anatomi dan pola pita protein biji lima varian waluh (Cucurbita moschata Duch.) dari provinsi Nanggroe Aceh Darussalam.
HALAMAN JUDUL
ANATOMI DAN POLA PITA PROTEIN BIJI LIMA VARIAN WALUH
(Cucurbita moschata Duch.) DARI PROVINSI NANGGROE ACEH
DARUSSALAM
Skripsi
Untuk memenuhi sebagian persyaratan
guna memperoleh gelar Sarjana Sains
Oleh :
Kuswatun Nurkasanah
M0411033
PROGRAM STUDI BIOLOGI
FAKULTAS MATEMATIKA DAN ILMU PENGETAHUAN ALAM
UNIVERSITAS SEBELAS MARET
SURAKARTA
2017
i
ii
PERNYATAAN
Dengan ini saya menyatakan bahwa skripsi ini adalah hasil penelitian saya sendiri
dan tidak terdapat karya yang pernah diajukan untuk memperoleh gelar
kesarjanaan di suatu Perguruan Tinggi serta tidak terdapat karya atau pendapat
yang pernah ditulis atau diterbitkan oleh orang lain, kecuali yang secara tertulis
diacu dalam naskah ini dan disebutkan dalam daftar pustaka.
Apabila di kemudian hari dapat ditemukan adanya unsur penjiplakan maka gelar
kesarjanaan yang telah diperoleh dapat ditinjau kembali dan/atau dicabut.
Surakarta, 01 Desember 2016
Kuswatun Nurkasanah
NIM. M0411033
iii
ANATOMI DAN POLA PITA PROTEIN BIJI LIMA VARIAN WALUH
(Cucurbita moschata Duch.) DARI PROVINSI NANGGROE ACEH
DARUSSALAM
ABSTRAK
KUSWATUN NURKASANAH
Program Studi Biologi, Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam,
Universitas Sebelas Maret, Surakarta
Waluh (Cucurbita moschata Duch.) merupakan tanaman menjalar yang
memiliki banyak kandungan gizi. Selain itu tanaman semusim ini juga berpotensi
sebagai tanaman bahan pangan alternatif. Potensi waluh sebagai bahan pangan
alternatif maka perlu adanya upaya pemuliaan waluh untuk memperoleh tanaman
unggul. Dalam program pemuliaan tanaman memerlukan studi tentang sifat
unggul suatu tanaman, melalui karakterisasi terhadap karakter morfologi, anatomi
dan molekuler. Tujuan dari penelitian ini adalah untuk mengetahui tentang
karakter anatomi dan pola pita protein biji serta hubungan kekerabatan lima
varian waluh dari Provinsi Nanggroe Aceh Darussalam.
Pengamatan anatomi dilakukan dengan metode paraffin dan pewarnaan
safranin. Adapun untuk analisis pola pita protein dilakukan dengan metode SDSPAGE yang memanfaatkan Commasie blue untuk pengecatan. Hasil penelitian
anatomi diuraikan secara deskriptif dan disajikan dalam bentuk tabel dan gambar.
Analisis pola pita protein dilakukan dengan menggunakan analisis kuantitatif dan
kualitatif yaitu berdasarkan muncul tidaknya pola pita protein pada gel dan
metode kualitatif berdasarkan kualitas pita yang terbentuk. Pola pita protein yang
terbentuk disajikan dalam bentuk elektroforegram. Untuk hubungan kekerabatan
disajikan dalam bentuk dendogram menggunakan software UPGMA-NTSYS.
Hasil dari pengamatan susunan anatomi pada biji lima varian waluh dari
Nanggroe Aceh Darussalam tidak menunjukkan perbedaan secara nyata walaupun
variasi dapat diamati. Adapun untuk hasil analisis pola pita protein menunjukkan
bahwa terdapat keragaman yang ditandai dengan perbedaan jumlah pita protein
yang muncul yaitu 6 pita pada waluh bulat, 4 pita pada waluh bulat ceper, 3 pita
pada waluh pir, 8 pita pada waluh botol dan 11 pita pada waluh silinder. Selain
itu, nilai Rf dan ketebalan pita diantara sampel biji waluh juga bervariasi.
