ISOLASI DAN SKRINING BAKTERI SELULOLITIK DARI SALURAN PENCERNAAN LARVA Oryctes rhinoceros (COLEOPTERA: SCARABAEIDAE).
perpustakaan.uns.ac.id
digilib.uns.ac.id
ISOLASI DAN SKRINING BAKTERI SELULOLITIK DARI SALURAN
PENCERNAAN LARVA Oryctes rhinoceros
(COLEOPTERA: SCARABAEIDAE)
Skripsi
Untuk memenuhi sebagian persyaratan
guna memperoleh gelar Sarjana Sains
Oleh :
Wahyu Hidayat
NIM. M0408118
JURUSAN BIOLOGI
FAKULTAS MATEMATIKA DAN ILMU PENGETAHUAN ALAM
UNIVERSITAS SEBELAS MARET
SURAKARTA
commit
to user
2013
1
perpustakaan.uns.ac.id
digilib.uns.ac.id
commit to user
2
perpustakaan.uns.ac.id
digilib.uns.ac.id
PERNYATAAN
Dengan ini saya menyatakan bahwa skripsi ini adalah hasil penelitian saya sendiri
dan tidak terdapat karya yang pernah diajukan untuk memperoleh gelar
kesarjanaan di suatu perguruan tinggi, serta tidak terdapat karya atau pendapat
yang pernah ditulis atau diterbitkan oleh orang lain, kecuali secara tertulis diacu
dalam naskah ini dan disebutkan dalam daftar pustaka.
Apabila di kemudian hari dapat ditemukan adanya unsur penjiplakan maka gelar
kesarjanaan yang telah diperoleh dapat ditinjau dan/atau dicabut.
Surakarta, 15 Juli 2013
Wahyu Hidayat
NIM. M0408118
commit to user
3
perpustakaan.uns.ac.id
digilib.uns.ac.id
ISOLASI DAN SKRINING BAKTERI SELULOLITIK DARI SALURAN
PENCERNAAN LARVA Oryctes rhinoceros
(COLEOPTERA: SCARABAEIDAE)
Wahyu Hidayat
Jurusan Biologi, Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam,
Universitas Sebelas Maret, Surakarta
Abstrak
Tujuan dari penelitian ini adalah mengisolasi, mengidentifikasi dan skrining
bakteri yang potensial menghasilkan selulase dari saluran pencernaan Oryctes
rhinoceros (coleoptera: scarabaeidae). Teknik isolasi diawali menggunakan
metode cawan sebar dan dilanjutkan metode empat kuadran. Skrining bakteri
selulolitik potensial berdasarkan pembentukan zona bening pada media LA yang
mengandung CMC 1%). Pada penelitian ini, 28 strain bakteri telah diisolasi
dengan nama isolat OR01, OR02, OR03 sampai OR28. Aktivitas selulolitik
tertinggi dihasilkan oleh strain OR08, OR14 dan OR17. Berdasarkan karakteristik
morfologi dan biokimia menunjukan bakteri ini adalah Bacillus pumilus OR08, B.
Cereus OR14, dan B.subtilis OR17.
Kata Kunci: Oryctes rhinoceros, Bakteri selulolitik, Bacillus pumilus OR08, B.
Cereus OR14, B.subtilis OR17
commit to user
4
perpustakaan.uns.ac.id
digilib.uns.ac.id
ISOLATION AND SCREENING OF CELLULOLYTIC BACTERIAFROM
THE ALIMENTARY TRACT OF Oryctes rhinoceros (COLEOPTERA:
SCARABAEIDAE)
Wahyu Hidayat
Biology Departement, Sciences and Mathematics Faculty,
Sebelas Maret University, Surakarta
Abstract
The aim of this study was to isolated, identificated and screened of bacteria with
potential cellulolytic from alimentary tract of Oryctes rhinoceros (coleoptera:
scarabaeidae). The isolation technique was initiated using spread plate and
continued by four kuadran method. Screening of potential cellulolytic bacteria
potential is based on formation of a clear zone on the LA media containing 1%
CMC. In this study, 28 strains of bacteria were isolated, namely as OR01, OR02,
OR03 to OR28. The highest cellulolytic enzymes were with
Carboxymethylcellulase was produced by Strain OR08, OR14 and OR17. Thes
strains ware selected for identification using biochemical tests. Based on
morphology and biochemistry characteristics showed thes bacterias were Bacillus
pumilus OR08, B. Cereus OR14, and B.subtilis OR17.
