Pelacakan Gen Protease Serin Pada Beberapa Isolat Xanthomonas campestris pv. glycines Asal Indonesia dengan Teknik Hibridasi Southhern
RINGKASAN
Novia Widiany R. Pelacakan Gen Protease Serin pada Beberapa isolat
Xartthornonas carnpestris pv. glycines Asal Indonesia dengan Teknik Hibrldisasl
Southern, dibawah bimbingan Dr. Ir. Maggy T. Suhartono sebagai ketua, Dr. Ir.
Antonius Suwanto M.Sc., dan Dr Tresnawati Punvadaria sebagai anggota.
Penggunaan enzim protease dewasa ini di berbagai industri menyebabkan
enzim protease memegang peranan penting. Peranannya dalam industri pangan
semakin meningkat seiring dengan perkembangan bioteknologi dan aplikasinya yang
semakin luas. Dari semua penghasil protease, mikroba merupakan penghasil protease
yang paling banyak dikembangkan karena alasan efisiensi dan kemudahan dalam
rekayasa genetika.
Xanthomonas campestris pv. glycines yang dikenal sebagai bakteri patogen
pada tanaman kedelai dalam perkembangan selanjutnya ditemukan sifat-sifat
menguntungkan
terutama
dalam
ind~~stripangan
karena
kemampuannya
menghasilkan gum xanthan, xanthomonadin dan protease.
Rosana (1997) telah memperoleh plasmid rekombinan pLRQ6 yang
dikonstruksi dari Xanthomonas campestris pv. glycines RSSA, ter
protease pada fragmen DNA genom yang berukuran 6.2 kb ha
restriksi AseI. Pada penelitian ini pLRQ6 digunakan sebagai pelac
keberadaan gen protease serin pada isolat Xanthoinonas canzp
YR32, YR64 dan 1FL dengan teknik hibridisasi southern.
Dalam penelitian ini hasil hibridiaasi dengan probe pL
signal positif pada X. campestris pv. glycines YR32 pada po
campestris pv. glycines YR64 ada dua signal dengan ukur
menunjukkan isolat ini memiliki lebih dari satu gen penyandi p
pv. glyciites IFL menunjukkan signal positif pada ukuran 6.2
pada posisi 6.2 kb menunjukkan kemungkina~ipada sekuen DNA dengall poslsi
tersebut terdapat DNA penyandi gen protease serin.
Hasil hibridisasi Xanthomonas campestris pv. glyc~nesIFL pada fragmen 6.2
kb- EcoRI berhasil diklon ke dalam E. co11 dengan ukuran 2.1 dan 0.7 kb.
PELACAKAN GEN PROTEASE SERIN PADA BEBERAPA
ISOLAT Xanthonzorzas campestris pv. glycirtes
ASAL INDONESIA DENGAN TEKNIK
HIBRIDISASl SOUTHERN
Oleh
Novia Widiany Rundupadang
Tesis sebagai salah satu syarat untuk memperoleh gelar
Magister Sains pada Program ~ a s c a~ a r j a n a
Institut Pertanian Bogor
PROGRAM PASCA SARJANA
Novia Widiany R. Pelacakan Gen Protease Serin pada Beberapa isolat
Xartthornonas carnpestris pv. glycines Asal Indonesia dengan Teknik Hibrldisasl
Southern, dibawah bimbingan Dr. Ir. Maggy T. Suhartono sebagai ketua, Dr. Ir.
Antonius Suwanto M.Sc., dan Dr Tresnawati Punvadaria sebagai anggota.
Penggunaan enzim protease dewasa ini di berbagai industri menyebabkan
enzim protease memegang peranan penting. Peranannya dalam industri pangan
semakin meningkat seiring dengan perkembangan bioteknologi dan aplikasinya yang
semakin luas. Dari semua penghasil protease, mikroba merupakan penghasil protease
yang paling banyak dikembangkan karena alasan efisiensi dan kemudahan dalam
rekayasa genetika.
Xanthomonas campestris pv. glycines yang dikenal sebagai bakteri patogen
pada tanaman kedelai dalam perkembangan selanjutnya ditemukan sifat-sifat
menguntungkan
terutama
dalam
ind~~stripangan
karena
kemampuannya
menghasilkan gum xanthan, xanthomonadin dan protease.
Rosana (1997) telah memperoleh plasmid rekombinan pLRQ6 yang
dikonstruksi dari Xanthomonas campestris pv. glycines RSSA, ter
protease pada fragmen DNA genom yang berukuran 6.2 kb ha
restriksi AseI. Pada penelitian ini pLRQ6 digunakan sebagai pelac
keberadaan gen protease serin pada isolat Xanthoinonas canzp
YR32, YR64 dan 1FL dengan teknik hibridisasi southern.
Dalam penelitian ini hasil hibridiaasi dengan probe pL
signal positif pada X. campestris pv. glycines YR32 pada po
campestris pv. glycines YR64 ada dua signal dengan ukur
menunjukkan isolat ini memiliki lebih dari satu gen penyandi p
pv. glyciites IFL menunjukkan signal positif pada ukuran 6.2
pada posisi 6.2 kb menunjukkan kemungkina~ipada sekuen DNA dengall poslsi
tersebut terdapat DNA penyandi gen protease serin.
Hasil hibridisasi Xanthomonas campestris pv. glyc~nesIFL pada fragmen 6.2
kb- EcoRI berhasil diklon ke dalam E. co11 dengan ukuran 2.1 dan 0.7 kb.
PELACAKAN GEN PROTEASE SERIN PADA BEBERAPA
ISOLAT Xanthonzorzas campestris pv. glycirtes
ASAL INDONESIA DENGAN TEKNIK
HIBRIDISASl SOUTHERN
Oleh
Novia Widiany Rundupadang
Tesis sebagai salah satu syarat untuk memperoleh gelar
Magister Sains pada Program ~ a s c a~ a r j a n a
Institut Pertanian Bogor
PROGRAM PASCA SARJANA