Berdasarkan dendogram, waluh bulat, bulat ceper dan pir berada dalam satu
kluster.
Kata Kunci : Anatomi, Nanggroe Aceh Darussalam, Pola Pita Protein, Waluh
(Cucurbita moschata Duch.), SDS-page
.
iv
ANATOMY AND PROTEIN BANDING PATTERN SEED OF FIVE
VARIAN PUMPKIN (Cucurbita moschata Duch.) FROM PROVINCE OF
NANGGROE ACEH DARUSSALAM
ABSTRACT
KUSWATUN NURKASANAH
Departement of Biology, Faculty of Mathemathic and Natural Sciences
Sebelas Maret University, Surakarta
Pumpkin (Cucurbita moschata Duch.) is a creeping plant that has a lot of
nutritional value. Besides seasonal crops also have potential as an alternative food
crops. The magnitude of the potential of pumpkin as an alternative food
ingredients hence the need for pumpkin breeding efforts to obtain improved crops.
In plant breeding program requires the study of superior properties of a plant,
through the characterization of morphological characters, anatomy and molecular.
The aims of this research were to know about the character of anatomy, protein
banding pattern seed and phylogenetic relationship five varian of pumpkin from
province of Nanggroe Aceh Darussalam.
Anatomical observation was conducted using paraffin method and safranin
staining. analysis of protein banding pattern was conducted using SDS-PAGE
utilizing Coomassie blue for staining. The result of the research of anatomy is
analyzed descriptively and presented in the form of tabels and figures. The
analysis of protein band pattern is done using quantitative and qualitative analysis
that is based on the appearancenor not the gel band pattern and qualitative method
based on the quality of the band formed. The band pattern formed is presented in
the form of electroforegram. The phylogenetic relationship presented in the form
dendogram using UPGMA-NTSYS software.
The results of the observations on the anatomical arrangement seeds of
five varian pumpkin from Nanggroe Aceh Darussalam showed no significant
difference, although variations can be observed. Analysis of protein banding
pattern showed different patterns which was indicated by quantity of band, they
are 6 bands on seed of globular pumpkin, 4 band on seed of roundflat pumpkin
and pir pumpkin, 5 on seed of bottle pumpkin and 11 on seed of cylinder
pumpkin. In addition, Rf value and the thickness of the band between pumpkin
seed sample also shows the variation. Based on dendogram round flat and peer are
in one cluster.
Keyword: Anatomy, Nanggroe Aceh Darussalam, protein banding pattern,
Pumpkin (Cucurbita moschata Duch.), SDS-page
v
MOTTO
“Sesungguhnya bersama kesulitan ada kemudahan”
vi
PERSEMBAHAN
Skripsi ini saya persembahkan untuk...
Bapak Marimo dan Ibu Karti tercinta yang telah
memberikan kesempatan pada saya untuk merasakan
kuliah dan selalu memberikan kasih sayang, dukungan,
nasehat serta doanya......
Kedua adik saya, Ririn Alma’unah dan Arkan Alfaruq
Miftahul Falah yang selalu mengganggu tapi selalu ada
menemani saya.......
Prof. Drs. Suranto, M.Sc., Ph.D. dan Ari Pitoyo, S.Si.,
M.Sc. yang telah membimbing dan mendukung penelitian
yang saya kerjakan......
Teman-teman biosukasuka, yang telah menemani
perjalanan dan bersama-sama berjuang bersama di prodi
Biologi UNS......
