EKSPLORASI BAKTERI SELULOLITIK DARI TANAH HUTAN MANGROVE BAROS KRETEK, BANTUL, Eksplorasi Bakteri Selulolitik Dari Tanah Hutan Mangrove Baros, Kretek, Bantul, Yogyakarta.
EKSPLORASI BAKTERI SELULOLITIK DARI TANAH
HUTAN MANGROVE BAROS KRETEK, BANTUL,
YOGYAKARTA
SKRIPSI
Untuk Memenuhi Sebagian Persyaratan Guna Mencapai
Derajat Sarjana S-1 Program Studi Pendidikan Biologi
Oleh:
FAJAR NURROCHMAN
A 420 110 060
FAKULTAS KEGURUAN DAN ILMU PENDIDIKAN
UNIVERSITAS MUHAMMADIYAH SURAKARTA
2015
HALAMAN PERSETUJUAN
EKSPLORASI BAKTERI SELULOLITIK DARI TANAH HUTAN
MANGROVE BAROS KRETEK, BANTUL, YOGYAKARTA
Yang Dipersiapkan dan Disusun Oleh :
FAJAR NURROCHMAN
A 420 110 060
Telah Disetujui dan Disahkan oleh Pembimbing
untuk Dipertahankan di Hadapan Dewan Penguji Skripsi
Fakultas Keguruan dan Ilmu Pendidikan
Universitas Muhammadiyah Surakarta
Pembimbing,
Triastuti Rahayu, S.Si., M.Si.
NIK. 920
Tanggal persetujuan: 23 April 2015
ii
HALAMAN PENGESAHAN
SKRIPSI
EKSPLORASI BAKTERI SELULOLITIK DARI TANAH HUTAN
MANGROVE BAROS KRETEK, BANTUL, YOGYAKARTA
Yang Dipersiapkan dan Disusun Oleh :
FAJAR NURROCHMAN
A 420 110 060
Telah Dipertahankan di Depan Dewan Penguji
Pada Hari Selasa, Tanggal 22 Mei 2015
dan Dinyatakan Telah Memenuhi Syarat
Susunan Dewan Penguji
1. Triastuti Rahayu, S.Si., M.Si.
(
)
2. Dra. Suparti, M.Si
(
)
3. Dra. Titik Suryani, M.Sc.
(
)
Surakarta, 9 Juni 2015
Universitas Muhammadiyah Surakarta
Fakultas Keguruan dan Ilmu Pendidikan
Dekan,
Prof. Dr. Harun Joko Prayitno, M.Hum.
NIP. 196504281993031001
iii
PERNYATAAN
Dengan ini, saya menyatakan bahwa dalam skripsi ini tidak terdapat karya
yang pernah diajukan untuk memperoleh gelar kesarjanaan di suatu Perguruan
Tinggi dan sepanjang pengetahuan saya juga tidak terdapat karya atau pendapat
yang pernah ditulis dan diterbitkan oleh orang lain, kecuali yang secara tertulis
diacu dalam naskah dan disebutkan dalam daftar pustaka.
Apabila ternyata kelak di kemudian hari terbukti ada ketidak benaran
dalam pernyataan saya di atas, maka saya akan bertanggung jawab sepenuhnya.
Surakarta, 15 Mei 2015
Fajar Nurrochman
NIM. A 420 110 0060
iv
MOTTO
“Sesungguhnya Allah tidak merubah keadaan suatu kaum sehingga mereka
merubah keadaan yang ada pada diri mereka sendiri”
(Qs. ar Ra’d : 11)
Saya percaya selalu ada harapan yang lebih baik di depan sana
ASAL
kita tidak pernah berhenti untuk berusaha, bersyukur, dan dilandasi do’a
(Joko Susilo)
Waktu tak pernah menunggu, berjalan seperti tak mau tau, tak ada yang bisa
menghentikan maupun menundanya, maka jangan sis-siakan waktu yang ada,
karena hanya penyesalan yang didapat.
