Penggunaan Catatan Test Day untuk Mengevaluasi Mutu Genetik Sapi Perah
PENGGUNAAN CATATAN TEST DAY UNTUK
MENGEVALUASI MLTTU GENETIK SAP1 PERAH
OLEH :
HEN1 INDRIJANI
PROGRAM PASCASARJANA
INSTITUT PERTANIAN BOGOR
2001
ABSTRAK
HEM INDRIJANI. Penggunaan Catatan Test Day untuk Mengevaluasi Mutu
Genetik Sapi Perah. Dibimbing oleh RONNY RACHMAN NOOR dan
CHALID TALIB.
Catatan Test Day telah digunakan sebagai kriteria seleksi untuk
mengevaluasi mutu genetik sapi perah karena penggunaan catatan 305 hari
dianggap tidak fleksibel. Penelitian ini bertujuan untuk mendapatkan model yang
tepat dengan memanfaatkan catatan test day untuk mengevaluasi mutu genetik
sapi perah.
Data produksi susu berasal dari sapi Fries Holland periode laktasi pertama
dan kedua dari tahun 1989-2000 di PT Taurus Dairy Farm Sukabumi. Catatan test
day sebanyak 7503 buah dan 769 catatan produksi 305 hari yang berasal dari 456
ekor sapi betina, 40 ekor pejantan dan 342 ekor induk. Model-model yang
digunakan adalah : (1) Dua kumulatif model atau Cumulative Model (CM) untuk
menganalisis catatan 305 hari, dan (2) Tiga model regresi atau Fixed Regression
Test Day Model (FRTDM) dan dua model Multiple Trait (MMT) untuk
menganalisis catatan test /lay. Ketujuh model ini melibatkan pemisahan TahunMusim dan Tahun-Musim-Laktasi sebagai efek tetap. Varian komponen
diestimasi dengan menggunakan Animal Model dengan analisis REML dan Nilai
Pemuliaan dengan BLUP.
Hasil analisis menunjukkan bahwa nilai heritabilitas untuk CM : model 1
adalah sebesar 0,308 dan model 2 adalah sebesar 0,3 14; FRTDM : model 3 adalah
sebesar 0,140, model 4 adalah sebesar 0,156, dan model 5 adalah sebesar 0,095;
dan MMT . model 6 adalah sebesar 0,087-0,261 dan model 7 adalah sebesar
0,053-0,358. Korelasi Spearman nilai pemuliaan antara CM, FRTDM, dan MMT
untuk seluruh ternak adalah 0,87-0,99 dan untuk pejantan adalah 0,83-0,98. Dari
hasil analisis dapat disimpulkan bahwa FRTDM adalah model yang fleksibel,
akurat dan efisien dalam mengevaluasi mutu genetik sapi perah.
SURATPERNYATAAN
Dengan ini saya menyatakan bahwa tesis yang berjudul :
PENGGUNAAN CATATAN TEST DA Y UNTUK
MENGEVALUASI MUTU GENETIK SAP1 PERAH
Adalah benar merupakan hasil karya saya sendiri dan belum pernah
dipublikasikan. Semua sumber data dan informasi yang digunakan telah
dinyatakan secara jelas dan dapat diperiksa kebenarannya.
Bogor, Agustus 2001
HEN1 INDRIJANI
Nrp. 99092lPTK
PENGGUNAAN CATATAN TEST DAY UNTUK
MENGEVALUASI MUTU GENETIK SAP1 PERAH
HEN1 INDRIJAN1
Tesis
sebagai salah satu syarat untuk memperoleh gelar
Magister Sains pada
Program Studi Ilmu Ternak
PROGRAM PASCASARJANA
INSTITUT PERTANIAN BOGOR
2001
Judul Tesis
: Penggunaan Catatan Test Day untuk Mengevaluasi
Nama
: Heni Indrijani
: 99092
: Ilmu Ternak
Mutu Genetik Sapi Perah
NRP
Program Studi
Menyetujui,
1. Komisi Pembimbing
---7
/
Dr. Ir Chalid Talib. MS.
