Purifi kasi secretory leukocyte protease inhibitor membran amnion rekombinan sebagai kandidat biomaterial menggunakan kromatografi afi nitas

  Vol. 64, No. 1, Januari-April 2015 | Hal. 11-16 | ISSN 0024-9548

Purifi kasi secretory leukocyte protease inhibitor

membran amnion rekombinan sebagai kandidat

biomaterial menggunakan kromatografi afi nitas

  

(Purifi cation of recombinant secretory leukocyte protease inhibitor amniotic

membrane as a biomaterial candidat by chromatography affi nity)

  Meiriani Putri, Elly Munadziroh, dan Soebagio Departemen Ilmu Material Kedokteran Gigi Fakultas Kedokteran Gigi Universitas Airlangga Surabaya-Indonesia

Korespondensi (correspondence): Meiriani Putri, Departemen Ilmu Material Kedokteran Gigi, Fakultas Kedokteran Gigi Universitas Airlangga.

  Jln. Mayjen. Prof. Dr. Moestopo No. 47 Surabaya 60132, Indonesia. E-mail: meiriani_020911044@yahoo.com ABSTRACT

Background: SLPI is a non-glycosylated protein as a biomaterial active in the wound healing process. Recombinant SLPI Amniotic

Membrane expressed in E.coli BL21 star with histidin tag. Purifi cation performed using a ffi nity chromatography with Ni-NTA column. Purpose: Purify recombinant SLPI amniotic membrane as a biomaterial candidat using a ffi nity chromatography with

Ni-NTA column. Method: Rocked recombinant SLPI amniotic membrane with Ni-NTA column. Eluted Ni-NTA bound protein

by imidazole. Optimization of the concentration gradient of imidazole with a storied, 50, 100, 150 and 200 mM. Results calculated

elution of protein concentration using Bradford assay. Results: Decrease in the concentration of the fl owtrough and washing than

the crude, from 3,745 decrease to 1,857 for fl owtrough and 1,348 for washing. Signifi cant increase in the concentraation of the

elution concentration of 50 mM imidazole of a second fraction at 1,0125, third fraction at 0,9225, and fourth fraction at 0,7425.

In fractions of 100 mM and 200 mM obtained a low protein concentration. Conclusion: Recombinant SLPI amniotic membrane

can be purifi ed using a

  ffi nity chromatography with Ni-NTA column.

  Keywords: SLPI; chromatography a ffi nity; Ni-NTA column ABSTRAK

Latar belakang: SLPI adalah protein non glikosilasi sebagai biomaterial aktif penyembuhan luka. SLPI membran amnion rekombinan

diekspresikan pada E.coli BL21 star telah dilengkapi tag histidin. Purifi kasi dilakukan menggunakan kromatografi afi nitas dengan

kolom Ni-NTA. Tujuan: Memurnikan SLPI membran amnion rekombinan sebagai kandidat biomaterial menggunakan kromatografi

afi nitas dengan kolom Ni-NTA. Metode: SLPI membran amnion rekombinan dimasukkan dalam kolom Ni-NTA. Elusi protein yang

terikat pada Ni-NTA menggunakan imidazol. Optimasi konsentrasi imidazol dengan gradien bertingkat, yaitu 50, 100, 150 dan

200 mM. Hasil elusi dihitung konsentrasi protein menggunakan Bradford assay. Hasil: Penurunankonsentrasi pada fl owthrough

dan washing dibandingkan dengan ekstrak kasar, yaitu dari 3,745 menjadi 1,857 untuk fl owtrough dan 1,348 untuk washing.

Peningkatan konsentrasi yang bermakna pada konsentrasi imidazol 50 mM fraksi ke-2 sebesar 1,0125, fraksi ke-3 sebesar 0,9225

dan fraksi ke-4 sebesar 0,7425. Pada fraksi-fraksi imidazol 100 mM sampai 200 mM didapatkan konsentrasi protein yang rendah.

Simpulan: SLPI membran amnion rekombinan dapat dimurnikan menggunakan kromatografi afi nitas dengan kolom Ni-NTA.