(Makrifatun Nur Hidayah)
Mengawali itu terasa sulit daripada membiasakan dan terbiasa itu terasa
mudah dilakukan, akan tetapi semua itu terasa ringan dengan adanya
NIAT dan KE-IHKLASAN
(Penulis)
v
PERSEMBAHAN
Alhamduliillahirobil’alamin,
Terucap syukur atas nikmat dan kemudahan Allah SWT sehingga
dapat tersellesaikannya goresan tinta ini yang saya persembahkan
untuk:
Ayah dan ibu (Bp. Ma’ruf dan Ibu Suparti)
Yang telah memberi motivasi, dorongan, doa, dan kasih sayang
hingga sampai ke jenjang ini. Terimakasih atas segalanya.
Adik (Febrian Lailia Nurrochim)
yang telah memberi semangat untuk menjadi yang terbaik.
Ibu Triastuti Rahayu, M.Si.
Terimakasih atas bimbingan dan kesabaran yang telah diberikan
selama ini.
Sahabat-sahabatku
Teman-teman seperjuangan FKIP BIOLOGI 2011
Teman-teman asisten Laboratorium Biologi 2013
Teman-teman Kos Belti
Terima kasih atas segala semangat, hiburan dan telah memberikan
arti kebersamaan selama ini.
vi
KATA PENGANTAR
Assalamu‘alaikum Wr. Wb.
Alhamdulillah, segala puji dan syukur kepada Allah SWT yang telah
melimpahkan rahmat, hidayah dan inayah-Nya sehingga dapat menyelesaikan
penyusunan
skripsi
yang
berjudul
“EKSPLORASI
BAKTERI
SELULOLITIK DARI TANAH HUTAN MANGROVE BAROS,
KRETEK, BANTUL, YOGYAKARTA”.
Penulis menyadari sepenuhnya tanpa adanya bantuan dari berbagai pihak,
penulis tidak akan mampu melaksanakan skripsi ini dengan baik. Untuk itu pada
kesempatan ini penulis menyampaikan terima kasih kepada:
1. Ibu Triastuti Rahayu, S.Si., M.Si., selaku dosen pembimping yang telah
berkenan meluangkan waktunya dalam membimbing dan memberikan
pengarahan, ilmu, serta nasehat, sehingga penulis mampu menyusun dan
menyelesaikan skripsi ini.
2. Ibu Dra. Aminah Asngad, M.Si., selaku pembimbing akademik yang telah
membimbing, mengarahkan dan memberi nasehat.
3. Semua Bapak dan Ibu dosen FKIP Biologi UMS yang telah mendidik selama
ini.
4. Bapak dan Ibu tercinta yang selalu memberi motivasi, doa dan dukungan
moril maupun materiil.
5. Adikku tersayang yang selalu memotivasi untuk selalu berusaha yang terbaik.
6. Seluruh teman-teman seperjuangan mahasiswa Program Studi Pendidikan
Biologi FKIP UMS angkatan 2011 yang telah memberi dukungan dan
bantuan dalam penelitian ini.
7. Teman-teman asisten Laboratorium Biologi FKIP UMS angkatan 2011 dan
angkatan 2012 yang turut membantu kelancaran proses penelitian.
8. Sahabat-sahabatku dan semua pihak yang turut membantu demi kelancaran
penyusunan skripsi ini.
vii
Semoga Skripsi ini dapat bermanfaat, baik bagi pembaca maupun penulis
dan dapat menjadi sumbangan bagi perkembangan ilmu pengetahuan. Semoga
ilmu yang di dapat dari skripsi ini dapat bermanfaat dalam kehidupan dunia dan
akhirat.
Wassalamu‘alaikum Wr. Wb.