Terima kasih......
vii
KATA PENGANTAR
Alhamdulillah, penulis panjatkan ke hadirat Allah SWT. Kini penulis telah
menyelesaikan penelitian dan penyusunan skripsi yang berjudul “anatomi dan
pola pita protein biji Cucurbita moschata Duch. dari provinsi Nanggroe Aceh
Darussalam”. Penyusunan skripsi ini di maksudkan untuk memenuhi sebagian
persyaratan guna memperoleh gelar Sarjana Sains pada program studi Biologi
Fakultas Matematia dan Ilmu Pengetauan Alam Universitas Sebelas Maret
Surakarta.
Dalam melakukan penelitian maupun penyusunan skripsi ini penulis telah
mendapatkan banyak masukan, bantuan dan bimbingan dari berbagai pihak yang
sangat berguna dan bermanfaat baik secara langsung maupun tidak langsung. Oleh
karena itu pada kesempatan yang baik ini dengan berbesar hati penulis ingin
mengucapkan terima kasih yang setulus-tulusnya dan sebesar-besarnya kepada :
Prof. Ir. Ari Handono Ramelan, M.Sc.(Hons)., Ph.D., selaku Dekan
Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam, Universitas Sebelas Maret
Surakarta yang telah memberikan ijin penelitian untuk keperluan skripsi.
Dr. Ratna Setyaningsih, M.Si., selaku Kepala Program Studi Biologi,
Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam, Universitas Sebelas Maret
Surakarta yang telah memberikan ijin dan saran-saran dalam penelitian.
Prof. Drs. Suranto, M.Sc., Ph.D., selaku dosen pembimbing I yang telah
memberikan biaya penelitian, bimbingan dan petunjuknya selama penelitian
sampai selesainya penyusunan skripsi.
viii
Ari Pitoyo, S.Si., M.Sc., selaku dosen pembimbing II yang telah
memberikan bimbingan dan petunjuknya selama penelitian sampai selesainya
penyusunan skripsi ini.
Suratman, S.Si., M.Si., dan Dr. Artini Pangastuti, M.Si. selaku dosen
penguji yang telah memberikan saran, kritik dan masukan selama penelitian
sampai selesainya penyusunan skripsi ini.
Dosen di Program Studi Biologi yang telah dengan sabar memberikan
pengarahan yang tiada henti-hentinya dan dorongan baik spiritual maupun materil
sehingga penulis dapat menyelesaikan skripsi ini.
Kepala dan staf Laboratorium Pusat, Sub Laboratorium Biologi,
Universitas Sebelas Maret Surakarta yang telah mengijinkan dan membantu
penulis untuk melakukan penelitian di laboratorium.
Semua pihak yang tidak dapat disebutkan satu per satu yang telah
memberikan bantuannya.
Menyadari sepenuhnya atas keterbatasan dan kemampuan dalam menulis
skripsi ini, untuk itu teguran, pelurusan, saran, maupun kritik yang membangun
untuk kesempurnaan skripsi ini akan saya terima dengan senang hati. Dengan
mengharap ridho Allah azza wa jalla, saya berharap skripsi ini dapat bermanfaat
untuk menambah hasanah ilmu kita dan penguat iman kita masing-masing.
Surakarta, 1 Desember 2016
Penulis
ix
DAFTAR ISI
halaman
HALAMAN JUDUL
i
HALAMAN PENGESAHAN
ii
HALAMAN PERNYATAAN ..........................................................................
iii
ABSTRAK
iv
ABSTRACT ......................................................................................................
v
HALAMAN MOTTO .......................................................................................
vi
HALAMAN PERSEMBAHAN ........................................................................ vii
KATA PENGANTAR ....................................................................................... viii
DAFTAR ISI
x
DAFTAR TABEL ............................................................................................. xii
DAFTAR GAMBAR......................................................................................... xiii
DAFTAR LAMPIRAN ..................................................................................... xiv
DAFTAR SINGKATAN ................................................................................... . xv
BAB I
BAB II
PENDAHULUAN
1
A. Latar Belakang Masalah
1
B. Perumusan Masalah
4
C. Tujuan Penelitian
5
D. Manfaat Penelitian
5
LANDASAN TEORI
6
A. Tinjauan Pustaka
6
x
1. Waluh (Cucurbita moschata Duch.)
6
2. Karakter Anatomi
12
3. Analisa Pola Pita Protein
14
4. Hubungan Kekerabatan
16
B. Kerangka Pemikiran
18
BAB III METODE PENELITIAN
20
A. Waktu dan Tempat Penelitian
20
B. Alat dan Bahan
20
C. Cara Kerja Penelitian
21
D. Analisis Data
27
BAB IV HASIL DAN PEMBAHASAN.........................................................
