Morfogenetik Kucing (Felis domesticus) di Tiga Kecamatan di Kabupaten Wonogiri

MORFOGENETIK KUCING (Felis domesticus) DI TIGA KECAMATAN
DI KABUPATEN WONOGIRI

RINA RODIANA

DEPARTEMEN BIOLOGI
FAKULTAS MATEMATIKA DAN ILMU PENGETAHUAN ALAM
INSTITUT PERTANIAN BOGOR
BOGOR
2012

ABSTRAK
RINA RODIANA. Morfogenetik kucing (Felis domesticus) di tiga kecamatan di kabupaten
Wonogiri. Dibimbing oleh R. R. DYAH PERWITASARI dan ACHMAD FARAJALLAH.
Felis domesticus merupakan hasil domestikasi dari Felis silvestris (kucing liar Eropa)
yang biasa dimanfaatkan manusia sebagai hewan peliharaan dan pengendali tikus. Penelitian ini
bertujuan mengestimasi keragaman kucing di tiga kecamatan di kabupaten Wonogiri berdasarkan
karakter morfologi yang diekspresikan oleh 11 lokus, yaitu A~a, B~b~bl, C~cb~cs~ca~c, D~d, i~I,
L~l, m~M, o~O, s~S, Ta~T~tb, dan w~W. Perhitungan frekuensi alel dilakukan menggunakan
metode square root dan maximum likelihood. Nilai heterozigositas (h) dan heterozigositas rataan
(Ĥ) digunakan untuk mengetahui keragaman alel. Nilai F ST digunakan untuk mengetahui

keragaman genetik antara ketiga kecamatan; Wonogiri, Ngadirojo, dan Selogiri. Berdasarkan 11
lokus yang diamati, alel baru yang ditemukan yaitu b, cs, d, I, l, tb, W. Sebagian besar alel tipe liar
memiliki frekuensi yang lebih tinggi daripada alel mutan, kecuali lokus m~M. Nilai h untuk lokus
A~a= 0.491, lokus B~b= 0.294, lokus C~cs= 0.167, lokus D~d= 0.227, lokus i~I= 0.021, lokus
L~l= 0.238, lokus m~M= 0.501, lokus o~O= 0.470, lokus s~S= 0.499, lokus Ta~T~tb= 0.311, dan
lokus w~W= 0.002. Lokus m~M memiliki keragaman alel (h) tertinggi. Nilai Ĥ untuk 11 lokus
yaitu sebesar 0.261, sedangkan nilai Ĥ untuk sembilan lokus yaitu sebesar 0.268. Perbedaan nilai
Ĥ tersebut mungkin disebabkan pengaruh penyebaran alel yang dipengaruhi oleh keadaan
geografik. Nilai F ST untuk lokus A~a, B~b, C~cs, i~I, L~l, Ta~T~tb, dan m~M lebih kecil dari 0.05
yang mengindikasikan perbedaan keragaman genetik yang rendah. Nilai F ST untuk lokus D~d,
o~O, s~S, dan w~W menunjukkan nilai negatif yang berarti tidak adanya perbedaan keragaman
genetik.
Kata kunci: Felis domesticus, keragaman, kucing, morfogenetik, Wonogiri

ABSTRACT
RINA RODIANA. Morphogenetic traits of cats (Felis domesticus) in three Wonogiri districts.
Supervised by R. R. DYAH PERWITASARI and ACHMAD FARAJALLAH.
Felis domesticus was originated from domestication of Felis silvestris (European wild
cat). Usually, cats were utilized as pets and mice controller by humans. This study aimed to
estimate cat diversity in three districts in Wonogiri based on morphological characters expressed

by 11 loci: A~a, B~b~bl, C~cb~cs~ca~c, D~d, i~I, L~l, m~M, o~O, s~S, Ta~T~tb, and w~W.
Estimation of allele frequencies were performed using square root and maximum likelihood
methods. Heterozygosity (h) and average heterozygosity (Ĥ) were applied to determine alleles
diversity. F ST was used to estimate genetic diversity among three districts; Wonogiri, Ngadirojo,
and Selogiri. Among 11 observed loci, new alleles that found were b, cs, d, I, l, tb, W. Mostly wild
type allele revealed higher frequency than mutan type allele, except m~M locus. Heterozygosity
(h) on each loci were A~a= 0.491, B~b= 0.294, C~cs= 0.167, D~d= 0.227, i~I= 0.021, L~l= 0.238,
m~M= 0.501, o~O= 0.470, s~S= 0.499, Ta~T~tb= 0.311, and w~W= 0.002. The highest allele
diversity (h) was revealed in m~M locus. Average heterozygosity (Ĥ) over 11 loci and 9 loci were
0.261 and 0.268, respectively. The difference of average heterozygosity (Ĥ) was due to allele
distribution and influenced by geography. F ST of A~a, B~b, C~cs, i~I, L~l, Ta~T~tb, and m~M loci
were smaller than 0.05 meaning that low genetic diversity detected upon loci. The negative F ST in
D~d, o~O, s~S, and w~W loci indicated that there were no difference on genetic diversity.
Key words: Cats, diversity, Felis domesticus, morphogenetic, Wonogiri

MORFOGENETIK KUCING (Felis domesticus) DI TIGA KECAMATAN
DI KABUPATEN WONOGIRI

RINA RODIANA

Skripsi
sebagai salah satu syarat untuk memperoleh gelar
Sarjana Sains pada
Departemen Biologi

DEPARTEMEN BIOLOGI
FAKULTAS MATEMATIKA DAN ILMU PENGETAHUAN ALAM
INSTITUT PERTANIAN BOGOR
BOGOR
2012

Judul Skripsi
Nama
NIM

: Morfogenetik Kucing (Felis domesticus) di Tiga Kecamatan di
Kabupaten Wonogiri
: Rina Rodiana
: G34080063

Disetujui

Pembimbing I

Pembimbing II

Dr. Ir. R. R. Dyah Perwitasari, M.Sc.
NIP. 19660403 199003 2 001

Dr. Ir. Achmad Farajallah, M.Si.
NIP. 19650427 199002 1 002

Diketahui

Dr. Ir. Ence Darmo Jaya Supena, M.Si.
NIP. 19641002 198903 1 002

Tanggal lulus:

PRAKATA

Puji dan syukur penulis panjatkan kepada Allah SWT atas segala karuniaNya sehingga
skripsi ini berhasil diselesaikan. Judul yang dipilih dalam penelitian yang dilaksanakan sejak bulan
Januari 2012 ini adalah Morfogenetik Kucing (Felis domesticus) di Tiga Kecamatan di Kabupaten
Wonogiri.
Terima kasih penulis ucapkan kepada Ibu Dr. Ir. R. R. Dyah Perwitasari, M.Sc. dan
Bapak Dr. Ir. Achmad Farajallah, M.Si. selaku pembimbing yang telah banyak memberi saran dan
bantuan dalam penelitian sampai dengan pembuatan skripsi. Penulis juga mengucapkan terima
kasih kepada ibu dan bapak, serta seluruh keluarga atas segala bantuan, doa, dan kasih sayangnya.
Ungkapan terima kasih juga disampaikan kepada Harits Adli Tegar Nevada, serta teman-teman
Biologi atas dukungan dan bantuan yang selalu diberikan.
Semoga karya ilmiah ini bermanfaat.

Bogor, Agustus 2012

Rina Rodiana

RIWAYAT HIDUP
Penulis dilahirkan di Wonogiri pada tanggal 9 April 1990 dari ayah Tukiyo Ridho Utomo
dan ibu Sriyanti. Penulis merupakan putri kedua dari tiga bersaudara.
Tahun 2008 penulis lulus dari SMA Negeri 3 Wonogiri dan pada tahun yang sama lulus

seleksi masuk IPB melalui jalur Undangan Seleksi Masuk IPB (USMI). Penulis memilih mayor
Biologi, Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam.
Selama perkuliahan, penulis mengikuti Unit Kegiatan Mahasiswa (UKM) Gentra
Kaheman pada tahun 2008 dan kegiatan beladiri Capoeira Alegria IPB Bogor mulai tahun 2008
sampai dengan 2012. Penulis juga berpartisipasi dalam kepanitiaan yang diselenggarakan
HIMABIO seperti Biology on Science on Application (2011) dan pemilihan ketua HIMABIO
(2010). Penulis melaksanakan kegiatan Studi Lapang di Pangandaran pada tahun 2010 dengan
judul Koleksi dan Identifikasi Avertebrata di Pantai Pangandaran, serta praktik lapang di Parung
Farm pada tahun 2011 dengan judul Budi daya Bayam (Amaranthus sp.) dengan Sistem
Hidroponik Deep Flow Technique (DFT) di Parung Farm, Parung, Bogor.