Key word: Oryctes rhinoceros, cellulolytic bacteria, Bacillus pumilus OR08, B.
Cereus OR14, B.subtilis OR17
commit to user
5
perpustakaan.uns.ac.id
digilib.uns.ac.id
MOTTO
―Iqra Bismi Rabbika Ladhi Khalaq - Read! In the name of your Lord who created
(everything)‖
(Q. Al ‗Alaq (96): 1)
―kita singkirkan batas-batas kenormalan, kita harus menjadi aneh-Patrick Star‖
(Spongebob Squarepant)
―Tahhajud, Dhuha, Sedekah‖
(Ippho)
―Hi wa mata noboru-The sun will rise again‖
(Toriko)
―"Berpikirlah sederhana dan efisien, maka kesuksesan akan mengikutimu Rhancodas Chancad Samladas‖
(3 Idiot)
commit to user
6
perpustakaan.uns.ac.id
digilib.uns.ac.id
PERSEMBAHAN
Skripsi ini saya persembahkan pada:
1. Alloh SWT, Tuhan Pencipta Segalanya, AllhamdulilLah,
Terima kasih atas kemudahan yang telah diberikan pada
saya sehingga dapat menyelesaikan skripsi ini tepat
waktu. AllhamdulilLah telah memberikan kelancaran
dan banyak pelajaran daglam perjalan hidup ini.
AllhamdulilLah memberikan beribu-ribu kesempatan
pada saya untuk berubah menjadi lebih baik lagi dan lagi.
AllhamdulilLah
untuk
bisa
AllhamdulilLah,
AllohuAkbarrr...
2. Kedua orang tua saya dan keluarga. Terutama ayah yang
sangat luar biasa pengorbanannya untuk saya. Dia tak
pernah lelah untuk membuat saya tersenyum.
commit to user
7
perpustakaan.uns.ac.id
digilib.uns.ac.id
KATA PENGANTAR
Pertama-tama penulis memanjatkan puji syukur ke hadirat Allah SWT
yang senantiasa melimpahkan kasih, rahmat serta hidayah-Nya sehingga penulis
dapat menyelesaikan penelitian dan penyusunan skripsi dengan judul : ―Isolasi
dan skrining bakteri selulolitik dari saluran pencernaan larva kumbang badak
(Oryctes rhinoceros)‖. Penyusunan skripsi ini merupakan salah satu syarat untuk
memperoleh gelar kesarjanaan strata 1 (S1) di Jurusan Biologi, Fakultas
Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam, Universitas Sebelas Maret, Surakarta.
Selama melakukan penelitian dan penyusunan skripsi, penulis telah
mendapatkan banyak masukan dan dukungan dari berbagai pihak yang sangat
membantu dan bermanfaat dalam penyelesaian skripsi ini. Oleh karena itu pada
kesempatan yang berbahagia ini penulis ingin mengucapkan terima kasih yang
sebesar-besarnya kepada :
1. Prof.Ir. Ari Handono Ramelan, M.Sc. (Hons), Ph.D. selaku Dekan
Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam, Universitas Sebelas
Maret, Surakarta yang telah memberikan dukungan dan dorongan baik
secara langsung maupun tidak langsung.
2. Dr. Agung Budiharjo, M.Si., selaku Ketua Jurusan Biologi dan Dosen
Penelaah II, Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam,
Universitas Sebelas Maret, Surakarta yang telah memberikan izin dan
dukungannya selama penelitian.
3. Dr. Artini Pangastuti, M.Si., selaku Dosen Pembimbing I yang telah
memberikan proyek penelitian, saran dan bimbingannya dari awal
penelitian hingga terselesaikannya penyusunan skripsi ini.
