Isolasi dan Uji Ekstrak Metanol Bakteri Endofit Keji Beling (Strobilanthes Crispus) dalam Menghambat Pertumbuhan Beberapa Mikroba Patogen

ISOLASI DAN UJI EKSTRAK METANOL BAKTERI
ENDOFIT KEJI BELING (Strobilanthes crispus) DALAM
MENGHAMBAT PERTUMBUHAN BEBERAPA MIKROBA
PATOGEN

SKRIPSI

AGUSTINA JATI PANGLIPUR
090805039

DEPARTEMEN BIOLOGI
FAKULTAS MATEMATIKA DAN ILMU PENGETAHUAN ALAM
UNIVERSITAS SUMATERA UTARA
MEDAN
2014

Universitas Sumatera Utara

ISOLASI DAN UJI EKSTRAK METANOL BAKTERI
ENDOFIT KEJI BELING (Strobilanthes crispus) DALAM
MENGHAMBAT PERTUMBUHAN BEBERAPA MIKROBA

PATOGEN

SKRIPSI

Diajukan untuk melengkapi tugas dan memenuhi syarat mencapai gelar
Sarjana Sains

AGUSTINA JATI PANGLIPUR
090805039

DEPARTEMEN BIOLOGI
FAKULTAS MATEMATIKA DAN ILMU PENGETAHUAN ALAM
UNIVERSITAS SUMATERA UTARA
MEDAN
2014

Universitas Sumatera Utara

PERSETUJUAN


Judul

: Isolasi dan Uji Ekstrak Metanol Bakteri Endofit
Keji Beling (Strobilanthes crispus) dalam
Menghambat Pertumbuhan Beberapa Mikroba
Patogen

Kategori
Nama
Nomor Induk Mahasiswa
Program Studi
Departemen
Fakultas

: Skripsi
: Agustina Jati Panglipur
: 090805039
: Sarjana (S1) Biologi
: Biologi
: Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam

Universitas Sumatera Utara

Disetujui di
Medan, April 2014

Komisi Pembimbing :
Pembimbing 2,

Pembimbing 1,

Dr. It Jamilah, M. Sc
NIP: 196310121991032003

Prof. Dr. Dwi Suryanto, M.Sc
NIP: 196404091994031003

Disetujui oleh
Departemen Biologi FMIPA USU
Ketua,


Dr. Nursahara Pasaribu, M. Sc
NIP. 1963012319900320

Universitas Sumatera Utara

PERNYATAAN

ISOLASI DAN UJI EKSTRAK METANOL BAKTERI ENDOFIT KEJI
BELING (Strobilanthes crispus) DALAM MENGHAMBAT
PERTUMBUHAN BEBERAPA MIKROBA PATOGEN

SKRIPSI

Saya mengakui bahwa skripsi ini adalah hasil karya sendiri. Kecuali beberapa
kutipan dan ringkasan yang masing-masing disebutkan sumbernya.

Medan, April 2014

Agustina Jati Panglipur
090805039


Universitas Sumatera Utara

PENGHARGAAN

Puji dan syukur penulis ucapkan kehadirat Tuhan Yang Maha Kuasa yang telah
memberikan kasihNya sehingga penulis dapat menyelesaikan skripsi ini dengan
judul Isolasi dan Uji Ekstrak Metanol Bakteri Endofit Keji Beling
(Strobilanthes crispus) dalam Menghambat Pertumbuhan Beberapa Mikroba
Patogen.
Pada kesempatan ini penulis mengucapkan terimakasih kepada Bapak Prof.
Dr. Dwi Suryanto, M. Sc selaku Dosen Pembimbing I dan Ibu Dr. It Jamilah, M.Sc
selaku Dosen Pembimbing II yang telah memberikan nasehat dan bimbingan
kepada penulis dalam penyusunan skripsi ini. Terimakasih kepada Ibu Dr. Nunuk
Priyani, M. Sc selaku Dosen Penguji I dan Bapak Riyanto Sinaga, S. Si, M. Si
selaku Dosen Penguji II yang telah memberikan kritik dan saran yang membangun
dalam penyusunan skripsi ini. Terimakasih kepada Ibu Dr. Nursahara Pasaribu, M.
Sc selaku Ketua Departemen Biologi FMIPA USU, Bapak Dr. Sutarman, M. Sc
selaku Dekan FMIPA USU, Ibu Dr. Marpongahtun, M. Sc selaku Pembantu Dekan
I, Bapak Drs. Nursal, M.Sc selaku Pembantu Dekan II dan Bapak Drs. Kerista

