ISOLASI BAKTERI METANOTROF DAN DETEKSI GEN pmoA BAKTERI METANOTROF PADA EKOSISTEM PADI SAWAH.
ISOT,AST
BAKTERI METANOjTROF DAN DETE(SI GrN
rd,,
gAKTERI
METANOTROF FAI}A ETOSISTEM P.4Dt SAWAIT
SI(RIPSI SAIUAITA BIOLOGI
OI,EE
EARYOST UTAMT
05133025
JURUSAIJ BIOLOGI
FAI('LTAS M{IEMAI'IKA DAN IIMIJ PENCETAFIIAN AI,AM
UNIITRSIIAS ANDAIi{S
PADANG,2OU
1u o/ baken neknobof psda ekosist€m
padi e*ah telah dilatakd de bure Juli @!d Oldober 2010 dj LlboBtorim
Ekolosi dm Fisiologi. Bideg Mikrcbiologi, Pual lenelilie Bioloei Lltl.
Cibinons. Tui@ DeDelili ini adalah dtuk nensetahri atdvit s bakeri metlnotrcf
dale needutsi enisi ea rumah kaa n€rm pada €tosbl.m swan, serta unhrk
mendspad{s bi.tktu bal-r.ri netanorrot Pe.elili@ i^i dil.llle d@go Detode
d€stiplit Smpel taan sa*ai didbit Fc@ lddon pada cnpai petaka eqr!
dcnsm tipe penmmm yeg bdbe.la yakni penddd padi sea6 koilnsional
(T0). !E snme padi dengd teknologi SRI. penupukd doledik (Tl),
p€n mm padi dene@ t€knologi SRI. ldnupur olseik G2) da penalmd
padi deng letnoloEi SRI. pemuput oryeil + putul hayati (It.
Hail penelindrmenujul&u balrm judan bal1di neo@rof tqbeyak
ymc dihitung denge netode MPN lerdapat pada T2 de T3 yaitu > I I00 MtN/61
dd junnal t€rl€cil peda T0 yaitu 36 M?N/nl. K€llrmpln absrbsi oelan olcb
knliu numi T3 Lanin8sbes{ 49 % sedmgte Tl orsse sbso 98 %. Ariupu
j€nis balteri yd8 dipercleh y€in! MethiacJ,stis s!. d^ Methlloba.ld sp.
P€nelitib tentang isoldi dM deteksl
gen
I. PEN DAHI]I,T]AN
bcsdM lndia du
Indoncsia
Cina
dikalcgontd
Gnin€si di duia. Sebasim bese
padi. Ekosislen saw!.h
e/ al-, 200?). shingga
nren}lnb
sebacai tisa
ddi nel3n ini
heras:l
g sekitar 10-25 %
lcrlu dilakrkm Fnuluan
nitisdi Fp€ni ydrs disaFnla
nes . p.nghsil n.la!
,ii.i
kesiaLn I'en.nsnfn
tdlll emiri nreta duni. (Sakai
ennsi sas
neid
sebasd
us.[r
oleh UNICCC.
Metan merupditr sahh satu
s6 luon
kaca ymg pcnhg de
*o$mtrasirya di atmosfer tenN n€nin8kat sclam bcbsdpa dckadc ini (l,hdlil dm
Rdnsseq
sslan satu
1990r Sleele
zr,l.,
1992; Cruten, 1995) Saw.h lcrgcnans ncrupakan
smbtr ntana @isi nctan di atnoste. (Nssllrln
dar Neue, 1994). Enisi ini ncrupale h6i1 dei
du
er d1.. 19t3r
poses: poduksi
MiMi
hcrd
olch
di linekmem eoksir da okidGi mcte olch baltn
netaloFof di lhsloryu oksik. Akivitas kedM tel.mrrk bulkn L€rschul
dilenluld oleh teb€Fd@ j6n €dinal elektron aeltor terutama oksigd, iedots
bal,rai mcrarogenik
potensirl, nulJisi dm senyawa orgmik tean. Kondhi tesebut jusa beDergaruh
te
ada!
pertublh r{mo
pldi
rroscs prodnLsi mctan pada ckosisrem s,wah smsst kompleks, dekonprsisi
hatdal o.Ceik oleh milaoba dekonFosd ydg nelibattd bdyak crim
penehid.olhis
redentu
ydg
skannentasfoncilanatenal orgeikmcnjadi
ale
ditonvcai ncnjadi Cd
nelanogenesis. Proses oksidai
yane paling
henotuhb siklus
nei
pada
scnyawaacoya*a
nch dd k(bondiokrida
nelalli
proses
lman eNan neruniLM s,hn elu lirld.r
mctan di alan
ul'rk ncncld jmlah gs nrcld yms
leEnhi ke ainosfer. Baheri yag berperu dslm
proses oksidsi neran lebih
Baltn ini nmpu nenssualar m€la,
dikenal sebacai batteri neknoLrol
satu-satuya sunber
rd6on
de
energi. Balden Fngoksiddi m€tan mmpu
nengkonsunsi smpai 90% dari produksi nebn yane dihasilta.6aken
pada
scb.sai
bna dasobilq sebelm alhimya lcpd ke al,nosfct.
