ISOLASI DNA DENGAN METODE DOYLE AND DOYLE DAN ANALISIS RAPD PADA SAWO - UNS Institutional Repository

  ISOLASI DNA DENGAN METODE DOYLE AND DOYLE DAN ANALISIS RAPD PADA SAWO SKRIPSI Untuk memenuhi sebagian persyaratan guna memperoleh derajat Sarjana Pertanian di Fakultas Pertanian Universitas Sebelas Maret Oleh Agus Santika Sitepu H0713012 PROGRAM STUDI AGROTEKNOLOGI FAKULTAS PERTANIAN UNIVERSITAS SEBELAS MARET SURAKARTA AGUSTUS 2017

  

ISOLASI DNA DENGAN METODE DOYLE AND DOYLE DAN ANALISIS RAPD

PADA SAWO

Agus Santika Sitepu

H0713012

Pembimbing Utama Pembimbing Pendamping Dr. Ir. Endang Yuniastuti, M.Si Dr. Ir. Parjanto, MP NIP. 197006091994022001 NIP. 196203231988031001

  

Surakarta, 31 Agustus 2017

Program Studi Agroteknologi

Kepala,

Prof. Dr. Ir. H. Bambang Pujiasmanto, M.S.

  

NIP. 195602251986011001

SKRIPSI

  

ISOLASI DNA DENGAN METODE DOYLE AND DOYLE DAN ANALISIS RAPD

PADA SAWO

Yang dipersiapkan dan disusun oleh:

  

Agus Santika Sitepu

H0713012

Telah dipertahankan di depan Tim Penguji

Pada tanggal:

  

Dan dinyatakan telah memenuhi syarat

untuk memperoleh gelar (derajat) Sarjana Pertanian

Program Studi Agroteknologi

Susunan Tim Penguji

  Ketua Anggota I Anggota II Dr. Ir. Endang Yuniastuti, M.Si Dr. Ir. Parjanto, MP Ir. Sukaya, M.S.

  

NIP. 197006091994022001 NIP. 196203231988031001 NIP. 195905151986031004

PERNYATAAN

Dengan ini saya Nama: Agus Santika Sitepu NIM: H0713012 Program Studi :

Agroteknologi menyatakan bahwa dalam skripsi saya yang berjudul “ISOLASI DNA

  

tidak terdapat karya yang pernah diajukan untuk memperoleh gelar akademik dan

sepanjang pengetahuan penulis juga tidak ada unsur plagiarisme, falsifikasi,

fabrikasi karya, data, atau pendapat yang pernah ditulis atau diterbitkan oleh penulis

lain, kecuali yang secara tertulis diacu dalam naskah ini dan disebutkan dalam daftar

pustaka.

  Pernyataan ini saya buat dengan sebenar-benarnya dan apabila dikemudian

hari terbukti ada penyimpangan dari pernyataan tersebut, maka saya bersedia

menerima sanksi sesuai ketentuan yang berlaku.

  Surakarta, 31 Agustus 2017 Yang menyatakan Agus Santika Sitepu NIM.H0713012 Puji Syukur penulis panjatkan kehadirat Tuhan Yang Maha Esa yang telah melimpahkan segala rahmat dan berkat-Nya, sehingga penulis dapat menyelesaikan penelitian sekaligus penyusunan sktipsi ini. Dalam penulisan skripsi ini tentunya penulis tidak lepas dari bantuan berbagai pihak. Oleh karenanya, penulis mengucapkan terimakasih kepada :

  1. Prof. Dr. Ir. Bambang Pujiasmanto, MS., selaku Dekan Fakultas Pertanian Universitas Sebelas Maret Surakarta.

  2. Dr. Ir. Endang Yuniastuti, M.Si, selaku pembimbing utama yang telah memberikan banyak arahan, masukan, saran, ide, dan nasehat untuk penulisan skripsi ini.

  3. Dr. Ir. Parjanto, M.P. selaku pembimbing pendamping yang telah memberikan koreksi, bimbingan dan saran dalam penulisan skripsi ini.

  4. Ir. Sukaya, M.S. selaku dosen penguji saya yang telah memberikan koreksi, bimbingan serta saran dalam penulisan skripsi ini.

