Transmisi Transgen (PhGH) dan Performa Pertumbuhan Ikan Lele (C. gariepinus) Transgenik F3 di Balai Penelitian Pemuliaan Ikan Sukamandi Subang, Jawa Barat
TRANSMISI TRANSGEN (PhGH) DAN PERFORMA
PERTUMBUHAN IKAN LELE (Clarias gariepinus)
TRANSGENIK F3 DI BALAI
PENELITIAN PEMULIAAN IKAN SUKAMANDI
SUBANG, JAWA BARAT
SULTAN AKBAR HABIBULLAH
110302019
PROGRAM STUDI MANAJEMEN SUMBERDAYA
PERAIRAN
FAKULTAS PERTANIAN
UNIVERSITAS SUMATERA UTARA
2015
Universitas Sumatera Utara
TRANSMISI TRANSGEN (PhGH) DAN PERFORMA
PERTUMBUHAN IKAN LELE (Clarias gariepinus)
TRANSGENIK F3 DI BALAI
PENELITIAN PEMULIAAN IKAN SUKAMANDI
SUBANG, JAWA BARAT
SKRIPSI
SULTAN AKBAR HABIBULLAH
110302019
PROGRAM STUDI MANAJEMEN SUMBERDAYA
PERAIRAN
FAKULTAS PERTANIAN
UNIVERSITAS SUMATERA UTARA
2015
Universitas Sumatera Utara
TRANSMISI TRANSGEN (PhGH) DAN PERFORMA
PERTUMBUHAN IKAN LELE (Clarias gariepinus)
TRANSGENIK F3 DI BALAI
PENELITIAN PEMULIAAN IKAN SUKAMANDI
SUBANG, JAWA BARAT
SKRIPSI
SULTAN AKBAR HABIBULLAH
110302019
Skripsi sebagai satu diantara beberapa syarat untuk memperoleh gelar
sarjana perikanan di Program Studi Manajemen Sumberdaya Perairan,
Fakultas Pertanian Universitas Sumatera Utara, Medan
PROGRAM STUDI MANAJEMEN SUMBERDAYA
PERAIRAN
FAKULTAS PERTANIAN
UNIVERSITAS SUMATERA UTARA
2015
Universitas Sumatera Utara
LEMBAR PENGESAHAN
Judul Penelitian
: Transmisi Transgen ( Ph GH) dan Performa Pertumbuhan
Ikan Lele ( Clarias gariepinus ) Transgenik F3 di Balai
Penelitian Pemuliaan Ikan Sukamandi Subang, Jawa Barat
Nama
: Sultan Akbar Habibullah
NIM
: 110302019
Program Studi
: Manajemen Sumberdaya Perairan
Disetujui Oleh:
Komisi Pembimbing
Prof. Ir. Zulkifli Nasution, M.Sc., Ph.D
Ketua
Dr. Ir. Yunasfi, M.Si
Anggota
Huria Marnis, S.Pi., M.Si
Anggota
Mengetahui
Dr. Ir. Yunasfi, M.Si
Ketua Program Studi Manajemen Sumberdaya Perairan
Universitas Sumatera Utara
PERNYATAAN MENGENAI SKRIPSI
DAN SUMBER INFORMASI
Dengan ini saya yang bertandatangan dibawah ini:
Nama : Sultan Akbar Habibullah
NIM : 110302019
Menyatakan bahwa skripsi yang berjudul “Transmisi Transgen ( Ph GH) dan
Performa Pertumbuhan Ikan Lele (Clarias gariepinus) Transgenik F3 di
Balai Penelitian Pemuliaan Ikan Sukamandi Subang, Jawa Barat” adalah
benar merupakan hasil karya saya sendiri dan belum pernah diajukan dalam
bentuk apapun kepada perguruan tinggi manapun. Semua sumber data dan
informasi yang berasal atau dikutip dari karya yang diterbitkan maupun yang tidak
diterbitkan dari penulis lain telah disebutkan dalam teks dan dicantumkan dalam
daftar pustaka di bagian akhir skripsi ini.
Medan, Agustus 2015
Sultan Akbar Habibullah
NIM. 110302019
Universitas Sumatera Utara
ABSTRAK
SULTAN AKBAR HABIBULLAH. Transmisi Transgen ( Ph GH) dan Performa
Pertumbuhan Ikan Lele (C. gariepinus) Transgenik F3 di Balai Penelitian
Pemuliaan Ikan Sukamandi Subang, Jawa Barat. Dibimbing oleh ZULKIFLI
NASUTION, YUNASFI dan HURIA MARNIS.