1

DAFTAR ISI
Halaman
DAFTAR TABEL ....................................................................................................................
vii
DAFTAR GAMBAR ...............................................................................................................

vii

DAFTAR LAMPIRAN ............................................................................................................

vii

PENDAHULUAN.....................................................................................................................

1

BAHAN DAN METODE
Waktu dan Tempat ................................................................................................................
Bahan dan Alat .....................................................................................................................
Metode ..................................................................................................................................

2
2
3

HASIL
Frekuensi Alel (q) dan Heterozigositas (h) ...........................................................................

Lokus A~a ........................................................................................................................
Lokus B~b~bl ...................................................................................................................
Lokus C~cb~cs~ca~c .........................................................................................................
Lokus D~d ........................................................................................................................
Lokus i~I ..........................................................................................................................
Lokus L~l .........................................................................................................................
Lokus o~O ........................................................................................................................
Lokus s~S .........................................................................................................................
Lokus Ta~T~tb ..................................................................................................................
Lokus w~W ......................................................................................................................
Lokus m~M ......................................................................................................................
Heterozigositas Rataan (Ĥ) ...................................................................................................
Diferensiasi genetik (FST) .....................................................................................................

4
4
4
4
4
5

5
5
5
5
6
6
6
6

PEMBAHASAN
Frekuensi alel pada 11 lokus .................................................................................................
Nilai Heterozigositas (h) dan Heterozigositas Rataan (Ĥ) ....................................................
Diferensiasi genetik (FST) .....................................................................................................

7
8
8

SIMPULAN ..............................................................................................................................

8

DAFTAR PUSTAKA ...............................................................................................................

9

LAMPIRAN ..............................................................................................................................

10

2

DAFTAR TABEL
Halaman
1 Gen-gen utama kucing domestik (Wright & Walters 1980) ................................................
2
2 Frekuensi alel dan heterozigositas setiap lokus pada populasi kucing di tiga
kecamatan di Kabupaten Wonogiri ......................................................................................
4
3 Nilai heterozigositas rataan (Ĥ) di tiga kecamatan di Kabupaten Wonogiri ........................

6
4 Keragaman genetik (FST) antara populasi (Wonogiri, Ngadirojo, Selogiri) .........................
6

DAFTAR GAMBAR
Halaman
1 Kucing dengan ekspresi lokus A~a. (a) Brown mackerel tabby (A-B-C-D-iiT-).
4
(b) Solid Black (aaB-C-D-ii) ..............................................................................................
4
2 Chocolate mackerel tabby and white (A-bbC-D-iiS-) .........................................................
3 Seal point (aaB-cscsD-) ........................................................................................................
4
4 Lilac tabby point (A-bbcscsddll)...........................................................................................
5
5 Silver mackerel tabby (A-B-C-D-I-) ....................................................................................
5
6 Solid black (aaB-C-D-ll) ......................................................................................................
5
7 Kucing dengan ekspresi lokus o~O. (a) Red mackerel tabby (C-D-iiOT-).
(b) Tortoiseshell (A- B-C-D-iiOoss). (c) Brown abyssinian tabby (A-B-C-D-iiooTa). .......
5
8 Black and white (aaB-C-D-iiS-)...........................................................................................
5
9 Kucing dengan ekspresi lokus Ta~T~tb. (a) Red abyssinian tabby and white
(C-D-iiOS-Ta-). (b) Brown mackerel tabby and white (A-B-C-D-iiS-T-).
(c) Calico Classic Tabby (A-B-C-D-iiOoS-tbtb) ..................................................................
6
10 Solid white (W-L-mm) .........................................................................................................
6
11 Kucing dengan ekspresi lokus m~M. (a) Brown abyssinian tabby and white
(A-B-C-D-iiS-Mm). (b) Tortoiseshell and white (calico) (A-B-C-D-iiOoS-mm) ...............
6

DAFTAR LAMPIRAN
Halaman
1 Genotipe pola tabby pada kucing domestik (Wright & Walters 1980). ...............................
11
2 Genotipe warna solid pada kucing domestik (Wright & Walters 1980). .............................
12
3 Lokasi pengambilan gambar di tiga kecamatan di Kabupaten Wonogiri (Kecamatan
12
Wonogiri, Ngadirojo, Selogiri; ditandai garis merah) dengan luas total 22638.90 Ha. .......
4 Jumlah fenotipe, frekuensi alel (q), dan heterozigositas (h) dari 11 lokus pada kucing
di tiga kecamatan di Kabupaten Wonogiri. ..........................................................................
13
5 Frekuensi alel (q) dan heterozigositas (h) setiap lokus pada populasi kucing di wilayah
15
Bogor (Noor 2007) ..............................................................................................................

1

PENDAHULUAN
Karakter morfologi merupakan salah satu
cara untuk melihat genotipe atau disebut juga
morfogenetik. Morfogenetik pada kucing
dapat memberikan informasi mengenai
keragaman kucing dalam suatu populasi.
Selain itu juga memberikan informasi
mengenai muncul atau hilangnya alel tertentu,
sehingga dapat mengetahui perubahan
keragaman kucing pada suatu populasi.
Bahkan melalui morfogenetik pada kucing ini,
dapat dikaitkan dengan tingkat kesejahteraan
masyarakat. Salah satu indikatornya yaitu
kemunculan
alel-alel
mutan,
karena
pemelihara dan breeder kucing dengan
karakter mutan umumnya didukung oleh
kondisi sosial ekonomi masyarakat yang
cukup baik.
Kucing telah mengalami domestikasi
sekitar 3000 sampai 4000 tahun yang lalu
pada zaman Mesir kuno. Kucing yang telah
mengalami domestikasi dikenal dengan nama
ilmiah Felis domesticus. Felis domesticus
merupakan hasil domestikasi dari Felis
silvestris (kucing liar Eropa) (Feldhamer
1999). Felis domesticus termasuk ke dalam
kelas Mammalia, ordo Carnivora, famili
Felidae (Wilson 1992). Kucing biasa
dimanfaatkan manusia sebagai hewan
peliharaan dan pengendali tikus (Vella et al.
1999).
Morfogenetik
pada
kucing
dapat
digunakan untuk menduga frekuensi alel yang
mengendalikan ekspresi variasi karakter
morfologi dalam suatu populasi kucing
(Nozawa et al. 2004c). Lokus kucing
domestik yang memiliki hubungan dominanresesif antar alel antara lain: A~a, B~b~bl,
C~cb~cs~ca~c, D~d, i~I, L~l, m~M, o~O, s~S,
Ta~T~tb, w~W. Lokus-lokus tersebut terdiri
atas tipe liar dan mutan. Tipe liar merupakan
karakter yang diekspresikan sesuai dengan
bentuk awalnya terdiri atas alel A, B, C, D, i,
L, m, s, T, w. Sedangkan alel mutan
merupakan alel yang telah mengalami mutasi,
terdiri atas a, b, bl, cb, cs, ca, c, d, I, l, O, M, S,
Ta, tb, W (Wright & Walters 1980). Variasi
alel pada lokus tersebut menyebabkan variasi
pada warna, pola warna, panjang rambut, dan
panjang ekor. Variasi warna rambut pada
mamalia berdasarkan modifikasi genetik dari
dua pigmen dasar yaitu eumelanin dan
phaeomelanin. Eumelanin memproduksi
warna hitam atau cokelat, sedangkan
phaeomelanin memproduksi warna merah,
oranye, atau kuning (Vella et al. 1999).

