Analisis Keragaman Genetik Bawang Merah (Allium ascalonicum L.) pada Beberapa Aksesi di Samosir Menggunakan Marka RAPD (Random Amplified Polymorphic DNA)
DAFTAR PUSTAKA
AAK. 1998. Pedoman Bertanam Bawang. Kanisius. Yogyakarta.
Allard, R.W. 2005. Principles of Plant Breeding. John Wiley and Sons. New
York.
Azrai, M. 2005. Pemanfaatan Markah Molekuler Dalam Proses Seleksi Pemuliaan
Tanaman. Jurnal AgroBiogen 1:26-37.
Bardacki, F. 2001. Random Amplified Polymorphic DNA (RAPD) Markers.
Turki Jurnal Biol 25:185-196.
Berita Resmi Statistik Provinsi Sumatera Utara (BRSPSU). 2015. Produksi Cabai
Besar, Cabai Rawit, dan Bawang Merah Tahun 2014. Medan.
Brewster. J.L. 2008. Onions and Other Vegetable Allium, 2nd Edition. CAB
International. Oxfordshire.
Chen, H.A. 2000. PCR [online]. Chen'sown protocols: Chen’s protocol list: PCR.
http://users. breathe.com/hachen/protocols/PCR.html.
Ebrahimi, R, Z., Zamani, A. Kashi. 2009. Genetic diversity evaluation of wild
persial shallot (Allium hirtifolium Boiss.) using morphological and
RAPD markers. Scientia Horticulturae 119:345-351.
Fatchiyah, Arumingtyas, E.L., Widyarti, S., dan Rahayu, S. 2011. Biologi
Molecular: Prinsip Dasar Analisis. Erlangga. Jakarta.
Ferreira, M.E dan D. Gratapaglia. 1998. Introducao Ao Uso De Marcadores Em
Analise Genetic. Embrapa-Cenargen.Brasilia.
Hittalmani, S., M.R. Foolad, T. Mew, R.L. Rodriguez, dan N. Huang. 1995.
Development of a PCR-Based Marker to Identify Rice Blast ResistanceGene, Pi-2(t) in a Segregating Population. Theor. Appl. Gen. 91:9-14.
Ishak. 1998. Identifikasi DNA Genom Mutan Padi Atomita-2 dan Tetuanya
Menggunakan RAPD Markers. Zuriat 9: 71-83.
Lee, G. A., Kwon, S. J., Park, Y. J., Lee, M. C., Kim, H. H., Lee, J. S., Young,
S. Y., Gwag, J. G., Kim, C. K., Ma, K. H. 2011. Crossamplification of
SSR markers developed from Allium sativum to other Allium species.
Scientia Horticulturae 128:401-407.
Lembaga Ilmu Pengetahuan Indonesi (LIPI). 2010. Hasil Identifikasi Bawang
Merah. Universitas Sumatera Utara Press. Medan.
Ma, K. H., Kwag, J. G., Zhao, W., Dixit, A., Lee, G. A., Kim, H.H., Chung, I.
M., Kim, N. S., Lee, J. S., Ji, J. J., Kim, T. S. Park, Y. J. 2009.
Isolation and characteristics of eight novel polymorphic microsatellite
Universitas Sumatera Utara
27
loci from the genome of garlic (Allium sativum L.). Scientia
Horticulturae 122:355-361.
Maftuchah dan A. Zainuddin. 2013. Studi Pendahuluan Variasi Genetik Jarak
Pagar (Jatrpha curcas L.) Lokal Berdasarkan Random Amplified
Polymorphic DNA. Pusat Pengembangan Bioteknologi Universitas
Muhammadiyah Malang (123-131).
Mahardika, I.G.N.K. 2003. Polymerase Chain Reaction. Laboratorium Virologi.
Fakultas Kedokteran Hewan. Universitas Udayana. Denpasar.
Murray, R.K., Granner, D.K., dan Rodwell, V.W. 2006. Biokimia Harper. Buku
Kedokteran EGC. Jakarta.
Mullis, K., Faloona, F., Scharf, S., Saiki, R., Horn, G. and Erlich, H. 1986.
Spesific Enzymatic Amplification of DNA Invitro: The Polymerase Chain
Reaction. Cold Spring Harbor Symp. Quantit. Biol. 51:263–273.
