Pengendalian Biofilm Edwardsiella tarda Pada Permukaan Sisik Ikan dan Plastik PVC dengan Senyawa Antimikroba yang Dihasilkan oleh Bakteri Asam Laktat (BAL)
PENGENDALIAN BIOFILM Edwardsiella tarda PADA PERMUKAAN SISIK IKAN DAN PLASTIK PVC DENGAN SENYAWA ANTIMIKROBA YANG DIHASILKAN OLEH BAKTERI ASAM LAKTAT (BAL) SKRIPSI TIEN PRATIWI SITINJAK 100805048
PENGENDALIAN BIOFILM Edwardsiella tarda PADA PERMUKAAN SISIK IKAN DAN PLASTIK PVC DENGAN SENYAWA ANTIMIKROBA YANG DIHASILKAN OLEH BAKTERI ASAM LAKTAT (BAL) SKRIPSI Diajukan untuk melengkapi tugas dan memenuhi syarat mencapai gelar Sarjana Sains TIEN PRATIWI SITINJAK 100805048
PERSETUJUAN
Judul : Pengendalian Biofilm Edwardsiella tarda Pada Permukaan Sisik Ikan dan Plastik PVC dengan Senyawa Antimikroba yang Dihasilkan oleh Bakteri Asam Laktat (BAL)
Kategori : Skripsi Nama : Tien Pratiwi Sitinjak Nomor Induk Mahasiswa : 100805048 Program Studi : Sarjana (S1) Biologi Departemen : Biologi Fakultas : Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam
Universitas Sumatera Utara Disetujui di Medan, Mei 2015
Komisi Pembimbing : Pembimbing 2, Pembimbing 1,
PERNYATAAN
PENGENDALIAN BIOFILM Edwardsiella tarda PADA PERMUKAAN
SISIK IKAN DAN PLASTIK PVC DENGAN SENYAWA ANTIMIKROBA
YANG DIHASILKAN OLEH BAKTERI ASAM LAKTAT (BAL)
SKRIPSI Saya mengakui bahwa skripsi ini adalah hasil karya sendiri. Kecuali beberapa kutipan dan ringkasan yang masing-masing disebutkan sumbernya.
Medan, Mei 2015 Tien Pratiwi Sitinjak 100805048
PENGHARGAAN
Puji dan syukur penulis ucapkan kehadirat Tuhan Yang Maha Kuasa yang telah memberikan kasihNya sehingga penulis dapat menyelesaikan skripsi ini dengan judul Pengendalian Biofilm Edwardsiella tarda pada Permukaan Sisik Ikan dan
Plastik PVC dengan Senyawa Antimikroba yang dihasilkan oleh Bakteri Asam
Laktat (BAL)Pada kesempatan ini penulis mengucapkan terimakasih kepada Ibu Dr. It Jamilah, M. Sc selaku Dosen Pembimbing I dan Ibu Dra. Nunuk Priyani, M.Sc selaku Dosen Pembimbing II yang telah memberikan nasehat dan bimbingan kepada penulis dalam penyusunan skripsi ini. Terimakasih kepada Bapak Prof. Dr. Dwi Suryanto, M. Sc selaku Dosen Penguji I dan Ibu Dr. Hesty Wahyuningsih M.Si selaku Dosen Penguji II yang telah memberikan kritik dan saran yang membangun dalam penyusunan skripsi ini. Terimakasih kepada Ibu Dr. Nursahara Pasaribu, M.Sc selaku Ketua Departemen Biologi FMIPA USU, Bapak Dr. Sutarman, M. Sc selaku Dekan FMIPA USU, Ibu Dr. Marpongahtun, M. Sc selaku Pembantu Dekan I, Bapak Drs. Nursal, M.Sc selaku Pembantu Dekan II dan Bapak Drs. Kerista Sebayang, M. Si selaku Pembantu Dekan III, Bapak dan Ibu Dosen Biologi FMIPA USU, kepada Bang Erwin dan Ibu Roslina Ginting serta seluruh staf pegawai FMIPA USU, terimakasih saya ucapkan atas semua bantuannya.
Terimakasih tak terhingga kepada kedua orangtuaku tercinta, Bapak St. Aden Sitinjak dan Ibu Nurtiana Simamora yang senantiasa berkorban, mencintai dan berdoa untukku, juga kepada kakak ku tersayang, Eva Helen Sitinjak, SE dan adik-adikku tercinta Dickwanda Lestari, Lily, Sonia Togi, Johannes Risky, Aber Tulusyang memberikan dukungan penuh dan juga mendoakanku dalam menyelesaikan skripsi ini.