Surakarta, 15 Mei 2015
Penulis
FAJAR NURROCHMAN
A 420 110 060
viii
DAFTAR ISI
HALAMAN JUDUL .........................................................................................
i
HALAMAN PERSETUJUAN..........................................................................
ii
HALAMAN PENGESAHAN ........................................................................... iii
HALAMAN PERNYATAAN ........................................................................... iv
HALAMAN MOTTO .......................................................................................
v
HALAMAN PERSEMBAHAN........................................................................ vi
KATA PENGANTAR ....................................................................................... vii
DAFTAR ISI ...................................................................................................... ix
DAFTAR TABEL.............................................................................................. xi
DAFTAR GAMBAR ......................................................................................... xii
DAFTAR LAMPIRAN ..................................................................................... xiii
ABSTRAK ......................................................................................................... xiv
BAB I
BAB II
PENDAHULUAN
A. Latar Belakang.......................................................................
1
B. Pembatasan Masalah .............................................................
3
C. Perumusan Masalah ...............................................................
4
D. Tujuan Penelitian ...................................................................
4
E. Manfaat Penelitian .................................................................
4
TINJAUAN PUSTAKA
A. Landasan Teori ......................................................................
5
Bakteri Selulolitik...........................................................
5
Teknik Isolasi .................................................................
7
Populasi Bakteri .............................................................
8
Karakterisasi ................................................................... 10
Uji Skrining .................................................................... 11
Hutan Mangrove ............................................................. 12
Hutan Mangrove Baros, Kretek, DIY ............................ 13
B. Penelitian Terdahulu yang Relevan ....................................... 13
ix
C. Kerangka Berpikir ................................................................. 15
BAB III
METODE PENELITIAN
A. Tempat dan Waktu Penelitian ............................................... 16
B. Populasi, Sampel dan Sampling ............................................ 16
C. Alat dan Bahan ...................................................................... 16
D. ProsedurPenelitian ................................................................. 16
E. Rancangan Percobaan ............................................................ 23
F. Teknik Pengumpulan Data .................................................... 23
G. Teknik Analisis Data ............................................................. 24
BAB IV
HASIL DAN PEMBAHASAN
A. Hasil Penelitian ...................................................................... 25
B. Pembahasan ........................................................................... 27
BAB V
KESIMPULAN DAN SARAN
A. Kesimpulan ............................................................................ 34
B. Saran ...................................................................................... 34
DAFTAR PUSTAKA
LAMPIRAN
x
DAFTAR TABEL
Tabel
Halaman
3.1.
Waktu Penelitian................................................................................. 16
3.2.
Rancangan Penelitian ......................................................................... 23
4.1.
Jumlah Populasi Bakteri Selulolitik Pada Kedalaman Berbeda ......... 25
4.2.
Hasil Uji Skrining dan Karakterisasi Bakteri Selulolitik.................... 26
4.3.
Hasil Pengukuran Fisik Pada Lingkungan Tanah Mangrove ............. 28
xi
DAFTAR GAMBAR
Gambar
Halaman
2.1.
Bakteri Bacillus ..................................................................................
2.2.
Skema Kerangka Berpikir .................................................................. 15
3.1
Skema Prosedur Penelitian ................................................................. 22
3.2.
Bentuk Elevasi Bakteri ....................................................................... 24
4.1.
Hasil Uji Potensi Bakteri Selulolitik .................................................. 31
4.2.
Hasil Pengecatan Gram dan Bentuk Sel ............................................. 33
xii
6
DAFTAR LAMPIRAN
Lampiran
1.
Tabel Hasil Isolasi Bakteri Selulolitik Pada Tanah Hutan
Mangrove Baros, Kretek, DIY
2.
Tabel Hasil Pengamatan Ukuran Koloni Bakteri Dan Zona Bening
(cm)
3.
Dokumentasi Proses Penelitian
4.
Agenda Kegiatan Pelaksanaan Penelitian.
5.
Surat Riset Penggunaan Laboratorium FKIP UMS.
6.
Berita Acara Bimbingan Skripsi
7.
Jadwal Bimbingan Mahasiswa Dan Uraian Hasil Pembimbingan
8.
Berita Acara Ujian Skripsi
9.
