Dina Karina Islami, 2015 ANALISIS KEKERABATAN ANGGOTA FAMILIA SOLANACEAE
BERDASARKAN SIKUEN DNA DAERAH ITS Universitas Pendidikan Indonesia
| repository.upi.edu
| perpustakaan.upi.edu
26
BAB III METODE PENELITIAN
3.1 Jenis Penelitian
Penelitian ini merupakan jenis penelitian dasar dengan menggunakan metode deskriptif, yaitu untuk menganalisis hubungan kekerabatan antar
anggota familia Solanaceae dengan cara merekonstruksi pohon filogenetik berdasarkan siuken DNA daerah ITS.
3.2 Sampel Penelitian
Sampel pada penelitian ini adalah sebanyak dua puluh spesies tumbuhan dari sebelas genus anggota familia Solanaceae. Familia Convolvulaceae,
Apocynaceae, dan Plantaginaceae digunakan sebagai outgroup. Pemilihan familia Convolvulaceae sebagai outgroup didasarkan pada penelitian
Stefanovic et al., 2002, hlm. 1510 yang menyatakan bahwa Convolvulaceae merupakan sister group dari familia Solanaceae. Sedangkan Plantaginaceae,
dan Apocynaceae dipilih sebagai outgroup karena memiliki kekerabatan yang dekat dengan familia Solanaceae Melotto-Passarin et al., 2008, hlm. 91;
Haston et al., 2009, hlm. 161. Sikuen DNA daerah ITS untuk genus Capsicum
dan Withania diperoleh dari genbank dengan alamat http:www.ncbi.nlm.nih.gov
. Daftar tumbuhan yang digunakan pada penelitian ini tercantum dalam Tabel 3.1.
Tabel 3.1
Tumbuhan yang Digunakan dalam Penelitian
No 1
Spesies 2
Nama Daerah 3
Keterangan 4
Lokasi Sampling
5
1 Physalis angulata
Ciplukan Ingroup
Ujung Berung 2
Solanum nigrum Leunca
Ingroup UPI
3 Solanum wrightii
Karundung Ingroup
UPI dan Dago 4
Solanum lycopersicum Tomat
Ingroup UPI Ujung
Berung
Dina Karina Islami, 2015 ANALISIS KEKERABATAN ANGGOTA FAMILIA SOLANACEAE
BERDASARKAN SIKUEN DNA DAERAH ITS Universitas Pendidikan Indonesia
| repository.upi.edu
| perpustakaan.upi.edu
5 Solanum viarum
Terong hutan Ingroup
UPI
1 2
3 4
5
6 Solanum melongena
Terong ungu Ingroup
Ujung Berung 7
Nicotiana tabacum Tembakau
Ingroup Ujung Berung
8 Brugmansia suaveolens
Kecubung orange
Ingroup UPI
9 Brugmansia candida
Kecubung putih Ingroup UPI
10 Brunfelsia uniflora
Manacá Ingroup
UPI 11
Cestrum nocturnum
Kembang dayang
Ingroup UPI
12
Solanum pseudocapsicum
Leunca kuning Ingroup
UPI 13
Capsicum annum Cabai merah
Ingroup Genbank
14 Withania somnifera
Ashwagandha Ingroup
Genbank 15
Datura metel Kecubung ungu Ingroup
Cihideung 16
Petunia grandiflora Petunia
Ingroup Cihideung
17 Nicandra physalodes
Ciplukan keras Ingroup
UPI 18
Cestrum cultum
Kembang dayang
Ingroup Dago
19 Physalis peruviana
Ciplukan Ingroup
Dago 20
Solanum tuberosum Kentang
Ingroup Cimahi
21 Plantago major
Ki sendok Outgroup
UPI Dago 22
Allamanda cathartica Alamanda
Outgroup UPI
23 Ipomoea cairica
Bunga terompet Outgroup UPI
3.3 Lokasi Penelitian
