IDENTIFIKASI FRAGMEN-FRAGMEN RAPD SPESIFIK TERKAIT TOLERANSI PADI (Oryza sativa L.) TERHADAP GULMA Echinochloa cruss-galli.

ID-ENTIFIKASI I'RACMEN-FRAGMEN RAPI' SPf,
SIFIK
TERKATT TOLE RAAS I PAfi \o,yz, saliw L) TERBAD,AP
cULNt t\ E.h,nochtoa qr6s4alti

OLEg
SI'RYA EKO PI'TRA
05112003

FAI'I'LTAS PERTA]\IAN
I'NIWRSITAS ANDAINS
20lo

TDI,NTTFII(A.SI FRAGMEN.FRA(]MEN RAPD

SItrSIfIK

'ITRXAIT TOLERANSI PADI (O'Jza rztya l--) TERHADAP

CUL\IA


r..hino, hloo .tuss

to

t

ABSTRAK
P€nelnirn tcnthg idcnlinkasi fmshen lr,gmen tuld snesifik rcrkait
fne.msi lldi{arr}uz.\zh? L.) t..hdap gulm Frhinochlor ctr$ g.llil, 1c1.\
dihksdatd di l-abontoriuD Rioleknolo8i d Penulim ld.ha. ruruen
BuJidala Pcrbriar lalulras lendn r Uiv$sitas Andala Padlns tenelnian di

nrlai dei bulm M&ct sdrpai Oktoler 2009 dens rujr Mlul
m.nf;indenrilikasi liagnen liagben lrne didug! be*ailan dcngm rolc.ansr padi
La.rnap su\n1a Fahinochlod ur$ s,l/i dalan jral sifal alelopari F.di lerhadap

Penclnid l.rd dri cmpat lal3p yaknj holrsi DNA padj {iaD /,.rr,,.r/o,
.r/.r]a,//t l. dcnge henggDalm prot,kol Sashai Md@l (1984). $lcksj

F'ner llAPD lda p@l DNA untul Dencari primer ydgncngha\ilkr raslen

lcbih dari 5, seleksi priDer pad, p,o/ DNA rolerm dd peka umuk mencri nrimcr
]ana ncnEhasilk n€snen polnnorfik Dada rral DNA rolcran dan sclcksi
indilidu urul nrcncdi fagnen spcsink.
Ddi 44 trincr yeg disclcksi ndla 2l prine! yoa mcnghasilkdr lirgmen
dcngM junlan lcbih dari 5. Ke 2l pnner discleki kcnbali d€ngtu
mengsudrD P,,/ DNA loleD da. peka sebagai DN,1 ledplar dln dip€rolen 5
pri,ner ydln; oPA 09, oPEl8, oPK-15. OpN-16 dm Oly 20 yaa
rp:,sn6ilkd polinorisne pada p,o/ DN]\ lolch Kelina pnnrer tesebut
hemudio dieuakm pada lahap sel€ki individn @tul nencdi EaEne. sFesink
pada genorip€ padi tolm. Kegiar rwbut b{hdil menenuks fmgE.n
sp,sifil dcnga ul!fu sckilar 800 bp y&g dihAilkm oleh prin$ OPN- l 6
Kala

krnci faEnen
roleran

R.1PD tihi,ochtoa

*lna


mtad i L, po.]

DN/, atekrpati,

,.PENI)AHULUA]t

r-r.l,rr,rl'.lrkang
Keh.dnrn

gul.

prda dcal tcnmanan prdi m€nimbullr. man ah

€clm

la4sung yakni. konpcri\ixDttra padidcngm gllna unruk mcnpe(neh air, unsur
hara sena ime.siks

can.yr


Secara

tidlk ldresuns eulna rr-qr dapat nenjadi

inlns baei hma dan palosen renertu Oleh karena itu. dapar dikalaldr balNa
gulma nc.iadi

