Peran Polimorfisme Nukleotida Tunggal Gen Interleukin (IL-6) pada kejadian psoriasis vulgaris di Sumatera Utara
59
Lampiran 1
NASKAH PENJELASAN KEPADA PASIEN
Selamat pagi/siang.
Perkenalkan nama saya dr. Cashtry Meher. Saat ini saya sedang menjalani
Program Pendidikan Magister Kedokteran Klinis di Departemen Ilmu Kesehatan
Kulit dan Kelamin Fakultas Kedokteran Universitas Sumatera Utara.
Untuk memenuhi salah satu persyaratan menyelesaikan Program Magister
Kedokteran Klinis, FK USU yang sedang saya jalani, saya melakukan penelitian
dengan judul "Peran Polimorfisme Nukleotida Tunggal Gen IL-6 pada
kejadian Psoriasis Vulgaris di RSUP H Adam Malik Medan 2015”
Tujuan penelitian ini adalah Mengetahui peran genetik dengan terjadinya penyakit
psoriasis vulgaris.
Jika Ibu/Kakak/Adik/Saudari bersedia untuk ikut serta dalam penelitian
ini, maka saya akan melakukan tanya jawab terhadap Ibu/Kakak/Adik/Saudari
untuk mengetahui identitas pribadi secara lebih lengkap. Setelah itu akan
dilakukan pengambilan darah.
Sebelum dilakukan pengambilan darah saya ingin menjelaskan sedikit
tentang faktor-faktor yang meyebabkan psoriasis vulgaris selain faktor genetik
dapat juga disebabkan faktor lingkungan seperti trauma, sinar matahari, infeksi,
obat-obatan, stress, merokok, alkohol, perubahan hormon, dan kelainan autoimun.
Pemeriksaan akan dilakukan di Laboratorium terpadu RSUP H Adam
malik Medan dengan cara daerah lengan yang akan diambil darahnya diolesi
dengan kapas alkohol agar steril kemudian setelah itu akan dipasangkan ikat
lengan (torniquet) lalu akan ditusuk jarum suntik setelah itu jarum suntik ditarik
dan bekas tusukan akan ditutup dengan kapas alkohol.
Universitas Sumatera Utara
60
Ibu/Kakak/Adi/Saudari tidak akan dikutip biaya apapun dalam penelitian
ini dan kerahasiaan mengenai penyakit yang di derita peserta penelitian akan di
jamin.
Keikutsertaan Ibu/Kakak/Adik/Saudari
dalam penelitian ini adalah
bersifat sukarela. Bila tidak bersedia Ibu/Kakak/Adik/Saudari
berhak untuk
menolak di dikutsertakan dalam penelitian ini. Jika Ibu/Kakak/Adik/Saudari
bersedia dan menyetujui pemeriksaan ini, mohom untuk menandatangani formulir
persetujuan ikut serta dalam penelitian.
Jika Ibu/Kakak/Adik/Saudari masih memerlukan penjelasan lebih lanjut
dapat menghubungi saya di nomer 081260552222.
Terima kasih
dr. Cashtry Meher
Universitas Sumatera Utara
61
Lampiran 2
PERSETUJUAN IKUT SERTA DALAM PENELITIAN
Setelah mendapat penjelasan, saya yang bertanda tangan dibawah ini :
Nama
:..............................................................................................
Jenis Kelamin
: Laki-laki / Perempuan
Umur
:................th
Alamat
:..............................................................................................
Telp
:
Dengan ini menyatakan secara sukarela SETUJU untuk ikut serta dalam
penelitian dan mengikuti berbagai prosedur pemeriksaan seperti yang telah di
jelaskan sebelumnya,
Demikianlah surat pernyataan persetujuan ini di buat dengan sebenarnya dalam
keadaan sadar tanpa adanya paksaan dari siapapun.
Medan,
2015
Dokter pemeriksa
dr. Cashtry Meher
Yang menyetujui
(
)
Universitas Sumatera Utara
62
Lampiran 3
STATUS PENELITIAN
Tanggal pemeriksaan
:
Nomor urut penelitian
:
Nomor catatan medik
:
IDENTITAS
Nama
:
Alamat
:
Telp.
:
Tempat tanggal lahir (hari, bulan, tahun) / Umur
:
Jenis kelamin
:
1. Laki-laki
2. Perempuan
Bangsa/Suku
:
1. Batak
2. Jawa
3.Melayu
4. Minangkabau
5. Tionghoa
6.Lainnya
1. Islam
2.Kristen Protestan
3. Katolik
4. Hindu
Agama
:
5.Budha
Pendidikan
:
1. Belum sekolah
2. SD / sederajat
3. SMP / sederajat
4. SMA / sederajat
5. Perguruan tinggi
Keluhan Utama
:
Telaah
:
Universitas Sumatera Utara
63
Riwayat penyakit keluarga
:
Riwayat penyakit terdahulu :
Riwayat pemakaian obat
:
PEMERIKSAAN FISIK
Status generalisata
Keadaan umum
:
Kesadaran
:
Gizi
:
Tekanan darah
:
Frekuensi nadi
:
Suhu
:
Frekuensi pernafasan :
Keadaan Spesifik
:
Kepala
:
Leher
:
Toraks
:
Abdomen
:
Genitalia
:
Ekstremitas
:
Status dermatologikus
Lokalisasi
:
Efloresensi
:
DIAGNOSIS KERJA :
PEMERIKSAAN PCR-RFLP
Universitas Sumatera Utara
64
Variasi gen/Urutan DNA sebagai marker psoriasis (Kasus) :
Variasi gen/Urutan DNA sebagai marker (Kontrol) :
PROGNOSIS
Quo ad vitam
:
Quo ad functionam
:
Quo ad sanactionam :
Universitas Sumatera Utara
65
LAMPIRAN 4
C1- C14
C15-28
Universitas Sumatera Utara
66
C29-42
P43- C45
Universitas Sumatera Utara
67
P1- P14
P15-P28
Universitas Sumatera Utara
68
P29-P42
Description
-
G Guanin
C Cytocin
Bp Base Pair
P Patient
-
C Control
-
NC Negative Control
Conclusion :
45 Patient for cases
a. GG = 21 Homozygote Mayor 164 Bp
b. cc = 4 Homozygote Minor 111, 59 Bp
c. Gc = 20 Heterozygote 164, 111, 59 Bp
45 Control
a. GG = 11 Homozygote Mayor 164 Bp
b. cc = 7 Homozygote Minor 111, 59 Bp
c. Gc = 27Heterozygote 164, 111, 59 Bp
Universitas Sumatera Utara
69
LAMPIRAN 5
HASIL SEQUENSING PASIEN DAN KONTROL
Universitas Sumatera Utara
70
Universitas Sumatera Utara
71
Universitas Sumatera Utara
72
Universitas Sumatera Utara
73
Universitas Sumatera Utara
74
Universitas Sumatera Utara
75
Universitas Sumatera Utara
76
Universitas Sumatera Utara
77
Universitas Sumatera Utara
78
Universitas Sumatera Utara
79
LAMPIRAN 6
Universitas Sumatera Utara
80
LAMPIRAN 7
DATA PENELITIAN PASIEN PSORIASIS VULGARIS
No
Nama
(Pasien)
Umur
(tahun)
Jenis
kelamin
1
P1
37
L
2
P2
58
P
3
4
5
P3
P4
P5
41
33
36
P
L
P
6
P6
7
8
9
P7
P8
P9
33
35
39
P
L
P
10
P10
47
P
11
12
P11
P12
42
37
P
L
13
14
15
P13
P14
P15
46
32
39
16
P16
17
18
Ras/ Suku
Urutan
nukleotida
Posisi
alel
(Bp)
Padang
Batak
Mandailing
Batak
Mandailing
India
Melayu
GG
164
GG
164
GG
Gc
Gc
164
164
164
