ISOLASI, IDENTIFIKASI DAN SENSITIVITAS Streptococcus pneumoniae, Klebsiella pneumoniae DAN Pseudomonas aeruginosa DARI SPUTUM PASIEN PNEUMONIA TERHADAP ANTIBIOTIK EMPIRIS YANG DIRESEPKAN
ISOLASI, IDENTIFIKASI DAN SENSITIVITAS Streptococcus
pneumoniae, Klebsiella pneumoniae DAN Pseudomonas aeruginosa
DARI SPUTUM PASIEN PNEUMONIA TERHADAP
ANTIBIOTIK EMPIRIS YANG DIRESEPKAN
SKRIPSI
Sebagai salah satu syarat untuk memperoleh gelar Sarjana Farmasi pada Program Studi Farmasi
Disusun Oleh :
Nama : Rizka Dewi Septiyani
Nim : 1008010080FAKULTAS FARMASI
UNIVERSITAS MUHAMMADIYAH PURWOKERTO
2014
ISOLASI, IDENTIFIKASI DAN SENSITIVITAS Streptococcus
pneumoniae, Klebsiella pneumoniae DAN Pseudomonas aeruginosa
DARI SPUTUM PASIEN PNEUMONIA TERHADAP
ANTIBIOTIK EMPIRIS YANG DIRESEPKAN
SKRIPSI
Sebagai salah satu syarat untuk memperoleh gelar Sarjana Farmasi pada Program Studi Farmasi
Nama : Rizka Dewi Septiyani
Nim : 1008010080FAKULTAS FARMASI
UNIVERSITAS MUHAMMADIYAH PURWOKERTO
2014
i
iv
INTISARI
RIZKA DEWI SEPTIYANI ISOLASI, IDENTIFIKASI DAN SENSITIVITAS
Streptococcus pneumoniae , Klebsiella pneumoniae DAN Pseudomonas
aeruginosa DARI SPUTUM PASIEN PNEUMONIA TERHADAP
ANTIBIOTIK EMPIRIS YANG DIRESEPKAN
Di bawah bimbingan Dr. Nunuk Aries Nurulita, M.Si., Apt dan Binar Asrining
Dhiani, M.Sc., Apt.Latar Belakang: Pneumonia merupakan masalah kesehatan didunia dengan
angka kematian yang tinggi. Angka kejadian pneumonia bervariasi pada berbagai daerah di Indonesia dan cenderung menunjukan adanya peningkatan. Antibiotik merupakan obat yang paling banyak diberikan pada pasien pneumonia. Beberapa galur bakteri penyebab pneumonia komuniti telah ditemukan resisten terhadap beberapa antibiotik. Informasi mengenai resistensi dan sensitivitas bakteri terhadap antibiotik menjadi sangat penting diketahui sebagai landasan dalam melakukan terapi.
Tujuan Penelitian: Mengisolasi, mengidentifikasi serta menentukan sensitivitas
bakteri Streptococcus pneumoniae, Klebsiella pneumoniae dan Pseudomonas dari sputum pasien yang didiagnosa pneumonia terhadap antibiotik
aeruginosa empiris yang diresepkan di RSUD Prof. Dr. Margono Soekarjo.
Metode Penelitian: Jenis dan rancangan penelitian yang digunakan adalah
penelitian observasional deskriptif dengan pendekatan cross sectional. Sampel sputum diperoleh dari pasien yang memenuhi kriteria inklusi dan eksklusi, kemudian diisolasi dan diidentifikasi bakteri dari sputum tersebut serta diuji sensitivitasnya terhadap antibiotik cefixime, azitromisin dan levofloksasin. Identifikasi bakteri dengan pewarnaan gram dan uji biokimia.
Hasil: Dari 17 sampel sputum pasien pneumonia didapatkan 109 isolat bakteri.
Isolat bakteri yang dominan menunjukan morfologi bentuk bulat menyebar, mukoid dan berwarna putih abu-abu. Dari hasil uji biokimia ditemukan 2 bakteri
Streptococcus pneumoniae , 7 bakteri Klebsiella pneumoniae dan 3 bakteri
Pseudomonas aeruginosa yang telah diuji sensitivitasnya dan didapatkan hasil semua
isolat Streptococcus pneumoniae, Klebsiella pneumoniae dan Pseudomonas
aeruginosa resisten terhadap cefixime dan sensitif terhadap levofloksasin. Sedangkan
pada azitromisin semua isolat Streptococcus pneumoniae, 57,14% isolat Klebsiella
pneumoniae dan 33,33% isolat Pseudomonas aeruginosa menunjukan hasil yang
resisten. Sedangkan 42,85% isolat Klebsiella pneumoniae dan 66,67% isolat Pseudomonas aeruginosa intermediat terhadap antibiotik ini.
