Image Segmentation
Image Segmentation
Key Stages in Digital Image
Processing
Image
Restoration
Morphological
Processing
Image
Enhancement
Segmentation
Image
Acquisition
Object
Recognition
Problem Domain
Representatio
n&
Description
Colour Image
Processing
Image
Compression
nzalez & Woods, Digital Image Processing (2002)
Key Stages in Digital Image
Processing:
SegmentationImage
Morphological
Restoration
Processing
Image
Enhancement
Segmentation
Image
Acquisition
Object
Recognition
Problem Domain
Representatio
n&
Description
Colour Image
Processing
Image
Compression
Image Segmentation
a) Segmentasi merupakan proses partisi citra digital ke
beberapa daerah (region).
b) Tujuan untuk :
•
•
membagi citra menjadi beberapa daerah (Region of Interest
(ROI)) yang homogen berdasarkan kriteria kemiripan
tertentu
menyederhanakan ataupun mengubah representasi citra
menjadi sesuatu yang lebih bermakna dan mudah dianalisa.
c) Kesalahan pada proses segmentasi akan mempengaruhi
proses pengenalan dan pemahaman citra pada tingkat yang
lebih lanjut.
Region of Interest Processing
(ROI)
• memungkinkan pengguna untuk mengakses bagian tertentu
dari sebuah citra digital untuk diolah secara berbeda.
• Fitur ini menjadi sangat penting, apabila terdapat bagian atau
area tertentu dari citra digital yang dianggap lebih penting dari
area yang lainnya.
Region of Interest Processing
(ROI)
• Process image only in the predefined area.
• The predefined area is called “Region Of Interest” (ROI).
• Function is the same as before but applied to only ROI.
Metoda Segmentasi
• Region based:
•
•
•
•
Thresholding
Region Growing
Region Merging and Splitting
Clustering
Thresholding
• Metode ini didasarkan pada pemisahan pixel ke dalam kelas
yang berbeda tergantung pada tingkat keabuan masingmasing pixel.
• Intensitas citra medis seperti tumor dan jaringan pada otak
sangat rumit dan memiliki tingkat keabuan yang sangat dekat
sehingga sulit menentukan nilai ambang batas (threshold).
• Metode ini tidak bisa diterapkan untuk citra dengan tingkat
keabuan yang berdekatan sehingga biasanya dikombinasikan
dengan metode lain.
ROI Selection: MATLAB
• Command: roipoly
• Syntax: roipoly(im);
roipoly(im, [x0 x1 …xm], [y0 y1 …ym];
• im : input image
• (x0, y0), (x1, y1), …, (xm, ym) : coordinate of the polygon covering
region of interest.
• E.g. roi = roipoly(im, [60 100 100 60], [40 40 80 80]);
Mask for ROI
• Binary image with the white (1) indicating ROI.
Mask coordinate: (222, 21) (272, 21) (300, 75)
(270, 121) (221, 121) (191, 75)
http://www.mathworks.com/access/helpdesk/help/toolbox/images/roipoly.html
ROI Filtering: MATLAB
• Command: roifilt2
• Syntax: roifilt2(filter, image, roi);
• filter : 2D linear filter
• image : input image
• roi : region of interest (1: ROI, 0: not ROI)
TRY !!
Effect of ROI Filtering
ROI at this coin
• Unsharp masking in ROI.
http://www.mathworks.com/access/helpdesk/help/toolbox/images/roifilt2.html
TAKE HOME QUIZ
QUIZ TAKE HOME
Sistem pengenalan dan klasifikasi sebuah penyakit melalui
ekstraksi ciri pola tepi
QUIZ TAKE HOME
Citra biomedik di samping ini mengalami degradasi
dan noise sehingga butuh dipulihkan untuk diproses
lebih lanjut. Proses pemulihan ini masuk ke dalam
tahap pre-processing dari sebuah sistem pengenalan
dan klasifikasi sebuah penyakit melalui ekstraksi ciri
pola tepi. Proses-proses pemulihan (diurutkan secara
acak) yang disyaratkan pada tahap pre-processing
sistem adalah sebagai berikut :
•Perbaikan kontras citra dengan histogram stretching
dan histogram equalization
•Menghilangkan/mengurangi noise pada citra (pilihlah
tipe filter yang tepat untuk jenis noise tsb)
•Perbaikan pencahayaan (brightness) citra dengan
operasi titik
•Deteksi tepi (edge detection) dengan menggunakan
image gradient, dengan operator Sobel berikut :
Kuis Praktek
Yang perlu dikerjakan :
1.Susun tahap-tahap pada pre-processing dengan tepat agar
citra dapat dipulihkan
2.Buatlah kode program dengan matlab sesuai dengan urutan
tahap yang telah disusun
3.Masukkan kode program dan citra keluaran dari masingmasing tahap ke dalam file .doc/.docx
4.Kirim file .doc/.docx ke email yang telah ditentukan
Key Stages in Digital Image
Processing
Image
Restoration
Morphological
Processing
Image
Enhancement
Segmentation
Image
Acquisition
Object
Recognition
Problem Domain
Representatio
n&
Description
Colour Image
Processing
Image
Compression
nzalez & Woods, Digital Image Processing (2002)
Key Stages in Digital Image
Processing:
SegmentationImage
Morphological
Restoration
Processing
Image
Enhancement
Segmentation
Image
Acquisition
Object
Recognition
Problem Domain
Representatio
n&
Description
Colour Image
Processing
Image
Compression
Image Segmentation
a) Segmentasi merupakan proses partisi citra digital ke
beberapa daerah (region).
