ISOLASI DAN IDENTIFIKASI BAKTERI DARI TANAH DI SEKITAR PENAMPUNGAN BESI RONGSOK

  Diajukan Untuk Memenuhi Sebagian Syarat Mencapai Derajat Sarjana S

  

ISOLASI DAN IDENTIFIKASI BAKTERI DARI TANAH DI

SEKITAR PENAMPUNGAN BESI RONGSOK

SKRIPSI

• –1

  

Oleh :

MEGA MARETA NGALIH

0901070045

  

PROGRAM STUDI PENDIDIKAN BIOLOGI

FAKULTAS KEGURUAN DAN ILMU PENDIDIKAN

UNIVERSITAS MUHAMMADIYAH PURWOKERTO

2013

  

MOTTO

  “ ”

  Lahaula Wala Quwata Illa Billah Hil Aliyil ‘Azim

Tiada Kekuatan dan Daya Melainkan dari Allah yang Maha Tinggi

  (

  lagi Maha Mulia )

  “ ”

  Hasbunallah Wa ni’mal wakiil ni’mal maulaa wa ni’mannashiir

Bagi kami cukup Allah saja pelindung yang baik, bagi kami tempat

  (

  berserah diri yang baik dan penolong yang baik bagi kami

  )

  

Selalu berikhtiar, tekun dan sabar dalam mengerjakan

kesulitan, selanjutnya bertawakalah kepada Allah SWT pasti

  .

  

akan ada kemudahan dan kesuksesan

  Sujud syukurku Kehadirat Illahi Robbi atas semua yang telah diberikan kepada penulis sehingga dapat menyelesaikan skripsi ini tanpa ada halangan, dan penulis ingin mempersembahkan skripsi ini untuk:

  

PERSEMBAHAN

• Bapak dan Ibu tercinta peluk cium ananda takkan ada hentinya serta senantiasa terucapkan tulusnya rasa terimakasih yang mendalam atas Do’a yang tiada hentinya dan mensuport penulis untuk selalu semangat dalam menyelesaikan skripsi ini.
• Segenap keluarga Rusidi Suhardjo, yang telah membantu secara moril dan materiil kepada penulis.
• Dosen Pembimbing Drs. Heri Maryanto, M.Si dan Dini Siswani Mulia M.Si, yang telah membantu dalam penyusunan skripsi ini.
• Tak lupa juga untuk mas Rozzaq yang selalu memberikan motivasi, perhatian, Do’a, bantuan, dan segala kasih sayang selama ini.

  UCAPAN TERIMAKASIH Bismillahirrohmaanirrohim

  Alhamdulillahirrobbil’alamiin, Puji Syukur penulis panjatkan kehadirat Allah SWT yang telah melimpahkan rahmat dan inayah-Nya sehingga penulis dapat menyelesaikan skripsi yang berjudul

  “Isolasi dan Identifikasi Bakteri dari Tanah di sekitar Penampungan Besi Rongsok”.

  Penulis menyadari bahwa terselesainya penyusunan skripsi ini pastinya berkat dukungan, bimbingan, serta bantuan dari berbagai pihak yang terlibat langsung maupun tidak langsung. Dalam kesempatan ini, perkenankanlah penulis mengucapkan terimakasih yang tulus ikhlas penulis sampaikan kepada bapak Drs. Heri Maryanto, M.Si dan Ibu Dini Siswani Mulia, S.Pi, M.Si selaku Dosen Pembimbing skripsi yang dengan segala kesabaran memberikan bimbingan, arahan serta dorongan sehingga penulis dapat menyelesaikan penelitian dan penulisan skripsi dengan baik dan lancar.

  Selain itu penulis juga mengucapkan terimakasih kepada: 1. Drs. Ahmad, M.Pd selaku Dekan Fakultas Keguruan dan Ilmu Pendidikan Universitas Muhammadiyah Purwokerto.

  2. Drs. Arief Husin, M.Si selaku Ketua Program Studi Pendidikan Biologi Fakultas Keguruan Ilmu Pendidikan Universitas Muhammadiyah Purwokerto atas fasilitasi kelancaran skipsi.

  3. Segenap Dosen Program Studi Pendidikan Biologi Universitas Muhammadiyah Purwokerto yang selalu memberikan tambahan ilmu.

