Sinergi Perguruan Tinggi, Penelitian dan Industri Untuk Menciptakan Produk Yang Berkualitas

  Sinergi Perguruan Tinggi, Penelitian dan Industri Untuk Menciptakan Produk Yang Berkualitas

  Antonius Darma Setiawan Konferensi Nasional Teknologi Informasi dan Komunikasi 2016 Universities Kristen Data Wacana

  Inovasi e-Health dan Biomedika Untuk Indonesia KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana Antonius Darma Setiawan

Agenda

  • Pendahuluan
  • Hubungan Sinergi PT - Industri
  • SIMRS dan Rekam Medis
  • PACS
  • Telemedecine
  • Penutup
KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana Antonius Darma Setiawan

  Agenda

  • Pendahuluan
  • Hubungan Sinergi PT - Industri
  • SIMRS dan Rekam Medis
  • PACS
  • Telemedecine
  • Penutup

  Antonius Darma Setiawan KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana

Antonius Darma Setiawan

  Direktur Riset, Pengembangan Bisnis, dan Kemitraan Strategis PT. Jasamedika Saranatama

  Chief Executive Officer PT. Logiq Aset Solusindo

  Sistem Informasi Kesehatan: SIMRS dan Telemedicine Computerized Maintenance and Management System (CMMS) dan Inspection tools KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana Antonius Darma Setiawan

PT. Jasamedika Saranatama

  • Didirikan than 2002
  • 135 karyawan
  • Produk utama: SIMRS Medifirst 2000
  • Terimplementasi di ~ 40 rumah sakit kelas A, B, C, dan D
  • Mengembangkan solusi untuk industri kesehatan (software dan hardware)
  • Kemitraan nasional dan international

  Antonius Darma Setiawan KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana

  

Mitra Strategis

  Antonius Darma Setiawan KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana

  Antonius Darma Setiawan KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana Antonius Darma Setiawan

  Agenda

  • Pendahuluan
  • Hubungan Sinergi PT - Industri
  • SIMRS dan Rekam Medis
  • PACS
  • Telemedecine
  • Penutup

  Antonius Darma Setiawan KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana

Perguruan Tinggi

  

SDM

  Penelitian Industri KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana Antonius Darma Setiawan

  Supply and Demand Perguruan

  Industri

Tinggi

  Dosen Killer App/Product SDM

  Mahasiswa Real Problem Laboratorium

  Disruptive Product/ Technology Penelitian KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana Antonius Darma Setiawan

  Agenda

  • Pendahuluan
  • Hubungan Sinergi PT - Industri
  • SIMRS dan Rekam Medis
  • PACS
  • Telemedecine
  • Kesimpulan

  Antonius Darma Setiawan KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana

  Rekapitulasi data, pelaporan, dan business intellegence Pemeliharaan, pencatatan, dan pengarsipan data terkait

  Penginputan data KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana Antonius Darma Setiawan

  Jumlah total rumah sakit di Indonesia ~ 2.500 buah Jumlah puskesmas di Indonesia ~ 9.600 buah Jumlah klinik di Indonesia ~ 15.000 - 20.000 Jumlah dokter yang terdaftar IDI ~ 88.000

  Antonius Darma Setiawan KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana

  Antonius Darma Setiawan KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana

  Antonius Darma Setiawan KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana Antonius Darma Setiawan

Tantangan

  • Belum terdapat standarisasi struktur data di dalam rekam medik
  • Setiap rumah sakit memiliki SOP (clinical pathway) yang sedikit berbeda
  • Rekam medik yang dapat dipertukarkan (sharable)
  • Rekam medik yang longitudinal

  Antonius Darma Setiawan KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana

  Antonius Darma Setiawan KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana

  Rekam Medik Longitudinal KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana Antonius Darma Setiawan

OpenEHR

  • Yayasan yang tidak bertujuan profit berbasis di UCL (University of London) CHIME (World Health Organisation Collaborating Centre for the Community Control of Hereditary Disorders)
  • Menghasilkan spesifikasi terbuka (open specification) untuk model informasi klinis (komersial dan opensource)
  • Mengembangkan spesifikasi konten klinis opensource berdasarkan: archetype, template dan termset
KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana Antonius Darma Setiawan