  Kata kunci: SLPI; kromatografi afi nitas; kolom Ni-NTA

  Putri, dkk.: Purifi kasi secretory leukocyte protease inhibitor membran amnion rekombinan Jurnal PDGI 64 (1) Hal. 11-16 © 2015

  300 mM NaCL, 250 mM imidazol, pH 8,0) dan Bradford working bufer. Perlengkapan alat yang digunakan adalah

  BAHAN DAN METODE

  Sampel penelitian yang digunakan dalam penelitian adalah E.coli BL21 star DE3 pET_SLPI.

  2 Bahan yang digunakan adalah E.coliBL-21 star DE3

  pET_SLPI, NaCl (1.06404.1000, Merck KgaA), tripton (Cat 1612.00, Conda), yeast extract (REF 212750, Becton, Dickinson and Company), bacto-agar (REF 214010, Becton, Dickinson and Company), aquades, kolom manual, Ni-NTA agarose (Nat. No. 1018244, Qiagen GmbH), IPTG (#PC0708, Vivantis Inc. USA), imidazol (L59139916 029, Merck KGaA), ampisilin (M. W. 371.39, MDBio, Inc), bufer fosfat pH 8, bufer A (50 mM NaH

  2 PO

  4

  , 300 ml NaCl, 20 mM imidazol, pH 8), bufer B (50 mM NaH

  2 PO 4,

  Autoklaf (OSK 6508 Steam pressure apparatus Ogawa Seiki Co., LTD), laminar flow (Bio clean Bench),

  7 Penelitian ini bertujuan untuk menghasilkan

  shaker incubator

  (Laboshake, Gerhadt), high speed

  micro refrigerated centrifuge

  (MRX-150 merk TOMY), timbangan analitik (Me tt ler AJI 50), oven (Memmert, Jerman), lemari pendingin -20 C (Royal Chest Freezer BD195), pipet mikro (NichipetEX, Nichiryo), spektrofotometer UV-VIS (Shimadzu 1700 pharma), vortex (Labinco L46) dan kolom manual.

  Pembuatan media padat LB-ampisilin dengan cara, 0,4 gram bacto-agar, 0,2 gram tripton, 0,2 gram NaCl, 0,1 gram yeast extract dilarutkan pada 20 ml aquades. Disterilkan menggunakan autoklaf pada suhu 121º C selama 15 menit. Media steril yang telah hangat ditambah dengan 20 μl ampisilin (100mg/ ml), dihomogenkan kemudian dituang ke dalam cawan petri. Pembuatan media cair LB-ampisilin sebanyak 5 ml dan 500 ml. Untuk 5 ml, ditimbang 0,05 g tipton, 0,05 g NaCl, dan 0,025 g yeast extract, dilarutkan dalam 5 ml aquades. Sedangkan untuk 500 ml ditimbang 5 g tripton, 5 g NaCl, dan 2,5 g yeast extract, dilarutkan dalam 500 ml aquades. Disterilkan dengan autoklaf pada suhu 121 C selama 15 menit setelah media hangat ditambahkan 5 μl ampisilin untuk 5 ml media cair LB dan 500 μl ampisilin untuk 500 ml media cair LB.

  8 Peremajaan E.coli BL21 star DE3 pET_SLPI dari

  stok gliserol yang sudah mencair dan sudah dapat dilakukan pengambilan menggunakan jarum ose kemudian digoreskan pada media padat LB- ampisilin secara aseptik. Diinkubasi pada suhu 37

  o

  bioproduk SLPI membran amnion rekombinan murni sebagai kandidat dental biomaterial pempercepat penyembuhan luka resesi gingiva.

  telah dimurnikan dengan kromatografi afinitas menggunakan kolom Ni-NTA dilakukan penentuan konsentrasi protein untuk elektroforesis gel menggunakan Bradford assay.

  PENDAHULUAN

  molekul 11,7 kDa yang terdiri dari 107 asam amino, tidak mengalami glikosilasi, stabil dalam kondisi asam, dan terdiri dari dua domain homolog kaya sistein dan domain C-terminal yaang berperan dalam inhibisi elastase.

  Konsep perawatan dan penyembuhan luka saat ini telah berkembang, seiring berkembangnya biomaterial di bidang kedokteran gigi. Material alami saat ini dipertimbangkan pemakaiannnya karena mengandung komponen yang menunjang perawatan dan penyembuhan luka seperti pada perawatan resesi gingiva secara bedah dapat menimbulkan luka muko gingiva yang cukup besar karena tarikan gingiva ke arah koronal pada.