Perkembangan produksi perikanan dibidang akuakultur membutuhkan
adanya pemenuhan kebutuhan akan induk unggul untuk mempercepat laju
produksi. Teknologi transgenesis dengan introduksi transgen ( Ph GH) dapat
dilakukan untuk menghasilkan ikan cepat tumbuh dan memiliki performa yang
lebih baik. Deteksi transgen dilakukan dengan menggunakan metode PCR
(Polymerase Chain Reaction ) dan elektroforesis menggunakan benih lele
transgenik F3 progeni. Selanjutnya dilakukan pengamatan terhadap performa ikan
melalui pengukuran derajat pembuahan (jumlah telur terbuahi/total telur), derajat
penetasan (jumlah telur menetas/jumlah telur dibuahi), tingkat kelangsungan
hidup (jumlah ikan awal/jumlah ikan akhir), performa pertumbuhan (bobot ratarata transgenik F3/bobot rata-rata non-transgenik) dan efisiensi pakan (laju
pertumbuhan mutlak/konsumsi pakan harian). Hasil menunjukkan bahwa tingkat
transmisi berkisar antara 0-75% dengan rata-rata transmisi pada induk betina
pembawa transgen sebesar 2,5% (15/600) dan 14,4% (75/520) pada induk jantan
pembawa transgen. Ikan lele transgenik F3 memiliki derajat pembuahan 0,37%
lebih kecil dan memiliki derajat penetasan 4% lebih besar dibanding nontransgenik. Efisiensi pakan ikan lele transgenik lebih tinggi dibanding nontransgenik Hal ini menunjukkan ikan lele transgenik memiliki performa yang
lebih baik dibanding dengan non-transgenik.
Kata Kunci: Lele Transgenik F3, transgen ( Ph GH), transmisi, Polymerase Chain
Reaction , performa pertumbuhan
Universitas Sumatera Utara
ABSTRACT
SULTAN AKBAR HABIBULLAH. Transgene Transmission ( Ph GH) and
Growth Performance Catfish (C. gariepinus) Transgenic F3 in Research Institute
for Fish Breeding Sukamandi Subang, West Java. Under academic supervision by
ZULKIFLI NASUTION, YUNASFI and HURIA MARNIS.
Developments in the field of aquaculture fish production requires the
fulfillment of the need to accelerate the pace brood production. Transgenesis
technology with the introduction of transgenes (PhGH) can be performed to
produce the fish grow faster and have better performance. Transgene detection
was performed using the PCR method (Polymerase Chain Reaction) and
electrophoresis using transgenic catfish seed F3 progeny. Furthermore, the
observation of the performance of catfish transgenic F3 by measuring the degree
of fertilization (the number of fertilized eggs / total eggs), hatching (the number of
eggs hatched / number of fertilized eggs), the survival rate (the number of early
fish / amount of fish end), the performance of growth (weight Average transgenic
F3 / weight average non-transgenic) and feed efficiency (absolute growth rate /
daily feed intake). Results indicate that the transmission rate ranged from 0-75%
with an average transmission in the female parent carriers of the transgene by
2.5% (15/600) and 14.4% (75/520) in the male carriers of the transgene. F3
transgenic catfish have a degree of fertilization 0.37% smaller and has a hatching
4% higher than the non-transgenic. Transgenic catfish feed efficiency higher than
non-transgenic This shows transgenic catfish have better performance compared
with non-transgenic.
Keywords: Transgenic catfish F3, transgene ( Ph GH), transmission, Polymerase
Chain Reaction, growth performance
Universitas Sumatera Utara
RIWAYAT HIDUP
Penulis dilahirkan di Kabupaten Simalungun,
Provinsi Sumatera Utara pada tanggal 23 Maret 1994 dari
pasangan Selamat Lubis dan Syamsiah Siregar sebagai
anak keempat dari empat bersaudara. Jenjang pendidikan
formal yang pernah ditempuh oleh penulis adalah Sekolah
Dasar Negeri (SDN) 096761 Kampung Lalang, Kabupaten
Simalungun pada tahun 1999-2005, Madrasah Tsanawiyah
Swasta (MTsS) Al-bayaan Parbutaran, Kabupaten Simalungun pada tahun 20052008 dan Madrasah Aliyah Negeri (MAN) 1 Medan pada tahun 2008-2011.
Penulis diterima di Program Studi Manajemen Sumberdaya Perairan, Fakultas
Pertanian, Universitas Sumatera Utara pada tahun 2011 melalui jalur Seleksi
Nasional Masuk Perguruan Tinggi Negeri-Undangan (SNMPTN-Undangan).
Selama masa perkulihan penulis aktif dalam organisasi sebagai anggota
dalam
Himpunan
Mahasiswa
Manajemen
Sumberdaya
Perairan
(HIMMASPERA). Penulis juga aktif sebagai asisten laboratorium mata kuliah
Ikhtiologi pada tahun 2012 dan 2013 serta mata kuliah Fisiologi Hewan Air pada
tahun 2012. Penulis melakukan kegiatan Praktik Kerja Lapangan (PKL) pada JuliAgustus 2014 dan Penelitian pada Februari-Mei 2015 di Balai Penelitian
Pemuliaan Ikan (BPPI) Sukamandi Subang, Jawa Barat.