Pengesahan Revisi Skripsi
xiii
EKSPLORATION CELLULOLITYC BACTERIA OF SOIL
MANGROVE FORESTS BAROS, KRETEK, BANTUL,
YOGYAKARTA
Fajar Nurrochman (1), A 420 110 060, Triastuti Rahayu (2),
(1)
College Student/Graduate, (2) Lecturer, Biology Education Program,
Faculty of Education and Teacher Training,
Muhammadiyah University Of Surakarta,
2015.
ABSTRACT
Cellulolytic bacteria are bacteria producing cellulase enzyme that functions to
degrade cellulose. One of cellulolytic bacteria habitat is soil. This study aims to
determine the population, the potential and characteristics of cellulolytic bacteria
in mangrove forest land Baros, Kretek, Bantul, Yogyakarta. Sampling was done
by the method of composite soil at a depth of 5, 10, 15 and 20 cm at five different
points. Isolation of cellulolytic bacteria using selective media Carboxy Methyl
Cellulose 1% (CMC 1%) with a spread plate method, incubated at 28 0C for 5
days. Cellulolytic bacterial isolates were grown colonies of each treatment was
calculated and chosen different isolates of the overall treatment for isolated on
NA medium. Characterization is done by growing the pure isolates were selected
in CMC 1% media further congo red 0.1% drops to test the potential of
cellulolitic (potential cellulolytic marked by the emergence of a clear zone around
the colony). Results obtained 23 isolates of bacteria isolation of potentially
degrade cellulose from 31 isolates. The population most commonly found at a
depth of 20 cm (6,44x105 CFU/g), whereas at a depth of 5 cm there are at most a
difference of character cellulolytic bacterial isolates (13 isolates) and most major
cellulolytic activity index isolates possessed 3 is 6.38. Cellulolytic bacterial
isolates obtained dominated by gram-negative cocci.
Keyword : Cellulolityc Bacteria, Soil Mangrove, Carboxyl Methyl Cellulose
(CMC), Congo Red.
xiv
EKSPLORASI BAKTERI SELULOLITIK DARI TANAH
HUTAN MANGROVE BAROS KRETEK, BANTUL,
YOGYAKARTA
Fajar Nurrochman (1), A 420 110 060, Triastuti Rahayu (2),
(1)
Mahasiswa/alumni, (2) Staf Pengajar, Program Studi Pendidikan Biologi,
Fakultas Keguruan dan Ilmu Pendidikan,
Universitas Muhammadiyah Surakarta,
2015.
ABSTRAK
Bakteri selulolitik merupakan bakteri penghasil enzim selulase yang berfungsi
untuk mendegradasi selulosa. Salah satu habitat bakteri selulolitik adalah tanah.
Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui populasi, potensi dan karakteristik
bakteri selulolitik pada tanah hutan mangrove Baros, Kretek, Bantul, DIY.
Pengambilan sampel tanah dilakukan dengan metode komposit pada kedalaman
5, 10, 15 dan 20 cm di lima titik yang berbeda. Isolasi bakteri selulolitik
menggunakan media selektif Carboxy Methyl Cellulose 1% (CMC 1%) dengan
metode spread plate, diinkubasi pada suhu 28 0C selama 5 hari. Isolat bakteri
selulolitik yang tumbuh dihitung koloninya setiap perlakuan dan dipilih isolat
yang berbeda dari keseluruhan perlakuan untuk diisolasi pada media NA.
Karakterisasi dilakukan dengan cara menumbuhkan isolat murni terpilih pada
media CMC 1% selanjutnya ditetesi Congo red 0,1% untuk menguji potensi
selulolitiknya (potensi selulolitik ditandai dengan munculnya zona bening di
sekitar koloni). Hasil isolasi bakteri diperoleh 23 isolat yang berpotensi
mendegradasi selulosa dari 31 isolat. Populasi paling banyak ditemukan pada
kedalaman 20 cm (6,44x105 CFU/g), sedangkan pada kedalaman 5 cm terdapat
paling banyak perbedaan karakter isolat bakteri selulolitik (13 isolat) dan indeks
aktifitas selulolitik paling besar dimiliki isolat 3 yaitu 6,38. Isolat bakteri
selulolitik yang diperoleh didominasi bentuk coccus gram negatif.