Kepada sahabat-sahabat terbaikku Evalentina Sinaga, Netty Gurning S.Si, Sunarty Sinaga S.Si danJesika Sembiring Amd, terimakasih untuk setiap penghiburan dan dukungannya, dan terkhusus kepada kekasihku Pranatal Manullang S.Pd terimakasih atas kasih sayang tak terhingga, motivasi dan doa yang
PENGENDALIAN BIOFILM Edwardsiella tarda PADA
PERMUKAAN SISIK IKAN DAN PLASTIK PVC DENGAN SENYAWA
ANTIMIKROBA YANG DIHASILKAN OLEH BAKTERI ASAM LAKTAT
(BAL)
ABSTRAK
merupakan bakteri penyebab edwardsielosis pada ikan dan
Eswardsiella tarda
mampu membentuk biofilm pada permukaan padat. Penelitian ini bertujuan untuk mengendalikan biofilm E. tarda dengan memanfaatkan ekstrak kasar senyawa antimikroba bakteri asam laktat (BAL) yang diisolasi dari saluran pencernaan ikan gurame. Dari 14 isolat hasil isolasi pada media MRSA didapatkan isolat PG7 yang paling potensial dalam menghambat E. tarda dengan diameter zona hambat 8,15 mm. Ekstrak kasar senyawa antimikroba BAL PG7 digunakan untuk mengendalikan biofilm E. tarda yang dibentuk pada hari ke 1, 3, 5 di dalam media NB pada permukaan sisik ikan gurame dan plastik PVC, kemudian dilakukan pelepasan sel biofilm dengan serbuk kaca halus (glass bead) dengan metode TPC. Biofilm E. tarda mampu membentuk biofilm dengan jumlah sel tertinggi pada hari
12
ke-3 yaitu sebesar 10 CFU/lempeng baik pada permukaan lempeng sisik ikan maupun plastik PVC. Ekstrak kasar senyawa antimikroba BAL PG7 mampu menurunkan jumlah sel biofilm pada masing-masing uji sebesar 18%. Dari hasil penelitian dapat disimpulkan bahwa biofilm E. tarda sulit untuk dikendalikan dan ekstrak kasar senyawa anti mikroba BAL PG7 dapat menghambat sel biofilm E.
tarda sebesar 18%.
Kata kunci: Bakteri asam laktat, Edwardsiella tarda, biofilm, sisik ikan, dan plastik
CONTROL OFEdwardsiella tarda BIOFILM ON SCALES OF FISH AND
PVC PLASTIC SURFACE WITH ANTIBACTERIAL COMPOUNDS OF
LACTID ACID BACTERIA (LAB)
ABSTRACT
Edwardsiella tarda is a bacterium that causes edwardsielosis on fish and able to
form biofilm on solid surface. The aim of this research was to control E. Tarda biofilm using antibacterial compound of lactid acid bacteria (LAB) isolated from
Osphronemous gouramy . There were 14 LAB isolates, among them PG7 was found
as a potential biocontrol agent which showed the highest inhibition (8.15 mm) compare to others. PG7 was used to produce antibacterial compound to control biofilm cells of E. Tarda which was performed in 1, 3, 5 days in nutrition broth medium on fish scale and Polyvinyl cloride then were detached using micro glass bead for counting by TPC. The highest number of biofilm cells were found at 3
12
days incubation as much 10 CFU/chip. Controlling biofilm cell of E. tarda with crude extract of antibacterial compound of LAB PG7 isolate reduced 18% biofilm cell of E. tarda. It was concluded that biofilm E. tarda difficult to control and crude extract can inhibit biofilm cells of E. tarda by 18%.
Keywords: Lactid acid bacteria, Edwardsiella tarda, biofilm, fish scale, PVC
DAFTAR ISI
Halaman
Persetujuan i Pernyataan ii Penghargaan iii Abstrak iv Abstract v Daftar Isi vi Daftar Tabel viii Daftar Gambar ix Daftar Lampiran x
BAB 1 Pendahuluan
1
1.1 Latar Belakang
1
1.2 Permasalahan
3
1.3 Tujuan Penelitian
3
1.4 Manfaat
3 BAB 2 Tinjauan Pustaka
4
2.1 Ikan Gurame (Osphrenomus gouramy)
4
2.2 BakteriEdwardsiella tarda
5
2.3 Biofilm
6
2.4 BAL (Bakteri Asam Laktat)
7
4.3 Fase pertumbuhan BAL
4.4 Uji antagonis senyawa antimikroba ekstrak kasar BAL terhadap
4.5 Pembentukan dan pengendalian Biofilm E. tarda
18
19
E. Tarda
21
BAB 5 Kesimpulan dan Saran
25 Daftar Pustaka Lampiran
26
31
DAFTAR TABEL
Nomor Judul Halaman
4.1. Karakteristik morfologi dan Biokimia Isolat BAL
15
4.2. Diameter zona hambat BAL terhadap E. Tarda
16
8
pada konsentrasi sel 10 CFU/mL
4.3. Diameter zona hambat senyawa antimikroba
20 ekstrak kasar BAL PG 7 dan US7 terhadap E.
Tarda
4.4. Pembentukan dan penurunan rata-rata Jumlah Sel
23 Biofilm Edwardsiella tarda pada Sisik Ikan dan Plastik PVC sebelum dan setelah kontak 1 jam dengan senyawa antimikrobaekstrak kasar BAL PG 7
DAFTAR GAMBAR
Nomor Judul Halaman
4.1. Diameter zona hambat isolat BAL potensial
17
4.2. Kurva pertumbuhan isolat BAL SPG 7 dan US7
18 pada media nutrient broth, suhu 28 C selama 30 jam
4.3. Diameter zona hambat ekstrak kasar senyawa
21 antimokroba BAL terhadap pertumbuhan bakteri patogen