IDENTIFIKASI BAKTERI KTTINOLITIK DI DAERAH RAWA PANTAI PADANG BERDASARKAN ANALISIS SEKUENS GEN 16S-rRNA.
IDENTIFIKASI BAKTERI KITINOLITIK DI DAERAH RA.WA
PAmAI PADAf\IC BERDASARKAN ANALISIS SEKUENS
GEN 16S-rRNA
CUT ANDESTI
SKRIPSI
Sebr€.i
Srl,l
Sydt Ulttr&
Strjtu Pedrln!
S!t'n
M€oD€rc|.t C.ltr
JURUSAII BI]DIDAYA PERTANIAN
FAKI'LTAS PERTANIAN
I,INIVERSITAS AI'DAIIS
PADANG
20r0
IDE\TIFIKASI RAKTIRI KITINOLI'I'IK DI DAERAH RAWA
P1\ fAI PADAN(; Bf,RD,,\S,4RKAN A\ALISIS SEKTJIi\S
(;llN
165 rRNA
\BS I RAK
_
:':i.lrirtr Ji!r jknr ' l(l.nririkrsi ll.lr.n Ki{nxniliL {l Dxernh ttr$x
, i,rJrns lr.dr\rr[in triLiris Sc(Rns (;rn ]rS rR\1 . r. ih dit utu di
l,aLm Bi.i.krologl d I).nitrlirao lxnlmrD.urrin lludidrrx Pcnanirn
. P.drnid I ri\c6n.s AndaL\ PaJxn| drri bulan l).sc nir. t0t9 srnrnai
j :1110 l.tr.lili! ini hurujuln unLlll mcndrNrt]n t.te[\i nnrts sotar
.::_ ..ri drrn,fu.\ri rlh\rr,\ ll r.lilik varg br sll dari a\x I'n.t.l PrJ.o.!
r' :r.nrulrn denihs sp.sics brklfi lilinolilik rertiih nr.ilgrDxlm dd!
-r
,.
biltrl dilrl.lsi dri du l.Lrir 1r n' mui Prnil rl, nq ! ,ri n ri\r
:-_ r1
. Jxdib|l l,xdlng DN.1 lrDomil dii\nx\r dcrgrD n'oscdrr
i_::ari orr(,dr llll Ne\nran ,\'ntlfikasi r' rnro mcnlruDrlln hfnibiJusi
l.rl i5 AC^Cl llL\lCNll(i(i(Ta,\G r') d.n lililt 1j'
!rnlla,\'L((]\Rcc l I s.ltrr jjoq dilxkuld rcc.ft ,,r /il.rr,r
jri.rn l,'i,r.r l5l5lt l!nrt jr! dlsetucDs xdxl:Llj .mrur iso]ll hrhr.ri
\ r4rilih du! nr al {Uanrrnntr nicNrlili nrdckl L n.lril ritrg!i J:!r
: trr ntnlLjiL i'rlcks kiliFlirlI nnJlh P.ocnnrn] nltarna\ hNLFn
Pr!
J.nlrn D.ngik{s Llxrxlre prblik Nanl Drcf!!u.ka. rnllisil
dengd Dt !!rn rn rn)!flnl
.: -:P:o.ruf lrdi t.l.r$x[tri dild k
nd.liliJn hc.lusil nrcrnp.rol.h l.Lorn inrl!l brlrer tin! b.idr si
. _ :."::LJrn Jur loL6l p.ngrnbiL :!hl[l l)rh h.sil .n.lisis BLAS drn .l
kilinflnlI rc'nilh orrnunrul[]n lconrpok: /r r/nhr.r., \t
' : _1ni
: - ..,t.t olr( tu aurs t: :ttin \\JAll ttr1r6.,nn,rd!r, ip l K00r drn
: - , ..a1a i i ( Al5 llrlreri )rnA bc[orcDsi LiriJriliril r.no!!i l)adr
::_::_::i \tlao 10 hrri rdrrh rrrtl/ra..??L\ {rurn a^lj n.rd$l[ai
'- . . i..L3tuhxr1n t.r.r( hr[rr] kiriiltiliL dcntxn m$!-rundd ptu!.xni
. il \\ \e$i I 3 lr.bcd(ul ri.!r tcl()mtol hesrrllJ^ dcmi.d k.ridll\mim
rrl
tr
\r-r,l k., /4\,f\ I i., tt."trlrltrt,
I.
