Ulasan: Bagaimana Protein Melipati: Suatu Masalah yang Nyata di dalam Bioteknologi
Vol. I .
Hawlri. Juni 1994, hlm.24-25
ISSN 0854-8587
0
No.I
ULASAN
Bagaimana Protein Melipat:
Suatu Masalah yang Nyata di dalam Bioteknologi
MAGGY THENAWIDJAJA SUHARTONO
Jurtcfan Tckrrolqi Pangan dan Giri FAETA IPB. K ~ a Surd
k
220, ~ P B ' ~ a r m a ~ a
Diteritna 27 Mei 1994/Disetujui 16 Juni 1994
Buryak p d u L biokknologi merupllua protein dmgsm
kenyatn;mnya mnduga bzntuk protein hanya k h r k a n
&rzt a w n uniaoaya saja me~pakanp d u r yang kompleks. Puluhan tahun sejak pnemuan Anfinsen ratusan
pencliti m i h tetap k k e r j a di ~ p u t amasslab
r
tersehut.
Obyek penelitian yang digunakan umumnya mzmpakan
protein globular larut. herukuran kecil dengan f ' 3 0 0
fungsi hryati yang sangat penting. Sebagian produk ini
ad.h dilirik dan dipduksi brhzslrrsn old sejumlah
iddustri bioteknologi. Dapat disebutkan di sini sejum1.h
a u i m don fkktor tumbub, bedmgai fdtor tmskripsi d m
truurlui, wjumlah endotoksin yang diaplikasikm sbagri
asam amino.
hiokektisida. dm barbogai.protr?in imunuaktif: antikdi
h t u k dan U ~ U M awm amino p y u s u n protein 6 m cmmnkbd m q m t i limfdria, JM sahgrinya.
pengaruhi hagaimma rangkaian asam amino ini dikemas
Denbsrlrembmgnya ilmu-ilmu dayma protein d.n
mznjadi molekul akhir. S i fat p l a r ataupun nunplamyr
nk.yur; gut, suatu pmtain ymg diiqinkm &pat Jiamlimznantukan sifat dan kekuatan interaksinya di dalam
s i s deret (sekuen) aaam amino peayusunnya, untuk
molekul protein, atau antara protein denpan lingkungan
k e d i u r d i ~ c r a ggem yang menuruniun'protein terseuimyr. Dalam lingkunyan polu. asam amino ymy brsibut. Sehiagga, apabila surtu protein ingin diproduksi
fat polar &rung
be& di Imgian luar mldcul protein.
b r - b a u m gea inilah yrag omti dimrrhkan kepuh
Sad.agkur di dalam wl. rantai polipeptida &an melipst
ptmk hidup (d)uatuk dihrnrnlrur nrcrjdi mRNA.
d e m i k i r n nrp. aehingga bagian asam amino nanplarNamua mcrsalahnya tidrk iraderhana slspcrti yang
nyr &an k r a d a di bagian d a l m menjauhi lingkungan
diteorikaa. Suatu protein mmpunyai f u n p i speuifik.
polamya.
Pertam, prutcin iai mmiliki bgiaa-hapian (laurn amiJadi. ralah satu rturon main yang k r l a k u Ji dalvm
no) s p i f i k ymg dru, mdlakukan intzrakri spwifikaya
melipatnyr protein yritu bahwr kontak aatara air dan
asucl l.ngsung h g a n molekul-moldtul khurrw, dingpa
prorsin ini d a p t malaap~ungkurfungrinya seh.gai anzim.
.sun amino hidrofilik hams d i h t u i atau dicelm d i k i t
faktor tumbuh. hornroa, toluia, mtibodi, Jm hgainya.
mungkin. Aturu, -in lain diJurrJlua atas u u i i a i a w g
protein. yaitu hahwa nrclng mikro di dalam mlelrul proK d w . protein yrng Wika ditunrah dari mRN A k r tein hams diisi tanpa overlap di m t a r r atom-atom y m g
k t & rurtai d m belum aktif kerndim mulipat secaia
hr#(ocurgp. Studi dcnyln model komptcr m c n u n ~ a n
baru menjdi bait& &lair yurg mamh.ntu mempmilah h w a pa& prod& &hir w t u protein, p j m y ik.& di
lun hurya mlhl ldrusur uatuk ~ n t ~dengmya,
r i
mtara atom dan sudut ikatannya -ma u j a dongan yrng
tetapi ticiak & p t berintedsi rembrrmgan durgu, .tau
ditemukm pd. molekul organik kwil.
di&i
m o l W mmqmdfik Iainnys, k m kdidakcoRantai protein yang haru diturunkrn d r r i mRNA
cdur pmetrimyr.
dengan c e p t memkntuk stmktur sekunder y a y strhil.