Panjang rambut dikendalikan oleh gen
panjang rambut (lokus L~l). Rambut pendek
yang diekspresikan oleh gen L, memiliki
panjang rata-rata sekitar 4.5 cm (Wright &
Walters 1980). Rambut panjang diekspresikan
oleh gen l dan bersifat resesif. Karakter
tersebut merupakan hasil mutasi gen yang
bertanggung jawab dalam periode siklus
pertumbuhan rambut (Vella et al. 1999).
Panjang ekor dikendalikan oleh gen Manx
(lokus m~M) (Wright & Walters 1980).
Keberadaan gen Manx ini akan bersifat letal
ketika dalam keadaan homozigot dominan
(MM) (Wright & Walters 1980).
Gen agouti (lokus A~a) menghasilkan
warna hitam pada ujung rambut dan warna
kuning pada dasar rambut. Gen non-agouti
(aa) menyebabkan hilangnya warna kuning
pada dasar rambut, sehingga pola tabby tidak
muncul (Wright & Walters 1980). Gen tabby
yang terdiri atas Abyssinian (Ta), mackerel
(T), dan blotched (tb) merupakan variasi pola
warna rambut kucing (Vella et al. 1999). Pola
tabby tersebut hanya muncul ketika kucing
memiliki gen agouti (Wright & Walters 1980).
Gen S (lokus s~S) menyebabkan adanya
daerah putih dan bersifat dominan (Wright &
Walters 1980). Gen B (lokus B~b~bl)
merupakan gen penyandi warna hitam dan
bersifat dominan dibandingkan alel b (warna
cokelat) dan alel bl (cokelat terang). Gen C
menghasilkan pigmentasi penuh dan mutasi
gen tersebut menghasilkan warna burmese
(cb), siamese (cs), blue eyed albino (ca), dan
albino atau tidak berpigmen (c). Gen D (lokus
D~d) mengekspresikan pigmentasi pekat dan
bila dalam keadaan homozigot resesif (dd)
mengekspresikan pigmentasi pudar (Vella et
al. 1999). Pigmentasi pekat terdiri atas warna
hitam, cokelat, cinnamon, dan red. Sedangkan
pigmentasi pudar terdiri atas warna blue, lilac,
fawn, dan cream (Burn 1999). Gen I (lokus
i~I) menekan perkembangan pigmen pada
rambut kucing.
Gen warna oranye (lokus o~O) terpaut
kromosom X, dan akan menghasilkan karakter
tortoiseshell jika genotipe heterozigot (Oo)
yang umumnya betina (Vella et al. 1999).
Betina akan memiliki warna keseluruhan
oranye ketika dalam keadaan homozigot
dominan (OO), sedangkan jantan secara
normal cukup dengan satu gen O (O) saja.
Ketika gen yang mengekspresikan warna
oranye berinteraksi dengan gen dilute, maka
akan menghasilkan warna cream pada rambut
kucing. Gen O tersebut bersifat epistasis, yaitu
ketika dalam keadaan homozigot dominan

2

berdasarkan karakter morfologi seperti warna,
pola warna, panjang rambut, dan panjang
ekor. Tiga Kecamatan di Kabupaten Wonogiri
memiliki topografi bervariasi yang didominasi
dengan topografi daerah yang tidak rata,
selain itu Kabupaten Wonogiri merupakan
jalur lintas daerah. Oleh karena itu penelitian
ini dilakukan di tiga kecamatan di Kabupaten
Wonogiri, karena ingin diamati pengaruhnya
terhadap keragaman kucing.

(OO) akan mengubah semua pigmen hitam
menjadi oranye (Wright & Walters 1980).
Gen W (lokus w~W) yang bersifat
dominan menghasilkan warna putih pada
rambut kucing dengan tiga variasi warna iris
mata, yaitu biru, bukan biru, dan odd eyed.
Gen W menutupi ekspresi dari semua gen
warna, atau disebut epistasis (Wright &
Walters 1980).
Mutasi dan imigrasi merupakan penyebab
variasi dan perubahan frekuensi alel pada
suatu populasi (Griffiths et al. 1999).
Kemunculan siamese (cs) yang merupakan
alel mutan di Indonesia dimungkinkan karena
aliran gen dari kucing nonlokal (kucing untuk
kontes) di daerah tertentu (Nozawa et al.
1983). Nozawa et al. (1983) menemukan alel
C dan cs pada lokus C~cb~cs~ca~c di Bogor
dengan nilai heterozigositas (h) sebesar 0.151.
Hasil penelitian Noor (2007) di Bogor
melaporkan terjadinya peningkatan nilai
heterozigositas
(h)
yang
disebabkan
penemuan alel baru yaitu cb untuk warna
burmese pada lokus C~cb~cs~ca~c. Nilai
heterozigositas untuk lokus C~cb~cs~ca~c di
Bogor meningkat dari 0.151 pada tahun 1983,
menjadi 0.164 pada tahun 2007.
Penelitian ini bertujuan mengestimasi
keragaman kucing (Felis domesticus) di tiga
kecamatan
di
Kabupaten
Wonogiri

BAHAN DAN METODE
Waktu dan Tempat
Penelitian ini dilakukan mulai tanggal 22
Januari sampai dengan tanggal 26 April 2012.
Pengambilan gambar kucing dilakukan di tiga
kecamatan di Kabupaten Wonogiri yaitu
kecamatan Wonogiri, Ngadirojo, dan Selogiri.
Luas total wilayah ketiga kecamatan tersebut
ialah 22638.90 Ha, dengan jumlah penduduk
229196 jiwa.
Bahan dan Alat
Bahan yang digunakan untuk analisis
morfogenetik adalah gambar kucing (Felis
domesticus)
yang
diambil
dengan
menggunakan kamera digital BenQ tipe DC
E1250, sedangkan untuk analisis data
mengggunakan komputer.

Tabel 1 Gen-gen utama kucing domestik (Wright & Walters 1980)
Simbol
A
B

C

Nama
Agouti
Black

Tipe Liar
Karakter
Pola agouti
Hitam

Full-colour

L
o

Dense
Normal
pigmentation
Normal hair
Normal colour

s
T

Normal colour
Mackerel

w

Normal colour

m

Normal tail

D
i

Pigmentasi penuh

Pigmentasi pekat
Pigmentasi normal
Rambut pendek
Pigmentasi normal
selain orange
Tanpa daerah putih
Pola tabby garis
Ekspresi penuh dari
gen lain
Ekor panjang

Simbol
a
b
bl
cb
cs
ca
c
d
I
l
O
S
Ta
tb
W
M

*gen mutan yang bersifat dominan terhadap tipe liar.

Mutan
Karakter
Tidak berpola
Cokelat muda
Cinnamon atau cokelat
terang
Burmese
Cokelat sepia gelap
Siamese
Cokelat sepia terang; pola
point; iris biru
Blue-eyes
Putih; iris biru
Albino
Putih
Dilute
Pigmentasi pudar
Inhibitor*
Menutupi pigmen lain;
warna perak
Long hair
Rambut panjang
Orange
Oranye atau kuning (terpaut
seks)
Piebald*
Dengan daerah putih
Abyssinian
Pola tabby Abyssinian
Pola tabby klasik
Blotched
Dominant white* Warna putih yang menutupi
warna lain; iris biru
Manx*
Ekor pendek atau tidak ada;
bersifat letal jika homozigot
Nama
Non-agouti
Brown
Light brown