30
A. Morfologi Biiji Waluh ...............................................................
30
B. Anatomi Biji Waluh ................................................................... 31
BAB V
C. Pola Pita Protein ........................................................................
34
D. Hubungan Kekerabatan .............................................................
37
PENUTUP ........................................................................................
43
A. Kesimpulan ................................................................................
43
B. Saran ..........................................................................................
43
DAFTAR PUSTAKA
44
xi
DAFTAR TABEL
Halaman
Tabel 1. Ketebalan kulit biji Cucurbita moschata Duch. dari Provinsi
Nanggroe Aceh Darussalam ...................................................................
33
Tabel 2. Kualitas protein berdasarkan tebal tipis dan jumlah kemunculan
pita biji Cucurbita moschata Duch. dari Provinsi Nanggroe
Aceh Darussalam ............................................................ .......................
xii
38
DAFTAR GAMBAR
Halaman
Gambar 1. Morfologi biji dan buah waluh (Cucurbita moschata Duch.)
dari Provinsi Nanggroe Aceh Darussalam ........................................
10
Gambar 2. Bagan kerangka pemikiran penelitian .................................................
19
Gambar 3. Peta lokasi pengambilan sampel .........................................................
21
Gambar 4. Morfologi biji waluh (Cucurbita moschata Duch.) dari
Provinsi Nanggroe Aceh Darussalam ...............................................
29
Gambar 5. Penampang melintang biji waluh (Cucurbita moschata Duch.)
dari Provinsi Nanggroe Aceh Darussalam perbesaran 40x................
31
Gambar 6. Penampang melintang biji waluh (Cucurbita moschata Duch.)
dari Provinsi Nanggroe Aceh Darussalam perbesaran 40x................
32
Gambar 7. Pita protein biji Cucurbita moschata Duch. dari Provinsi
Nanggroe Aceh Darussalam ....................... .......................................
35
Gambar 8. Dendogram hubungan kekerabatan Cucurbita moschata Duch.
dari Provinsi Nanggroe Aceh Darussalam ........... ............................. . 40
xiii
DAFTAR LAMPIRAN
Halaman
Lampiran 1. Pembobotan pola pita protein biji lima varian waluh dari
Provinsi
Nanggroe
Aceh
Darussalam
berdasarkan
pengamatan karakter anatomi ............................ .................
45
Lampiran 2. Pembobotan pola pita protein biji lima varian waluh dari
Provinsi Nanggroe Aceh Darussalam berdasarkan muncul
tidaknya pita potein ............................ .................................
46
Lampiran 3. Nilai Indeks Similaritas biji lima varian waluh dari
Provinsi Nanggroe Aceh Darussalam ..................... ............
47
Lampiran 4. Daftar riwayat hidup penulis ................................................
