Analisis Kromosom pada Anggrek Alam Jawa Timur (Paphiopedilum glaucophyllum, Coelogyne speciosa dan Dendrobium crumenatum).

SKRIPSI

ANALISIS KROMOSOM PADA ANGGREK ALAM JAWA TIMUR
(Paphiopedilum glaucophyllum, Coelogyne speciosa dan
Dendrobium crumenatum)

Oleh :
INDAH DEWI M.J
H 0709056

PROGRAM STUDI AGROTEKNOLOGI
FAKULTAS PERTANIAN UNIVERSITAS SEBELAS MARET
SURAKARTA
2016

i

ANALISIS KROMOSOM PADA ANGGREK ALAM JAWA TIMUR
(Paphiopedilum glaucophyllum, Coelogyne speciosa dan
Dendrobium crumenatum)


SKRIPSI

untuk memenuhi sebagian persyaratan guna
memperoleh (derajat) Sarjana Pertanian di
Fakultas Pertanian Universitas Sebelas Maret
Surakarta

Oleh :
Indah Dewi M.J
H0709056

PROGRAM STUDI AGROTEKNOLOGI
FAKULTAS PERTANIAN UNIVERSITAS SEBELAS MARET
SURAKARTA
2016
ii

SKRIPSI

ANALISIS KROMOSOM PADA ANGGREK ALAM JAWA TIMUR

(Paphiopedilum glaucophyllum, Coelogyne speciosa dan
Dendrobium crumenatum)

Indah Dewi M.J
H0709056

Pembimbing Utama

Pembimbing Pendamping

Dr. Ir. Sri Hartati, M.P
NIP. 195705201980032002

Dra. Linayanti Darsana, M.Si
NIP. 195207111980032001

Surakarta,

2016


Universitas Sebelas Maret Surakarta
Fakultas Pertanian
Dekan

Prof. Dr. Ir. Bambang Pudjiasmanto, M.S
NIP. 195602251986011001

iii

SKRIPSI

ANALISIS KROMOSOM PADA ANGGREK ALAM JAWA TIMUR
(Paphiopedilum glaucophyllum, Coelogyne speciosa dan
Dendrobium crumenatum)

yang dipersiapkan dan disusun oleh
Indah Dewi M.J
H0709056

telah dipertahankan di depan Tim Penguji

pada tanggal:

2016

dan dinyatakan telah memenuhi syarat untuk
memperoleh gelar (derajat) Sarjana Pertanian
Program Studi Agroteknologi

Susunan Tim Penguji :

Ketua

Anggota I

Anggota II

Dr. Ir. Sri Hartati, M.P
Dra. Linayanti Darsana, M.Si
Dr. Ir. Parjanto M.P
NIP. 195705201980032002 NIP. 195207111980032001

NIP.196203231988031001

iv

PERNYATAAN
Dengan ini saya Nama: Indah Dewi M.J, NIM: H0709056, Program Studi
Agroteknologi, menyatakan bahwa dalam skripsi saya yang berjudul “ANALISIS
KROMOSOM PADA ANGGREK ALAM JAWA TIMUR (Paphiopedilum
glaucophyllum, Coelogyne speciosa dan Dendrobium crumenatum)” ini tidak

terdapat karya yang pernah diajukan untuk memperoleh gelar akademik dan
sepanjang pengetahuan penulis juga tidak ada unsur plagiarisme, fabrikasi karya,
data atau pendapat yang pernah ditulis dan dipublikasikan oleh penulis lain
kecuali yang secara tertulis diacu dalam naskah ini dan disebutkan dalam daftar
pustaka.

