiolasr. vot 4:l No 6 p2559 2562.
200r. rvi.r,rntranln Awlitdia s Lobarutar!- Mahu"l
cdetal Mi.lohkl.sr. I'r ed. lI\e Mccraw Ilill Conpdieslrs.
Benson.
Bhuiyan, N. .ranuan
2002
pa ku.d.lttj.ts in Dhaka
'Prevalence olPendemic Ccnolype
Bansladeslr, and Sisnificanlcc
ih
ol rrtr&
ol lls
dlstribulion
acmss Dillerenl Sciorypci' J,lrnal ofclinicol Mictohiolog!. voln0,1'l28,1 286.
Brooks. C F BDtel. J.S. & Motsc. S.A 20A5 Miknhnnoxi Kulnklltun
(cd.l) Jarrtu : salenba Medika.
cabrea-Gmr'a. M.D, CarLos !a zquez. salinas. & lile lma Quin'uncs
Rmnrez. 1100,1. Serologic md Molecutar Chmd€nztion of l/ln/D
pa,zrd.ro&,cd Strlins Isolared li.n sea*arcr and rnh Prcducrs orlhe Culrof
Mex)... ,1p?lit.l A ti Enrir.nt otal MiLruhi.l.g. V6l 70 N. ll P 6401
Vibno pafthaenolrticus PADA IKAN BAL.EDANG{rfl chiurrs
ISOL.ASI DAN DETEKSI GEN
le.pfirflrs, Linn) DEI{GAN METODA POaYI,IFMSE CtfArilr
RFACI/OIJ (PCR)
!;(l{r
PSI
SrrR,IANl FARlllA\I
AS?J
DIAN
FAKULTAS FARMASI
Lfr\lVEr6ITASAND^I.AS
2011
ABSTRAK
Tclah dilakuk0n stuli gen rdR, 7dr, drr /r, prln hkrcri
'rrrn,
Nrahaenolrricrs dti sampel \kan baleda4 yans diperoleh dtui Mnaru Pddms
ftbap isoldi baltcri didalului densan n.nEinolulasi supel d l nr rrdnnr
isola\i selekll.5-.?, /.t pr, ,r,r, (SPll) dan Jnediutu o€rlumbLl'an selckal
'M
CIIROM,\sar Vibno. Hasil isoLasinrnunjukkrn bdwa sampel ikM brledma
ncnld\tl'^Ebaktcti I Panhae,,1:/tzr y g diiodai dcnsa.limbuiny! koloni
berw,ma ungtr Sclanjutnya dilakukan uji penesas dcngm ndal^ !ol\,,1ouv
(:hdin RLtLl n (PcR). ftsil ampliiikasi l,cll didclcksi dcnge loes
elekt Lresa gel dxn dan tiga pulLrh dchpan kultur yang diisolasi nehberikm
Isil dua puluhtujlh kulLu posiil gen rr l dm Lidak salwuo kulturyanc Frsirl
I,
Scbasian besar
rihyah di bumi dilelilingi olcl huho, sehiissa
nnl.,
hdiad malamn banyak lang bffasal dan laul. ltan. kerans,keraieaD. cumi dar
udrng meoprkrn bebefttpa
rr.l,d
rms
cukun diecmari k.rcia r.s.nya yang
le4r dan bcrai/i rinegi Hasil laut lang paling
ditonsl.*i
banyak
ol€h
naslaraldl .dalah ilan LaEm ikan paline nudaa ditcrnlch d,n nrenriliki ienls
yang berag.fr. seleni ikan baled^ng (TiLhhm$
l.ptw^ Lim)
ymg ncnjadi
sabn satu konuditas ckspor lndoncsia (.\drbrnvali. 2003) rkro hrle{lona son!{L
niudah dikenali dari benlukn)-a yans pmj.ng dan pipih.
lke
ini dikcnal dcnge
ilai layr (J,wa). n.l.l
berbrsai macm nma lokal raitu
de
b.ledans (radan3). rajuru Gurawesi seratan). ronu (Amb.n).