  1 Salah satu material alami yang diharapkan dapat

  mempercepat penyembuhan luka adalah membran amnion. Biomaterial banyak yang direkayasa dengan teknik rekayasa genetika untuk mendapatkan protein rekombinan, salah satunya secretory leukocyte

  protease inhibitor

  (SLPI) yang berasal dari membran amnion. Penelitian sebelumnya telah berhasil megekspresikan SLPI manusia yang berasal dari membran amnion sebagai SLPI rekombinan full-

  length

  (rSLPI) di E.coliBL21 star dengan dilengkapi tag histidin (E. coli BL21 star DE3 pET_SLPI).

  2 SLPI adalah protein rantai tunggal dengan berat

  3 Hasil purifi kasi SLPI rekombinan sebelumnya

  6 SLPI membran amnion rekombinan yang

  menggunakan fast protein liquid chromatography (FPLC) dengan kolom immobilized metal affinity

  chromatography

  (IMAC) berisi resin iminodiacetic

  acid

  (Ni-NDA) didapatkan SLPI dengan tingkat kemurnian rendah.

  4 Pada penelitian ini, purifi kasi

  SLPI rekombinan menggunakan kromatografi afi nitas dengan kolom resin nitrilotiacetic acid (Ni- NTA). Agarosa Ni-NTA banyak digunakan untuk purifi kasi protein karena mempunyai afi nitas tinggi dan selektivitas untuk protein rekombinan yang ditandai dengan enam residu histidin.

  5 Teknik purifi kasi protein yang digunakan harus

  disesuaikan dengan tujuan pemanfaatan protein tersebut, sehingga dapat diperoleh dengan tingkat kemurniaan yang diharapkan. Teknik kromatografi berdasarkan afi nitas merupakan teknik yang cukup efektif untuk purifi kasi protein.

  C selama ± 18 jam. Nantinya koloni tunggal yang

  Putri, dkk.: Purifi kasi secretory leukocyte protease inhibitor membran amnion rekombinan Jurnal PDGI 64 (1) Hal. 11-16 © 2015

9 Biakan E.coliBL21 star DE3 pET_SLPI sebanyak 5

  Hasil peremajaan isolat E. coli BL21 star DE3 pET_ SLPI pada media padat LB-ampisilin yaitu tampak pertumbuhan E. coli BL21 star DE3 pET_SLPI. Hasil inokulum berupa perubahan tingkat kekeruhan yang terjadi pada media cair LB-ampisilin sebelum dan setelah dilakukan inokulasi. Ekstrak kasar SLPI membran amnion rekombinan berupa supernatan, hasil lisis pelet yang didapatkan dari hasil panen E.

  Setelah didapatkan data absorbansi untuk masing-masing konsentrasi BSA maka dapat diperoleh persamaan regresi kurva standar dengan persamaan Y=bX+a, Y sebagai fungsi absorbansi

  0.02 0.018 0.019 0.02 0.078 0.087 0.082 0.04 0.168 0.17 0.169 0.06 0.248 0.214 0.231 0.08 0.301 0.332 0.316 0.1 0.382 0.392 0.387

  Absorbansi Rata-rata Absorbansi A 1 A 2 0.005

  Tabel 1. Data hasil pengukuran konsentrasi BSA Konsentrasi BSA (mg/mL)

  Pembuatan kurva standar protein dilakukan sebelum mengukur konsentrasi SLPI membran amnion rekombinan. Pembuatan kurva standar protein dilakukan menggunakan metode Bradford dengan variasi konsentrasi Bovine Serum Albumin (BSA). Hasil pengukuran konsentrasi BSA dapat dilihat pada Tabel 1.

  Ekstrak kasar SLPI membran amnion rekombinan berupa supernatan yang didapatkan berwarna kekuningan. Hasil purifi kasi ekstrak kasar SLPI membran amnion rekombinan yaitu berupa pembuangan protein yang tidak terikat (fl owthrough) dan pencucian dari protein yang tidak terikat (washing). Pada saat pembuangan protein yang tidak terikat didapatkan larutan berwarna kekuningan pucat, sedangkan hasil proses pencucian dari protein yang tidak terikat yaitu didapatkan larutan berwarna kekuningan dengan intensitas yang lebih pucat dibandingkan dengan flowthrough. Hasil proses elusi didapatkan larutan yang tidak berwarna atau bening.

  coli BL21 star DE3 pET_SLPI dari media produksi.