48
xiv
DAFTAR SINGKATAN
Singkatan
Kepanjangan
APS
Ammonium Persulphate
BM
Berat Molekul
DTT
Ditriotitol
FAA
Formalin acetat acid alcohol
HCl
Hydroximethyl Chloride
HPLC
High Performance Liquid Chromatography
Ism
Indeks Similaritas
NAD
Nanggroe Aceh Darussalam
SDS-PAGE
Sodium Dedocyl Sulfate Polyacrilamide Gel Electrophoresis
SEM
Scanning Electron Microscope
TEM
Transmission Electron Microscope
TEMED
N-N-N-N Tetra Methyl Ethylene Diamine
UPGMA-NTSYS
Unweighted Pair Group Method Arithmathic Numerical
Taxonomy and Multivariate Analysis System
UV
Ultraviolet
xv
ANATOMI DAN POLA PITA PROTEIN BIJI LIMA VARIAN WALUH
(Cucurbita moschata Duch.) DARI PROVINSI NANGGROE ACEH
DARUSSALAM
Skripsi
Untuk memenuhi sebagian persyaratan
guna memperoleh gelar Sarjana Sains
Oleh :
Kuswatun Nurkasanah
M0411033
PROGRAM STUDI BIOLOGI
FAKULTAS MATEMATIKA DAN ILMU PENGETAHUAN ALAM
UNIVERSITAS SEBELAS MARET
SURAKARTA
2017
i
ii
PERNYATAAN
Dengan ini saya menyatakan bahwa skripsi ini adalah hasil penelitian saya sendiri
dan tidak terdapat karya yang pernah diajukan untuk memperoleh gelar
kesarjanaan di suatu Perguruan Tinggi serta tidak terdapat karya atau pendapat
yang pernah ditulis atau diterbitkan oleh orang lain, kecuali yang secara tertulis
diacu dalam naskah ini dan disebutkan dalam daftar pustaka.
Apabila di kemudian hari dapat ditemukan adanya unsur penjiplakan maka gelar
kesarjanaan yang telah diperoleh dapat ditinjau kembali dan/atau dicabut.
Surakarta, 01 Desember 2016
Kuswatun Nurkasanah
NIM. M0411033
iii
ANATOMI DAN POLA PITA PROTEIN BIJI LIMA VARIAN WALUH
(Cucurbita moschata Duch.) DARI PROVINSI NANGGROE ACEH
DARUSSALAM
ABSTRAK
KUSWATUN NURKASANAH
Program Studi Biologi, Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam,
Universitas Sebelas Maret, Surakarta
Waluh (Cucurbita moschata Duch.) merupakan tanaman menjalar yang
memiliki banyak kandungan gizi. Selain itu tanaman semusim ini juga berpotensi
sebagai tanaman bahan pangan alternatif. Potensi waluh sebagai bahan pangan
alternatif maka perlu adanya upaya pemuliaan waluh untuk memperoleh tanaman
unggul. Dalam program pemuliaan tanaman memerlukan studi tentang sifat
unggul suatu tanaman, melalui karakterisasi terhadap karakter morfologi, anatomi
dan molekuler. Tujuan dari penelitian ini adalah untuk mengetahui tentang
karakter anatomi dan pola pita protein biji serta hubungan kekerabatan lima
varian waluh dari Provinsi Nanggroe Aceh Darussalam.
Pengamatan anatomi dilakukan dengan metode paraffin dan pewarnaan
safranin. Adapun untuk analisis pola pita protein dilakukan dengan metode SDSPAGE yang memanfaatkan Commasie blue untuk pengecatan. Hasil penelitian
anatomi diuraikan secara deskriptif dan disajikan dalam bentuk tabel dan gambar.
Analisis pola pita protein dilakukan dengan menggunakan analisis kuantitatif dan
kualitatif yaitu berdasarkan muncul tidaknya pola pita protein pada gel dan
metode kualitatif berdasarkan kualitas pita yang terbentuk. Pola pita protein yang
terbentuk disajikan dalam bentuk elektroforegram. Untuk hubungan kekerabatan
disajikan dalam bentuk dendogram menggunakan software UPGMA-NTSYS.
Hasil dari pengamatan susunan anatomi pada biji lima varian waluh dari
Nanggroe Aceh Darussalam tidak menunjukkan perbedaan secara nyata walaupun
variasi dapat diamati. Adapun untuk hasil analisis pola pita protein menunjukkan
bahwa terdapat keragaman yang ditandai dengan perbedaan jumlah pita protein
yang muncul yaitu 6 pita pada waluh bulat, 4 pita pada waluh bulat ceper, 3 pita
pada waluh pir, 8 pita pada waluh botol dan 11 pita pada waluh silinder. Selain
itu, nilai Rf dan ketebalan pita diantara sampel biji waluh juga bervariasi.