Balcdans mcrupakln
Ke
nrnln
nrensko.sumsi
ncnan ilu
lu|ao.l nrla\ neljadi
lnlh.me diu:z.t! y.ns
L€rjadin!! rv$dh
t.r.ltuan.4ri.ns
titc ik.n rrcddo, ylns
pada
(Palabulramtu).
rriur (Mrdun,)
kccil.
tuog lccil
pcrhadd
scrclan
didusa kareno infcksi li6r'o
as^l tahm 1950 di .repxna dxo sdn,cnjrk tll,u. 19!6
multri Fndenrik di neg.tu n€grtu Asia dan Amerika (WonS. 2001r II&a-Kudo.
20Ol). Nlcnurur Nair
./ ,r
pcnycbdd kasus pmdc
m
it
(200r). lndon.sia remlsuk salah slru Eilalah
yanr
d
R^rtct't t' pukthtnal),inu!
isebabkm olch bakl$i
^t
l,h balrcn (ham ncsrlil bcrbcntul blkng
bcngkok. .naerob fakultalil dan bdsifat halolilik.
(Wons?/,t,
1999,
t/ tunktmrlrtin:
Fng lrlt,gen
pnda nmusnr
w.ng,200:lj Nan,.r,1,2007:sujccwa.rdl.2000) lnicksi
dapar rorildi karcn, nMgkonstrmsi
'n,kdim
yrns rerkonrrnrin{si
parogen. nakanan yana diinAak setengal, ma!an!, atau m.krnan
lbh
brkrcrj
yrn!dikon$n$l
tatrF
dinrasal<
(l,ida..r,l..
1998i wong- 2003t Oknda ?r
L
purahacn.Uticu! meDpunyai
1997), densan
.Iur
scjaln yme dirimbulke adalah easho.nreriris yms silirlnla
Battcti
dl,
gc. st sint
yanu brn
Kcbradmn gcn ini ridak bcreilat parogen terhldlp monusia. Nrmun l/
poaht. olftitu\
sen
r/, }!ns
bcnmssunsiaRab rrhadap pnduksi rotsin beruFa Thun.nuhlt
,, yane nctunroduksi r.ksin I".Jll R.tdd
th'noiysin l:tFH) Ti.gkar riulen r lar,rdeud". tidak dipcngmhi olch
jtn\^h tt ptahd.nouti.rs tcrsbur. t.pi sdgxr lcrsmrury r Jr ioks,n Fn3
Ditld
Ht
nen9hxllkankan gen gen viflletr lrarg silahlx rd{)gen }ritu
obsih
(tDl]) dn
Een
dihasilld gemya (Wong, 2001r Sujee{a ./ d/.. 2009) Mekturh ie rrlosen t'
punthulnat!|i ! sbeai bcthrbug dcngd
yang nemberiku respon
le
radap
adanya produlsi gcn klh dan trh.
l-r.,,,/rrrs (Melim.2003)
Peneri(ian mcnsenxi addya gen vnulcn pada baklcri
rclah didcrcksi pada bcberapa ienh
zcracrr,:t,
udang kelong
rd/D,/ dimLlEnla
(/ezttu! inrtit
s),
l. t)aruha.nalJr.us
udans !trrih
(/,r'dcrr
wlsi (t:orhiculd nohkitlh.
Ptnn )
dm lmekitmg (F,,,,J ar.r) (Marlina, cr z/,200?; Mudlris,200t)i A/.renela,
2009).l'ada pcnclnid ini dilakukan del€ksi gcn
nri
dan s€n lnul€n prda ikm
h.lcdlns denslr menBgun.k.n tuetoda tCR. Deng adanya penelnid ini
diharapkd dapar dipcroleh dala mengenai keberadad gc.
bxlj.cti I' para hacno bt icus y lti8 lerdlpa I
pad a sam
pcl
ikd
trn dd sen vnulcn
ba
lcdanr
V. KISIMPI]LAN DAN SAR N
D[i lrsil penelilian dapar dianbil kesimpulan bahwa tada ssl)cl i*an
bdldddg (r /ct,/,J) yme dipcrolch dari Muaro Padans, sunratem Raral
terdapat bakreri
r p.tuhtln.lt1i. !