4. Siti Lusi Arumsari, M.Biotech., selaku Dosen Pembimbing II yang telah
memberikan saran dan bimbingan dari awal hingga terselesaikannya
penyusunan skripsi ini.
5. Tjahjadi Purwoko, M.Si., selaku Dosen Penelaah I yang telah memberikan
to user
bimbingan serta dukungancommit
baik secara
moril maupun materiil.
8
perpustakaan.uns.ac.id
digilib.uns.ac.id
6. Dra. Noor Soesanti H., selaku Pembimbing Akademik beserta dosendosen di Jurusan Biologi, Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan
Alam, Universitas Sebelas Maret, Surakarta yang telah mendidik dan
memberikan dorongan baik moril maupun spiritual sehingga penulis dapat
menyelesaikan skripsi ini.
7. Mas Munir dan mas Agus selaku pengurus Jurusan serta Mas Adnan,
Mbak Atik, dan Mbak Nina selaku laboran yang telah membantu
kelancaran penelitian ini.
8. Kepala dan staf Laboratorium Pusat, Sub Laboratorium Biologi
Universitas Sebelas Maret, Surakarta yang telah memberikan izin
penelitian beserta sarana, prasarana dan bantuan selama penelitian.
9. Mbak Sri yang telah banyak membantu dan senantiasa memberikan
banyak petunjuk. Semua pihak yang telah membantu dalam penyelesaian
skripsi ini yang tidak dapat disebutkan satu persatu.
Penulis menyadari sepenuhnya bahwa dalam melakukan penelitian hingga
penyusunan skripsi ini masih jauh dari sempurna. Oleh karena itu masukan yang
berupa saran dan kritik yang bersifat membangun sangat penulis harapkan.
Semoga skripsi ini dapat bermanfaat bagi kita semua dan pihak-pihak yang
berkepentingan.
Surakarta, 15 Juli 2013
Penyusun
commit to user
9
perpustakaan.uns.ac.id
digilib.uns.ac.id
DAFTAR ISI
Halaman
HALAMAN JUDUL........................................................................................ i
HALAMAN PERSETUJUAN PEMBIMBING .............................................. ii
HALAMAN PENGESAHAN .......................................................................... iii
PERNYATAAN ............................................................................................... iv
ABSTRAK ....................................................................................................... v
ABSTRACT ..................................................................................................... vi
MOTTO ........................................................................................................... vii
PERSEMBAHAN ............................................................................................ viii
KATA PENGANTAR ..................................................................................... ix
DAFTAR ISI .................................................................................................... xi
DAFTAR TABEL ............................................................................................ xiii
DAFTAR GAMBAR ....................................................................................... xiv
DAFTAR LAMPIRAN .................................................................................... xv
DAFTAR SINGKATAN ................................................................................. xvi
BAB I. PENDAHULUAN ............................................................................... 1
A. Latar Belakang .............................................................................. 1
B. Perumusan Masalah ....................................................................... 3
C. Tujuan Penelitian ........................................................................... 4
D. Manfaat Penelitian ......................................................................... 4
BAB II. LANDASAN TEORI ......................................................................... 5
A. Tinjauan Pustaka ............................................................................ 5
1. Selulosa .................................................................................... 5
2. Hidrolisis Selulosa oleh Enzim Selulase .................................. 7
3. Aplikasi Selulase ...................................................................... 10
4. Mikroba Endosimbion pada Saluran Pencernaan Arthropoda
(Famili: Scarabaeidae)............................................................. 11
