Hubungan Polimorfisme Gen Matriks Metaloproteinase-12 Dengan Kejadian Penyakit Paru Obstruktif Kronik Dibandingkan Dengan Non Penyakit Paru Obstruktif Kronik

LAMPIRAN 1
SURAT PERSETUJUAN KOMISI ETIK

Universitas Sumatera Utara

LAMPIRAN 2
SURAT IJIN PENELITIAN

Universitas Sumatera Utara

Universitas Sumatera Utara

LAMPIRAN 3
DAFTAR SAMPEL KEJADIAN PPOK DAN NON PPOK
PPOK
POLIMORFISME MMP-12
NO

KODE
AA

AG

GG

P1.

N227

√

-

-

P2.

S211

√

-

-

P3.

H212

√

-

-

P4.

J213

√

-

-

P5.

SO46

√

-

-

P6.

P050

√

-

-

P7.

KO43

√

-

-

P8.

TO42

√

-

-

P9.

G041

√

-

-

P10.

N040

√

-

-

P11.

H039

√

-

-

P12.

T038

√

-

-

P13.

N037

√

-

-

P14.

H036

√

-

-

P15.

S028

√

-

-

P16.

S027

√

-

-

P17.

S026

√

-

-

P18.

S024

√

-

-

P19.

N023

√

√

-

Universitas Sumatera Utara

P20.

N022

√

-

-

P21.

M021

√

-

-

P22.

S017

√

-

-

P23.

H016

√

-

-

P24.

N013

√

-

-

P25.

R009

√

-

-

P26.

T008

√

√

-

P27.

S006

√

-

-

P28.

T004

√

-

-

P29.

M124

√

-

-

P30.

M122

√

-

-

NON PPOK
POLIMORFISME MMP-12
NO

KODE
AA

AG

GG

N1.

M136

√

-

-

N2.

J137

√

-

-

N3.

J138

√

-

-

N4.

S140

√

-

-

N5.

S141

√

-

-

N6.

A142

√

-

-

N7.

N143

√

-

-

N8.

R144

√

-

-

N9.

F145

√

√

-

Universitas Sumatera Utara

N10.

D156

√

-

-

N11.

T154

√

-

-

N12.

T153

√

-

-

N13.

S152

√

-

-

N14.

S151

√

-

-

N15.

P150

√

-

-

N16.

M148

√

-

-

N17.

M147

√

-

-

N18.

I146

√

-

-

N19.

S167

√

-

-

N20.

A166

√

-

-

N21.

S165

√

-

-

N22.

S164

√

-

-

N23.

T162

√

-

-

N24.

T161

√

-

-

N25.

R159

√

-

-

N26.

M158

√

-

-

N27.

M157

√

-

-

N28.

A183

√

-

-

N29.

N181

√

-

-

N30.

J179

√

-

-

Universitas Sumatera Utara

LAMPIRAN 4
UJI STATISTIK PEARSON CHI SQUARE
Tabel 1. Hubungan antara polimorfisme gen MMP-12 dengan kejadian PPOK
POLIMORFISME

PPOK

TOTAL

NONPPOK

Nilai p*

n

%

n

%

n

%

AG

2

6.7%

1

3.3%

3

5.0%

AA

28

93.3%

29

96.7%

57

95.0%

GG

0

0

0

0

0

0

30

100.0%

30

100.0%

60

100.0%

TOTAL

0.5

*Significant with Fisher exact test
POLIMORFISME * SAMPLE Crosstabulation
SAMPLE
Total
PPOK
POLIMORFISME

AG

NONPPOK

Count
% within

2

1

3

6.7%

3.3%

5.0%

28

29

57

93.3%

96.7%

95.0%

SAMPLE
Count

AA

% within
SAMPLE

0

0

0

0%

0%

0%

Count
GG

% within
SAMPLE

Total

Count
% within

30

30

60

100.0%

100.0%

100.0%

SAMPLE

Chi-Square Tests

Value
Pearson Chi-

df

Asymp. Sig.

Exact Sig.

