ISOLASI DAN KARAKTERISASI BAKTERI ASAM LAKTAT PROTEOLITIK DARI SALURAN PENCERNAAN KEPITING BAKAU (Scylla spp.)

  SKRIPSI

  ISOLASI DAN KARAKTERISASI BAKTERI ASAM LAKTAT PROTEOLITIK DARI SALURAN PENCERNAAN KEPITING BAKAU (Scylla spp.) Oleh : PIPIN SUCIATI MAGETAN - JAWA TIMUR FAKULTAS PERIKANAN DAN KELAUTAN UNIVERSITAS AIRLANGGA SURABAYA 2015 Yang bertanda tangan di bawah ini : N a m a : Pipin Suciati N I M : 141111036 Tempat, tanggal lahir : Magetan, 04 April 1993 Alamat : Ds. Pupus Rt/Rw 02/01 Kec. Lembeyan, Magetan

  Telp./HP 085735927911 Judul Skripsi : Isolasi Dan Karakterisasi Bakteri Asam Laktat Dari

  Saluran Pencernaan Kepiting Bakau (Scylla spp.) Pembimbing : 1. Wahju Tjahjaningsih, Ir., M.Si.

  2. Dr. Endang Dewi Masithah, Ir., M.P. Menyatakan dengan sebenarnya bahwa hasil tulisan laporan Skripsi yang saya buat adalah murni hasil karya saya sendiri (bukan plagiat) yang berasal dari Dana Penelitian : Mandiri / Proyek Dosen / Hibah / PKM (coret yang tidak perlu). Di dalam skripsi / karya tulis ini tidak terdapat keseluruhan atau sebagian tulisan atau gagasan orang lain yang saya ambil dengan cara menyalin atau meniru dalam bentuk rangkaian kalimat atau simbol yang saya aku seolah-olah sebagai tulisan saya sendiri tanpa memberikan pengakuan pada penulis aslinya, serta kami bersedia :

  1. Dipublikasikan dalam Jurnal Ilmiah Perikanan dan Kelautan Fakultas Perikanan dan Kelautan Universitas Airlangga;

  2. Memberikan ijin untuk mengganti susunan penulis pada hasil tulisan skripsi / karya tulis saya ini sesuai dengan peranan pembimbing skripsi;

  3. Diberikan sanksi akademik yang berlaku di Universitas Airlangga, termasuk pencabutan gelar kesarjanaan yang telah saya peroleh (sebagaimana diatur di dalam Pedoman Pendidikan Unair 2010/2011 Bab.

  XI pasal 38 – 42), apabila dikemudian hari terbukti bahwa saya ternyata melakukan tindakan menyalin atau meniru tulisan orang lain yang seolah- olah hasil pemikiran saya sendiri

  Demikian surat pernyataan yang saya buat ini tanpa ada unsur paksaan dari siapapun dan dipergunakan sebagaimana mestinya.

  Surabaya, 1 Agustus 2015 Yang membuat pernyataan,

  Pipin Suciati NIM. 141111036

  SKRIPSI

  ISOLASI DAN KARAKTERISASI BAKTERI ASAM LAKTAT PROTEOLITIK DARI SALURAN PENCERNAAN KEPITING BAKAU (Scylla spp.)

  Sebagai Salah Satu Syarat Untuk Memperoleh Gelar Sarjana Perikanan Pada Fakultas Perikanan dan Kelautan Universitas Airlangga

  Oleh : PIPIN SUCIATI NIM. 141111036

  Menyetujui, Komisi Pembimbing

  Pembimbing Utama Wahju Tjahjaningsih, Ir., M.Si NIP. 19580914 198601 2 001

  Pembimbing Serta Dr. Endang Dewi Masithah, Ir., M.P.

  NIP. 19690912 199702 2 001

  SKRIPSI

  ISOLASI DAN KARAKTERISASI BAKTERI ASAM LAKTAT PROTEOLITIK DARI SALURAN PENCERNAAN KEPITING BAKAU (Scylla spp.)

  Oleh : PIPIN SUCIATI NIM. 141111036

  Telah diujikan pada Tanggal : 19 Mei 2015 KOMISI PENGUJI SKRIPSI Ketua : Prof. Dr. Hari Suprapto, Ir., M.Agr.

  Anggota : Rahayu Kusdarwati, Ir., M.Kes. Ir Dr. Rr. Juni Triastuti, S.Pi., M.Si.

  Wahju Tjahjaningsih, Ir., M.Si Dr. Endang Dewi Masithah, Ir., M.P.