Jawa
Batak
Mandailing
Jawa
Jawa
GG
164
cc
Gc
Gc
164
164
GG
164
GG
Gc
P
P
P
Jawa
Batak
Mandailing
Padang
Batak
Mandailing
Aceh
Jawa
44
P
P17
P18
46
36
19
P19
20
21
22
23
Posisi
alel (Bp)
Posisi
alel
(Bp)
59
59
111
111
59
59
59
111
111
111
164
164
59
111
GG
Gc
Gc
164
164
164
59
59
111
111
Jawa
GG
164
L
L
Cina
Batak Toba
GG
Gc
164
164
59
111
45
P
Jawa
GG
164
P20
P21
P22
P23
45
34
36
49
L
P
P
P
GG
Gc
Gc
Gc
164
164
164
164
59
59
59
111
111
111
24
P24
54
L
Karo
Melayu
Melayu
Jawa
Batak
Mandailing
GG
164
25
P25
51
P
Jawa
GG
164
26
P26
38
P
Karo
cc
59
111
27
28
29
P27
P28
P29
56
32
42
P
L
L
Cina
Batak Toba
Batak Toba
GG
Gc
Gc
164
164
164
59
59
111
111
30
31
P30
P31
52
33
P
P
Jawa
Aceh
GG
Gc
164
164
59
111
32
33
P32
P33
37
60
P
P
Jawa
Melayu
cc
Gc
164
59
59
111
111
34
P34
51
P
GG
164
35
P35
31
P
Karo
Batak
Mandailing
Gc
164
59
111
51
P
Kesimpulan
Homozigot
dominan
Homozigot
dominan
Homozigot
dominan
Heterozigot
Heterozigot
Homozigot
dominan
Homozigot
resesif
Heterozigot
Heterozigot
Homozigot
dominan
Homozigot
dominan
Heterozigot
Homozigot
dominan
Heterozigot
Heterozigot
Homozigot
dominan
Homozigot
dominan
Heterozigot
Homozigot
dominan
Homozigot
dominan
Heterozigot
Heterozigot
Heterozigot
Homozigot
dominan
Homozigot
dominan
Homozigot
resesif
Homozigot
dominan
Heterozigot
Heterozigot
Homozigot
dominan
Heterozigot
Homozigot
resesif
Heterozigot
Homozigot
dominan
Heterozigot
Universitas Sumatera Utara
81
36
P36
50
P
37
38
39
P37
P38
P39
49
44
48
P
L
L
Batak
Mandailing
Batak
Mandailing
Jawa
Jawa
40
P40
55
L
41
42
P41
P42
52
47
43
P43
44
45
P44
P45
GG
164
GG
Gc
Gc
164
164
164
Jawa
GG
164
P
L
Melayu
Melayu
GG
Gc
164
164
50
P
Jawa
GG
164
36
43
P
P
Aceh
Karo
cc
Gc
164
59
59
111
111
59
111
59
59
111
111
Homozigot
dominan
Homozigot
dominan
Heterozigot
Heterozigot
Homozigot
dominan
Homozigot
dominan
Heterozigot
Homozigot
dominan
Homozigot
resesif
Heterozigot
Universitas Sumatera Utara
82
LAMPIRAN 8
DATA PENELITIAN KONTROL
N
o
Nama
(Kontrol)
Umur
(tahun)
Jenis
kelamin
1
K1
37
L
2
K2
58
P
3
K3
41
4
K4
5
K5
6
Ras/ Suku
Urutan
nukleotida
Posisi
alel
(Bp)
Posisi
alel
(Bp)
Posisi
alel
(Bp)
Kesimpulan
Gc
164
59
111
Heterozigot
Gc
164
59
111
Heterozigot
P
Padang
Batak
Mandailing
Batak
Mandailing
59
111
Homozigot resesif
33
L
India
Gc
164
59
111
Heterozigot
36
P
Melayu
GG
164
K6
51
P
Gc
164
59
111
Heterozigot
7
K7
33
P
Jawa
Batak
Mandailing
Gc
164
59
111
Heterozigot
8
K8
35
L
Jawa
Gc
164
59
111
Heterozigot
9
K9
39
P
Jawa
GG
164
10
K10
47
P
cc
11
K11
42
P
Jawa
Batak
Mandailing
Gc
12
K12
37
L
13
K13
46
P
Padang
Batak
Mandailing
14
K14
32
P
15
K15
39
P
16
K16
44
17
K17
18
19
cc
Homozigot dominan
Homozigot dominan
59
111
Homozigot resesif
164
59
111
Heterozigot
Gc
164
59
111
Heterozigot
Gc
164
59
111
Heterozigot
Aceh
GG
164
Homozigot dominan
Jawa
GG
164
Homozigot dominan
P
Jawa
Gc
164
59
111
Heterozigot
46
L
Cina
Gc
164
59
111
Heterozigot
K18
36
L
Batak Toba
cc
59
111
Homozigot resesif
K19
45
P
Jawa
Gc
164
59
111
Heterozigot
20
K20
45
L
Karo
GG
164
21
K21
34
P
Melayu
Gc
164
22
K22
36
P
Melayu
GG
164
23
K23
49
P
Gc
24
K24
54
L
Jawa
Batak
Mandailing
25
K25
51
P
26
K26
38
27
K27
28
K28
29
Homozigot dominan
59
111
Heterozigot
164
59
111
Heterozigot
Gc
164
59
111
Heterozigot
Jawa
GG
164
P
Karo
Gc
164
56
P
Cina
GG
164
32
L
Batak Toba
Gc
K29
42
L
Batak Toba
30
K30
52
P
31
K31
33
32
K32
37
33
K33
34
Homozigot dominan
Homozigot dominan
59
111
164
59
111
Heterozigot
Gc
164
59
111
Heterozigot
Jawa
Gc
164
59
111
Heterozigot
P
Aceh
Gc
164
59
111
Heterozigot
P
Jawa
GG
164
60
P
Melayu
cc
K34
51
Pe
Gc
35
K35
31
P
36
K36
50
P
Karo
Batak
Mandailing
Batak
Mandailing
164
cc
GG
164
Heterozigot
Homozigot dominan
Homozigot dominan
59
111
Homozigot resesif
59
111
Heterozigot
59
111
Homozigot resesif
Homozigot dominan
Universitas Sumatera Utara
83
37
K37
49
P
Batak
Mandailing
GG
38
K38
44
L
Jawa
cc
39
K39
48
L
Jawa
Gc
40
K40
55
L
Jawa
41
K41
52
P
Melayu
42
K42
47
L
Melayu
cc
43
K43
50
P
Jawa
Gc
44
K44
36
P
Aceh
45
K45
43
P
Karo
164
Homozigot dominan
59
111
Homozigot resesif
164
59
111
Heterozigot
Gc
164
59
111
Heterozigot
Gc
164
59
111
Heterozigot
59
111
Homozigot resesif
164
59
111
Heterozigot
Gc
164
59
111
Heterozigot
Gc
164
59
111
Heterozigot
Universitas Sumatera Utara
84
LAMPIRAN 9
ALEL GENOTIP DAN PERAN ALEL KASUS-KONTROL
Persentase
Gen
Genotip
N
Peran
(%)
Kasus
IL-6 Rs
1800795
GG
21
46,7
Homozigot
Dominan
Gc
20
44,4
Heterozigot
CC
4
8,96
Homozigot
Resesif
Total
45
100
Genotip
n
Persentase
Gen
Peran
(%)
Kontrol
IL-6 Rs
1800795
GG
11
24,4
Homozigot
Dominan
Gc
27
60
Heterozigot
CC
7
15,6
Homozigot
Resesif
Total
45
100
Universitas Sumatera Utara
85
LAMPIRAN 10
ANALISIS STATISTIK
Crosstabs
Case Processing Summary
Cases
Valid
N
Missing
Percent
N
Total
Percent
N
Percent
jk * kasus
90
100,0%
0
0,0%
90
100,0%
ras * kasus
90
100,0%
0
0,0%
90
100,0%
urutan * kasus
90
100,0%
0
0,0%
90
100,0%
kesimpulan * kasus
90
100,0%
0
0,0%
90
100,0%
jk * kasus
Crosstab
kasus
kasus
jk
Laki-laki
Count
14
28
14,0
14,0
28,0
% within jk
50,0%
50,0%
100,0%
% within kasus
31,1%
31,1%
31,1%
31
31
62
31,0
31,0
62,0
% within jk
50,0%
50,0%
100,0%
% within kasus
68,9%
68,9%
68,9%
45
45
90
45,0
45,0
90,0
50,0%
50,0%
100,0%
100,0%
100,0%
100,0%
Count
Expected Count
Total
Total
14
Expected Count
Perempuan
kontrol
Count
Expected Count
% within jk
% within kasus
Universitas Sumatera Utara
86
Chi-Square Tests
Value
Pearson Chi-Square
Continuity Correction
df
a
1
1,000
,000
1
1,000
,000
1
1,000
,000
b
Likelihood Ratio
Asymp. Sig. (2sided)
Fisher's Exact Test
N of Valid Cases
Exact
Sig. (1sided)
Exact Sig. (2sided)
1,000
,590
90
a. 0 cells (0,0%) have expected count less than 5. The minimum expected count is 14,00.