Kesimpulan: Dari 17 sampel didapatkan 2 bakteri Streptococcus pneumoniae, 7
bakteri Klebsiella pneumoniae dan 3 bakteri Pseudomonas aeruginosa. Semua isolat bakteri menunjukan hasil yang sensitif terhadap levofloksasin dan resisten terhadap cefixime, Sedangkan pada azitromisin semua isolat Streptococcus pneumoniae, 57,14% isolat Klebsiella pneumoniae dan 33,33% isolat Pseudomonas aeruginosa menunjukan hasil yang resisten. Sedangkan 42,85% isolat Klebsiella pneumoniae dan 66,67% isolat Pseudomonas aeruginosa intermediat terhadap antibiotik ini Kata Kunci: Isolasi, Identifikasi, sensitivitas Antibiotik, pneumonia. v
ABTRACT
DewiSeptiyani, Rizka. ISOLATION, IDENTIFICATION, AND SENSITIVITY
OF Streptococcus pneumoniae, Klebsiella pneumoniae AND Pseudomonas
aeruginosa FROM SPUTUM PATIENT OF PNEUMONIA TOWARD
EMPIRICAL ANTIBIOTIC PRESCRIBED.
Guide byDr. Nunuk Aries Nurulita, M.Si., Apt and Binar Asrining Dhiani, M.Sc.,
Apt.Background: Pneumonia is a health problem worldwide with high mortality.
Pneumonia incidency is varied in Indonesia and it still rising. Antibiotic is given to pneumonia patient. Some of bacteria strains which cause community pneumonia is found to be resistant toward antibiotics. The information about resistance and sensitivity bacteria toward antibiotic is very important as a reference for pneumonia therapy.
Aims: This research was done to Isolate, identify, and also determine the
sensitivity of bacteria Streptococcus pneumoniae, Klebsiella pneumoniae,and
Pseudomonas aeruginosa from patient sputum who diagnosed pneumonia toward
empirical antibiotic prescribed.
Method: The research is designed as observational descriptive research with
cross sectional design. Sputum sample obtained from patient who fulfill the
inclusion and exclusion criteria. And then bacteria isolation and identification from the sputum and the sensitivity test was performed toward cefixime, azithromycin, and levoflocaxin. The identification of bacteria is with Gram staining and biochemical identification.
Result: From 17 sputum samples of patient pneumonia was found 109 isolate
bacteria. Dominant Isolate bacteria showed the morphology of circle form spreading, mucoid, and grey colored. Based on the Biochemical identification was found 2 bacteria identified as Streptococcus pneumoniae, 7 bacteriaKlebsiella
pneumoniae, and 3 bacteria Pseudomonas aeruginosa. The sensitivity assay exhibited
that all Streptococcus pneumoniae, Klebsiella pneumoniae, and Pseudomonas isolate was resistant toward cefiximine and sensitive toward levoflocaxin.
aeruginosa
Whereas against azithromycin, all of Streptococcus pneumoniae isolate, 57,14% of
Klebsiella pneumoniae, and 33,33% of Pseudomonas aeruginosa isolate was resistant.
Furthermore, 42,85% of Klebsiella pneumoniae, and 66,67% of Pseudomonas aeruginosa isolate intermediate toward Azithromycin.
Conclution: From 17 samples we found 2 bacteria identified as Streptococcus
pneumoniae , 7 bacteria as Klebsiella pneumoniae, and 3 bacteria Pseudomonas
vi
aeruginosa. All of isolate bacteria was sensitive toward levoflocaxin and resistant
toward cefixime, where as against azithromycin all of isolate Streptococcus
pneumoniae, 57,14% of Klebsiella pneumoniae, and 33,33% of Pseudomonas
aeruginosa isolated was resistant. Furthermore, 42,85% of Klebsiella pneumoniae,
and 66,67% of Pseudomonas aeruginosa isolate was intermediate toward this antibiotic.
