KERAGAMAN WERENG COKLAT (Nilaparvata lugens Stall) (HOMOPTERA:DELPHACIDAE) BERDASARKAN MARKA PROTEIN TOTAL.

perpustakaan.uns.ac.id

digilib.uns.ac.id

SKRIPSI
KERAGAMAN WERENG COKLAT (Nilaparvata lugens Stall)
(HOMOPTERA:DELPHACIDAE) BERDASARKAN
MARKA PROTEIN TOTAL

Oleh
Oktaviana Brian Kusuma
H0709087

PROGRAM STUDI AGROTEKNOLOGI
FAKULTAS PERTANIAN UNIVERSITAS SEBELAS MARET
SURAKARTA
2013

commit to user

i


perpustakaan.uns.ac.id

digilib.uns.ac.id

KERAGAMAN WERENG COKLAT (Nilaparvata lugens Stall)
(HOMOPTERA:DELPHACIDAE) BERDASARKAN
MARKA PROTEIN TOTAL

SKRIPSI

Untuk memenuhi sebagian persyaratan
guna memperoleh derajat Sarjana Pertanian
di Fakultas Pertanian
Universitas Sebelas Maret

Oleh
Oktavian Brian Kusuma
H0709087


PROGRAM STUDI AGROTEKNOLOGI
FAKULTAS PERTANIAN UNIVERSITAS SEBELAS MARET
SURAKARTA
commit
to user
2013

ii

perpustakaan.uns.ac.id

digilib.uns.ac.id

SKRIPSI

KERAGAMAN WERENG COKLAT (Nilaparvata lugens Stall)
(HOMOPTERA:DELPHACIDAE) BERDASARKAN
MARKA PROTEIN TOTAL

Oktaviana Brian Kusuma

H0709087

Pembimbing Utama

Pembimbing Pendamping

Ir. Retno Wijayanti, MSi
NIP. 1966071519994022001

Dr. Ir. Supriyadi, MS.
NIP. 195808131985031003

Surakarta, April 2013

Fakultas Pertanian
Dekan,

Prof. Dr. Ir. H. Bambang Pujiasmanto, MS
NIP.195602251986011001
commit to user


iii

perpustakaan.uns.ac.id

digilib.uns.ac.id

SKRIPSI

KERAGAMAN WERENG COKLAT (Nilaparvata lugens Stall)
(HOMOPTERA:DELPHACIDAE) BERDASARKAN
MARKA PROTEIN TOTAL

yang dipersiapkan dan disusun oleh
Oktaviana Brian Kusuma
H0709087

telah dipertahankan di depan Tim Penguji
pada tanggal: 08 April 2013
dan dinyatakan telah memenuhi syarat

untuk memperoleh gelar Sarjana Pertanian
Program Studi Agroteknologi

Susunan Tim Penguji:

Ketua

Anggota I

Anggota II

Dr. Ir. Supriyadi, MS.
NIP. 195808131985031003

Ir. Retno Wijayanti, MSi
NIP.1966071519994022001

Dr. Ir. Subagiya, MP
NIP. 19610227 198803 1 004


commit to user

iv

perpustakaan.uns.ac.id

digilib.uns.ac.id

KATA PENGANTAR

Segala puja dan puji syukur senantiasa penulis panjatkan kehadirat Allah
SWT. Karena dengan limpahan segala taufik, hidayah, dan inayahNya penulis
dapat

menyelesaikan penelitian dan penyusunan skripsi yang berjudul

“Keragaman Wereng Coklat Nilaparvata lugens Stall (Homoptera:Delphacidae)
Berdasarkan Marka Protein Total”. Dalam penyusunan skripsi ini, penulis tidak
lepas dari bantuan berbagai pihak. Untuk itu penulis mengucapkan banyak terima
kasih kepada :

1. Prof. Dr. Ir. Bambang Pujiasmanto, MS selaku Dekan Fakultas Pertanian
Universitas Sebelas Maret Surakarta.
2. Dr.Ir. Hadiwiyono, MSi selaku Ketua Program Studi Agroteknologi Fakultas
Pertanian Universitas Sebelas Maret Surakarta.
3. Dr. Ir. Supriyadi, MS selaku pembimbing utama yang banyak memberikan
masukan, koreksi dan bimbingannya dalam menyelesaikan penelitian dan
penyusunan skripsi.
4. Ir. Retno Wijayanti, M.Si selaku pembimbing pendamping yang senantiasa
mendampingi dan memberi saran dalam menyelesaikan penelitian dan
penyusunan skripsi.
5. Dr. Ir. Subagiya, MP selaku dosen pembahas yang banyak memberikan
masukan dalam penyusunan skripsi
6. Ayah, Mama, dan kakak tercinta yang selalu memberikan dukungan, do’a,
nasehat, serta kasih sayang yang luar biasa.
7. Segenap Laboran Hama Penyakit Tanaman, Biologi Tanah, dan Rumah Kaca
yang banyak membantu selama penelitian berlangsung.
8. Seluruh keluarga besar Agroteknologi 2009 “KETAN” dan keluarga kecil
Agroteknologi B 2009 sebagai teman senasib dan seperjuangan dalam suka
maupun duka.
9. Teman-teman minat “Perlindungan Tanaman” yang selalu memberi