$lah eru

hklr

l)cmhrlls poduksi b.si penandnan padi

lalins banval dlrenrui di la\d padi adahl
E.hin.thbo truss autti a'atr lcbih dikcnal dengd nrD jaiasoan. Jajasod
r.maruk gulna edas sctundcr aercsif ydg sulil dik.ndjlikD Pcnljang.n
Salah salu spesi.s eulna )ans

slh dil.lukd liarcna pada umnDDya Dorlilogi brad t.di du
jal.sos kdika n6ih n r susah dibedato s.tu $nra lain. Puba (200,1)

menyarala bah*a ke.dpdh l0 cgak Ethituchloa Ur\lqalj padn tcal
s.cad drni

|]etudrn i.di

I)er mr dapat teiadi p.nurunm

plduksi sebesr I I

%. lada

kdapatan 60 r.ealan dapal LladipcDuruno ri.rgilandnnn padiscblsar 56.5 on.
Pada uDUnDya tumbuhan rclah

nenilikj

suaru

nckmishe perlindunsd


ekmm bioriL nupu !.biolit. BebeEpa b€ntuL mckmisne
tc^cbor mr,m lain Bcnbcnirk dui. .ell dedth proaran- basian epidemns

lecendiri crtddap

randar yes ne4andunR lilin,

hinaEa

neDeiasiltd *nrawr dlsloliimta

ll6ilp€neljtia trhdap r00 senolipe padiyansdiuji. b$hail mc.chllb
a,Luya empar Bcn.tipe padi yee nDnlebrbLd penghdbabn penlnbuhan akd
Lthino.hloa ottrAalli,. 50 %. Keenpal genolipc l6cblt.dalah Ccm!. l.uiu!
Badivoadih Kabalai, K{Ema B- (l3. Smson den8an nilai pen.ktuh
scb.s& 60.1502, 58-09%, 52,96%. dd 50.01%
rrlradap konhol yds ditumbun](a bcBmoe dmg& gulha rers€bur (Chaiaso
p€numbuhm b€rturur

t!.ul


Fcnonri. dlelopati pala acDorifr pxdi
nenjadi ispirasi ndul
'e6ebul
mer.lit vdels padi y eDeniliki silal alelopati scb.eai nckdisdd r€tuhman
r€rhadap gulm. dmgd pcmbne kcDned lmg lebih llna Untuk mencapai
hatus dilrtulm .dabn menemukan gcn
rulub reeb!! l&gkah penarna

'!n3

pcnscndali silai alelopali sehinega nmrinyr d,iprl disisipkm ke
S.lnh saru up.ya unrul menenrnkan ge.

tc

tal@m p{li

gcnd,li delopati adalai dcnear


menssunakan penanda nolekuler. Pada s.ar ini.

p..dda holekuler didgB.F

etiktil dibandinshan dcnsan peraDdn noraologi tmna hdsil yana dip€roleh
lehih spesifik d.. \aktu tang diFnukan relariflcbih siiglar tdend penodu

lebih

d,laluk

pada rjiAkar stJuklur DNr\.

brlaris nrdka DNA mala
lilcrukm lisa tipc p.narda molcktrlcr dcngm sesala kel€bihm dad
k.klm8mla. l,enuda pemndn leBebur ad,lan : (l) Penarda yss hcrdMkm
ketada bibndisrsi DNA seFni llFl-P (Rdti.1nn Ftas cht Lenglh
hr)norphtn), (2) li.a nd^ yrs berdaskan kepadr rcaksi bermrai polymeEsc
d.ngd de.ggunalon sekuc.s rrkle.tid! sebaai p.imer spcni RAPD (RLnAo
.,lnptilel Pob,ntphi. r ,l) de AFLP tA,tpliieA [ragnr.nt t.lngh

t'otnorph^n). (l) Penuda -\, 8 ncnCgMrld pnnr yans mensg.bug*6
setucns komplemen spesifik {lalan DNA sNrd sepcni S1S (SxquchLe ligEet
sl7rs), s(rARs ft?qzcdzr atu a.tetizcd Antplilul Rqtl,u). nu SNPS l,9,s/a
ihc tlot il P. ! | norrhi n,!) \ irri. 2005
Penmda I-AID diswk n dalan pcn€lnian ini kmna pe.dda RAPD
s.cdr lmum h.miliki kcurunsar : (l) !im6 mudan diperol€h dd srd.Jr
b&yrk ymg dibne^ilktui (2) Tid,l nemqlutm psr.ra probes (pr,r.r
Scinne dc.Cm berkcnbd8nya rclnoh)gi )ang