Anggota
Ketua
Mengetahui,
2. Ketua Program Studi Ilmu Ternak
Tanggal Lulus : 27 Agustus 2001
3. Direktur Program Pascasajana
RIWAYAT HIDUP
Penulis dilahirkan di Bandung pada tanggal 30 Januari 1970 sebagai anak
ke sernbilan dari pasangan Soegito dan T. Djoewitasari. Pendidikan SDN Ciujung
I11 lulus pada tahun 1982, SMPN 14 lulus pada tahun 1985, dan SMAN 10 lulus
pada tahun 1988.
Pendidikan sarjana strata I ditempuh di Jurusan Produksi Fakultas
Peternakan, Universitas Padjadjaran, lulus pada tahun 1994. Pada bulan
September tahun 1999, penulis diterima di Program Studi Ilmu Ternak pada
Program Pascasajana IPB dan menamatkannya pada bulan Agustus tahun 2001.
Beasiswa pendidikan pascasajana (BPPS) diperoleh dari Direktorat Jenderal
Pendidikan Tinggi Republik Indonesia.
Penuiis mulai bekeja sebagai Tenaga Pengajar di Fakultas Peternakan
Universitas Padjadjaran sejak bulan Maret tahun 1997. Laboratorium yang
menjadi tanggung jawab penulis adalah Laboratorium Pemuliaan Ternak dan
Biometrika.
Selama mengikuti program S2 karya ilrniah bejudul Penggunaan Catatan
Test Day untuk Mengevaluasi Mutu Genetik Sapi Perah telah disajikan pada
Seminar Nasional dan Pameran Teknologi Peternakan dan Veteriner 2001 di
Cimanggu-Bogor.
PRAKATA
Puji dan syukur penulis panjatkan kepada Allah SWT atas segala karuniaNya sehingga karya ilmiah ini berhasil diselesaikan. Tema yang dipilih dalam
penelitian yang dilaksanakan sejak bulan Maret 2001 ini adalah p e d a a t a n test
day, dengan judul Penggunaan Catatan Test Day untuk Mengevaluasi Mutu
Genetik Sapi Perah.
Terima kasih penulis ucapkan kepada Bapak Dr. Ir. Ronny Rachman Noor,
M.Rur.Sc dan Bapak Dr. Ir. Chalid Talib, MS. sebagai pembimbing, serta Bapak
Ir. Catur Nugroho sebagai manager peternakan PT. Taurus Dairy Farm yang telah
memberikan izin kepada penulis untuk menggunakan data milik perusahaan. Pada
kesempatan ini penulis ingin mengucapkan terima kasih kepada Bapak Ir. Asep
Anang, M.Phill., Ph.D. atas segala bantuannya sehubungan dengan programprogram yang penulis gunakan untuk menganalisis data. Di samping itu, penulis
sampaikan terima kasih juga kepada Ir. Harry Triely Uhi, M.Si., Ir. Eko
Handiwirawan dan Arifah Hesti Sukmasari, S.Pt. atas kerjasama dan bantuannya.
Akhirnya penulis mengucapkan terima kasih kepada orang tuaku, Bapak
(alm), Mamah, Papap, Mama, Suami, dan anakku tersayang Adinda Kinasih
Joffana, atas segala doa, cinta, dan kasih sayangnya selama penulis menempuh
studi di Program Pascasarjana IPB.
Semoga karya ilmiah ini bermanfaat.
Bandung, Agustus 200 1
Hen; Irldrijarzi
DAFTAR IS1
Halaman
DAFTAR TABEL .................................................................................
vi
DAFTAR GAMBAR .............................................................................
vii
DAFTAR LAMPIRAN ..........................................................................
viii
PENDAHULUAN ..................................................................................
Latar Belakang ................................................................................
..
Tujuan Penel~tlan.............................................................................
Manfaat Penelitian ...........................................................................
..
Hipotesis Penelltian...........................................................................
TINJAUAN PUSTAKA ........................................................................
Faktor-faktor yang Berpengaruh terhadap Produksi Susu .................