Berkembangaya industri bioteknalogi cukup mzmiliki
peranan &lam p y e i i d i l w r ilmu Juu. Bagaimuu ~ t r i Berhayai 'ptonyan' rrtruktur tickunder ini Apt d i n g
herinterhi, d i n g -bilkan
mdnjadi stitnrlttur pdccin
protein yrug w u J . h Jitunraku, dwi DNA Jan R N A ini
melipat manjadi beatuk yant b a a r sehinypa tersapai
y ~ lebih
g kamp.k.
rlanal lnsrirures of Hralrh di Amzrikr mengemgkakan
penemuan peatins &#kuaun b g m hagrimma moliptnya m
a ini. P u r ilmuwur r u t itu bagah nmmpmmulahkur apakrh ymg mc6nyah.hkan rantai protein yany
hrru dirintesir =rib k l u m aktif ini melipat-liprtkrn
diriayr mcam @fik ahingga dqmt mnjalmkan hurysi
hayrtinya d i dalam rtau luar MI.
Jawrhrnnya terletrk
pad. Jeret a s a m amino protein yang herrangkutan.
Penurnurn ini tolah dibuktikrn herkali-krli. minimum
p d a pmtein b ~ k u n k
nw i l d i n p g r para rhli mengrnpgrp prinrip Jarur pengubatun hzntuk rantui mcnjadi
lipatan terletak pad. n i f r t firik Jan kimi. prcrtcin. Jadi
mcnurut t.eori ini, h i l a &rat r r r m amino rurtu protein
Jtketrhui, yung hrnu dipcmcltiku, hrnyrlah *ifat kimiawi
r u m rmim~muing-musing dan tingkah iakunya di hlam
lamtun (interior h ~ m p i rremu. MI mcrupakan air). Pad*
Meliptnya pmtein, terutama Ji &lam sel dengur lingkunpan yang penuh dengrn k r h r g r i wcsayawr dapat
diploJ.ng r d u g u hrail kompsriri kinacik di antam jalurjalur r d r i ywng mendoroay mslipatnya pmcin dsngan
benrr d m ruksi-rerkri manyimpang yang mungkin
mtmydmhlun prokran melip! secam MI&.
Bagaimruu cam rel maccyah di yury manyimpany
ini? Sel dapat melindungi hrgirn protein y8ng hersifat
hidrofohik denpan mcnydiakm r w t u faktar yang Jrpot
hcrikatan rrocara rcverwihcl Jenyan hagian ini. Studi i r r
virro dan in t4itvj =lama Jekade terrkhir in8 melaporkan
molekul tukany rntar (chaperon) sehagai faktor ~ l u l e r
yang mcnyarahkun rantai pmteln yany barn dirinteals ini
melalui nuatu lingkungan 'krhrhaya' mcnjrdi ntruktur
prrbtcin yang t c r l t p t denern h r . Golongan prc~einHSP
(heal shm4 pnjrcin) ymg tcmyata hcrfunysi xhrg.8
Hawlri. Juni 1994, hlm.24-25
ISSN 0854-8587
0
No.I
ULASAN
Bagaimana Protein Melipat:
Suatu Masalah yang Nyata di dalam Bioteknologi
MAGGY THENAWIDJAJA SUHARTONO
Jurtcfan Tckrrolqi Pangan dan Giri FAETA IPB. K ~ a Surd
k
220, ~ P B ' ~ a r m a ~ a
Diteritna 27 Mei 1994/Disetujui 16 Juni 1994
Buryak p d u L biokknologi merupllua protein dmgsm
kenyatn;mnya mnduga bzntuk protein hanya k h r k a n
&rzt a w n uniaoaya saja me~pakanp d u r yang kompleks. Puluhan tahun sejak pnemuan Anfinsen ratusan
pencliti m i h tetap k k e r j a di ~ p u t amasslab
r
tersehut.
Obyek penelitian yang digunakan umumnya mzmpakan
protein globular larut. herukuran kecil dengan f ' 3 0 0
fungsi hryati yang sangat penting. Sebagian produk ini
ad.h dilirik dan dipduksi brhzslrrsn old sejumlah
iddustri bioteknologi. Dapat disebutkan di sini sejum1.h
a u i m don fkktor tumbub, bedmgai fdtor tmskripsi d m
truurlui, wjumlah endotoksin yang diaplikasikm sbagri
asam amino.
hiokektisida. dm barbogai.protr?in imunuaktif: antikdi
h t u k dan U ~ U M awm amino p y u s u n protein 6 m cmmnkbd m q m t i limfdria, JM sahgrinya.
pengaruhi hagaimma rangkaian asam amino ini dikemas
Denbsrlrembmgnya ilmu-ilmu dayma protein d.n
mznjadi molekul akhir. S i fat p l a r ataupun nunplamyr
nk.yur; gut, suatu pmtain ymg diiqinkm &pat Jiamlimznantukan sifat dan kekuatan interaksinya di dalam
s i s deret (sekuen) aaam amino peayusunnya, untuk
molekul protein, atau antara protein denpan lingkungan
k e d i u r d i ~ c r a ggem yang menuruniun'protein terseuimyr. Dalam lingkunyan polu. asam amino ymy brsibut. Sehiagga, apabila surtu protein ingin diproduksi
fat polar &rung
be& di Imgian luar mldcul protein.
b r - b a u m gea inilah yrag omti dimrrhkan kepuh
Sad.agkur di dalam wl. rantai polipeptida &an melipst
ptmk hidup (d)uatuk dihrnrnlrur nrcrjdi mRNA.
d e m i k i r n nrp. aehingga bagian asam amino nanplarNamua mcrsalahnya tidrk iraderhana slspcrti yang
nyr &an k r a d a di bagian d a l m menjauhi lingkungan
diteorikaa. Suatu protein mmpunyai f u n p i speuifik.
polamya.