Key word: Isolation, Identification, sensitivity Antibiotic, pneumonia.
vii
MOTTO HIDUP
Don’t be shy if you want to do something good Allah always with us Sebisa mungkin bisa berdiri sendiri dan tidak bergantung pada orang lain
viii
Lembar Persembahan
Skripsi ini saya persembahkan untuk kalian yang selalu mendoakanku Bapak dan Ibuku tercinta, untuk adik-adikku, keluargaku, Bapak danIbu Dosen Fakultas Farmasi dan untuk seluruh teman-teman yang selalu menyemangatiku.
ix
PRAKATA
Kegiatan penelitian selalu dibutuhkan dan dilakukan dengan tujuan untuk mendapatkan suatu hasil kesimpulan yang merupakan perbaikan dari segala sesuatu yang telah ada. Puji syukur penulis panjatkan kepada Tuhan Yang Maha Esa yang telah melimpahkan berkah dan karunia-Nya, sehingga penulis dapat menyelesaikan penelitian ini dengan judul “Isolasi, Identifikasi, dan Sensitivitas Streptococcus pneumoniae, Klebsiella pneumoniae, dan Pseudomonas aeruginosa Dari Sputum Pasien pneumonia terhadap Antibiotik Empiris yang Diresepkan ”.
Dalam rangkaian penelitian ini penulis menyadari sepenuhnya akan keterbatasan dan kekurangan yang dimiliki, sehingga usul karya tulis ilmiah ini selesai atas bantuan dari berbagai pihak.
Pada kesempatan ini penulis ingin menyampaikan ucapan terima kasih yang sedalam-dalamnya kepada :
1. Allah Subhanallahu wa Ta’ala yang selalu memberikan kemudahan pada setiap kesulitan dalam penelitian ini.
Bapak dan Ibuku yang selalu mendoakan q dan memberikan dorongan 2. moril maupun materil hingga penelitian ini selesai.
3. Dr. Nunuk Aries Nurulita, M.Si., Apt, selaku Dosen Pembimbing I dan Binar Asrining Dhiani, M.Sc., Apt, selaku Dosen Pembimbing II yang telah meluangkan waktu ditengah kesibukan untuk membimbing, membantu dalam memecahkan setiap masalah serta mengarahkan dalam penelitian karya tulis ilmiah ini.
Dr. Asmiyenti Djaliasrin Djalil, M.Si. dan Suparman, M.Sc., Apt 4. selaku Dosen Penguji
5. Ibu Hartini, Bapak Warko, dan Bapak Aji yang telah membantu dalam pengambilan sampel di rumah sakit RSUD Prof. Dr. Margono Soekarjo.
6. Teman-Teman di Laboratorium yang terlibat dan turut serta membantu dalam penelitian ini.
Orang-orang yang selalu membantuku pada setiap kesulitan.
7. x
Penulis sangat menyadari bahwa dalam karya tulis ini masih jauh dari sempurna dan masih banyak kekurangan di dalamnya. Untuk itu, segala kritik dan saran sangat diharapkan demi kesempurnaan dimasa mendatang. Semoga karya tulis ini bermanfaat bagi pembaca, perkembangan ilmu farmasi serta masyarakat.
Purwokerto, 10 September 2014 Penulis xi
RIWAYAT HIDUP
Nama : Rizka Dewi septiyani Tempat Tanggal Lahir : Tegal, 29 September 1992 Nama Ayah : Lut Muryanto S.Pd.
Nama Ibu : Sri Sukarniati S.Pd.Aud Riwayat Pendidikan Sekolah Menengah Atas (SMA) : SMA Negeri 1 warureja Riwayat Kegiatan Ilmiah yang Pernah Diikuti : 1.
Seminar “Self Management in Atshma Patients” Fakultas Farmasi Universitas Muhammadiyah Purwokerto pada tanggal 21 Mei 2013.
Fakultas Farmasi Universitas Muhammadiyah Purwokerto pada tanggal 7 September 2013. xii
DAFTAR ISI
DAFTAR TABEL ............................................................................................ xvi DAFTAR GAMBAR ........................................................................................ xvii DAFTAR LAMPIRAN .................................................................................... xviii BAB I PENDAHULUAN .................................................................................
1 A. Latar Belakang ..................................................................................
1 B. Perumusan masalah ..........................................................................
2 C. Tujuan Penelitian .............................................................................
3 D. Manfaat penelitian ...........................................................................
3 BAB II TINJAUAN PUSTAKA .......................................................................
4 A. Pneumonia ........................................................................................
4 1. Etiologi ......................................................................................