Universitas Sumatera Utara
KATA PENGANTAR
Puji dan syukur penulis panjatkan kehadirat Allah SWT karena atas berkat,
rahmat dan karunia-Nya sehingga penulis dapat menyelesaikan skripsi ini tepat
pada waktunya. Adapun judul dari skripsi ini adalah “Transmisi Transgen
(Ph GH) dan Performa Pertumbuhan Ikan Lele ( C. gariepinus ) Transgenik
F3 di Balai Penelitian Pemuliaan Ikan Sukamandi Subang, Jawa Barat”.
Pada kesempatan ini penulis menghaturkan banyak terima kasih kepada
Ayahanda Selamat Lubis dan Ibunda Syamsiah Siregar yang dengan lapang dada
telah membesarkan dan mendidik penulis sampai pada saat ini serta doa dan
dukungan baik moril maupun materil sehingga penulis dapat menyelesikan skripsi
ini dengan baik. Penulis juga mengucapkan terimakasih kepada kakanda Desy
Maisarah Lubis Amd. Keb, Nona Syafarina Lubis Amd. Kep dan Try Maya Sari
Lubis Amd. Keb atas doa, perhatian, dukungan, dan kasih sayang kepada penulis
dalam menyelesaikan kegiatan penelitian dan penulisan skripsi ini dengan baik.
Ucapan terimakasih juga penulis sampaikan kepada Bapak Prof. Ir.
Zulkifli Nasution, M.Sc., Ph.D, Bapak Dr. Ir. Yunasfi, M.Si dan Ibu Huria
Marnis, S.Pi., M.Si selaku ketua dan anggota komisi pembimbing yang telah
banyak memberikan bimbingan semangat serta dorongan dan saran sehingga
penulis dapat menyelesaikan skripsi ini. Penulis juga mengucapkan terimakasih
kepada Bapak Dr. Imron, S.Pi., M.Si selaku Kepala Balai Penelitian Pemuliaan
Ikan (BPPI) Sukamandi dan teknisi Laboratorium Balai Penelitian Pemuliaan Ikan
Sukamandi uni Selny, mbak Diah dan teh Ina atas arahan, kerjasama, dan
Universitas Sumatera Utara
bantuannya selama di laboratorium serta teknisi komoditas kang Ahong dan mbak
Maya atas kerjasamanya yang membangun selama penulis melakukan penelitian.
Teman seperjuangan selama penelitian Putri Widyawati dan Fery Jaksen
Sihotang yang telah meluangkan banyak waktunya untuk membantu melancarkan
penulis dalam melaksanakan kegiatan penelitian. Kepada sahabat penulis Yahya
Pintor Nasution, Dharma Yanti dan Raihan Jannah yang banyak memberikan
semangat penulis dalam menyelesaikan tulisan ini. Terimakasih kepada Ainul
Mardiah, Laily Dirda Fitrianingsih, Santa Odilia P Nainggolan, Mardiah
Hasibuan, Mas Bintang Batubara, Kartika Dewi, Sumarwan Syahputra, Julia
Syahriani Hasibuan, Horas C Martua Simatupang dan seluruh rekan-rekan
angkatan 2011 Program Studi Manajemen Sumberdaya Perairan serta kakak dan
adik PS MSP Muhammad Dafikri, Anggia Dolly S, Gracia Denata Tumanggor
dan yang tidak bisa disebutkan satu persatu atas persaudaraan, bantuan, dan
motivasi kepada penulis selama perkuliahan dan penyusunan skripsi.
Penulis berharap semoga skripsi ini dapat memberikan manfaat kepada
pembaca dan Program Studi Manajemen Sumberdaya Perairan sebagai bahan
informasi serta bermanfaat bagi pengembangan ilmu pengetahuan khususnya
dibidang pengelolaan sumberdaya perairan.
Medan, Agustus 2015
Penulis
Universitas Sumatera Utara
DAFTAR ISI
Halaman
ABSTRAK .....................................................................................................
i
ABSTRACT ....................................................................................................
ii
RIWAYAT HIDUP .................................................................................. ...
iii
KATA PENGANTAR .............................................................................. ...
iv
DAFTAR ISI ............................................................................................. ...
vi
DAFTAR GAMBAR ....................................................................................
viii
DAFTAR TABEL ..................................................................................... ...
ix
DAFTAR LAMPIRAN ............................................................................ ...
x
PENDAHULUAN
Latar Belakang ......................................................................................
Perumusan Masalah ..............................................................................
Kerangka Pemikiran .............................................................................
Tujuan Penelitian ..................................................................................
Manfaat Penelitian ................................................................................
1
3
4
5
5
TINJAUAN PUSTAKA
Teknologi Transgenesis .......................................................................
Hormon Pertumbuhan ..........................................................................
Transmisi Transgen ..............................................................................