3

Metode
Pengambilan gambar kucing dengan cara
road sampling yaitu berjalan pada setiap
lokasi yang telah ditentukan (Ratti & Garton
1996). Waktu pengambilan gambar dilakukan
antara pukul 07.30-11.00 dan pukul 15.0017.30 WIB. Pengambilan gambar hanya
dilakukan sekali pada setiap ruas jalan untuk
menghindari pengulangan. Gambar yang telah
diperoleh dicatat berdasarkan karakter
morfologi meliputi warna, pola warna,
panjang rambut, dan panjang ekor. Sebelas
lokus diamati berdasarkan karakter morfologi
yaitu: A~a, B~b~bl, C~cb~cs~ca~c, D~d, i~I,
L~l, o~O, m~M, s~S, Ta~T~tb, w~W. Data
dikonversi ke dalam notasi alel yang mengacu
pada Wright dan Walters (1980) (Tabel 1 &
Lampiran 1). Perhitungan frekuensi alel
dilakukan menggunakan metode square root
dan maximum likelihood mengikuti Nozawa et
al. (2004c).
Frekuensi alel untuk gen autosom dihitung
dengan metode square root (lokus A~a,
B~b~bl, C~cb~cs~ca~c, D~d, i~I, L~l, s~S,
Ta~T~tb, w~W). Jumlah individu yang
menunjukkan karakter dominan adalah D,
sedangkan karakter resesif adalah R, sehingga
diperoleh:
Jumlah individu total (n) = D + R
Frekuensi alel resesif (qx): √

Frekuensi alel dominan (px): 1-qx
Standar eror (SE) untuk perhitungan frekuensi
alel ditentukan dengan cara:
√

⁄

Lokus o~O yang terpaut kromosom X,
akan menunjukkan tiga macam fenotipe yaitu
oranye (a1), tortoiseshell (a2), dan bukan
oranye (a3) dengan jumlah a1+a2+a3=n.
Frekuensi alel dapat ditentukan dengan
metode maximum likelihood dengan asumsi
perbandingan jantan-betina adalah 1:1, yaitu
dengan cara:

Perhitungan standar eror (SE) ditentukan
dengan cara:
SE= √

(

)( -

) -

⁄

Ekspresi karakter ekor pendek diduga
bersifat poligen, frekuensi alel ekor pendek
(qM) dan ekor normal (q m) dalam suatu
populasi dihitung dengan cara:
qM= ⁄
qm= 1-qM
(D= jumlah individu dengan ekor pendek).
Standar eror (SE) ditentukan dengan cara:
)⁄

SE= √(

Nilai heterozigositas (h) dan nilai
heterozigositas rataan (Ĥ) yang diperlukan
untuk mengetahui keragaman suatu alel dalam
suatu populasi dihitung dengan cara:
hi=2n(1-Σxi2)/2n-1
Ĥ Σhi/nh
(hi=nilai heterozigositas lokus i, xi=frekuensi
alel dari lokus i, nh=jumlah lokus yang
diperoleh). Standar eror (SE) untuk kedua
nilai tersebut dapat ditentukan berdasarkan
Nei (1987) dengan cara:
SEhi= {

[ (

- ) ∑ xi -[∑ xi ]
(

- )

∑ xi -(∑ xi ) ]

}

Diferensiasi genetik (FST) antara populasi
dihitung dengan menggunakan perangkat
lunak Arlequin versi 3.5.

HASIL
Jumlah sampel kucing yang diperoleh dari
tiga kecamatan di Kabupaten Wonogiri
sebanyak 474 ekor dengan umur lebih dari
empat bulan. Data yang diperoleh kemudian
dianalisis menjadi frekuensi alel (q) dan
heterozigositas
(h)
(Tabel
2),
dan
heterozigositas rataan (Ĥ) (Tabel 3).

4

Tabel 2 Frekuensi alel dan heterozigositas
setiap lokus pada populasi kucing
di tiga kecamatan di Kabupaten
Wonogiri
Lokus

Alel

Frekuensi alel
(q)

Heterozigositas
(h)

A~a
n=345

A
a

0.569±0.024
0.431±0.024

0.491±0.005

B~b
n=344

B
b

0.821±0.027
0.179±0.027

0.294±0.019

C~cs
n=473

C
cs

0.908±0.023
0.092±0.023

0.167±0.015

D~d
n=473

D
d

0.870±0.023
0.130±0.023

0.227±0.016

i~I
n=473

i
I

0.989±0.003
0.011±0.003

0.021±0.007

L~l
n=474

L
l

0.862±0.023
0.138±0.023

0.238±0.016

o~O
n=473

o
O

0.624±0.019
0.376±0.019

0.470±0.008

s~S
n=474

s
S

0.524±0.020
0.476±0.020

0.499±0.002

Ta~T~tb
n=427

Ta
T
tb

0.072±0.009
0.820±0.046
0.108±0.024

0.311±0.019

w~W
n=474

w
W

0.999±0.001
0.001±0.001

0.002±0.002

m~M*
n=474

+

0.498±0.023
0.502±0.023

0.501±0.001

*(-) ekor panjang; (+) ekor pendek.
Frekuensi Alel (q) dan Heterozigositas (h)
Lokus A~a
Secara keseluruhan tiga kecamatan di
Kabupaten Wonogiri memiliki frekuensi alel
yang relatif sama untuk lokus ini. Alel A yang
mengekspresikan pola agouti memiliki
frekuensi sebesar 0.569, sedangkan alel a
sebesar 0.431 (Tabel 2). Nilai heterozigositas
untuk lokus A~a cukup tinggi yaitu 0.491
(Tabel 2).

(a)

(b)

Gambar 1 Kucing dengan ekspresi lokus A~a. (a)
Brown mackerel tabby (A-B-C-D-iiT-).
(b) Solid Black (aaB-C-D-ii).

Lokus B~b~bl
Frekuensi alel B yang mengekspresikan
warna hitam di tiga kecamatan di Kabupaten
wonogiri sangat tinggi yaitu 0.821,
dibandingkan dengan frekuensi alel b (Tabel
2). Alel b hanya ditemukan di kecamatan
Wonogiri dan Selogiri, dengan frekuensi
sebesar 0.169 dan 0.197 (Lampiran 4). Nilai
heterozigositas (h) untuk lokus ini yaitu 0.294.

Gambar 2 Chocolate mackerel tabby and white (AbbC-D-iiS-).

Lokus C~cb~cs~ca~c
Alel C yang mengekspresikan pigmentasi
penuh memiliki frekuensi alel yang sangat
tinggi
yaitu 0.908.
Alel
cs
yang
mengekspresikan warna siamese, merupakan
satu-satunya alel mutan yang ditemukan pada
lokus ini. Alel cs tersebut memiliki frekuensi
yang sangat rendah dibandingkan alel C yaitu
0.092. Heterozigositas untuk lokus ini sebesar
0.167 (Tabel 2).

Gambar 3 Seal point (aaB-cscsD-).

Lokus D~d
Secara keseluruhan frekuensi alel D
sebesar 0.870. Alel d yang mengekspresikan
warna pudar memiliki frekuensi yang rendah
yaitu 0.130. Nilai heterozigositas untuk lokus
ini yaitu 0.227 (Tabel 2).

5

(a)

(b)

Gambar 4 Lilac tabby point (A-bbcscsddll).

Lokus i~I
Alel I yang mengekspresikan warna perak
sangat jarang ditemukan di tiga kecamatan di
Kabupaten Wonogiri, bahkan di kecamatan
Ngadirojo sama sekali tidak ditemukan alel I
(Lampiran 4). Frekuensi alel I secara
keseluruhan yaitu 0.011. Alel i yang
mengekspresikan
warna
selain
perak
(pigmentasi normal) sangat banyak ditemukan
dengan frekuensi sebesar 0.989 dengan nilai
heterozigositas sebesar 0.021 (Tabel 2).

(c)
Gambar 7

Kucing dengan ekspresi lokus o~O.
(a) Red mackerel tabby (C-D-iiOT-).
(b) Tortoiseshell (A-B-C-D-iiOoss).
(c) Brown abyssinian tabby (A-B-CD-iiooTa).

Lokus s~S
Alel S yang mengekspresikan spot putih
(white spoting) memiliki frekuensi sebesar
0.476. Alel s memiliki freuensi sebesar 0.524.
Nilai heterozigositas untuk lokus ini cukup
tinggi yaitu 0.499 (Tabel 2).

Gambar 5 Silver mackerel tabby (A-B-C-D-I-).

