Isolasi Bakteri Keratinolitik Dari Limbah Bulu Ayam Dan Karakterisasi Enzim Keratinasenya

ISOLASI BAKTERI KERATINOLITIK DARI LIMBAH BULU
AYAM DAN KARAKTERISASI ENZIM KERATINASENYA

TESIS

Oleh

HILWA WALIDA
127030019/BIO

PROGRAM PASCASARJANA
FAKULTAS MATEMATIKA DAN ILMU PENGETAHUAN ALAM

UNIVERSITAS SUMATERA UTARA
MEDAN
2015

ISOLASI BAKTERI KERATINOLITIK DARI LIMBAH BULU
AYAM DAN KARAKTERISASI ENZIM KERATINASENYA

TESIS


Diajukan Sebagai Salah Satu Syarat untuk Memperoleh Gelar Magister Sains pada
Program Studi Magister Ilmu Biologi pada Program Pascasarjana Fakultas MIPA,
Universitas Sumatera Utara

Oleh

HILWA WALIDA
127030019/BIO

PROGRAM PASCASARJANA
FAKULTAS MATEMATIKA DAN ILMU PENGETAHUAN ALAM

UNIVERSITAS SUMATERA UTARA
MEDAN
2015

PERSETUJUAN
Judul


: ISOLASI BAKTERI KERATINOLITIK DARI
LIMBAH BULU AYAM DAN KARAKTERISASI
ENZIM KERATINASENYA

Nama Mahasiswa

: HILWA WALIDA

Nomor Induk Mahasiswa

: 127030019

Program Studi

: Magister Biologi

Fakultas

: Matematika Dan Ilmu Pengetahuan Alam (FMIPA)
Universitas Sumatera Utara


Medan,
Komisi Pembimbing

April 2015

:

Pembimbing II

Prof. Dr. Erman Munir, M.Sc
NIP. 19651101 199103 1 002

Ketua Program Studi,
Pascasarjana Biologi FMIPA USU

Prof. Dr. Syafruddin Ilyas, M.Biomed
NIP. 19660209 1992 03 1 003

Pembimbing I


Prof. Dr. Dwi Suryanto, M.Sc
NIP. 19640409 1994 03 1 003

Dekan FMIPA USU

Dr. Sutarman, M.Sc
NIP. 19631026 199103 1 001

PERNYATAAN ORISIONALITAS

ISOLASI BAKTERI KERATINOLITIK DARI LIMBAH BULU
AYAM DAN KARAKTERISASI ENZIM KERATINASENYA

TESIS

Dengan ini saya menyatakan bahwa saya mengakui semua karya tesis ini adalah
hasil kerja saya sendiri kecuali kutipan dan ringkasan yang tiap satunya telah
dijelaskan sumbernya dengan benar.


Medan,

April

2015

Hilwa Walida
NIM. 127030019

PERNYATAAN PERSETUJUAN PUBLIKASI KARYA ILMIAH
UNTUK KEPENTINGAN AKADEMIS

Sebagai sivitas akademika Universitas Sumatera Utara, saya yang bertanda tangan
di bawah ini:
Nama

: Hilwa Walida

NIM


: 127030019

Program Studi

: Magister Biologi

Jenis Karya Ilmiah

: Tesis

Demi pengembangan ilmu pengetahuan, menyetujui untuk memberikan kepada
Universitas Sumatera Utara Hak Bebas Royalti Non-Eksekutif (Non-Executive
Free Right) atas tesis saya yang berjudul:
Isolasi Bakteri Keratinolitik Dari Limbah Bulu Ayam Dan Karakterisasi Enzim
Keratinasenya
beserta perangkat yang ada (jika diperlukan). Dengan Hak Bebas Royalti NonEksekutif ini, Universitas Sumatera Utara berhak menyimpan, mengalih data,
memformat, mengelola dalam bentuk data-base, merawat dan mempublikasikan
tesis saya tanpa meminta izin dari saya selama tetap mencantumkan nama saya
sebagai penulis dan pemegang dan atau sebagai pemilik hak cipta.
Demikian pernyataan ini dibuat dengan sebenarnya.