Pertumbuhan .........................................................................................
Ikan Lele (Clarias gariepinus ) ............................................................
6
8
9
10
13
METODE PENELITIAN
Waktu dan Tempat Penelitian ..............................................................
Alat dan Bahan .....................................................................................
Ekstraksi DNA ...........................................................................
Amplifikasi PCR ( Polymerase Chain Reaction ) .....................
Elektroforesis .............................................................................
Performa Pertumbuhan ..............................................................
Prosedur Penelitian ...............................................................................
Transmisi Transgen ( Ph GH) .....................................................
Deteksi Transgen ................................................................
Hewan Uji ...................................................................
Ekstraksi DNA............................................................
Amplifikasi PCR ( Polymerase Chain Reaction ) ......
Elektroforesis ..............................................................
15
15
15
15
16
16
17
17
17
17
18
18
19
Universitas Sumatera Utara
Analisis Data.......................................................................
Performa Pertumbuhan ..............................................................
Pemeliharaan Ikan ..............................................................
Parameter Pertumbuhan ....................................................
Derajat Pembuahan dan Derajat Penetasan ..............
Laju Pertumbuhan Bobot ...........................................
Tingkat Konsumsi Pakan ...........................................
Tingkat Kelangsungan Hidup ....................................
Analisis Data.......................................................................
Pengukuran Kualitas Air ...........................................................
19
19
19
21
21
21
22
22
23
23
HASIL DAN PEMBAHASAN
Hasil.......................................................................................................
Derajat Pembuahan Derajat Penetasan dan Kelangsungan
Hidup ..........................................................................................
Transmisi Transgen ( Ph GH) .....................................................
Laju Pertumbuhan Bobot ...........................................................
Tingkat Konsumsi Pakan ...........................................................
Parameter Kualitas Air ..............................................................
Pembahasan ..........................................................................................
Derajat Pembuahan Derajat Penetasan dan Kelangsungan
Hidup ..........................................................................................
Transmisi Transgen ( Ph GH) .....................................................
Laju Pertumbuhan Bobot ...........................................................
Tingkat Konsumsi Pakan ...........................................................
Parameter Kualitas Air ..............................................................
30
31
33
35
35
KESIMPULAN DAN SARAN
Kesimpulan ...........................................................................................
Saran ......................................................................................................
38
38
24
24
24
26
39
30
30
DAFTAR PUSTAKA
LAMPIRAN
Universitas Sumatera Utara
DAFTAR GAMBAR
No.
Teks
Halaman
1. Konstruksi gen pCcBA-Ph GH ................................................................
20
2. Grafik Laju Pertumbuhan Ikan Lele Transgenik F3 Selama 50 Hari
Masa Pemeliharaan. T bar menunjukkan standar deviasi ( n =24) .........
30
3. Perbandingan Ikan Transgenik F3 (A) dan Ikan Non-transgenik (B)
setelah 20 hari masa pemeliharaan..........................................................
31
4. Perbandingan Ikan Transgenik F3 (A) dan Ikan Non-transgenik (B)
setelah 50 hari masa pemeliharaan..........................................................
31
5. Distribusi Ikan Lele Transgenik F3 (A) dan Distribusi Ikan Lele
Non-transgenik (B). .................................................................................
32
Universitas Sumatera Utara
DAFTAR TABEL
No.
Teks
Halaman
1. Derajat Pembuahan, Derajat Penetasan dan Kelangsungan Hidup
Larva Selama Satu Bulan Pemeliharaan .................................................
27
2. Persentasi Transmisi Induk Ikan Lele Transgenik F2 Hasil PCR
(Polymerase Chain Reaction ) .................................................................
28
3. Jumlah Hari Pemberian Pakan, Konsumsi Pakan, Rasio Konversi
Pakan dan Efisiensi Pakan Ikan Lele Transgenik F3 dan Nontransgenik..................................................................................................
33
4. Hasil Pengukuran Kualitas Air Kolam Selama Pemeliharaan Benih
Lele Transgenik F3 ..................................................................................
33
Universitas Sumatera Utara
DAFTAR LAMPIRAN
No.
Teks
Halaman
1. Kegiatan Penelitian ................................................................................
51
2. Metode Fenat Spektrofotometri (SNI 66-6989.30-2005) ....................
52
3. Metode Sulfalinamid Spektrofotometri (SNI 06-6989.9-2004) ..........
54
4. F-Test Two-Sample for Variances dan t-Test Laju Pertumbuhan
Bobot .......................................................................................................
56
5. Data Pengamatan Botot Ikan Lele (C. gariepinus) Transgenik
Selama Masa Pemeliharaan ...................................................................
57
6. F-Test Two-Sample for Variances dan t-Test Pakan ...........................
58
7. Hasil Pengukuran Kualitas Air ..............................................................
59
8. Laporan Hasil Uji Kandungan Amonia dan Nitrit ...............................
61
9. Data Pakan Ikan Lele (C. gariepinus ) Transgenik Selama Masa
Pemeliharaan ..........................................................................................
