Estimasi Jarak Genetik dan Faktor Peubah Pembeda Antara Kambing Kacang, Muara dan Samosir Melalui Analisis Kraniometri

ESTIMASI JARAK GENETIK DAN FAKTOR PEUBAH PEMBEDA
ANTARA KAMBING KACANG, MUARA DAN SAMOSIR
MELALUI ANALISIS KRANIOMETRI

SKRIPSI

OLEH:

HARIS SAPUTRA
120306008

PROGRAM STUDI PETERNAKAN
FAKULTAS PERTANIAN
UNIVERSITAS SUMATERA UTARA
2017

Universitas Sumatera Utara

ESTIMASI JARAK GENETIK DAN FAKTOR PEUBAH PEMBEDA
ANTARA KAMBING KACANG, MUARA DAN SAMOSIR
MELALUI ANALISIS KRANIOMETRI


SKRIPSI

OLEH :

HARIS SAPUTRA
120306008/PETERNAKAN

Skripsi sebagai salah satu syarat untuk memperoleh gelar sarjana
di Program Studi Peternakan Fakultas Pertanian
Universitas Sumatera Utara

PROGRAM STUDI PETERNAKAN
FAKULTAS PERTANIAN
UNIVERSITAS SUMATERA UTARA
2017

Universitas Sumatera Utara

Judul Proposal


: Estimasi Jarak Genetik Dan Faktor Peubah Pembeda
Antara Kambing Kacang, Muara Dan Samosir Melalui
Analisis Kraniometri
: Haris Saputra
: 120306008
: Peternakan

Nama
NIM
Program Studi

Disetujui Oleh
Komisi Pembimbing

Hamdan, S.Pt, M.Si
Ketua

Ir. Tri Hesti Wahyuni, M.Sc
Anggota


Mengetahui,

Prof. Dr. Ir. Hasnudi, MS
Ketua Program Studi Peternakan

Tanggal ACC:

Juli 2017

Universitas Sumatera Utara

ABSTRAK

HARIS SAPUTRA, 2017 : Estimasi Jarak Genetik Dan Faktor Peubah Pembeda
Antar Kambing Kacang, Muara Dan Samosir Melalui Analisis Kraniometri.
Dibimbing oleh Hamdan dan Tri Hesti Wahyuni.
Penelitian ini bertujuan untuk melihat jarak genetik dan faktor peubah
pembeda antar jenis kambing yang ada di Sumatera Utara (kambing Kacang,
Muara dan Samosir). Penelitian ini dilaksanakan di desa Paya Bakung, desa

Hamparan Perak dan desa Klambir Lima Kampung, kecamatan Hamparan Perak,
kabupaten Deli Serdang, desa Batu Binumbun, desa Aritonang dan desa Huta
Ginjang, kecamatan Muara, kabupaten Tapanuli Utara, dan di desa Parbaba
Dolok, desa Siopat Sosor dan desa Sinabulan di kecamatan Pangururan dan desa
Ronggur Nihuta, desa Sitonggi-tonggi di kecamatan Ronggur Nihuta, kabupaten
Samosir dari bulan juli 2016. Analisis yang digunakan dalam penelitian ini adalah
Analisis Deskriptif, Analisis Diskriminan, Analisis Kanonikal, Analisis
Komponen Utama, Jarak Genetik dan Pohon Filogenik.
Hasil penelitian ini menunjukkan bahwa jarak genetik kambing yang
terdekat terdapat pada kambing Kacang dengan Samosir dengan nilai (1.937), dan
jarak genetik terjauh terdapat pada bangsa kambing Samosir dengan kambing
Muara (8.671). Peubah-peubah yang menjadi pembeda bangsa kambing adalah
Panjang Tanduk (0.878) dan Lingkar Pangkal Tanduk (0.856).
Dengan nilai jarak genetik paling jauh antara kambing Muara dengan
kambing Samosir yaitu (8.671), dari hasil ini dapat ditarik kesimpulan bahwa
untuk mendapatkan hasil persilangan yang unggul sebaiknya dilakukan
persilangan antar kedua bangsa kambing ini karena dengan nilai jarak genetik
yang paling jauh akan memiliki peluang lebih besar terjadinya heterosis pada hasil
persilangannya.
Kata kunci : Jarak Genetik, Peubah Pembeda, Kambing, Kraniometri.