Pf,NDAHIJI,IJAN
l.l
Latar Betakang
S&t ini lahan pertanian di lndoncsia mtuk budidaya tanmrer semakin
t !rytt Hal lesebul dika€nak
oleh b€benpa fattor
rtuEjmrtd
db bsgune jsa.
&
Mtuk Fnndu{nan
didlllfula
Disisi lain.
bmyak yang
lan
di lndonesia dipcrkimrrd ncncapai 3l-4 juta ha. Sekitar 60 %
nwa ymg
(20
jula
ha)
.ld@ya nerupal lanan rawa pdrai atau r.sa p4ang sunrt dan 40 % selctfu?(ll,4 jut ha) adalab lalEn nwa non pabs surur.Il6il suryey talun 1994
Ei{6r&
rEkniikai
!7).
Ela
b:nva, ku6ne dan
50 % yaitu seluN 9 juta ha
ddi lahb rdwa panlai
porensial unruk penscnbonsan pcnanid (suriadikana
Denem denikid
hnd F.nmi&
untuk budiday!
lanmm
db
Suriadi,
b€rpotcnsi di-
te dacnn m"a pdrai tcscbut.
Lana Ewa pant.i densan kondhi li.Bkungb
lds
mlrjinal, densm tins-
tr elini'.s yang linasi. sulir din fm&dr untuk budidala lanaman. Tanaman
-E dea! b.radaplnsi Grhadap laha slin. Pcnsemm ielnik rekdyAa Bene
iE mugkinkd untuk me.gh6ilkln tanmm-hmd ydg toienn te.hadap
trb elh slnneea lanan& daFt bendapksi ierhadap lanan bcrealsi salini1,1\.
tdt i@ dengan hal rescbut naka dibutu*m sudber sumbfl gen adaptif y g
-:
raindapat dipemleh dei mikJoorc isnca.hptildi land salin.
Vir@.guisme mikroorsanisne lerscbur biMya diaeroleh dui lol6i
kondni linekunaan yans besifat salin. spcrti land tamai Mikro
tcscbut biasanyr bouilir kninolilil karem ssara umun potcnsi kc-
=rl-Eis
'.i&! shyawa kitin bmyal ditemdld ddn limbah laut seperti hewm inlel€Er berliulil keEs (C ntz.ea?).
\{adal lai!
dari nikroba ,yatrc bcBilar kirinohik €aebut ldalah sebasai
4Erhli bayni j@ur p€nyebab penyakit pada t md. Dmpal dri selanglD
,- Et dap ldanan ssal bdyat salah satunya adalan produlci dari lanb
F-- alm ncnuu shingga ne.yebrbkd nilai ekonomi d i suaru poduk
ta- EuM. Olch scbab itu dilalukdlah pensendalian lefiadap jmur penyeE po)n.kit pada tanamd secara almi dcngd nelakurd per,rild lananan
..- brdd bhadap jamur, densan bantud cMim kitina$ yang dihasilkan oleh
-.lri t tin.lni[. l]aktr kninolilik u.mDrDrri k.drnpmn drl$r nrsnJe!.a
i-. jr.drn! se irmur ).ra pen\tr{Ln urmrr\r xlalah k rin r)cnlan dcmikiar
:-.:Jri Lrrin.lilil brrtolcnsi icb4ri ttog.rdrli rlrnrijanu pableD b.rditrd Dg
- .rjn r\ddF rltilirxs rc.s.bu. ih dihxrxtlxn d!|rd nrenlhrnrhd ner
--rr!hm drri.rmrr nxbsc p.drturmix.ltu' pxU rkhi.nlr i! urtrr)!.ndr
,\lhi!.khii ini. tnr,/v, [cnhrli nrc'rt i
:-.r
'
l '.'..
nerhd
rn karcl .d.nF
r il,i".'
inio \ete iianlur Pe.S.ndxhrn hlrrrii!nLr
JenSan
kc-
' - 'J.iltl
ordnlgunrlrn rn,knl
',-iLinc lili.blnik !Lid$dltu] p.!r lcnturpuxd drild]ryrri:m! nr.nlhrsilLrn
. :.. tlan/, / j !/i{d,,r. J_rn! &prl ni.lisis s.l ilhr K. ia nuatr hrrrc.