62
Universitas Sumatera Utara
PERTUMBUHAN IKAN LELE (Clarias gariepinus)
TRANSGENIK F3 DI BALAI
PENELITIAN PEMULIAAN IKAN SUKAMANDI
SUBANG, JAWA BARAT
SULTAN AKBAR HABIBULLAH
110302019
PROGRAM STUDI MANAJEMEN SUMBERDAYA
PERAIRAN
FAKULTAS PERTANIAN
UNIVERSITAS SUMATERA UTARA
2015
Universitas Sumatera Utara
TRANSMISI TRANSGEN (PhGH) DAN PERFORMA
PERTUMBUHAN IKAN LELE (Clarias gariepinus)
TRANSGENIK F3 DI BALAI
PENELITIAN PEMULIAAN IKAN SUKAMANDI
SUBANG, JAWA BARAT
SKRIPSI
SULTAN AKBAR HABIBULLAH
110302019
PROGRAM STUDI MANAJEMEN SUMBERDAYA
PERAIRAN
FAKULTAS PERTANIAN
UNIVERSITAS SUMATERA UTARA
2015
Universitas Sumatera Utara
TRANSMISI TRANSGEN (PhGH) DAN PERFORMA
PERTUMBUHAN IKAN LELE (Clarias gariepinus)
TRANSGENIK F3 DI BALAI
PENELITIAN PEMULIAAN IKAN SUKAMANDI
SUBANG, JAWA BARAT
SKRIPSI
SULTAN AKBAR HABIBULLAH
110302019
Skripsi sebagai satu diantara beberapa syarat untuk memperoleh gelar
sarjana perikanan di Program Studi Manajemen Sumberdaya Perairan,
Fakultas Pertanian Universitas Sumatera Utara, Medan
PROGRAM STUDI MANAJEMEN SUMBERDAYA
PERAIRAN
FAKULTAS PERTANIAN
UNIVERSITAS SUMATERA UTARA
2015
Universitas Sumatera Utara
LEMBAR PENGESAHAN
Judul Penelitian
: Transmisi Transgen ( Ph GH) dan Performa Pertumbuhan
Ikan Lele ( Clarias gariepinus ) Transgenik F3 di Balai
Penelitian Pemuliaan Ikan Sukamandi Subang, Jawa Barat
Nama
: Sultan Akbar Habibullah
NIM
: 110302019
Program Studi
: Manajemen Sumberdaya Perairan
Disetujui Oleh:
Komisi Pembimbing
Prof. Ir. Zulkifli Nasution, M.Sc., Ph.D
Ketua
Dr. Ir. Yunasfi, M.Si
Anggota
Huria Marnis, S.Pi., M.Si
Anggota
Mengetahui
Dr. Ir. Yunasfi, M.Si
Ketua Program Studi Manajemen Sumberdaya Perairan
Universitas Sumatera Utara
PERNYATAAN MENGENAI SKRIPSI
DAN SUMBER INFORMASI
Dengan ini saya yang bertandatangan dibawah ini:
Nama : Sultan Akbar Habibullah
NIM : 110302019
Menyatakan bahwa skripsi yang berjudul “Transmisi Transgen ( Ph GH) dan
Performa Pertumbuhan Ikan Lele (Clarias gariepinus) Transgenik F3 di
Balai Penelitian Pemuliaan Ikan Sukamandi Subang, Jawa Barat” adalah
benar merupakan hasil karya saya sendiri dan belum pernah diajukan dalam
bentuk apapun kepada perguruan tinggi manapun. Semua sumber data dan
informasi yang berasal atau dikutip dari karya yang diterbitkan maupun yang tidak
diterbitkan dari penulis lain telah disebutkan dalam teks dan dicantumkan dalam
daftar pustaka di bagian akhir skripsi ini.
Medan, Agustus 2015
Sultan Akbar Habibullah
NIM. 110302019
Universitas Sumatera Utara
ABSTRAK
SULTAN AKBAR HABIBULLAH. Transmisi Transgen ( Ph GH) dan Performa
Pertumbuhan Ikan Lele (C. gariepinus) Transgenik F3 di Balai Penelitian
Pemuliaan Ikan Sukamandi Subang, Jawa Barat. Dibimbing oleh ZULKIFLI
NASUTION, YUNASFI dan HURIA MARNIS.