Universitas Sumatera Utara

ABSTRACT

HARIS SAPUTRA, 2017 : Genetic Distance Estimates And Variable Factors
Distinguishing Between Goat Kacang, Muara And Samosir Through Analysis
Craniometri.
This study aims to look at the genetic distance and variable factors
distinguishing between types of goats in North Sumatra. This research was
conducted in the village of Paya Bakung, the village of Hamparan Perak and
Klambir Lima village, subdistrict Hamparan Perak, Deli Serdang district, the
village of Batu Binumbun, village Aritonang and the village of Huta Ginjang,
subdistrict of Muara, the district of North Tapanuli, and in the village Parbaba
Dolok, village Siopat Sosor and Sinabulan villages in the district and village
Ronggur Nihuta Pangururan, Sitonggi-tonggi village in the district Ronggur
Nihuta, Samosir regency of the month of July 2016. the analysis used in this
research is descriptive analysis, discriminant analysis, canonical analysis,
Principal Component Analysis, Distance genetic and Tree Filogenik.
The results showed that the genetic distance of the nearest goat found in

goat Kacang with Samosir by value (1.937), and the farthest genetic distance
found in the nation goat Samsir with goat Muara (8.671). Variables that made the
difference is the goat race Base Rim Horn (0.856) and Long Horn (0.878).
With the value of genetic distance most far between goat Muara with goat
Samosir ie (8.671), from these results it can be concluded that to get the result of
crossing a superior should be a cross between the two nations goat for the value
of genetic distance of the most distant will have a better chance the occurrence of
heterosis in crosses results.
Keywords: Genetic Distance, Distinguishing variables, Horse, Craniometri.

Universitas Sumatera Utara

RIWAYAT HIDUP

Penulis dilahirkan di desa Huta Toras, kecamatan Pakantan, kabupaten
Mandailing Natal, Provinsi Sumatera Utara pada tanggal 05 Nopember 1993 dari
Bapak Alm. Rahmad Syah Lubis dan Ibu Yus Hanum Nasution. Penulis
merupakan anak ke-tiga dari empat bersaudara.
Tahun 2012 penulis lulus dari SMK N 2 Kotanopan, dan pada tahun yang
sama penulis masuk ke Program Studi Peternakan, Fakultas Pertanian, Universitas

Sumatera Uatara melalu jalur Seleksi Nasional Masuk Perguruan Tinggi Negeri
(SNMPTN).
Selama mengikuti perkuliahan penulis pernah menjabat sebagai wakil
ketua dalam organisasi Himpunan Mahasiswa Muslim Peternakan (HIMMIP),
pernah ikut dalam organisasi Badan Kemakmuran Mushalla (BKM) Fakultas
Pertanian. Penulis juga aktif pada beberapa kepanitian seperti Pekan Olahraga dan
Seni Peternakan (PORSIPET) dan Pekan Olahraga dan Seni (PORSENI), Fakultas
Pertanian Universitas Sumatera Utara dan penulis pernah menjadi coordinator
bagian dalam kegiatan Toba Go Green yang diselenggarakan oleh Fakultas
Pertanian, Universitas Sumatera Utara.
Selama proses perkuliahan penulis menerima beasiswa Bantuan Belajar
Mahasiswa (BBM) tahun (2013 dan 2014) dan beasiswa Peningkatan Prestati
Akademik (PPA) pada tahun (2015). Penulis melaksanakan Praktek Kerja
Lapangan (PKL) di UD. Teratai Peternakan Sapi Potong, Desa Dalu X B, Tanjung
Morawa, Sumatera Utara mulai dari bulan Juli sampai dengan Agustus 2015.

Universitas Sumatera Utara

KATA PENGANTAR


Puji dan syukur penulis ucapkan kehadirat Tuhan Yang Maha Esa atas
berkat dan rahmat-Nya sehingga penulis dapat menyelesaikan Skripsi yang
berjudul “Estimasi Jarak Genetik dan Faktor Peubah Pembeda Antara Kambing
Kacang, Muara dan Samosir Melalui Analisis Kraniometri”.
Pada kesempatan ini penulis mengucapkan terimakasih kepada bapak
Hamdan, S.Pt, M.Si selaku ketua komisi pembimbing dan kepada ibu
Ir. Tri Hesti Wahyuni, M. Sc selaku anggota pembimbing atas segala bimbingan
saran dan pengarahannya sehingga penelitian dan penulisan skripsi ini dapat
terselesaikan dan kepada seluruh pihak terkait yang tidak dapat disebutkan satu
persatu yang telah memberi dukungan kepada penulis dalam pembuatan Skripsi
ini.
Penulis menyadari bahwa Skripsi ini masih jauh dari kesempurnaan. Oleh
karena itu, penulis mengharapkan kritik dan saran yang membangun demi
perbaikan di selanjutnya. Akhir kata penulis mengucapkan terimakasih.