Medan,

April 2015

Hilwa Walida

Telah diuji pada
Tanggal

: 29 April 2015

PANITIA PENGUJI TESIS
Ketua

: Prof. Dr. Dwi Suryanto, M.Sc

Anggota

: 1. Prof. Dr. Erman Munir, M.Sc

2. Dr. It Jamilah, M.Sc
3. Dra. Nunuk Priyani, M.Sc

Lulus Pada Tanggal

:

29 April 2015

RIWAYAT HIDUP

Nama Lengkap Berikut Gelar

:

Hilwa Walida, S.Pd

Tempat dan Tanggal Lahir

:


Medan, 02 Januari 1991

Alamat Rumah

:

Jalan Medan Tenggara III No. 5 Medan

Telepon/Faks/Hp

:

085697451695

Email

:

hw2191@gmail.com


Instansi Tempat Bekerja

:

-

Alamat Kantor

:

-

Telepon

:

-

DATA PENDIDIKAN

SD

:

Swasta Kartini Medan

Tamat :

2002

SMP

:

Negeri 3 Medan

Tamat :

2005

SMA

:

Negeri 5 Medan

Tamat :

2008

Strata-1

:

Pendidikan Biologi FMIPA UNJ

Tamat :

2012

Strata-2

:

Program Pascasarjana Biologi,

Tamat :

2015

FMIPA USU

KATA PENGANTAR

Alhamdulillah puji serta syukur penulis panjatkan kehadirat Allah SWT yang
selalu mencurahkan nikmatNya. Karena rahmat dan hidayahNya lah penulis dapat
menyelesaikan penyusunan tesis ini. Shalawat beriring salam juga penulis sampaikan
kepada junjungan nabi besar Muhammad SAW.
Selama penyusunan tesis dan belajar di Program Studi Pascasarjana Biologi
FMIPA USU, penulis banyak mendapatkan dukungan baik moral maupun materi dari
berbagai pihak. Oleh karena itu, penulis dalam kesempatan ini mengucapkan terima
kasih kepada:
1.

Prof. Dr. Dwi Suryanto dan Prof. Dr. Erman Munir, M.Sc selaku dosen
pembimbing yang penuh kesabaran dalam membimbing dan memberi motivasi
dalam penyelesain tesis ini.

2.

Dr. It Jamilah, M.Sc dan Nunuk Priyani, M.Sc selaku dosen penguji yang telah
memberikan saran dan kritik yang membangun dalam menyelesaikan tesis ini.

3.

Prof. Dr. Syafruddin Ilyas, M.Biomed selaku ketua Program Studi Pascasarjana
Biologi FMIPA USU dan Dr. Suci Rahayu, M.Si selaku sekretaris Program Studi
Pascasarjana Biologi FMIPA USU atas nasihat, saran dan bantuan yang telah
diberikan dalam penyelesaian studi.

4.

Para bapak dan ibu dosen Program Studi Pascasarjana Biologi FMIPA USU yang
telah memberikan arahan dan bimbingan kepada penulis dalam penyelesaian
studi.

5.

Kedua orang tua penulis, Drs. H. Abdul Walid dan Dra. Hj. Rukyatul Hilal
Sagala. Terima kasih untuk motivasi, cinta dan kasih sayang yang tulus serta doa
yang tak pernah putus.

6.

Saudara kandung penulis Yulia Walida, S.Pd dan Ihsanul Arifin yang selalu
mendoakan dan memotivasi penulis dalam menyelesaikan tesis ini.

7.

Adik-adik Biologi FMIPA USU 2010, Farah Dwi Larasati, Mailani Quanti, Devi
Permata Sutadi, Nurul Alfitanisa Lubis, Yuli Evalintina, dll. Terima kasih telah
berbagi tawa dan semangat dalam menyelesaikan penelitan dan studi kita.

8.

Teman-teman Program Studi Pascasarjana Biologi FMIPA USU. Terima kasih
atas kebersamaan selama kuliah dengan segala suka dan duka yang dilalui
bersama.

9.

Pihak-pihak lain yang telah membantu penulis dalam pelaksanaan dan
penyelesaian tesis ini.
Penulis menyadari bahwa dalam penyusunan tesis ini masih jauh dari

sempurna. Oleh karena itu, dengan penuh rendah hati penulis akan menerima saran
dan kritik untuk penyempurnaan tesis ini. Akhirnya penulis berharap semoga tesis ini
dapat bermanfaat bagi semua pihak.