Perkembangan produksi perikanan dibidang akuakultur membutuhkan
adanya pemenuhan kebutuhan akan induk unggul untuk mempercepat laju
produksi. Teknologi transgenesis dengan introduksi transgen ( Ph GH) dapat
dilakukan untuk menghasilkan ikan cepat tumbuh dan memiliki performa yang
lebih baik. Deteksi transgen dilakukan dengan menggunakan metode PCR
(Polymerase Chain Reaction ) dan elektroforesis menggunakan benih lele
transgenik F3 progeni. Selanjutnya dilakukan pengamatan terhadap performa ikan
melalui pengukuran derajat pembuahan (jumlah telur terbuahi/total telur), derajat
penetasan (jumlah telur menetas/jumlah telur dibuahi), tingkat kelangsungan
hidup (jumlah ikan awal/jumlah ikan akhir), performa pertumbuhan (bobot ratarata transgenik F3/bobot rata-rata non-transgenik) dan efisiensi pakan (laju
pertumbuhan mutlak/konsumsi pakan harian). Hasil menunjukkan bahwa tingkat
transmisi berkisar antara 0-75% dengan rata-rata transmisi pada induk betina
pembawa transgen sebesar 2,5% (15/600) dan 14,4% (75/520) pada induk jantan
pembawa transgen. Ikan lele transgenik F3 memiliki derajat pembuahan 0,37%
lebih kecil dan memiliki derajat penetasan 4% lebih besar dibanding nontransgenik. Efisiensi pakan ikan lele transgenik lebih tinggi dibanding nontransgenik Hal ini menunjukkan ikan lele transgenik memiliki performa yang
lebih baik dibanding dengan non-transgenik.
Kata Kunci: Lele Transgenik F3, transgen ( Ph GH), transmisi, Polymerase Chain
Reaction , performa pertumbuhan
Universitas Sumatera Utara
ABSTRACT
SULTAN AKBAR HABIBULLAH. Transgene Transmission ( Ph GH) and
Growth Performance Catfish (C. gariepinus) Transgenic F3 in Research Institute
for Fish Breeding Sukamandi Subang, West Java. Under academic supervision by
ZULKIFLI NASUTION, YUNASFI and HURIA MARNIS.
Developments in the field of aquaculture fish production requires the
fulfillment of the need to accelerate the pace brood production. Transgenesis
technology with the introduction of transgenes (PhGH) can be performed to
produce the fish grow faster and have better performance. Transgene detection
was performed using the PCR method (Polymerase Chain Reaction) and
electrophoresis using transgenic catfish seed F3 progeny. Furthermore, the
observation of the performance of catfish transgenic F3 by measuring the degree
of fertilization (the number of fertilized eggs / total eggs), hatching (the number of
eggs hatched / number of fertilized eggs), the survival rate (the number of early
fish / amount of fish end), the performance of growth (weight Average transgenic
F3 / weight average non-transgenic) and feed efficiency (absolute growth rate /
daily feed intake). Results indicate that the transmission rate ranged from 0-75%
with an average transmission in the female parent carriers of the transgene by
2.5% (15/600) and 14.4% (75/520) in the male carriers of the transgene. F3
transgenic catfish have a degree of fertilization 0.37% smaller and has a hatching
4% higher than the non-transgenic. Transgenic catfish feed efficiency higher than
non-transgenic This shows transgenic catfish have better performance compared
with non-transgenic.
Keywords: Transgenic catfish F3, transgene ( Ph GH), transmission, Polymerase
Chain Reaction, growth performance
Universitas Sumatera Utara
RIWAYAT HIDUP
Penulis dilahirkan di Kabupaten Simalungun,
Provinsi Sumatera Utara pada tanggal 23 Maret 1994 dari
pasangan Selamat Lubis dan Syamsiah Siregar sebagai
anak keempat dari empat bersaudara. Jenjang pendidikan
formal yang pernah ditempuh oleh penulis adalah Sekolah
Dasar Negeri (SDN) 096761 Kampung Lalang, Kabupaten
Simalungun pada tahun 1999-2005, Madrasah Tsanawiyah
Swasta (MTsS) Al-bayaan Parbutaran, Kabupaten Simalungun pada tahun 20052008 dan Madrasah Aliyah Negeri (MAN) 1 Medan pada tahun 2008-2011.
Penulis diterima di Program Studi Manajemen Sumberdaya Perairan, Fakultas
Pertanian, Universitas Sumatera Utara pada tahun 2011 melalui jalur Seleksi
Nasional Masuk Perguruan Tinggi Negeri-Undangan (SNMPTN-Undangan).
Selama masa perkulihan penulis aktif dalam organisasi sebagai anggota
dalam
Himpunan
Mahasiswa
Manajemen
Sumberdaya
Perairan
(HIMMASPERA). Penulis juga aktif sebagai asisten laboratorium mata kuliah
Ikhtiologi pada tahun 2012 dan 2013 serta mata kuliah Fisiologi Hewan Air pada
tahun 2012. Penulis melakukan kegiatan Praktik Kerja Lapangan (PKL) pada JuliAgustus 2014 dan Penelitian pada Februari-Mei 2015 di Balai Penelitian
Pemuliaan Ikan (BPPI) Sukamandi Subang, Jawa Barat.