b) Tujuan untuk :
•
•
membagi citra menjadi beberapa daerah (Region of Interest
(ROI)) yang homogen berdasarkan kriteria kemiripan
tertentu
menyederhanakan ataupun mengubah representasi citra
menjadi sesuatu yang lebih bermakna dan mudah dianalisa.
c) Kesalahan pada proses segmentasi akan mempengaruhi
proses pengenalan dan pemahaman citra pada tingkat yang
lebih lanjut.
Region of Interest Processing
(ROI)
• memungkinkan pengguna untuk mengakses bagian tertentu
dari sebuah citra digital untuk diolah secara berbeda.
• Fitur ini menjadi sangat penting, apabila terdapat bagian atau
area tertentu dari citra digital yang dianggap lebih penting dari
area yang lainnya.
Region of Interest Processing
(ROI)
• Process image only in the predefined area.
• The predefined area is called “Region Of Interest” (ROI).
• Function is the same as before but applied to only ROI.
Metoda Segmentasi
• Region based:
•
•
•
•
Thresholding
Region Growing
Region Merging and Splitting
Clustering
Thresholding
• Metode ini didasarkan pada pemisahan pixel ke dalam kelas
yang berbeda tergantung pada tingkat keabuan masingmasing pixel.
• Intensitas citra medis seperti tumor dan jaringan pada otak
sangat rumit dan memiliki tingkat keabuan yang sangat dekat
sehingga sulit menentukan nilai ambang batas (threshold).
• Metode ini tidak bisa diterapkan untuk citra dengan tingkat
keabuan yang berdekatan sehingga biasanya dikombinasikan
dengan metode lain.
ROI Selection: MATLAB
• Command: roipoly
• Syntax: roipoly(im);
roipoly(im, [x0 x1 …xm], [y0 y1 …ym];
• im : input image
• (x0, y0), (x1, y1), …, (xm, ym) : coordinate of the polygon covering
region of interest.
• E.g. roi = roipoly(im, [60 100 100 60], [40 40 80 80]);
Mask for ROI
• Binary image with the white (1) indicating ROI.
Mask coordinate: (222, 21) (272, 21) (300, 75)
(270, 121) (221, 121) (191, 75)
http://www.mathworks.com/access/helpdesk/help/toolbox/images/roipoly.html
ROI Filtering: MATLAB
• Command: roifilt2
• Syntax: roifilt2(filter, image, roi);
• filter : 2D linear filter
• image : input image
• roi : region of interest (1: ROI, 0: not ROI)
TRY !!
Effect of ROI Filtering
ROI at this coin
• Unsharp masking in ROI.
http://www.mathworks.com/access/helpdesk/help/toolbox/images/roifilt2.html
TAKE HOME QUIZ
QUIZ TAKE HOME
Sistem pengenalan dan klasifikasi sebuah penyakit melalui
ekstraksi ciri pola tepi
QUIZ TAKE HOME
Citra biomedik di samping ini mengalami degradasi
dan noise sehingga butuh dipulihkan untuk diproses
lebih lanjut. Proses pemulihan ini masuk ke dalam
tahap pre-processing dari sebuah sistem pengenalan
dan klasifikasi sebuah penyakit melalui ekstraksi ciri
pola tepi. Proses-proses pemulihan (diurutkan secara
acak) yang disyaratkan pada tahap pre-processing
sistem adalah sebagai berikut :
•Perbaikan kontras citra dengan histogram stretching
dan histogram equalization
•Menghilangkan/mengurangi noise pada citra (pilihlah
tipe filter yang tepat untuk jenis noise tsb)
•Perbaikan pencahayaan (brightness) citra dengan
operasi titik
•Deteksi tepi (edge detection) dengan menggunakan
image gradient, dengan operator Sobel berikut :
Kuis Praktek
Yang perlu dikerjakan :
1.Susun tahap-tahap pada pre-processing dengan tepat agar
citra dapat dipulihkan
2.Buatlah kode program dengan matlab sesuai dengan urutan
tahap yang telah disusun
3.Masukkan kode program dan citra keluaran dari masingmasing tahap ke dalam file .doc/.docx
4.Kirim file .doc/.docx ke email yang telah ditentukan