Musim. Tahun. dan Peternakan ........................................................
Laktasi Sapi Perah ...........................................................................
Pencatatan Produksi Susu ...............................................................
Model 305 hari ...............................................................................
Model Test Day ................................................................................
Pemanfaatan Test Day Model ..........................................................
Model Regresi Tetap ......................................................................
Penetapan Kurva Linier sebagai Kovariat Tetap ...............................
Ripitabilitas versus Model Mzdtiple- Trait ........................................
hlodel Multiyle- Trait ......................................................................
Heritabilitas Produksi Susu ..............................................................
. .
Nlla~Pemuliaan ...............................................................................
Pendugaan Nilai Pemuliaan ..............................................................
MATERI DAN METODE ....................................................................
Waktu dan Tempat Penelitian ...........................................................
..
Materi Penel~t~an
.............................................................................
Metode Penelitian ............................................................................
..
Analis~sData ....................................................................................
24
24
24
27
29
HASIL DAN PEMBAHASAN ..............................................................
. .
Desknpsi Data .................................................................................
Analisis Efek Tetap ..........................................................................
Analisis Kovariabel dan Kurva Laktasi .............................................
,
Dugaan Ragarn Genetik dan Ragarn Lingkungan ..............................
Nilai Pemuliaan ................................................................................
Korelasi Antarnilai Pemuliaan ..........................................................
35
35
37
42
KESIMPULAN DAN SARAN .............................................................
60
DAFTAR PUSTAKA .............................................................................
61
LAMPIRAN ...........................................................................................
65
44
51
52
DAFTAR TABEL
Halaman
1 Rataan produksi susu pada musim hujan dan musim kemarau
di tiga petemakan di Malang, Jawa Timur ...........................................
8
Nilai heritabilitas dari beberapa hasil penelitian di Indonesia ..............
19
3 Nilai heritabilitas test dcry dan produksi 305 hari dari beberapa
hasil penelitian di luar negeri ...................................................... .........
20
4
Nilai heritabilitas hasil dari Fixed Regression Model ................... ........
21
5
Data produksi susu test day dan produksi susu 305 hari
per ekor pada periode laktasi pertama (dalam liter) .............................
36
Data produksi susu test aby dan produksi susu 305 hari
per ekor pada periode laktasi kedua (dalam liter) ............... .... ....... .. .. ..
37
7 Pengaruh musim terhadap produksi susu test day dan produksi
susu 305 hari (dalam liter) ..................................................................
39
Pengaruh tahun terhadap produksi susu test day dan produksi
susu 305 hari (dalam liter) ...................................................................
39
Pengaruh laktasi terhadap produksi susu test dzy dan produksi
susu 305 hari (dalam liter) ...................................................................
40
2
6
8
9
10 Nilai estimasi koefisien regresi
...... . ....... ..................... ............ . ........... .
42
1 1 Uji keakuratan persaman regresi Ali dan Schaeffer ............................
42
12 Dugaan ragam genetik, ragam lingkungan dan nilai
heritabilitas dari CM Model 1 dan 2 ...................................................
44
13 Dugaan ragam genetik, ragam lingkungan, ragam lingkungan
permanen, nilai heritabilitas dan proporsi dari ragam lingkungan
permanen terhadap fenotipik (PE) dari FRTDM Model 3, 4 dan 5 ....
46
*14 Korelasi Spearman nilai pemuliaan antarmodel ..................................
57
DAFTAR GAMBAR
Halaman
1 Kurva produksi susu test day laktasi I dan laktasi I1
...........................
2 Pola perubahan ragam genetik dan lingkungan
dari Model 6 dan 7 .............................................................................
43
48
3
Pola perubahan dugaan nilai heritabilitas dari Model 6 dan 7 ..............
49
4
Korelasi Spearman antarnilai pemuliaan catatan test day dengan
nilai pemuliaan total dari MMT Model 6 dan CM Model 1 ..................
54
Korelasi Spearman antarnilai pemuliaan catatan test day dengan
nilai pemuliaan total dari MMT Model 7 dan CM Model 2 ................