. .:Lrik dai bakrdi ,.r,,",rr rrr,rk ieLrh diluri(rn ritlk nrcn-lcnda lkan
li1.r.r jrinu prolen lnnrnxn Cllur.\!?,?arUrld\..n\ lchh dimJnli.lkan
:
r1.r-rcf.la ilQn irDrtr' nrr,gdn rFn, ,'/.rttr,, r,r\i; (M!nir.1006)
\unrb.r p.nrebarrn drii hrIl.ri r.]ri ilil iDil.rd.prl prd. b.b.r:N 1.m
:i ::fl lril lrldr Lxnrh dro lrrdr dftrah n\r trrlrL. nrJrrrr lxur. pl(lr nerr
.-_:: hrnrn drn rornxt .lnri,r srrudi l!\'ah lunung d suDbur riL p.nrs
r-- \rhr!!i corprl L! r!r! diarlrsro b.rlrrl$\i untuL lumhuhnrr hrLlrri ki
_. rr.h$i k t rolirik il 1cLtrh h.ira[ ditcjni ! tddod.sia. ]!i{u ,lrlx r pc
'-irnli scb.!.ipenlcnar ihrlaliscmn!.n anntr lcrln rp {x.anxd
3r.h!ri hlsil Fnellirn lelrh hxnFl dikdrahu, berhrlr kcorl.r.grn.n
: jf,\i \ncsi.5 rfc\ics brktn Jcngan rlr v r!\ [ilirnnir k nr.si|! D.sin! nr]i
-r-_..- hrhitrt lllrtun l rt|r Mlrt,$lxr bxlto. ilu \.ndiri drfihil Nanrun
--:;: n,{ ,i trr,r}d tads d trjLikxtr ritut nr.nnr-!kx&.0 k.J..DrOL.d akrlllhs
.
: ii b.lLm bii]
lihkr[ r. AprLili upr]a rclnrasa sccda -!...rik sam
.r J:,nib.lLn 6.frrk diftrb iLrsikrn ()leh sch.b t' prdr tuhrr rNr dri kc:.: r-.nrnskrrrn knramttrxn !lliliris kihnolltil. plrlu dlLkukn id.nriliktrsi
. , -.rt Lrl.liil!n! ditld.li
:.idL u trLl drdla .lnn id.'il. kc,.gr.rd !. .rik l!d. \trlu jr.prlxs,
-r: :.!. b.iL lunrbtrhrr. hc$in. nrililbx dxn r.balrirrr (.1.h b.rl..rbdg
r-_:i ri.r ,'\u.lnta dinruhi Inelrlu l*sesi lcrl]irt rx,irsl mvlnlo!. lisiol.
. - :ri bnr[irnii\ . l]ahun ml ini J$!rn Frkemhxogr lrknik amliri\
BAB Y. KESIMPIII,AN
Dlri semqkai&
I
pcnchlian )aDg
rcl$
Ditedeh 8 kolat brrrcri kilrolilil tans
bcrasal ddn dlerrh ra*,x panrai
Bungus PadaD! dar Panrai PNrlaDrbat PrtanS. B$daerkao 8 isotar bakteri
kilitroliril. dipilih J isolar rans mesakili jndek\ kitinotirik rif!ri dx. ind€ks
2
Dlta
l.sil
analisis
nr*akih I
BI^Sl dri 4 isolar batrn
rninotit:k rrpilih
Fis
isolar dcneln i0deks kninolnik
/tzird.cr.A
strain
C
l5 dan
lnrrrj dijdcntifik.sita. sebrexi
Zrrel.1,,./.r sp.t U l t:t90 Jan I hotar yang
to.wikili nrdeks kirnrolnik rcndah diid.nlilikNikan scbagr,.l.r,rord./r/
TK006
165dmt r.roaa0 /rro!,",.LsrahWAB
llerdaselan hasil
v
sp
1906
s dldapatkd da.i dnallsjs BLASt. tul. z.ienis brkrcri
)ans berh.slldiidc lilikasika0 sa.tar ke ievcl spc\icsny. rairu
ri,r?/,rd./..