4 2. Patofisiologi...............................................................................
5 3. Klsifikasi pneumonia .................................................................
6 4. Penatalaksanaan .........................................................................
8 B. Antibiotik .........................................................................................
4 1. Azithromycin ...............................................................................
9 2. Levoflocaxin .................................................................................
9 3. Cefixime .......................................................................................
9 C. Resistensi .........................................................................................
10 D. Bakteri .............................................................................................
12 1. Streptococcus pneumoniae ............................................................
12 2. Klebsiella pneumoniae .................................................................
13 3. Pseudomonas aeruginosa ..............................................................
13 E. Isolasi dan Identifikasi Bakteri ..........................................................
13 1. Pewarnaan Sederhana ....................................................................
14 2. Pewarnaan Diferensial ..................................................................
14 3. Pewarnaan Khusus .......................................................................
14 F. Uji Sensitivitas Bakteri ....................................................................
15
1. Metode difusi ................................................................................ 15
2. Metode Dilusi ............................................................................... 15 xiii
G. Sputum ............................................................................................ 16 BAB III METODE PENELITIAN ....................................................................
17 A. Jenis dan Rancang Penelitian .........................................................
17 B. Definisi Variabel Operasional ........................................................
17 C. Alat dan Bahan ..............................................................................
18 D. Pembuatan Media ..........................................................................
18 E. Cara Penelitian ...............................................................................
1. Tahap Persiapan .........................................................................
19 a. Populasi ................................................................................
20 b. Kriteria Inklusi .....................................................................
20 c. Kriteria Ekslusi ......................................................................
20 d. Metode Sampling...................................................................
20 e. Pengambilan Sampel ............................................................
20 2. Sterilisasi Alat dan Bahan ..........................................................
20 3. Isolasi Bakteri ............................................................................
21 4. Pembuatan Stok Kultur Bakteri ...................................................
21 5. Identifikasi Bakteri ....................................................................
22 a. Pewarnaan Gram ....................................................................
22 b. Uji Biokimia .........................................................................
22 6. Uji Resistensi Antibiotik ............................................................
24 BAB IV HASIL DAN PEMBAHASAN ...........................................................
26 A. Pengambilan Sampel .....................................................................
26 B. Isolasi Bakteri ................................................................................
28 C. Identifikasi Bakteri .........................................................................
29 1. Uji Oksidase ...............................................................................
29 2. Fermentasi Karbohidrat...............................................................
30 3. Uji Sitrat .....................................................................................
31 4. Uji Voges Proskauer ...................................................................
32 5. Uji Metil Red ..............................................................................
32 6. Cetrimid Agar .............................................................................
33 7. Pewarnaan Gram.........................................................................
34 C. Uji Sensitivitas Antibiotik ................................................................
36 xiv
BAB V KESIMPULAN DAN SARAN ............................................................. A. Kesimpulan ....................................................................................
43 B. Saran.................................................................................................
43 DAFTAR PUSTAKA ........................................................................................
44 LAMPIRAN ......................................................................................................
47 xv
DAFTAR TABEL
Tabel 1. Diameter zona hambat resistensi bakteri .........................................25 Tabel 2. Karakteristik responden ...................................................................
26 Tabel 3. Hasil pewarnaan gram isolat bakteri ...............................................
35 Tabel 4. Identifikasi biokimia bakteri Klebsiella pneumoniae , Streptococcus pneumoniae dan Pseudomonas aeruginosa ............
36 Tabel 5. Diameter zona hambat isolat bakteri dari sputum pasien terhadap beberapa antibiotik ..........................................................................
39 Tabel 6. Sensitivitas isolat bakteri Klebsiella pneumoniae, Streptococcus
pneumoniae dan Pseudomonas aeruginosa terhadap beberapa antibiotik ..........................................................................................
40 xvi
DAFTAR GAMBAR
Gambar 1. Pemurnian bakteri pada agar darah ...................................................29 Gambar 2. Hasil uji oksidase beberapa isolat bakteri ..........................................
30 Gambar 3. Hasil isolat bakteri positif Pseudomonas aeruginosa pada cetrimid agar .
33 Gambar 4. Hasil pewarnaan gram beberapa isolat bakteri ..........................................
34 Gambar 5. Gambar zona hambat beberapa isolat bakteri ...........................................
37 xvii