ftchoetr
Pcmanlaalan boheri
nclmotrof pada lanan sawan ncnbdike dmPa! ymg posilil dinuo
mensnrmsi ptudursi
ncl
besd-besan dari
ptugm pengud8e pelrHasan
1.2
L
lclales
ddm
global.
2.
te$ebut, nata dapat
dnmuske pemasalanm
sebaeai beriliut i
Apahn akiviiar bakeri nelamFof padl etosisten ewal b{pcngturh
brnadap
penurun enisi gd nele?
yde
Apa saja biatm metootrcf
didapal?
Tujud drn M,nLat Pcnclitia.
Tuiw
I
dad penelitiu ini adalal
?
:
Mengerrhui aktiriras bahen m€tanolrcf dalar neredutsi enisi gas runa!
kea nere
dan
e{a,L
pada ekosislom
Mcndapalku
Mafat
l.
sertn .1etohantu
?.ronNan Mrsrlab
Dtri lab
1.3
smh
tlu
biale baketi meleoirct
!.nolirid ini
adalah
:
Peo€litid ini dihMpkm nampu mcmb€rik.n dlleriaLil Emecanar Da$lah
untuk nengurdgi ebisi cas melan yan! dihsilkan
2 Dihmpkm nasil penelitian
ini dapat
dai sa*,t dcng.n
diiadilm
das unr&
nin lsi
pcn.lilim
V.
(ISIMPIILAN DAN SARAN
Ddi loelitid ydg tel.n dllahrkm, dalat dilrik
k*iFrdo *blgli
l. Kemdp@
n@i'13 luilg sbrsr
absrbsi ncta! oleh kultu
b€nku1 :
4t%
sed&gke Tl omyc *b€se 98%
2.
Jmis bgkleri ydg diDmleh y6tu Methrlacyeis ea.
ldlu dilaluLo
p€n€l;li@ Iebih lmjur tdhaiap 6aken
mtuk F€nsenbmsm puput yalg
m
pu
meng@gi
de Methtlobaaa
hail Goldi d&i
disi nel{
sp.
r,nan sasah
di al@ .lnn
lerlu
addya tajitu lebih dalm i€nrars bakeri ddi 1an0l sa*€h yme bedm8d
n€luffld
enisi nctan
sda alu.
Aij!, D. ed W. Mingxins.
and
ts Appli.alioh
lat Methane Enksions lron Rica Fieldr
arid. Adv. Atnos. Sci. 13:159.170,
1996. Mulel
in Sauthern
Arexmder. M. 1982. M.rr P/abable Nunber Mzthorl.fo Microhidl ?a\latiN, p.
815-820..i, A.L. Page, R.H. Milld md D.R. Keoey Gd.), Mdrods a/.t i1
Andlysf, pd1 2. Ch.nical a".1 Mictuhnn.gical lrcPetties, Aglolot
,L/,rogza?l no.9,2'd cd. AsA-sssA, Madison,
vI.
,a.r./,a/ Or;.hti.a of Metha"e dhd Methdnol. p.ll)-210. ln
(ed.),,41vd"&s
tr M?rabu I Pil,ri,1,ar. ,\codemic Press lrn{ldn.
H. R.se
Afihony. C.
!
USA.
1986.
A.
R. (nowles. r9a9. Physiologt, Biach.hisir dnd Spe.i-tc tnhibito6
af CHr ,NHr uhd Ca Oxi.ldion h, MdhahonoPh! a rl Njii|ie\ Mictubiol
ed
Bedard. C.
Mol Rinl Rev 5li 68
84.
M. dd R. Comd. 1995. EllIt ot Methatu Con entratioN aa.l Soil
a:onditiou\ an The ld,ction oI Methahe otidation Activity, Soil Bi.\'
Bend€r.
Binchem 27: l5l7-1527.
BownH. J. 1., L, lincnez. L Roseo. T. C. H&4 md C. S. Saylcr. 19Cl
Choacteri2ation .f The Methanonophic Btcteritl Connuhities lresent in I
Ttichtoloethllene-Conlanihaterl Stbsutfacc Crountuater Site Appt En\non
Micobiol. 59:2380-2387.
