Sinergi Perguruan Tinggi, Penelitian dan Industri Untuk Menciptakan Produk Yang Berkualitas
Sinergi Perguruan Tinggi, Penelitian dan Industri Untuk Menciptakan Produk Yang Berkualitas
Antonius Darma Setiawan Konferensi Nasional Teknologi Informasi dan Komunikasi 2016 Universities Kristen Data Wacana
Inovasi e-Health dan Biomedika Untuk Indonesia KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana Antonius Darma Setiawan
Agenda
- Pendahuluan
- Hubungan Sinergi PT - Industri
- SIMRS dan Rekam Medis
- PACS
- Telemedecine
- Penutup
Agenda
- Pendahuluan
- Hubungan Sinergi PT - Industri
- SIMRS dan Rekam Medis
- PACS
- Telemedecine
- Penutup
Antonius Darma Setiawan KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana
Antonius Darma Setiawan
Direktur Riset, Pengembangan Bisnis, dan Kemitraan Strategis PT. Jasamedika Saranatama
Chief Executive Officer PT. Logiq Aset Solusindo
Sistem Informasi Kesehatan: SIMRS dan Telemedicine Computerized Maintenance and Management System (CMMS) dan Inspection tools KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana Antonius Darma Setiawan
PT. Jasamedika Saranatama
- Didirikan than 2002
- 135 karyawan
- Produk utama: SIMRS Medifirst 2000
- Terimplementasi di ~ 40 rumah sakit kelas A, B, C, dan D
- Mengembangkan solusi untuk industri kesehatan (software dan hardware)
- Kemitraan nasional dan international
Antonius Darma Setiawan KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana
Mitra Strategis
Antonius Darma Setiawan KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana
Antonius Darma Setiawan KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana Antonius Darma Setiawan
Agenda
- Pendahuluan
- Hubungan Sinergi PT - Industri
- SIMRS dan Rekam Medis
- PACS
- Telemedecine
- Penutup
Antonius Darma Setiawan KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana
Perguruan Tinggi
SDM
Penelitian Industri KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana Antonius Darma Setiawan
Supply and Demand Perguruan
Industri
Tinggi
Dosen Killer App/Product SDM
Mahasiswa Real Problem Laboratorium
Disruptive Product/ Technology Penelitian KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana Antonius Darma Setiawan
Agenda
- Pendahuluan
- Hubungan Sinergi PT - Industri
- SIMRS dan Rekam Medis
- PACS
- Telemedecine
- Kesimpulan
Antonius Darma Setiawan KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana
Rekapitulasi data, pelaporan, dan business intellegence Pemeliharaan, pencatatan, dan pengarsipan data terkait
Penginputan data KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana Antonius Darma Setiawan
Jumlah total rumah sakit di Indonesia ~ 2.500 buah Jumlah puskesmas di Indonesia ~ 9.600 buah Jumlah klinik di Indonesia ~ 15.000 - 20.000 Jumlah dokter yang terdaftar IDI ~ 88.000
Antonius Darma Setiawan KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana
Antonius Darma Setiawan KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana
Antonius Darma Setiawan KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana Antonius Darma Setiawan
Tantangan
- Belum terdapat standarisasi struktur data di dalam rekam medik
- Setiap rumah sakit memiliki SOP (clinical pathway) yang sedikit berbeda
- Rekam medik yang dapat dipertukarkan (sharable)
- Rekam medik yang longitudinal
Antonius Darma Setiawan KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana
Antonius Darma Setiawan KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana
Rekam Medik Longitudinal KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana Antonius Darma Setiawan
OpenEHR
- Yayasan yang tidak bertujuan profit berbasis di UCL (University of London) CHIME (World Health Organisation Collaborating Centre for the Community Control of Hereditary Disorders)
- Menghasilkan spesifikasi terbuka (open specification) untuk model informasi klinis (komersial dan opensource)
