PENGGAMBARAN FITUR-FITUR FARMAKOFOR TURUNAN ASPARTIL-DIPEPTIDA SEBAGAI PEMANIS.
ABSTRAK
Aspartam (L-alfa-aspartil-L-fenilalanin-1-metil ester) telah diketahui memiliki
rasa manis. Turunan dari aspartil-dipeptida diketahui merupakan senyawa yang
berpotensi sebagai pemanis (Laszlo Tarko et al., 2006). Pada penelitian ini
dilakukan penggambaran fitur-fitur farmakofor dari turunan aspartil-dipeptida,
agar dapat diketahui fitur-fitur farmakofor apa saja yang paling bertanggungjawab
untuk memberikan rasa manis. Proses pemodelan farmakofor secara umum dapat
dibagi menjadi empat tahap, yaitu meliputi pertama penyiapan data yang
mencakup penggambaran 2D dengan ChemDraw Ultra , optimasi geometri dengan
Hyperchem 7.0, Common Feature Generation Pharmacophore dengan perangkat
lunak Discovery Studio, dan pembuatan training set. Kedua pharmacophore
generation dengan 3D QSAR Pharmacophore, ketiga analisis data, dan yang
keempat validasi model. Hasil penelitian ini dapat menunjukkan gambaran fiturfitur farmakofor yang bertanggungjawab memberikan rasa manis yaitu gugus
hidroksi dan karbonil berperan sebagai hydrogen bond acceptor (HBA), gugus
amina sekunder berperan sebagai hydrogen bond donor (HBD), gugus benzen dan
metil berperan sebagai hydrophobic (HY), dan gugus amina sekunder berperan
sebagai positive ionizable (PI).
Kata kunci: aspartam, aspartil-dipeptida, farmakofor, pemanis.
iii
ABSTRACT
The aspartame (N-(L-α-Aspartyl)-L-phenylalanine,1-methyl ester), to possessing
a sweet taste has shown that the derivatives of aspartyl-dipeptides has the
potential as sweeteners (Laszlo Tarko et al., 2006). So, it is suggested that a study
of the sweetening level from the derivatives to be done. In this study, drawings of
pharmacophore features of the aspartyl-dipeptides were done to discover which
pharmacophore features are responsible for the sweetening ability. The
pharmacophore modelling process consists of four levels. The first steps are the
preparation of datas that cover the 2D drawing with ChemDraw Ultra, the
geometrical optimization using Hyperchem 7.0, doing Common Feature
Generation Pharmacophore using the Discovery Studio software, and the making
of the training set. The second level is the pharmacophore generation with 3D
QSAR Pharmacophore, the third is the data analysis, and the fourth is the model
validation. Present study showed that the pharmacophore features responsible for
the sweetening ability are the hydroxyls and the carbonyls as the hydrogen bond
acceptor (HBA), the benzenes and the methyls as the hydrophobic (HY) group,
and the secondary amines as the positive ionizable (PI) group.
Key words: aspartame, aspartyl-dipeptide, pharmacophore, sweetener .
iv
Aspartam (L-alfa-aspartil-L-fenilalanin-1-metil ester) telah diketahui memiliki
rasa manis. Turunan dari aspartil-dipeptida diketahui merupakan senyawa yang
berpotensi sebagai pemanis (Laszlo Tarko et al., 2006). Pada penelitian ini
dilakukan penggambaran fitur-fitur farmakofor dari turunan aspartil-dipeptida,
agar dapat diketahui fitur-fitur farmakofor apa saja yang paling bertanggungjawab
untuk memberikan rasa manis. Proses pemodelan farmakofor secara umum dapat
dibagi menjadi empat tahap, yaitu meliputi pertama penyiapan data yang
mencakup penggambaran 2D dengan ChemDraw Ultra , optimasi geometri dengan
Hyperchem 7.0, Common Feature Generation Pharmacophore dengan perangkat
lunak Discovery Studio, dan pembuatan training set. Kedua pharmacophore
generation dengan 3D QSAR Pharmacophore, ketiga analisis data, dan yang
keempat validasi model. Hasil penelitian ini dapat menunjukkan gambaran fiturfitur farmakofor yang bertanggungjawab memberikan rasa manis yaitu gugus
hidroksi dan karbonil berperan sebagai hydrogen bond acceptor (HBA), gugus
amina sekunder berperan sebagai hydrogen bond donor (HBD), gugus benzen dan
metil berperan sebagai hydrophobic (HY), dan gugus amina sekunder berperan
sebagai positive ionizable (PI).
Kata kunci: aspartam, aspartil-dipeptida, farmakofor, pemanis.
iii
ABSTRACT
The aspartame (N-(L-α-Aspartyl)-L-phenylalanine,1-methyl ester), to possessing
a sweet taste has shown that the derivatives of aspartyl-dipeptides has the
potential as sweeteners (Laszlo Tarko et al., 2006). So, it is suggested that a study
of the sweetening level from the derivatives to be done. In this study, drawings of
pharmacophore features of the aspartyl-dipeptides were done to discover which
pharmacophore features are responsible for the sweetening ability. The
pharmacophore modelling process consists of four levels. The first steps are the
preparation of datas that cover the 2D drawing with ChemDraw Ultra, the
geometrical optimization using Hyperchem 7.0, doing Common Feature
Generation Pharmacophore using the Discovery Studio software, and the making
of the training set. The second level is the pharmacophore generation with 3D
QSAR Pharmacophore, the third is the data analysis, and the fourth is the model
validation. Present study showed that the pharmacophore features responsible for
the sweetening ability are the hydroxyls and the carbonyls as the hydrogen bond
acceptor (HBA), the benzenes and the methyls as the hydrophobic (HY) group,
and the secondary amines as the positive ionizable (PI) group.
Key words: aspartame, aspartyl-dipeptide, pharmacophore, sweetener .
iv