Numba, S. 2010. Analisis Keragaman Genetic Kultivar Kentang Dan Kentang
Spesies Liar. J. Agrivigor 9 (3):305-316, Mei-Agustus 2010; ISSN14122286.
Orozco-Castillo, Chalmers, K.J., Waugh, R., Powell, W. 1994. Detection of
genetic diversity and selective gene introgression on coffe using RAPD
markers. Theor. Appl. Genest. 87.934-940.
Ovesna, J. L., Kucera, J., Hornickova, L., Svobodova, H., Stavelikova, J., Valisek,
L., Milella. 2011. Diversity of S-alk(en)nyl cystein sulphoxide content
with a collection of garlic (Allium sativum L.) and its association with
the morphological and genetic background assessed by AFLP. Scientia
Horticulturae 129:541-547.
Perrier,
X dan J.P. Jacquemoud-Colled.
http://darwin.cirad.fr/darwin
2006.
DARwin
Software.
Pitojo, S. 2003. Benih Bawang Merah. Kansius. Yogyakarta.
Prana KD, NS Hartati. 2003. Identifikasi Sidik Jari DNA Talas (Colocasia
esculenta L. Schott) Indonesia dengan Teknik RAPD (Random Amplified
Polymorphic DNA). Skrining Primer dan Optimasi Kondisi PCR. J. Natur
Indonesia Vol 5 (2): 107-112.
Rukmana, R. 1994. Bawang Merah Budidaya Dan Pengolahan Pasca Panen.
Kanisius. Jakarta.
, R. 1995. Bawang Merah Budidaya Dan Pengolahan Pasca Panen.
Kanisius. Jakarta.
Samal, S., G. R. Rout and P. C. Lenka. 2003. Analysis of genetic relationship
between populations of cashew (Anacardium occidentale L.) by using
Universitas Sumatera Utara
28
morphological characterization and RAPD Markers. Plant Soil
Environment 49 (4): 176-182.
Sambrook, J, Fritsch E.F., Maniatis, T. 1989. Molecular Cloning A Laboratory
Manual. Second Edition. New York: Cold Spring Harbor Laboratory Pr.
Sianipar, J.F.2015. J. Agronom. (151) : 1962-1972. Desember 2015. E-ISSN No.
2337-6597.
Sinclair, P. 1988. The Botany of Onions. Australian Onion Grower. Vol 5:7-10.
Siregar,E. 2016. Bawang merah Impor Ada pada Tahun 2013 dan 2014. Antara
Sumut. Diakses melalui http://www.antarasumut.com/berita/154948/bpssumut-belum-ada-impor-bawang-merah pada tanggal 07 Juli 2016.
Sitompul, S. M. dan B. Guritno. 1995. Analisis Pertumbuhan Tanaman. Gadjah
Mada University Press. Yogyakarta.
Sumarni, N. dan Hidayat, A. 2005. Panduan Teknis Budidaya Bawang Merah.
Balai Penelitian Tanaman Sayuran. Lembang.
Sumarsono. 2000. Keanekaragaman Genetik Lima Populasi Kelapa Dalam Dari
Jawa Berdasarkan Penanda RAPD. Tesis. PPS IPB. Bogor, hlm. 12-18.
Suparman. 2010. Bercocok Tanam Bawang Merah. Azka Press. Jakarta.
Sutarya, R. dan G. Grubben. 1995. Pedoman Bertanam Sayuran Dataran Rendah.
Gadjah Mada University Press. Prosea Indonesia – Balai Penel.
Hortikultura Lembang.
Van Steenis, C.G.G.J. 2003. Flora. PT Pradnya Paramita. Jakarta.
Wibowo, S. 2007. Budidaya Bawang Merah. Penebar Swadaya. Jakarta.
Williams, J.G.K., Kubaik, A.R., Livak, K.J., Rafalski, J.A., and Tinge,y S.V.
1990. DNA polymorphisms amplified by arbitrary primers are useful as
genetic markers. Nucleic Acid Research 18:6531-6535.
Wilson, K. dan Walker, J. 2010. Principles and Techniques of Biochemistry and
Molecular Biology. Cambridge University Press. Cambridge
Wirnas, D. 2005. Analisis Kuantitatif Dan Molekular dalam Rangka Mempercepat
Perakitan Varietas Baru Kedelai Toleran Terhadap Intensitas Cahaya
Rendah. Falsafah Sains. PPS 702.
