STUDI VARIASI MORFOLOGI DAN POLA PITA PROTEIN WERENG HIJAU ( Nephotettix virescens ) DARI LIMA DAERAH SENTRA PENGHASIL PADI DI INDONESIA.

perpustakaan.uns.ac.id

digilib.uns.ac.id

STUDI VARIASI MORFOLOGI DAN POLA PITA PROTEIN
WERENG HIJAU ( Nephotettix virescens ) DARI LIMA
DAERAH SENTRA PENGHASIL PADI DI INDONESIA

TESIS

Disusun untuk Memenuhi Persyaratan Mencapai Derajat Magister
Program Studi Biosain

Oleh
SUWARNO
NIM: S 900908014

PROGRAM PASCA SARJANA
UNIVERSITAS SEBELAS MARET
SURAKARTA
commit

to user
2013
i

perpustakaan.uns.ac.id

digilib.uns.ac.id

commit to user
ii

perpustakaan.uns.ac.id

digilib.uns.ac.id

commit to user
iii

perpustakaan.uns.ac.id


digilib.uns.ac.id

commit to user
iv

perpustakaan.uns.ac.id

digilib.uns.ac.id

Suwarno. 2013. S 900908014. Studi Variasi Morfologi Dan Pola Pita Protein
Wereng Hijau ( Nephotettix virescens ) Dari Lima Daerah Sentra Penghasil
Padi Di Indonesia. TESIS. Pembimbing I : Prof. Drs. Suranto, M.Sc, Ph.D,
Pembimbing II: Prof. Dr. rer. Nat. Sajidan, M.Si. Program Studi Biosain, Program
Pascasarjana, Universitas Sebelas Maret Surakarta
ABSTRAK
Wereng hijau ( Nephotettix virescens ) merupakan serangga vektor penyakit
tungro pada tanaman padi. Spesies tersebut saat ini mendominasi populasi spesies
wereng hijau di hampir seluruh pertanaman padi yang ada di Indonesia. Penelitian
ini bertujuan untuk:1) Untuk mengetahui keragaman morfologi N.virescens dari
beberapa daerah di Indonesia; dan 2) Untuk menguji adanya variasi pola pita

protein N.virescens dari beberapa daerah di Indonesia.
Penelitian dilaksanakan di Laboratorium Pusat UNS dan Laboratorium
Mikrobiologi PAU UGM. Pendekatan yang digunakan dalam pengamatan
morfologi yaitu dengan mengukur panjang dan lebar tubuh dan elektroforesis
untuk profil pola protein. Identifikasi profil pola pita protein dengan SDS-PAGE.
Metode ekstraksi sampel menggunakan buffer mercapto ethanol, sedangkan
ekstraksi sampel menggunakan buffer PBS IX. Pengecatan pita protein
menggunakan commasie blue. Analisis data dengan cara deskriptif berdasarkan
nilai migrasi ( Rf ). Identifikasi karakter profil pita protein dimunculkan dengan
zimogram.
Hasil Penelitian menunjukkan adanya variasi morfologi dari N.virescens
yang berasal dari 5 daerah yang berbeda di Indonesia. Dari hasil pengamatan
morfologi terdapat perbedaan yang signifikan, terdapat perbedaan panjang dan
lebar tubuh, spot pada sayap dan warna pada bagian dorsal tubuh Dari hasil
pengamatan profil pola pita protein hasil elektroforesis menunjukkan adanya
keunikan profil pola pita protein yang muncul pada BM 30, 80, 120 dan 150 kDa.
Berdasar hasil dendogram diperoleh 3 kelompok, yaitu; kelompok pertama spesies
dari Jawa Barat, Jawa Tengah dan Jawa Timur ; kelompok kedua spesies dari Bali
dan kelompok ketiga spesies dari Sulawesi Selatan
Kata kunci : Tungro,wereng hijau, Nephotettix virescens, profil protein


commit to user
v

perpustakaan.uns.ac.id

digilib.uns.ac.id

Suwarno. 2013. S 900908014. Study of Morphological Variation and
Protein Band Pattern of Green Leafhopper ( Nephotettix virescens ) From Five
Areas of Rice Production In Indonesia. Thesis, First Counselor: Prof. Drs.
Suranto, M.Sc, Ph.D, Second Counselor: Prof. Dr. rer.nat. Sajidan, M.Si. Biosain
Study Program, Postgraduate, Surakarta Sebelas Maret University.
ABSTRACT
Nephotettix virescens ( Green Leafhopper ) was an insect vector of tungro
disease in rice plants. The species now dominate the populations of green
leafhopper species in almost all rice cultivation in Indonesia. This research aims
to:1) To find N.virescens morphological diversity of some regions in Indonesia;
and 2) o examine the variation in protein band pattern N.virescens of several
regions in Indonesia.


