27
3.5 Prosedur Penelitian 3.5.1 Menggambar Struktur Kimia Senyawa Analog Apigenin
Struktur kimia senyawa analog apigenin yang digunakan dalam penelitian ini digambar menggunakan software gaussview-5.08. Diawali dengan menggambar
struktur dasar yang tersaji dalam gambar, kemudian disubstitusi pada masing- masing gugus R dengan senyawa seperti pada Tabel 2.1. File disimpan dalam
format Gaussian input file .gjf agar mampu dibaca oleh software Gaussian-09W yang digunakan dalam tahap optimasi geometri struktur.
3.5.2 Optimasi geometri
Sampel dioptimasi menggunakan software Gaussian-09 dengan metode hatree fork pada basis sets 6-311G. Kemudian deskriptor dihitung pada struktur
geometri yang telah optimal menggunakan metode yang sama. Proses Optimasi ini tidak secara langsung menggunakan software Gaussian-09, namun terlebih dahulu
dipreparasi menggunakan software GaussView-5.08. Tahap ini dilakukan untuk mempermudah penulisan Gaussian input file .gjf. Langkah selanjutnya yaitu
memilih metode perhitungan dan basis sets. Klik menu Calculate, kemudian pilih menu Gaussian maka akan muncul kotak dialog. Tetapkan Job Type pada
Optimization, lanjutkan dengan memilih metode pada kotak dialog method. Tetapkan metode pada Ground State, Hatree Fork. Atur basis sets pada 6-311G,
charge 0 dan spin singlet, kemudian klik retain. Simpan dengan cara klik menu File, kemudian pilih Save. Ketik nama file pada kotak File name, tetapkan Files of type
pada Gaussian input file .gjf, .com dan Save as pada Gaussian input file, kemudian
klik tombol
Save.
28
3.5.2 Perhitungan nilai deskriptor
Nilai deskriptor dihitung menggunakan software MarvinBeans-15.1.26 dan Gaussian-09. Deskriptor sterik dan hidrofobik dihitung menggunakan software
MarvinBeans-15.1.26. Langkah awal yaitu membuka file Gaussian output file .out hasil optimasi menggunakan software MarvinBeans-15.1.26. dengan cara
klik menu File, kemudian pilih menu Open. Klik menu Calculate, kemudian pilih deskriptor yang akan dihitung, kemudian klik tombol Ok. Deskriptor elektronik
dihitung menggunakan software Gaussian-09. Langkah perhitungan energi HOMO-LUMO yaitu membuka Gaussian output file .out hasil optimasi pada
software GaussView-5.08 dengan Job Type Frequency. Atur pula Guess Method Mix HOMO-LUMO orbital dan menambahkan perintah pop=reg untuk
menampilkan eigenvalues. Potensial ionisasi dihitung dengan metode OVGF dan menambahkan perintah tran=full untuk menampilkan hasil perhitungan.
3.6 Analisis Statistika Kajian HKSA