  Pengembangan Standar Konten Klinis

  • Memisahkan model klinis dari infrastruktur

  teknis

  • OpenEHR adalah cara yang sesuai untuk mengembangkan standar konten klinis secara nasional/internasional
  • Australia, New Zealand, Swedia, Brasil, dan Slovenia
KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana Antonius Darma Setiawan

  Pendekatan OpenEHR

  • Arsitektur semantik , melakukan standarisasi secara fleksibel :

  data, struktur konten, penggunaan terminologi, dan API

  • Konten dikembangkan oleh klinisi
  • Pengembangan sistem yang mampu beradaptasi – S/W tidak bergantung pada model konten
  • Query berdasarkan konten , bukan basisdata secara fisik
  • Service-Oriented Architechture (SOA) – melakukan standarisasi bagaimana aplikasi berkomunikasi dengan sistem – API
  • Dan bagaimana sistem berkomunikasi satu dengan yang lain

  Antonius Darma Setiawan KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana

  OpenEHR: Multi Level Model KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana Antonius Darma Setiawan

  Reference Model

  • Artefak teknis generik yang spesifik untuk menampilkan informasi kesehatan :
  • Tipe dan struktur data
  • Pengaturan rekam medis
  • Keamanan
  • Versioning
  • Tidak ditampilkan untuk klinisi

  Antonius Darma Setiawan KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana

  Archetype

  Antonius Darma Setiawan KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana

  Archetype Editor

  Antonius Darma Setiawan KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana

  Archetype Editor

  Antonius Darma Setiawan KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana

  Template

  Antonius Darma Setiawan KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana

  Antonius Darma Setiawan KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana

  Template dan Terminologi

  Antonius Darma Setiawan KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana

  Antonius Darma Setiawan KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana

  Antonius Darma Setiawan KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana Antonius Darma Setiawan

  Apa Yang Disediakan Oleh OpenEHR?

  • Model informasi logik standar yang menjelaskan tentang tipe data dasar dan struktur relasi
  • Kemampuan untuk membangun model konten yang terbuka dan dapat dipercaya
  • Reliable, menggunakan terminologi yang

  sudah dikenal KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana Antonius Darma Setiawan

  Agenda

  • Pendahuluan
  • Hubungan Sinergi PT - Industri
  • SIMRS dan Rekam Medis
  • RIS - PACS
  • Telemedecine
  • Penutup

  Antonius Darma Setiawan KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana

Modalitas Pencitraan Medik

  magnetic spin sound waves X-ray metabolic tracer Ultrasound

  Antonius Darma Setiawan KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana

  Alur Sebelum RIS - PACS

  Antonius Darma Setiawan KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana

  Alur Setelah RIS - PACS

  Antonius Darma Setiawan KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana

  Ukuran Citra Medik

  Antonius Darma Setiawan KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana

  Ukuran Citra Medik

  Antonius Darma Setiawan KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana

  Kompresi? Kualitas Diagnostik !

  Media Penyimpanan/Bandwidth? Standar

  Antonius Darma Setiawan KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana Antonius Darma Setiawan

  

Pengkodean Citra Kuantisasi

Vektor Asimetrik

Setiawan A.D. dan Suksmono A. B. Citra terkode Decoding Kirim data posisi RoI ( I = IR + R ) RoI

  Residu citra sesuai RoI dikirimkan untuk

meningkatkan kualitas

citra rekonstruksi di RoI

  Pilih RoI Residu Citra sesuai posisi RoI Residu Citra (R) – 1 MB

  • , * min , ; , ,

  m ik k k i

  ⎝ ⎠ ⎢ ⎥ ⎣ ⎦

  ⎡ ⎤ ⎛ ⎞ ⎢ ⎥ = ⎜ ⎟ ⎢ ⎥ ⎜ ⎟

  − − =

  1 m c ik ik j jk d u d

  1

  2

  1

  1

  ∑ ∑

  = = =

  N m ik k u x p u

  ∑∑ P U P U P U X x p

  = ⎨ ⎬ ⎩ ⎭

  ⎧ ⎫ =

  = =

  J c m u d

  FCM ik ik k i i k

  , c N m

  1

  1

  2 ,

  ( ) ( ) ( ) ( )

  

Pembentukan Buku Kode

Berbasis FCM ( )

  Antonius Darma Setiawan KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana

  • 2
  • 1

  ∑ KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana Antonius Darma Setiawan

  Pembentukan Buku Kode k

  : ℜ → Q C k

  : ℜ → E J k

  Antonius Darma Setiawan KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana

  FCM Clustering m=1.25 m=2

  Grafik tingkat keanggotaan per kelas m=1.25

  Grafik tingkat keanggotaan per kelas m=2

  Antonius Darma Setiawan KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana

  Antonius Darma Setiawan KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana

  K-Means

  Antonius Darma Setiawan KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana

  FCM

  Antonius Darma Setiawan KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana

  Antonius Darma Setiawan KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana

  Peningkatan Kinerja KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana Antonius Darma Setiawan

  Compresible dan Sparse

  • Pemampatan: menurunkan alokasi bit
  • Nature dari sebuah citra adalah compresible
  • Compresible: Jika koefisien representasi yang

  diurutkan meluruh dengan cepat

  • Sparse: Jika terdapat sejumlah kecil koefisien

  representasi tidak nol, sisanya nol

  • Sifat sparse pada citra dapat dipaksakan
  • Sparsitas : Jumlah koefisien representasi tidak nol
KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana Antonius Darma Setiawan

  Pemodelan Citra Sparse Jika D adalah pustaka basis overcomplete, maka sinyal Y dapat dibentuk dari kombinasi linear dari koefisien sparse/representasi X dan pustaka basis D

  Y D

  X KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana Antonius Darma Setiawan

Pemodelan Citra Sparse

  Jika D adalah pustaka basis overcomplete, maka sinyal Y dapat dibentuk dari kombinasi linear dari koefisien sparse/representasi X dan pustaka basis D KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana Antonius Darma Setiawan

  Pemodelan Citra Sparse Jika D adalah pustaka basis overcomplete, maka sinyal Y dapat dibentuk dari kombinasi linear dari koefisien sparse/representasi X dan pustaka basis D

  P min ( ) x s.t Y = Dx x

  P ε min x s.t y Dx

  ε 0,

  ( ) x KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana Antonius Darma Setiawan

  Kombinasi Linear L

  Citra

Y

  ˆ , k y d

  L = 4 i = ∑ j j j=1

  L − ∀i, y k d ij j < ε j=1

  Konstanta Basis k j d

  Basis Representasi j

  Pustaka Lewat Lengkap (overcomplete) K

  D = d KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana Antonius Darma Setiawan

  

Dasar Pemikiran Metoda Sparsitas

Dinamik

Matrik sparse untuk koefisien X

  Seluruh vektor citra direpresentasiskan dengan sparsitas yang sama, bahkan untuk vektor citra dengan nilai nol

  Semakin tinggi energi, semakin besar galat KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana Antonius Darma Setiawan

  Area Dengan g Kecil g : beda antara intensitas maksimum dan minimum dalam vektor citra

  Seluruh vektor citra dikodekan 25% vektor citra dikodekan dengan dengan sparsitas = L sparsitas = 1 (satu) KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana Antonius Darma Setiawan

  Metoda Sparsitas Dinamik Sparsitas Dinamik (PCSD)

  2 min s.t

  Y DXi, xf (E, g) i F

D,X

  p y i

  ∑ g max min

  ⎧ = II

  1=1 , g g

  ⎪ p

  Jarak antara intensitas piksel ⎨ f (E, g) = maksimum dan minimum

  ⎪ E

  ⎩ L L

  , g > g + max g

E

  dan ditentukan max L

  • !
  • !

  ⎤ ⎦⎥ ⎡ ⎣⎢

  H ( )

  mp

  id

  co ( )

  L i i=1

  L

  ! b id

  = log

  2 p

  2 R ( )

  B ec

  ⎠ ⎟ = v

  

=

v

  H

  H ( )

  mp

  id

  co ( )

  NL !

  CR = b s b id

  co ⎛ ⎝ ⎜ ⎞

  ⎠ ⎟ p

  H

  ⎛ ⎝ ⎜ ⎞

  2 L !

  L

  Antonius Darma Setiawan KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana

  

Jumlah Koefisien Tak-Nol, Dimensi Vektor

Citra dan Ukuran Citra Terkode Header, 4 x16 bit

  Basis Index, 16 bit per index Koefisien, 16 bit per index

  Pemetaan Jumlah Koefisien, 8 bit Ukuran Citra Terkode (Kilo Byte)

  ! !"

  = !" + ! !"#

  !"#

  !"#$$ !