- Mengembangkan spesifikasi konten klinis opensource berdasarkan: archetype, template dan termset
Pengembangan Standar Konten Klinis
- Memisahkan model klinis dari infrastruktur
teknis
- OpenEHR adalah cara yang sesuai untuk mengembangkan standar konten klinis secara nasional/internasional
- Australia, New Zealand, Swedia, Brasil, dan Slovenia
Pendekatan OpenEHR
- Arsitektur semantik , melakukan standarisasi secara fleksibel :
data, struktur konten, penggunaan terminologi, dan API
- Konten dikembangkan oleh klinisi
- Pengembangan sistem yang mampu beradaptasi – S/W tidak bergantung pada model konten
- Query berdasarkan konten , bukan basisdata secara fisik
- Service-Oriented Architechture (SOA) – melakukan standarisasi bagaimana aplikasi berkomunikasi dengan sistem – API
- Dan bagaimana sistem berkomunikasi satu dengan yang lain
Antonius Darma Setiawan KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana
OpenEHR: Multi Level Model KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana Antonius Darma Setiawan
Reference Model
- Artefak teknis generik yang spesifik untuk menampilkan informasi kesehatan :
- Tipe dan struktur data
- Pengaturan rekam medis
- Keamanan
- Versioning
- Tidak ditampilkan untuk klinisi
Antonius Darma Setiawan KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana
Archetype
Antonius Darma Setiawan KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana
Archetype Editor
Antonius Darma Setiawan KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana
Archetype Editor
Antonius Darma Setiawan KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana
Template
Antonius Darma Setiawan KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana
Antonius Darma Setiawan KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana
Template dan Terminologi
Antonius Darma Setiawan KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana
Antonius Darma Setiawan KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana
Antonius Darma Setiawan KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana Antonius Darma Setiawan
Apa Yang Disediakan Oleh OpenEHR?
- Model informasi logik standar yang menjelaskan tentang tipe data dasar dan struktur relasi
- Kemampuan untuk membangun model konten yang terbuka dan dapat dipercaya
- Reliable, menggunakan terminologi yang
sudah dikenal KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana Antonius Darma Setiawan
Agenda
- Pendahuluan
- Hubungan Sinergi PT - Industri
- SIMRS dan Rekam Medis
- RIS - PACS
- Telemedecine
- Penutup
Antonius Darma Setiawan KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana
Modalitas Pencitraan Medik
magnetic spin sound waves X-ray metabolic tracer Ultrasound
Antonius Darma Setiawan KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana
Alur Sebelum RIS - PACS
Antonius Darma Setiawan KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana
Alur Setelah RIS - PACS
Antonius Darma Setiawan KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana
Ukuran Citra Medik
Antonius Darma Setiawan KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana
Ukuran Citra Medik
Antonius Darma Setiawan KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana
Kompresi? Kualitas Diagnostik !
Media Penyimpanan/Bandwidth? Standar
Antonius Darma Setiawan KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana Antonius Darma Setiawan
Pengkodean Citra Kuantisasi
Vektor AsimetrikSetiawan A.D. dan Suksmono A. B. Citra terkode Decoding Kirim data posisi RoI ( I = IR + R ) RoI
Residu citra sesuai RoI dikirimkan untuk
meningkatkan kualitas
citra rekonstruksi di RoIPilih RoI Residu Citra sesuai posisi RoI Residu Citra (R) – 1 MB
- , * min , ; , ,
m ik k k i
⎝ ⎠ ⎢ ⎥ ⎣ ⎦
⎡ ⎤ ⎛ ⎞ ⎢ ⎥ = ⎜ ⎟ ⎢ ⎥ ⎜ ⎟
− − =
1 m c ik ik j jk d u d
1
2
1
1
∑ ∑
= = =
N m ik k u x p u
∑∑ P U P U P U X x p