The experiment was conducted at UNS laboratory Center and PAU UGM
Microbiology Laboratory. The approach used in the morphological observation by
measuring the length and width of the body, wings spot and color of dorsal-body
and electrophoresis for protein pattern profiles. Identification of the protein
banding pattern profiles by SDS-PAGE. Sample extraction method using a buffer
mercapto ethanol, while the sample extraction using PBS buffer IX. Staining of
protein bands using commasie blue. Descriptive data analysis was based on the
value of migration (Rf). Identification of protein bands as the profile character
was presented in form zimogram.
Research results indicated a variation in the morphology of N.virescens
derived from 5 different regions in Indonesia. There were variations of length and
width of body, wings spot and color of dorsal-body. From the observation of
protein banding pattern showed a unique banding pattern of protein profiles that
appear on the 30, 80, 120 and 150 kDa. The dendogram classified into 3 groups;
the first group of Java ( West Java, Central Java and East Java ), the second was
Bali and last group was South Sulawesi )
Keywords : Tungro, green leafhoppers, Nephotettix virescens, protein
profiles


commit to user
vi

perpustakaan.uns.ac.id

digilib.uns.ac.id

HALAMAN PERSEMBAHAN

Karya ilmiah ini kupersembahkan untuk:
Bapak dan Ibu tercinta
Istri dan anakku tersayang
Segenap keluarga dan sahabat

MAN JADDA WAJADA

commit to user
vii

perpustakaan.uns.ac.id


digilib.uns.ac.id

KATA PENGANTAR
Dengan memanjatkan puji syukur kehadirat Allah SWT atas limpahan
rahmat dan hidayah-Nya penulis dapat menyelesaikan tulisan thesis berjudul :
STUDI VARIASI MORFOLOGI DAN POLA PITA PROTEIN WERENG
HIJAU ( Nephotettix virescens ) DARI LIMA DAERAH PENGHASIL PADI
DI INDONESIA . Dalam tulisan ini disajikan pokok-pokok tulisan meliputi
keragaman morfologi serta karakter molekuler profil pola pita protein Nephotettix
virescens yang berasal dari beberapa daerah penghasil padi di Indonesia.

Nilai penting dari tulisan ini adalah mengetahui keragaman morfologi dan
molekuler Nephotettix virescens sebagai vektor penular tungro pada tanaman padi.
Dari hasil penelitian ditemukan bahwa ada keragaman morfologi (yang meliputi
lebar dan panjang tubuh) dan profil pola pita protein. Perlu kiranya diadakan
penelitian lebih lanjut mengenai karakter-karakter yang lain termasuk karakter
molukel DNA untuk mengetahui variasi molekuler lebih lanjut.
Disadari bahwa dengan kekurangan dan keterbatasan yang dimiliki penulis,
walaupun telah dikerahkan segenap kemampuan untuk lebih teliti, tetapi masih

dirasakan banyak kekurangan, oleh karena itu penulis mengharapkan saran dan
kritik yang membangun agar tulisan ini bermanfaat bagi yang membutuhkan.
Surakarta, Februari 2013
Penulis

commit to user
viii

perpustakaan.uns.ac.id

digilib.uns.ac.id

UCAPAN TERIMAKASIH
Puji syukur atas segala rahmad dan hidayah-Nya sehingga penulis dapat
menyelesaikan thesis dengan judul ‘STUDI VARIASI MORFOLOGI DAN POLA
PITA PROTEIN WERENG HIJAU ( Nephotettix virescens ) DARI LIMA
DAERAH PENGHASIL PADI DI INDONESIA’. Pada kesempatan ini, penulis
tidak lupa mengucapkan terima kasih kepada:
1. Dirjen Dikti atas pemberian beasiswanya ( BPPS ) untuk mengikuti Program
Pendidikan Pascasarjana di UNS

2. Rektor UNS yang telah mengijinkan menggunakan semua fasilitas selama
penulis mengikuti pendidikan di PPs UNS
3. Direktur PPs UNS yang telah memberikan dukunganmoral dan fasilitas selama
mengikuti pendidikan di PPs UNS.
4. Bapak Prof. Drs. Suranto, M.Sc, Ph.D sebagai Dosen Pembimbing I yang telah
memberikan semua fasilitas, dorongan moril dan memberikan bimbingan
dengan penuh kesabaran selama melakukan pendidikan dan penelitian di Prodi
Biosain PPs UNS
5. Bapak Prof.Dr.rer.nat Sajidan, M.Si selaku dosen pembimbing II yang
senantiasa memberikan semua fasilitas,doronga moril dan memberikan
bimbingan dengan penuh kesabaran selama penelitian di Prodi Biosain PPs
UNS
6. Ketua Prodi Biosain yang telah banyak memberikan dorongan moril demi
terselesaikannya menempuh pendidikan di PPs UNS
7. Drs. Susilo, Laboran di Laboratorium Pusat MIPA sub Lab Biologi UNS
8. Ibu Arsiyah yang banyak membantu penulis dalam melakukan penelitian dan
memahami hasil penelitian profil pola pita protein di PAU Bioteknologi UGM
9. Bapak,ibu,istri dan segenap keluargaku, dengan doa dan dorongan
semangatnya sebagai motivator yang sangat besar bagi penulis
10.

