KERAGAMAN GENETIK TIGA POPULASI KELAPA SAWIT (Elaeis guinensis Jacq.) TIPE PISIFERA BERDASARKAN MARKA RAPD
KERAGAMAN GENETIK TIGA POPULASI KELAPA SAWIT (Elaeis guinensis Jacq.) TIPE PISIFERA BERDASARKAN MARKA RAPD SKRIPSI OLEH : HERU PRAYOGI 111201104/ Budidaya Hutan
PROGRAM STUDI KEHUTANAN FAKULTAS PERTANIAN UNIVERSITAS SUMATERA UTARA 2015
PERTUMBUHAN DAN KOMPOSISI RANTAI PANJANG POLYISOPRENOID PADA MANGROVE
Avicennia marina (Forsk). DI BAWAH CEKAMAN SALINITAS SKRIPSI Oleh : HAMSYAH R HARAHAP 111201134 BUDIDAYA HUTAN
Skripsi sebagai salah satu syarat untuk memperoleh gelar sarjana di Fakultas Kehutanan Universitas Sumatera Utara
FAKULTAS KEHUTANAN UNIVERSITAS SUMATERA UTARA 2015
HALAMAN PENGESAHAN
Judul Penelitian: Keragaman Genetik Tiga Populasi Kelapa Sawit (Elaeis guinensis Jacq.) Tipe Pisifera Berdasarkan Marka RAPD
Nama : Heru Prayogi NIM : 111201104 Program studi : Kehutanan
Disetujui Oleh Komisi Pembimbing Mohammad Basyuni, S.Hut.,M.Si.,Ph.D Dr. Ir. Lollie A.P. Putri, M.Si.
Ketua Anggota Mengetahui
Siti Latifah, S.Hut.,M.Si.,Ph.D Ketua Program Studi Kehutanan
ABSTRAK
HERU PRAYOGI. Keragaman Genetik Tiga Populasi Kelapa Sawit (Elaeis guinensis Jacq.) Tipe Pisifera Berdasarkan Marka RAPD Dibimbing oleh MOHAMMAD BASYUNI dan LOLLIE AGUSTINA P. PUTRI Kelapa sawit sebagai tanaman penghasil minyak kelapa sawit merupakan salah satu primadona tanaman perkebunan yang menjadi sumber penghasil devisa non- migas bagi Indonesia. Varietas unggul kelapa sawit yang dihasilkan oleh berbagai lembaga riset adalah tenera yang merupakan hibrida dura x pisifera (DxP).
Pisifera memiliki fungsi yang penting dalam produksi benih kelapa sawit. Oleh karena itu populasi pisifera sangat penting untuk dikelola dan dikembangkan. Metode RAPD merupakan metode untuk mengidentifikasi sejumlah besar polimorfisme DNA pada genom dengan cepat, efisien dan cocok untuk studi keanekaragaman genetik. Tujuan dari penelitian ini adalah untuk menganalisis keragaman genetik tipe sawit dari tiga populasi yakni Yangambi origin, Lame origin dan Lame silang lanjut di koleksi kebun Bangun Bandar PT. Socfin Indonesia menggunakan marka RAPD. Dari 18 sampel untuk setiap populasi Yangambi origin, Lame origin dan Lame silang lanjut sawit tipe pisifera dapat diketahui tingkat keragaman genetik yang sedang dengan nilai rata-rata 0,24 dengan nilai tertinggi 0,28 dan nilai terendah 0,21. Persentase pita polimorfik tertinggi terdapat pada primer 15 dan primer 19 Lame origin yang mencapai nilai 100%. Nilai PIC tertinggi terdapat pada primer 11 Yangambi origin dan primer 10 Lame sl sebesar 0,49, sedangkan untuk nilai PIC terendah terdapat pada primer 21 Lame origin sebesar 0,01.
Kata kunci: Kelapa sawit, Elaeis guinensis Jacq., RAPD, keragaman genetik
ABSTRACT
HERU PRAYOGI. The genetic diversity, palm oil (Elaeis guinensis Jacq.) of
pisifera using RAPD markers under academic supervision by MOHAMMAD
BASYUNI and LOLLIE AGUSTINA P. PUTRI.Palm oil as a plant producing oil is one of the primadonna oil palm plantations
that become a source of producer non-migas for Indonesia foreign exchange.
Superior varieties of palm oil produced by various research institutions that is a
x pisifera (DxP). Pisifera having an important function in
hybrid is tenera dura
the production of seed oil palm. Hence the population pisifera very important to
be managed and developed . A method of RAPD is a method to identify a number
of large polymorphism DNA in the genome quickly, efficient and suitable for the
study of genetic diversity. The purpose of this research is to analyze genetic
diversity type palm oil by three population namely Yangambi origin, Lame origin
and Lame silang lanjut in collections garden bangun bandar PT Socfin Indonesia
use RAPD markers. Sample of 18 for each oil palm population Yangambi origin,
Lame origin and Lame silang lanjut pisifera type can be seen the level of genetic
diversity is the average value 0.24 with the highest 0,28 and the lowest value 0.21.