= ⎨ ⎬ ⎩ ⎭
⎧ ⎫ =
= =
J c m u d
FCM ik ik k i i k
, c N m
1
1
2 ,
( ) ( ) ( ) ( )
Pembentukan Buku Kode
Berbasis FCM ( )Antonius Darma Setiawan KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana
- 2
- 1
∑ KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana Antonius Darma Setiawan
Pembentukan Buku Kode k
: ℜ → Q C k
: ℜ → E J k
Antonius Darma Setiawan KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana
FCM Clustering m=1.25 m=2
Grafik tingkat keanggotaan per kelas m=1.25
Grafik tingkat keanggotaan per kelas m=2
Antonius Darma Setiawan KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana
Antonius Darma Setiawan KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana
K-Means
Antonius Darma Setiawan KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana
FCM
Antonius Darma Setiawan KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana
Antonius Darma Setiawan KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana
Peningkatan Kinerja KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana Antonius Darma Setiawan
Compresible dan Sparse
- Pemampatan: menurunkan alokasi bit
- Nature dari sebuah citra adalah compresible
- Compresible: Jika koefisien representasi yang
diurutkan meluruh dengan cepat
- Sparse: Jika terdapat sejumlah kecil koefisien
representasi tidak nol, sisanya nol
- Sifat sparse pada citra dapat dipaksakan
- Sparsitas : Jumlah koefisien representasi tidak nol
Pemodelan Citra Sparse Jika D adalah pustaka basis overcomplete, maka sinyal Y dapat dibentuk dari kombinasi linear dari koefisien sparse/representasi X dan pustaka basis D
Y D
X KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana Antonius Darma Setiawan
Pemodelan Citra Sparse
Jika D adalah pustaka basis overcomplete, maka sinyal Y dapat dibentuk dari kombinasi linear dari koefisien sparse/representasi X dan pustaka basis D KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana Antonius Darma Setiawan
Pemodelan Citra Sparse Jika D adalah pustaka basis overcomplete, maka sinyal Y dapat dibentuk dari kombinasi linear dari koefisien sparse/representasi X dan pustaka basis D
P min ( ) x s.t Y = Dx x
P ε min x s.t y − Dx ≤
ε 0,
( ) x KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana Antonius Darma Setiawan
Kombinasi Linear L
Citra
Y
ˆ , k y d
L = 4 i = ∑ j j j=1
L − ∀i, y k d i ∑ j j < ε j=1
Konstanta Basis k j d
Basis Representasi j
Pustaka Lewat Lengkap (overcomplete) K
D = d KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana Antonius Darma Setiawan
Dasar Pemikiran Metoda Sparsitas
DinamikMatrik sparse untuk koefisien X
Seluruh vektor citra direpresentasiskan dengan sparsitas yang sama, bahkan untuk vektor citra dengan nilai nol
Semakin tinggi energi, semakin besar galat KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana Antonius Darma Setiawan
Area Dengan g Kecil g : beda antara intensitas maksimum dan minimum dalam vektor citra
Seluruh vektor citra dikodekan 25% vektor citra dikodekan dengan dengan sparsitas = L sparsitas = 1 (satu) KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana Antonius Darma Setiawan
Metoda Sparsitas Dinamik Sparsitas Dinamik (PCSD)
2 min s.t
Y − DX ∀i, x ≤ f (E, g) i F
D,X
p y i
∑ g max min
⎧ = I − I
1=1 , g ≤ g
⎪ p
Jarak antara intensitas piksel ⎨ f (E, g) = maksimum dan minimum
⎪ E
⎩ L L
, g > g + max g
E
dan ditentukan max L
- !
- !
⎤ ⎦⎥ ⎡ ⎣⎢
H ( )
mp
id
co ( )
L i i=1
L ∑
! b id
= log
2 p
2 R ( )
B ec
⎠ ⎟ = v
=
vH
H ( )
mp
id
co ( )
NL !
CR = b s b id
co ⎛ ⎝ ⎜ ⎞
⎠ ⎟ p
H
⎛ ⎝ ⎜ ⎞
2 L !
L ∑
Antonius Darma Setiawan KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana
Jumlah Koefisien Tak-Nol, Dimensi Vektor
Citra dan Ukuran Citra Terkode Header, 4 x16 bitBasis Index, 16 bit per index Koefisien, 16 bit per index
Pemetaan Jumlah Koefisien, 8 bit Ukuran Citra Terkode (Kilo Byte)
! !"
= !" + ! !"#
!"#
!"#$$ !