  HASIL

  terbentuk diambil untuk diinokulasikan ke 5 ml media cair LB-ampisilin kemudian dimasukkan dalam shaker incubator pada suhu 37 °C dengan kecepatan 150 rpm selama ± 18 jam.

  diperlukan adanya kontrol, yaitu berupa akuades. Kontrol dan tiap sampel yang akan dilakukan pengujian, diambil sebanyak 20 μl, ditambahkan 1 ml Bradford Working Bufer. Campuran reaksi dicampurkan menggunakan vortek dengan tanpa menimbulkan buih selama 30 detik, kemudian diinkubasi selama 2 menit pada suhu ruang. Absorbansi larutan protein diukur pada panjang gelombang 595 nm. Setelah 2 menit, sampel dimasukkan dalam spektrofotometer UV-VIS untuk dilakukan penentuan konsentrasi protein.

  7

  Pada uji Bradford

  Supernatan sebanyak 5 ml dimasukkan dalam kolom Ni-NTA kemudian diinkubasi pada penangas es selama 2 jam. Ditampung hasil inkubasi. Kolom dicuci 5 kali dengan 500 μl bufer A lalu hasil ditampung. Kolom dicuci 5 kali dengan 500 μl bufer B (konsentrasi imidazol 50 mM), kemudian setiap hasil ditampung. Kolom dicuci 5 kali dengan 500 μl bufer B (konsentrasi imidazol 100 mM), kemudian setiap hasil ditampung kembali. Kolom dicuci 5 kali dengan 500 μl bufer B (konsentrasi imidazol 150 mM), kemudian setiap hasil ditampung kembali. Kolom dicuci 5 kali dengan 500 μl bufer B (konsentrasi imidazol 200 mM), kemudian setiap hasil ditampung kembali. Setiap hasil supernatan yang telah ditampung dihitung konsentrasi protein menggunakan Bradford assay.

  Kolom dipreparasi dengan cara dimasukkan 1 ml agarosa Ni-NTA, ditambahkan 500 μl bufer A sebanyak 5 kali untuk proses pencucian kemudian hasil pencucian dikeluarkan melalui ujung kolom.

  Kemudian disentrifugasi pada kecepatan 3500 rpm selama 15 menit, supernatan ditampung dan pelet dibuang.

  sekitar 0,5-0,8. Ditambahkan sebanyak 1,25 ml IPTG 0,4 M ke dalam media produksi, lalu digojog selama 4 jam, kemudian disentrifugasi pada kecepatan 3500 rpm selama 15 menit, supernatan dibuang dan pelet ditampung. Pelet diambil dan dilarutkan dalam bufer fosfat pH 8 sebanyak 20 ml, lalu disentrifugasi pada kecepatan 3500 rpm selama 10 menit, supernatan dibuang dan pelet ditampung. Pelet diambil dan dilarutkan dalam bufer A sebanyak 5 ml. Pelet dilisis menggunakan ultrasanikator dengan frekuensi

  600

  ml diinokulasikan ke dalam 500 ml media cair LB- ampisilin, kemudian digojog selama 2 jam hingga mendapat OD

20 Hz (15 detik on + 30 detik o ff , diulang 7 kali).

  Putri, dkk.: Purifi kasi secretory leukocyte protease inhibitor membran amnion rekombinan Jurnal PDGI 64 (1) Hal. 11-16 © 2015 dan X sebagai fungsi konsentrasi BSA (mg/mL).

  Persamaan regresi linier yang diperoleh dari grafi k dibawah ini yaitu Y=3.853x + 0.004 dengan nilai R

  2 =0.998.

  Gambar 1. Kurva standar konsentrasi protein.