The percentage of ribbon polymorphic highest on the primary 15 and primary 19
Lame origin which reached 100 percent. The PIC highest on the primary 11
Yangambi origin and primary 10 lame sl of 0.49, while to the PIC the lowest on
primary 21 Lame origin of 0.01.Key words: Palm oil, Elaeis guinensis Jacq., RAPD, genetic diversity
RIWAYAT HIDUP
Penulis lahir di desa Serapuh kabupaten Simalungun pada 17 November 1992 dari Misman dan Tukiyawati. Penulis merupakan anak keempat dari empat bersaudara.
Penulis Lulusan SD Negeri 097320 Serapuh pada Tahun 2005, lulusan SMP Negeri 2 Siantar pada tahun 2008, dan lulusan SMA Negeri 3 Pematang Siantar pada tahun 2011. Juni 2011 penulis diterima di Program Studi Kehutanan, Fakultas Pertanian Universitas Sumatera Utara melalui jalur SNMPTN tulis.
Selanjutnya penulis memilih peminatan Budidaya Hutan.
Penulis mengikuti Praktik Pengenalan Ekosistem Hutan (P2EH) 22-31 Agustus 2013 di hutan pendidikan USU Tahura, Tongkoh, Kabupaten Karo.
Penulis melaksanakan Praktik Kerja Lapang di Taman Nasional Gunung Halimun Salak, Jawa Barat pada 28 Januari – 28 Februari 2015.
KATA PENGANTAR
Puji dan syukur penulis panjatkan kehadirat Allah SWT atas segala rahmat dan karunia-Nya kepada penulis, sehingga penulis dapat menyelesaikan penyusunan skripsi yang berjudul “Keragaman Genetik Kelapa Sawit Elaeis
guinensis (Jacq.) Tipe Pisifera dari Tiga Populasi Berdasarkan Marka RAPD.”.
Skripsi ini merupakan salah satu syarat untuk memperoleh gelar sarjana di Program Studi Kehutanan, Fakultas Pertanian, Universitas Sumatera Utara.
Pada kesempatan ini penulis mengucapkan terima kasih kepada kedua orang tua penulis yang telah membesarkan dan mendidik penulis selama ini.
Penulis juga menyampaikan ucapan terima kasih kepada Mohammad Basyuni, S.Hut, M.Si, Ph.D sebagai ketua komisi pembimbing skripsi dan Dr. Ir. Lollie A.P. Putri, M.Si. sebagai anggota komisi pembimbing skripsi, yang telah banyak membimbing dan memberikan arahan serta masukan kepada penulis sehingga penulis dapat menyelesaikan penelitian ini.
Disamping itu penulis juga mengucapkan terima kasih kepada kepada semua staf pengajar dan pegawai di Program Studi Kehutanan, serta semua teman-teman mahasiswa yang telah membantu penulis dalam menyelesaikan skripsi ini. Semoga skripsi ini dapat bermanfaat bagi pengembangan ilmu pengetahuan.
Medan, Juni 2015 Penulis
DAFTAR ISI
10 Isolasi DNA .....................................................................................
35 Saran ...........................................................................................................
19 KESIMPULAN DAN SARAN Kesimpulan .................................................................................................
14 Analisa Profil Pita Hasil Isolasi DNA Tanaman Kelapa Sawit Pisifera .....
13 HASIL DAN PEMBAHASAN Analisa Profil Pita Hasil Isolasi DNA Tanaman Kelapa Sawit Pisifera .....
13 Penentuan Ukuran Pasangan Basa ..............................................................
12 Penentuan Skoring Marka RAPD ...............................................................
12 Penanda RAPD ................................................................................
12 Reaksi PCR primer dengan marka RAPD .......................................
11 Running gel elektroforesis ..............................................................
11 Gel agarose 1 % ...............................................................................
10 Pengukuran konsentrasi DNA .........................................................
10 Pengambilan sample ........................................................................
Halaman
9 Prosedur Penelitian......................................................................................
9 Alat dan Bahan ............................................................................................
7 BAHAN DAN METODE Waktu dan Tempat ......................................................................................
6 Marka RAPD ...............................................................................................
5 Reaksi polymerase chain reaction (PCR) ...................................................
5 Isolasi DNA .................................................................................................
4 Keragaman genetik......................................................................................
3 TINJAUAN PUSTAKA Kelapa sawit secara umum ..........................................................................
3 Manfaat Penelitian ......................................................................................
1 Tujuan Penelitian ........................................................................................
RIWAYAT HIDUP ................................................................................... iii
KATA PENGANTAR ............................................................................... iv
DAFTAR TABEL ..................................................................................... vii
DAFTAR GAMBAR ................................................................................. viii
PENDAHULUAN Latar Belakang ............................................................................................
ABSTRAK ................................................................................................. i
ABSTRACT ................................................................................................ ii35