5. Kumbang Badak (Oryctes rhinoceros L.) ................................ 14
commit to user
B. Kerangka pemikiran .......................................................................
16
10
perpustakaan.uns.ac.id
digilib.uns.ac.id
BAB III. METODE PENELITIAN.................................................................. 18
A. Waktu dan Tempat Penelitian ........................................................ 18
B. Alat dan Bahan Penelitian .............................................................. 18
C. Cara Kerja ...................................................................................... 19
BAB IV. HASIL DAN PEMBAHASAN ........................................................ 23
BAB V. PENUTUP.......................................................................................... 33
A. Kesimpulan .................................................................................... 33
B. Saran ............................................................................................... 33
DAFTAR PUSTAKA ...................................................................................... 34
LAMPIRAN ..................................................................................................... 47
RIWAYAT HIDUP PENULIS ........................................................................ 62
commit to user
11
perpustakaan.uns.ac.id
digilib.uns.ac.id
DAFTAR TABEL
Halaman
Tabel 1. Komposisi komponen biomassa ........................................................
5
Tabel 2. Tujuan masing-masing Uji Biokimia dan Pewarnaan Bakteri ......... 22
Tabel 3. Hasil uji kuantitatif dan skrining bakteri selulolitik dari saluran
pencernaan larva Oryctes rhinoceros pada media CMC................... 24
commit to user
12
perpustakaan.uns.ac.id
digilib.uns.ac.id
DAFTAR GAMBAR
Halaman
Gambar 1. Struktur kimia selulosa ................................................................ 6
Gambar 2. Enzim yang terlibat dalam pemecahan selulosa .......................... 8
Gambar 3. Siklus hidup O.rhinoceros ........................................................... 15
Gambar 4. Kerangka Pemikiran .................................................................... 17
Gambar 5. Hasil penumbuhan isi saluran pencernaan larva O.rhinoceros
pengenceran 10-3pada media LA selama 48 jam, 37oC............... 23
Gambar 6. Hasil isolat tunggal strain OR14 dengan metode 4 kuadran pada
media LA selama 48 jam, 37oC. .................................................. 24
Gambar 7. Zona bening yang terbentuk setelah pewarnaan dengan congo
red pada isolat OR14 yang ditumbuhkan pada media CMC
selama 24 jam, 37oC. ................................................................... 29
commit to user
13
perpustakaan.uns.ac.id
digilib.uns.ac.id
DAFTAR LAMPIRAN
Halaman
Lampiran 1. Karakteristik morfologi koloni isolat bakteri yang terdapat
pada saluran pencernaan larva O.rhinoceros ditumbuhkan
pada media CMC .......................................................................
47
Lampiran 2. Karakteristik morfologi 15 isolat bakteri O.rhinoceros yang
memiliki aktivitas enzim tertinggi .............................................
48
Lampiran 3. Sampel Larva O. rhinoceros ......................................................
48
Lampiran 4. Hasil perhitungan kuantitatif aktivitas enzim sulalase isolat
bakteri pada saluran pencernaan O. rhinoceros ........................
49
Lampiran 5. Hasil skrining isolat-isolat pada media CMC dan
sebagian uji Gram .....................................................................
50
Lampiran 6. Hasil identifikasi bakteri secara uji Biokimia oleh
BLK-Yogyakarta .......................................................................
57
Lampiran 7. Hasil identifikasi genus isolat-isolat paling potensial
menghasilkan selulase dengan Bergey's Manual of
Determinative Bacteriology. 9th Edition ...................................
58
Lampiran 8. Hasil identifikasi Spesies isolat-isolat paling potensial
menghasilkan selulase Bergey’s Manual of
Systematic Bacteriology, Vol. 3: The Firmicutes ......................
58
Lampiran 9. Hasil identifikasi isolat-isolat potensial menghasilkan
selulase menggunakan ABIS (Advanced Bacterial
Identification Software).............................................................