  Perubahan warna yang tampak hasil reaksi antara SLPI membran amnion rekombinan dengan pereaksi Bradford yaitu warna biru keh ij auan menjadi biru terang. Pengukuran absorbansi SLPI membran amnion rekombinan setiap sampel dilakukan sebanyak dua kali (duplo). Sebelumnya telah dilakukan pengukuran absorbansi pada kontrol dan didapatkan hasil 0,31. Hasil pengukuran setiap absorbansi SLPI membran amnion rekombinan dikurangi 0,31. Rata-rata absorbansi yang didapatkan kemudian dimasukkan dalam persamaan regresi linier untuk mendapatkan konsentrasi SLPI membran amnion rekombinan pada setiap sampel. Tetapi hasil konsentrasi SLPI membran amnion tersebut bukan konsentrasi total karena pada beberapa sampel dilakukan pengenceran. Sehingga konsentrasi total pada setiap sampel didapatkan dari konsentrasi SLPI membran amnion rekombinan dikalikan dengan banyaknya pengenceran yang dilakukan. Hasil konsentrasi SLPI membran amnion rekombinan total ditampilkan pada gambar 2.

  Hasil pengukuran konsentrasi SLPI membran amnion rekombinan menunjukkan bahwa terjadi penurunan konsentrasi protein pada fraksi

  flowthrough

  dan washing dibandingkan dengan ekstrak kasar, yaitu dari 3,745 menjadi 1,857 untuk

  fl owtrough

  dan 1,348 untuk washing. Tetapi terdapat peningkatan konsentrasi protein pada elusi protein dengan konsentrasi imidazol 50 mM. Peningkatan konsentrasi protein yang bermakna pada konsentrasi imidazol 50 mM fraksi ke-2 sebesar 1,0125, fraksi ke-3 sebesar 0,9225 dan fraksi ke-4 sebesar 0,7425 imidazol 50 mM disebabkan oleh adanya imidazol yang ditambahkan pada larutan elusi. Kemudian pada konsentrasi imidazol selanjutnya didapatkan fraksi dengan konsentrasi protein yang sangat kecil. Pada fraksi-fraksi imidazol 100 mM sampai dari 200 mM didapatkan konsentrasi protein yang rendah.

  PEMBAHASAN

  SLPI yang berasal dari membran amnion diharapkan menghasilkan bioproduk SLPI membran amnion rekombinan murni sebagai kandidat dental biomaterial pempercepat penyembuhan luka resesi gingiva. Untuk mendapatkan SLPI rekombinan, terlebih dahulu SLPI direkayasa dengan teknik

  Gambar 2. Konsentrasi SLPI membran amnion rekombinan total dalam bentuk grafi k batang.

  Putri, dkk.: Purifi kasi secretory leukocyte protease inhibitor membran amnion rekombinan Jurnal PDGI 64 (1) Hal. 11-16 © 2015

10 Koloni tunggal hasil peremajaan isolat E. Coli BL21

  12 Pada penelitian ini,

  5 Elusi pada protein his tag efektif dengan kosentrasi imidazol 20-250 Mm.

  , kemudian akan terelusi dengan bufer yang mengandung imidazol. Imidazol memiliki struktur yang sama dengan cincin rantai samping residu histidin. Hal ini menjadikan imidazol dapat menggantikan protein untuk berikatan dengan ligan, sehingga protein target dapat terlepas dari kolom. Konsentrasi imidazol dalam bufer elusi selama purifi kasi kromatografi afi nitas dioptimasi secara manual.

  2+

  selektif pada ligan Ni

  5 Tag histidin dalam SLPI rekombinan akan terikat

  . Sisanya dua sisi koordinasi biasanya ditempati oleh molekul air dan dapat digantikan dengan residu histidin dari protein rekombinan. Pembentukan sisi koordinasi telah berubah menjadi optimal untuk purifi kasi protein tag histidin.

  2+

  dengan tag histidin (6xHis), sehingga kolom yang digunakan dalam proses purifi kasi adalah dengan kolom Ni-NTA. NTA adalah chelator tetradentate karena menempati dari 6 sisi pengikat dalam lingkup koordinasi ion Ni

  11 Protein SLPI rekombinan telah dilengkapi

  Penelitian purifi kasi sebelumnya menggunakan FPLC dengan kolom IMAC berisi resin Ni-NDA. Penelitian kali ini menggunakan kromatografi afi nitas dengan kolom berisi resin Ni-NTA. Pada proses purifi kasi protein, umumnya digunakan ligan NTA dibanding IDA, terutama proses purifi kasi dengan kolom manual. Secara umum, NTA lebih kuat dalam mengikat protein karena memiliki sisi pengikatan yang lebih banyak untuk berinteraksi dengan ion logam daripada IDA. Sedangkan jika menggunakan IDA, level pelepasan ion logam cenderung lebih besar dan pengikatan proteinnya menjadi lebih rendah dari NTA.

