3.3.1.1 Perangkat keras Hardware
Perangkat keras yang digunakan pada penelitian berupa prosesor Intel Quart Core, harddisk 250 GB, Monitor Hp LE1851w dan Random Access
Memory RAM 4 GB.
3.3.1.2 Perangkat lunak Software
Perangkat lunak yang digunakan adalah Sistem operasi Windows Vista ® Business OA EM-SEA, Program yang digunakan adalah, GaussView3.07 untuk
memasukkan metode perhitungan, Marvin Beans untuk menggambar model struktur quinoxalin, Gaussian09W untuk perhitungan kimia, dan IBM SPSS 21 untuk
menganalisis regresi multilinier pada pemodelan HKSA. 3.3.2
Bahan
Bahan kajian dalam penelitian ini adalah senyawa analog quinoxalin beserta data IC
50
yang telah diperoleh dari eksperimen.
3.4 Prosedur Penelitian
3.4.1 Menggambar Struktur Kimia Senyawa Analog
Model struktur kimia senyawa analog quinoxalin yang digunakan dalam penelitian ini digambar menggunakan software Marvin Beans. Diawali dengan
menggambar struktur dasar yang tersaji dalam Gambar 2.2, dilanjutkan dengan dilakukan substitusi pada W, R6, dan R7 seperti pada Tabel 2.1. File disimpan dalam
format gaussian input file .gjf.
3.4.2 Optimasi Geometri Struktur
Proses dilanjutkan dengan optimisasi geometri struktur turunan senyawa quinoxalin yang tertera pada Tabel 2.1 dan 2.2 berupa minimisasi energi molekul
untuk memperoleh konformasi struktur molekul paling stabil. Sebelum optimasi dilakukan, file dipreparasi terlebih dahulu menggunakan Gaussview 3.07 untuk
mengatur metode yang digunakan. Preparasi dilakukan dengan membuka file model senyawa quinoxalin dalam format .gjf, selanjutnya memilih Calculate, memilih
Gaussian pada Job type kemudian Optimization. Pada method memilih ground state kemudian DFT unrestricted dan digunakan metode B3LYP 6311G, selanjutnnya
diklik retain dan file preparasi di simpan sebagai gaussian input file .gjf. Optimisasi struktur dengan menggunakan metode mekanika kuantum
DFT dilakukan dengan membuka file pada aplikasi Gaussian09W dengan memilih File dan Open kemudian dipilih file gaussian file input .gjf yang akan dioptimasi
selanjutnya dipilih Load dan memilih directory hasil output optimasi kemudian klik Run untuk memulai mengoptimasi.
3.4.3 Perhitungan Nilai Deskriptor Elektronik
Perhitungan selanjutnya yaitu menghitung muatan bersih pada atom-atom yang terdapat dalam kerangka struktur induk quinoxalin terdiri dari 20 atom qN1,
qC2, qC3, qN4, qC5, qC6, qC7, qC8, qC9, qC10, qO11, qO12, qC13, qC14, qC15, qC16, qC17, qC18, qC19, qN20. Perhitungan dilakukan dengan membuka file .out
hasil optimasi dari model senyawa quinoxalin menggunakan Marvin Beans,
kemudian memilih Calculation, memilih Charge dan dihasilkan muatan bersih atom model senyawa quinoxalin.
Gambar 3.1 Struktur senyawa 3-fenilquinoxalin 1,4-di N-oksida Deskriptor elektronik selanjutnya adalah yaitu perhitungan energi
HOMO-LUMO, energi HOMO merupakan energi pada orbital molekul paling tinggi yang terisi elektron, sedangkan energi LUMO merupakan energi pada orbital molekul
terendah yang tidak terisi elektron. Perhitungan energi HOMO-LUMO dilakukan dengan membuka file output optimasi .out dengan GaussView3.07 kemudian di
klik Calculate dan dipilih Guess kemudian dipilih Mix HOMO-LUMO dan ditambahkan keyword pop=reg. Metode yang dipilih sama dengan metode yang
digunakan saat optimasi model, selanjutnya dipilih Retain kemudian file disimpan sebagai Gausssian Input File .gjf. Optimasi dimulai dengan membuka Gausssian
Input File pada aplikasi Gaussian09W kemudian dipilih load kemudian file output di simpan dan diklik Run untuk optimasi model.
3.4.4 Perhitungan Momen Dipol
Kategori