Pertam, prutcin iai mmiliki bgiaa-hapian (laurn amiJadi. ralah satu rturon main yang k r l a k u Ji dalvm
no) s p i f i k ymg dru, mdlakukan intzrakri spwifikaya
melipatnyr protein yritu bahwr kontak aatara air dan
asucl l.ngsung h g a n molekul-moldtul khurrw, dingpa
prorsin ini d a p t malaap~ungkurfungrinya seh.gai anzim.
.sun amino hidrofilik hams d i h t u i atau dicelm d i k i t
faktor tumbuh. hornroa, toluia, mtibodi, Jm hgainya.
mungkin. Aturu, -in lain diJurrJlua atas u u i i a i a w g
protein. yaitu hahwa nrclng mikro di dalam mlelrul proK d w . protein yrng Wika ditunrah dari mRN A k r tein hams diisi tanpa overlap di m t a r r atom-atom y m g
k t & rurtai d m belum aktif kerndim mulipat secaia
hr#(ocurgp. Studi dcnyln model komptcr m c n u n ~ a n
baru menjdi bait& &lair yurg mamh.ntu mempmilah h w a pa& prod& &hir w t u protein, p j m y ik.& di
lun hurya mlhl ldrusur uatuk ~ n t ~dengmya,
r i
mtara atom dan sudut ikatannya -ma u j a dongan yrng
tetapi ticiak & p t berintedsi rembrrmgan durgu, .tau
ditemukm pd. molekul organik kwil.
di&i
m o l W mmqmdfik Iainnys, k m kdidakcoRantai protein yang haru diturunkrn d r r i mRNA
cdur pmetrimyr.
dengan c e p t memkntuk stmktur sekunder y a y strhil.
Berkembangaya industri bioteknalogi cukup mzmiliki
peranan &lam p y e i i d i l w r ilmu Juu. Bagaimuu ~ t r i Berhayai 'ptonyan' rrtruktur tickunder ini Apt d i n g
herinterhi, d i n g -bilkan
mdnjadi stitnrlttur pdccin
protein yrug w u J . h Jitunraku, dwi DNA Jan R N A ini
melipat manjadi beatuk yant b a a r sehinypa tersapai
y ~ lebih
g kamp.k.
rlanal lnsrirures of Hralrh di Amzrikr mengemgkakan
penemuan peatins &#kuaun b g m hagrimma moliptnya m
a ini. P u r ilmuwur r u t itu bagah nmmpmmulahkur apakrh ymg mc6nyah.hkan rantai protein yany
hrru dirintesir =rib k l u m aktif ini melipat-liprtkrn
diriayr mcam @fik ahingga dqmt mnjalmkan hurysi
hayrtinya d i dalam rtau luar MI.
Jawrhrnnya terletrk
pad. Jeret a s a m amino protein yang herrangkutan.
Penurnurn ini tolah dibuktikrn herkali-krli. minimum
p d a pmtein b ~ k u n k
nw i l d i n p g r para rhli mengrnpgrp prinrip Jarur pengubatun hzntuk rantui mcnjadi
lipatan terletak pad. n i f r t firik Jan kimi. prcrtcin. Jadi
mcnurut t.eori ini, h i l a &rat r r r m amino rurtu protein
Jtketrhui, yung hrnu dipcmcltiku, hrnyrlah *ifat kimiawi
r u m rmim~muing-musing dan tingkah iakunya di hlam
lamtun (interior h ~ m p i rremu. MI mcrupakan air). Pad*
Meliptnya pmtein, terutama Ji &lam sel dengur lingkunpan yang penuh dengrn k r h r g r i wcsayawr dapat
diploJ.ng r d u g u hrail kompsriri kinacik di antam jalurjalur r d r i ywng mendoroay mslipatnya pmcin dsngan
benrr d m ruksi-rerkri manyimpang yang mungkin
mtmydmhlun prokran melip! secam MI&.
Bagaimruu cam rel maccyah di yury manyimpany
ini? Sel dapat melindungi hrgirn protein y8ng hersifat
hidrofohik denpan mcnydiakm r w t u faktar yang Jrpot
hcrikatan rrocara rcverwihcl Jenyan hagian ini. Studi i r r
virro dan in t4itvj =lama Jekade terrkhir in8 melaporkan
molekul tukany rntar (chaperon) sehagai faktor ~ l u l e r
yang mcnyarahkun rantai pmteln yany barn dirinteals ini
melalui nuatu lingkungan 'krhrhaya' mcnjrdi ntruktur
prrbtcin yang t c r l t p t denern h r . Golongan prc~einHSP
(heal shm4 pnjrcin) ymg tcmyata hcrfunysi xhrg.8