Hubungan Genetik Empat Populasi Kelapa Genjah Berdasarkan Penanda RAPD (Random Amplified Polymorphic DNA)

Saleha Hannum: Hubungan genetik empat populasi kelapa genjah berdasarkan..., 2001.
USU e-Repository © 2008

Saleha Hannum: Hubungan genetik empat populasi kelapa genjah berdasarkan..., 2001.
USU e-Repository © 2008

ABSTRACT
Genetic Relationship of Four Dwarf Coconut
Populations Based on RAPD (Ram/QmA""lijkd PolymoT]Jhic DNA)
SALEHA HANNUM
Under the supervision ofALEX HARTANA and SUHARSONO

Genetic relationships among 4 dwarf coconut populations [Genjah Hijau
Jombang (Gill), Geniah Raja (GRA), Genjah Hijau Nias (GHN), Genjah Malabar
(GMB)] bad been evaluated based on RAPD markers. Ten trees from each
coconut populations were chosen, and their leaf DNA's were amplified using
9 primers (selected from 35 random deeamer primers) in PCR thermed cycler
machine. A total of 108 RAPD bands were recorded, and 83 of them were
polimorphic (77 %). Unweighted Pair-Group Method Arithmetic (UPGMA) was
applied to RAPD binary data matrix using Numerical Taxonomy and Multivariate
System (NTSYS) version 1.8 computer program, showed dwarf coconut trees

were grouped within their populations. Genetic similarity of dwarf coconuts
within GRA population was the most closely related compared to those within
other populations. Closely geographical distance of dwarf coconut origin did not
make their genetic ralationships closer. RAPD data did not support that the same
fruit nut color bad to have more genetically similar. The Principle Component
Analysis ofRAPD binary data matrix showed dwarf coconut populations grouped
in four different quadrants. OPB-08 350 RAPD band could be used as a specific
genetic markers for GRA coconut populations. While OPA-082500,OPA-Q81250,
and OPC-QS550 RAPD band can be used to distinguish Gill or GMB from GRA
and GHN coconuts. OPA-13300 RAPD band had been identified and found only
in GRA and GMB coconut populations.

Key words:

genetic relationship, dwarf coconut, molecular markers, RAPD,
genetic similarity.

Saleha Hannum: Hubungan genetik empat populasi kelapa genjah berdasarkan..., 2001.
USU e-Repository © 2008


Saleha Hannum: Hubungan genetik empat populasi kelapa genjah berdasarkan..., 2001.
USU e-Repository © 2008

ABSTRAK
Hubungan Genetik Empat Populasi Kelapa Genjab Berdasarkao Penanda
RAPD (RDndom A»f11ifiet1 Polymorphic DNA)
SALEHA HANNUM

Di bawah bimbingan ALEX HARTANA dan SUHARSONO

Evaluasi hubungan genetik telah diIa1rukan pada 40 individu dari 4
populasi kelapa geniah, yaitu Genjah Hijau Jombang (GIll), Genjah Raja (GRA),
Genjah Hijau Nias (GHN), dan Genjah Malabar (GMB) menggunakan penanda
RAPD. Dati 9 primer acak 10-mer yang digunakan (diseleksi dari 35 primer acak
decamer) dihasilkan 108 pita dan 77 % diantaranya merupakan pita polimorfik.
Jumlah pita berkisar antara 7 dan 15 pita per primer yang berukuran antara 250 2500 pb, Berdasarkan analisis data biller dari pita RAPD dengan metode
UPGMA (Unweighted Pair-Group Method Arithmetic) melalui program NTSYS
(Numericai Taxonomy and Multivariate System) versi 1.80, menunjukkan bahwa
individu pohon kelapa Genjah mengelompok kedalam populasinya masingmasing. Kemiripan genetik pohon kelapa di daIam populasi GRA relatif lebih
dekat dibandingkan di dalam populasi lainnya. Hubungan genetik kelapa antar

populasi GHN dan GMB relatif lebih dekat dibandingkan terhadap GID atau
GRA Kedekatan jarak geografi tempat asal populasi kelapa Genjah dan
kesamaan wama buah tidak menjamin kedekatan hubungan genetik antar populasi
kelapa Genjah berdasarkan penanda RAPD. Analisis komponen utama, berhasil
melacak pita yang berperan dalam mengelompokkan keempat populasi kelapa
Genjah. Pita RAPD OPA-082500, OPA-08125o dan OPC-05550 dapat digunakan
untuk membedakan populasi kelapa GID atau GMB dari kelapa GRA dan GHN,
sedangkan pita OPA-13 30o membedakan populasi kelapa GRA atau GMB dati
kelapa GID dan GHN. Pita RAPD OPB-08 350 dapat digunakan sebagai penanda
populasi kelapa GRA yang membedakannya dati ketiga populasi kelapa lainnya

Kata kunci :

hubungan genetik, kelapa geniah, penanda molekul, RAPD,
kemiripan genetik,

Saleha Hannum: Hubungan genetik empat populasi kelapa genjah berdasarkan..., 2001.
USU e-Repository © 2008

Saleha Hannum: Hubungan genetik empat populasi kelapa genjah berdasarkan..., 2001.