Berdasarkan dendogram, waluh bulat, bulat ceper dan pir berada dalam satu
kluster.
Kata Kunci : Anatomi, Nanggroe Aceh Darussalam, Pola Pita Protein, Waluh
(Cucurbita moschata Duch.), SDS-page
.
iv
ANATOMY AND PROTEIN BANDING PATTERN SEED OF FIVE
VARIAN PUMPKIN (Cucurbita moschata Duch.) FROM PROVINCE OF
NANGGROE ACEH DARUSSALAM
ABSTRACT
KUSWATUN NURKASANAH
Departement of Biology, Faculty of Mathemathic and Natural Sciences
Sebelas Maret University, Surakarta
Pumpkin (Cucurbita moschata Duch.) is a creeping plant that has a lot of
nutritional value. Besides seasonal crops also have potential as an alternative food
crops. The magnitude of the potential of pumpkin as an alternative food
ingredients hence the need for pumpkin breeding efforts to obtain improved crops.
In plant breeding program requires the study of superior properties of a plant,
through the characterization of morphological characters, anatomy and molecular.
The aims of this research were to know about the character of anatomy, protein
banding pattern seed and phylogenetic relationship five varian of pumpkin from
province of Nanggroe Aceh Darussalam.
Anatomical observation was conducted using paraffin method and safranin
staining. analysis of protein banding pattern was conducted using SDS-PAGE
utilizing Coomassie blue for staining. The result of the research of anatomy is
analyzed descriptively and presented in the form of tabels and figures. The
analysis of protein band pattern is done using quantitative and qualitative analysis
that is based on the appearancenor not the gel band pattern and qualitative method
based on the quality of the band formed. The band pattern formed is presented in
the form of electroforegram. The phylogenetic relationship presented in the form
dendogram using UPGMA-NTSYS software.
The results of the observations on the anatomical arrangement seeds of
five varian pumpkin from Nanggroe Aceh Darussalam showed no significant
difference, although variations can be observed. Analysis of protein banding
pattern showed different patterns which was indicated by quantity of band, they
are 6 bands on seed of globular pumpkin, 4 band on seed of roundflat pumpkin
and pir pumpkin, 5 on seed of bottle pumpkin and 11 on seed of cylinder
pumpkin. In addition, Rf value and the thickness of the band between pumpkin
seed sample also shows the variation. Based on dendogram round flat and peer are
in one cluster.
Keyword: Anatomy, Nanggroe Aceh Darussalam, protein banding pattern,
Pumpkin (Cucurbita moschata Duch.), SDS-page
v
MOTTO
“Sesungguhnya bersama kesulitan ada kemudahan”
vi
PERSEMBAHAN
Skripsi ini saya persembahkan untuk...
Bapak Marimo dan Ibu Karti tercinta yang telah
memberikan kesempatan pada saya untuk merasakan
kuliah dan selalu memberikan kasih sayang, dukungan,
nasehat serta doanya......
Kedua adik saya, Ririn Alma’unah dan Arkan Alfaruq
Miftahul Falah yang selalu mengganggu tapi selalu ada
menemani saya.......
Prof. Drs. Suranto, M.Sc., Ph.D. dan Ari Pitoyo, S.Si.,
M.Sc. yang telah membimbing dan mendukung penelitian
yang saya kerjakan......
Teman-teman biosukasuka, yang telah menemani
perjalanan dan bersama-sama berjuang bersama di prodi
Biologi UNS......
Terima kasih......
vii
KATA PENGANTAR
Alhamdulillah, penulis panjatkan ke hadirat Allah SWT. Kini penulis telah
menyelesaikan penelitian dan penyusunan skripsi yang berjudul “anatomi dan
pola pita protein biji Cucurbita moschata Duch. dari provinsi Nanggroe Aceh
Darussalam”. Penyusunan skripsi ini di maksudkan untuk memenuhi sebagian
persyaratan guna memperoleh gelar Sarjana Sains pada program studi Biologi
Fakultas Matematia dan Ilmu Pengetauan Alam Universitas Sebelas Maret
Surakarta.