  Pada tahap ini telah didapatkan ekstrak kasar SLPI rekombinan yang akan ditentukan konsentrasi protein dan digunakan untuk tahapan purifi kasi.

  berhasil megekspresikan SLPI manusia yang berasal dari membran amnion sebagai SLPI rekombinan full-

2 SLPI membran amnion rekombinan diharapkan

  berkisar 0,5-0,8. Penggunaan IPTG sebagai induser, karena IPTG tidak dimetabolisme oleh sel.

  Pengukuran konsentrasi protein dilakukan setelah proses elusi selesai. Kosentrasi protein dalam sampel sangat penting untuk diketahui. Situasi paling umum dimana informasi tersebut diperlukan terdapat dalam 3 kategori, diantaranya karakterisasi dan purifi kasi pada protein dan enzim, studi fi siologis pada ekspresi protein, dan diagnosa klinis kadar protein yang diubah dalam cairan tubuh

  600

  telah mencapai 0,6, yakni sel berada pada fase pertumbuhan logaritma (eksponensial). Pada fase ini sel membelah diri paling cepat dengan waktu generasi pendek dan konstan. Selama fase logaritma, metabolisme sel paling aktif, sintesis bahan sel sangat cepat dangan jumlah konstan sampai nutrisi habis atau terjadinya penimbunan hasil metabolisme yang menyebabkan terhambatnya pertumbuhan. Kondisi ini sesuai dengan prosedur standar induksi IPTG pada E.Coli, dimana waktu ideal saat memulai induksi adalah ketika OD

  600

  BL21 star DE3 pET_SLPI ditandai dengan perubahan tingkat kekeruhan dari media cair LB- ampisilin. Setelah diketahui adanya pertumbuhan bakteri, dilakukan proses induksi IPTG ke dalam media produksi setelah 2 jam. Hal ini dilakukan karena OD

  E. coli

  produksi dengan menginokulasikan inokulum isolat E. coli BL21 star DE3 pET_SLPI pada media produksi LB-ampisilin. Adanya pertumbuhan isolat

  coli BL21 star DE3 pET_SLPI, maka dapat dilakukan

  DE3 pET_SLPI digunakan untuk pembuatan inokulum. Setelah didapatkan inokulum isolat E.

  star

  E.coli dapat tumbuh pada media LB-ampisilin karena bakteri ini resisten terhadap ampisilin.

  Peremajaan isolat E.coli BL21 star DE3 pET_SLPI dari stok gliserol dilakukan dengan cara digoreskan pada media padat LB-ampisilin. Dapat diketahui hasil dari peremajaan isolat tampak tumbuh mengikuti alur goresan pada media padat LB- ampisilin. Daerah sekitar goresan tampak bersih, hal ini membuktikan tidak terjadi kontaminasi.

  dalam kondisi murni untuk menghilangkan debris, meningkatkan konsentrasinya dan menjaga protein tetap stabil sehingga dapat dimanfaatkan menjadi kandidat biomaterial pempercepat penyembuhan luka resesi gingiva. Sebelum dilakukan purifi kasi, SLPI membran amnion rekombinan harus diproduksi dalam jumlah banyak.

  (rSLPI) di E.coli BL21 star dengan dilengkapi tag histidin (E.coli BL21 star DE3 pET_SLPI).

  length

  bufer A sebagai pencuci menggunakan imidazol 20 mM, sedangkan bufer B sebagai elusi menggunakan imidazol bertingkat, yaitu 50 mM, 100 mM, 150 mM dan 200 mM.

4 Panen dari media produksi dipisahkan melalui proses sentrifugasi, sehingga didapatkan pelet.

  DE3 pET_SLPI secara fi sika yaitu menggunakan alat sonikator. Ekstrak kasar SLPI rekombinan dipisahkan dari debris sel melalui proses sentrifugasi.

