1. Home
  2. Lainnya

PENGEMBANGAN PENANDA MOLEKULER BERBASIS PCR SEBAGAI SISTEM DETEKSI DINI KEBERADAAN JAMUR PENYEBAB ANTHRAKNOSA PADA PERTANAMAN CABAI.

PENGEMBANGAN PENANDA MOLEKULER BERBASIS PCR SEBAGAI
SISTEM DETEKSI DINI KEBERADAAN JAMUR PENYEBAB
ANTHRAKNOSA PADA PERTANAMAN CABAI
Oleh:
Jamsari dan Reflin
Nomor kontrak: 023/SP2H/PP/DP2M/III/2007
Abstrak
Keberhasilan pengendalian dan penanganan penyakit anthraknosa pada tanaman
cabai sangat ditentukan oleh kemampuan identifikasi dini keberadaan pathogen
penyebabnya. Untuk tujuan tersebut telah dilakukan analisis finger printing berbasis
RAPD terhadap 20 isolat jamur penyebab anthraknosa, sehingga diperoleh 4 primer yang
memperlihatkan adanya fragmen spesifik pada spesies C. gleosporides, 3 primer pada C.
capsici dan 1 primer ditemukan pada kedua species tersebut. Protokol Saghai – Maroof et
al., (1994) dan protokol Kit dari Promega ternyata dapat digunakan untuk preparasi DNA
spesies C. gleosporides dan C. Capsici, sdangkan material terbaik adalah miselia yang
dihasilkan dari cultur cair berumur 2 hari. Dari 25 primer RAPD yang di uji, 80% mampu
menghasilkan produk PCR yang dapat digunakan untuk analisis variabilitas diantara
spesies C. capsici dan C. gleosporides. Dari 10 primer yang diuji, 4 primer
memperlihatkan fragmen spesifik pada C. capsici, sedangkan 1 primer memperlihatkan
fragmen umum untuk kedua spesies. Pengujian reamplifikasi bberapa fragmen RAPD
spesifik yang telah di isolasi dan di purifikasi dari matrik agarnya memperlihatkan bukti

yang beragam tentang spesifitas fragmen RAPD, yang terlihat dari terbentuknya beberapa
fragmen dengan ukuran berbeda, sehingga perlu kehati – hatian dalam menggunakan
fragmen ini untuk kegiatan sekuensi langsung

Dokumen yang terkait

Penggunaan Gen Miostatin sebagai Penanda Molekular untuk Deteksi Dini Pertumbuhan Otot Domba Lokal

0 7 1

Pengembangan metode deteksi molekuler Chrysanthemum stunt viroid (CSVd) penyebab penyakit kerdil pada tanaman krisan (Dendranthema grandiflora Kitam)

0 14 109

Perancangan Primer untuk Pengembangan Sistem Deteksi Berbasis PCR (Polymerase Chain Reaction) pada Ganoderma spp

0 5 34

PENGUJIAN PRIMER SPESIFIK UNTUK DETEKSI BERBASIS PCR SPESIES Colletotrichum sp., PATOGEN PENYEBAB PENYAKIT ANTRAKNOSA PADA PERTANAMAN CABAI (Capsicum sp.).

0 0 6

Koleksi dan Identifikasi Isolat-lsolat Jamur Penyebab Anfhrachnose pada Pertanaman Cabai.

0 1 1

PENGEMBANGAN METODE DETEKSI KADAR KATEKIN BERBASIS MOLEKULER PADA SPESIES Uncaria gambir Roxb 1).

0 0 1

ringkasan - PENGEMBANGAN METODE DETEKSI KADAR KATEKIN BERBASIS MOLEKULER PADA SPESIES Uncaria gambir Roxb.

0 0 1

Kloning Fragmen-Fragmen RAPD Penciri Spesies Colletotrichum sp Untuk Pengembangan Sistem Deteksi Dini Pathogen Penyebab Anthrachnosa Pada Pertanaman Cabai.

0 1 15

Ringkasan - PENGEMBANGAN PENANDA MOLEKULER BERBASIS PCR SEBAGAI SISTEM DETEKSI DINI KEBERADAAN JAMUR PENYEBAB ANTRAKNOSA PADA PERTANAMAN CABAI.

0 0 4

Deteksi Molekuler Keberadaan Toxoplasma gondii Pada Sumber Air di Bali.

0 1 7