b. Computed only for a 2x2 table
Risk Estimate
95% Confidence Interval
Value
Odds Ratio for jk (Laki-laki /
Lower
Upper
1,000
,410
2,441
For cohort kasus = kasus
1,000
,640
1,562
For cohort kasus = kontrol
1,000
,640
1,562
Perempuan)
N of Valid Cases
90
Universitas Sumatera Utara
87
katumur * kasus Crosstabulation
kasus
kasus
katumur
31-35
Count
8
16
8,0
8,0
16,0
% within katumur
50,0%
50,0%
100,0%
% within kasus
17,8%
17,8%
17,8%
10
10
20
10,0
10,0
20,0
% within katumur
50,0%
50,0%
100,0%
% within kasus
22,2%
22,2%
22,2%
8
8
16
8,0
8,0
16,0
% within katumur
50,0%
50,0%
100,0%
% within kasus
17,8%
17,8%
17,8%
9
9
18
9,0
9,0
18,0
% within katumur
50,0%
50,0%
100,0%
% within kasus
20,0%
20,0%
20,0%
7
7
14
7,0
7,0
14,0
% within katumur
50,0%
50,0%
100,0%
% within kasus
15,6%
15,6%
15,6%
3
3
6
3,0
3,0
6,0
50,0%
50,0%
100,0%
6,7%
6,7%
6,7%
45
45
90
45,0
45,0
90,0
50,0%
50,0%
100,0%
100,0%
100,0%
100,0%
Count
Expected Count
41-45
Count
Expected Count
46-50
Count
Expected Count
51-55
Count
Expected Count
56-60
Count
Expected Count
% within katumur
% within kasus
Total
Total
8
Expected Count
36-40
kontrol
Count
Expected Count
% within katumur
% within kasus
Universitas Sumatera Utara
88
ras * kasus
Crosstab
kasus
kasus
ras
Aceh
Count
3
6
3,0
3,0
6,0
50,0%
50,0%
100,0%
6,7%
6,7%
6,7%
9
9
18
9,0
9,0
18,0
% within ras
50,0%
50,0%
100,0%
% within kasus
20,0%
20,0%
20,0%
3
3
6
3,0
3,0
6,0
50,0%
50,0%
100,0%
6,7%
6,7%
6,7%
2
2
4
2,0
2,0
4,0
50,0%
50,0%
100,0%
4,4%
4,4%
4,4%
1
1
2
1,0
1,0
2,0
50,0%
50,0%
100,0%
2,2%
2,2%
2,2%
15
15
30
15,0
15,0
30,0
% within ras
50,0%
50,0%
100,0%
% within kasus
33,3%
33,3%
33,3%
4
4
8
4,0
4,0
8,0
50,0%
50,0%
100,0%
8,9%
8,9%
8,9%
6
6
12
6,0
6,0
12,0
% within ras
50,0%
50,0%
100,0%
% within kasus
13,3%
13,3%
13,3%
2
2
4
% within ras
% within kasus
Count
Expected Count
Batak Toba
Count
Expected Count
% within ras
% within kasus
Cina
Count
Expected Count
% within ras
% within kasus
India
Count
Expected Count
% within ras
% within kasus
Jawa
Count
Expected Count
Karo
Count
Expected Count
% within ras
% within kasus
Melayu
Count
Expected Count
Padang
Total
3
Expected Count
Batak Mandailing
kontrol
Count
Universitas Sumatera Utara
89
Expected Count
% within ras
2,0
2,0
4,0
50,0%
50,0%
100,0%
4,4%
4,4%
4,4%
45
45
90
45,0
45,0
90,0
50,0%
50,0%
100,0%
100,0%
100,0%
100,0%
% within kasus
Total
Count
Expected Count
% within ras
% within kasus
Chi-Square Tests
Value
Pearson Chi-Square
df
a
8
1,000
,000
8
1,000
,000
Likelihood Ratio
N of Valid Cases
Asymp. Sig. (2-sided)
90
a. 12 cells (66,7%) have expected count less than 5. The minimum expected count is 1,00.
Risk Estimate
Value
Odds Ratio for ras (Aceh / Batak Mandailing)
a
a. Risk Estimate statistics cannot be computed. They are only computed for a 2*2 table without
empty cells.
Universitas Sumatera Utara
90
urutan * kasus
Crosstab
kasus
kasus
urutan
cc
Gc
GG
Total
Count
kontrol
Total
4
7
11
Expected Count
5,5
5,5
11,0
% within urutan
36,4%
63,6%
100,0%
% within kasus
8,9%
15,6%
12,2%
20
27
47
Expected Count
23,5
23,5
47,0
% within urutan
42,6%
57,4%
100,0%
% within kasus
44,4%
60,0%
52,2%
21
11
32
Expected Count
16,0
16,0
32,0
% within urutan
65,6%
34,4%
100,0%
% within kasus
46,7%
24,4%
35,6%
45
45
90
Expected Count
45,0
45,0
90,0
% within urutan
50,0%
50,0%
100,0%
% within kasus
100,0%
100,0%
100,0%
Count
Count
Count
Chi-Square Tests
Value
Pearson Chi-Square
Likelihood Ratio
N of Valid Cases
df
Asymp. Sig. (2-sided)
a
2
,083
5,053
2
,080
4,986
90
a. 0 cells (0,0%) have expected count less than 5. The minimum expected count is 5,50.