55
5
MENGEVALUASI MLTTU GENETIK SAP1 PERAH
OLEH :
HEN1 INDRIJANI
PROGRAM PASCASARJANA
INSTITUT PERTANIAN BOGOR
2001
ABSTRAK
HEM INDRIJANI. Penggunaan Catatan Test Day untuk Mengevaluasi Mutu
Genetik Sapi Perah. Dibimbing oleh RONNY RACHMAN NOOR dan
CHALID TALIB.
Catatan Test Day telah digunakan sebagai kriteria seleksi untuk
mengevaluasi mutu genetik sapi perah karena penggunaan catatan 305 hari
dianggap tidak fleksibel. Penelitian ini bertujuan untuk mendapatkan model yang
tepat dengan memanfaatkan catatan test day untuk mengevaluasi mutu genetik
sapi perah.
Data produksi susu berasal dari sapi Fries Holland periode laktasi pertama
dan kedua dari tahun 1989-2000 di PT Taurus Dairy Farm Sukabumi. Catatan test
day sebanyak 7503 buah dan 769 catatan produksi 305 hari yang berasal dari 456
ekor sapi betina, 40 ekor pejantan dan 342 ekor induk. Model-model yang
digunakan adalah : (1) Dua kumulatif model atau Cumulative Model (CM) untuk
menganalisis catatan 305 hari, dan (2) Tiga model regresi atau Fixed Regression
Test Day Model (FRTDM) dan dua model Multiple Trait (MMT) untuk
menganalisis catatan test /lay. Ketujuh model ini melibatkan pemisahan TahunMusim dan Tahun-Musim-Laktasi sebagai efek tetap. Varian komponen
diestimasi dengan menggunakan Animal Model dengan analisis REML dan Nilai
Pemuliaan dengan BLUP.
Hasil analisis menunjukkan bahwa nilai heritabilitas untuk CM : model 1
adalah sebesar 0,308 dan model 2 adalah sebesar 0,3 14; FRTDM : model 3 adalah
sebesar 0,140, model 4 adalah sebesar 0,156, dan model 5 adalah sebesar 0,095;
dan MMT . model 6 adalah sebesar 0,087-0,261 dan model 7 adalah sebesar
0,053-0,358. Korelasi Spearman nilai pemuliaan antara CM, FRTDM, dan MMT
untuk seluruh ternak adalah 0,87-0,99 dan untuk pejantan adalah 0,83-0,98. Dari
hasil analisis dapat disimpulkan bahwa FRTDM adalah model yang fleksibel,
akurat dan efisien dalam mengevaluasi mutu genetik sapi perah.
SURATPERNYATAAN
Dengan ini saya menyatakan bahwa tesis yang berjudul :
PENGGUNAAN CATATAN TEST DA Y UNTUK
MENGEVALUASI MUTU GENETIK SAP1 PERAH
Adalah benar merupakan hasil karya saya sendiri dan belum pernah
dipublikasikan. Semua sumber data dan informasi yang digunakan telah
dinyatakan secara jelas dan dapat diperiksa kebenarannya.
Bogor, Agustus 2001
HEN1 INDRIJANI
Nrp. 99092lPTK
PENGGUNAAN CATATAN TEST DAY UNTUK
MENGEVALUASI MUTU GENETIK SAP1 PERAH
HEN1 INDRIJAN1
Tesis
sebagai salah satu syarat untuk memperoleh gelar
Magister Sains pada
Program Studi Ilmu Ternak
PROGRAM PASCASARJANA
INSTITUT PERTANIAN BOGOR
2001
Judul Tesis
: Penggunaan Catatan Test Day untuk Mengevaluasi
Nama
: Heni Indrijani
: 99092
: Ilmu Ternak
Mutu Genetik Sapi Perah
NRP
Program Studi
Menyetujui,
1. Komisi Pembimbing
---7
/
Dr. Ir Chalid Talib. MS.