Lokus L~l
Alel L yang mengekspresikan rambut
pendek memiliki frekuensi sebesar 0.862. Alel
l yang mengekspresikan rambut panjang
jarang ditemukan di ketiga kecamatan.
Frekuensi alel l secara keseluruhan sebesar
0.138. Nilai heterozigositas lokus ini yaitu
0.238 (Tabel 2).

Gambar 6 Solid black (aaB-C-D-ll).

Lokus o~O
Alel O yang mengekspresikan warna
oranye di kecamatan Wonogiri, Ngadirojo,
dan Selogiri relatif sama, yaitu berturut-turut
0.385, 0.358, dan 0.375 (Lampiran 4). Secara
keseluruhan, ketiga kecamatan di Kabupaten
Wonogiri memiliki frekuensi alel O lebih
rendah yaitu 0.376 dibandingkan frekuensi
alel o. Nilai heterozigositas untuk lokus ini
yaitu 0.470 (Tabel 2).

Gambar 8 Black and white (aaB-C-D-iiS-).

Lokus Ta~T~tb
Alel Ta, T, dan tb mengekspresikan pola
tabby abyssinian, tabby mackerel, dan tabby
blotched. Kecamatan Ngadirojo memiliki
frekuensi tertinggi yaitu 0.946 untuk alel T.
Sedangkan kecamatan Selogiri memiliki
frekuensi alel tertinggi yaitu 0.091 untuk alel
Ta (Lampiran 4). Alel tb sangat jarang
ditemukan, bahkan di kecamatan Ngadirojo
alel tersebut sama sekali tidak ditemukan.
Secara keseluruhan alel Ta, alel T, dan alel tb
memiliki frekuensi berturut-turut yaitu 0.072,
0.820, dan 0.108, dengan nilai heterozigositas
0.311 (Tabel 2).

6

(a)

(b)

(c)
Gambar 9

Kucing dengan ekspresi lokus Ta~T~tb.
(a) Red abyssinian tabby and white (CD-iiOS-Ta-). (b) Brown mackerel tabby
and white (A-B-C-D-iiS-T-). (c)
Calico Classic Tabby (A-B-C-DiiOoS-tbtb).

Lokus w~W
Alel W mengekspresikan warna putih pada
rambut kucing. Alel ini hanya ditemukan di
kecamatan Selogiri, dengan frekuensi yang
sangat rendah yaitu 0.001 (Tabel 2). Frekuensi
alel w di ketiga kecamatan sangat tinggi yaitu
0.999. Nilai heterozigositas untuk lokus ini
sangat rendah yaitu 0.002 (Tabel 2).

Heterozigosit s R t
Ĥ
Nilai heterozigositas rataan (Ĥ) digunakan
untuk melihat keragaman kucing di tiga
kecamatan di Kabupaten Wonogiri. Nilai Ĥ
secara keseluruhan di tiga kecamatan di
Kabupaten Wonogiri untuk 11 lokus yaitu
0.261. Sedangkan nilai Ĥ untuk 9 lokus
sebagai pembanding terhadap populasi di
Indonesia dan Asia yaitu 0.268 dan 0.295
(Tabel 3).
Tabel 3 Nilai heterozigositas rataan (Ĥ) di
tiga kecamatan di Kabupaten
Wonogiri
Kecamatan
Ĥ
Ĥ*
Ĥ**
Wonogiri

0.270

0.275

0.293

Ngadirojo

0.235

0.249

0.288

Selogiri

0.279

0.280

0.304

Rata-rata

0.261

0.268

0.295

*

tanpa lokus B~b dan L~l sebagai
pembanding terhadap populasi di Indonesia
berdasarkan Nozawa et al. (1983)
**
tanpa lokus B~b dan i~I sebagai
pembanding terhadap populasi di Asia
berdasarkan Kawamoto et al. (2002).
Diferensiasi genetik (FST)
Hasil perhitungan diferensiasi genetik
antara populasi (Wonogiri, Ngadirojo,
Selogiri) (FST) setiap lokus ditunjukkan pada
Tabel 4.

Gambar 10 Solid white (W-L-mm).

Lokus m~M
Alel M mengekspresikan karakter ekor
pendek sedangkan alel m mengekspresikan
karakter ekor panjang. Frekuensi alel M
secara keseluruhan yaitu 0.502, sedangkan
alel m memiliki frekuensi sebesar 0.498. Nilai
heterozigositas untuk lokus ini yaitu 0.501
(Tabel 2).

Tabel 4 Diferensiasi genetik (FST) antara
populasi (Wonogiri, Ngadirojo,
Selogiri)
Lokus
FST
A~a
B~b
C~cs
D~d
i~I
L~l
o~O

0.008
0.030
0.012
-0.004
0.014
0.002
-0.007

s~S
a

(a)

(b)

Gambar 11 Kucing dengan ekspresi lokus m~M.
(a) Brown abyssinian tabby and white
(A-B-C-D-iiS-Mm). (b) Tortoiseshell
and white (calico) (A-B-C-D-iiOoSmm).

T ~T~t
w~W
m~M

-0.005
b

0.023
-0.005
0.035

Nilai FST untuk lokus A~a dan L~l relatif
rendah yaitu sebesar 0.008 dan 0.002. Lokus
B~b, C~cs, i~I, Ta~T~tb, dan m~M memiliki

7

nilai FST sebesar 0.030, 0.012, 0.014, 0.023,
0.035. Lokus D~d, o~O, s~S, dan w~W
memiliki nilai FST negatif yaitu -0.004, -0.007,
-0.005, dan -0.005.

PEMBAHASAN
Frekuensi alel pada 11 lokus
Secara keseluruhan frekuensi alel dari
lokus yang diamati yaitu lokus A~a, B~b~bl,
C~cb~cs~ca~c, D~d, i~I, L~l, o~O, s~S,
Ta~T~tb, w~W masih didominasi oleh tipe
liarnya, kecuali lokus m~M. Pada lokus
tersebut frekuensi alel mutan lebih tinggi yaitu
0.502, sedangkan frekuensi tipe liarnya yaitu
0.498. Berdasarkan hasil penelitian Noor
(2007) menunjukkan bahwa frekuensi alel M
(ekor pendek) lebih tinggi yaitu 0.602 dan
frekuensi alel m (ekor panjang) lebih rendah
yaitu 0.398. Nozawa et al. (1983) menyatakan
bahwa karakter ekor pendek merupakan ciri
khusus kucing di Asia. Populasi kucing di
Thailand, Indo-China, Malay Peninsula dan
Indonesia memiliki frekuensi lebih dari 0.500
untuk karakter ekor pendek (Nozawa et al.
2004c).
Frekuensi alel A (agouti) pada lokus A~a
di ketiga kecamatan lebih tinggi dibandingkan
frekuensi alel a (non-agouti). Data ini
didukung dengan hasil penelitian Nozawa et
al. (1983) yang menyatakan bahwa kucing di
Indonesia memiliki frekuensi alel a yang lebih
rendah dan frekuensi alel A yang lebih tinggi
dibandingkan dengan populasi kucing di
Euro-American dan Jepang.
Frekuensi alel b pada lokus B~b~bl lebih
rendah dibandingkan frekuensi alel B. Alel b
merupakan alel baru yang ditemukan pada
populasi kucing di ketiga kecamatan di
Kabupaten Wonogiri, sedangkan alel bl tidak
ditemukan. Nozawa et al. (1983) tidak
menemukan alel tersebut di Jawa Tengah.
Alel cs pada lokus C~cb~cs~ca~c hanya
ditemukan di kecamatan Wonogiri dan
Selogiri, dengan frekuensi sebesar 0.092. Alel
cs sama sekali tidak ditemukan di Jawa
Tengah (Nozawa et al. 1983). Apabila
dibandingkan dengan penelitian Lesmana
(2008) di Jakarta Timur, Noor (2007) di
Bogor, dan Aditya (2006) di Bogor Tengah,
memiliki frekuensi alel cs sebesar 0.012,
0.025, dan 0.037 tergolong lebih rendah dari
frekuensi alel cs di kecamatan di Kabupaten
Wonogiri. Hal ini mungkin dipengaruhi oleh
adanya aliran gen dari hasil perkawinan
kucing lokal dengan kucing nonlokal yang
berasal dari Eropa dan Amerika (Nozawa
2004b). Selain itu keberadaan alel cs di