Universitas Sumatera Utara
91
Risk Estimate
Value
a
Odds Ratio for urutan (cc / Gc)
a. Risk Estimate statistics cannot be computed. They are only computed for a 2*2 table without
empty cells.
kesimpulan * kasus
Crosstab
kasus
kasus
kesimpulan
Heterozigot
Count
27
47
23,5
23,5
47,0
% within kesimpulan
42,6%
57,4%
100,0%
% within kasus
44,4%
60,0%
52,2%
21
11
32
16,0
16,0
32,0
% within kesimpulan
65,6%
34,4%
100,0%
% within kasus
46,7%
24,4%
35,6%
4
7
11
5,5
5,5
11,0
36,4%
63,6%
100,0%
8,9%
15,6%
12,2%
45
45
90
45,0
45,0
90,0
50,0%
50,0%
100,0%
100,0%
100,0%
100,0%
Count
Expected Count
Homozigot resesif
Count
Expected Count
% within kesimpulan
% within kasus
Total
Total
20
Expected Count
Homozigot dominan
kontrol
Count
Expected Count
% within kesimpulan
% within kasus
Chi-Square Tests
Value
Pearson Chi-Square
Likelihood Ratio
N of Valid Cases
df
Asymp. Sig. (2-sided)
a
2
,083
5,053
2
,080
4,986
90
a. 0 cells (0,0%) have expected count less than 5. The minimum expected count is 5,50.
Universitas Sumatera Utara
92
Risk Estimate
Value
Odds Ratio for kesimpulan (Heterozigot / Homozigot dominan)
a
a. Risk Estimate statistics cannot be computed. They are only computed for a 2*2 table without
empty cells.
Case Processing Summary
Cases
Valid
kasus
umur
N
Missing
Percent
N
Total
Percent
N
Percent
kasus
45
100,0%
0
0,0%
45
100,0%
kontrol
45
100,0%
0
0,0%
45
100,0%
Descriptives
kasus
umur
kasus
Statistic
Mean
43,38
95% Confidence Interval for
Lower Bound
41,00
Mean
Upper Bound
45,75
5% Trimmed Mean
43,19
Median
44,00
Variance
7,904
Minimum
31
Maximum
60
Range
29
Interquartile Range
14
Skewness
Kurtosis
Mean
,190
,354
-1,018
,695
43,38
1,178
95% Confidence Interval for
Lower Bound
41,00
Mean
Upper Bound
45,75
5% Trimmed Mean
43,19
Median
44,00
Variance
Std. Deviation
1,178
62,468
Std. Deviation
kontrol
Std. Error
62,468
7,904
Minimum
31
Maximum
60
Universitas Sumatera Utara
93
Range
29
Interquartile Range
14
Skewness
Kurtosis
,190
,354
-1,018
,695
Tests of Normality
Kolmogorov-Smirnov
kasus
umur
Statistic
df
a
Shapiro-Wilk
Sig.
Statistic
df
Sig.
kasus
,123
45
,083
,958
45
,099
kontrol
,123
45
,083
,958
45
,099
a. Lilliefors Significance Correction
Crosstabs
Case Processing Summary
Cases
Valid
N
alel * kasus
Missing
Percent
79
100,0%
N
Total
Percent
0
N
0,0%
Percent
79
100,0%
alel * kasus Crosstabulation
kasus
kasus
alel
GG
Count
11
32
16,6
15,4
32,0
% within alel
65,6%
34,4%
100,0%
% within kasus
51,2%
28,9%
40,5%
20
27
47
24,4
22,6
47,0
% within alel
42,6%
57,4%
100,0%
% within kasus
48,8%
71,1%
59,5%
41
38
79
41,0
38,0
79,0
51,9%
48,1%
100,0%
100,0%
100,0%
100,0%
Count
Expected Count
Total
Total
21
Expected Count
GC
kontrol
Count
Expected Count
% within alel
% within kasus
Universitas Sumatera Utara
94
Chi-Square Tests
Value
Pearson Chi-Square
Continuity Correction
Likelihood Ratio
Exact Sig. (2-
Exact Sig. (1-
(2-sided)
sided)
sided)
df
a
1
,044
3,188
1
,074
4,110
1
,043
4,059
b
Asymp. Sig.
Fisher's Exact Test
,066
Linear-by-Linear
4,008
Association
N of Valid Cases
1
,037
,045
79
a. 0 cells (0,0%) have expected count less than 5. The minimum expected count is 15,39.
b. Computed only for a 2x2 table
Risk Estimate
95% Confidence Interval
Value
Odds Ratio for alel (GG / GC)
Lower
Upper
2,577
1,016
6,538
For cohort kasus = kasus
1,542
1,017
2,338
For cohort kasus = kontrol
,598
,349
1,025
N of Valid Cases
79
Crosstabs
Case Processing Summary
Cases
Valid
N
alel * kasus
Missing
Percent
58
100,0%
N
Total
Percent
0
N
0,0%
Percent
58
100,0%
Universitas Sumatera Utara
95
alel * kasus Crosstabulation
kasus
kasus
alel
GC
kontrol
Count
20
27
47
19,4
27,6
47,0
% within alel
42,6%
57,4%
100,0%
% within kasus
83,3%
79,4%
81,0%
4
7
11
4,6
6,4
11,0
% within alel
36,4%
63,6%
100,0%
% within kasus
16,7%
20,6%
19,0%
24
34
58
24,0
34,0
58,0
41,4%
58,6%
100,0%
100,0%
100,0%
100,0%
Expected Count
CC
Count
Expected Count
Total
Total
Count
Expected Count
% within alel
% within kasus
Chi-Square Tests
Value
Pearson Chi-Square
Continuity Correction
df
Likelihood Ratio
Exact Sig. (2-
Exact Sig. (1-
(2-sided)
sided)
sided)
a
1
,708
,001
1
,972
,142
1
,706
,141
b
Asymp. Sig.
Fisher's Exact Test
Linear-by-Linear
Association
N of Valid Cases
1,000
,138
1
,491
,710
58
a. 1 cells (25,0%) have expected count less than 5. The minimum expected count is 4,55.
b. Computed only for a 2x2 table
Risk Estimate
95% Confidence Interval
Value
Odds Ratio for alel (GC / CC)
Lower
Upper
1,296
,333
5,039
For cohort kasus = kasus
1,170
,500
2,736
For cohort kasus = kontrol
,903
,542
1,503
N of Valid Cases
58
Universitas Sumatera Utara
96
Crosstabs
Case Processing Summary
Cases
Valid
N
alel * kasus
Missing
Percent
43
N
100,0%
Total
Percent
0
N
Percent
0,0%
43
100,0%
alel * kasus Crosstabulation
kasus
kasus
alel
GG
Count
11
32
18,6
13,4
32,0
% within alel
65,6%
34,4%
100,0%
% within kasus
84,0%
61,1%
74,4%
4
7
11
6,4
4,6
11,0
% within alel
36,4%
63,6%
100,0%
% within kasus
16,0%
38,9%
25,6%
25
18
43
25,0
18,0
43,0
58,1%
41,9%
100,0%
100,0%
100,0%
100,0%
Asymp. Sig.
Exact Sig. (2-
Exact Sig. (1-
(2-sided)
sided)
sided)
Count
Expected Count
Total
Total
21
Expected Count
CC
kontrol
Count
Expected Count
% within alel
% within kasus
Chi-Square Tests
Value
Pearson Chi-Square
Continuity Correction
Likelihood Ratio
1
,090
1,803
1
,179
2,862
1
,091
2,880
b
df
a
Fisher's Exact Test
Linear-by-Linear
Association
,156
2,813
N of Valid Cases
1
,090
,094
43
a. 1 cells (25,0%) have expected count less than 5. The minimum expected count is 4,60.
b. Computed only for a 2x2 table
Universitas Sumatera Utara
97
Risk Estimate
95% Confidence Interval
Value
Odds Ratio for alel (GG / CC)
Lower
Upper
3,341
,801
13,943
For cohort kasus = kasus
1,805
,794
4,102
For cohort kasus = kontrol
,540
,281
1,040
N of Valid Cases
43
Universitas Sumatera Utara
Lampiran 1
NASKAH PENJELASAN KEPADA PASIEN
Selamat pagi/siang.