Surakarta,

2016


Yang menyatakan

Indah Dewi M.J
H0709056

v

KATA PENGANTAR

Segala Puji bagi Allah SWT atas segala limpahan rahmat-Nya kepada
penulis sehingga penyusunan skripsi ini dapat terselasaikan dengan baik tanpa
halangan yang berarti. Penulis sadari bahwa dalam penyusunan skripsi ini tidak
terlepas dari bantuan berbagai pihak. Oleh karena itu penulis sampaikan
terimakasih kepada:
1. Prof. Dr. Ir. Bambang Pudjiasmanto, MS selaku Dekan Fakultas Pertanian
Universitas Sebelas Maret Surakarta
2. Prof. Dr. Ir. Hadiwiyono, M.Si selaku Ketua Program Studi Agroteknologi
Fakultas Pertanian Universitas Sebelas Maret Surakarta.
3. Dr. Ir. Sri Hartati, MP selaku Pembimbing Utama yang dengan sabar
memberikan saran, pengarahan, bimbingan dan bantuan biaya penelitian

kepada penulis sehingga skripsi ini dapat diselesaikan.
4. Dra. Linayanti Darsana, M.Si selaku Pembimbing Pendamping yang telah
memberikan pengarahan, bimbingan dan motivasi sehingga skripsi ini dapat
diselesaikan
5. Dr. Ir. Parjanto MP selaku Dosen Pembahas yang telah memberikan masukan
dan saran pada skripsi ini.
6. Prof. Dr. Ir Sulandjari, MS selaku Pembimbing Akademik yang telah
memberikan bimbingan dan pengarahan akademik.
7. Keluarga tercinta, Bapak Subiyanto S.Pd, Ibu Nurul Hidayah, Kakak Novi
Farida Nurjannah S.Pd M.Pd, Adik Rizky Setyo Nurahmadi atas doa dan
dukungannya baik yang bersifat moril maupun materil.
8. Teman-teman Agroteknologi 2009 yang telah membantu dan mendukung
penulis selama penelitian dan penyusunan skripsi.
9. Semua pihak yang telah membantu dan mendukung penulis selama penelitian
dan penyusunan skripsi
Penulis menyadari bahwa dalam penulisan skripsi ini masih jauh dari
sempurna, oleh karena itu kritik dan saran yang bersifat membangun sangat
diharapkan

vi


Akhir

kata,

semoga

skripsi

ini

dapat

bermanfaat

bagi

yang

berkepentingan dan pembaca pada umumnya.


Surakarta,

2016

Penulis

vii

DAFTAR ISI

Halaman
KATA PENGANTAR .....................................................................................

vi

DAFTAR ISI ....................................................................................................

viii


DAFTAR TABEL ............................................................................................

x

DAFTAR GAMBAR .......................................................................................

xi

DAFTAR LAMPIRAN ...................................................................................

xii

RINGKASAN .................................................................................................

xiii

SUMMARY.......................................................................................................

xiv


I. PENDAHULUAN ....................................................................................

1

A. Latar Belakang ....................................................................................

1

B. Rumusan Penelitian .............................................................................

2

C. Tujuan Penelitian ................................................................................

3

D. Hipotesis Penelitian .............................................................................

3

II. TINJAUAN PUSTAKA ............................................................................

4

A. Klasifikasi Anggrek ............................................................................

4

B. Kromosom ...........................................................................................

7

C. Kariotipe ..............................................................................................

12

III. METODE PENELITIAN ...........................................................................

14

A. Waktu dan Tempat Penelitian .............................................................

14

B. Bahan dan Alat ....................................................................................

14

C. Cara Kerja Penelitian ..........................................................................

14

D. Variable pengamatan ..........................................................................

15

E. Analisis Data ......................................................................................

16

IV. HASIL DAN PEMBAHASAN ................................................................

18

A. Jumlah Kromosom ...............................................................................

18

B. Ukuran Kromosom ...............................................................................

21

C. Bentuk Kromosom ...............................................................................

22

D. Kariotipe Kromosom ...........................................................................

23

viii

DAFTAR ISI
(Lanjutan)

V. KESIMPULAN DAN SARAN ..................................................................

27

A. Kesimpulan .........................................................................................

27

B. Saran .....................................................................................................

27

DAFTAR PUSTAKA ....................................................................................