Anggota
Ketua
Mengetahui,
2. Ketua Program Studi Ilmu Ternak
Tanggal Lulus : 27 Agustus 2001
3. Direktur Program Pascasajana
RIWAYAT HIDUP
Penulis dilahirkan di Bandung pada tanggal 30 Januari 1970 sebagai anak
ke sernbilan dari pasangan Soegito dan T. Djoewitasari. Pendidikan SDN Ciujung
I11 lulus pada tahun 1982, SMPN 14 lulus pada tahun 1985, dan SMAN 10 lulus
pada tahun 1988.
Pendidikan sarjana strata I ditempuh di Jurusan Produksi Fakultas
Peternakan, Universitas Padjadjaran, lulus pada tahun 1994. Pada bulan
September tahun 1999, penulis diterima di Program Studi Ilmu Ternak pada
Program Pascasajana IPB dan menamatkannya pada bulan Agustus tahun 2001.
Beasiswa pendidikan pascasajana (BPPS) diperoleh dari Direktorat Jenderal
Pendidikan Tinggi Republik Indonesia.
Penuiis mulai bekeja sebagai Tenaga Pengajar di Fakultas Peternakan
Universitas Padjadjaran sejak bulan Maret tahun 1997. Laboratorium yang
menjadi tanggung jawab penulis adalah Laboratorium Pemuliaan Ternak dan
Biometrika.
Selama mengikuti program S2 karya ilrniah bejudul Penggunaan Catatan
Test Day untuk Mengevaluasi Mutu Genetik Sapi Perah telah disajikan pada
Seminar Nasional dan Pameran Teknologi Peternakan dan Veteriner 2001 di
Cimanggu-Bogor.
PRAKATA
Puji dan syukur penulis panjatkan kepada Allah SWT atas segala karuniaNya sehingga karya ilmiah ini berhasil diselesaikan. Tema yang dipilih dalam
penelitian yang dilaksanakan sejak bulan Maret 2001 ini adalah p e d a a t a n test
day, dengan judul Penggunaan Catatan Test Day untuk Mengevaluasi Mutu
Genetik Sapi Perah.
Terima kasih penulis ucapkan kepada Bapak Dr. Ir. Ronny Rachman Noor,
M.Rur.Sc dan Bapak Dr. Ir. Chalid Talib, MS. sebagai pembimbing, serta Bapak
Ir. Catur Nugroho sebagai manager peternakan PT. Taurus Dairy Farm yang telah
memberikan izin kepada penulis untuk menggunakan data milik perusahaan. Pada
kesempatan ini penulis ingin mengucapkan terima kasih kepada Bapak Ir. Asep
Anang, M.Phill., Ph.D. atas segala bantuannya sehubungan dengan programprogram yang penulis gunakan untuk menganalisis data. Di samping itu, penulis
sampaikan terima kasih juga kepada Ir. Harry Triely Uhi, M.Si., Ir. Eko
Handiwirawan dan Arifah Hesti Sukmasari, S.Pt. atas kerjasama dan bantuannya.
Akhirnya penulis mengucapkan terima kasih kepada orang tuaku, Bapak
(alm), Mamah, Papap, Mama, Suami, dan anakku tersayang Adinda Kinasih
Joffana, atas segala doa, cinta, dan kasih sayangnya selama penulis menempuh
studi di Program Pascasarjana IPB.
Semoga karya ilmiah ini bermanfaat.
Bandung, Agustus 200 1
Hen; Irldrijarzi
DAFTAR IS1
Halaman
DAFTAR TABEL .................................................................................
vi
DAFTAR GAMBAR .............................................................................
vii
DAFTAR LAMPIRAN ..........................................................................
viii
PENDAHULUAN ..................................................................................
Latar Belakang ................................................................................
..
Tujuan Penel~tlan.............................................................................
Manfaat Penelitian ...........................................................................
..
Hipotesis Penelltian...........................................................................
TINJAUAN PUSTAKA ........................................................................
Faktor-faktor yang Berpengaruh terhadap Produksi Susu .................
Musim. Tahun. dan Peternakan ........................................................