  Untuk mendapatkan ekstrak kasar SLPI rekombinan diperlukan proses pemecahan dinding sel E.coli BL21

  star

  Putri, dkk.: Purifi kasi secretory leukocyte protease inhibitor membran amnion rekombinan Jurnal PDGI 64 (1) Hal. 11-16 © 2015 yaitu untuk indikasi berbagai penyakit.

  8. Sezonov G, Joseleau-Petit D, D’Ari R. Escherhia coli physiology in Luria Bertani Broth. J of Bacteriology 2007; 189(23): 8746-49.

  4. Purnamasari S. Analisis inhibisi secretory leukocyte protease inhibitor (slpi) terhadap enzim porcine pankreatic elastase (ppe). Tesis. Surabaya: Fakultas Sains dan Teknologi Universitas Airlangga; 2011.

  5. Invitrogen. Ni-NTA purifi cation system: For purifi cation of polyhistidine-containing recombinant proteins.

  Invitrogen Corporation 2006; p. 1-23.

  6. Hage SD. Handbook of a ffi nity chromatography. 2 nd ed.

  Boca Raton: CRC press; 2006. p. 593.

  7. Bradford MM. A rapid and sensitive method for the quantitation of microgram quantities of protein utilizing the principle of protein dye binding. Anal Biochem 1976; 72: 248-54.

  9. Black Jacquelyn G. Microbiology: Principles and explorations. 4 th ed. New York: John Wiley Sons; 1999. p. 155.

  2. Munadziroh E. Karakterisasi, ekspresi, dan kloning gen penyandi protein secretory leukocyte protease inhibitor membran amnion sebagai kandidat untuk mempercepat penyembuhan luka gingiva. Disertasi. Surabaya: Fakultas Kedokteran Gigi Universitas Airlangga; 2007.

  10. Kutmanova MD, Ainura. Antimicrobial resistance of pathogens of acute intestinal infection in Kyrgyz Republic. Turkiye EKMUD Kongresi 2012.

  11. Chaga G, Bochkariov DE, Jokhadze GG, Hopp J, Nelson P. Natural poly-histidine affinity tag for purification of recombinant proteins on cobalt(II)- carboxymet hylaspartate crossli n ked agarose. J Chromatography 1999; 864(2): 247-56.

  12. Terpe K. Overview of tag protein fusions: frommolecular and biochemical fundamentals to commercial systems.

  Appl Microbiol Biotechnol 2003; 60: 523-24.

  13. Ninfa AJ, Ballou DP, Benore M. Fundamental laboratory approaches for biochemistry and biotechnology. New York: John Wiley Sons; 2009. p. 114.

  14. Stoscheck CM. Quantification of protein. Methods Enzymol 1990; 182: 50-68.

  3. Angelov N, Moutsopoulos N, Jeong Moon-Jin, Nares S, Aschro ft G, Wahl SM. Aberrant mucosal wound repair in the absence of secretory leukocyte protease inhibitor. Thromb Haemost 2004; 92: 288-97.

  1. New m a n MG, Ta ke i H H. C a r ra n z a’s c l i n ic a l periodontology. 9 th ed. Philadelphia: WB Saunders Co; 2002. p. 651.

  13 Salah satu cara untuk mengukur konsentrasi protein adalah menggunakan Bradford assay.

  7 Pengikatan dye, Coomassie Brilliant Blue G-250

  Bradford assay

  direkomendasikan untuk penggunaan umum, terutama menentukan kadar protein fraksi sel dan menilai konsentrasi protein untuk elektroforesis gel, seperti Sodium Dodecyl Sulfate

  Polyacrilamide Gel Electrophoresis (SDS-page).

  14 Bradford assay

  adalah metode penentuan protein yang melibatkan pengikatan dari Coomassie Brilliant

  Blue G-250 sebagai dye dengan protein.

  , untuk protein menyebabkan pergeseran pada absorbsi maksimum

  DAFTAR PUSTAKA

  dye

  dari 465 nm (merah) sampai 595 nm (biru) di cairan asam.

  15 Pengenceran dilakukan pada beberapa sampel

  diantaranya ekstrak kasar, flowtrough, washing dan elusi imidazol 50 mM fraksi ke-2 sampai ke-

  4. Pengenceran dilakukan pada beberapa sampel tersebut di atas karena saat dilakukan pengukuran absorbansi didapatkan hasil lebih dari 0,387. Hasil absorbansi lebih dari 0,387 tidak dapat dimasukkan dalam persamaan regresi linier yang telah didapatkan dari kurva standar sehingga perlu dilakukan pengenceran sampai didapatkan absorbansi kurang dari sama dengan 0,387.