,?/racr.J stnin W]\a 1906 daD &i.tl6 (.,?,r {nnr CAt5, dd I jcDG
b.llcn laAiberhasldiidcndlilrsl(0silansa.U! kclc!.1 Cjcfusntasxrx!!ilu
,.ircr,6d.?.rf
l KOir6 l6S dan
Fnlr.hadet {;lUt:Ltgt)
5,2sann
lJnluk mendapdlkm iotumusi idcnrilxs dan tct.abara. gcncrik surru
orgmhn.
llng
lebih.kurar.
frrk! dalur
xnrtisis ltLr\ST dan anxtisis
kek.rabab gcnehk disiranlan ,hcnssunalitu cnrq data sekucns yang Lchih
d.Fr
:nloml\i lang tchjh lkumt dan Gpat. llat irj
dxrd dilakukan dengan mcnleuul,n dua pdncr sekaliers datanr pmscs
paojafe. schirger
diperoteh
selucnsing secara dui &ah
(ril,?4rrr,
lcbi| Fnjxns dan infom.si id.nftas
schingSi dat. sckuens
sualu
!an! dihrsjtkan
rrsrnijne ymg dilapat(m
tcbjh
T}AFT,TR PTISTAKA
Agrnvib!$L Nl 1004 D€leksi dan A.alsis Sckuens Cen l ribiror Prorci.asc
pdr Bebenpa Klon Klkro lla.apan lahan leng8erck llual Kalao dari
suli\r.si ScLrlan. Fakulras
Perkebu ai.7l(l). l- 10
r\Li.
I
2008 P.numbuhan
Biklei
Per'1.nl0n
daD
n
ddr K.hurturd Bolor
Mrnara
ru. hnp:/A$*!.iqtiaLaLi..on lliJ
l,linr
2010
Alh:tr M 2000. Didco!-S.n!er. Snrtu M.toda l,cmmutui ljruhn \ukleotidr
D\^ J laksath ? ll) 63-81)
lliirl.
1
100.1. M.rloLo-{i
h!!:l**w
llallcLi pada lrlcksi Srlurxn Kcnrib dln K.lanrin
lib.tur.dsr.ac.id
ll
ltlci
20101
B.xro H.rvh l. LB.. S.A. DanichcD. drd SA NicrsickiBlucr. 199:.
Delelonme.r .l x rrtid olcrhod Jnr derecting br4e.i!l celG nr rr, uslng
Ii-_\\
.
JjiJt
P l '.1'_ ir:84ii
( lLISTALW I 31 2009 hro:/1r\rvry(i.ocbcc nr!,.lrchNrlr.lvanc.d.hhl
120
IDKPI Depdlenrdr Kelnurrn dan reri[rnrn Rcpublik lftoNsia ]00:l
Pcrlcmbarg.n ckspor komoditi h.sil p*ikadan lndrn.\ir 19981001.
hno NrN r.sNccs ur!&.c.1! lTluni 20091
laui. S. 100!. |.kl.rfaklor !rr!
McmDc
laruhi Prflumhuhln
hro//rv$a.c[ nrlsaurus.bLo$oor .oiii l0 Mrftr.
Uakrcri.
]0101
200.1. hol.si dx ldulilikxsi R*l€n P(biotik d0i
(Fphin.d.]u\
lku Kcnru Mr[n
Jn{osatus) dalam Llpara litisicnsi
P.kan lliu JunrlNrrurl.do.esia6lz) 75 80.
lirLiatd ll I dln Str.taii tr
|enrah- RS lan PuNa.rnlri. s 2008 KrrakrerisNi Silitl Biollnri. llasil
l,cn.Fisan holal BaLrcri Kitlnolirik hlrpl $r1.sv.ir79.i1cs."tdprcs conl
llidxlar. l.2005 lrcn-laillr
sp .4R
pIIlerh .p Akriyil.s l:h.I. I I
h
(;!tu.
tsl RdLrlh^
1)09 6(.1)i1.1,1-1,16.
Hid.Jat. P. Dc{i S.. Sri ll.100.1. K.iid Ciri NtrbLogi dm N1l)lclulcr
Kurukebul (H.nrottcm : L.yrodida.) S€b4di Drsar PcngcndaLian
Penlxkll Cenrinivnus nxJr ra.rman Sar-urrn Jumal Lenrbasa lenelirlan
du Pcrgibdi.n Kcpdn Mdyarlkat. lirslitu Pcfxniar
htrr:l$rr *cb
ipb.&j!L[27 Ollobe. ]0091
Boeor
PAmAI PADAf\IC BERDASARKAN ANALISIS SEKUENS
GEN 16S-rRNA
CUT ANDESTI
SKRIPSI
Sebr€.i
Srl,l
Sydt Ulttr&
Strjtu Pedrln!
