IDENTIFIKASI DAN RESISTENSI Mycobacterium tuberculosis DARI SPUTUM PASIEN TUBERKULOSIS TERHADAP RIFAMPISIN

  

IDENTIFIKASI DAN RESISTENSI Mycobacterium tuberculosis

DARI SPUTUM PASIEN TUBERKULOSIS TERHADAP

RIFAMPISIN

SKRIPSI

  Untuk memenuhi sebagian persyaratan Mencapai Derajat Sarjana S-1

  Diajukan oleh:

  

Vinie Triana

1008010100

Kepada

Fakultas Farmasi

  

Universitas Muhammadiyah Purwokerto

Purwokerto

2014 ii

iii

iv

RIWAYAT HIDUP

  Nama : VINIE TRIANA Tempat Tanggal Lahir : Jatibarang, 12 september 1992 Nama Ayah : Darmansyah Nama Ibu : Sunani Riwayat Pendidikan SD NEGERI 1 PILANGSARI Tahun 1998-2004 SMP NEGERI 1 JATIBARANG Tahun 2004-2007 SMK FARMASI INDRAMAYU Tahun 2007-2010 UNIVERSITAS MUHAMMADIYAH PURWOKERTO Tahun 2010-2014 Riwayat Kegiatan Ilmiah yang pernah diikuti : 1.

  Seminar Nasional “Pharmacist For Solving Hypertension With Herbal

  Medicine

  ” Program Profesi Apoteker Angkatan XIII Fakultas Farmasi Universitas Muhammadiyah Purwokerto pada tanggal 22 Januari 2011.

2. Seminar Nasional Kefarmasian “Self Management in Asthma Patients”

  Fakultas Farmasi Universitas Muhammadiyah Purwokerto pada tanggal 21 Maret 2013.

  Riwayat Kegiatan Pengembangan Diri yang Dilakukan :

  1. Anggota BEM Fakultas Farmasi Universitas Muhammadiyah Purwokerto, masa jabatan 2011-2012.

  2. Anggota ISMAFARSI Universitas Muhammadiyah Purwokerto, masa jabatan 2011-2012.

  3. Anggota PIKMA YOUTH CENTER Universitas Muhammadiyah Purwokerto, masa jabatan 2010-2012 dan 2012-2014.

  4. Panitia Seminar Nasional “ Belajar bersama tentang seksualitas untuk Tanggal 10 Mei 2012.

  5. Panitia Talk Show “Pergaulan Bebas sebagai investasi menuju HIV/AIDS” pada tanggal 2 Desember 2012.

  6. Panitia Training Of Trainer “Soft Skills Education, Information And Comunication” pada tanggal 12 Mei 2013. v

  MOTTO “

  

Sesungguhnya sesudah kesulitan itu ada

kemudahan

  ”

  ( terjemahan Q.S. Al-Insyirah : 6 )

  

Tak ada

sesuatupun yang dapat membuatmu menyerah!

  

Kecuali dirimu

yang mengizinkannya!

  ( buku “selalu ada harapan” )

  

Detik Sekarang

bukanlah waktunya untuk menyesali apa yang telah terjadi,tetapi waktunya

mencari solusi

untuk kedepannya yang

lebih baik

  ( vinie Triana ) vi

  

PERSEMBAHAN

  Puji syukur penulis panjatkan ke hadirat Allah SWT yang telah memberi kenikmatan yang sungguh luar biasa. Penulis persembahkan karya ini untuk:

  1. Bapak Darmansyah dan Ibu Sunani, terima kasih atas segala doa dan dukungan yang telah diberikan serta kasih sayang yang tulus kepadaku.

  2. Kakakku tersayang (Sugiono, Yuli Darmansyah, Novi Anggraeni) dan Adikku tersayang (Lintang Risgiyani), serta kedua keponakanku yang cantik (Ayunda Rahani dan Syahla Aulia F) yang selalu membuatku tersenyum dan penuh semangat, terimakasih atas doa dan dukungannya.

