B1J009040 5 1.
RINGKASAN
Siluriformes merupakan salah satu ordo ikan yang sebagian besar hidup di
perairan tawar. Hampir semua ikan ordo Siluriformes memiliki sungut di sekeliling
mulutnya. Siluriformes adalah salah satu ordo pada Classis Pisces yang mempunyai
keragaman hayati dan nilai ekonomis tinggi. Tujuan penelitian ini adalah untuk
mengetahui spesies ikan Ordo Siluriformes yang tertangkap dari Sungai Cijalu dan
hubungan kekerabatan filogenetiknya. Materi penelitian meliputi beberapa spesies ikan
anggota Ordo Siluriformes yang merupakan hasil koleksi Dr. Agus Nuryanto yang
disimpan di Laboratorium Taksonomi Hewan Fakultas Biologi Universitas Jenderal
Soedirman dan ditangkap dari Sungai Cijalu Kecamatan Majenang Kabupaten Cilacap.
Metode yang digunakan adalah survei, dengan teknik pengambilan sampel yaitu
purposive sampling. Cara kerja penelitian yaitu memilih ikan dengan ukuran > 8 cm dari
Ordo Siluriformes yang telah diawetkan di Laboratorium Taksonomi Hewan Fakultas
Biologi Universitas Jenderal Soedirman, kemudian diidentifikasi dan dideterminasi.
Karakter morfologi yang diamati meliputi sirip, bentuk garis rusuk, bentuk sirip ekor, tipe
sisik, letak mulut, panjang tubuh total, panjang tubuh standar, tinggi badan, tinggi
batang ekor, jumlah spesies, jumlah individu per spesies, dan jenis ikan. Data morfologi
ikan dianalisis secara deskriptif untuk mengetahui deskripsi lengkap masing-masing
spesies. Analisis hubungan kekerabatan dilakukan menggunakan metode kladistik
dengan algoritma maximum parsimony dan melalui software computer yaitu program
PAUP (Phylogenetic Analysis Using Parsimony) versi 4.0.b agar terbentuk pohon evolusi
atau kladogram dan hasilnya disajikan dalam bentuk kladogram. Hasil pengambilan
sampel diperoleh 6 spesies ikan, yaitu Pterygoplichthys pardalis, Hemibagrus nemurus,
Glyptothorax platypogon, Channa striata, Mystus gulio, dan Mystus micracanthus. Hasil
analisis menunjukkan bahwa Ordo Siluriformes bersifat monofiletik. Pohon filogenetik
(kladogram) menunjukkan Mystus micracanthus merupakan kelompok monofiletik
viii
bersama Mystus gulio (sebagai sister taxa) dengan nilai bootstrap 100%, nilai indeks
konsistensi (CI) sebesar 0,753 dan nilai indeks retensi (RI) sebesar 0,5714. Penelitian ini
diharapkan dapat memberikan informasi tentang jumlah spesies ikan dari Ordo
Siluriformes yang tertangkap di Sungai Cijalu Kecamatan Majenang Kabupaten Cilacap
serta hubungan filogenetik berdasarkan morfologinya.
Kata Kunci : kladogram, filogenetik, Siluriformes, Sungai Cijalu
ix
SUMMARY
Siluriformes is one order of fish that live in freshwater. Almost all the fish of the
order Siluriformes has barbells around the mouth. Order Siluriformes is one of the Classis
Pisces and biodiversity that have high economic value. Purpose of this study is determine
the number of fish species on Siluriformes caught in the Cijalu River and their phylogenetic
relationships based on their morphological characters. The materials used in this study
were fish species that belong to order Siluriformes and out-group species from the order of
Cypriniformes. The specimens are collection of the Laboratory of Animal Taxonomy Faculty
of Biology, Jenderal Soedirman University. A survey method was used by applying purposive
sampling technique. How the research is to choose fish with size > 8 cm of the order
Siluriformes which has been preserved in the Laboratory of Animal Taxonomy Faculty of
Biology, Jenderal Soedirman University, then include species identification and
determination morphological character measurement and phylogenetic relationship
analysis. The morphological character is fin, linea lateralis, caudal fin, scales type, mouth
position, total length, standard length, body height, caudal peduncle, number of species,
number of individuals per species, and species of fish were observed to variables. The data
were analyzed descriptively by observing similarities and differences in their morphology.
Phylogenetic relationships was estimated using cladistic analysis based on maximum
parsimony algorithm as implemented in PAUP (Phylogenetic Analysis Using parsimony)
software version 4.0.b. Phylogenetic tree was presented in a cladogram. Identification and
determination process resulted on 6 fish species, namely Pterygoplichthys pardalis,
Hemibagrus nemurus, Glyptothorax platypogon, Channa striata, Mystus gulio, and Mystus
micracanthus. The analysis showed that order Siluriformes formed monophyletic group on
the tree. Phylogenetic tree also shows that Mystus micracanthus formed a monophyletic
group with Mystus gulio (as sister taxa) with a bootstrap value = 100%, the value of
consistency index (CI) = 0.753 and a retention index values (RI) = 0.5714. This research is
expected to provide information about the number of species of fish of the order
Siluriformes caught in the Cijalu River and their phylogenetic relationships based on
morphological.