  Ha s i l pe n g u k u r a n k o n s en t ra s i p r o t e i n menunjukkan bahwa terjadi penurunan konsentrasi protein pada fraksi flowthrough dan washing dibandingkan dengan ekstrak kasar, yaitu dari 3,745 menjadi 1,857 untuk flowtrough dan 1,348 untuk washing. Hasil ini menunjukkan adanya protein yang diduga terikat atau tertahan pada ligan. Dugaan ini diperkuat setelah dilakukan elusi menggunakan imidazol 50 mM yang menunjukkan adanya peningkatan konsentrasi protein yang bermakna pada fraksi ke-2 sampai dari ke-4, yaitu pada konsentrasi imidazol 50 mM fraksi ke-2 sebesar 1,0125, fraksi ke-3 sebesar 0,9225 dan fraksi ke-4 sebesar 0,7425 imidazol 50 mM disebabkan oleh adanya imidazol yang ditambahkan pada larutan elusi. Kemudian pada konsentrasi imidazol selanjutnya didapatkan fraksi dengan konsentrasi protein yang sangat kecil. Pada fraksi-fraksi imidazol 100 mM sampai dari 200 mM didapatkan konsentrasi protein yang rendah. Oleh karena itu untuk membuktikan kebenaran apakah SLPI rekombinan terelusi pada imidazol 50 mM maka dilakukan analisis protein menggunakan SDS-page pada penelitian yang lainnya.

  Simpulan dari penelitian ini adalah SLPI membran amnion rekombinan dapat dimurnikan menggunakan kromatografi afi nitas dengan kolom Ni-NTA.

  15. Sedmark JJ, Grossberg, Sidney E. A rapid, sensitive and versatile assay for protein using Coomassie Brilliant Blue G-250. Anal Biochem 1977; 79: 544-552.

Dokumen yang terkait

Ekspresi tissue inhibitor metaloproteinase-2 pada metastasis kelenjar limfe leher pada karsinoma sel skuamosa laring

0 0 7

Pola Topografi Pewarnaan Tetrazolium sebagai Tolok Ukur Viabilitas dan Vigor Benih Kedelai (Glycine max L.Merr.) untuk Pendugaan Pertumbuhan Tanaman di Lapangan Topographical Tetrazolium Pattern for Evaluating Viability and Vigor of Soybean Seeds (Glycine

1 2 8

Defisit Evapotranspirasi sebagai Indikator Kekurangan Air pada Padi Gogo (Oryza sativa L.) The Deficit of Evapotranspiration as An Indicator of Water Deficit on Upland Rice (Oryza sativa L.)

0 0 6

Analisis Dialel untuk Pendugaan Parameter Genetik Komponen Hasil pada Cabai (Capsicum annuum L.) menggunakan Metode Hayman Diallel Analysis for Genetic Parameters Study of Yield Component in Pepper (Capsicum annuum L.) using Hayman Method

0 0 6

Evaluasi Pertumbuhan dan Perkembangan Arachis pintoi sebagai Biomulsa pada Budidaya Tanaman di Lahan Kering Tropis Evaluation on Growth and Development of Arachis pintoi as Biomulch in Tropical Upland Agriculture

0 0 6

Perbandingan Arachis pintoi dengan Jenis Tanaman Penutup Tanah Lain sebagai Biomulsa di Pertanaman Kelapa Sawit Belum Menghasilkan Comparing Arachis pintoi versus Other Cover Crops as Biomulch in Immature Oil Palm Plantations

0 0 7

Deteksi Dini Toleransi Padi Hibrida terhadap Kekeringan menggunakan PEG 6000 Early Detection of Hybrid Rice Tolerance to Drought Using PEG 6000

0 0 7

Gigi molar tiga sebagai indikator prakiraan usia kronologis pada usia 14–22 tahun

0 0 6

Perawatan maloklusi kelas I disertai agenesis insisif lateral menggunakan protesa

0 15 6

Pengambilan gutta percha point menggunakan bahan pelarut minyak jeruk yang dikombinasi dengan instrumen manual

0 0 7