1. Home
  2. Lainnya

Profil RAPD Polimorfisme Hasil

III. HASIL DAN PEMBAHASAN

3.1 Hasil

3.1.1 Profil RAPD

Keragaman profil RAPD meliputi jumlah dan ukuran fragmen DNA. Hasil amplifikasi dengan menggunakan 3 primer OPA-02, OPA-03 dan OPC-05 menunjukkan hasil yang bervariasi, data selengkapnya disajikan pada Tabel 3. Amplifikasi DNA pada 3 populasi true breeding BEST, Nirwana dan Red NIFI ikan nila uji dapat dilihat pada Gambar 1-3. Sedangkan untuk hasil hibridisasinya dapat dilihat pada Lampiran 6. Gambar 1. Amplifikasi OPA-02 pada ikan nila BEST, Nirwana dan Red NIFI Gambar 2. Amplifikasi OPA-03 pada ikan nila BEST, Nirwana dan Red NIFI Gambar 3. Amplifikasi OPC-05 pada ikan nila BEST, Nirwana dan Red NIFI 3000 bp 1000 bp 500 bp 200 bp 3000 bp 1000 bp 500 bp 200 bp 3000 bp 1000 bp 500 bp 200 bp 8 Tabel 3. Profil DNA hasil persilangan resiprok 3 strain ikan nila Populasi Jumlah Fragmen Kisaran Ukuran Fragmen bp Nirwana x BEST 1-15 200-3000 BEST X Nirwana 1-18 200-3000 BEST x Red NIFI 2-16 200-2000 BEST x BEST 1-14 200-2200 Nirwana x Red NIFI 5-16 200-1800 Nirwana x Nirwana 6-15 200-3000 Red NIFI x Nirwana 6-14 225-2000 Red NIFI x Red NIFI 6-15 200-2000 Red NIFI x BEST 6-16 225-2200 Jumlah dan ukuran fragmen DNA pada 9 populasi ikan nila hasil hibridisasi menunjukkan hasil yang bervariasi. Untuk 3 populasi true breeding yaitu BEST memiliki jumlah dan ukuran fragmen DNA berkisar 1-14 dan 200-2200 bp, Nirwana 6-15, 200-3000 bp, dan Red NIFI 6-15, 200-2000 bp. Sedangkan hasil hibridisasinya yaitu NirwanaxBEST 1-15, 200-3000 bp, BESTxNirwana 1-18, 200-3000 bp, BESTxRed NIFI 2-16, 200-2000 bp, NirwanaxRed NIFI 6-15, 200-1800 bp, Red NIFIxNirwana 6-14, 225-2000 bp, Red NIFIxBEST 6-16, 225-2200 bp.

3.1.1 Polimorfisme

Persentase polimorfisme dianalisis menggunakan program TFPGA Lampiran 1. Data persentase polimorfisme selengkapnya disajikan pada Tabel 4. Tabel 4. Persentase polimorfisme hasil persilangan resiprok 3 strain ikan nila Jantan BEST Nirwana Red NIFI Betina BEST 20,31 27,93 15,13 Nirwana 19,80 15,41 10,46 Red NIFI 26,91 27,23 17,04 Persentase polimorfisme pada 3 populasi hasil hibridisasi BESTxRed NIFI, NirwanaxRed NIFI, dan NirwanaxBEST lebih tinggi dari pada true breedingnya yaitu pada populasi BESTxBEST 20,31, Red NIFIxRed NIFI 17,04. Persentase polimorfisme tertinggi tercapai pada hasil persilangan NirwanaxBEST 9 27,93 dan terendah pada populasi Red NIFIxNirwana 10,46, sedangkan pada true breeding yaitu populasi NirwanaxNirwana 15,41.

3.1.2 Heterozigositas

Dokumen yang terkait

Identifikasi Dan Prevalensi Ektoparasit Pada Ikan Nila (Oreochromis niloticus) di Rawa Dan Tambak Paluh Merbau Percut Sei Tuan

9 144 57

Studi Pembudidayaan Ikan Nila (Oreochromis Niloticus) Dalam Air Tawar Dan Dalam Campuran Air Tawar Dan Air Laut

3 92 100

Efektifitas Pertumbuhan Bibit Ikan Nila (Oreochromis niloticus) Terhadap Pengaruh Mineral Fe, Na, Ca, Mg, Dan Cl Pada Akuarium Air Tawar Dan Campuran Air Tawar Dan Air Laut.

4 66 64

Analisis keragaman 20 genotipe pepaya berdasarkan penanda morfologi dan RAPD (Random Amplified Polymorphic DNA)

0 2 89

Keragaman Tiga Populasi Ikan Tambakan (Helostoma temminckii) dengan Metode RAPD (Random Amplified Polymorphic DNA) dan Karakter Morfometrik

0 5 111

Analisis keragaman 20 genotipe pepaya berdasarkan penanda morfologi dan RAPD (Random Amplified Polymorphic DNA)

0 2 79

Variasi Genetika Jati Jawa Berdasarkan Metode Random Amplified Polymorphic DNA (RAPD)

1 17 60

Identifikasi Pola Larik DNA Katuk (Sauropus Androgynus) Dengan Metode Random Amplified Polymorphic DNA (RAPD) - Ubaya Repository

0 0 1

KERAGAMAN GENETIK KEDELAI BERDASARKAN POLA PITA DNA HASIL RAPD (Random Amplified Polymorphic DNA) Genetic Diversity of Soybean Based on The DNA Pattern of RAPD (Random Amplified Polymorphic DNA)

0 0 7

TOLERANSI SALINITAS BENIH PERSILANGAN 3 STRAIN IKAN NILA (Oreochromis niloticus) DENGAN IKAN MUJAIR (O. mossambicus)

0 0 6