S!t'n
M€oD€rc|.t C.ltr
JURUSAII BI]DIDAYA PERTANIAN
FAKI'LTAS PERTANIAN
I,INIVERSITAS AI'DAIIS
PADANG
20r0
IDE\TIFIKASI RAKTIRI KITINOLI'I'IK DI DAERAH RAWA
P1\ fAI PADAN(; Bf,RD,,\S,4RKAN A\ALISIS SEKTJIi\S
(;llN
165 rRNA
\BS I RAK
_
:':i.lrirtr Ji!r jknr ' l(l.nririkrsi ll.lr.n Ki{nxniliL {l Dxernh ttr$x
, i,rJrns lr.dr\rr[in triLiris Sc(Rns (;rn ]rS rR\1 . r. ih dit utu di
l,aLm Bi.i.krologl d I).nitrlirao lxnlmrD.urrin lludidrrx Pcnanirn
. P.drnid I ri\c6n.s AndaL\ PaJxn| drri bulan l).sc nir. t0t9 srnrnai
j :1110 l.tr.lili! ini hurujuln unLlll mcndrNrt]n t.te[\i nnrts sotar
.::_ ..ri drrn,fu.\ri rlh\rr,\ ll r.lilik varg br sll dari a\x I'n.t.l PrJ.o.!
r' :r.nrulrn denihs sp.sics brklfi lilinolilik rertiih nr.ilgrDxlm dd!
-r
,.
biltrl dilrl.lsi dri du l.Lrir 1r n' mui Prnil rl, nq ! ,ri n ri\r
:-_ r1
. Jxdib|l l,xdlng DN.1 lrDomil dii\nx\r dcrgrD n'oscdrr
i_::ari orr(,dr llll Ne\nran ,\'ntlfikasi r' rnro mcnlruDrlln hfnibiJusi
l.rl i5 AC^Cl llL\lCNll(i(i(Ta,\G r') d.n lililt 1j'
!rnlla,\'L((]\Rcc l I s.ltrr jjoq dilxkuld rcc.ft ,,r /il.rr,r
jri.rn l,'i,r.r l5l5lt l!nrt jr! dlsetucDs xdxl:Llj .mrur iso]ll hrhr.ri
\ r4rilih du! nr al {Uanrrnntr nicNrlili nrdckl L n.lril ritrg!i J:!r
: trr ntnlLjiL i'rlcks kiliFlirlI nnJlh P.ocnnrn] nltarna\ hNLFn
Pr!
J.nlrn D.ngik{s Llxrxlre prblik Nanl Drcf!!u.ka. rnllisil
dengd Dt !!rn rn rn)!flnl
.: -:P:o.ruf lrdi t.l.r$x[tri dild k
nd.liliJn hc.lusil nrcrnp.rol.h l.Lorn inrl!l brlrer tin! b.idr si
. _ :."::LJrn Jur loL6l p.ngrnbiL :!hl[l l)rh h.sil .n.lisis BLAS drn .l
kilinflnlI rc'nilh orrnunrul[]n lconrpok: /r r/nhr.r., \t
' : _1ni
: - ..,t.t olr( tu aurs t: :ttin \\JAll ttr1r6.,nn,rd!r, ip l K00r drn
: - , ..a1a i i ( Al5 llrlreri )rnA bc[orcDsi LiriJriliril r.no!!i l)adr
::_::_::i \tlao 10 hrri rdrrh rrrtl/ra..??L\ {rurn a^lj n.rd$l[ai
'- . . i..L3tuhxr1n t.r.r( hr[rr] kiriiltiliL dcntxn m$!-rundd ptu!.xni
. il \\ \e$i I 3 lr.bcd(ul ri.!r tcl()mtol hesrrllJ^ dcmi.d k.ridll\mim
rrl
tr
\r-r,l k., /4\,f\ I i., tt."trlrltrt,
I.