Yuwono, T. 2006. Teori dan Aplikasi Polymerase Chain Reaction. Andi Offset.
Yogyakarta.
Universitas Sumatera Utara
AAK. 1998. Pedoman Bertanam Bawang. Kanisius. Yogyakarta.
Allard, R.W. 2005. Principles of Plant Breeding. John Wiley and Sons. New
York.
Azrai, M. 2005. Pemanfaatan Markah Molekuler Dalam Proses Seleksi Pemuliaan
Tanaman. Jurnal AgroBiogen 1:26-37.
Bardacki, F. 2001. Random Amplified Polymorphic DNA (RAPD) Markers.
Turki Jurnal Biol 25:185-196.
Berita Resmi Statistik Provinsi Sumatera Utara (BRSPSU). 2015. Produksi Cabai
Besar, Cabai Rawit, dan Bawang Merah Tahun 2014. Medan.
Brewster. J.L. 2008. Onions and Other Vegetable Allium, 2nd Edition. CAB
International. Oxfordshire.
Chen, H.A. 2000. PCR [online]. Chen'sown protocols: Chen’s protocol list: PCR.
http://users. breathe.com/hachen/protocols/PCR.html.
Ebrahimi, R, Z., Zamani, A. Kashi. 2009. Genetic diversity evaluation of wild
persial shallot (Allium hirtifolium Boiss.) using morphological and
RAPD markers. Scientia Horticulturae 119:345-351.
Fatchiyah, Arumingtyas, E.L., Widyarti, S., dan Rahayu, S. 2011. Biologi
Molecular: Prinsip Dasar Analisis. Erlangga. Jakarta.
Ferreira, M.E dan D. Gratapaglia. 1998. Introducao Ao Uso De Marcadores Em
Analise Genetic. Embrapa-Cenargen.Brasilia.
Hittalmani, S., M.R. Foolad, T. Mew, R.L. Rodriguez, dan N. Huang. 1995.
Development of a PCR-Based Marker to Identify Rice Blast ResistanceGene, Pi-2(t) in a Segregating Population. Theor. Appl. Gen. 91:9-14.
Ishak. 1998. Identifikasi DNA Genom Mutan Padi Atomita-2 dan Tetuanya
Menggunakan RAPD Markers. Zuriat 9: 71-83.
Lee, G. A., Kwon, S. J., Park, Y. J., Lee, M. C., Kim, H. H., Lee, J. S., Young,
S. Y., Gwag, J. G., Kim, C. K., Ma, K. H. 2011. Crossamplification of
SSR markers developed from Allium sativum to other Allium species.
Scientia Horticulturae 128:401-407.
Lembaga Ilmu Pengetahuan Indonesi (LIPI). 2010. Hasil Identifikasi Bawang
Merah. Universitas Sumatera Utara Press. Medan.
Ma, K. H., Kwag, J. G., Zhao, W., Dixit, A., Lee, G. A., Kim, H.H., Chung, I.
M., Kim, N. S., Lee, J. S., Ji, J. J., Kim, T. S. Park, Y. J. 2009.
Isolation and characteristics of eight novel polymorphic microsatellite
Universitas Sumatera Utara
27
loci from the genome of garlic (Allium sativum L.). Scientia
Horticulturae 122:355-361.
Maftuchah dan A. Zainuddin. 2013. Studi Pendahuluan Variasi Genetik Jarak
Pagar (Jatrpha curcas L.) Lokal Berdasarkan Random Amplified
Polymorphic DNA. Pusat Pengembangan Bioteknologi Universitas
Muhammadiyah Malang (123-131).
Mahardika, I.G.N.K. 2003. Polymerase Chain Reaction. Laboratorium Virologi.
Fakultas Kedokteran Hewan. Universitas Udayana. Denpasar.
Murray, R.K., Granner, D.K., dan Rodwell, V.W. 2006. Biokimia Harper. Buku
Kedokteran EGC. Jakarta.
Mullis, K., Faloona, F., Scharf, S., Saiki, R., Horn, G. and Erlich, H. 1986.
Spesific Enzymatic Amplification of DNA Invitro: The Polymerase Chain
Reaction. Cold Spring Harbor Symp. Quantit. Biol. 51:263–273.
Numba, S. 2010. Analisis Keragaman Genetic Kultivar Kentang Dan Kentang
Spesies Liar. J. Agrivigor 9 (3):305-316, Mei-Agustus 2010; ISSN14122286.