28

LAMPIRAN ...................................................................................................

31

ix

DAFTAR TABEL

Nomor

Dalam Teks

Halaman

1

Bentuk Kromosom Berdasarkan Rasio Lengan Kromosom ............... .

15

2

Jumlah Kromosom Anggrek Alam Jawa Timur ................................ .

18

3

Ringkasan Kisaran Panjang Total Kromosom Anggrek Alam Jawa Timur
(Paphiopedilum glaucophyllum, Coelogyne speciosa dan Dendrobium
crumenatum)………………………………………. …………………

4

21

Bentuk Kromosom dan Pola kariotipe Anggrek Alam Jawa Timur
(Paphiopedilum

glaucophyllum,

Coelogyne

speciosa

dan

Dendrobium crumenatum). ..................................................................

5

23

Nilai Indeks Asimetri Intrakromosomal (A1) dan Indeks Asimetri
Interkromosomal (A2) Anggrek Alam Jawa Timur (Paphiopedilum
glaucophyllum,

Coelogyne

speciosa

dan

Dendrobium

crumenatum)………………………………………………………….

26

Dalam Lampiran
1

Ukuran dan Bentuk Kromosom Anggrek Paphiopedilum glaucophyllum
............................................................................................ ..................

32

2

Ukuran dan Bentuk Kromosom Anggrek Coelogyne speciosa ............

33

3

Ukuran dan Bentuk Anggrek Dendrobium crumenatum .....................

34

x

DAFTAR GAMBAR

Nomor

Dalam Teks

Halaman

1

Anggrek Paphiodilum glaucophyllum .................................................

5

2

Anggrek Coelogyne speciosa ...............................................................

6

3

Anggrek Dendrobium crumenatum .....................................................

7

4

Kromosom Anggrek Paphiodilum glaucophyllum ..............................

19

5

Kromosom Anggrek Coelogyne speciosa ............................................

19

6

Kromosom Anggrek Dendrobium crumenatum...................................

20

7

Kariogram Paphiodilum glaucophyllum ..............................................

24

8

Kariogram Coelogyne speciosa ............................................................

24

9

Kariogram Dendrobium crumenatum ..................................................

25

10

Idiogram Paphiodilum glaucophyllum .................................................

25

11

Idiogram Coelogyne speciosa ..............................................................

25

12

Idiogram Dendrobium crumenatum .....................................................

26

Dalam Lampiran
1

Pemotongan akar .................................................................................

35

2

Ujung Akar Paphiopedilum glaucophyllum.........................................

35

3

Ujung Akar Coelogyne speciosa ..........................................................

36

4

Ujung Akar Dendrobium crumenatum.................................................

36

xi

DAFTAR LAMPIRAN

Nomor
1

Judul

Halaman

Tabel1. Ukuran dan Bentuk Kromosom Anggrek Paphiopedilum
glaucophyllum ......................................................................................

2

32

Tabel 2. Ukuran dan Bentuk Kromosom Anggrek Coelogyne speciosa
..............................................................................................................

33

3

Tabel 3. Ukuran dan Bentuk Anggrek Dendrobium crumenatum .......

34

4

Gambar 1. Pemotongan akar ...............................................................

35

5

Gambar 2. Ujung Akar Paphiopedilum glaucophyllum .......................

35

6

Gambar 3. Ujung Akar Coelogyne speciosa ........................................

36

7

Gambar 4. Ujung Akar Dendrobium crumenatum ..............................