Pf,NDAHIJI,IJAN
l.l
Latar Betakang
S&t ini lahan pertanian di lndoncsia mtuk budidaya tanmrer semakin
t !rytt Hal lesebul dika€nak
oleh b€benpa fattor
rtuEjmrtd
db bsgune jsa.
&
Mtuk Fnndu{nan
didlllfula
Disisi lain.
bmyak yang
lan
di lndonesia dipcrkimrrd ncncapai 3l-4 juta ha. Sekitar 60 %
nwa ymg
(20
jula
ha)
.ld@ya nerupal lanan rawa pdrai atau r.sa p4ang sunrt dan 40 % selctfu?(ll,4 jut ha) adalab lalEn nwa non pabs surur.Il6il suryey talun 1994
Ei{6r&
rEkniikai
!7).
Ela
b:nva, ku6ne dan
50 % yaitu seluN 9 juta ha
ddi lahb rdwa panlai
porensial unruk penscnbonsan pcnanid (suriadikana
Denem denikid
hnd F.nmi&
untuk budiday!
lanmm
db
Suriadi,
b€rpotcnsi di-
te dacnn m"a pdrai tcscbut.
Lana Ewa pant.i densan kondhi li.Bkungb
lds
mlrjinal, densm tins-
tr elini'.s yang linasi. sulir din fm&dr untuk budidala lanaman. Tanaman
-E dea! b.radaplnsi Grhadap laha slin. Pcnsemm ielnik rekdyAa Bene
iE mugkinkd untuk me.gh6ilkln tanmm-hmd ydg toienn te.hadap
trb elh slnneea lanan& daFt bendapksi ierhadap lanan bcrealsi salini1,1\.
tdt i@ dengan hal rescbut naka dibutu*m sudber sumbfl gen adaptif y g
-:
raindapat dipemleh dei mikJoorc isnca.hptildi land salin.
Vir@.guisme mikroorsanisne lerscbur biMya diaeroleh dui lol6i
kondni linekunaan yans besifat salin. spcrti land tamai Mikro
tcscbut biasanyr bouilir kninolilil karem ssara umun potcnsi kc-
=rl-Eis
'.i&! shyawa kitin bmyal ditemdld ddn limbah laut seperti hewm inlel€Er berliulil keEs (C ntz.ea?).
\{adal lai!
dari nikroba ,yatrc bcBilar kirinohik €aebut ldalah sebasai
4Erhli bayni j@ur p€nyebab penyakit pada t md. Dmpal dri selanglD
,- Et dap ldanan ssal bdyat salah satunya adalan produlci dari lanb
F-- alm ncnuu shingga ne.yebrbkd nilai ekonomi d i suaru poduk
ta- EuM. Olch scbab itu dilalukdlah pensendalian lefiadap jmur penyeE po)n.kit pada tanamd secara almi dcngd nelakurd per,rild lananan
..- brdd bhadap jamur, densan bantud cMim kitina$ yang dihasilkan oleh
-.lri t tin.lni[. l]aktr kninolilik u.mDrDrri k.drnpmn drl$r nrsnJe!.a
i-. jr.drn! se irmur ).ra pen\tr{Ln urmrr\r xlalah k rin r)cnlan dcmikiar
:-.:Jri Lrrin.lilil brrtolcnsi icb4ri ttog.rdrli rlrnrijanu pableD b.rditrd Dg
- .rjn r\ddF rltilirxs rc.s.bu. ih dihxrxtlxn d!|rd nrenlhrnrhd ner
--rr!hm drri.rmrr nxbsc p.drturmix.ltu' pxU rkhi.nlr i! urtrr)!.ndr
,\lhi!.khii ini. tnr,/v, [cnhrli nrc'rt i
:-.r
'
l '.'..
nerhd
rn karcl .d.nF
r il,i".'
inio \ete iianlur Pe.S.ndxhrn hlrrrii!nLr
JenSan
kc-
' - 'J.iltl
ordnlgunrlrn rn,knl
',-iLinc lili.blnik !Lid$dltu] p.!r lcnturpuxd drild]ryrri:m! nr.nlhrsilLrn
. :.. tlan/, / j !/i{d,,r. J_rn! &prl ni.lisis s.l ilhr K. ia nuatr hrrrc.