kecamatan Selogiri disebabkan adanya
breeder yang sengaja memelihara kucing
dengan alel tersebut untuk dikembangbiakkan,
sehingga terjadi penyebaran alel cs.
Berdasarkan hasil penelitian Nozawa et al.
(2004a), alel cs yang merupakan alel mutan,
muncul di Myanmar diduga berasal dari hasil
imigrasi kucing dari Thailand.
Frekuensi alel d yang mengekspresikan
warna pudar pada lokus D~d, dan alel I yang
mengekspresikan warna perak pada lokus i~I
di ketiga kecamatan di Kabupaten Wonogiri
lebih rendah dibandingkan dengan frekuensi
tipe liarnya. Menurut Nozawa et al. (1983)
alel d dan alel I jarang ditemukan di
Indonesia. Alel l pada lokus L~l, merupakan
alel mutan bersifat resesif dan memiliki
frekuensi lebih rendah yaitu 0.138,
dibandingkan dengan alel L (Tabel 2). Alel l
merupakan alel baru yang ditemukan pada
populasi kucing di ketiga kecamatan di
Kabupaten Wonogiri. Berdasarkan hasil
penelitian Nozawa et al. (1983) di Jawa
Tengah, alel tersebut tidak ditemukan.
Frekuensi alel O pada lokus o~O pada
kromosom X di tiga kecamatan di Kabupaten
Wonogiri yaitu 0.376 (Tabel 2). Frekuensi alel
O tersebut lebih tinggi dibandingkan hasil
penelitian Nozawa et al. (1983) di Jawa
Tengah yang memiliki frekuensi sebesar
0.306. Penelitian Noor (2007) di Bogor
menunjukkan frekuensi alel O lebih tinggi
dibandingkan 24 tahun yang lalu yaitu dari
0.236 menjadi 0.351. Nozawa et al. (1983)
menyatakan bahwa tingginya frekuensi alel O
disebabkan alel tersebut merupakan ciri
khusus kucing Asia Timur.
Alel s pada lokus s~S merupakan tipe liar
yang bersifat resesif, memiliki frekuensi lebih
tinggi yaitu 0.524, dibandingkan dengan alel
S. Hasil yang serupa juga diperoleh Noor
(2007), tipe liar s memiliki frekuensi lebih
tinggi yaitu 0.544, dibandingkan alel
mutannya (S).
Frekuensi alel T pada lokus Ta~T~tb lebih
tinggi dibandingkan alel lainnya pada lokus
tersebut. Alel T merupakan tipe liar,
sedangkan Ta dan tb merupakan alel mutan.
Nozawa et al. (1983) menyatakan bahwa
sepanjang pulau dari Sumatra ke Sumbawa,
frekuensi alel Ta semakin menurun. Hasil
penelitian di tiga kecamatan di Kabupaten
Wonogiri ini memperkuat pernyataan dari
Nozawa tersebut. Hasil penelitian Lesmana
(2008) di Jakarta dan hasil penelitian di tiga
kecamatan
di
Kabupaten
Wonogiri,
menunjukkan frekuensi alel T a semakin
menurun. Hasil penelitian Lesmana (2008) di

8

Jakarta menunjukkan bahwa frekuensi alel T a
lebih tinggi yaitu 0.163, sedangkan frekuensi
alel Ta di tiga kecamatan di Kabupaten
Wonogiri lebih rendah yaitu 0.072 (Tabel 2).
Distribusi global frekuensi tiga alel pada lokus
Ta~T~tb digunakan untuk menduga sejarah
migrasi dari kucing (Nozawa et al. 2004c).
Menurut Nozawa et al. (1983) alel tb yang
bersifat resesif jarang ditemukan di Indonesia
sama seperti di Jepang, sangat berkebalikan
dengan kucing di Euro-American.
Alel W pada lokus w~W sangat jarang
ditemukan, bahkan frekuensinya
hanya
sebesar 0.001 (Tabel 2). Nozawa et al. (2000)
menyatakan bahwa alel W merupakan alel
mutan yang kemungkinan berasal dari aliran
gen dari beberapa perkawinan antara kucing
lokal dengan nonlokal.
Kemunculan
alel-alel
baru
yang
merupakan alel mutan di tiga kecamatan di
Kabupaten Wonogiri dikarenakan Kabupaten
Wonogiri merupakan jalur lintas daerah
sehingga memungkinkan terjadinya migrasi
kucing nonlokal yang dibawa dan dijadikan
hewan peliharaan. Apabila dibandingkan
dengan penelitian Nozawa et al. (1983) di
Jawa Tengah, maka saat ini kucing dengan
karakter mutan lebih banyak ditemukan.
Pemelihara dan breeder kucing dengan
karakter mutan umumnya didukung oleh
kondisi sosial ekonomi masyarakat yang
cukup baik. Berdasarkan hal tersebut maka
dapat dijadikan salah satu indikator tingkat
kesejahteraan masyarakat di Kabupaten
Wonogiri yang lebih baik dibandingkan 29
tahun yang lalu.
Nilai Heterozigositas (h) dan Heterozigositas
R t
Ĥ
Nilai heterozigositas (h) digunakan untuk
memberikan informasi mengenai keragaman
dari setiap lokus pada suatu populasi kucing.
Nilai h pada masing-masing lokus sangat
bervariasi, pada lokus A~a, o~O, s~S,
Ta~T~tb, dan m~M memiliki nilai h yang
relatif tinggi, secara berturut-turut yaitu 0.491,
0.470, 0.499, 0.311, 0.501. Sedangkan lokus
lainnya seperti lokus B~b, C~cs, D~d, i~I,
L~l, dan w~W memiliki nilai h yang cukup
rendah, yaitu 0.294, 0.167, 0.227, 0.021,
0.238, dan 0.002 (Tabel 2).
Nilai heterozigositas rataan (Ĥ) digunakan
untuk memberikan informasi mengenai
keragaman dari keseluruhan lokus pada suatu
populasi kucing di wilayah tertentu, yaitu
kecamatan Wonogiri, Ngadirojo, dan Selogiri.
Jika dibandingkan antara ketiga kecamatan,
nilai Ĥ dari 11 lokus di kecamatan Selogiri

lebih tinggi yaitu 0.279 (Tabel 3),
dibandingkan kecamatan lainnya. Nilai Ĥ dari
9 lokus di ketiga kecamatan di Kabupaten
Wonogiri tanpa lokus B~b dan L~l yaitu
0.268. Nilai Ĥ di Provinsi Jawa Tengah dan
Indonesia yaitu sebesar 0.286 dan 0.276
(Nozawa et al. 1983). Berdasarkan data
tersebut dapat diketahui bahwa nilai Ĥ di tiga
kecamatan di Kabupaten Wonogiri tersebut
lebih rendah jika dibandingkan dengan
Provinsi Jawa Tengah dan Indonesia. Nilai Ĥ
dari 9 lokus di ketiga kecamatan di Kabupaten
Wonogiri tanpa lokus B~b dan i~I yaitu 0.295
(Tabel 3). Nilai Ĥ dari 9 lokus di Asia sebesar
0.257 (Kawamoto et al. 2002). Berdasarkan
penelitian tersebut, dapat diketahui bahwa
nilai Ĥ di tiga kecamatan di Kabupaten
Wonogiri lebih tinggi dibandingkan nilai Ĥ di
Asia. Perbedaan nilai Ĥ tersebut dapat
disebabkan pengaruh penyebaran alel yang
mungkin dipengaruhi oleh keadaan geografik.
Menurut Nei (1987) perbedaan nilai Ĥ
ditentukan oleh mutasi, seleksi, dan hanyutan
genetik. Berdasarkan pernyataan tersebut
dapat diketahui bahwa tinggi rendahnya nilai
Ĥ dipengaruhi frekuensi alel mutan, pengaruh
para breeder dalam menyeleksi alel-alel
tertentu, serta aliran gen antar wilayah.
Diferensiasi genetik (FST)
Nilai FST digunakan untuk melihat
perbedaan genetik antara populasi di
Wonogiri, Ngadirojo, dan Selogiri untuk
setiap lokus. Lokus A~a, B~b, C~ cs, i~I, L~l,
Ta~T~tb, dan m~M memiliki nilai FST lebih
kecil dari 0.05 yang berarti mengindikasikan
perbedaan genetik yang rendah. Nilai FST
untuk lokus D~d, o~O, s~S, dan w~W
menunjukkan nilai negatif yang berarti tidak
adanya perbedaan genetik (Tabel 4). Hasil
tersebut menunjukkan terjadinya aliran gen
yang diduga berasal dari perkawinan acak
kucing antara populasi di Wonogiri,
Ngadirojo, dan Selogiri. Adanya migrasi
antara populasi ini akan menyebabkan
terjadinya pencampuran genetik akibat aliran
gen (Randi & Ragni 1991). Migrasi dalam
jangka panjang akan menyebabkan perbedaan
genetik antara populasi menjadi tidak terlalu
tinggi (Damayanti 2007).