Kata kunci: Bakteri Selulolitik, Tanah Mangrove, Carboxyl Methyl Cellulose
(CMC), Congo Red.
xv
HUTAN MANGROVE BAROS KRETEK, BANTUL,
YOGYAKARTA
SKRIPSI
Untuk Memenuhi Sebagian Persyaratan Guna Mencapai
Derajat Sarjana S-1 Program Studi Pendidikan Biologi
Oleh:
FAJAR NURROCHMAN
A 420 110 060
FAKULTAS KEGURUAN DAN ILMU PENDIDIKAN
UNIVERSITAS MUHAMMADIYAH SURAKARTA
2015
HALAMAN PERSETUJUAN
EKSPLORASI BAKTERI SELULOLITIK DARI TANAH HUTAN
MANGROVE BAROS KRETEK, BANTUL, YOGYAKARTA
Yang Dipersiapkan dan Disusun Oleh :
FAJAR NURROCHMAN
A 420 110 060
Telah Disetujui dan Disahkan oleh Pembimbing
untuk Dipertahankan di Hadapan Dewan Penguji Skripsi
Fakultas Keguruan dan Ilmu Pendidikan
Universitas Muhammadiyah Surakarta
Pembimbing,
Triastuti Rahayu, S.Si., M.Si.
NIK. 920
Tanggal persetujuan: 23 April 2015
ii
HALAMAN PENGESAHAN
SKRIPSI
EKSPLORASI BAKTERI SELULOLITIK DARI TANAH HUTAN
MANGROVE BAROS KRETEK, BANTUL, YOGYAKARTA
Yang Dipersiapkan dan Disusun Oleh :
FAJAR NURROCHMAN
A 420 110 060
Telah Dipertahankan di Depan Dewan Penguji
Pada Hari Selasa, Tanggal 22 Mei 2015
dan Dinyatakan Telah Memenuhi Syarat
Susunan Dewan Penguji
1. Triastuti Rahayu, S.Si., M.Si.
(
)
2. Dra. Suparti, M.Si
(
)
3. Dra. Titik Suryani, M.Sc.
(
)
Surakarta, 9 Juni 2015
Universitas Muhammadiyah Surakarta
Fakultas Keguruan dan Ilmu Pendidikan
Dekan,
Prof. Dr. Harun Joko Prayitno, M.Hum.
NIP. 196504281993031001
iii
PERNYATAAN
Dengan ini, saya menyatakan bahwa dalam skripsi ini tidak terdapat karya
yang pernah diajukan untuk memperoleh gelar kesarjanaan di suatu Perguruan
Tinggi dan sepanjang pengetahuan saya juga tidak terdapat karya atau pendapat
yang pernah ditulis dan diterbitkan oleh orang lain, kecuali yang secara tertulis
diacu dalam naskah dan disebutkan dalam daftar pustaka.
Apabila ternyata kelak di kemudian hari terbukti ada ketidak benaran
dalam pernyataan saya di atas, maka saya akan bertanggung jawab sepenuhnya.
Surakarta, 15 Mei 2015
Fajar Nurrochman
NIM. A 420 110 0060
iv
MOTTO
“Sesungguhnya Allah tidak merubah keadaan suatu kaum sehingga mereka
merubah keadaan yang ada pada diri mereka sendiri”
(Qs. ar Ra’d : 11)
Saya percaya selalu ada harapan yang lebih baik di depan sana
ASAL
kita tidak pernah berhenti untuk berusaha, bersyukur, dan dilandasi do’a
(Joko Susilo)
Waktu tak pernah menunggu, berjalan seperti tak mau tau, tak ada yang bisa
menghentikan maupun menundanya, maka jangan sis-siakan waktu yang ada,
karena hanya penyesalan yang didapat.