Broad Institute. 2002. Methanoxeneri: Pzlr,4
BAKTERI METANOjTROF DAN DETE(SI GrN
rd,,
gAKTERI
METANOTROF FAI}A ETOSISTEM P.4Dt SAWAIT
SI(RIPSI SAIUAITA BIOLOGI
OI,EE
EARYOST UTAMT
05133025
JURUSAIJ BIOLOGI
FAI('LTAS M{IEMAI'IKA DAN IIMIJ PENCETAFIIAN AI,AM
UNIITRSIIAS ANDAIi{S
PADANG,2OU
1u o/ baken neknobof psda ekosist€m
padi e*ah telah dilatakd de bure Juli @!d Oldober 2010 dj LlboBtorim
Ekolosi dm Fisiologi. Bideg Mikrcbiologi, Pual lenelilie Bioloei Lltl.
Cibinons. Tui@ DeDelili ini adalah dtuk nensetahri atdvit s bakeri metlnotrcf
dale needutsi enisi ea rumah kaa n€rm pada €tosbl.m swan, serta unhrk
mendspad{s bi.tktu bal-r.ri netanorrot Pe.elili@ i^i dil.llle d@go Detode
d€stiplit Smpel taan sa*ai didbit Fc@ lddon pada cnpai petaka eqr!
dcnsm tipe penmmm yeg bdbe.la yakni penddd padi sea6 koilnsional
(T0). !E snme padi dengd teknologi SRI. penupukd doledik (Tl),
p€n mm padi dene@ t€knologi SRI. ldnupur olseik G2) da penalmd
padi deng letnoloEi SRI. pemuput oryeil + putul hayati (It.
Hail penelindrmenujul&u balrm judan bal1di neo@rof tqbeyak
ymc dihitung denge netode MPN lerdapat pada T2 de T3 yaitu > I I00 MtN/61
dd junnal t€rl€cil peda T0 yaitu 36 M?N/nl. K€llrmpln absrbsi oelan olcb
knliu numi T3 Lanin8sbes{ 49 % sedmgte Tl orsse sbso 98 %. Ariupu
j€nis balteri yd8 dipercleh y€in! MethiacJ,stis s!. d^ Methlloba.ld sp.
P€nelitib tentang isoldi dM deteksl
gen
I. PEN DAHI]I,T]AN
bcsdM lndia du
Indoncsia
Cina
dikalcgontd
Gnin€si di duia. Sebasim bese
padi. Ekosislen saw!.h
e/ al-, 200?). shingga
nren}lnb
sebacai tisa
ddi nel3n ini
heras:l
g sekitar 10-25 %
lcrlu dilakrkm Fnuluan
nitisdi Fp€ni ydrs disaFnla
nes . p.nghsil n.la!
,ii.i
kesiaLn I'en.nsnfn
tdlll emiri nreta duni. (Sakai
ennsi sas
neid
sebasd
us.[r
oleh UNICCC.
Metan merupditr sahh satu
s6 luon
kaca ymg pcnhg de
*o$mtrasirya di atmosfer tenN n€nin8kat sclam bcbsdpa dckadc ini (l,hdlil dm
Rdnsseq
sslan satu
1990r Sleele
zr,l.,
1992; Cruten, 1995) Saw.h lcrgcnans ncrupakan
smbtr ntana @isi nctan di atnoste. (Nssllrln
dar Neue, 1994). Enisi ini ncrupale h6i1 dei
du
er d1.. 19t3r
poses: poduksi
MiMi
hcrd
olch
di linekmem eoksir da okidGi mcte olch baltn
netaloFof di lhsloryu oksik. Akivitas kedM tel.mrrk bulkn L€rschul
dilenluld oleh teb€Fd@ j6n €dinal elektron aeltor terutama oksigd, iedots
bal,rai mcrarogenik
potensirl, nulJisi dm senyawa orgmik tean. Kondhi tesebut jusa beDergaruh
te
ada!
pertublh r{mo
pldi
rroscs prodnLsi mctan pada ckosisrem s,wah smsst kompleks, dekonprsisi
hatdal o.Ceik oleh milaoba dekonFosd ydg nelibattd bdyak crim
penehid.olhis
redentu
ydg
skannentasfoncilanatenal orgeikmcnjadi
ale
ditonvcai ncnjadi Cd
nelanogenesis. Proses oksidai
yane paling
henotuhb siklus
nei
pada
scnyawaacoya*a
nch dd k(bondiokrida
nelalli
proses
lman eNan neruniLM s,hn elu lirld.r
mctan di alan
ul'rk ncncld jmlah gs nrcld yms
leEnhi ke ainosfer. Baheri yag berperu dslm
proses oksidsi neran lebih
Baltn ini nmpu nenssualar m€la,
dikenal sebacai batteri neknoLrol
satu-satuya sunber
rd6on
de
energi. Balden Fngoksiddi m€tan mmpu
nengkonsunsi smpai 90% dari produksi nebn yane dihasilta.6aken
pada
scb.sai
bna dasobilq sebelm alhimya lcpd ke al,nosfct.