  B ec

  = v H

  H ( )

  mp L i i=1

  L

  ⎛ ⎝ ⎜ ⎞

  ⎠ ⎟

  id L i i=1

  L

  ⎛ ⎝ ⎜ ⎞

  • B
  • b
  • b
  • B
  • b
  • b
  • b
  • B
  • b
  • b
  • b

  • b

  ⎠ ⎟

  co L i i=1

  • b
KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana Antonius Darma Setiawan

Pengujian Pada Citra Natural: Citra Latih dan Pustaka Basis

  Citra Latih, University of Southern California-SIPI image database Pustaka Basis Latih, p = 8, Redudansi = 4 KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana Antonius Darma Setiawan

  Pengujian Pada Citra Natural FVQ 0.14 bpp, PSNR = 30.95 PCSD 0.14 bpp, PSNR = 36.14 KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana Antonius Darma Setiawan

  Pengujian Pada Citra Natural FVQ 0.2 bpp, perbesaran 200% PCSD 0.2 bpp, perbesaran 200% KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana Antonius Darma Setiawan

Pengujian Pada Citra MRI Otak

  Citra Latih: Penginderaan MRI Otak Secara Axial, Sumber: Osirix KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana Antonius Darma Setiawan

Pengujian Pada Citra MRI Otak

  Pustaka Basis Latih, p = 8 Redudansi = 4 Citra Uji

  Antonius Darma Setiawan KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana

  Citra Rekonstruksi Citra Asal

  Citra rekonstruksi dengan pengkodean p = 16, L =10, PSNR = 37.72 dB KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana Antonius Darma Setiawan

  

Pengujian Pada Citra Medik

Chest PA Ukuran file: 12.2 MB

Depth: 8 bit

  Dimensi: 3480 x 3480 piksel Pustaka basis dengan p = 16 dan L = 4

  Antonius Darma Setiawan KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana

Kinerja PCSD Pada Citra Chest PA

  Patch: 32 PSNR 37.91 dB CR: 46.08

  Patch: 32 PSNR 37.92 dB CR: 64.58

  Antonius Darma Setiawan KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana

  Citra Asal KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana Antonius Darma Setiawan

  JPEG 0.1 bpp, PSNR 34.1 dB JPEG 0.1 bpp

  Antonius Darma Setiawan KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana

  JPEG 2000 0.1 bpp, PSNR 40.8 dB

  Antonius Darma Setiawan KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana

  PCSD 0.1 bpp, PSNR 41.12 dB

  Antonius Darma Setiawan KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana Antonius Darma Setiawan

  10.1” Android Tablet 22” LCD Touchscreen KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana Antonius Darma Setiawan

Teleradiologi

  FK UNPAD – RSUD Jampang Kulon (Kelas C). Ada fasilitas pencitraan konvensional tanpa cardiolog. Butuh 7 hari untuk mendapatkan ekspertise dari Sukabumi dan Anyer. KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana Antonius Darma Setiawan

  Agenda

  • Pendahuluan
  • Hubungan Sinergi PT - Industri
  • SIMRS dan Rekam Medis
  • PACS
  • Telemedecine
  • Penutup

  Antonius Darma Setiawan KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana Antonius Darma Setiawan

  Prevalensi Sumber: WHO Global Status Report 2014

  Antonius Darma Setiawan KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana

  Antonius Darma Setiawan KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana

  Antonius Darma Setiawan KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana

  Antonius Darma Setiawan KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana

  Antonius Darma Setiawan KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana

  Antonius Darma Setiawan KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana

  Antonius Darma Setiawan KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana

  Antonius Darma Setiawan KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana

  Antonius Darma Setiawan KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana Antonius Darma Setiawan

Agenda

  • Pendahuluan
  • Hubungan Sinergi PT - Industri
  • SIMRS dan Rekam Medis
  • PACS
  • Telemedecine
  • Penutup
KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana Antonius Darma Setiawan

Penutup

  • Diperlukan sinergi yang kuat antara PT dan industri agar dapat menghasilkan SDM yang berdaya guna
  • Sinergi ini juga akan memperkuat kualitas produk dari sisi teknologi yang dihasilkan oleh industri dalam negeri
  • Hasil penelitian-penelitian PT dapat dikomersialisasikan oleh industri dalam hubungan sinergi yang saling menguntungkan

  Antonius Darma Setiawan KNASTIK 2016 Universitas Kristen Duta Wacana

  Terima Kasih