Perkenalkan nama saya dr. Cashtry Meher. Saat ini saya sedang menjalani
Program Pendidikan Magister Kedokteran Klinis di Departemen Ilmu Kesehatan
Kulit dan Kelamin Fakultas Kedokteran Universitas Sumatera Utara.
Untuk memenuhi salah satu persyaratan menyelesaikan Program Magister
Kedokteran Klinis, FK USU yang sedang saya jalani, saya melakukan penelitian
dengan judul "Peran Polimorfisme Nukleotida Tunggal Gen IL-6 pada
kejadian Psoriasis Vulgaris di RSUP H Adam Malik Medan 2015”
Tujuan penelitian ini adalah Mengetahui peran genetik dengan terjadinya penyakit
psoriasis vulgaris.
Jika Ibu/Kakak/Adik/Saudari bersedia untuk ikut serta dalam penelitian
ini, maka saya akan melakukan tanya jawab terhadap Ibu/Kakak/Adik/Saudari
untuk mengetahui identitas pribadi secara lebih lengkap. Setelah itu akan
dilakukan pengambilan darah.
Sebelum dilakukan pengambilan darah saya ingin menjelaskan sedikit
tentang faktor-faktor yang meyebabkan psoriasis vulgaris selain faktor genetik
dapat juga disebabkan faktor lingkungan seperti trauma, sinar matahari, infeksi,
obat-obatan, stress, merokok, alkohol, perubahan hormon, dan kelainan autoimun.
Pemeriksaan akan dilakukan di Laboratorium terpadu RSUP H Adam
malik Medan dengan cara daerah lengan yang akan diambil darahnya diolesi
dengan kapas alkohol agar steril kemudian setelah itu akan dipasangkan ikat
lengan (torniquet) lalu akan ditusuk jarum suntik setelah itu jarum suntik ditarik
dan bekas tusukan akan ditutup dengan kapas alkohol.
Universitas Sumatera Utara
60
Ibu/Kakak/Adi/Saudari tidak akan dikutip biaya apapun dalam penelitian
ini dan kerahasiaan mengenai penyakit yang di derita peserta penelitian akan di
jamin.
Keikutsertaan Ibu/Kakak/Adik/Saudari
dalam penelitian ini adalah
bersifat sukarela. Bila tidak bersedia Ibu/Kakak/Adik/Saudari
berhak untuk
menolak di dikutsertakan dalam penelitian ini. Jika Ibu/Kakak/Adik/Saudari
bersedia dan menyetujui pemeriksaan ini, mohom untuk menandatangani formulir
persetujuan ikut serta dalam penelitian.
Jika Ibu/Kakak/Adik/Saudari masih memerlukan penjelasan lebih lanjut
dapat menghubungi saya di nomer 081260552222.
Terima kasih
dr. Cashtry Meher
Universitas Sumatera Utara
61
Lampiran 2
PERSETUJUAN IKUT SERTA DALAM PENELITIAN
Setelah mendapat penjelasan, saya yang bertanda tangan dibawah ini :
Nama
:..............................................................................................
Jenis Kelamin
: Laki-laki / Perempuan
Umur
:................th
Alamat
:..............................................................................................
Telp
:
Dengan ini menyatakan secara sukarela SETUJU untuk ikut serta dalam
penelitian dan mengikuti berbagai prosedur pemeriksaan seperti yang telah di
jelaskan sebelumnya,
Demikianlah surat pernyataan persetujuan ini di buat dengan sebenarnya dalam
keadaan sadar tanpa adanya paksaan dari siapapun.
Medan,
2015
Dokter pemeriksa
dr. Cashtry Meher
Yang menyetujui
(
)
Universitas Sumatera Utara
62
Lampiran 3
STATUS PENELITIAN
Tanggal pemeriksaan
:
Nomor urut penelitian
:
Nomor catatan medik
:
IDENTITAS
Nama
:
Alamat
:
Telp.
:
Tempat tanggal lahir (hari, bulan, tahun) / Umur
:
Jenis kelamin
:
1. Laki-laki
2. Perempuan
Bangsa/Suku
:
1. Batak
2. Jawa
3.Melayu
4. Minangkabau
5. Tionghoa
6.Lainnya
1. Islam
2.Kristen Protestan
3. Katolik
4. Hindu
Agama
:
5.Budha
Pendidikan
:
1. Belum sekolah
2. SD / sederajat
3. SMP / sederajat
4. SMA / sederajat
5. Perguruan tinggi
Keluhan Utama
:
Telaah
:
Universitas Sumatera Utara
63
Riwayat penyakit keluarga
:
Riwayat penyakit terdahulu :
Riwayat pemakaian obat
:
PEMERIKSAAN FISIK
Status generalisata
Keadaan umum
:
Kesadaran
:
Gizi
:
Tekanan darah
:
Frekuensi nadi
:
Suhu
:
Frekuensi pernafasan :
Keadaan Spesifik
:
Kepala
:
Leher
:
Toraks
:
Abdomen
:
Genitalia
:
Ekstremitas
:
Status dermatologikus
Lokalisasi
:
Efloresensi
:
DIAGNOSIS KERJA :
PEMERIKSAAN PCR-RFLP
Universitas Sumatera Utara
64
Variasi gen/Urutan DNA sebagai marker psoriasis (Kasus) :
Variasi gen/Urutan DNA sebagai marker (Kontrol) :
PROGNOSIS
Quo ad vitam
:
Quo ad functionam
:
Quo ad sanactionam :
Universitas Sumatera Utara
65
LAMPIRAN 4
C1- C14
C15-28
Universitas Sumatera Utara
66
C29-42
P43- C45
Universitas Sumatera Utara
67
P1- P14
P15-P28
Universitas Sumatera Utara
68
P29-P42
Description
-
G Guanin
C Cytocin
Bp Base Pair
P Patient
-
C Control
-
NC Negative Control
Conclusion :
45 Patient for cases
a. GG = 21 Homozygote Mayor 164 Bp
b. cc = 4 Homozygote Minor 111, 59 Bp
c. Gc = 20 Heterozygote 164, 111, 59 Bp
45 Control
a. GG = 11 Homozygote Mayor 164 Bp
b. cc = 7 Homozygote Minor 111, 59 Bp
c. Gc = 27Heterozygote 164, 111, 59 Bp
Universitas Sumatera Utara
69
LAMPIRAN 5
HASIL SEQUENSING PASIEN DAN KONTROL
Universitas Sumatera Utara
70
Universitas Sumatera Utara
71
Universitas Sumatera Utara
72
Universitas Sumatera Utara
73
Universitas Sumatera Utara
74
Universitas Sumatera Utara
75
Universitas Sumatera Utara
76
Universitas Sumatera Utara
77
Universitas Sumatera Utara
78
Universitas Sumatera Utara
79
LAMPIRAN 6
Universitas Sumatera Utara
80
LAMPIRAN 7
DATA PENELITIAN PASIEN PSORIASIS VULGARIS
No
Nama
(Pasien)
Umur
(tahun)
Jenis
kelamin
1
P1
37
L
2
P2
58
P
3
4
5
P3
P4
P5
41
33
36
P
L
P
6
P6
7
8
9
P7
P8
P9
33
35
39
P
L
P
10
P10
47
P
11
12
P11
P12
42
37
P
L
13
14
15
P13
P14
P15
46
32
39
16
P16
17
18
Ras/ Suku
Urutan
nukleotida
Posisi
alel
(Bp)
Padang
Batak
Mandailing
Batak
Mandailing
India
Melayu
GG
164
GG
164
GG
Gc
Gc
164
164
164
Jawa
Batak
Mandailing
Jawa
Jawa
GG
164
cc
Gc
Gc
164
164
GG
164
GG
Gc
P
P
P
Jawa
Batak