  Surabaya, 19 Mei 2015 Fakultas Perikanan dan Kelautan

  Universitas Airlangga Dekan, Prof. Dr. Hj. Sri Subekti, drh., DEA.

  NIP.19520517 197803 2 001

  RINGKASAN PIPIN SUCIATI. Isolasi dan Karakterisasi Bakteri Asam Laktat Proteolitik dari Saluran Pencernaan Kepiting Bakau (Scylla spp.). Dosen Pembimbing Wahju Tjahjaningsih, Ir., M.Si. dan Dr. Endang Dewi Masithah, Ir., M.P.

  Perkembangan usaha budidaya bidang perikanan memicu perkembangan penggunaan probiotik. Probiotik didefinisikan sebagai mikroba hidup yang ditambahkan dalam jumlah tertentu yang mampu bertahan hidup dalam ekosistem saluran pencernaan. Bakteri asam laktat merupakan bakteri yang aktif dengan kebiasaan dan karakteristik yang unik memungkinkan bakteri asam laktat bertahan hidup pada saluran pencernaan dan berkompetesi dengan mikroba lainnya. Enzim amilase, lipase dan protease ekstraseluler yang dihasilkan oleh mikroba yang diisolasi dari saluran pencernaan ikan dapat digunakan sebagai kandidat probiotik. Enzim proteolitik ekstraseluler secara alami diproduksi oleh mikroba untuk menghidrolisis polipeptida dalam media menjadi peptida dan asam amino.

  Penelitian ini bertujuan untuk mendapatkan isolat bakteri asam laktat dari saluran pencernaan kepiting bakau (Scylla spp.) yang mempunyai aktivitas proteolitik. Penelitian ini menggunakan metode deskriptif berupa aktifitas proteolitik isolat bakteri asam laktat dari saluran pencernaan kepiting bakau (Scylla spp.). Jumlah kepiting bakau yang digunakan adalah 10 ekor.

  Parameter utama aktivitas proteolitik dan karakter isolat bakteri asam laktat dengan menggunakan uji biokimia, uji salinitas, dan uji pH. Parameter pendukung yang diamati yaitu karakterisasi fisiologi bakteri asam laktat dengan uji amilolitik dan uji lipolitik dari isolat bakteri asam laktat yang mempunyai aktivitas proteolitik.

  Hasil penelitian diperoleh tiga isolat bakteri asam laktat yang mempunyai aktivitas proteolitik kuat, yaitu WK 28 (Pediococcus sp.), WK 33 (Lactobacillus sp.), dan WK 53 (Streptococcus sp.). Isolat WK 53 (Streptococcus sp.) mempunyai aktivitas amilolitik. Isolat WK 28 (Pediococcus sp.), WK 33 (Lactobacillus sp.), dan WK 53 (Streptococcus sp.) mempunyai aktivitas lipolitik. Isolat WK 28 dan WK 53 mampu pada salinitas 10 ppt, 20 ppt, 30 ppt, 40 ppt, dan 50 ppt. Isolat WK 33 tumbuh pada salinitas 10 ppt, 30 ppt, dan 40 ppt. Isolat WK 28, WK 33, dan WK 53 mampu tumbuh pada pH 5, 7, dan 9.

  SUMMARY PIPIN SUCIATI. Isolation and Characterization of Proteolytic Lactic Acid Bacteria from The Digestive Tract of Mud Crabs (Scylla spp.). Academic Advisors Wahju Tjahjaningsih, Ir., M.Si. and Dr. Endang Dewi Masithah, Ir., M.P.

  The development of fishery cultivation field triggered the development of the use of probiotics. Probiotics are defined as live microbes are added in a certain amount that is able to survive in the digestive tract ecosystem. Lactic acid bacteria are bacteria that are active with the customs and unique characteristics allow lactic acid bacteria survive in the digestive tract and berkompetesi with other microbes. Enzymes produced by microbes isolated from the digestive tract of fish can be used as probiotics. Extracellular proteolytic enzymes naturally produced by the microbes to hydrolyze a polypeptide in a media into peptides and amino acids.

  This study aims to get the lactic acid bacteria isolates from the gastrointestinal tract of mangrove crab (Scylla spp.) That have proteolytic activity. This research uses descriptive method such as proteolytic activity of the lactic acid bacteria isolates from the gastrointestinal tract of mud crab (Scylla spp.). Amount of mud crab used is 10 fish.