  4. Staf karyawan Fakultas Keguruan dan Ilmu Pendidikan.

  5. Staf laboran yang telah memberi bantuan selama penelitian: Kurniawan, S.Si, Alhikmah, S.Si, & R. Nindra, S.Si.

  6. Bapak dan Ibu yang selalu memberikan Doa dan semangat, beribu-ribu terima kasih untuk semuanya yang tak akan cukup jika diungkapkan dengan kata- kata dan yang tak akan mungkin terbalaskan sampai kapanpun.

  7. Kakak dan saudara-saudaraku yang selalu memberi nasehat dan motivasi.

  8. My special one M. Ridlo Nur Ar Rozzaq terimakasih telah menjadi penyemangat selama ini, dukungan, Doa, dan bantuannya dalam penyelesaian skripsi ini.

  9. Sahabat-sahabatku Siti Nur Amanah, Neira Wiluyandari, Peni Rahayu, mas Rudi, terima kasih untuk bantuannya selama ini, motivasi, dan bersedia menjadi pendengar keluh kesahku serta teman-teman Midi poto kos terimakasih telah memberikan semangat dan Doa.

  10. Teman-teman seperjuangan di Program Studi Pendidikan Biologi angkatan 2009 atas kerjasamanya selama ini.

  11. Kepada semua pihak yang tidak bisa penulis sebutkan satu persatu yang telah membantu dalam penyusunan skripsi ini.

  Semoga amal dan kebaikan yang telah diberikan Bapak dan Ibu dosen serta teman-teman semua kepada penulis mendapat balasan yang setimpal dari Allah SWT.

  Penulis menyadari karya ini masih sangat jauh dari sempurna. Oleh karena itu, kritik dan saran yang membangun sangat diharapkan. Semoga dapat bermanfaat bagi pembaca.

  Purwokerto, 12 Agustus 2013 Penulis

  

ISOLASI DAN IDENTIFIKASI BAKTERI DARI TANAH DI SEKITAR

PENAMPUNGAN BESI RONGSOK

Oleh:

MEGA MARETA NGALIH

  

0901070045

ABSTRAK

  Penelitian tentang Isolasi dan Identifikasi Bakteri dari Tanah di sekitar Penampungan Besi Rongsok telah dilaksanakan di Laboratorium Mikrobiologi dan Lingkungan Progam Studi Pendidikan Biologi Universitas Muhammadiyah Purwokerto pada bulan Februari-April 2013. Penelitian ini bertujuan untuk mengisolasi dan mengidentifikasi jenis-jenis bakteri dari tanah di sekitar tempat penampungan besi rongsok, di Desa Karangsalam, Kecamatan Kedungbanteng, Kabupaten Banyumas. Penelitian ini menggunakan metode survey. Sampel tanah diambil dari tempat penampungan besi rongsok. Pengambilan sampel dilakukan sebanyak 2 kali dengan interval waktu 1 minggu. Isolasi dilakukan dengan metode

• 3

  

dillution plating (pengenceran) yang dilakukan sampai tingkat 10 . Beberapa

  kriteria yang digunakan di dalam mengidentifikasi bakteri dapat dilakukan dengan mengamati karakteristik makroskopis, mikroskopis, dan uji biokimia bakteri. Pengamatan makroskopis meliputi bentuk koloni, warna koloni, bentuk tepi koloni, dan ukuran koloni. Pengamatan mikroskopis meliputi pewarnaan Gram, bentuk sel, dan ukuran sel. Pengujian biokimiawi meliputi uji indole, uji methyl red, uji voges proskauer, simmon citrate, produksi H

  2 S, urease, fermentasi

  karbohidrat, dan uji katalase. Isolat bakteri diidentifikasi menggunakan buku

  

Bergey’s Manual Deteminative of Bacteriology (Holt et al., 1994). Hasil

  identifikasi terhadap isolat bakteri diperoleh 10 genus bakteri yaitu Acinetobacter,

  

Alcaligenes, Arthrobacter, Azomonas, Enterobacter, Klebsiella, Kluyvera,

Neisseria, Oscillospira, dan Serratia.

  Kata Kunci: Bakteri tanah, Besi rongsok, Identifikasi bakteri, Isolasi

  

DAFTAR ISI

Halaman

  UCAPAN TERIMAKASIH ........................................................................ vii ABSTRAK ................................................................................................... ix DAFTAR ISI ................................................................................................ x DAFTAR TABEL ......................................................................................... xii DAFTAR GAMBAR ................................................................................... xiii DAFTAR LAMPIRAN ................................................................................. xiv

  BAB I PENDAHULUAN 1.1 Latar Belakang ....................................................................

  1 1.2 Rumusan Masalah ...............................................................