dukungan, semangat, dan kebersamaan dalam menjalankan penelitian
commit to user
maupun penyusunan skripsi.
v

perpustakaan.uns.ac.id

digilib.uns.ac.id

10. Kakak-kakak di Pusat Pengembangann Kewirausahaan (PPKwu) LPPM UNS
yang selalu memberikan motivasi, dorongan dan semangat belajar dalam
penyusunan skripsi.
Penulis menyadari bahwa penyusunan skripsi ini masih jauh dari kata
sempurna. Untuk itu, penulis mengharap saran kritik yang membangun dalam
penyusunan skripsi agar menjadi lebih baik. Semoga karya kecil ini dapat
bermanfaat bagi semua orang khususnya bagi penulis sendiri. Amin

Surakarta, April 2013

Penulis


DAFTAR ISI

Halaman
HALAMAN JUDUL ..........................................................................................i
HALAMAN PENGESAHAN ...........................................................................iii
commit to user
KATA PENGANTAR ........................................................................................
v

vi

perpustakaan.uns.ac.id

digilib.uns.ac.id

DAFTAR ISI .......................................................................................................vii
DAFTAR TABEL ...............................................................................................ix
DAFTAR GAMBAR ..........................................................................................x
RINGKASAN ......................................................................................................xii

SUMMARY .........................................................................................................xiii
I.

PENDAHULUAN........................................................................................1
A. Latar Belakang ........................................................................................1
B. Perumusan Masalah ................................................................................3
C. Tujuan dan Manfaat Penelitian ..............................................................4

II. TINJAUAN PUSTAKA..............................................................................5
A. Wereng Coklat Nilaparvata lugens .......................................................5
1. Biologi dan Morfologi Wereng Coklat Nilaparvata lugens……..5
2. Biotipe Wereng Coklat Nilaparvata lugens………......…………. 7
B. Studi Molekuler Biotipe Wereng Coklat Nilaparvata lugens..............8
III. METODE PENELITIAN...........................................................................13
A. Waktu dan Tempat Penelitian ................................................................13
B. Bahan dan Alat ........................................................................................13
C. Cara Kerja Penelitian ..............................................................................13
1. Perancangan Penelitian.....................................................................13
2. Pelaksanaan Penelitian .....................................................................13
IV. HASIL DAN PEMBAHASAN .................................................................. 16

A. Deskripsi Lokasi Pengambilan Sampel Wereng Coklat
(Nilaparvata lugensStall)………………………………….…………..17
B. Profil Pita Protein Wereng Coklat (Nilaparvata lugens)………….......21

C. Analisis Kemiripan Genetik Berdasarkan Pola Pita
Protein Total…………………………………………………………....24
V. KESIMPULAN DAN SARAN .................................................................. 30
A. Kesimpulan..............................................................................................30
B. Saran ........................................................................................................30
commit to user
DAFTAR PUSTAKA .........................................................................................
31

vii

perpustakaan.uns.ac.id

digilib.uns.ac.id

LAMPIRAN ........................................................................................................35

DAFTAR TABEL

Nomor

Judul dalam Teks

Halaman

1. Tabel Profil Pita Protein Total Wereng Coklat
(Nilaparvata lugens) dari Daerah Endemi dan Non endemi………. 23
commit to user

viii

perpustakaan.uns.ac.id

digilib.uns.ac.id

DAFTAR GAMBAR

Nomor

Judul dalam Teks

Halaman

1. Hasil profil pita protein total sampel wereng dari daerah
endemi dan non endemi dengan elektroforesis SDS-PAGE……….. 19
to user
2. Zimogram profil pita protein commit
total sampel
wereng dari daerah

ix

perpustakaan.uns.ac.id

digilib.uns.ac.id

endemi dan non endemi dengan elektroforesis SDS-PAGE……….. 21
3. Dendrogram-UPGMA berdasarkan pola pita protein total
hasil elektroforesis………………………………………………….. 27

Judul dalam Lampiran
1. Rumah Kasa di Belakang Laboratorium Hama Penyakit Tumbuhan,
Fakultas Pertanian, UNS……………………………………………….35
2. Kotak Sangkar Pemeliharaan Wereng Coklat………………………....35
3. Pemindahan Wereng Coklat Ke Kotak Sangkar Pemeliharaan
Wereng Coklat……………………………………………………….. 36
4. Bibit Padi Sebagai Pakan Wereng Coklat……………………………. 36
5.

Laboratorium Mikrobiologi II, Gedung Pusat Antar Universitas,
UGM…………………………………………………………………..37

6.

Sampel Wereng Coklat...........................................................................38

7.

Ekstraksi Wereng Coklat........................................................................38

8.

Proses Sentrifugasi .................................................................................38

9.