SIMPULAN
Secara keseluruhan frekuensi alel pada
populasi kucing di tiga kecamatan di
Kabupaten Wonogiri masih didominasi oleh
tipe liarnya, kecuali tipe mutan pada lokus
m~M. Selain itu lokus m~M juga memiliki

9

keragaman alel (h) tertinggi. Berdasarkan 11
lokus yang diamati, 7 lokus diantaranya
ditemukan alel baru untuk tiga kecamatan di
Kabupaten Wonogiri yaitu b, cs, d, I, l, tb, W.
Tiga kecamatan di Kabupaten Wonogiri
memiliki heterozigositas rataan (Ĥ) sebesar
0.261. Nilai FST pada setiap lokus kurang dari
0.05 menunjukkan terjadinya aliran gen
melalui kawin acak.

DAFTAR PUSTAKA
Aditya N. 2006. Keragaman kucing (Felis
domesticus) di Kecamatan Bogor
Tengah berdasarkan karakter morfologi
[skripsi]. Bogor: Fakultas Matematika
dan Ilmu Pengetahuan Alam, Institut
Pertanian Bogor.
Burn D. 1999. An Instant Guide to Cats.
London: Malcolm Saunders Publishing
Ltd.
Damayanti CS. 2007. Analisa keragaman
genetik dan struktur populasi babi
hutan Sulawesi (Sus celebensis) di
Semenanjung Utara dan Tenggara
Pulau Sulawesi [tesis]. Bogor: Program
Pascasarjana, Institut Pertanian Bogor.
Feldhamer GA, Drickamer LC, Vessey SH,
Merritt JF. 1999. Mammalogy:
Adaptation, Diversity, and Ecology.
New York: McGraw-Hill Companies.
Griffiths AJF, Miller JH, Suzuki DT,
Lewontin RC, Gelbart WM. 1999. An
Introduction to Genetic Analysis. Ed
ke-7. New York: W.H Freman and
Company.
Kawamoto Y, Nozawa K, Wangchuk T,
Sherub. 2002. Coat-color variations of
the cats in Bhutan. Rep Soc Res Native
Livestock 20:55-64.
Lesmana T. 2008.
Morfogenetik kucing
(Felis domesticus) di Jakarta Timur
[skripsi]. Bogor: Fakultas Matematika
dan Ilmu Pengetahuan Alam, Institut
Pertanian Bogor.
Nei M. 1987. Moleculer Evolutionary
Genetics. New York: Columbia
University Press.
Noor M A. 2007. Morfogenetik kucing (Felis
domesticus) di Bogor [skripsi]. Bogor:
Fakultas Matematika dan Ilmu
Pengetahuan Alam, Institut Pertanian
Bogor.
Nozawa et al. 2004a. Coat-color and other
morphogenetic polymorphisms in the
cats of Myanmar. Rep Soc Res Native
Livestock 21:245-256.

Nozawa K. 2004b. Study on the origin and
phylogeny of feral cats in Japan and
East-Asian countries by means of
analyses of coat-color and other
morphogenetic polymorphism. Rep Soc
Res Native Livestock 21:341-362.
Nozawa K, Kawamoto Y, Kondo K,
Namikawa T. 1983. Coat-color
polymorphisms of the cats in
Indonesia. Rep Soc Res Native
Livestock 10:226-235.
Nozawa K, Maeda Y, Hasegawa Y,
Kawamoto
Y.
2000.
Genetic
polymorphisms in coat color and other
morphological traits of the Japanes
feral cats – Report of the 3rd
compilation of data. Rep Soc Res
Native Livestock 18:225-268.
Nozawa K, Masangkay JS, Namikawa T,
Kawamoto Y. 2004c. Morphogenetic
traits and gene frequencies of the feral
cats in the philipphines. Rep Soc Res
Native Livestock 21:245-256.
Randi E, Ragni B. 1991. Genetic variability
and biochemical systematics of
domestic and wild cat populations
(Felis silvestris: Felidae). J Mammal
72:79-88.
Ratti JT, Garton EO. 1996. Research and
experimental design. Di dalam:
Bookhout TA, editor. Research and
Management Techniques for Wildlife
and Habitats. Bethesda: The Wildlife
Society, Inc. hlm 1–23.
Vella CM, Shelton LM, McGonagle JJ,
Stanglein TW. 1999. Robinson’s
Genetics for Cat Breeders and
Veterinarians. Ed ke-4. London: Reed
Educational
and
Professional
Publishing Ltd.
Wilson EO. 1992. The Diversity of Life. New
York: Harvard University Press.
Wright M, Walters S. 1980. The Book of The
Cat. London: Pan Book Ltd.

10

LAMPIRAN

11

Lampiran 1 Genotipe pola tabby pada kucing domestik (Wright & Walters 1980)

Genotipe dari pola tabby Abyssinian
A-B-C-D-iiTa1 Usual (ruddy) Abyssinian
A-B-C-ddiiTa2 Blue Abyssinian
A-bbC-D-iiTa3 Chocolate (chestnut) Abyssinian
A-bbC-ddiiTa4 Lilac Abyssinian
A-blblC-D-iiTa5 Non Sex-linked “red” Abyssinian
A-blblC-ddiiTa6 Non Sex-linked “cream” Abyssinian
C-D-iiO(O)Ta7 Sex-linked “red” Abyssinian
C-ddiiO(O)Ta8 Sex-linked “cream” Abyssinian
A-B-C-D-I-Ta9 Silver usual (ruddy) Abyssinian

Genotipe dari pola tabby Mackerel/Classic
A-B-C-D-iiT-/tbtb
1 Brown (black: ebony) tabby
A-B-C-ddiiT-/tbtb
2 Blue tabby
A-bbC-D-iiT-/tbtb
3 Chocolate (chestnut) tabby
A-blblC-D-iiT-/tbtb
4 Cinnamon tabby
A-bbC-ddiiT-/tbtb
5 Lilac tabby
C-D-iiO(O)T-/tbtb
6 Red tabby
C-ddiiO(O)T-/tbtb
7 Cream tabby
A-B-C-D-I-T-/tbtb
8 Silver tabby
C-D-I-O(O)T-/tbtb
9 Cameo tabby
Keterangan: Genotipe T- menunjukkan kucing yang memiliki pola tabby mackerel sedangkan
genotipe tbtb menujukkan pola tabby classic.