. .:Lrik dai bakrdi ,.r,,",rr rrr,rk ieLrh diluri(rn ritlk nrcn-lcnda lkan
li1.r.r jrinu prolen lnnrnxn Cllur.\!?,?arUrld\..n\ lchh dimJnli.lkan
:
r1.r-rcf.la ilQn irDrtr' nrr,gdn rFn, ,'/.rttr,, r,r\i; (M!nir.1006)
\unrb.r p.nrebarrn drii hrIl.ri r.]ri ilil iDil.rd.prl prd. b.b.r:N 1.m
:i ::fl lril lrldr Lxnrh dro lrrdr dftrah n\r trrlrL. nrJrrrr lxur. pl(lr nerr
.-_:: hrnrn drn rornxt .lnri,r srrudi l!\'ah lunung d suDbur riL p.nrs
r-- \rhr!!i corprl L! r!r! diarlrsro b.rlrrl$\i untuL lumhuhnrr hrLlrri ki
_. rr.h$i k t rolirik il 1cLtrh h.ira[ ditcjni ! tddod.sia. ]!i{u ,lrlx r pc
'-irnli scb.!.ipenlcnar ihrlaliscmn!.n anntr lcrln rp {x.anxd
3r.h!ri hlsil Fnellirn lelrh hxnFl dikdrahu, berhrlr kcorl.r.grn.n
: jf,\i \ncsi.5 rfc\ics brktn Jcngan rlr v r!\ [ilirnnir k nr.si|! D.sin! nr]i
-r-_..- hrhitrt lllrtun l rt|r Mlrt,$lxr bxlto. ilu \.ndiri drfihil Nanrun
--:;: n,{ ,i trr,r}d tads d trjLikxtr ritut nr.nnr-!kx&.0 k.J..DrOL.d akrlllhs
.
: ii b.lLm bii]
lihkr[ r. AprLili upr]a rclnrasa sccda -!...rik sam
.r J:,nib.lLn 6.frrk diftrb iLrsikrn ()leh sch.b t' prdr tuhrr rNr dri kc:.: r-.nrnskrrrn knramttrxn !lliliris kihnolltil. plrlu dlLkukn id.nriliktrsi
. , -.rt Lrl.liil!n! ditld.li
:.idL u trLl drdla .lnn id.'il. kc,.gr.rd !. .rik l!d. \trlu jr.prlxs,
-r: :.!. b.iL lunrbtrhrr. hc$in. nrililbx dxn r.balrirrr (.1.h b.rl..rbdg
r-_:i ri.r ,'\u.lnta dinruhi Inelrlu l*sesi lcrl]irt rx,irsl mvlnlo!. lisiol.
. - :ri bnr[irnii\ . l]ahun ml ini J$!rn Frkemhxogr lrknik amliri\
BAB Y. KESIMPIII,AN
Dlri semqkai&
I
pcnchlian )aDg
rcl$
Ditedeh 8 kolat brrrcri kilrolilil tans
bcrasal ddn dlerrh ra*,x panrai
Bungus PadaD! dar Panrai PNrlaDrbat PrtanS. B$daerkao 8 isotar bakteri
kilitroliril. dipilih J isolar rans mesakili jndek\ kitinotirik rif!ri dx. ind€ks
2
Dlta
l.sil
analisis
nr*akih I
BI^Sl dri 4 isolar batrn
rninotit:k rrpilih
Fis
isolar dcneln i0deks kninolnik
/tzird.cr.A
strain
C
l5 dan
lnrrrj dijdcntifik.sita. sebrexi
Zrrel.1,,./.r sp.t U l t:t90 Jan I hotar yang
to.wikili nrdeks kirnrolnik rcndah diid.nlilikNikan scbagr,.l.r,rord./r/
TK006
165dmt r.roaa0 /rro!,",.LsrahWAB
llerdaselan hasil
v
sp
1906
s dldapatkd da.i dnallsjs BLASt. tul. z.ienis brkrcri
)ans berh.slldiidc lilikasika0 sa.tar ke ievcl spc\icsny. rairu
ri,r?/,rd./..