Keywords : cladogram, phylogenetic, Siluriformes, Cijalu River
x
Siluriformes merupakan salah satu ordo ikan yang sebagian besar hidup di
perairan tawar. Hampir semua ikan ordo Siluriformes memiliki sungut di sekeliling
mulutnya. Siluriformes adalah salah satu ordo pada Classis Pisces yang mempunyai
keragaman hayati dan nilai ekonomis tinggi. Tujuan penelitian ini adalah untuk
mengetahui spesies ikan Ordo Siluriformes yang tertangkap dari Sungai Cijalu dan
hubungan kekerabatan filogenetiknya. Materi penelitian meliputi beberapa spesies ikan
anggota Ordo Siluriformes yang merupakan hasil koleksi Dr. Agus Nuryanto yang
disimpan di Laboratorium Taksonomi Hewan Fakultas Biologi Universitas Jenderal
Soedirman dan ditangkap dari Sungai Cijalu Kecamatan Majenang Kabupaten Cilacap.
Metode yang digunakan adalah survei, dengan teknik pengambilan sampel yaitu
purposive sampling. Cara kerja penelitian yaitu memilih ikan dengan ukuran > 8 cm dari
Ordo Siluriformes yang telah diawetkan di Laboratorium Taksonomi Hewan Fakultas
Biologi Universitas Jenderal Soedirman, kemudian diidentifikasi dan dideterminasi.
Karakter morfologi yang diamati meliputi sirip, bentuk garis rusuk, bentuk sirip ekor, tipe
sisik, letak mulut, panjang tubuh total, panjang tubuh standar, tinggi badan, tinggi
batang ekor, jumlah spesies, jumlah individu per spesies, dan jenis ikan. Data morfologi
ikan dianalisis secara deskriptif untuk mengetahui deskripsi lengkap masing-masing
spesies. Analisis hubungan kekerabatan dilakukan menggunakan metode kladistik
dengan algoritma maximum parsimony dan melalui software computer yaitu program
PAUP (Phylogenetic Analysis Using Parsimony) versi 4.0.b agar terbentuk pohon evolusi
atau kladogram dan hasilnya disajikan dalam bentuk kladogram. Hasil pengambilan
sampel diperoleh 6 spesies ikan, yaitu Pterygoplichthys pardalis, Hemibagrus nemurus,
Glyptothorax platypogon, Channa striata, Mystus gulio, dan Mystus micracanthus. Hasil
analisis menunjukkan bahwa Ordo Siluriformes bersifat monofiletik. Pohon filogenetik
(kladogram) menunjukkan Mystus micracanthus merupakan kelompok monofiletik
viii
bersama Mystus gulio (sebagai sister taxa) dengan nilai bootstrap 100%, nilai indeks
konsistensi (CI) sebesar 0,753 dan nilai indeks retensi (RI) sebesar 0,5714. Penelitian ini
diharapkan dapat memberikan informasi tentang jumlah spesies ikan dari Ordo
Siluriformes yang tertangkap di Sungai Cijalu Kecamatan Majenang Kabupaten Cilacap
serta hubungan filogenetik berdasarkan morfologinya.
Kata Kunci : kladogram, filogenetik, Siluriformes, Sungai Cijalu
ix
SUMMARY
Siluriformes is one order of fish that live in freshwater. Almost all the fish of the
order Siluriformes has barbells around the mouth. Order Siluriformes is one of the Classis
Pisces and biodiversity that have high economic value. Purpose of this study is determine
the number of fish species on Siluriformes caught in the Cijalu River and their phylogenetic
relationships based on their morphological characters. The materials used in this study
were fish species that belong to order Siluriformes and out-group species from the order of
Cypriniformes. The specimens are collection of the Laboratory of Animal Taxonomy Faculty
of Biology, Jenderal Soedirman University. A survey method was used by applying purposive
sampling technique. How the research is to choose fish with size > 8 cm of the order
Siluriformes which has been preserved in the Laboratory of Animal Taxonomy Faculty of
Biology, Jenderal Soedirman University, then include species identification and
determination morphological character measurement and phylogenetic relationship
analysis. The morphological character is fin, linea lateralis, caudal fin, scales type, mouth
position, total length, standard length, body height, caudal peduncle, number of species,
number of individuals per species, and species of fish were observed to variables. The data
were analyzed descriptively by observing similarities and differences in their morphology.
Phylogenetic relationships was estimated using cladistic analysis based on maximum
parsimony algorithm as implemented in PAUP (Phylogenetic Analysis Using parsimony)
software version 4.0.b. Phylogenetic tree was presented in a cladogram. Identification and
determination process resulted on 6 fish species, namely Pterygoplichthys pardalis,
Hemibagrus nemurus, Glyptothorax platypogon, Channa striata, Mystus gulio, and Mystus
micracanthus. The analysis showed that order Siluriformes formed monophyletic group on
the tree. Phylogenetic tree also shows that Mystus micracanthus formed a monophyletic
group with Mystus gulio (as sister taxa) with a bootstrap value = 100%, the value of
consistency index (CI) = 0.753 and a retention index values (RI) = 0.5714. This research is
expected to provide information about the number of species of fish of the order
Siluriformes caught in the Cijalu River and their phylogenetic relationships based on
morphological.
Keywords : cladogram, phylogenetic, Siluriformes, Cijalu River
x