J

r,nrdrt r). senyawa hdioaklif,

iradcr'roarrer, : (3) Rclail du.irh dilakuke

&n Maiad, 2008).
RAPD adalai si{eh penmda berbGis DN,\ ydA hcngguakan apliklsi
PCR Siftn nn p.i
loli dikc'ultr oleh Willim .r ,/ pada tanun 1980
(JaNdi. 2007). Prinsip dasd p€mda ini adalJr drplitikEi iasmen DNA yes

b.rsiral ronin dmad nenglabakan sru d.u dM abtl,'r prtrer yue lcrdin
'lerba

ddi 8-10 nukleolid. Pmmda i-^PD

klrl

diguakm untul menmrulaD fFemen
rag diduga teDaur denga tehnanm terhad.p ebrknose yang discbabro oleh
Q tkrrnun upliti l.snjxta w,timena Cuhdja, YusDl. As$dinoor dar Su.
aoryespora casii.olo

{'totun-

trd

]ans ren&n dd rolcrm te.hadap
I alu- Seddsono dd Aswidinoor 20!2). daD

:002). nenentuke kem8dran Uon-klon


V. KESIMPI]LAN DAN SARAN
5.t (.siDpul,n
Dan l€nelnis ]ane relah dilalukd nala d.par diank kcsimpuln balsa

sif

lolem (Cempo Luiut dd BadiL/cadih Kabrtai)
diduga bdkaib dengan ketudnan fnghen raA?D spcsitik yaDS bctutuD
alclopali pada Fadi senoripe

sekil$ 800 bp ymg dihasilkb olch pnner OPN 16 Kehadirar firgmen densd

dod y

a sma tada lihjnbrhloa jtss Kulli senakjn ncmperkuat asunsi
bahwa liasnen tescbul mcnMg bertairs dengM aletopali oteb kena
Fahinochlaa Lr^s sdlli jDga mcniliki kcnmpun urmk nenshasilkm

S.2

Sar.tr

de didalisis lcbih lmjul Mmk nemp€rolch inlnmdi adeya
teterkailan mlaE fE8r.en yhg dirEroleh pada !€oeliti ini dengs silal
Polu dikaji

Dr\FTr\R PITSTAli
Anonim 2009 Baha

Biolo:i Molckuler
^jar

\

$$r\

,n5ocJ

L

rlpr's..n Irj

,\rdr 1939 I riu (;ulm,I lDikktl PidaDe I rrversiras ,\ndatas tB

'\rrai \,1 :045
t

ananan ,/tn

ha

lrernrntialan Marl.h Nloetuicr Datani parscs PcDutiaan
tnl )!:t o llhg." tlt) 16:,1

r1,/ emakerga. R l-croux. G D aid Sima.d. R R tqe5 Fitects otBenToic and
a nalnnji. ,^cjds (tj Memb(nePomeabllir On Solb.n t(us./rr,2//ry'
( hthtLut 1...b!t 1 t)..1- 1t5
SueaJnan. N,l, RdJli.ur. r\gisimanto. D drn Suyono t00,1 Va.asi G..erik padi
Tahan Bli\ Berdasarkan Sldlk Jan DNA d.nga Markal a;e. Analog

t\.sislcn .lrrral

(

lianirgo.l

l|bt.lr.bs P. arn t9(2J t(

6l

lanisan 2i107 P.nggaLian Por. si.^tekrpar pada Tanamarl,adj
t(rtar tur. L) Dtlam tlpal,a Mciiigkarkan l)a!a Sarnsoya tcrhadao
cllna t..h mhltu ctu\\.eallt L Bexrv lLapord Hasit l,enetnjan
Fund,me.tall Padans !alaltasPenanian UDirersn.s Andatas
dan

l)akhsin. K M

I,1 .

lo),. (: L and

lftcrjil

,1M IIIlita ldAnnMhbl:cr,/,:J'