Sebayang, M. Si selaku Pembantu Dekan III, Bapak dan Ibu Dosen Biologi FMIPA
USU, kepada Bang Erwin dan Ibu Roslina Ginting serta seluruh staf pegawai
FMIPA USU, terimakasih saya ucapkan atas semua bantuannya.
Terimakasih tak terhingga kepada orangtuaku tercinta, Bapak
Christophorus Bangun Topo (alm) dan Ibu Yuliana Sumariyam yang senantiasa
berkorban, mencintai dan berdoa untukku, juga kepada adik-adikku tersayang,
Yohana Retno Puspo Giwang dan Cicilia Dewi Melati Sari yang memberikan
dukungan penuh. Terimakasih juga kepada masku Andreas Urip Waluyo yang telah
memberikan dukungan dan doanya kepadaku. Tak lupa juga kepada Tante Tetty
dan Opung serta rekan-rekan di opung camp yang selalu menghibur dan berbagi
cerita.
Kepada seluruh sahabatku Febrin, Jesica, Silvia, Grace, Ledi, Febri, Yenni,
Bertua, Uba, Itok Raymond, Edag Fivin dan seluruh stambuk 2009. Kepada adikku
Doris dan seluruh stambuk 2010, 2011 dan 2012. Kepada Kak Yanti, Kak Netty,
Kak Nikmah, Kak Widya, dan Kak Rahmi yang telah membantu selama penelitian.
Terimakasih juga kepada rekan-rekan Persekutuan Keluarga Besar Kristen Biologi
(PKBKB), Biologi Pecinta Alam dan Studi Lingkungan Hidup (BIOPALAS) dan
Keluarga Mahasiswa Katolik (KMK) St. Aloysius Gonzaga serta semua pihak yang
telah memberikan ilmu, pengalaman dan membantu penulis yang tidak dapat
disebutkan satu persatu.

Penulis menyadari masih banyak kekurangan dalam penyusunan skripsi ini,
untuk itu dengan lapang dada penulis mengharapkan kritik dan saran yang
membangun dari semua pihak demi kesempurnaan skripsi ini. Atas partisipasi dan
dukungannya penulis ucapkan terimakasih.

Universitas Sumatera Utara

ISOLASI DAN UJI EKSTRAK METANOL BAKTERI
ENDOFIT KEJI BELING (Strobilanthes crispus) DALAM
MENGHAMBAT PERTUMBUHAN BEBERAPA MIKROBA
PATOGEN
ABSTRAK

Penelitian mengenai isolasi dan uji ekstrak metanol bakteri endofit keji beling
(Strobilanthes crispus) dalam menghambat pertumbuhan mikroba Salmonella
typhii, Streptococcus mutans, Escherichia coli dan Aspergillus flavus telah
dilakukan. Penelitian ini bertujuan untuk mendapatkan isolat bakteri endofit
penghasil senyawa antimikroba. Terdapat 12 isolat bakteri endofit yang diisolasi
dari keji beling. Dua isolat yaitu AJ5 dan AJ7 dipilih untuk diekstrak dengan
metanol berdasarkan kemampuannya dalam menghambat pertumbuhan mikroba

patogen. Kemampuan ekstrak dalam menghambat pertumbuhan mikroba patogen
dibuat dalam konsentrasi 40%, 60%, 80% dan 100%. Hasil penelitian menunjukkan
bahwa zona hambat tertinggi terhadap Salmonella typhii ditunjukkan oleh ekstrak
AJ7 pada konsentrasi 60% dengan besar 14 mm, terhadap Streptococcus mutans
ditunjukkan oleh ekstrak AJ7 pada konsentrasi 40% dengan zona hambat 8,4 mm,
sedangkan ekstrak AJ5 pada konsentrasi 40% dan 60% menghambat Escherichia
coli sebesar 10 mm. Penghambatan terhadap jamur Aspergillus flavus ditunjukkan
oleh ekstrak AJ7 pada konsentrasi 100% sebesar 6,6 mm.
Kata kunci: aktivitas antimikroba, bakteri endofit, ekstrak metanol, keji beling
(Strobilanthes crispus)

Universitas Sumatera Utara

ISOLATION AND EXAMINATION METHANOL EXTRACT
OF ENDOPHYTIC BACTERIA FROM KEJI BELING
(Strobilanthes crispus) IN INHIBIT SEVERAL PATHOGENIC
MICROBE GROWTH
ABSTRACT

A study on isolation and examination methanol extract of endophytic bacteria from

keji beling (Strobilanthes crispus) in inhibiting Salmonella typhii, Streptococcus
mutans, Escherichia coli and Aspergillus flavus microbe growth was conducted.
The objective of the study was to isolate endophytic bacteria producing
antimicrobial compounds. There were 12 isolates of endophytic bacteria isolated
from “keji beling”. Two isolates, AJ5 and AJ7 were chosen to be extracted with
methanol based on their ability to inhibit the pathogen growth. The ability of the
extract to inhibit the gowth of the pathogens were conducted at concentration of
40%, 60%, 80%, and 100%. The results showed that higher inhibition zone against
Salmonella typhii was shown by the extract of AJ7 at concentration of 60% by 14
mm, Streptococcus mutans was shown by extract of AJ7 at concentration of 40%
with inhibition zone of 8.4 mm, respectively, while extract of AJ5 with
concentration of 40% and 60% inhibited Escherichia coli by 10 mm. Inhibition of
fungi Aspergillus flavus was shown by the extract of AJ7 at concentration of 100%
by 6.6 mm.
Keywords: antimicrobial activity, endophytic bacteria, methanol extract,
Strobilanthes crispus