59
commit to user
14
perpustakaan.uns.ac.id
digilib.uns.ac.id
DAFTAR SINGKATAN
Singkatan
CMC
LA
LB
sRNA
CMCase
G/ C
ABIS
NaOH
NaCl
CBH
EC
BG
OR
Kepanjangan
carboxymethylcelollose
Luria-Bertani agar
Luria-Bertani Broth
single-stranded ribonucleic acid
carboxymethylcelullase
Guanin/ Cytocin
Advanced Bacterial Identification Software
Natrium Hidroksida
Natrium Klorida
Cellobiohydrolase
Enzim Code
Β-glucosidase
Oryctes rhinoceros
commit to user
15
digilib.uns.ac.id
ISOLASI DAN SKRINING BAKTERI SELULOLITIK DARI SALURAN
PENCERNAAN LARVA Oryctes rhinoceros
(COLEOPTERA: SCARABAEIDAE)
Skripsi
Untuk memenuhi sebagian persyaratan
guna memperoleh gelar Sarjana Sains
Oleh :
Wahyu Hidayat
NIM. M0408118
JURUSAN BIOLOGI
FAKULTAS MATEMATIKA DAN ILMU PENGETAHUAN ALAM
UNIVERSITAS SEBELAS MARET
SURAKARTA
commit
to user
2013
1
perpustakaan.uns.ac.id
digilib.uns.ac.id
commit to user
2
perpustakaan.uns.ac.id
digilib.uns.ac.id
PERNYATAAN
Dengan ini saya menyatakan bahwa skripsi ini adalah hasil penelitian saya sendiri
dan tidak terdapat karya yang pernah diajukan untuk memperoleh gelar
kesarjanaan di suatu perguruan tinggi, serta tidak terdapat karya atau pendapat
yang pernah ditulis atau diterbitkan oleh orang lain, kecuali secara tertulis diacu
dalam naskah ini dan disebutkan dalam daftar pustaka.
Apabila di kemudian hari dapat ditemukan adanya unsur penjiplakan maka gelar
kesarjanaan yang telah diperoleh dapat ditinjau dan/atau dicabut.
Surakarta, 15 Juli 2013
Wahyu Hidayat
NIM. M0408118
commit to user
3
perpustakaan.uns.ac.id
digilib.uns.ac.id
ISOLASI DAN SKRINING BAKTERI SELULOLITIK DARI SALURAN
PENCERNAAN LARVA Oryctes rhinoceros
(COLEOPTERA: SCARABAEIDAE)
Wahyu Hidayat
Jurusan Biologi, Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam,
Universitas Sebelas Maret, Surakarta
Abstrak
Tujuan dari penelitian ini adalah mengisolasi, mengidentifikasi dan skrining
bakteri yang potensial menghasilkan selulase dari saluran pencernaan Oryctes
rhinoceros (coleoptera: scarabaeidae). Teknik isolasi diawali menggunakan
metode cawan sebar dan dilanjutkan metode empat kuadran. Skrining bakteri
selulolitik potensial berdasarkan pembentukan zona bening pada media LA yang
mengandung CMC 1%). Pada penelitian ini, 28 strain bakteri telah diisolasi
dengan nama isolat OR01, OR02, OR03 sampai OR28. Aktivitas selulolitik
tertinggi dihasilkan oleh strain OR08, OR14 dan OR17. Berdasarkan karakteristik
morfologi dan biokimia menunjukan bakteri ini adalah Bacillus pumilus OR08, B.
Cereus OR14, dan B.subtilis OR17.
Kata Kunci: Oryctes rhinoceros, Bakteri selulolitik, Bacillus pumilus OR08, B.
Cereus OR14, B.subtilis OR17
commit to user
4
perpustakaan.uns.ac.id
digilib.uns.ac.id
ISOLATION AND SCREENING OF CELLULOLYTIC BACTERIAFROM
THE ALIMENTARY TRACT OF Oryctes rhinoceros (COLEOPTERA:
SCARABAEIDAE)
Wahyu Hidayat
Biology Departement, Sciences and Mathematics Faculty,
Sebelas Maret University, Surakarta
Abstract
The aim of this study was to isolated, identificated and screened of bacteria with
potential cellulolytic from alimentary tract of Oryctes rhinoceros (coleoptera:
scarabaeidae). The isolation technique was initiated using spread plate and
continued by four kuadran method. Screening of potential cellulolytic bacteria
potential is based on formation of a clear zone on the LA media containing 1%
CMC. In this study, 28 strains of bacteria were isolated, namely as OR01, OR02,
OR03 to OR28. The highest cellulolytic enzymes were with
Carboxymethylcellulase was produced by Strain OR08, OR14 and OR17. Thes
strains ware selected for identification using biochemical tests. Based on
morphology and biochemistry characteristics showed thes bacterias were Bacillus
pumilus OR08, B. Cereus OR14, and B.subtilis OR17.