USU e-Repository © 2008

Saleha Hannum: Hubungan genetik empat populasi kelapa genjah berdasarkan..., 2001.
USU e-Repository © 2008

Saleha Hannum: Hubungan genetik empat populasi kelapa genjah berdasarkan..., 2001.
USU e-Repository © 2008

Saleha Hannum: Hubungan genetik empat populasi kelapa genjah berdasarkan..., 2001.
USU e-Repository © 2008

Saleha Hannum: Hubungan genetik empat populasi kelapa genjah berdasarkan..., 2001.
USU e-Repository © 2008

Saleha Hannum: Hubungan genetik empat populasi kelapa genjah berdasarkan..., 2001.
USU e-Repository © 2008

Saleha Hannum: Hubungan genetik empat populasi kelapa genjah berdasarkan..., 2001.
USU e-Repository © 2008


Saleha Hannum: Hubungan genetik empat populasi kelapa genjah berdasarkan..., 2001.
USU e-Repository © 2008

Saleha Hannum: Hubungan genetik empat populasi kelapa genjah berdasarkan..., 2001.
USU e-Repository © 2008

Saleha Hannum: Hubungan genetik empat populasi kelapa genjah berdasarkan..., 2001.
USU e-Repository © 2008

Saleha Hannum: Hubungan genetik empat populasi kelapa genjah berdasarkan..., 2001.
USU e-Repository © 2008

Saleha Hannum: Hubungan genetik empat populasi kelapa genjah berdasarkan..., 2001.
USU e-Repository © 2008

Saleha Hannum: Hubungan genetik empat populasi kelapa genjah berdasarkan..., 2001.
USU e-Repository © 2008

Saleha Hannum: Hubungan genetik empat populasi kelapa genjah berdasarkan..., 2001.
USU e-Repository © 2008


Saleha Hannum: Hubungan genetik empat populasi kelapa genjah berdasarkan..., 2001.
USU e-Repository © 2008

Saleha Hannum: Hubungan genetik empat populasi kelapa genjah berdasarkan..., 2001.
USU e-Repository © 2008

Saleha Hannum: Hubungan genetik empat populasi kelapa genjah berdasarkan..., 2001.
USU e-Repository © 2008

Saleha Hannum: Hubungan genetik empat populasi kelapa genjah berdasarkan..., 2001.
USU e-Repository © 2008

Saleha Hannum: Hubungan genetik empat populasi kelapa genjah berdasarkan..., 2001.
USU e-Repository © 2008

Saleha Hannum: Hubungan genetik empat populasi kelapa genjah berdasarkan..., 2001.
USU e-Repository © 2008

Saleha Hannum: Hubungan genetik empat populasi kelapa genjah berdasarkan..., 2001.

USU e-Repository © 2008

Saleha Hannum: Hubungan genetik empat populasi kelapa genjah berdasarkan..., 2001.
USU e-Repository © 2008

Saleha Hannum: Hubungan genetik empat populasi kelapa genjah berdasarkan..., 2001.
USU e-Repository © 2008

Saleha Hannum: Hubungan genetik empat populasi kelapa genjah berdasarkan..., 2001.
USU e-Repository © 2008

Saleha Hannum: Hubungan genetik empat populasi kelapa genjah berdasarkan..., 2001.
USU e-Repository © 2008

Saleha Hannum: Hubungan genetik empat populasi kelapa genjah berdasarkan..., 2001.
USU e-Repository © 2008

Saleha Hannum: Hubungan genetik empat populasi kelapa genjah berdasarkan..., 2001.
USU e-Repository © 2008


Saleha Hannum: Hubungan genetik empat populasi kelapa genjah berdasarkan..., 2001.
USU e-Repository © 2008

Saleha Hannum: Hubungan genetik empat populasi kelapa genjah berdasarkan..., 2001.
USU e-Repository © 2008

Saleha Hannum: Hubungan genetik empat populasi kelapa genjah berdasarkan..., 2001.
USU e-Repository © 2008

Saleha Hannum: Hubungan genetik empat populasi kelapa genjah berdasarkan..., 2001.
USU e-Repository © 2008

Saleha Hannum: Hubungan genetik empat populasi kelapa genjah berdasarkan..., 2001.
USU e-Repository © 2008

Saleha Hannum: Hubungan genetik empat populasi kelapa genjah berdasarkan..., 2001.
USU e-Repository © 2008