Universitas Sumatera Utara

DAFTAR ISI


Persetujuan
Pernyataan
Penghargaan
Abstrak
Abstract
Daftar Isi
Daftar Tabel
Daftar Gambar
Daftar Lampiran

Halaman
i
ii
iii
iv
v
vi
viii
ix

x

BAB 1. Pendahuluan
1.1. Latar Belakang
1.2. Permasalahan
1.3. Tujuan Penelitian
1.4. Hipotesis
1.5. Manfaat

1
2
3
3
3

BAB 2. Tinjauan Pustaka
2.1. Keji Beling (Strobilanthes crispus)
2.2. Bakteri Endofit
2.3. Mikroba Patogen
2.3.1. Streptococcus mutans
2.3.2. Salmonella typhii
2.3.3. Escherichia coli
2.3.5. Aspergillus flavus

4
5
6
6
6
7
8

BAB 3. Bahan Dan Metoda
3.1. Waktu dan Tempat
3.2. Alat dan Bahan
3.3. Isolasi Bakteri Endofit dari Akar dan Batang Keji Beling
3.4. Karakterisasi Isolat Bakteri Endofit
3.5. Uji Daya Hambat Isolat Bakteri Endofit terhadap Jamur Patogen
3.6. Uji Daya Hambat Isolat Bakteri Endofit terhadap Bakteri Patogen
3.7. Ekstraksi Bakteri Endofit
3.8. Pengamatan hifa abnormal jamur patogen
3.9. Uji Aktivitas Antimikroba Ekstrak Metanol Bakteri Endofit
terhadap Mikroba Patogen

11
11
12
12
12
13
14
14
15

Universitas Sumatera Utara

BAB 4. Hasil Dan Pembahasan
4.1. Isolasi dan Karakterisasi Bakteri Endofit dari Tanaman Keji
Beling
4.2. Uji Daya Hambat Isolat Bakteri Endofit terhadap Pertumbuhan
Mikroba Patogen
4.3. Uji Aktivitas Antimikroba Ekstrak Metanol Bakteri Endofit
terhadap Mikroba Patogen
4.4. Pengamatan Hifa Abnormal

16
18
20
24

BAB 5. Kesimpulan Dan Saran
5.1. Kesimpulan
5.2. Saran

25
25

Daftar Pustaka
Lampiran

26
30

Universitas Sumatera Utara

DAFTAR TABEL

Nomor Tabel
4.1.
4.2.
4.3.

Judul

Halaman

Karakterisasi Isolat Bakteri Endofit
Hasil Uji Daya Hambat Isolat Bakteri Endofit
terhadap Pertumbuhan Mikroba Patogen
Hasil Uji Aktivitas Ekstrak Metanol Bakteri
Endofit terhadap Mikroba Patogen

17
18
20

Universitas Sumatera Utara

DAFTAR GAMBAR

Nomor
Gambar

Judul

Halaman

2.1.
2.2.

Keji Beling (Strobilanthes crispus)
Koloni jamur A. flavus & Konidia A. flavus
pada
pembesaran
100x10

4
9

3.1.

Metode pengukuran zona hambat bakteri
endofit terhadap koloni jamur patogen
Uji daya hambat isolat bakteri endofit terhadap
bakteri pathogen
Uji daya hambat isolat bakteri endofit terhadap
jamur patogen
Hifa jamur A. flavus

13

4.1.
4.2.
4.3.

20
20
24

Universitas Sumatera Utara

DAFTAR LAMPIRAN

Nomor
Lampiran
1.
2.
3.
4.
5.
6.
7.
8.

Judul

Halaman

Isolasi Bakteri Endofit dari Akar dan Batang Keji
Beling
Karakterisasi Isolat Bakteri Endofit
Uji Daya Hambat Isolat Bakteri Endofit terhadap
Jamur Patogen
Uji Daya Hambat Isolat Bakteri Endofit terhadap
Mikroba Patogen
Ekstraksi Bakteri Endofit
Pengamatan hifa abnormal jamur patogen
Uji Aktivitas Antimikroba Ekstrak Metanol
Bakteri Endofit terhadap Mikroba Patogen
Dokumentasi penelitian

30
31
32
33
33
34
34
35

Universitas Sumatera Utara