1999
Boca

llliophtD (rt(-.rrl.D.nt rl

Ra.rjn CRCtj.ss ppI t.l

R 2007 (a.akrerisasi Morlologl Beberapa Ccnolipe Caba
lca?idhr d M) Dan Seleksi Primer Unrlk Analhis Kekerabaun

Danrssalam.

lsknpsil Padans FakultasPdanianUnllesiras Andalas

Diday. RH. WG Yan (AK. Voldenhauer and Gravois K A l99R
',\lleloprthic Aclivily ln Rice For Conrolting Major Aquarj. Weedf. tn
AlbloValhf ht RtLt Ma.ila IntemalioratRice Rescarc| tnsriiute pp 7 26

M aid St.ller. tiw l99B AbroNn.
4n r- LuJr, t,,..1t. a ,.t -a
Crcsel. J 2000 Molecular Diologtr .l Wecd C.ntrot .ti tldl .l tia"\ge,t.
nPvrth9 t lt 1l,
F.es. M M J . l-n,, I- . Trancl. P J . Wax. L

Jansali 2AA1 Bk .k ol.gi Pennl. l,tin:tp
t/o/.rrlcr Riau UNRI ?res

J!ta,

Da.k Dd,

Aptik.st A"dhns

Aswidnb,J H daD Sa o!,. l) 1r'al Deleksi dai,\n!lir:
SchrcDs G€n Inhibit.r lada Ucberapa Klon Kakao Harapan Trhan
Penggerer Buah Kakao Dari Sulawesi Sctabn .rhntt Iv.raru |'!tk!hudn

/lMS.

72(t) I

t0

Dokumen yang terkait

Evaluasi Toleransi Genotipe Padi Sawah (Oryza Sativa L ) Pada Persaingan Dengan Gulma Echinochloa Crus Galli

1 7 74

PENGARUH ALLELOPATI BEBERAPA GENOTIPE PADI (Oryza sativa L.) LOKAL SUMATERA BARAT TERHADAP PERKECAMBAHAN DAN PERTUMBUHAN AWAL GULMA Echinochloa cruss-galli (L.) Beauv.

0 2 12

KAJIAN PENDAHULUAN ALLELOPATI PADI (Oryza sativa L.) TERHADAP PERTUMBUHAN AWAL GULMA JAJAGOAN (Echinochloa cruss-galli (L.) Beauv.).

0 0 8

Ringkasan - Penggalian potensi allelopati padi (Oryza sativa L.) dalam upaya meningkatkan daya saingnya terhadap gulma Echinochloa cruss-galli (L.) Beauv.

0 0 1

Penggalian potensi allelopati padi (Oryza sativa L.) dalam upaya meningkatkan daya saingnya terhadap gulma Echinochloa cruss-galli (L.) Beauv.

0 0 15

PERTUMBUHAN AWAL BEBERAPA GENOTIPE PADI (Oryza sativa L.) SEBAGAI RESPON TERHADAP ALLELOPATI GULMA JAJAGOAN (Echinochloa cruss-galli L. Beauv.).

0 0 6

TRANSFORMASI GENETIK TRAGMEN SPESIFIK DNA PADr (oryza sativa L.) HASIL RAPD TERKAIT TOLERANSI GULMA Echinochloa cruss-galli L. (Beauv).

0 0 6

PENGARUH ALLELOPATI BEBERAPA GENOTIPE PADI (Oryza sATiva L.) LOKAL SUMATERA BARAT TERHADAP PERTUMBUHAN AWAL GULMA PADI- PADIAN (Echinochloa cruss-galli (L) Beauv.).

0 1 6

PENGGALIAN POTENSI ALLELOPATI PADI (Oryza sativa L.) DALAM UPAYA MENINGKATKAN DAYA SAINGNYA TERHADAP GULMA Echinochloa cruss-galli (L) Beauv.

0 0 1

Toleransi Galur Harapan Padi Sawah (Oryza sativa L.) pada Persaingan dengan Gulma Echinochloa crus-galli Tolerance of Rice Promising Lines (Oryza sativa L.) in Competitivenes with Echinochloa crus-galli

0 0 8