Saleha Hannum: Hubungan genetik empat populasi kelapa genjah berdasarkan..., 2001.
USU e-Repository © 2008


Saleha Hannum: Hubungan genetik empat populasi kelapa genjah berdasarkan..., 2001.
USU e-Repository © 2008

Saleha Hannum: Hubungan genetik empat populasi kelapa genjah berdasarkan..., 2001.
USU e-Repository © 2008

Saleha Hannum: Hubungan genetik empat populasi kelapa genjah berdasarkan..., 2001.
USU e-Repository © 2008

Saleha Hannum: Hubungan genetik empat populasi kelapa genjah berdasarkan..., 2001.
USU e-Repository © 2008

Saleha Hannum: Hubungan genetik empat populasi kelapa genjah berdasarkan..., 2001.
USU e-Repository © 2008

Saleha Hannum: Hubungan genetik empat populasi kelapa genjah berdasarkan..., 2001.
USU e-Repository © 2008

Saleha Hannum: Hubungan genetik empat populasi kelapa genjah berdasarkan..., 2001.

USU e-Repository © 2008

Saleha Hannum: Hubungan genetik empat populasi kelapa genjah berdasarkan..., 2001.
USU e-Repository © 2008

Saleha Hannum: Hubungan genetik empat populasi kelapa genjah berdasarkan..., 2001.
USU e-Repository © 2008

Saleha Hannum: Hubungan genetik empat populasi kelapa genjah berdasarkan..., 2001.
USU e-Repository © 2008

Saleha Hannum: Hubungan genetik empat populasi kelapa genjah berdasarkan..., 2001.
USU e-Repository © 2008

Saleha Hannum: Hubungan genetik empat populasi kelapa genjah berdasarkan..., 2001.
USU e-Repository © 2008

Saleha Hannum: Hubungan genetik empat populasi kelapa genjah berdasarkan..., 2001.
USU e-Repository © 2008


Saleha Hannum: Hubungan genetik empat populasi kelapa genjah berdasarkan..., 2001.
USU e-Repository © 2008

Saleha Hannum: Hubungan genetik empat populasi kelapa genjah berdasarkan..., 2001.
USU e-Repository © 2008

Saleha Hannum: Hubungan genetik empat populasi kelapa genjah berdasarkan..., 2001.
USU e-Repository © 2008

Saleha Hannum: Hubungan genetik empat populasi kelapa genjah berdasarkan..., 2001.
USU e-Repository © 2008

Saleha Hannum: Hubungan genetik empat populasi kelapa genjah berdasarkan..., 2001.
USU e-Repository © 2008

Saleha Hannum: Hubungan genetik empat populasi kelapa genjah berdasarkan..., 2001.
USU e-Repository © 2008

Saleha Hannum: Hubungan genetik empat populasi kelapa genjah berdasarkan..., 2001.
USU e-Repository © 2008

Saleha Hannum: Hubungan genetik empat populasi kelapa genjah berdasarkan..., 2001.
USU e-Repository © 2008

Saleha Hannum: Hubungan genetik empat populasi kelapa genjah berdasarkan..., 2001.
USU e-Repository © 2008

Saleha Hannum: Hubungan genetik empat populasi kelapa genjah berdasarkan..., 2001.
USU e-Repository © 2008

Saleha Hannum: Hubungan genetik empat populasi kelapa genjah berdasarkan..., 2001.
USU e-Repository © 2008

Saleha Hannum: Hubungan genetik empat populasi kelapa genjah berdasarkan..., 2001.
USU e-Repository © 2008

Saleha Hannum: Hubungan genetik empat populasi kelapa genjah berdasarkan..., 2001.
USU e-Repository © 2008

Saleha Hannum: Hubungan genetik empat populasi kelapa genjah berdasarkan..., 2001.
USU e-Repository © 2008

Saleha Hannum: Hubungan genetik empat populasi kelapa genjah berdasarkan..., 2001.
USU e-Repository © 2008

Saleha Hannum: Hubungan genetik empat populasi kelapa genjah berdasarkan..., 2001.
USU e-Repository © 2008

Saleha Hannum: Hubungan genetik empat populasi kelapa genjah berdasarkan..., 2001.
USU e-Repository © 2008

Saleha Hannum: Hubungan genetik empat populasi kelapa genjah berdasarkan..., 2001.
USU e-Repository © 2008

Saleha Hannum: Hubungan genetik empat populasi kelapa genjah berdasarkan..., 2001.
USU e-Repository © 2008

Saleha Hannum: Hubungan genetik empat populasi kelapa genjah berdasarkan..., 2001.
USU e-Repository © 2008

Saleha Hannum: Hubungan genetik empat populasi kelapa genjah berdasarkan..., 2001.
USU e-Repository © 2008