Universitas Sumatera Utara

DAFTAR ISI

Hal

ABSTRAK ............................................................................................................ i
ABSTRACT .......................................................................................................... ii
DAFTAR RIWAYAT HIDUP .............................................................................. iii
KATA PENGANTAR .......................................................................................... iv
DAFTAR ISI ......................................................................................................... v
DAFTAR GAMBAR ............................................................................................ vi
DAFTAR TABEL ................................................................................................. vii
PENDAHULUAN
Latar Belakang ...................................................................................................... 1
Tujuan Penelitian .................................................................................................. 3
Kegunaan Penelitian.............................................................................................. 3
TINJAUAN PUSTAKA
Kondisi Umum Lokasi Penelitian
Kecamatan Hamparan Perak ......................................................................... 4
Kecamatan Muara ......................................................................................... 5
Kabupaten Samosir ....................................................................................... 6
Sejarah Domestikasi Kambing .............................................................................. 6
Kambing Kacang................................................................................................... 8
Kambing Muara .................................................................................................... 9
Kambing Samosir .................................................................................................. 10

Korelasi Kraniometri ............................................................................................. 11
Keragaman Fenotip ............................................................................................... 13
Metode Analisis
Karakterisasi ................................................................................................. 14
Analisis Diskriminan.................................................................................... 14
Analisis Kanonikal ....................................................................................... 15
Analisis Komponen Utama (AKU) .............................................................. 16
Jarak Genetik................................................................................................ 17
Pohon Filogenik ........................................................................................... 18
Alat Ukur ............................................................................................................... 20
BAHAN DAN METODE PENELITIAN
Tempat dan Waktu Penelitian ............................................................................... 21
Bahan dan Alat
Bahan ............................................................................................................ 21
Alat ................................................................................................................ 21
Metode Penelitian.................................................................................................. 22
Parameter Penelitian.............................................................................................. 22
Analisa Data .......................................................................................................... 23

Universitas Sumatera Utara


HASIL DAN PEMBAHASAN
Perbandingan Kraniometrik Kambing .................................................................. 27
Peubah Pembeda Bangsa Kambing ....................................................................... 31
Analisis Gerombol Bangsa Kambing .................................................................... 31
Analisis Gerombol Bangsa Kambing Jantan......................................................... 32
Analisis Gerombol Bangsa Kambing Betina ........................................................ 33
Analisis Diskriminan............................................................................................. 34
Penentuan Estimasi Jarak Genetik Dan Dendogram Antar Bangsa Kambing ...... 35
KESIMPULAN DAN SARAN
Kesimpulan ........................................................................................................... 37
Saran ...................................................................................................................... 37
DAFTAR PUSTAKA
LAMPIRAN

Universitas Sumatera Utara

DAFTAR GAMBAR

Hal
Gambar 1. Kambing Kacang ................................................................................. 9
Gambar 2. Kambing Muara................................................................................... 9
Gambar 3. Kambing Samosir ................................................................................ 11
Gambar 4. Parameter yang diukur ........................................................................ 23
Gambar 5. Analisis Gerombol bangsa kambing ................................................... 32
Gambar 6. Analisis Gerombol bangsa kambing Jantan ........................................ 32
Gambar 7. Analisis Gerombol bangsa kambing Betina ........................................ 33
Gambar 8. Analisis Dendogram ............................................................................ 36

Universitas Sumatera Utara

DAFTAR TABEL

Hal
Tabel 1. Rataan, simpangan baku dan koefisien keragaman peubah antar
kambing Kacang(dewasa tubuh) ............................................................. 27
Tabel 2. Rataan, simpangan baku dan koefisien keragaman peubah antar
kambing Muara (dewasa tubuh) .............................................................. 28
Tabel 3. Rataan, simpangan baku dan koefisien keragaman peubah antar
kambing Samosir (dewasa tubuh) .......................................................... 29
Tabel 4. Rataan, simpangan baku dan koefisien keragaman peubah antar
kambing (dewasa tubuh) ......................................................................... 30
Tabel 5. Struktur peubah bangsa kambing ............................................................ 31
Tabel 6. Analisis Diskriminan............................................................................... 34
Tabel 7. Matriks jarak genetik bangsa kambing ................................................... 35

Universitas Sumatera Utara