Universitas Sumatera Utara
KATA PENGANTAR
Puji dan syukur penulis panjatkan kehadirat Allah SWT karena atas berkat,
rahmat dan karunia-Nya sehingga penulis dapat menyelesaikan skripsi ini tepat
pada waktunya. Adapun judul dari skripsi ini adalah “Transmisi Transgen
(Ph GH) dan Performa Pertumbuhan Ikan Lele ( C. gariepinus ) Transgenik
F3 di Balai Penelitian Pemuliaan Ikan Sukamandi Subang, Jawa Barat”.
Pada kesempatan ini penulis menghaturkan banyak terima kasih kepada
Ayahanda Selamat Lubis dan Ibunda Syamsiah Siregar yang dengan lapang dada
telah membesarkan dan mendidik penulis sampai pada saat ini serta doa dan
dukungan baik moril maupun materil sehingga penulis dapat menyelesikan skripsi
ini dengan baik. Penulis juga mengucapkan terimakasih kepada kakanda Desy
Maisarah Lubis Amd. Keb, Nona Syafarina Lubis Amd. Kep dan Try Maya Sari
Lubis Amd. Keb atas doa, perhatian, dukungan, dan kasih sayang kepada penulis
dalam menyelesaikan kegiatan penelitian dan penulisan skripsi ini dengan baik.
Ucapan terimakasih juga penulis sampaikan kepada Bapak Prof. Ir.
Zulkifli Nasution, M.Sc., Ph.D, Bapak Dr. Ir. Yunasfi, M.Si dan Ibu Huria
Marnis, S.Pi., M.Si selaku ketua dan anggota komisi pembimbing yang telah
banyak memberikan bimbingan semangat serta dorongan dan saran sehingga
penulis dapat menyelesaikan skripsi ini. Penulis juga mengucapkan terimakasih
kepada Bapak Dr. Imron, S.Pi., M.Si selaku Kepala Balai Penelitian Pemuliaan
Ikan (BPPI) Sukamandi dan teknisi Laboratorium Balai Penelitian Pemuliaan Ikan
Sukamandi uni Selny, mbak Diah dan teh Ina atas arahan, kerjasama, dan
Universitas Sumatera Utara
bantuannya selama di laboratorium serta teknisi komoditas kang Ahong dan mbak
Maya atas kerjasamanya yang membangun selama penulis melakukan penelitian.
Teman seperjuangan selama penelitian Putri Widyawati dan Fery Jaksen
Sihotang yang telah meluangkan banyak waktunya untuk membantu melancarkan
penulis dalam melaksanakan kegiatan penelitian. Kepada sahabat penulis Yahya
Pintor Nasution, Dharma Yanti dan Raihan Jannah yang banyak memberikan
semangat penulis dalam menyelesaikan tulisan ini. Terimakasih kepada Ainul
Mardiah, Laily Dirda Fitrianingsih, Santa Odilia P Nainggolan, Mardiah
Hasibuan, Mas Bintang Batubara, Kartika Dewi, Sumarwan Syahputra, Julia
Syahriani Hasibuan, Horas C Martua Simatupang dan seluruh rekan-rekan
angkatan 2011 Program Studi Manajemen Sumberdaya Perairan serta kakak dan
adik PS MSP Muhammad Dafikri, Anggia Dolly S, Gracia Denata Tumanggor
dan yang tidak bisa disebutkan satu persatu atas persaudaraan, bantuan, dan
motivasi kepada penulis selama perkuliahan dan penyusunan skripsi.
Penulis berharap semoga skripsi ini dapat memberikan manfaat kepada
pembaca dan Program Studi Manajemen Sumberdaya Perairan sebagai bahan
informasi serta bermanfaat bagi pengembangan ilmu pengetahuan khususnya
dibidang pengelolaan sumberdaya perairan.
Medan, Agustus 2015
Penulis
Universitas Sumatera Utara
DAFTAR ISI
Halaman
ABSTRAK .....................................................................................................
i
ABSTRACT ....................................................................................................
ii
RIWAYAT HIDUP .................................................................................. ...
iii
KATA PENGANTAR .............................................................................. ...
iv
DAFTAR ISI ............................................................................................. ...
vi
DAFTAR GAMBAR ....................................................................................
viii
DAFTAR TABEL ..................................................................................... ...
ix
DAFTAR LAMPIRAN ............................................................................ ...
x
PENDAHULUAN
Latar Belakang ......................................................................................
Perumusan Masalah ..............................................................................
Kerangka Pemikiran .............................................................................
Tujuan Penelitian ..................................................................................
Manfaat Penelitian ................................................................................
1
3
4
5
5
TINJAUAN PUSTAKA
Teknologi Transgenesis .......................................................................
Hormon Pertumbuhan ..........................................................................
Transmisi Transgen ..............................................................................
Pertumbuhan .........................................................................................
Ikan Lele (Clarias gariepinus ) ............................................................
6
8
9
10
13
METODE PENELITIAN
Waktu dan Tempat Penelitian ..............................................................