  5. Dr. Ir. Pardono, M. S, selaku dosen pembimbing akademik yang telah memberikan bimbingan dan nasehat selama perkuliahan.

  6. Mamak dan Bapak tercinta, serta adik-adikku, Cheptiana, Sonia dan Okta yang telah memberikan kasih sayang tak terhingga, doa, nasehat, dan dukungan.

  7. Hisyan Fery Yando yang selalu memberikan semangat, doa, dan dukungan

  8. Keluarga Alsfifagetsu-Fe yang selalu memberi dukungan dan doa

  9. Keluarga Naposo HKBP Solo, Naposo Angkatan 2013, khususnya Ade Indah, Vania, Grace, Abdi dan Julio yang telah memberikan pengalaman luar biasa, suka, duka, dan semangat yang diberikan kepada saya.

  10. Keluarga Agroteknologi 2013, Keluarga PMK UNS dan PMK FP yang senantiasa memberikan doa dan dukungan.

  Penulis menyadari bahwa dalam pembuatan skripsi ini masih banyak kekurangan. Oleh karena itu, saran dan kritik yang bersifat membangun sangat diharapkan agar dapat lebih baik. Akhirnya penulis berharap semoga skripsi ini dapat memberikan manfaat bagi penulis sendiri khususnya dan bagi para pembanya pada umumnya.

  Surakarta, 31 Agustus 2017 Penulis

  DAFTAR ISI

  A. Waktu dan Tempat Penelitian ................................................................. 13

  B. Saran ...................................................................................................... 31

  A. Kesimpulan ............................................................................................. 31

  V. KESIMPULAN DAN SARAN .......................................................................... 31

  B. Identifikasi Keragaman Genetik Sawo .................................................... 24

  A. Uji Kualitas dan Kuantitas DNA Sawo ..................................................... 19

  IV. PEMBAHASAN ............................................................................................. 19

  D. Analisis Data ........................................................................................... 18

  C. Pelaksanaan Penelitian .......................................................................... 13

  B. Alat dan Bahan Penelitian ....................................................................... 13

  III. METODE PENELITIAN ................................................................................. 13

  Halaman

  D. RAPD ..................................................................................................... 10

  C. Isolasi DNA ............................................................................................... 7

  B. Analisis Keragaman Genetik ..................................................................... 6

  A. Sawo (Achras zapota L) ........................................................................... 4

  II. TINJAUAN PUSTAKA ...................................................................................... 4

  C. Tujuan Penelitian ...................................................................................... 3

  B. Perumusan Masalah ................................................................................. 3

  A. Latar belakang .......................................................................................... 1

  I. PENDAHULUAN .............................................................................................. 1

  HALAMAN JUDUL ................................................................................................ i HALAMAN PENGESAHAN .................................................................................. ii HALAMAN PERSETUJUAN ................................................................................ iii PERNYATAAN .................................................................................................... iv KATA PENGANTAR ........................................................................................... vi DAFTAR ISI ....................................................................................................... vii DAFTAR TABEL ................................................................................................viii DAFTAR GAMBAR ............................................................................................. ix DAFTAR LAMPIRAN ........................................................................................... x RINGKASAN ....................................................................................................... xi SUMMARY ........................................................................................................ xii

  DAFTAR PUSTAKA

  Nomor Judul Halaman

  A. Tabel 1. Hasil Uji Kuantitatif DNA Sawo (Achras Zapota) ....................... 22

  B. Tabel 2. Jenis primer, urutan basa, jumlah lokus teramplifikasi dan polimorfisme DNA sawo ....................................................................................................... 27 C. Tabel 3. Matriks Koefisien Kemiripan Genetik Sawo Manyaran dengan sawo

  Bojonegoro berdasarkan Amplifikasi DNA .............................................. 29

  

DAFTAR GAMBAR

Nomor Judul Halaman

  A. Gambar 1. Hasil Uji Kualitas DNA dengan Elektroforesis ....................... 23 B. Gambar 2. Interpretasi hasil amplifikasi DNA sawo menggunakan beberapa primer.

  26