marmorata n. nebulosa MOLECULAR PHYLOGENY AND GENETIC DIVERSITY OF FRESHWATER EEL GENUS Anguilla IN INDONESIA

44 A. b. pacifica supported by 99 replicatons bootstrap subspecies that inhabit in eastern of Indonesia water have three nucleotide diagnostic T at 449 th , T at 466 th and T at 711 th and three amino acid diagnostic L, M, L at codon 156 th , 231 th and 236 th respectively with all species. A. celebensis supported by 99 replicatons bootstrap be identified clearly with five nucleotide diagnostics T at 182 th , T at 518 th , T at 582 th , G at 605 th and T at 734 th with all Anguillid species. According to Figure 4, A. celebesensis consist of two clades bootstrap 100. Clade-1 has one nucleotide diagnostic T at 746 th , supported with 81 replication bootstrap and clade-2 has two substitution nucleotide diagnostic G at 542 th and T at 981 th with all Anguillid species, supported with 99 replication bootstrap. Noticing the topology branch of clade-2, it divided into two subclade, which supported by significant bootstrap 83 and 99, however we did not find diagnostic nucleotides for the subclade. Genetic distance within species A. celebesensis also have the large value in comparison to other species, this fact supports high divergence of this species. A. interioris supported by 99 replicatons bootstrap have two substitution nucleotide diagnostics T at 536 th and T at 920 th with all species. In accordance Fig. 7 A. interioris divided into two clades, clades-1 support by 78 bootstrap have one nucleotide diagnostic G at 873 th and clade-2 support by 71 bootstrap have 1 nucleotide diagnostic T at 650 th . There was one specimen Men 4 out of both of clade. Table 8. Nucleotide diagnostic of each species and clade on the species nucleotide position nucleotide position nucleotide position nucleotide position nucleotide position nucleotide position nucleotide position C nt-38 T nt-182 A nt-113 T nt-449 nd nd G nt-338 T nt-536 T nt-68 T nt-518 T nt-305 T nt-466 T nt-410 T nt-920 A nt-95 T nt-582 T nt-482 T nt-711 T nt-696 T nt-101 G nt-605 G nt-635 G nt-986 T nt-152 T nt-734 T nt-644 T nt-164 T nt-705 G nt-392 T nt-878 T nt-435 A nt-465 T nt-467 A nt-491 T nt-686 G nt-710 T nt-755 nd nd T nt-746 C nt-215 nd nd C nt-20 nd nd G nt-893 G nt-386 G nt-902 nd nd G nt-542 G nt- 362 nd nd G nt-485 nd nd T nt-650 T nt-891 G nt-620 A. n. nebulosa A. interioris Nucleotide diagnostic for Species and subspecies Clade 1 Clade 2 A. b. bicolor A. borneensis A. celebesensis A. marmorata

A. b. pacifica

Note: nd = no data 45 46 Table 9. Matrix genetic distance between all of species-subspecies on genus Anguilla. Grey highlights one is species-subspecies during this study. Standar errors SE was showed above diagonal. Analysis conducted under Kimura 2-parameter 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 1. A. b. bicolor 0,004 0,011 0,008 0,008 0,008 0,008 0,010 0,009 0,011 0,010 0,010 0,011 0,011 0,008 0,010 0,009 0,010 2. A. b. pacifica 0,023 0,011 0,008 0,008 0,009 0,008 0,010 0,009 0,011 0,010 0,010 0,011 0,011 0,008 0,010 0,010 0,010 3. A. borneensis 0,103 0,100 0,010 0,009 0,010 0,010 0,011 0,010 0,011 0,011 0,010 0,010 0,010 0,010 0,010 0,010 0,010 4. A. celebesensis 0,077 0,074 0,089 0,008 0,008 0,008 0,008 0,009 0,011 0,010 0,008 0,008 0,010 0,009 0,009 0,008 0,009 5. A. interioris 0,067 0,063 0,081 0,062 0,007 0,007 0,009 0,006 0,011 0,010 0,009 0,010 0,011 0,007 0,010 0,009 0,010 6. A. marmorata 0,072 0,070 0,087 0,065 0,048 0,008 0,010 0,007 0,011 0,011 0,008 0,009 0,011 0,008 0,011 0,010 0,010 7. A. n. nebulosa 0,063 0,063 0,092 0,068 0,051 0,057 0,009 0,008 0,011 0,010 0,009 0,009 0,010 0,008 0,010 0,009 0,010 8. A. megastoma 0,089 0,087 0,096 0,061 0,075 0,072 0,080 0,011 0,010 0,011 0,010 0,010 0,012 0,010 0,010 0,009 0,010 9. A. luzonensis 0,075 0,070 0,088 0,075 0,043 0,053 0,056 0,090 0,011 0,010 0,009 0,010 0,010 0,008 0,011 0,010 0,011 10. A. mossambica 0,101 0,101 0,097 0,096 0,098 0,096 0,099 0,093 0,102 0,010 0,010 0,011 0,011 0,011 0,010 0,010 0,010 11. A. rostrata 0,097 0,094 0,098 0,094 0,096 0,090 0,092 0,104 0,093 0,095 0,010 0,011 0,007 0,010 0,010 0,010 0,010 12. A. reinthardtii 0,083 0,083 0,087 0,070 0,076 0,063 0,068 0,079 0,075 0,088 0,091 0,009 0,011 0,009 0,010 0,009 0,010 13. A. japonica 0,102 0,096 0,094 0,073 0,082 0,074 0,076 0,079 0,085 0,093 0,094 0,062 0,011 0,010 0,011 0,009 0,011 14. A. anguilla 0,108 0,101 0,095 0,101 0,095 0,095 0,097 0,104 0,092 0,102 0,046 0,096 0,099 0,011 0,011 0,010 0,011 15. A. obscura 0,068 0,062 0,088 0,074 0,056 0,060 0,063 0,083 0,058 0,104 0,092 0,075 0,084 0,096 0,011 0,010 0,011 16. A. a. australis 0,095 0,089 0,079 0,076 0,085 0,086 0,091 0,085 0,096 0,084 0,084 0,080 0,087 0,086 0,097 0,008 0,001 17. A. diefenbachii 0,079 0,075 0,077 0,061 0,073 0,079 0,069 0,074 0,076 0,081 0,078 0,072 0,074 0,079 0,080 0,061 0,008 18. A. a. scimidthi 0,094 0,088 0,080 0,075 0,084 0,085 0,090 0,083 0,095 0,084 0,082 0,079 0,088 0,085 0,095 0,001 0,060 Table 10 Genetic distance within species and sub species. Species Genetic distance within species SE

A. marmorata

0,0055 0,0013 A. interioris 0,0058 0,0015

A. n. nebulosa

0,0035 0,0011

A. b. pacifica

0,0040 0,0010 A. b. bicolor 0,0080 0,0018 A. celebesensis 0,0063 0,0015 A. borneensis 0,0013 0,0010