Teman-teman Prodi Biosains yang selalu mengingatkan dan memberi
dukungan dengan penuh semangat dan tak pernah lelah membentu penulis.
11.
Saudara M.Rosyid serta seluruh staff administrasi PPs UNS yang telah
membantu memperlancar sarana administrasi selama di PPs UNS.
Penulis menyadari bahwa semua bantuan dan kebaikan yang telah diberikan
kepada penulis, kami tidak dapat membalasnya, semoga diberikan balasan oleh
Allah SWT. Penulis hanya dapat mengucapkan terima kasih dan semoga apa yang
telah diberikan penulis menjadi amal ibadah yang diridhoi Allah SWT.

commit to user
ix

Surakarta, Februari 2013
Penulis

perpustakaan.uns.ac.id

digilib.uns.ac.id


DAFTAR ISI

HALAMAN JUDUL........................................................................................ i
HALAMAN PENGESAHAN PEMBIMBING ............................................... ii
HALAMAN PENGESAHAN PENGUJI ........................................................ iii
PERNYATAAN ORISINALITAS TESIS ...................................................... iv
ABSTRAK ...................................................................................................... v
ABSTRACT ..................................................................................................... vi
HALAMAN PERSEMBAHAN ..................................................................... vii
KATA PENGANTAR .................................................................................... viii
UCAPAN TERIMAKASIH ............................................................................ ix
DAFTAR ISI ................................................................................................... x
DAFTAR TABEL ........................................................................................... xii
DAFTAR GAMBAR ...................................................................................... xiii
DAFTAR LAMPIRAN ................................................................................... xiv
BAB I PENDAHULUAN ............................................................................... 1
A. Latar Belakang ................................................................................ 3
B. Rumusan Masalah .......................................................................... 3
C. Tujuan Penelitian ............................................................................ 3
D. Manfaat Penelitian .......................................................................... 4
BAB II TINJAUAN PUSTAKA DAN KERANGKA PEMIKIRAN ............ 5
A. TINJAUAN PUSTAKA ................................................................. 5
1. Nephotettix virescens ............................................................... 5
2. Karakterisasi Pola Pita Protein ................................................ 11
3. Hubungan Tungro Dengan Vektor .......................................... 13
B. KERANGKA BERPIKIR .............................................................. 16
C. HIPOTHESIS ................................................................................. 16
BAB III METODOLOGI PENELITIAN ........................................................ 17
A. Tempat dan Waktu Penelitian ........................................................ 17
B. Jenis Penelitian ............................................................................... 17
commit to user
C. Populasi dan Sampel ....................................................................... 17
x

perpustakaan.uns.ac.id

digilib.uns.ac.id

D. Teknik Pengumpulan Data ............................................................. 18
E. Alata dan Bahan .............................................................................. 18
F. Prosedur Penelitian ......................................................................... 20
G. Analisis Data .................................................................................. 24
BAB IV HASIL PENELITIAN DAN PEMBAHASAN ................................ 26
A. Identifikasi Berdasarkan Sifat Morfologi ....................................... 26
B. Analisis Profil Pola Pita Protein ..................................................... 32
BAB V KESIMPULAN DAN SARAN .......................................................... 39
A. Kesimpulan ..................................................................................... 39
B. Saran ............................................................................................... 39
DAFTAR PUSTAKA ..................................................................................... 40
LAMPIRAN

commit to user
xi

perpustakaan.uns.ac.id

digilib.uns.ac.id

DAFTAR TABEL

Tabel 1. Jenis wereng dan daya tular terhadap tungro ........................................... 9
Tabel 2. Hasil uji lebar dan pajang tubuh Nephotettix virescens ..........................27
Tabel 3. Kadar protein sampel N.virescens dari kelima daerah ............................34

commit to user
xii

perpustakaan.uns.ac.id

digilib.uns.ac.id

DAFTAR GAMBAR

Gambar 1. Serangga penular penyakit tungro N. virescens,
N.nigropictus, R. Dorsalis ............................................................. 6

Gambar 2. Serangga penular penyakit tungro
N. virescens ( dewasa dan nimfa ) ................................................. 7

Gambar 3. Siklus hidup N.virescens ................................................................ 8
Gambar 4. Tanaman padi yang terkena gejala penyakit tungro ....................... 15
Gambar 6. Cara pengukuran panjang dan lebar tubuh N. Virescens ................ 24
Gambar 6. Diagram batang rerata panjang dan lebar tubuh N.virescens ......... 27
Gambar 8. Dendogram interaksi lebar dan panjang tubuh N.virescens ........... 29
Gambar 9. Bagian-bagian tubuh spesies N. Virescens .................................... 30
Gambar 10. Perbandingan spesies N.virescens jantan dan betina .................... 31
Gambar 11. Gel pola pita protein hasil elektroforesi ....................................... 35
Gambar 12. Dendogram hasil analisis pola pita protein N.virescens ............... 36

commit to user
xiii

perpustakaan.uns.ac.id

digilib.uns.ac.id

DAFTAR LAMPIRAN

Lampiran I. Tabel rata-rata lebar tubuh N. virescens
Lampiran II. Penghitungan konsentrasi protein sampel
Lampiran III. Dokumentasi

commit to user
xiv