Mandailing
Padang
Batak
Mandailing
Aceh
Jawa
44
P
P17
P18
46
36
19
P19
20
21
22
23
Posisi
alel (Bp)
Posisi
alel
(Bp)
59
59
111
111
59
59
59
111
111
111
164
164
59
111
GG
Gc
Gc
164
164
164
59
59
111
111
Jawa
GG
164
L
L
Cina
Batak Toba
GG
Gc
164
164
59
111
45
P
Jawa
GG
164
P20
P21
P22
P23
45
34
36
49
L
P
P
P
GG
Gc
Gc
Gc
164
164
164
164
59
59
59
111
111
111
24
P24
54
L
Karo
Melayu
Melayu
Jawa
Batak
Mandailing
GG
164
25
P25
51
P
Jawa
GG
164
26
P26
38
P
Karo
cc
59
111
27
28
29
P27
P28
P29
56
32
42
P
L
L
Cina
Batak Toba
Batak Toba
GG
Gc
Gc
164
164
164
59
59
111
111
30
31
P30
P31
52
33
P
P
Jawa
Aceh
GG
Gc
164
164
59
111
32
33
P32
P33
37
60
P
P
Jawa
Melayu
cc
Gc
164
59
59
111
111
34
P34
51
P
GG
164
35
P35
31
P
Karo
Batak
Mandailing
Gc
164
59
111
51
P
Kesimpulan
Homozigot
dominan
Homozigot
dominan
Homozigot
dominan
Heterozigot
Heterozigot
Homozigot
dominan
Homozigot
resesif
Heterozigot
Heterozigot
Homozigot
dominan
Homozigot
dominan
Heterozigot
Homozigot
dominan
Heterozigot
Heterozigot
Homozigot
dominan
Homozigot
dominan
Heterozigot
Homozigot
dominan
Homozigot
dominan
Heterozigot
Heterozigot
Heterozigot
Homozigot
dominan
Homozigot
dominan
Homozigot
resesif
Homozigot
dominan
Heterozigot
Heterozigot
Homozigot
dominan
Heterozigot
Homozigot
resesif
Heterozigot
Homozigot
dominan
Heterozigot
Universitas Sumatera Utara
81
36
P36
50
P
37
38
39
P37
P38
P39
49
44
48
P
L
L
Batak
Mandailing
Batak
Mandailing
Jawa
Jawa
40
P40
55
L
41
42
P41
P42
52
47
43
P43
44
45
P44
P45
GG
164
GG
Gc
Gc
164
164
164
Jawa
GG
164
P
L
Melayu
Melayu
GG
Gc
164
164
50
P
Jawa
GG
164
36
43
P
P
Aceh
Karo
cc
Gc
164
59
59
111
111
59
111
59
59
111
111
Homozigot
dominan
Homozigot
dominan
Heterozigot
Heterozigot
Homozigot
dominan
Homozigot
dominan
Heterozigot
Homozigot
dominan
Homozigot
resesif
Heterozigot
Universitas Sumatera Utara
82
LAMPIRAN 8
DATA PENELITIAN KONTROL
N
o
Nama
(Kontrol)
Umur
(tahun)
Jenis
kelamin
1
K1
37
L
2
K2
58
P
3
K3
41
4
K4
5
K5
6
Ras/ Suku
Urutan
nukleotida
Posisi
alel
(Bp)
Posisi
alel
(Bp)
Posisi
alel
(Bp)
Kesimpulan
Gc
164
59
111
Heterozigot
Gc
164
59
111
Heterozigot
P
Padang
Batak
Mandailing
Batak
Mandailing
59
111
Homozigot resesif
33
L
India
Gc
164
59
111
Heterozigot
36
P
Melayu
GG
164
K6
51
P
Gc
164
59
111
Heterozigot
7
K7
33
P
Jawa
Batak
Mandailing
Gc
164
59
111
Heterozigot
8
K8
35
L
Jawa
Gc
164
59
111
Heterozigot
9
K9
39
P
Jawa
GG
164
10
K10
47
P
cc
11
K11
42
P
Jawa
Batak
Mandailing
Gc
12
K12
37
L
13
K13
46
P
Padang
Batak
Mandailing
14
K14
32
P
15
K15
39
P
16
K16
44
17
K17
18
19
cc
Homozigot dominan
Homozigot dominan
59
111
Homozigot resesif
164
59
111
Heterozigot
Gc
164
59
111
Heterozigot
Gc
164
59
111
Heterozigot
Aceh
GG
164
Homozigot dominan
Jawa
GG
164
Homozigot dominan
P
Jawa
Gc
164
59
111
Heterozigot
46
L
Cina
Gc
164
59
111
Heterozigot
K18
36
L
Batak Toba
cc
59
111
Homozigot resesif
K19
45
P
Jawa
Gc
164
59
111
Heterozigot
20
K20
45
L
Karo
GG
164
21
K21
34
P
Melayu
Gc
164
22
K22
36
P
Melayu
GG
164
23
K23
49
P
Gc
24
K24
54
L
Jawa
Batak
Mandailing
25
K25
51
P
26
K26
38
27
K27
28
K28
29
Homozigot dominan
59
111
Heterozigot
164
59
111
Heterozigot
Gc
164
59
111
Heterozigot
Jawa
GG
164
P
Karo
Gc
164
56
P
Cina
GG
164
32
L
Batak Toba
Gc
K29
42
L
Batak Toba
30
K30
52
P
31
K31
33
32
K32
37
33
K33
34
Homozigot dominan
Homozigot dominan
59
111
164
59
111
Heterozigot
Gc
164
59
111
Heterozigot
Jawa
Gc
164
59
111
Heterozigot
P
Aceh
Gc
164
59
111
Heterozigot
P
Jawa
GG
164
60
P
Melayu
cc
K34
51
Pe
Gc
35
K35
31
P
36
K36
50
P
Karo
Batak
Mandailing
Batak
Mandailing
164
cc
GG
164
Heterozigot
Homozigot dominan
Homozigot dominan
59
111
Homozigot resesif
59
111
Heterozigot
59
111
Homozigot resesif
Homozigot dominan
Universitas Sumatera Utara
83
37
K37
49
P
Batak
Mandailing
GG
38
K38
44
L
Jawa
cc
39
K39
48
L
Jawa
Gc
40
K40
55
L
Jawa
41
K41
52
P
Melayu
42
K42
47
L
Melayu
cc
43
K43
50
P
Jawa
Gc
44
K44
36
P
Aceh
45
K45
43
P
Karo
164
Homozigot dominan
59
111
Homozigot resesif
164
59
111
Heterozigot
Gc
164
59
111
Heterozigot
Gc
164
59
111
Heterozigot
59
111
Homozigot resesif
164
59
111
Heterozigot
Gc
164
59
111
Heterozigot
Gc
164
59
111
Heterozigot
Universitas Sumatera Utara
84
LAMPIRAN 9
ALEL GENOTIP DAN PERAN ALEL KASUS-KONTROL
Persentase
Gen
Genotip
N
Peran
(%)
Kasus
IL-6 Rs
1800795
GG
21
46,7
Homozigot
Dominan
Gc
20
44,4
Heterozigot
CC
4
8,96
Homozigot
Resesif
Total
45
100
Genotip
n
Persentase
Gen
Peran
(%)
Kontrol
IL-6 Rs
1800795
GG
11
24,4
Homozigot
Dominan
Gc
27
60
Heterozigot
CC
7
15,6
Homozigot
Resesif
Total
45
100
Universitas Sumatera Utara
85
LAMPIRAN 10
ANALISIS STATISTIK
Crosstabs
Case Processing Summary
Cases
Valid
N
Missing
Percent
N
Total
Percent
N
Percent
jk * kasus
90
100,0%
0
0,0%
90
100,0%
ras * kasus
90
100,0%
0
0,0%
90
100,0%
urutan * kasus
90
100,0%
0
0,0%
90
100,0%
kesimpulan * kasus
90
100,0%
0
0,0%
90
100,0%
jk * kasus
Crosstab
kasus
kasus
jk
Laki-laki
Count
14
28
14,0
14,0
28,0
% within jk
50,0%
50,0%
100,0%
% within kasus
31,1%
31,1%
31,1%
31
31
62
31,0
31,0
62,0
% within jk
50,0%
50,0%
100,0%
% within kasus
68,9%
68,9%
68,9%
45
45
90
45,0
45,0
90,0
50,0%
50,0%
100,0%
100,0%
100,0%
100,0%
Count
Expected Count
Total
Total
14
Expected Count
Perempuan
kontrol
Count
Expected Count
% within jk
% within kasus
Universitas Sumatera Utara
86
Chi-Square Tests
Value
Pearson Chi-Square
Continuity Correction
df
a
1
1,000
,000
1
1,000
,000
1
1,000
,000
b
Likelihood Ratio
Asymp. Sig. (2sided)
Fisher's Exact Test
N of Valid Cases
Exact
Sig. (1sided)
Exact Sig. (2sided)
1,000
,590
90
a. 0 cells (0,0%) have expected count less than 5. The minimum expected count is 14,00.