  The main parameters and character of the proteolytic activity of lactic acid bacteria isolates using biochemical test, salinity, and pH test. Parameter supporters observed that physiological characterization of lactic acid bacteria to test amylolytic and lipolytic testing of isolates of lactic acid bacteria that have proteolytic activity.

  The result showed three isolates of lactic acid bacteria that have a strong proteolytic activity, among others WK 28 (Pediococcus sp.), WK 33 (Lactobacillus sp.), and WK 53 (Streptococcus sp.). Isolate WK 53 (Streptococcus sp.) has amylolytic activity. Isolates WK 28 (Pediococcus sp.), WK 33 (Lactobacillus sp.), and WK 53 (Streptococcus sp.) have lipolytic activity. Isolates WK 28 and WK 53 grew at a salinity 10 ppt, 20 ppt, 30 ppt, 40 ppt and 50 ppt. Isolate WK 33 grow at a salinity of 10 ppt, 30 ppt and 40 ppt. Isolates WK 28 WK 33 and WK 53 is able to grow at pH 5, 7 and 9.

  Puji syukur kehadirat Allah SWT, atas limpahan rakhmat, taufiq serta hidayah-Nya sehingga penulis dapat menyelesaikan Skripsi tentang Isolasi dan Karakterisasi Bakteri Asam Laktat Proteolitik dari Saluran Pencernaan Kepiting Bakau (Scylla spp.). Skripsi ini disusun sebagai salah satu syarat untuk memperoleh gelar Sarjana Perikanan pada Program Studi Budidaya Perairan, Fakultas Perikanan dan Kelautan Universitas Airlangga Surabaya.

  Akhirnya penulis berharap semoga Karya Ilmiah ini bermanfaat dan dapat memberikan informasi kepada semua pihak, khususnya bagi mahasiswa Fakultas Perikanan dan Kelautan Universitas Airlangga Surabaya guna kemajuan serta perkembangan ilmu dan teknologi dalam bidang perikanan, terutama budidaya perairan.

  Surabaya, 27 April 2015 Penulis Pada kesempatan ini, dengan penuh rasa hormat penulis haturkan terima kasih yang sebesar-besarnya kepada:

  1. Ibu Prof. Dr.Hj.Sri Subekti,drh.,DEA selaku Dekan Fakultas Perikanan dan Kelautan Universitas Airlangga Surabaya.

  2. Ibu Wahju Tjahjaningsih, Ir., M.Si. Dosen Pembimbing Utama dan Ibu Dr.

  Endang Dewi Masithah, Ir., M.P. Dosen Pembimbing Serta yang telah memberikan arahan, masukan serta bimbingan sejak penyusunan usulan hingga penyelesaian Skripsi ini.

  3. Terima kasih kepada Bapak Prof. Dr. Hari Suprapto, Ir., M.Agr., Ibu Rahayu Kusdarwati, Ir., M.Kes., dan Ibu Dr. Rr. Juni Triastuti, S.Pi., M.Si. Dosen Penguji yang telah memberikan masukan, kritik dan saran atas penyempurnaan Skripsi ini.

  4. Bapak Heru P. M.Si., M.Biotech. terima kasih yang telah memberikan arahan, masukan serta bimbingan Skripsi.

  5. Bapak Sudarno, Ir., M.Kes Dosen Wali yang telah memberikan masukan serta saran dalam proses akademik.

  6. Seluruh dosen dan staf Fakultas Perikanan dan Kelautan Universitas Airlangga yang telah membantu dalam pelaksanaan dan penyelesaian Skripsi.

  7. Bapak Heru P. M.Si., M.Biotech. terima kasih yang telah memberikan arahan, masukan serta bimbingan Skripsi.

  8. Kedua orang tua yang selalu memberikan dukungan dan semangat.

  9. Teman-teman Khairanita, Tasyarrafa, Aris Lulu I J, Ainun Naim, Ali, Chaesar, Kurnia, dan teman-teman “Octopus 2011” yang telah memberikan bantuan, masukan dan semangat dalam penyelesaian Skripsi.