Dalam melakukan penelitian maupun penyusunan skripsi ini penulis telah
mendapatkan banyak masukan, bantuan dan bimbingan dari berbagai pihak yang
sangat berguna dan bermanfaat baik secara langsung maupun tidak langsung. Oleh
karena itu pada kesempatan yang baik ini dengan berbesar hati penulis ingin
mengucapkan terima kasih yang setulus-tulusnya dan sebesar-besarnya kepada :
Prof. Ir. Ari Handono Ramelan, M.Sc.(Hons)., Ph.D., selaku Dekan
Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam, Universitas Sebelas Maret
Surakarta yang telah memberikan ijin penelitian untuk keperluan skripsi.
Dr. Ratna Setyaningsih, M.Si., selaku Kepala Program Studi Biologi,
Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam, Universitas Sebelas Maret
Surakarta yang telah memberikan ijin dan saran-saran dalam penelitian.
Prof. Drs. Suranto, M.Sc., Ph.D., selaku dosen pembimbing I yang telah
memberikan biaya penelitian, bimbingan dan petunjuknya selama penelitian
sampai selesainya penyusunan skripsi.
viii
Ari Pitoyo, S.Si., M.Sc., selaku dosen pembimbing II yang telah
memberikan bimbingan dan petunjuknya selama penelitian sampai selesainya
penyusunan skripsi ini.
Suratman, S.Si., M.Si., dan Dr. Artini Pangastuti, M.Si. selaku dosen
penguji yang telah memberikan saran, kritik dan masukan selama penelitian
sampai selesainya penyusunan skripsi ini.
Dosen di Program Studi Biologi yang telah dengan sabar memberikan
pengarahan yang tiada henti-hentinya dan dorongan baik spiritual maupun materil
sehingga penulis dapat menyelesaikan skripsi ini.
Kepala dan staf Laboratorium Pusat, Sub Laboratorium Biologi,
Universitas Sebelas Maret Surakarta yang telah mengijinkan dan membantu
penulis untuk melakukan penelitian di laboratorium.
Semua pihak yang tidak dapat disebutkan satu per satu yang telah
memberikan bantuannya.
Menyadari sepenuhnya atas keterbatasan dan kemampuan dalam menulis
skripsi ini, untuk itu teguran, pelurusan, saran, maupun kritik yang membangun
untuk kesempurnaan skripsi ini akan saya terima dengan senang hati. Dengan
mengharap ridho Allah azza wa jalla, saya berharap skripsi ini dapat bermanfaat
untuk menambah hasanah ilmu kita dan penguat iman kita masing-masing.
Surakarta, 1 Desember 2016
Penulis
ix
DAFTAR ISI
halaman
HALAMAN JUDUL
i
HALAMAN PENGESAHAN
ii
HALAMAN PERNYATAAN ..........................................................................
iii
ABSTRAK
iv
ABSTRACT ......................................................................................................
v
HALAMAN MOTTO .......................................................................................
vi
HALAMAN PERSEMBAHAN ........................................................................ vii
KATA PENGANTAR ....................................................................................... viii
DAFTAR ISI
x
DAFTAR TABEL ............................................................................................. xii
DAFTAR GAMBAR......................................................................................... xiii
DAFTAR LAMPIRAN ..................................................................................... xiv
DAFTAR SINGKATAN ................................................................................... . xv
BAB I
BAB II
PENDAHULUAN
1
A. Latar Belakang Masalah
1
B. Perumusan Masalah
4
C. Tujuan Penelitian
5
D. Manfaat Penelitian
5
LANDASAN TEORI
6
A. Tinjauan Pustaka
6
x
1. Waluh (Cucurbita moschata Duch.)
6
2. Karakter Anatomi
12
3. Analisa Pola Pita Protein
14
4. Hubungan Kekerabatan
16
B. Kerangka Pemikiran
18
BAB III METODE PENELITIAN
20
A. Waktu dan Tempat Penelitian
20
B. Alat dan Bahan
20
C. Cara Kerja Penelitian
21
D. Analisis Data
27
BAB IV HASIL DAN PEMBAHASAN.........................................................