Key word: Oryctes rhinoceros, cellulolytic bacteria, Bacillus pumilus OR08, B.
Cereus OR14, B.subtilis OR17
commit to user
5
perpustakaan.uns.ac.id
digilib.uns.ac.id
MOTTO
―Iqra Bismi Rabbika Ladhi Khalaq - Read! In the name of your Lord who created
(everything)‖
(Q. Al ‗Alaq (96): 1)
―kita singkirkan batas-batas kenormalan, kita harus menjadi aneh-Patrick Star‖
(Spongebob Squarepant)
―Tahhajud, Dhuha, Sedekah‖
(Ippho)
―Hi wa mata noboru-The sun will rise again‖
(Toriko)
―"Berpikirlah sederhana dan efisien, maka kesuksesan akan mengikutimu Rhancodas Chancad Samladas‖
(3 Idiot)
commit to user
6
perpustakaan.uns.ac.id
digilib.uns.ac.id
PERSEMBAHAN
Skripsi ini saya persembahkan pada:
1. Alloh SWT, Tuhan Pencipta Segalanya, AllhamdulilLah,
Terima kasih atas kemudahan yang telah diberikan pada
saya sehingga dapat menyelesaikan skripsi ini tepat
waktu. AllhamdulilLah telah memberikan kelancaran
dan banyak pelajaran daglam perjalan hidup ini.
AllhamdulilLah memberikan beribu-ribu kesempatan
pada saya untuk berubah menjadi lebih baik lagi dan lagi.
AllhamdulilLah
untuk
bisa
AllhamdulilLah,
AllohuAkbarrr...
2. Kedua orang tua saya dan keluarga. Terutama ayah yang
sangat luar biasa pengorbanannya untuk saya. Dia tak
pernah lelah untuk membuat saya tersenyum.
commit to user
7
perpustakaan.uns.ac.id
digilib.uns.ac.id
KATA PENGANTAR
Pertama-tama penulis memanjatkan puji syukur ke hadirat Allah SWT
yang senantiasa melimpahkan kasih, rahmat serta hidayah-Nya sehingga penulis
dapat menyelesaikan penelitian dan penyusunan skripsi dengan judul : ―Isolasi
dan skrining bakteri selulolitik dari saluran pencernaan larva kumbang badak
(Oryctes rhinoceros)‖. Penyusunan skripsi ini merupakan salah satu syarat untuk
memperoleh gelar kesarjanaan strata 1 (S1) di Jurusan Biologi, Fakultas
Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam, Universitas Sebelas Maret, Surakarta.
Selama melakukan penelitian dan penyusunan skripsi, penulis telah
mendapatkan banyak masukan dan dukungan dari berbagai pihak yang sangat
membantu dan bermanfaat dalam penyelesaian skripsi ini. Oleh karena itu pada
kesempatan yang berbahagia ini penulis ingin mengucapkan terima kasih yang
sebesar-besarnya kepada :
1. Prof.Ir. Ari Handono Ramelan, M.Sc. (Hons), Ph.D. selaku Dekan
Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam, Universitas Sebelas
Maret, Surakarta yang telah memberikan dukungan dan dorongan baik
secara langsung maupun tidak langsung.
2. Dr. Agung Budiharjo, M.Si., selaku Ketua Jurusan Biologi dan Dosen
Penelaah II, Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam,
Universitas Sebelas Maret, Surakarta yang telah memberikan izin dan
dukungannya selama penelitian.
3. Dr. Artini Pangastuti, M.Si., selaku Dosen Pembimbing I yang telah
memberikan proyek penelitian, saran dan bimbingannya dari awal
penelitian hingga terselesaikannya penyusunan skripsi ini.