B ec
= v H
H ( )
mp L i i=1
L ∑
⎛ ⎝ ⎜ ⎞
⎠ ⎟
id L i i=1
L ∑
⎛ ⎝ ⎜ ⎞
- B
- b
- b
- B
- b
- b
- b
- B
- b
- b
- b
- b
⎠ ⎟
co L i i=1
- b
Pengujian Pada Citra Natural: Citra Latih dan Pustaka Basis
Citra Latih, University of Southern California-SIPI image database Pustaka Basis Latih, p = 8, Redudansi = 4 KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana Antonius Darma Setiawan
Pengujian Pada Citra Natural FVQ 0.14 bpp, PSNR = 30.95 PCSD 0.14 bpp, PSNR = 36.14 KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana Antonius Darma Setiawan
Pengujian Pada Citra Natural FVQ 0.2 bpp, perbesaran 200% PCSD 0.2 bpp, perbesaran 200% KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana Antonius Darma Setiawan
Pengujian Pada Citra MRI Otak
Citra Latih: Penginderaan MRI Otak Secara Axial, Sumber: Osirix KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana Antonius Darma Setiawan
Pengujian Pada Citra MRI Otak
Pustaka Basis Latih, p = 8 Redudansi = 4 Citra Uji
Antonius Darma Setiawan KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana
Citra Rekonstruksi Citra Asal
Citra rekonstruksi dengan pengkodean p = 16, L =10, PSNR = 37.72 dB KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana Antonius Darma Setiawan
Pengujian Pada Citra Medik
Chest PA Ukuran file: 12.2 MBDepth: 8 bit
Dimensi: 3480 x 3480 piksel Pustaka basis dengan p = 16 dan L = 4
Antonius Darma Setiawan KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana
Kinerja PCSD Pada Citra Chest PA
Patch: 32 PSNR 37.91 dB CR: 46.08
Patch: 32 PSNR 37.92 dB CR: 64.58
Antonius Darma Setiawan KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana
Citra Asal KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana Antonius Darma Setiawan
JPEG 0.1 bpp, PSNR 34.1 dB JPEG 0.1 bpp
Antonius Darma Setiawan KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana
JPEG 2000 0.1 bpp, PSNR 40.8 dB
Antonius Darma Setiawan KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana
PCSD 0.1 bpp, PSNR 41.12 dB
Antonius Darma Setiawan KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana Antonius Darma Setiawan
10.1” Android Tablet 22” LCD Touchscreen KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana Antonius Darma Setiawan
Teleradiologi
FK UNPAD – RSUD Jampang Kulon (Kelas C). Ada fasilitas pencitraan konvensional tanpa cardiolog. Butuh 7 hari untuk mendapatkan ekspertise dari Sukabumi dan Anyer. KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana Antonius Darma Setiawan
Agenda
- Pendahuluan
- Hubungan Sinergi PT - Industri
- SIMRS dan Rekam Medis
- PACS
- Telemedecine
- Penutup
Antonius Darma Setiawan KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana Antonius Darma Setiawan
Prevalensi Sumber: WHO Global Status Report 2014
Antonius Darma Setiawan KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana
Antonius Darma Setiawan KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana
Antonius Darma Setiawan KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana
Antonius Darma Setiawan KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana
Antonius Darma Setiawan KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana
Antonius Darma Setiawan KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana
Antonius Darma Setiawan KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana
Antonius Darma Setiawan KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana
Antonius Darma Setiawan KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana Antonius Darma Setiawan
Agenda
- Pendahuluan
- Hubungan Sinergi PT - Industri
- SIMRS dan Rekam Medis
- PACS
- Telemedecine
- Penutup
Penutup
- Diperlukan sinergi yang kuat antara PT dan industri agar dapat menghasilkan SDM yang berdaya guna
- Sinergi ini juga akan memperkuat kualitas produk dari sisi teknologi yang dihasilkan oleh industri dalam negeri
- Hasil penelitian-penelitian PT dapat dikomersialisasikan oleh industri dalam hubungan sinergi yang saling menguntungkan
Antonius Darma Setiawan KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana
Terima Kasih