Setelah beroperasi lebih dari 11 tahun, dan yayasan telah mampu memperkerjakan sekitar 40 staf tetap termasuk penggalang dana, pendapatan
Dompet Duafa terus meningkat, lokasi proyek Dompet Dhuafa pun tidak lagi terbatas dipulau jawa saja akan tetapi meluas keseluruh wilayah Indonesia,
sehingga kegiatannya pun bergeser dari sebatas program sosial menjadi pengembangan sumber daya manusia dan ekonomi.
jika di tahun 1993 Dompet Duafa berhasil mengumpulkan dana kurang dari Rp. 100 juta maka pada tahun 1998 meningkat menjadi lebih dari 30 kali
lipat menjadi lebih dari Rp. 3 M, sementara dana yang tergalang pada tahun 2002 sebesar, Rp. 21,7 M. Hal tersebut telah membuktikan bahwa Dompet
Dhuafa Republika telah menjelma seperti sebuah perusahaan managemen ekonomi yang lahir atas dasar sosial, oleh karenanya Dompet dhuafa
memerlukan peningkatan dalam mutunya.
1. Program Pendistribusian dan Pendayagunaan
Pada saat ini ada tiga program utama Dompet Duafa untuk melebarkan sayapnya yakni Program Sosial, Program Pengembangan Ekonomi dan
program Pengembangan Sumber Daya Manusia, ketiga program ini adalah program regular pada DD.
Program sosial membidangi segala hal yang berkaitan langsung kepedulian DD terhadap masyarakat, dalam program ini DD mempunyai LKC
Layanan Kesehatan Cuma-Cuma, layanan ini dididrikan oleh DD pada tanggal 6 November 2001, yakni layanan kesehatan yang diperuntukkan bagi
kaum dhufa secara gratis.
Program kedua pada DD adalah pengembangan sumber daya manusia, program ini termanajemen kedalam Lembaga Pengembangan Insani LPI,
Lembaga ini memiliki tiga program yang bertujuan untuk mendampingi pendidikan masyarakat miskin di Indonesia.
1. Program pertama adalah SMART Ekselensia Indonesia SMART EI yakni
sekolah unggulan berasrama dan bebas biaya, sekolah ini diperuntukkan bagi anak Indonesia yang berprestasi, namun memiliki kendala biaya.
2. Program kedua adalah Makmal Pendidikan, ini adalah program
Laboratorium pendidikan untuk meningkatkan kemampuan para guru dalam mengajar.
3. Program ketiga adalah Beastudi Etos, program ini adalah Beasiswa yang
diperuntukkan bagi para mahasiswa yang berasal dari keluarga dhuafa. Program ketiga DD adalah pengembangan ekonomi yang oleh DD diberi
nama Masyarakat Mandiri yang mana program pemberdayaan ekonomi masyarakat dhuafa adalah program pemberdayaan masyarakat yang dikelola
oleh masyarakat mandiri DD dan berfokus pada aktivitas menumbuhkan budaya kewirausahaan sosial untuk kepentingan pengembangan ekonomi
lokal. Selanjutnya disamping tiga program yang masuk kedalam program regular
serta program-program sosial lainnya, DD juga senantiasa mengembangkan programnya melalui program tahunan yang disesuiakan dengan kebutuhan
masyarakat serta kebutuhan sosial yang dipesan dari para donaturnya.
2. Program Penghimpunan