  10. Dedi Hariyadi S.T. yang memberikan doa serta motivasi hingga selesainya Skripsi.

  DAFTAR ISI Halaman

  2.1.4 Mikroba Saluran Pencernaan .................................................. 6

  2.3 Isolasi dan Karakterisasi Bakteri ........................................................ 14

  2.2.6 Enzim Lipolitik ......................................................................... 13

  2.2.5 Enzim Amilolitik ...................................................................... 13

  2.2.4 Enzim Proteolitik .................................................................... 12

  2.2.3 Bakteri Proteolitik Asam Laktat ............................................. 10

  2.2.2 Jenis Bakteri Probiotik ............................................................ 10

  2.2.1 Manfaat Bakteri Probiotik ......................................................... 9

  2.2 Bakteri Probiotik ............................................................................... 7

  2.1.3 Kebiasaan Hidup Kepiting Bakau (Scylla spp.) ...................... 6

  RINGKASAN ................................................................................................. iv SUMMARY .................................................................................................... vi KATA PENGANTAR .................................................................................... viii UCAPAN TERIMAKASIH ............................................................................. ix DAFTAR ISI ................................................................................................... x DAFTAR TABEL ........................................................................................... xii DAFTAR GAMBAR ...................................................................................... xiii DAFTAR LAMPIRAN ................................................................................... xiv

  2.1.2 Morfologi Kepiting Bakau (Scylla spp.) .................................. 5

  2.1.1 Klasifikasi Kepiting Bakau (Scylla spp.) ................................. 5

  2.1 Kepiting Bakau (Scylla spp.) ............................................................. 5

  II TINJAUAN PUSTAKA .......................................................................... 5

  1.4 Manfaat ............................................................................................. 4

  1.3 Tujuan ................................................................................................ 3

  1.2 Rumusan Masalah ............................................................................. 3

  1.1 Latar Belakang .................................................................................. 1

  I PENDAHULUAN ................................................................................... 1

  III KERANGKA KONSEPTUAL ................................................................ 16

  3.1 Kerangka Konseptual ........................................................................ 16

  IV METODOLOGI ....................................................................................... 19

  4.1 Tempat dan Waktu Penelitian ............................................................ 19

  4.2 Materi Penelitian ............................................................................... 19

  4.2.1 Peralatan Penelitian .................................................................. 19

  4.2.2 Bahan Penelitian ....................................................................... 19

  4.3 Metode Penelitian ............................................................................. 20

  4.3.1 Rancangan Penelitian ............................................................... 20

  4.3.2 Prosedur Kerja ............................................................ ............. 20

  4.3.3 Parameter Pengamatan .............................................................. 30

  4.4 Analisa Data ....................................................................................... 31

  V HASIL DAN PEMBAHASAN ................................................................ 33

  5.1 Hasil .................................................................................................. 33

  5.1.1 Isolasi dan Seleksi Bakteri Asam Laktat ................................ 33

  5.1.2 Kemampuan Aktivitas Proteolitik Isolat Bakteri Asam Laktat ................................................................ 34

  5.1.3 Kemampuan Aktivitas Amilolitik dan Aktivitas Lipolitik ...... 35

  5.1.4 Kemampuan Uji Salinitas Isolat Bakteri Asam Laktat ............ 37

  5.1.5 Kemampuan Uji pH Isolat Bakteri Asam Laktat ..................... 38

  5.1.6 Karakterisasi Isolat Bakteri Asam Laktat ................................. 39

  5.2 Pembahasan ....................................................................................... 40

  VI KESIMPULAN DAN SARAN ............................................................... 51

  6.1 Kesimpulan ............................................................................................... 51

  6.2 Saran .......................................................................................................... 51 DAFTAR PUSTAKA ...................................................................................... 52 LAMPIRAN ................................................................................................... 59

  DAFTAR TABEL Tabel Halaman

  1 Data diameter zona jernih uji aktivitas proteolitik II .............................. 35

  2 Hasil uji salinitas isolat bakteri asam laktat .............................................. 37

  3 Hasil uji pH isolat bakteri asam laktat ....................................................... 38

  4 Hasil uji biokimia ...................................................................................... 39

  DAFTAR GAMBAR Gambar Halaman

  1 Morfologi kepiting bakau .......................................................................... 5

  2 Kerangka konsep ....................................................................................... 18

  3 Diagram alir penelitian ............................................................................... 31

  4 Isolat bakteri asam laktat ............................................................................ 33

  5 Uji aktivitas proteolitik .............................................................................. 35

  6 Uji aktivitas amilolitik ............................................................................... 36

  7 Uji aktivitas lipolitik .................................................................................. 37

  8 Kultur isolat pada media MRS broth ......................................................... 37

  9 Uji aktivitas pH .......................................................................................... 39

  10 Morfologi koloni bakteri ............................................................................ 39

  11 Pewarnaan Gram isolat bakteri asam laktat ............................................... 40