4. Siti Lusi Arumsari, M.Biotech., selaku Dosen Pembimbing II yang telah
memberikan saran dan bimbingan dari awal hingga terselesaikannya
penyusunan skripsi ini.
5. Tjahjadi Purwoko, M.Si., selaku Dosen Penelaah I yang telah memberikan
to user
bimbingan serta dukungancommit
baik secara
moril maupun materiil.
8
perpustakaan.uns.ac.id
digilib.uns.ac.id
6. Dra. Noor Soesanti H., selaku Pembimbing Akademik beserta dosendosen di Jurusan Biologi, Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan
Alam, Universitas Sebelas Maret, Surakarta yang telah mendidik dan
memberikan dorongan baik moril maupun spiritual sehingga penulis dapat
menyelesaikan skripsi ini.
7. Mas Munir dan mas Agus selaku pengurus Jurusan serta Mas Adnan,
Mbak Atik, dan Mbak Nina selaku laboran yang telah membantu
kelancaran penelitian ini.
8. Kepala dan staf Laboratorium Pusat, Sub Laboratorium Biologi
Universitas Sebelas Maret, Surakarta yang telah memberikan izin
penelitian beserta sarana, prasarana dan bantuan selama penelitian.
9. Mbak Sri yang telah banyak membantu dan senantiasa memberikan
banyak petunjuk. Semua pihak yang telah membantu dalam penyelesaian
skripsi ini yang tidak dapat disebutkan satu persatu.
Penulis menyadari sepenuhnya bahwa dalam melakukan penelitian hingga
penyusunan skripsi ini masih jauh dari sempurna. Oleh karena itu masukan yang
berupa saran dan kritik yang bersifat membangun sangat penulis harapkan.
Semoga skripsi ini dapat bermanfaat bagi kita semua dan pihak-pihak yang
berkepentingan.
Surakarta, 15 Juli 2013
Penyusun
commit to user
9
perpustakaan.uns.ac.id
digilib.uns.ac.id
DAFTAR ISI
Halaman
HALAMAN JUDUL........................................................................................ i
HALAMAN PERSETUJUAN PEMBIMBING .............................................. ii
HALAMAN PENGESAHAN .......................................................................... iii
PERNYATAAN ............................................................................................... iv
ABSTRAK ....................................................................................................... v
ABSTRACT ..................................................................................................... vi
MOTTO ........................................................................................................... vii
PERSEMBAHAN ............................................................................................ viii
KATA PENGANTAR ..................................................................................... ix
DAFTAR ISI .................................................................................................... xi
DAFTAR TABEL ............................................................................................ xiii
DAFTAR GAMBAR ....................................................................................... xiv
DAFTAR LAMPIRAN .................................................................................... xv
DAFTAR SINGKATAN ................................................................................. xvi
BAB I. PENDAHULUAN ............................................................................... 1
A. Latar Belakang .............................................................................. 1
B. Perumusan Masalah ....................................................................... 3
C. Tujuan Penelitian ........................................................................... 4
D. Manfaat Penelitian ......................................................................... 4
BAB II. LANDASAN TEORI ......................................................................... 5
A. Tinjauan Pustaka ............................................................................ 5
1. Selulosa .................................................................................... 5
2. Hidrolisis Selulosa oleh Enzim Selulase .................................. 7
3. Aplikasi Selulase ...................................................................... 10
4. Mikroba Endosimbion pada Saluran Pencernaan Arthropoda
(Famili: Scarabaeidae)............................................................. 11
5. Kumbang Badak (Oryctes rhinoceros L.) ................................ 14
commit to user
B. Kerangka pemikiran .......................................................................
16
10
perpustakaan.uns.ac.id
digilib.uns.ac.id
BAB III. METODE PENELITIAN.................................................................. 18
A. Waktu dan Tempat Penelitian ........................................................ 18
B. Alat dan Bahan Penelitian .............................................................. 18
C. Cara Kerja ...................................................................................... 19
BAB IV. HASIL DAN PEMBAHASAN ........................................................ 23
BAB V. PENUTUP.......................................................................................... 33
A. Kesimpulan .................................................................................... 33
B. Saran ............................................................................................... 33
DAFTAR PUSTAKA ...................................................................................... 34
LAMPIRAN ..................................................................................................... 47
RIWAYAT HIDUP PENULIS ........................................................................ 62
commit to user
11
perpustakaan.uns.ac.id
digilib.uns.ac.id
DAFTAR TABEL
Halaman
Tabel 1. Komposisi komponen biomassa ........................................................