Alat dan Bahan .....................................................................................
Ekstraksi DNA ...........................................................................
Amplifikasi PCR ( Polymerase Chain Reaction ) .....................
Elektroforesis .............................................................................
Performa Pertumbuhan ..............................................................
Prosedur Penelitian ...............................................................................
Transmisi Transgen ( Ph GH) .....................................................
Deteksi Transgen ................................................................
Hewan Uji ...................................................................
Ekstraksi DNA............................................................
Amplifikasi PCR ( Polymerase Chain Reaction ) ......
Elektroforesis ..............................................................
15
15
15
15
16
16
17
17
17
17
18
18
19
Universitas Sumatera Utara
Analisis Data.......................................................................
Performa Pertumbuhan ..............................................................
Pemeliharaan Ikan ..............................................................
Parameter Pertumbuhan ....................................................
Derajat Pembuahan dan Derajat Penetasan ..............
Laju Pertumbuhan Bobot ...........................................
Tingkat Konsumsi Pakan ...........................................
Tingkat Kelangsungan Hidup ....................................
Analisis Data.......................................................................
Pengukuran Kualitas Air ...........................................................
19
19
19
21
21
21
22
22
23
23
HASIL DAN PEMBAHASAN
Hasil.......................................................................................................
Derajat Pembuahan Derajat Penetasan dan Kelangsungan
Hidup ..........................................................................................
Transmisi Transgen ( Ph GH) .....................................................
Laju Pertumbuhan Bobot ...........................................................
Tingkat Konsumsi Pakan ...........................................................
Parameter Kualitas Air ..............................................................
Pembahasan ..........................................................................................
Derajat Pembuahan Derajat Penetasan dan Kelangsungan
Hidup ..........................................................................................
Transmisi Transgen ( Ph GH) .....................................................
Laju Pertumbuhan Bobot ...........................................................
Tingkat Konsumsi Pakan ...........................................................
Parameter Kualitas Air ..............................................................
30
31
33
35
35
KESIMPULAN DAN SARAN
Kesimpulan ...........................................................................................
Saran ......................................................................................................
38
38
24
24
24
26
39
30
30
DAFTAR PUSTAKA
LAMPIRAN
Universitas Sumatera Utara
DAFTAR GAMBAR
No.
Teks
Halaman
1. Konstruksi gen pCcBA-Ph GH ................................................................
20
2. Grafik Laju Pertumbuhan Ikan Lele Transgenik F3 Selama 50 Hari
Masa Pemeliharaan. T bar menunjukkan standar deviasi ( n =24) .........
30
3. Perbandingan Ikan Transgenik F3 (A) dan Ikan Non-transgenik (B)
setelah 20 hari masa pemeliharaan..........................................................
31
4. Perbandingan Ikan Transgenik F3 (A) dan Ikan Non-transgenik (B)
setelah 50 hari masa pemeliharaan..........................................................
31
5. Distribusi Ikan Lele Transgenik F3 (A) dan Distribusi Ikan Lele
Non-transgenik (B). .................................................................................
32
Universitas Sumatera Utara
DAFTAR TABEL
No.
Teks
Halaman
1. Derajat Pembuahan, Derajat Penetasan dan Kelangsungan Hidup
Larva Selama Satu Bulan Pemeliharaan .................................................
27
2. Persentasi Transmisi Induk Ikan Lele Transgenik F2 Hasil PCR
(Polymerase Chain Reaction ) .................................................................
28
3. Jumlah Hari Pemberian Pakan, Konsumsi Pakan, Rasio Konversi
Pakan dan Efisiensi Pakan Ikan Lele Transgenik F3 dan Nontransgenik..................................................................................................
33
4. Hasil Pengukuran Kualitas Air Kolam Selama Pemeliharaan Benih
Lele Transgenik F3 ..................................................................................
33
Universitas Sumatera Utara
DAFTAR LAMPIRAN
No.
Teks
Halaman
1. Kegiatan Penelitian ................................................................................
51
2. Metode Fenat Spektrofotometri (SNI 66-6989.30-2005) ....................
52
3. Metode Sulfalinamid Spektrofotometri (SNI 06-6989.9-2004) ..........
54
4. F-Test Two-Sample for Variances dan t-Test Laju Pertumbuhan
Bobot .......................................................................................................
56
5. Data Pengamatan Botot Ikan Lele (C. gariepinus) Transgenik
Selama Masa Pemeliharaan ...................................................................
57
6. F-Test Two-Sample for Variances dan t-Test Pakan ...........................
58
7. Hasil Pengukuran Kualitas Air ..............................................................
59
8. Laporan Hasil Uji Kandungan Amonia dan Nitrit ...............................
61
9. Data Pakan Ikan Lele (C. gariepinus ) Transgenik Selama Masa
Pemeliharaan ..........................................................................................
62
Universitas Sumatera Utara