(Makrifatun Nur Hidayah)
Mengawali itu terasa sulit daripada membiasakan dan terbiasa itu terasa
mudah dilakukan, akan tetapi semua itu terasa ringan dengan adanya
NIAT dan KE-IHKLASAN
(Penulis)
v
PERSEMBAHAN
Alhamduliillahirobil’alamin,
Terucap syukur atas nikmat dan kemudahan Allah SWT sehingga
dapat tersellesaikannya goresan tinta ini yang saya persembahkan
untuk:
Ayah dan ibu (Bp. Ma’ruf dan Ibu Suparti)
Yang telah memberi motivasi, dorongan, doa, dan kasih sayang
hingga sampai ke jenjang ini. Terimakasih atas segalanya.
Adik (Febrian Lailia Nurrochim)
yang telah memberi semangat untuk menjadi yang terbaik.
Ibu Triastuti Rahayu, M.Si.
Terimakasih atas bimbingan dan kesabaran yang telah diberikan
selama ini.
Sahabat-sahabatku
Teman-teman seperjuangan FKIP BIOLOGI 2011
Teman-teman asisten Laboratorium Biologi 2013
Teman-teman Kos Belti
Terima kasih atas segala semangat, hiburan dan telah memberikan
arti kebersamaan selama ini.
vi
KATA PENGANTAR
Assalamu‘alaikum Wr. Wb.
Alhamdulillah, segala puji dan syukur kepada Allah SWT yang telah
melimpahkan rahmat, hidayah dan inayah-Nya sehingga dapat menyelesaikan
penyusunan
skripsi
yang
berjudul
“EKSPLORASI
BAKTERI
SELULOLITIK DARI TANAH HUTAN MANGROVE BAROS,
KRETEK, BANTUL, YOGYAKARTA”.
Penulis menyadari sepenuhnya tanpa adanya bantuan dari berbagai pihak,
penulis tidak akan mampu melaksanakan skripsi ini dengan baik. Untuk itu pada
kesempatan ini penulis menyampaikan terima kasih kepada:
1. Ibu Triastuti Rahayu, S.Si., M.Si., selaku dosen pembimping yang telah
berkenan meluangkan waktunya dalam membimbing dan memberikan
pengarahan, ilmu, serta nasehat, sehingga penulis mampu menyusun dan
menyelesaikan skripsi ini.
2. Ibu Dra. Aminah Asngad, M.Si., selaku pembimbing akademik yang telah
membimbing, mengarahkan dan memberi nasehat.
3. Semua Bapak dan Ibu dosen FKIP Biologi UMS yang telah mendidik selama
ini.
4. Bapak dan Ibu tercinta yang selalu memberi motivasi, doa dan dukungan
moril maupun materiil.
5. Adikku tersayang yang selalu memotivasi untuk selalu berusaha yang terbaik.
6. Seluruh teman-teman seperjuangan mahasiswa Program Studi Pendidikan
Biologi FKIP UMS angkatan 2011 yang telah memberi dukungan dan
bantuan dalam penelitian ini.
7. Teman-teman asisten Laboratorium Biologi FKIP UMS angkatan 2011 dan
angkatan 2012 yang turut membantu kelancaran proses penelitian.
8. Sahabat-sahabatku dan semua pihak yang turut membantu demi kelancaran
penyusunan skripsi ini.
vii
Semoga Skripsi ini dapat bermanfaat, baik bagi pembaca maupun penulis
dan dapat menjadi sumbangan bagi perkembangan ilmu pengetahuan. Semoga
ilmu yang di dapat dari skripsi ini dapat bermanfaat dalam kehidupan dunia dan
akhirat.
Wassalamu‘alaikum Wr. Wb.