Medan,

April 2015

Penulis

ISOLASI BAKTERI KERATINOLITIK DARI LIMBAH BULU
AYAM DAN KARAKTERISASI ENZIM KERATINASENYA
ABSTRAK

Penelitian mengenai isolasi bakteri keratinolitik dari limbah bulu ayam dan
karakterisasi enzim keratinasenya telah dilaksanakan. Isolasi dilakukan menggunakan
medium Skim Milk Agar dan Feather Meal Agar yang diinkubasi pada suhu 31 oC
dan pH 7. Uji indeks keratinolitik dilakukan di medium Feather Meal Agar.
Presipitasi enzim kasar dilakukan dengan penambahan amonium sulfat secara
bertingkat dan dialisis. Pengaruh pH dan suhu terhadap aktivitas keratinase dilakukan
untuk mengetahui karakteristik masing-masing enzim. Sembilan belas isolat dengan
karakteristik morfologi yang berbeda diperoleh dari hasil isolasi. Tiga isolat yaitu A4,
B4, dan B6 dipilih untuk pengujian lanjut berdasarkan indeks keratinolitik. Aktivitas
tertinggi diperoleh keratinase isolat A4 pada konsentrasi amonium sulfat 20% yaitu
sebesar 95,9 U/ml, dan keratinase isolat B4 dan B6 pada konsentrasi amonium sulfat
70%, berturut-turut sebesar 57,5 U/ml dan 71,2 U/ml. Aktivitas spesifik keratinase
setelah dialisis isolat A4 yaitu sebesar 4,61 U/mg, isolat B4 sebesar 3,13 U/mg, dan
isolat B6 sebesar 4,08 U/mg. Aktivitas keratinase isolat A4 optimum pada pH 8 dan
suhu 45 oC, keratinase isolat B4 optimum pada pH 7 dan suhu 35 oC, dan keratinase
isolat B6 optimum pada pH 7 dan suhu 40 oC. Identifikasi berdasarkan gen 16S
rRNA menunjukkan bahwa isolat A4, B4 dan B6 berturut-turut mendekati Leclercia
adecarboxylata strain M-X17B dengan homologi 97%, Azotobacter chroococcum
strain ABA-1 dengan homologi 85%, dan Stenotrophomonas maltophilia strain BIW
dengan homologi 96%.
Kata kunci : bakteri keratinolitik, keratinase, limbah bulu ayam

ISOLATION OF KERATINOLYTIC BACTERIA FROM
FEATHER WASTE AND CHARACTERIZATION OF ITS
KERATINASE

ABSTRACT

A study on isolation of keratinolytic bacteria from feather waste and characterization
of its keratinase has been done. Isolation was conducted on Skim Milk Agar and
Feather Meal Agar incubated at 31 oC and pH 7. Index keratinolytic was measured
on Feather Meal Agar. Crude enzyme presipitation was performed by addition the
concentration series of ammonium sulfate followed by dialysis. The influences of pH
and temperature to keratinase activity were studied to examine the characteristics of
each enzyme. Nineteen bacteria with different morphological characteristics were
isolated from feather waste. Three isolates, A4, B4, and B6, were chosen for futher
studied based on their keratinolitic index. The highest production of keratinase of A4
isolate was shown on 6 th day, B4 isolate was on 4 th day, and B6 isolate was on 5 th
day. The maximum keratinase activity was produced by A4 isolate at 20% ammonium
sulfate of 95.9 U/ml, B4 and B6 isolates produced it at 70% ammonium sulfate of
57.5 U/ml and 71.2 U/ml respectively. The specific activity after dialysis were 4.61
U/mg for A4 isolate, 3.13 U/mg for B4 isolate, and 4.08 U/mg for B6 isolate. The
optimum of keratinase A4 isolate was at pH 8 and 45 oC, B4 isolate was at pH 7 and
35 °C, and B6 isolate was at pH 7 and 40 °C. Identification based on 16S rRNA gene
showed that A4, B4 and B6 isolates closed to Leclercia adecarboxylata strain MX17B with similarity of 97%, Azotobacter chroococcum strain ABA-1 with similarity
of 85%, and Stenotrophomonas maltophilia strain BIW with similarity of 96%,
respectively.
Keywords: keratinolytic bacteria, keratinase, feather waste