ftchoetr
Pcmanlaalan boheri
nclmotrof pada lanan sawan ncnbdike dmPa! ymg posilil dinuo
mensnrmsi ptudursi
ncl
besd-besan dari
ptugm pengud8e pelrHasan
1.2
L
lclales
ddm
global.
2.
te$ebut, nata dapat
dnmuske pemasalanm
sebaeai beriliut i
Apahn akiviiar bakeri nelamFof padl etosisten ewal b{pcngturh
brnadap
penurun enisi gd nele?
yde
Apa saja biatm metootrcf
didapal?
Tujud drn M,nLat Pcnclitia.
Tuiw
I
dad penelitiu ini adalal
?
:
Mengerrhui aktiriras bahen m€tanolrcf dalar neredutsi enisi gas runa!
kea nere
dan
e{a,L
pada ekosislom
Mcndapalku
Mafat
l.
sertn .1etohantu
?.ronNan Mrsrlab
Dtri lab
1.3
smh
tlu
biale baketi meleoirct
!.nolirid ini
adalah
:
Peo€litid ini dihMpkm nampu mcmb€rik.n dlleriaLil Emecanar Da$lah
untuk nengurdgi ebisi cas melan yan! dihsilkan
2 Dihmpkm nasil penelitian
ini dapat
dai sa*,t dcng.n
diiadilm
das unr&
nin lsi
pcn.lilim
V.
(ISIMPIILAN DAN SARAN
Ddi loelitid ydg tel.n dllahrkm, dalat dilrik
k*iFrdo *blgli
l. Kemdp@
n@i'13 luilg sbrsr
absrbsi ncta! oleh kultu
b€nku1 :
4t%
sed&gke Tl omyc *b€se 98%
2.
Jmis bgkleri ydg diDmleh y6tu Methrlacyeis ea.
ldlu dilaluLo
p€n€l;li@ Iebih lmjur tdhaiap 6aken
mtuk F€nsenbmsm puput yalg
m
pu
meng@gi
de Methtlobaaa
hail Goldi d&i
disi nel{
sp.
r,nan sasah
di al@ .lnn
lerlu
addya tajitu lebih dalm i€nrars bakeri ddi 1an0l sa*€h yme bedm8d
n€luffld
enisi nctan
sda alu.
Aij!, D. ed W. Mingxins.
and
ts Appli.alioh
lat Methane Enksions lron Rica Fieldr
arid. Adv. Atnos. Sci. 13:159.170,
1996. Mulel
in Sauthern
Arexmder. M. 1982. M.rr P/abable Nunber Mzthorl.fo Microhidl ?a\latiN, p.
815-820..i, A.L. Page, R.H. Milld md D.R. Keoey Gd.), Mdrods a/.t i1
Andlysf, pd1 2. Ch.nical a".1 Mictuhnn.gical lrcPetties, Aglolot
,L/,rogza?l no.9,2'd cd. AsA-sssA, Madison,
vI.
,a.r./,a/ Or;.hti.a of Metha"e dhd Methdnol. p.ll)-210. ln
(ed.),,41vd"&s
tr M?rabu I Pil,ri,1,ar. ,\codemic Press lrn{ldn.
H. R.se
Afihony. C.
!
USA.
1986.
A.
R. (nowles. r9a9. Physiologt, Biach.hisir dnd Spe.i-tc tnhibito6
af CHr ,NHr uhd Ca Oxi.ldion h, MdhahonoPh! a rl Njii|ie\ Mictubiol
ed
Bedard. C.
Mol Rinl Rev 5li 68
84.
M. dd R. Comd. 1995. EllIt ot Methatu Con entratioN aa.l Soil
a:onditiou\ an The ld,ction oI Methahe otidation Activity, Soil Bi.\'
Bend€r.
Binchem 27: l5l7-1527.
BownH. J. 1., L, lincnez. L Roseo. T. C. H&4 md C. S. Saylcr. 19Cl
Choacteri2ation .f The Methanonophic Btcteritl Connuhities lresent in I
Ttichtoloethllene-Conlanihaterl Stbsutfacc Crountuater Site Appt En\non
Micobiol. 59:2380-2387.
Broad Institute. 2002. Methanoxeneri: Pzlr,4