,?/racr.J stnin W]\a 1906 daD &i.tl6 (.,?,r {nnr CAt5, dd I jcDG
b.llcn laAiberhasldiidcndlilrsl(0silansa.U! kclc!.1 Cjcfusntasxrx!!ilu
,.ircr,6d.?.rf
l KOir6 l6S dan
Fnlr.hadet {;lUt:Ltgt)
5,2sann
lJnluk mendapdlkm iotumusi idcnrilxs dan tct.abara. gcncrik surru
orgmhn.
llng
lebih.kurar.
frrk! dalur
xnrtisis ltLr\ST dan anxtisis
kek.rabab gcnehk disiranlan ,hcnssunalitu cnrq data sekucns yang Lchih
d.Fr
:nloml\i lang tchjh lkumt dan Gpat. llat irj
dxrd dilakukan dengan mcnleuul,n dua pdncr sekaliers datanr pmscs
paojafe. schirger
diperoteh
selucnsing secara dui &ah
(ril,?4rrr,
lcbi| Fnjxns dan infom.si id.nftas
schingSi dat. sckuens
sualu
!an! dihrsjtkan
rrsrnijne ymg dilapat(m
tcbjh
T}AFT,TR PTISTAKA
Agrnvib!$L Nl 1004 D€leksi dan A.alsis Sckuens Cen l ribiror Prorci.asc
pdr Bebenpa Klon Klkro lla.apan lahan leng8erck llual Kalao dari
suli\r.si ScLrlan. Fakulras
Perkebu ai.7l(l). l- 10
r\Li.
I
2008 P.numbuhan
Biklei
Per'1.nl0n
daD
n
ddr K.hurturd Bolor
Mrnara
ru. hnp:/A$*!.iqtiaLaLi..on lliJ
l,linr
2010
Alh:tr M 2000. Didco!-S.n!er. Snrtu M.toda l,cmmutui ljruhn \ukleotidr
D\^ J laksath ? ll) 63-81)
lliirl.
1
100.1. M.rloLo-{i
h!!:l**w
llallcLi pada lrlcksi Srlurxn Kcnrib dln K.lanrin
lib.tur.dsr.ac.id
ll
ltlci
20101
B.xro H.rvh l. LB.. S.A. DanichcD. drd SA NicrsickiBlucr. 199:.
Delelonme.r .l x rrtid olcrhod Jnr derecting br4e.i!l celG nr rr, uslng
Ii-_\\
.
JjiJt
P l '.1'_ ir:84ii
( lLISTALW I 31 2009 hro:/1r\rvry(i.ocbcc nr!,.lrchNrlr.lvanc.d.hhl
120
IDKPI Depdlenrdr Kelnurrn dan reri[rnrn Rcpublik lftoNsia ]00:l
Pcrlcmbarg.n ckspor komoditi h.sil p*ikadan lndrn.\ir 19981001.
hno NrN r.sNccs ur!&.c.1! lTluni 20091
laui. S. 100!. |.kl.rfaklor !rr!
McmDc
laruhi Prflumhuhln
hro//rv$a.c[ nrlsaurus.bLo$oor .oiii l0 Mrftr.
Uakrcri.
]0101
200.1. hol.si dx ldulilikxsi R*l€n P(biotik d0i
(Fphin.d.]u\
lku Kcnru Mr[n
Jn{osatus) dalam Llpara litisicnsi
P.kan lliu JunrlNrrurl.do.esia6lz) 75 80.
lirLiatd ll I dln Str.taii tr
|enrah- RS lan PuNa.rnlri. s 2008 KrrakrerisNi Silitl Biollnri. llasil
l,cn.Fisan holal BaLrcri Kitlnolirik hlrpl $r1.sv.ir79.i1cs."tdprcs conl
llidxlar. l.2005 lrcn-laillr
sp .4R
pIIlerh .p Akriyil.s l:h.I. I I
h
(;!tu.
tsl RdLrlh^
1)09 6(.1)i1.1,1-1,16.
Hid.Jat. P. Dc{i S.. Sri ll.100.1. K.iid Ciri NtrbLogi dm N1l)lclulcr
Kurukebul (H.nrottcm : L.yrodida.) S€b4di Drsar PcngcndaLian
Penlxkll Cenrinivnus nxJr ra.rman Sar-urrn Jumal Lenrbasa lenelirlan
du Pcrgibdi.n Kcpdn Mdyarlkat. lirslitu Pcfxniar
htrr:l$rr *cb
ipb.&j!L[27 Ollobe. ]0091
Boeor