DaD
patuhden.\ricts yn1 didebksi membcrik iasil
ddal sarupu kultu yuB positilgen /.ll dan gen
dei l8
2T
Lultur
b.ltcri l:
kullur posilirscn tur?. dm
tl.
DGarankan kep&Ll pmehi selanjuhya uDtuk nielakukm idenlinkdsijenis
vibno hin spcni vihrh alsirovicus, vibria.f,lhjtit,s, dM
densan nctode PCR pada sanpel
I
lzrlrruJ.
lliht
thrtoa
RUJUlri_{N
Agus. S., rdillier, C, ,\min, S, Anh, K, SnDlos.. Hly l. Il.
Budinm, 8.. Soemar$no. I,,^bdrl, R., Kasira[.. l,ifa. I lrrky. H M
Mardiastuti, ll.W. Malhild.. L.. Miiam, T., Asnrom., Praliqi, S. Rc(rru. I S..
Robcn. U.. sddjiro., Suhano,.r., Suhar1o.. Suhrd. S., Suiudi., Susid!,,\., T.dia.
II., Miaasati, S.. ddr Usman. C.W.1q91. DLtu,'iiur t/ihohid.xi Kul.*1uan.
Edd rcvhi.Faloltas Kcdol1cmn. Unirc6il6 Indonesia : Jalatu.
Anbtrwati,D.v.S 2008.Sht.li Biolori lrprotluksi lkln luyu tsuptlu,niti
bithirtui.l.a) di reruirh lalohuhdnratu, Kahttldl.n Sukthun J6ro Bdtat.
(skril)si) Bosor: lnslilUl Pcnanian Bogor.
Azyenela, L.2049. Dctctt\i Ct, viruln Btkloi litui rorahulhrlrtitut
Dtri lanplp Plhsj (Catbic la ntaLkiaka. lrr"e) Dah Lah|kita"F 6a"nts akt)
D.4:an Mah.ta Prlyn.ta!.4:hdih R..tti.n lr(tt). (Skripsil I'admg i
Ansuaan,
M.. Marcelinolucas.. Jacquclinel-.Den. N.A.Dhuir.n..
X@ Yiwbe, Ashmtussafa.. Mdziasullara., A.Chowdhury. (i BJ*rishNi.
DovidA.Sach.. I-oEnzvonscidlcin., MahcshK,Puri,. MohamiadAli.ClaircLisechaignlr. John D.C!.mcns.. & ,\vertino Brn€to 2005 Plnd€mic \cruvfs
(OlrK6 and O4:K68) ol
2/zr,?,,,//r,r AssocidGd trilh Dimhe! in
'/irrm
Moambiquesprerd ol lhe Ptudcnlic imo Lhe Africa Coniiient. .tt)u ul Ol
Clihical Mi.rabiolasr. vot 4:l No 6 p2559 2562.
200r. rvi.r,rntranln Awlitdia s Lobarutar!- Mahu"l
cdetal Mi.lohkl.sr. I'r ed. lI\e Mccraw Ilill Conpdieslrs.
Benson.
Bhuiyan, N. .ranuan
2002
pa ku.d.lttj.ts in Dhaka
'Prevalence olPendemic Ccnolype
Bansladeslr, and Sisnificanlcc
ih
ol rrtr&
ol lls
dlstribulion
acmss Dillerenl Sciorypci' J,lrnal ofclinicol Mictohiolog!. voln0,1'l28,1 286.
Brooks. C F BDtel. J.S. & Motsc. S.A 20A5 Miknhnnoxi Kulnklltun
(cd.l) Jarrtu : salenba Medika.
cabrea-Gmr'a. M.D, CarLos !a zquez. salinas. & lile lma Quin'uncs
Rmnrez. 1100,1. Serologic md Molecutar Chmd€nztion of l/ln/D
pa,zrd.ro&,cd Strlins Isolared li.n sea*arcr and rnh Prcducrs orlhe Culrof
Mex)... ,1p?lit.l A ti Enrir.nt otal MiLruhi.l.g. V6l 70 N. ll P 6401