  3. Keluarga besarku yang tidak dapat disebutkan satu per satu, terima kasih atas doa dan dukungannya.

  4. Untuk Supporterku (Om Raya) yang selalu membuatku tersenyum dan bersemangat kembali disaat ingin menyerah, terimakasih atas doa dan dukungannya yang yakin bahwa Vinie pasti mampu menyelesaikan tugas akhir ini.

  5. Teman terdekatku (Mba Agustina Olivia Nezar, Mba Siti komerawati, Mba Rulfita Oka, A ri Ardiansyah, Adi Wibowo, Helmi Al’afghani, Mba Kheriyah, Ika Arifah D, Diah Nurlaily) terima kasih atas persahabatannya selama ini, yang tak lupa memberikan semangat dan doanya.

  6. Teman- teman di Fajar kozt yang selalu membuatku tersenyum.

  7. Teman-teman Farmasi angkatan 2010 terima kasih untuk dukungan dan semangatnya. vii

KATA PENGANTAR

  Syukur alhamdulillah penulis panjatkan kepada Allah SWT, yang telah melimpahkan rahmat dan karunia-Nya sehingga penulis dapat menyelesaikan skripsi yang berjudul “

IDENTIFIKASI DAN RESISTENSI

  Mycobacterium tuberculosis

DARI SPUTUM PASIEN TUBERKULOSIS TERHADAP RIFAMPISIN.

  Penulis menyadari bahwa penyusunan skripsi ini masih jauh dari sempurna karena keterbatasan, kemampuan dan pengetahuan, namun berkat bimbingan, saran, dorongan dan bantuan dari berbagai pihak, akhirnya penulis dapat menyelesaikan skripsi ini. Oleh karena itu, pada kesempatan ini penulis mengucapkan terima kasih yang setulus- tulusnya kepada:

  1. Darmansyah dan Sunani, sebagai kedua orang tua yang selalu memberikan dukungan dan motivasinya hingga selesainya skripsi ini.

  2. Drs. H. Syamsuhadi Irsyad, S.H., M.H. Rektor Universitas Muhammadiyah Purwokerto.

  3. Dr. Nunuk Aries Nurulita.,M.Si,Apt. Sebagai Dekan Fakultas Farmasi dan Dosen pembimbing I, yang telah memberikan bimbingan dan pengarahan serta motivasi dalam penulisan skripsi ini.

  4. Githa Fungie Galistiani.,M.Sc.,Apt. Sebagai pembimbing II yang dengan sabar membimbing dan mengarahkan serta memotivasi penulis dalam menyelesaikan skripsi ini.

  5. Dosen penguji skripsi Program Studi Farmasi Universitas Muhammadiyah Purwokerto.

  6. Seluruh Dosen Fakultas Farmasi Universitas Muhammadiyah Purwokerto yang telah memberikan ilmunya sehingga dapat dapat membantu penulis dalam menyelesaikan penulisan skripsi ini. viii

  7. Seluruh laboran dan karyawan TU Fakultas Farmasi Universitas Muhammadiyah Purwokerto yang telah memberikan arahan dan bimbingannya.

  8. Semua pihak yang telah membantu terselesaikannya skripsi ini.

  Peneliti menyadaribahwaskripsiinimasihjauhdarisempurnakarenafaktorketerbatasan yang adadalamdiripenulisolehsebabitupenulismohon saran dankritik yangmembangundansemogaskripsiinidapatbermanfaatbagisemuapihak.Terim akasih.