12

Lampiran 2 Genotipe warna solid pada kucing domestik (Wright & Walters 1980)

aaB-C-DaaB-C-dd
aabbC-DaablblC-DaabbC-dd
aablblC-dd
C-D-O(O)
C-ddO(O)
aaB-cbcbDaaB-cbcbdd
aabbcbcbDaabbcbcbdd
cbcbD-O(O)
cbcbddO(O)
W-;caca;cc

1 Black
2 Blue
3 Chocolate (chesnut brown)
4 Cinnamon
5 Lilac
6 Light lilac
7 Red
8 Cream
9 Brown Burmese
10 Blue Burmese
11 Chocolate Burmese
12 Lilac Burmese
13 Red Burmese
14 Cream Burmese
15 White

Lampiran 3 Lokasi pengambilan gambar di tiga kecamatan di Kabupaten Wonogiri (Kecamatan
Wonogiri, Ngadirojo, Selogiri; ditandai garis merah) dengan luas total 22638.90 Ha

13

Lampiran 4

Jumlah fenotipe, frekuensi alel (q), dan heterozigositas (h) dari 11 lokus pada
kucing di tiga kecamatan di Kabupaten Wonogiri

Lokus

Keterangan

Wonogiri

Ngadirojo

Selogiri

A~a

A_

78

27

176

aa

27

5

32

n

105

32

208

qA

0.493±0.042

0.605±0.081

0.608±0.032

qa

0.507±0.042

0.395±0.081

0.392±0.032

h

0.502±0.004

0.486±0.028

0.032±0.010

B_

102

32

199

bb

3

0

8

n

105

32

207

qB

0.831±0.048

1

0.803±0.034

qa

0.169±0.048

-

0.197±0.034

h

0.282±0.034

0

0.317±0.024

C_

148

43

278

s

c_

1

0

3

n

149

43

281

qC

0.918±0.041

1

0.897±0.030

qcs

0.082±0.041

-

0.103±0.030

h

0.075±0.027

0

0.093±0.020

D_

146

42

277

dd

3

1

4

n

149

43

281

qD

0.858±0.041

0.848±0.075

0.881±0.030

qd

0.142±0.041

0.152±0.075

0.119±0.030

h

0.244±0.029

0.262±0.054

0.211±0.021

ii

142

43

278

I_

7

0

3

n

149

43

281

qi

0.976±0.009

1

0.995±0.003

qI

0.024±0.009

-

0.005±0.003

h

0.047±0.017

0

0.011±0.006

L_

147

41

277

ll

2

2

5

n

149

43

282

qL

0.884±0.041

0.784±0.074

0.867±0.030

ql

0.116±0.041

0.216±0.074

0.133±0.030

h

0.206±0.029

0.342±0.051

0.030±0.021

B~b

s

C~c

D~d

i~I

L~l

14

Lanjutan Lampiran 4
Lokus

Keterangan

Wonogiri

Ngadirojo

Selogiri

o~O

oo

77

23

144

Oo

28

9

63

OO

44

11

74

n

149

43

281

qo

0.615±0.034

0.642±0.063

0.625±0.025

qO

0.385±0.034

0.358±0.063

0.375±0.025

h

0.475±0.013

0.465±0.030

0.469±0.010

ss

44

9

77

S_

105

34

205

n

149

43

282

qs

0.543±0.034

0.457±0.068

0.523±0.025

qS

0.457±0.034

0.543±0.068

0.477±0.025

h

0.498±0.006

0.502±0.012

0.500±0.002

a

T_

10

4

45

T_

119

34

210

b b

1

0

4

n

s~S

a

T ~T~t

b

tt

130

38

259

a

0.039±0.012

0.054±0.026

0.091±0.013

qT

0.873±0.046

0.946±0.026

0.785±0.034

b

0.088±0.044

-

0.124±0.031

h

0.149±0.033

0.104±0.046

0.252±0.024

ww

149

43

281

W_

0

0

1

n

149

43

282

qw

1

1

0.998±0.002

qW

-

-

0.002±0.002

h

0

0

0.004±0.004

-

62

30

144

+

87

13

138

n

149

43

282

q-

0.416±0.040

0.698±0.070

0.511±0.030

q+

0.584±0.040

0.302±0.070

0.489±0.030

h

0.488±0.010

0.427±0.040

0.501±0.002

qT

qt

w~W

m~M

15

Lampiran 5 Frekuensi alel (q) dan heterozigositas (h) setiap lokus pada populasi kucing di
wilayah Bogor (Noor 2007)

*

A
a

Frekuens Alel
(q)
0.456±0.048
0.544±0.048

Heterozigositas
(h)
0.494±0.010

B~b
n=1082

B
b
bl

0.537±0.050
0.337±0.084
0.126±0.037

0.567±0.019

C~cb~csca~c
n=1425

C
cb
cs
ca
c

0.905±0.049
0.016±0.018
0.025±0.003
0.012±0.014
0.040±0.013

0.164±0.024

D~d
n=1415

D
d

0.791±0.048
0.209±0.048

0.327±0.032

i~I
n=1415

i
I

0.984±0.008
0.016±0.008

0.031±0.015

L~l
n=1425

L
l

0.904±0.048
0.096±0.048

0.155±0.018

o~O
n=1425

o
O

0.649±0.040
0.351±0.040

0.455±0.019

s~S
n=1415

s
S

0.544±0.041
0.456±0.041

0.492±0.009

Ta~T~tb

Ta
T
tb

0.164±0.030
0.633±0.074
0.203±0.050

0.523±0.033

w~W
n=1425

w
W

0.996±0.003
0.004±0.003

0.008±0.005

m~M*
n=1425

+

0.398±0.047
0.602±0.047

0.463±0.017

Lokus

Alel

A~a
n=1082

(-) ekor panjang ; (+) ekor pendek.

ABSTRAK
RINA RODIANA. Morfogenetik kucing (Felis domesticus) di tiga kecamatan di kabupaten
Wonogiri. Dibimbing oleh R. R. DYAH PERWITASARI dan ACHMAD FARAJALLAH.
Felis domesticus merupakan hasil domestikasi dari Felis silvestris (kucing liar Eropa)
yang biasa dimanfaatkan manusia sebagai hewan peliharaan dan pengendali tikus. Penelitian ini
bertujuan mengestimasi keragaman kucing di tiga kecamatan di kabupaten Wonogiri berdasarkan
karakter morfologi yang diekspresikan oleh 11 lokus, yaitu A~a, B~b~bl, C~cb~cs~ca~c, D~d, i~I,
L~l, m~M, o~O, s~S, Ta~T~tb, dan w~W. Perhitungan frekuensi alel dilakukan menggunakan
metode square root dan maximum likelihood. Nilai heterozigositas (h) dan heterozigositas rataan
(Ĥ) digunakan untuk mengetahui keragaman alel. Nilai F ST digunakan untuk mengetahui
keragaman genetik antara ketiga kecamatan; Wonogiri, Ngadirojo, dan Selogiri. Berdasarkan 11
lokus yang diamati, alel baru yang ditemukan yaitu b, cs, d, I, l, tb, W. Sebagian besar alel tipe liar
memiliki frekuensi yang lebih tinggi daripada alel mutan, kecuali lokus m~M. Nilai h untuk lokus
A~a= 0.491, lokus B~b= 0.294, lokus C~cs= 0.167, lokus D~d= 0.227, lokus i~I= 0.021, lokus
L~l= 0.238, lokus m~M= 0.501, lokus o~O= 0.470, lokus s~S= 0.499, lokus Ta~T~tb= 0.311, dan
lokus w~W= 0.002. Lokus m~M memiliki keragaman alel (h) tertinggi. Nilai Ĥ untuk 11 lokus
yaitu sebesar 0.261, sedangkan nilai Ĥ untuk sembilan lokus yaitu sebesar 0.268. Perbedaan nilai
Ĥ tersebut mungkin disebabkan pengaruh penyebaran alel yang dipengaruhi oleh keadaan
geografik. Nilai F ST untuk lokus A~a, B~b, C~cs, i~I, L~l, Ta~T~tb, dan m~M lebih kecil dari 0.05
yang mengindikasikan perbedaan keragaman genetik yang rendah. Nilai F ST untuk lokus D~d,
o~O, s~S, dan w~W menunjukkan nilai negatif yang berarti tidak adanya perbedaan keragaman
genetik.
Kata kunci: Felis domesticus, keragaman, kucing, morfogenetik, Wonogiri

ABSTRACT
RINA RODIANA. Morphogenetic traits of cats (Felis domesticus) in three Wonogiri districts.
Supervised by R. R. DYAH PERWITASARI and ACHMAD FARAJALLAH.
Felis domesticus was originated from domestic