Surakarta, 15 Mei 2015
Penulis
FAJAR NURROCHMAN
A 420 110 060
viii
DAFTAR ISI
HALAMAN JUDUL .........................................................................................
i
HALAMAN PERSETUJUAN..........................................................................
ii
HALAMAN PENGESAHAN ........................................................................... iii
HALAMAN PERNYATAAN ........................................................................... iv
HALAMAN MOTTO .......................................................................................
v
HALAMAN PERSEMBAHAN........................................................................ vi
KATA PENGANTAR ....................................................................................... vii
DAFTAR ISI ...................................................................................................... ix
DAFTAR TABEL.............................................................................................. xi
DAFTAR GAMBAR ......................................................................................... xii
DAFTAR LAMPIRAN ..................................................................................... xiii
ABSTRAK ......................................................................................................... xiv
BAB I
BAB II
PENDAHULUAN
A. Latar Belakang.......................................................................
1
B. Pembatasan Masalah .............................................................
3
C. Perumusan Masalah ...............................................................
4
D. Tujuan Penelitian ...................................................................
4
E. Manfaat Penelitian .................................................................
4
TINJAUAN PUSTAKA
A. Landasan Teori ......................................................................
5
Bakteri Selulolitik...........................................................
5
Teknik Isolasi .................................................................
7
Populasi Bakteri .............................................................
8
Karakterisasi ................................................................... 10
Uji Skrining .................................................................... 11
Hutan Mangrove ............................................................. 12
Hutan Mangrove Baros, Kretek, DIY ............................ 13
B. Penelitian Terdahulu yang Relevan ....................................... 13
ix
C. Kerangka Berpikir ................................................................. 15
BAB III
METODE PENELITIAN
A. Tempat dan Waktu Penelitian ............................................... 16
B. Populasi, Sampel dan Sampling ............................................ 16
C. Alat dan Bahan ...................................................................... 16
D. ProsedurPenelitian ................................................................. 16
E. Rancangan Percobaan ............................................................ 23
F. Teknik Pengumpulan Data .................................................... 23
G. Teknik Analisis Data ............................................................. 24
BAB IV
HASIL DAN PEMBAHASAN
A. Hasil Penelitian ...................................................................... 25
B. Pembahasan ........................................................................... 27
BAB V
KESIMPULAN DAN SARAN
A. Kesimpulan ............................................................................ 34
B. Saran ...................................................................................... 34
DAFTAR PUSTAKA
LAMPIRAN
x
DAFTAR TABEL
Tabel
Halaman
3.1.
Waktu Penelitian................................................................................. 16
3.2.
Rancangan Penelitian ......................................................................... 23
4.1.
Jumlah Populasi Bakteri Selulolitik Pada Kedalaman Berbeda ......... 25
4.2.
Hasil Uji Skrining dan Karakterisasi Bakteri Selulolitik.................... 26
4.3.
Hasil Pengukuran Fisik Pada Lingkungan Tanah Mangrove ............. 28
xi
DAFTAR GAMBAR
Gambar
Halaman
2.1.
Bakteri Bacillus ..................................................................................
2.2.
Skema Kerangka Berpikir .................................................................. 15
3.1
Skema Prosedur Penelitian ................................................................. 22
3.2.
Bentuk Elevasi Bakteri ....................................................................... 24
4.1.
Hasil Uji Potensi Bakteri Selulolitik .................................................. 31
4.2.
Hasil Pengecatan Gram dan Bentuk Sel ............................................. 33
xii
6
DAFTAR LAMPIRAN
Lampiran
1.
Tabel Hasil Isolasi Bakteri Selulolitik Pada Tanah Hutan
Mangrove Baros, Kretek, DIY
2.
Tabel Hasil Pengamatan Ukuran Koloni Bakteri Dan Zona Bening
(cm)
3.
Dokumentasi Proses Penelitian
4.
Agenda Kegiatan Pelaksanaan Penelitian.
5.
Surat Riset Penggunaan Laboratorium FKIP UMS.
6.
Berita Acara Bimbingan Skripsi
7.
Jadwal Bimbingan Mahasiswa Dan Uraian Hasil Pembimbingan
8.
Berita Acara Ujian Skripsi
9.
Pengesahan Revisi Skripsi
xiii
EKSPLORATION CELLULOLITYC BACTERIA OF SOIL
MANGROVE FORESTS BAROS, KRETEK, BANTUL,
YOGYAKARTA
Fajar Nurrochman (1), A 420 110 060, Triastuti Rahayu (2),
(1)
College Student/Graduate, (2) Lecturer, Biology Education Program,
Faculty of Education and Teacher Training,
Muhammadiyah University Of Surakarta,
2015.