  Purwokerto, 10 September 2014 VinieTriana ix

  

DAFTAR ISI

  Halaman HALAMAN JUDUL ................................................................................... i HALAMAN PERSETUJUAN. ................................................................... ii HALAMAN PENGESAHAN. .................................................................... iii SURAT PERNYATAAN............................................................................ iv RIWAYAT HIDUP ..................................................................................... v MOTTO.. .................................................................................................... vi PERSEMBAHAN. ...................................................................................... vii KATA PENGANTAR ............................................................................... viii DAFTAR ISI .............................................................................................. x DAFTAR GAMBAR .................................................................................. xiii DAFTAR TABEL ....................................................................................... xiv DAFTAR LAMPIRAN. .............................................................................. xv

  INTISARI. ................................................................................................... xvi ABSTRACT. ............................................................................................... xvii

  BAB I PENDAHULUAN A. Latar Belakang .......................................................................

  1 B. Rumusan Masalah .................................................................

  2 C. Tujuan Penelitian ...................................................................

  3 D. Manfaat Penelitian. ................................................................

  3 x

  BAB II TINJAUAN PUSTAKA A. Tuberkulosis Paru ..................................................................

  16 E. Populasi dan Sampel ..............................................................

  31 BAB V PENUTUP A. Kesimpulan ...........................................................................

  28 D. Keterbatasan penelitian ..........................................................

  22 C. Hasil deteksi M.tuberculosis dan Resistensinya ....................

  21 B. Identifikasi dan Resistensi dengan GeneXpert MTB/RIF .....

  20 BAB IV HASIL PENELITIAN DAN PEMBAHASAN A. Pengambilan sampel ..............................................................

  18 G. Analisis Data ..........................................................................

  16 F. Cara Penelitian .......................................................................

  16 D. Alat dan Bahan .......................................................................

  4 B. M. tuberculosis .......................................................................

  15 C. Waktu dan tempat penelitian .................................................

  15 B. Definisi Variabel Operasional ...............................................

  13 BAB III METODEPENELITIAN A. Jenis dan Rancangan Penelitian .............................................

  11 G. Identifikasi real time PCR Genexpert MTB/RIF ..................

  9 F. PCR (Polymerase Chain Reaction) .......................................

  8 E. Resistensi M. tuberculosis .....................................................

  8 D. Obat Anti Tuberkulosis ..........................................................

  7 C. Sputum ...................................................................................

  32 xi

  B. Saran .....................................................................................

  32 DAFTAR PUSTAKA ................................................................................ xviii

  LAMPIRAN ............................................................................................... xxii

  xii

  

DAFTAR GAMBAR

Halaman

  Gambar 1.Faktor Risiko Kejadian TB dan riwayat alamiah pasien TB yang tidak diobati ...................................................

  6 Gambar 2.Tahapan perkembangan TB resistensi OAT ..............................

  10 Gambar 3. Gen rpoB menentukan regio resistensi rifampisin; Mutasi gen rpoB terjadi pada probe B, probe D,dan probe E ..............

  24 Gambar 4a. Hasil Real-time PCR deteksi gen rpoB pada Probe B,

  Probe D,dan Probe E pada sputum pasien TB dengan jumlah

  MTB sangat rendah, rendah, sedang, dan tinggi, Tidak terjadi resistensi .................................................................................

  25 Gambar 4b. Hasil Real-time PCR deteksi gen rpoB pada Probe B, Probe D, dan Probe E pada sputum pasien TB dengan jumlah MTB rendah, sedang, dan tinggi,terjadi resistensi .......................... .

  26 xiii

  

DAFTAR TABEL

  Halaman Tabel 1. Sistem klasifikasi Tuberkulosis dalam U.S.Departement of

Health and human services ...........................................................

  7 Tabel 2. Hasil MTB dan jumlah nilai Ct .....................................................

  20 Tabel 3. Karakteristik subjek penelitian .....................................................

  21 Tabel 4. Hasil identifikasi M. tuberculosis pasien Tuberkulosis ................

  28 Tabel 5.Informasi gen ropBmenentukan regio resistensi rifampisin. .........

  29 Tabel 6.Jumlah pasien TB yang resisten terhadap Rifampisin ...................

  30 xiv