Diferensiasi DNA Mitokondria Lebah Madu Apis cerana di Jawa, Lombok, Sumbawa dan Flores
DIFERENSIASI DNA MITOKONDRIA LEBAH MADU Apis cerana DI JAWA,
LOMBOK, SUMBAWA DAN FLORES
Rika Raffiudin, Islamul Hadi1)
Staf Pengajar Dep. Biologi Fakultas Matematika dan IPA IPB
1)
Abstrak
Indonesia memiliki biodiversitas spesies lebah madu tertinggi, lima dari sembilan spesies
lebah di dunia, termasuk lebah Apis Cerana. Namun disayangkan belum ada data
distribusi dan genetik lebah A. Cerana di Indonesia. Tujuan penelitian adalah
mengeksplorasi distribusi peternak lebah A. cerana di Jawa, Lombok, Sumbawa dan
Flores dan mempelajari diferensiasi DNA mitokondria lebah dengan menggunakan
penanda genetik daerah intergenik coxI_II dan gen ribosom besar (IrRNA). Penelitian
menggunakan analisis: (1) keragaman genetik, (2) gen penenda, (3) metode sekuen
nukleotida, (4) statistik nukleotida dan (5) homologi nukleotida. Di Jawa berhasil
dikoleksi 113 koloni A. cerana. Daerah intergenik coxI_II/DraI yang dianalisis
menghasilkan tujuh haplotipe yaitu haplotipe A, B, C, D, E, F dan G. Haplotipe A dari
gen coxI_II/DraI merupakan haplotipe umum di Jawa dan Lombok, dengan prosentase
28 % di Jawa dan 15% di Lombok. Haplotipe D prosentase tinggi di Jawa (timur) sebesar
31,77%, sedang di Lombok (4,95%) dan sumbawa (0,9%). Haplotipe F ditemukan di
Sumbawa dengan prosentase rendah (0,93%). Haplotipe G dengan presentase sedang di
Sumbawa dan Flores masing-masing 2,8% dan 3,73%. Daerah gen IrRNA yang dipotong
dengan DraI menghasilkan haplotipe A dan B di Jawa. Haplotipe C ditemukan di
Lombok, Sumbawa dan Flores. Haplotipe A dari gen IrRNA/DraI merupakan haplotipe
umum di seluruh daerah koleksi di Jawa, Lombok, Sumbawa dan Flores. Haplotipe A gen
IrRNA/DraI merupakan haplotipe dominan (90,29%) pada populasi A. cerana di ketiga
lokasi. Keragaman genetik lebah A. cerana sangat tinggi di Jawa, Lombok, Sumbawa dan
Flores dan terdapat haplotipe-haplotipe yang khas dari beberapa pulau yang dapat menjadi
penanda atau marker dari tiap subpopulasi di pulau-pulau.
Kata kunci: diferensiasi DNA, koloni, haplotipe, gen, lebah madu
LOMBOK, SUMBAWA DAN FLORES
Rika Raffiudin, Islamul Hadi1)
Staf Pengajar Dep. Biologi Fakultas Matematika dan IPA IPB
1)
Abstrak
Indonesia memiliki biodiversitas spesies lebah madu tertinggi, lima dari sembilan spesies
lebah di dunia, termasuk lebah Apis Cerana. Namun disayangkan belum ada data
distribusi dan genetik lebah A. Cerana di Indonesia. Tujuan penelitian adalah
mengeksplorasi distribusi peternak lebah A. cerana di Jawa, Lombok, Sumbawa dan
Flores dan mempelajari diferensiasi DNA mitokondria lebah dengan menggunakan
penanda genetik daerah intergenik coxI_II dan gen ribosom besar (IrRNA). Penelitian
menggunakan analisis: (1) keragaman genetik, (2) gen penenda, (3) metode sekuen
nukleotida, (4) statistik nukleotida dan (5) homologi nukleotida. Di Jawa berhasil
dikoleksi 113 koloni A. cerana. Daerah intergenik coxI_II/DraI yang dianalisis
menghasilkan tujuh haplotipe yaitu haplotipe A, B, C, D, E, F dan G. Haplotipe A dari
gen coxI_II/DraI merupakan haplotipe umum di Jawa dan Lombok, dengan prosentase
28 % di Jawa dan 15% di Lombok. Haplotipe D prosentase tinggi di Jawa (timur) sebesar
31,77%, sedang di Lombok (4,95%) dan sumbawa (0,9%). Haplotipe F ditemukan di
Sumbawa dengan prosentase rendah (0,93%). Haplotipe G dengan presentase sedang di
Sumbawa dan Flores masing-masing 2,8% dan 3,73%. Daerah gen IrRNA yang dipotong
dengan DraI menghasilkan haplotipe A dan B di Jawa. Haplotipe C ditemukan di
Lombok, Sumbawa dan Flores. Haplotipe A dari gen IrRNA/DraI merupakan haplotipe
umum di seluruh daerah koleksi di Jawa, Lombok, Sumbawa dan Flores. Haplotipe A gen
IrRNA/DraI merupakan haplotipe dominan (90,29%) pada populasi A. cerana di ketiga
lokasi. Keragaman genetik lebah A. cerana sangat tinggi di Jawa, Lombok, Sumbawa dan
Flores dan terdapat haplotipe-haplotipe yang khas dari beberapa pulau yang dapat menjadi
penanda atau marker dari tiap subpopulasi di pulau-pulau.
Kata kunci: diferensiasi DNA, koloni, haplotipe, gen, lebah madu