ABSTRACT
Cellulolytic bacteria are bacteria producing cellulase enzyme that functions to
degrade cellulose. One of cellulolytic bacteria habitat is soil. This study aims to
determine the population, the potential and characteristics of cellulolytic bacteria
in mangrove forest land Baros, Kretek, Bantul, Yogyakarta. Sampling was done
by the method of composite soil at a depth of 5, 10, 15 and 20 cm at five different
points. Isolation of cellulolytic bacteria using selective media Carboxy Methyl
Cellulose 1% (CMC 1%) with a spread plate method, incubated at 28 0C for 5
days. Cellulolytic bacterial isolates were grown colonies of each treatment was
calculated and chosen different isolates of the overall treatment for isolated on
NA medium. Characterization is done by growing the pure isolates were selected
in CMC 1% media further congo red 0.1% drops to test the potential of
cellulolitic (potential cellulolytic marked by the emergence of a clear zone around
the colony). Results obtained 23 isolates of bacteria isolation of potentially
degrade cellulose from 31 isolates. The population most commonly found at a
depth of 20 cm (6,44x105 CFU/g), whereas at a depth of 5 cm there are at most a
difference of character cellulolytic bacterial isolates (13 isolates) and most major
cellulolytic activity index isolates possessed 3 is 6.38. Cellulolytic bacterial
isolates obtained dominated by gram-negative cocci.
Keyword : Cellulolityc Bacteria, Soil Mangrove, Carboxyl Methyl Cellulose
(CMC), Congo Red.
xiv
EKSPLORASI BAKTERI SELULOLITIK DARI TANAH
HUTAN MANGROVE BAROS KRETEK, BANTUL,
YOGYAKARTA
Fajar Nurrochman (1), A 420 110 060, Triastuti Rahayu (2),
(1)
Mahasiswa/alumni, (2) Staf Pengajar, Program Studi Pendidikan Biologi,
Fakultas Keguruan dan Ilmu Pendidikan,
Universitas Muhammadiyah Surakarta,
2015.
ABSTRAK
Bakteri selulolitik merupakan bakteri penghasil enzim selulase yang berfungsi
untuk mendegradasi selulosa. Salah satu habitat bakteri selulolitik adalah tanah.
Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui populasi, potensi dan karakteristik
bakteri selulolitik pada tanah hutan mangrove Baros, Kretek, Bantul, DIY.
Pengambilan sampel tanah dilakukan dengan metode komposit pada kedalaman
5, 10, 15 dan 20 cm di lima titik yang berbeda. Isolasi bakteri selulolitik
menggunakan media selektif Carboxy Methyl Cellulose 1% (CMC 1%) dengan
metode spread plate, diinkubasi pada suhu 28 0C selama 5 hari. Isolat bakteri
selulolitik yang tumbuh dihitung koloninya setiap perlakuan dan dipilih isolat
yang berbeda dari keseluruhan perlakuan untuk diisolasi pada media NA.
Karakterisasi dilakukan dengan cara menumbuhkan isolat murni terpilih pada
media CMC 1% selanjutnya ditetesi Congo red 0,1% untuk menguji potensi
selulolitiknya (potensi selulolitik ditandai dengan munculnya zona bening di
sekitar koloni). Hasil isolasi bakteri diperoleh 23 isolat yang berpotensi
mendegradasi selulosa dari 31 isolat. Populasi paling banyak ditemukan pada
kedalaman 20 cm (6,44x105 CFU/g), sedangkan pada kedalaman 5 cm terdapat
paling banyak perbedaan karakter isolat bakteri selulolitik (13 isolat) dan indeks
aktifitas selulolitik paling besar dimiliki isolat 3 yaitu 6,38. Isolat bakteri
selulolitik yang diperoleh didominasi bentuk coccus gram negatif.
Kata kunci: Bakteri Selulolitik, Tanah Mangrove, Carboxyl Methyl Cellulose
(CMC), Congo Red.
xv