Orozco-Castillo, Chalmers, K.J., Waugh, R., Powell, W. 1994. Detection of
genetic diversity and selective gene introgression on coffe using RAPD
markers. Theor. Appl. Genest. 87.934-940.
Ovesna, J. L., Kucera, J., Hornickova, L., Svobodova, H., Stavelikova, J., Valisek,
L., Milella. 2011. Diversity of S-alk(en)nyl cystein sulphoxide content
with a collection of garlic (Allium sativum L.) and its association with
the morphological and genetic background assessed by AFLP. Scientia
Horticulturae 129:541-547.
Perrier,
X dan J.P. Jacquemoud-Colled.
http://darwin.cirad.fr/darwin
2006.
DARwin
Software.
Pitojo, S. 2003. Benih Bawang Merah. Kansius. Yogyakarta.
Prana KD, NS Hartati. 2003. Identifikasi Sidik Jari DNA Talas (Colocasia
esculenta L. Schott) Indonesia dengan Teknik RAPD (Random Amplified
Polymorphic DNA). Skrining Primer dan Optimasi Kondisi PCR. J. Natur
Indonesia Vol 5 (2): 107-112.
Rukmana, R. 1994. Bawang Merah Budidaya Dan Pengolahan Pasca Panen.
Kanisius. Jakarta.
, R. 1995. Bawang Merah Budidaya Dan Pengolahan Pasca Panen.
Kanisius. Jakarta.
Samal, S., G. R. Rout and P. C. Lenka. 2003. Analysis of genetic relationship
between populations of cashew (Anacardium occidentale L.) by using
Universitas Sumatera Utara
28
morphological characterization and RAPD Markers. Plant Soil
Environment 49 (4): 176-182.
Sambrook, J, Fritsch E.F., Maniatis, T. 1989. Molecular Cloning A Laboratory
Manual. Second Edition. New York: Cold Spring Harbor Laboratory Pr.
Sianipar, J.F.2015. J. Agronom. (151) : 1962-1972. Desember 2015. E-ISSN No.
2337-6597.
Sinclair, P. 1988. The Botany of Onions. Australian Onion Grower. Vol 5:7-10.
Siregar,E. 2016. Bawang merah Impor Ada pada Tahun 2013 dan 2014. Antara
Sumut. Diakses melalui http://www.antarasumut.com/berita/154948/bpssumut-belum-ada-impor-bawang-merah pada tanggal 07 Juli 2016.
Sitompul, S. M. dan B. Guritno. 1995. Analisis Pertumbuhan Tanaman. Gadjah
Mada University Press. Yogyakarta.
Sumarni, N. dan Hidayat, A. 2005. Panduan Teknis Budidaya Bawang Merah.
Balai Penelitian Tanaman Sayuran. Lembang.
Sumarsono. 2000. Keanekaragaman Genetik Lima Populasi Kelapa Dalam Dari
Jawa Berdasarkan Penanda RAPD. Tesis. PPS IPB. Bogor, hlm. 12-18.
Suparman. 2010. Bercocok Tanam Bawang Merah. Azka Press. Jakarta.
Sutarya, R. dan G. Grubben. 1995. Pedoman Bertanam Sayuran Dataran Rendah.
Gadjah Mada University Press. Prosea Indonesia – Balai Penel.
Hortikultura Lembang.
Van Steenis, C.G.G.J. 2003. Flora. PT Pradnya Paramita. Jakarta.
Wibowo, S. 2007. Budidaya Bawang Merah. Penebar Swadaya. Jakarta.
Williams, J.G.K., Kubaik, A.R., Livak, K.J., Rafalski, J.A., and Tinge,y S.V.
1990. DNA polymorphisms amplified by arbitrary primers are useful as
genetic markers. Nucleic Acid Research 18:6531-6535.
Wilson, K. dan Walker, J. 2010. Principles and Techniques of Biochemistry and
Molecular Biology. Cambridge University Press. Cambridge
Wirnas, D. 2005. Analisis Kuantitatif Dan Molekular dalam Rangka Mempercepat
Perakitan Varietas Baru Kedelai Toleran Terhadap Intensitas Cahaya
Rendah. Falsafah Sains. PPS 702.
Yuwono, T. 2006. Teori dan Aplikasi Polymerase Chain Reaction. Andi Offset.
Yogyakarta.
Universitas Sumatera Utara