  3 1.3 Tujuan Penelitian .................................................................

  3 1.4 Manfaat Penelitian ...............................................................

  3 BAB II TINJAUAN PUSTAKA 2.1 Isolasi Bakteri .......................................................................

  4 2.2 Identifikasi Bakteri ..............................................................

  5 2.3 Bakteri ............................................................................... ..

  7 2.4 Resistensi Bakteri ................................................................

  9 2.5 Besi (Fe) .................... ..........................................................

  11 2.6 Tembaga (Cu) .................................................................... ..

  12 2.7 Seng (Zn) ..............................................................................

  13 BAB III METODE PENELITIAN 3.1 Lokasi dan Penelitian ..........................................................

  14 3.2 Alat dan Bahan ....................................................................

  14 3.3 Metode Penelitian ................................................................

  15 3.4 Prosedur Penelitian ..............................................................

  15 3.5 Identifikasi Bakteri ..............................................................

  25 BAB IV HASIL DAN PEMBAHASAN

  4.1

  26 Hasil Penelitian ...................................................................

  4.2

  47 Pembahasan ........................................................................

  BAB V SIMPULAN DAN SARAN

  5.1

  59 Simpulan .............................................................................

  5.2

  59 Saran ................................................................................... DAFTAR PUSTAKA ............................................................................... ...

  60 LAMPIRAN ............................................................................................... ..

  65

  DAFTAR TABEL Halaman

Tabel 4.1 Isolat bakteri yang berhasil diisolasi dari tanah di sekitar penampungan besi

  rongsok................................................................................

  26 Tabel 4.2 Karakteristik genus Serratia ..............................................

  34 Tabel 4.3 Karakteristik genus Neisseria ............................................

  36 Tabel 4.4 Karakteristik genus Klebsiella ...........................................

  37 Tabel 4.5 Karakteristik genus Alcaligenes .........................................

  38 Tabel 4.6 Karakteristik genus Acinetobacter .....................................

  40 Tabel 4.7 Karakteristik genus Enterobacter ......................................

  41 Tabel 4.8 Karakteristik genus Kluyvera .............................................

  42 Tabel 4.9 Karakteristik genus Azomonas ...........................................

  44 Tabel 4.10 Karakteristik genus Arthrobacter .......................................

  45 Tabel 4.11 Karakteristik genus Oscillospira ........................................

  47 Tabel 4.12 Kuantitas isolat bakteri .......................................................

  48

  DAFTAR GAMBAR Halaman

Gambar 4.1 Isolat MG-4 (A) bentuk koloni bulat, tepi halus, dan elevasi rata, isolat MG-9 (B) bentuk koloni bulat, tepi

  bergerigi, dan elevasi rata................................................................................

  27 Gambar 4.2 Hasil uji indole + ditunjukkan dengan warna merah

• – pada permukn medium (A) dan uji indole ditunjukkan dengan warna kuning pada permukaan medium (B)................................................................................

  29 Gambar 4.3 Hasil uji MR + pada isolat MG-1 (A) dan hasil uji MR

• – pada isolat MG-4 (B)................................................................................

  30

• – Gambar 4.4 Hasil uji VP + pada isolat MG-2 (A) dan uji VP pada isolat MG-9 (B)

  31 …............................................................................

Gambar 4.5 Hasil uji simmon citrate + pada isolat MG-5 (A) dan uji simmon citrate

• – pada isolat MG-7 (B)................................................................................

  31 Gambar 4.6 Hasil uji katalase +.......................................................

  33 Gambar 4.7 Persamaan reaksi hidrolisis glukosa (Cappuccino & Sherman 1987)............................................................................

  53 Gambar 4.8 Persamaan reaksi fermentasi karbohidrat (a) (Cappuccino & Sherman 1987)............................................................................

  54 Gambar 4.8 Persamaan reaksi perubahan warna pada medium uji (b) VP (Cappuccino & Sherman 1987) ............................

  54 Gambar 4.9 Reaksi penguraian tryptophan oleh enzim tryptophanase (Cappuccino & Sherman 1987)............................................................................

  55

  Gambar 4.10 (a)

  Reaksi (I) Fermentasi asam sitrat (Cappuccino & Sherman 1987) ............................................................

  56 Gambar 4.10 (b)

  Reaksi (II) Fermentasi asam sitrat (Cappuccino & Sherman 1987) ............................................................

  57 Gambar

  4.11 Persamaan reksi penguraian H

  2 O 2 oleh enzim katalase (Cappuccino & Sherman 1987) .....................

  58