Exact Sig. (1-

(2-sided)

(2-sided)

sided)

a

1

.554

.000

1

1.000

.357

1

.550

.351

Square
Continuity
Correction

b

Likelihood Ratio
Fisher's Exact Test
Linear-by-Linear

1.000
.345

1

.500

.557

Association
N of Valid Cases

60

Universitas Sumatera Utara

LAMPIRAN 5
HARDY-WEINBERG EQUILIBRIUM CALCULATOR
Genotypes

AA

AG

GG

Observed

28

2

0

Compute Exp. H-W
Equilibrium Freq.
& Chi2 P-Value

Expected

28.03

1.93

0.03

H-W Freq

(93.44%)

(6.44%)

(0.11%)

Clear Form Values

P-Value = 0.8502
Allele
Frequencies

AA = 58

AG = 2

(96.67%)

(3.33%)

Genotypes

AA

AG

GG

Observed

29

1

0

Compute Exp. H-W
Equilibrium Freq.
& Chi2 P-Value

Expected

29.01

0.98

0.01

H-W Freq

(96.69%)

(3.28%)

(0.03%)

Clear Form Values

P-Value = 0.926
Allele
Frequencies

AA = 59

AG = 1

(98.33%)

(1.67%)

Universitas Sumatera Utara

LAMPIRAN 6
HASIL PENELITIAN PCR DAN RFLP

2 Mei 2015, PCR, sampel P1-P6

12 Mei 2015, PCR, sampel P7-P12

Universitas Sumatera Utara

27 Mei 2015, PCR, sampel P13-P30, N1-N10

27 Mei 2015, PCR, sampel N11-N30

Universitas Sumatera Utara

6 Juni 2015, RFLP, sampel P1-P6

19 Juni 2015, RFLP, sampel P7-P12

Universitas Sumatera Utara

2 Juli 2015, RFLP, sampel P13-P18

4 Juli 2015, RFLP, sampel P19-P30 dan N1-N16

Universitas Sumatera Utara

8 Juli 2015, RFLP, sampel N17-N30

29 Juli 2015, RFLP, sampel P19, P20, P21, P26, N9, N10

Universitas Sumatera Utara

6 Juni 2015, RFLP, sampel P1-P6, Inverse

19 Juni 2015, RFLP, sampel P7-P12, Inverse

Universitas Sumatera Utara

2 Juli 2015, RFLP, sampel P13-P18, Inverse

4 Juli 2015, RFLP, sampel P19-P30 dan N1-N16, Inverse

Universitas Sumatera Utara

8 Juli 2015, RFLP, sampel N17-N30, Inverse

29 Juli 2015, RFLP, sampel P19, P20, P21, P26, N9, N10, Inverse

Universitas Sumatera Utara

LAMPIRAN 7
DOKUMENTASI PENELITIAN

1. Bahan-bahan Penelitian

PCR mix (Go Taq® Green Master Mix (Promega USA)], Nuclease Free Water,
marker DNA, DNA Loading Dye

Primer forward MMP-12: 5’GTCAAGGGATGATATCAGCT-3’
Primer reverse MMP-12: 5’CTTCTAAACGGATCAATTCAG-3’

Enzim Restriksi Pvu II (Thermo scientific®)
2. Sampel Penelitian

Isolat DNA dengan penderita PPOK dan non PPOK

Universitas Sumatera Utara

3. Alat-alat Penelitian

Mesin PCR (Thermal Cycler)

Gel Casting Tray

Mesin Inkubator

Universitas Sumatera Utara

4. Proses Amplifikasi isolat DNA dengan Polymerase Chain Reaction

Universitas Sumatera Utara

5. Visualisasi Hasil Restriksi dengan Elektroforesa Gel Agarosa

Universitas Sumatera Utara

LAMPIRAN 8
DAFTAR RIWAYAT HIDUP

1. Identitas
Nama

: Ruth Agree Kartini Sihombing

Tempat/Tgl Lahir: Medan, 22 April 1987
Agama

: Kristen Protestan

Alamat

: Jl. Setia Jadi Gg Pribadi No.63 A Medan

2. Keluarga
Suami

: Andres Situmorang, S.Pd

Anak

: Daud Lionel Situmorang

3. Pendidikan
TK SW RK ST ANTONIUS VI, tamat tahun 1993
SD SW RK ST ANTONIUS VI, tamat tahun 1999
SMP SW RK BUDI MURNI-4, tamat tahun 2002
SMA NEGERI 8 MEDAN, Tamat tahun 2005
Jurusan Biologi, Fakultas MIPA USU, tamat tahun 2010
4. Riwayat Pekerjaan
•

Tentor di Bimbel Medika, tahun 2008

•

Staf pengajar di STIKES Imelda Medan, tahun 2015-sekarang

5. Perkumpulan profesi
-

Universitas Sumatera Utara