Supernatan Wereng coklat .....................................................................38

10. Proses Denaturasi Protein ......................................................................38
11. Pembuatan Gel ........................................................................................39
12. Peletakkan Sumuran Pada Gel ...............................................................39
13. Proses Running Protein ..........................................................................39
14. Pengangkatan gel ....................................................................................39
15. Pewarnaan Gel (Staining) ......................................................................39
16. Pencucian Gel .........................................................................................40
17. Lampu visible………………………………………………………....40
18. Pengeringan Gel dengan Plastik Kaca………………………………..40

commit to user

x

perpustakaan.uns.ac.id

digilib.uns.ac.id

RINGKASAN

KERAGAMAN WERENG COKLAT (Nilaparvata lugens Stall)
(HOMOPTERA:DELPHACIDAE) BERDASARKAN MARKA PROTEIN
TOTAL. Skripsi: Oktaviana Brian Kusuma (H0709087). Pembimbing: Supriyadi,
Retno Wijayanti, Subagiya. Program
Studi:
Agroteknologi, Fakultas Pertanian
commit
to user
Universitas Sebelas Maret (UNS) Surakarta.
xi

perpustakaan.uns.ac.id

digilib.uns.ac.id

Wereng coklat (Nilaparvata lugens Stall.) merupakan hama padi yang
merugikan hasil padi di Indonesia. Strategi pengendalian yang sering dilakukan
oleh petani yaitu penggunaan varietas unggul tahan wereng (VUTW). Namun
penggunaan VUTW ini menimbulkan dampak munculnya biotipe wereng yang
baru. Saat ini penentuan suatu biotipe wereng hanya didasarkan pada kemampuan
wereng coklat mematahkan ketahanan varietas padi. Untuk mengidentifikasi
terbentuknya suatu biotipe yang baru diperlukan studi molekuler karena studi
morfologi dan biologi sulit diketahui perbedaannya. Studi molekuler profil pita
protein total digunakan untuk mengetahui hubungan antara profil pita protein total
dengan biotipe.
Penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasi keragaman profil protein
total beberapa koloni wereng coklat. Penelitian ini dirancang sebagai bentuk
penelitian eksploratif. Sampel N.lugens diambil secara purposif yakni dari lokasi
serangan wereng coklat (endemi) seperti Klaten dan Yogyakarta serta serangan
wereng coklat non endemi seperti Sukoharjo, Karanganyar dan Pacitan. Wereng
coklat dipelihara kemudian dirunning dengan teknik elektroforesis untuk
mengetahui pita protein totalnya kemudian dianalisis menggunakan NTsys 2.0
dengan hasil dendogram. Hasil penelitian menunjukkan koloni wereng coklat dari
daerah endemi Klaten memiliki kemiripan pola protein total dengan koefisien 0,68
dengan wereng coklat koloni Sukoharjo yang merupakan daerah non endemi.
Sedangkan wereng coklat asal daerah non endemi Pacitan memiliki kemiripan
yang paling rendah dengan koefisien kemiripan 0,61 dengan koloni wereng coklat
asal Karanganyar dan Yogyakarta.

SUMMARY

VARIETY OF BROWNPLANTHOPPER Nilaparvata lugens Stall
(HOMOPTERA:DELPHACIDAE) BESED ON TOTAL PROTEIN
PATTERN. Thesis-S1: Oktaviana Brian Kusuma (H0709087). Advisers:
Supriyadi, Retno Wijayanti and Subagiya. Study Program: Agrotechnology,
to user
Faculty of Agriculture, Universitycommit
of Sebelas
Maret (UNS) Surakarta.

xii

perpustakaan.uns.ac.id

digilib.uns.ac.id

Brown planthopper (Nilaparvata lugens Stall.) is a key pest of rice in
Indonesia. Control strategy that often used by farmer is resistant varieties of
planthopper. Using resistant varieties of planthopper can induce a new brown
planthopper biotype. Currently, identification of a planthopper biotypes only
based on the ability to outbreak biotype of the brown planthopper resistance. To
identify the new biotype, molecular of technique are necessary because the
morphological and biological studies is difficult to identify the difference.
Molecular marker studies by using total protein pattern to determine the relation
of total protein profiles and biotype.
The aim of this research was to identify the total protein profiles of some
brown planthopper colonies that was different biotypes. This research was
designed as an exploratory study. Samples were collected from the brown
planthopper endemic areas of Klaten and Yogyakarta and non-endemic of
Sukoharjo, Karanganyar, and Pacitan. Brown planthopper was reared then run
electrophoresis technique to find out bands of the total protein pattern and was
analyzed by using NTsys 2.0 to get a dendrogram. The results showed that brown
planthopper from Klaten (endemic areas) indicated similarity with brown
planthopper from Sukoharjo which was non-endemic areas with a similarity
coefficient of 0,68. Brown plant hopper from Pacitan (non-endemic areas) showed
lowest similarity with a brown planthopper Karanganyar and Yogyakarta.

commit to user

xiii