DAFTAR ISI

KATA PENGANTAR
ABSTRAK
ABSTRACT
DAFTAR ISI
DAFTAR GAMBAR
DAFTAR TABEL
DAFTAR LAMPIRAN

i
iii
iv
v
vii
viii
ix

BAB I

PENDAHULUAN
1.1 Latar Belakang
1.2 Perumusan Masalah
1.3 Tujuan Penelitian
1.4 Hipotesis Penelitian
1.5 Manfaat Penelitian

1
1
3
3
3
3

BAB II

TINJAUAN PUSTAKA
2.1 Keratin pada Bulu Ayam
2.2 Enzim Keratinase
2.3 Mikroorganisme Penghasil Enzim Keratinase

4
4
6
7

BAB III METODOLOGI PENELITIAN
3.1 Persiapan Medium Feather Meal Agar dan
Larutan Keratin 0,5%
3.2 Isolasi Bakteri Keratinolitik
3.3 Pengukuran Indeks Keratinolitik
3.4 Karakterisasi Morfologi Isolat
3.5 Penentuan Waktu Produksi Keratinase
3.6 Produksi Keratinase
3.7 Pemurnian Parsial Keratinase
3.7.1 Presipitasi Keratinase Dengan Konsentrasi
Amonium Sulfat Bertingkat
3.7.2 Proses Dialisis Hasil Presipitasi Amonium Sulfat
3.8 Pengukuran Aktivitas Keratinase

9
9
10
10
10
11
11
12
12
12
13

3.9 Penentuan Kadar Protein
3.10 Karakterisasi Keratinase Berdasarkan pH dan Suhu
3.11 Identifikasi Bakteri Keratinolitik Berdasarkan
Gen Penyandi 16S rRNA

13
13

BAB IV HASIL DAN PEMBAHASAN
4.1 Karakteristik Isolat Bakteri Keratinolitik dari Limbah
Bulu Ayam
4.2 Pengukuran Indeks Keratinolitik
4.3 Profil Produksi Enzim Keratinase
4.4 Aktivitas Keratinase Hasil Presipitasi dengan Amonium Sulfat
secara Bertingkat
4.5 Pengaruh pH terhadap Aktivitas Keratinase
4.6 Pengaruh Suhu terhadap Aktivitas Keratinase
4.7 Identifikasi Bakteri Keratinolitik Berdasarkan
Gen Penyandi 16S rRNA

16

BAB V

29
29
29

KESIMPULAN DAN SARAN
5.1 Kesimpulan
5.2 Saran

14

16
17
19
21
24
25
27

DAFTAR PUSTAKA

30

LAMPIRAN

36

DAFTAR GAMBAR

Nomor
2.1
4.1
4.2

4.3
4.4

Judul
Struktur Keratin
Populasi Sel dan Aktivitas Keratinase Isolat Bakteri
Keratinolitik
Aktivitas Keratinase Supernatan dan Pelet Isolat
Bakteri Keratinolitik Pada Konsentrasi Amonium
Sulfat Bertingkat
Pengaruh pH terhadap Aktivitas Keratinase
Pengaruh Suhu terhadap Aktivitas Keratinase

Halaman
4
20
21

24
26

DAFTAR TABEL

Nomor

Judul

Halaman

2.1
2.2

Kandungan Asam Amino pada Bulu Ayam
Karakteristik beberapa Mikroorganisme Penghasil
Keratinase
Karakteristik Morfologi Koloni dan Sel Isolat
Bakteri Keratinolitik
Indeks Keratinolitik Isolat Bakteri dari Limbah
Bulu Ayam
Tingkat Kemurnian Enzim Keratinase dari Isolat
Limbah Bulu Ayam

5
7

4.1
4.2
4.3

17
18
23

DAFTAR LAMPIRAN

Nomor

Judul

Halaman

L1
L2
L3
L4
L5

Alur Kerja Penelitian
Uji Aktivitas Enzim Keratinase
Kurva Standar Bovine Serum Albumin (BSA)
Uji Kadar Protein
Komposisi Reagen Bradford dan Pembuatan
Reagen Bradford
Nilai Absorbansi Kadar Protein
Identifikasi Isolat Bakteri Keratinolitik

36
37
39
40
41

L6
L7

42
43