b. Computed only for a 2x2 table
Risk Estimate
95% Confidence Interval
Value
Odds Ratio for jk (Laki-laki /
Lower
Upper
1,000
,410
2,441
For cohort kasus = kasus
1,000
,640
1,562
For cohort kasus = kontrol
1,000
,640
1,562
Perempuan)
N of Valid Cases
90
Universitas Sumatera Utara
87
katumur * kasus Crosstabulation
kasus
kasus
katumur
31-35
Count
8
16
8,0
8,0
16,0
% within katumur
50,0%
50,0%
100,0%
% within kasus
17,8%
17,8%
17,8%
10
10
20
10,0
10,0
20,0
% within katumur
50,0%
50,0%
100,0%
% within kasus
22,2%
22,2%
22,2%
8
8
16
8,0
8,0
16,0
% within katumur
50,0%
50,0%
100,0%
% within kasus
17,8%
17,8%
17,8%
9
9
18
9,0
9,0
18,0
% within katumur
50,0%
50,0%
100,0%
% within kasus
20,0%
20,0%
20,0%
7
7
14
7,0
7,0
14,0
% within katumur
50,0%
50,0%
100,0%
% within kasus
15,6%
15,6%
15,6%
3
3
6
3,0
3,0
6,0
50,0%
50,0%
100,0%
6,7%
6,7%
6,7%
45
45
90
45,0
45,0
90,0
50,0%
50,0%
100,0%
100,0%
100,0%
100,0%
Count
Expected Count
41-45
Count
Expected Count
46-50
Count
Expected Count
51-55
Count
Expected Count
56-60
Count
Expected Count
% within katumur
% within kasus
Total
Total
8
Expected Count
36-40
kontrol
Count
Expected Count
% within katumur
% within kasus
Universitas Sumatera Utara
88
ras * kasus
Crosstab
kasus
kasus
ras
Aceh
Count
3
6
3,0
3,0
6,0
50,0%
50,0%
100,0%
6,7%
6,7%
6,7%
9
9
18
9,0
9,0
18,0
% within ras
50,0%
50,0%
100,0%
% within kasus
20,0%
20,0%
20,0%
3
3
6
3,0
3,0
6,0
50,0%
50,0%
100,0%
6,7%
6,7%
6,7%
2
2
4
2,0
2,0
4,0
50,0%
50,0%
100,0%
4,4%
4,4%
4,4%
1
1
2
1,0
1,0
2,0
50,0%
50,0%
100,0%
2,2%
2,2%
2,2%
15
15
30
15,0
15,0
30,0
% within ras
50,0%
50,0%
100,0%
% within kasus
33,3%
33,3%
33,3%
4
4
8
4,0
4,0
8,0
50,0%
50,0%
100,0%
8,9%
8,9%
8,9%
6
6
12
6,0
6,0
12,0
% within ras
50,0%
50,0%
100,0%
% within kasus
13,3%
13,3%
13,3%
2
2
4
% within ras
% within kasus
Count
Expected Count
Batak Toba
Count
Expected Count
% within ras
% within kasus
Cina
Count
Expected Count
% within ras
% within kasus
India
Count
Expected Count
% within ras
% within kasus
Jawa
Count
Expected Count
Karo
Count
Expected Count
% within ras
% within kasus
Melayu
Count
Expected Count
Padang
Total
3
Expected Count
Batak Mandailing
kontrol
Count
Universitas Sumatera Utara
89
Expected Count
% within ras
2,0
2,0
4,0
50,0%
50,0%
100,0%
4,4%
4,4%
4,4%
45
45
90
45,0
45,0
90,0
50,0%
50,0%
100,0%
100,0%
100,0%
100,0%
% within kasus
Total
Count
Expected Count
% within ras
% within kasus
Chi-Square Tests
Value
Pearson Chi-Square
df
a
8
1,000
,000
8
1,000
,000
Likelihood Ratio
N of Valid Cases
Asymp. Sig. (2-sided)
90
a. 12 cells (66,7%) have expected count less than 5. The minimum expected count is 1,00.
Risk Estimate
Value
Odds Ratio for ras (Aceh / Batak Mandailing)
a
a. Risk Estimate statistics cannot be computed. They are only computed for a 2*2 table without
empty cells.
Universitas Sumatera Utara
90
urutan * kasus
Crosstab
kasus
kasus
urutan
cc
Gc
GG
Total
Count
kontrol
Total
4
7
11
Expected Count
5,5
5,5
11,0
% within urutan
36,4%
63,6%
100,0%
% within kasus
8,9%
15,6%
12,2%
20
27
47
Expected Count
23,5
23,5
47,0
% within urutan
42,6%
57,4%
100,0%
% within kasus
44,4%
60,0%
52,2%
21
11
32
Expected Count
16,0
16,0
32,0
% within urutan
65,6%
34,4%
100,0%
% within kasus
46,7%
24,4%
35,6%
45
45
90
Expected Count
45,0
45,0
90,0
% within urutan
50,0%
50,0%
100,0%
% within kasus
100,0%
100,0%
100,0%
Count
Count
Count
Chi-Square Tests
Value
Pearson Chi-Square
Likelihood Ratio
N of Valid Cases
df
Asymp. Sig. (2-sided)
a
2
,083
5,053
2
,080
4,986
90
a. 0 cells (0,0%) have expected count less than 5. The minimum expected count is 5,50.