30
A. Morfologi Biiji Waluh ...............................................................
30
B. Anatomi Biji Waluh ................................................................... 31
BAB V
C. Pola Pita Protein ........................................................................
34
D. Hubungan Kekerabatan .............................................................
37
PENUTUP ........................................................................................
43
A. Kesimpulan ................................................................................
43
B. Saran ..........................................................................................
43
DAFTAR PUSTAKA
44
xi
DAFTAR TABEL
Halaman
Tabel 1. Ketebalan kulit biji Cucurbita moschata Duch. dari Provinsi
Nanggroe Aceh Darussalam ...................................................................
33
Tabel 2. Kualitas protein berdasarkan tebal tipis dan jumlah kemunculan
pita biji Cucurbita moschata Duch. dari Provinsi Nanggroe
Aceh Darussalam ............................................................ .......................
xii
38
DAFTAR GAMBAR
Halaman
Gambar 1. Morfologi biji dan buah waluh (Cucurbita moschata Duch.)
dari Provinsi Nanggroe Aceh Darussalam ........................................
10
Gambar 2. Bagan kerangka pemikiran penelitian .................................................
19
Gambar 3. Peta lokasi pengambilan sampel .........................................................
21
Gambar 4. Morfologi biji waluh (Cucurbita moschata Duch.) dari
Provinsi Nanggroe Aceh Darussalam ...............................................
29
Gambar 5. Penampang melintang biji waluh (Cucurbita moschata Duch.)
dari Provinsi Nanggroe Aceh Darussalam perbesaran 40x................
31
Gambar 6. Penampang melintang biji waluh (Cucurbita moschata Duch.)
dari Provinsi Nanggroe Aceh Darussalam perbesaran 40x................
32
Gambar 7. Pita protein biji Cucurbita moschata Duch. dari Provinsi
Nanggroe Aceh Darussalam ....................... .......................................
35
Gambar 8. Dendogram hubungan kekerabatan Cucurbita moschata Duch.
dari Provinsi Nanggroe Aceh Darussalam ........... ............................. . 40
xiii
DAFTAR LAMPIRAN
Halaman
Lampiran 1. Pembobotan pola pita protein biji lima varian waluh dari
Provinsi
Nanggroe
Aceh
Darussalam
berdasarkan
pengamatan karakter anatomi ............................ .................
45
Lampiran 2. Pembobotan pola pita protein biji lima varian waluh dari
Provinsi Nanggroe Aceh Darussalam berdasarkan muncul
tidaknya pita potein ............................ .................................
46
Lampiran 3. Nilai Indeks Similaritas biji lima varian waluh dari
Provinsi Nanggroe Aceh Darussalam ..................... ............
47
Lampiran 4. Daftar riwayat hidup penulis ................................................
48
xiv
DAFTAR SINGKATAN
Singkatan
Kepanjangan
APS
Ammonium Persulphate
BM
Berat Molekul
DTT
Ditriotitol
FAA
Formalin acetat acid alcohol
HCl
Hydroximethyl Chloride
HPLC
High Performance Liquid Chromatography
Ism
Indeks Similaritas
NAD
Nanggroe Aceh Darussalam
SDS-PAGE
Sodium Dedocyl Sulfate Polyacrilamide Gel Electrophoresis
SEM
Scanning Electron Microscope
TEM
Transmission Electron Microscope
TEMED
N-N-N-N Tetra Methyl Ethylene Diamine
UPGMA-NTSYS
Unweighted Pair Group Method Arithmathic Numerical
Taxonomy and Multivariate Analysis System
UV
Ultraviolet
xv