Laktasi Sapi Perah ...........................................................................
Pencatatan Produksi Susu ...............................................................
Model 305 hari ...............................................................................
Model Test Day ................................................................................
Pemanfaatan Test Day Model ..........................................................
Model Regresi Tetap ......................................................................
Penetapan Kurva Linier sebagai Kovariat Tetap ...............................
Ripitabilitas versus Model Mzdtiple- Trait ........................................
hlodel Multiyle- Trait ......................................................................
Heritabilitas Produksi Susu ..............................................................
. .
Nlla~Pemuliaan ...............................................................................
Pendugaan Nilai Pemuliaan ..............................................................
MATERI DAN METODE ....................................................................
Waktu dan Tempat Penelitian ...........................................................
..
Materi Penel~t~an
.............................................................................
Metode Penelitian ............................................................................
..
Analis~sData ....................................................................................
24
24
24
27
29
HASIL DAN PEMBAHASAN ..............................................................
. .
Desknpsi Data .................................................................................
Analisis Efek Tetap ..........................................................................
Analisis Kovariabel dan Kurva Laktasi .............................................
,
Dugaan Ragarn Genetik dan Ragarn Lingkungan ..............................
Nilai Pemuliaan ................................................................................
Korelasi Antarnilai Pemuliaan ..........................................................
35
35
37
42
KESIMPULAN DAN SARAN .............................................................
60
DAFTAR PUSTAKA .............................................................................
61
LAMPIRAN ...........................................................................................
65
44
51
52
DAFTAR TABEL
Halaman
1 Rataan produksi susu pada musim hujan dan musim kemarau
di tiga petemakan di Malang, Jawa Timur ...........................................
8
Nilai heritabilitas dari beberapa hasil penelitian di Indonesia ..............
19
3 Nilai heritabilitas test dcry dan produksi 305 hari dari beberapa
hasil penelitian di luar negeri ...................................................... .........
20
4
Nilai heritabilitas hasil dari Fixed Regression Model ................... ........
21
5
Data produksi susu test day dan produksi susu 305 hari
per ekor pada periode laktasi pertama (dalam liter) .............................
36
Data produksi susu test aby dan produksi susu 305 hari
per ekor pada periode laktasi kedua (dalam liter) ............... .... ....... .. .. ..
37
7 Pengaruh musim terhadap produksi susu test day dan produksi
susu 305 hari (dalam liter) ..................................................................
39
Pengaruh tahun terhadap produksi susu test day dan produksi
susu 305 hari (dalam liter) ...................................................................
39
Pengaruh laktasi terhadap produksi susu test dzy dan produksi
susu 305 hari (dalam liter) ...................................................................
40
2
6
8
9
10 Nilai estimasi koefisien regresi
...... . ....... ..................... ............ . ........... .
42
1 1 Uji keakuratan persaman regresi Ali dan Schaeffer ............................
42
12 Dugaan ragam genetik, ragam lingkungan dan nilai
heritabilitas dari CM Model 1 dan 2 ...................................................
44
13 Dugaan ragam genetik, ragam lingkungan, ragam lingkungan
permanen, nilai heritabilitas dan proporsi dari ragam lingkungan
permanen terhadap fenotipik (PE) dari FRTDM Model 3, 4 dan 5 ....
46
*14 Korelasi Spearman nilai pemuliaan antarmodel ..................................
57
DAFTAR GAMBAR
Halaman
1 Kurva produksi susu test day laktasi I dan laktasi I1
...........................
2 Pola perubahan ragam genetik dan lingkungan
dari Model 6 dan 7 .............................................................................
43
48
3
Pola perubahan dugaan nilai heritabilitas dari Model 6 dan 7 ..............
49
4
Korelasi Spearman antarnilai pemuliaan catatan test day dengan
nilai pemuliaan total dari MMT Model 6 dan CM Model 1 ..................
54
Korelasi Spearman antarnilai pemuliaan catatan test day dengan
nilai pemuliaan total dari MMT Model 7 dan CM Model 2 ................
55
5