Universitas Sumatera Utara
91
Risk Estimate
Value
a
Odds Ratio for urutan (cc / Gc)
a. Risk Estimate statistics cannot be computed. They are only computed for a 2*2 table without
empty cells.
kesimpulan * kasus
Crosstab
kasus
kasus
kesimpulan
Heterozigot
Count
27
47
23,5
23,5
47,0
% within kesimpulan
42,6%
57,4%
100,0%
% within kasus
44,4%
60,0%
52,2%
21
11
32
16,0
16,0
32,0
% within kesimpulan
65,6%
34,4%
100,0%
% within kasus
46,7%
24,4%
35,6%
4
7
11
5,5
5,5
11,0
36,4%
63,6%
100,0%
8,9%
15,6%
12,2%
45
45
90
45,0
45,0
90,0
50,0%
50,0%
100,0%
100,0%
100,0%
100,0%
Count
Expected Count
Homozigot resesif
Count
Expected Count
% within kesimpulan
% within kasus
Total
Total
20
Expected Count
Homozigot dominan
kontrol
Count
Expected Count
% within kesimpulan
% within kasus
Chi-Square Tests
Value
Pearson Chi-Square
Likelihood Ratio
N of Valid Cases
df
Asymp. Sig. (2-sided)
a
2
,083
5,053
2
,080
4,986
90
a. 0 cells (0,0%) have expected count less than 5. The minimum expected count is 5,50.
Universitas Sumatera Utara
92
Risk Estimate
Value
Odds Ratio for kesimpulan (Heterozigot / Homozigot dominan)
a
a. Risk Estimate statistics cannot be computed. They are only computed for a 2*2 table without
empty cells.
Case Processing Summary
Cases
Valid
kasus
umur
N
Missing
Percent
N
Total
Percent
N
Percent
kasus
45
100,0%
0
0,0%
45
100,0%
kontrol
45
100,0%
0
0,0%
45
100,0%
Descriptives
kasus
umur
kasus
Statistic
Mean
43,38
95% Confidence Interval for
Lower Bound
41,00
Mean
Upper Bound
45,75
5% Trimmed Mean
43,19
Median
44,00
Variance
7,904
Minimum
31
Maximum
60
Range
29
Interquartile Range
14
Skewness
Kurtosis
Mean
,190
,354
-1,018
,695
43,38
1,178
95% Confidence Interval for
Lower Bound
41,00
Mean
Upper Bound
45,75
5% Trimmed Mean
43,19
Median
44,00
Variance
Std. Deviation
1,178
62,468
Std. Deviation
kontrol
Std. Error
62,468
7,904
Minimum
31
Maximum
60
Universitas Sumatera Utara
93
Range
29
Interquartile Range
14
Skewness
Kurtosis
,190
,354
-1,018
,695
Tests of Normality
Kolmogorov-Smirnov
kasus
umur
Statistic
df
a
Shapiro-Wilk
Sig.
Statistic
df
Sig.
kasus
,123
45
,083
,958
45
,099
kontrol
,123
45
,083
,958
45
,099
a. Lilliefors Significance Correction
Crosstabs
Case Processing Summary
Cases
Valid
N
alel * kasus
Missing
Percent
79
100,0%
N
Total
Percent
0
N
0,0%
Percent
79
100,0%
alel * kasus Crosstabulation
kasus
kasus
alel
GG
Count
11
32
16,6
15,4
32,0
% within alel
65,6%
34,4%
100,0%
% within kasus
51,2%
28,9%
40,5%
20
27
47
24,4
22,6
47,0
% within alel
42,6%
57,4%
100,0%
% within kasus
48,8%
71,1%
59,5%
41
38
79
41,0
38,0
79,0
51,9%
48,1%
100,0%
100,0%
100,0%
100,0%
Count
Expected Count
Total
Total
21
Expected Count
GC
kontrol
Count
Expected Count
% within alel
% within kasus
Universitas Sumatera Utara
94
Chi-Square Tests
Value
Pearson Chi-Square
Continuity Correction
Likelihood Ratio
Exact Sig. (2-
Exact Sig. (1-
(2-sided)
sided)
sided)
df
a
1
,044
3,188
1
,074
4,110
1
,043
4,059
b
Asymp. Sig.
Fisher's Exact Test
,066
Linear-by-Linear
4,008
Association
N of Valid Cases
1
,037
,045
79
a. 0 cells (0,0%) have expected count less than 5. The minimum expected count is 15,39.
b. Computed only for a 2x2 table
Risk Estimate
95% Confidence Interval
Value
Odds Ratio for alel (GG / GC)
Lower
Upper
2,577
1,016
6,538
For cohort kasus = kasus
1,542
1,017
2,338
For cohort kasus = kontrol
,598
,349
1,025
N of Valid Cases
79
Crosstabs
Case Processing Summary
Cases
Valid
N
alel * kasus
Missing
Percent
58
100,0%
N
Total
Percent
0
N
0,0%
Percent
58
100,0%
Universitas Sumatera Utara
95
alel * kasus Crosstabulation
kasus
kasus
alel
GC
kontrol
Count
20
27
47
19,4
27,6
47,0
% within alel
42,6%
57,4%
100,0%
% within kasus
83,3%
79,4%
81,0%
4
7
11
4,6
6,4
11,0
% within alel
36,4%
63,6%
100,0%
% within kasus
16,7%
20,6%
19,0%
24
34
58
24,0
34,0
58,0
41,4%
58,6%
100,0%
100,0%
100,0%
100,0%
Expected Count
CC
Count
Expected Count
Total
Total
Count
Expected Count
% within alel
% within kasus
Chi-Square Tests
Value
Pearson Chi-Square
Continuity Correction
df
Likelihood Ratio
Exact Sig. (2-
Exact Sig. (1-
(2-sided)
sided)
sided)
a
1
,708
,001
1
,972
,142
1
,706
,141
b
Asymp. Sig.
Fisher's Exact Test
Linear-by-Linear
Association
N of Valid Cases
1,000
,138
1
,491
,710
58
a. 1 cells (25,0%) have expected count less than 5. The minimum expected count is 4,55.
b. Computed only for a 2x2 table
Risk Estimate
95% Confidence Interval
Value
Odds Ratio for alel (GC / CC)
Lower
Upper
1,296
,333
5,039
For cohort kasus = kasus
1,170
,500
2,736
For cohort kasus = kontrol
,903
,542
1,503
N of Valid Cases
58
Universitas Sumatera Utara
96
Crosstabs
Case Processing Summary
Cases
Valid
N
alel * kasus
Missing
Percent
43
N
100,0%
Total
Percent
0
N
Percent
0,0%
43
100,0%
alel * kasus Crosstabulation
kasus
kasus
alel
GG
Count
11
32
18,6
13,4
32,0
% within alel
65,6%
34,4%
100,0%
% within kasus
84,0%
61,1%
74,4%
4
7
11
6,4
4,6
11,0
% within alel
36,4%
63,6%
100,0%
% within kasus
16,0%
38,9%
25,6%
25
18
43
25,0
18,0
43,0
58,1%
41,9%
100,0%
100,0%
100,0%
100,0%
Asymp. Sig.
Exact Sig. (2-
Exact Sig. (1-
(2-sided)
sided)
sided)
Count
Expected Count
Total
Total
21
Expected Count
CC
kontrol
Count
Expected Count
% within alel
% within kasus
Chi-Square Tests
Value
Pearson Chi-Square
Continuity Correction
Likelihood Ratio
1
,090
1,803
1
,179
2,862
1
,091
2,880
b
df
a
Fisher's Exact Test
Linear-by-Linear
Association
,156
2,813
N of Valid Cases
1
,090
,094
43
a. 1 cells (25,0%) have expected count less than 5. The minimum expected count is 4,60.
b. Computed only for a 2x2 table
Universitas Sumatera Utara
97
Risk Estimate
95% Confidence Interval
Value
Odds Ratio for alel (GG / CC)
Lower
Upper
3,341
,801
13,943
For cohort kasus = kasus
1,805
,794
4,102
For cohort kasus = kontrol
,540
,281
1,040
N of Valid Cases
43
Universitas Sumatera Utara