5
Tabel 2. Tujuan masing-masing Uji Biokimia dan Pewarnaan Bakteri ......... 22
Tabel 3. Hasil uji kuantitatif dan skrining bakteri selulolitik dari saluran
pencernaan larva Oryctes rhinoceros pada media CMC................... 24
commit to user
12
perpustakaan.uns.ac.id
digilib.uns.ac.id
DAFTAR GAMBAR
Halaman
Gambar 1. Struktur kimia selulosa ................................................................ 6
Gambar 2. Enzim yang terlibat dalam pemecahan selulosa .......................... 8
Gambar 3. Siklus hidup O.rhinoceros ........................................................... 15
Gambar 4. Kerangka Pemikiran .................................................................... 17
Gambar 5. Hasil penumbuhan isi saluran pencernaan larva O.rhinoceros
pengenceran 10-3pada media LA selama 48 jam, 37oC............... 23
Gambar 6. Hasil isolat tunggal strain OR14 dengan metode 4 kuadran pada
media LA selama 48 jam, 37oC. .................................................. 24
Gambar 7. Zona bening yang terbentuk setelah pewarnaan dengan congo
red pada isolat OR14 yang ditumbuhkan pada media CMC
selama 24 jam, 37oC. ................................................................... 29
commit to user
13
perpustakaan.uns.ac.id
digilib.uns.ac.id
DAFTAR LAMPIRAN
Halaman
Lampiran 1. Karakteristik morfologi koloni isolat bakteri yang terdapat
pada saluran pencernaan larva O.rhinoceros ditumbuhkan
pada media CMC .......................................................................
47
Lampiran 2. Karakteristik morfologi 15 isolat bakteri O.rhinoceros yang
memiliki aktivitas enzim tertinggi .............................................
48
Lampiran 3. Sampel Larva O. rhinoceros ......................................................
48
Lampiran 4. Hasil perhitungan kuantitatif aktivitas enzim sulalase isolat
bakteri pada saluran pencernaan O. rhinoceros ........................
49
Lampiran 5. Hasil skrining isolat-isolat pada media CMC dan
sebagian uji Gram .....................................................................
50
Lampiran 6. Hasil identifikasi bakteri secara uji Biokimia oleh
BLK-Yogyakarta .......................................................................
57
Lampiran 7. Hasil identifikasi genus isolat-isolat paling potensial
menghasilkan selulase dengan Bergey's Manual of
Determinative Bacteriology. 9th Edition ...................................
58
Lampiran 8. Hasil identifikasi Spesies isolat-isolat paling potensial
menghasilkan selulase Bergey’s Manual of
Systematic Bacteriology, Vol. 3: The Firmicutes ......................
58
Lampiran 9. Hasil identifikasi isolat-isolat potensial menghasilkan
selulase menggunakan ABIS (Advanced Bacterial
Identification Software).............................................................
59
commit to user
14
perpustakaan.uns.ac.id
digilib.uns.ac.id
DAFTAR SINGKATAN
Singkatan
CMC
LA
LB
sRNA
CMCase
G/ C
ABIS
NaOH
NaCl
CBH
EC
BG
OR
Kepanjangan
carboxymethylcelollose
Luria-Bertani agar
Luria-Bertani Broth
single-stranded ribonucleic acid
carboxymethylcelullase
Guanin/ Cytocin
Advanced Bacterial Identification Software
Natrium Hidroksida
Natrium Klorida
Cellobiohydrolase
Enzim Code
Β-glucosidase
Oryctes rhinoceros
commit to user
15