36

xii

RINGKASAN

ANALISIS KROMOSOM PADA ANGGREK ALAM JAWA TIMUR
(Paphiopedilum glaucophyllum, Coelogyne speciosa dan Dendrobium
crumenatum).Skripsi : Indah Dewi M.J (H0709056). Pembimbing Sri Hartati,
Linayanti Darsana, Parjanto. Program Studi: Agroteknologi, Fakultas Pertanian
Universitas Sebelas Maret (UNS) Surakarta.
Anggrek Alam yang ada di Jawa Timur populasinya sangat beragam,
namun jumlahnya di habitat asli sangat terbatas. Pemuliaan tanaman dapat
digunakan untuk melestarikan dan membudidayakan tanaman anggrek. Salah satu
faktor yang mendukung keberhasilan pemuliaan tanaman dengan mengetahui
informasi genetik. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui informasi genetik
berupa jumlah, bentuk, ukuran, dan kariotipe kromosom. Diharapkan dengan
adanya informasi genetik tersebut dapat digunakan sebagai dasar dalam pemuliaan
tanaman untuk mendapatkan varietas unggul dan perbaikan sifat tanaman.
Penelitian ini dilaksanakan pada bulan Oktober 2015 - Februari 2016 di
Laboratorium Fisiologi dan Bioteknologi Fakultas Pertanian Universitas Sebelas
Maret Surakarta. Metode yang digunakan dalam penelitian ini adalah metode
squash (pencet) pada ujung akar tanaman anggrek. Metode squash dilakukan
dengan beberapa tahap meliputi: Pra-perlakuan selama 24 jam dengan
8-Hydroxyquinoline 0,002 M pada suhu 6ºC, Fiksasi dengan asam acetat glacial
45% selama 2 jam, hidrolisis dengan larutan HCL 1N di dalam oven suhu 65ºC
selama 3 menit, Pewarnaan larutan aceto orcein 2% selama 24 jam, dilanjutkan
squashing dan penyegelan. Pengamatan dilakukan dengan mikroskop cahaya.
Variabel yang diamati adalah jumlah kromosom, ukuran kromosom, bentuk
kromosom dan kariotipe kromosom. Data hasil pengamatan dianalisis secara
deskriptif berdasarkan pengamatan dari gambar kromosom hasil pemotretan dan
data pengamatan ukuran dan bentuk kromosom.
Hasil penelitian menunjukkan Anggrek Paphiopedilum glaucophyllum,
Coelogyne speciosa dan Dendrobium crumenatum memiliki kesamaan jumlah
kromosom yaitu n = 19 dengan 2n=38. Anggrek P. glaucophyllum memiliki
ukuran kromosom 4.26 ± 014 sampai 9.73 ± 019 µm. Anggrek C. speciosa
memiliki ukuran kromosom 0.35 ± 0.03 sampai 6.30 ± 0.84 µm. Anggrek
D. crumenatum 2.46 ± 0.20 sampai 5.33 ± 0.02 µm. Bentuk kromosom Anggrek
P.glaucophyllum, C.speciosa dan D.crumenatum dominan metasentrik. Susunan
pola kariotipe Anggrek P.glaucophyllum adalah 2n = 38 m, C.speciosa adalah 2n
= 36 m + 2 ak dan D. crumenatum adalah 2n = 38 m.

xiii

SUMMARY

ANALYSIS CHROMOSOMES ON EAST JAVA-NATURAL ORCHIDS
(Paphiopedilum glaucophyllum, Coelogyne speciosa and Dendrobium
crumenatum). Thesis: Indah Dewi M.J (H0709056). Consultant: Sri Hartati,
Linayanti Darsana, Parjanto. Agrotechnology Study Program, Agricultural
Faculty of Surakarta SebelasMaret University (UNS).
Natural Orchid existing in East Java has very diverse population, but its
number in original habitat is very limited. Plant breeding can be used to conserve
and to breed orchid plant. One factor supporting a successful plant breeding by
find out genetic information. This research aimed to find out genetic information
constituting number, form, size, and chromosome karyotype. The presence of
genetic information is expected to be used as the foundation in plant breeding in
order to get superior variety and to improve the properties of plant.
This research was conducted on October 2015 to February 2016 in
Physiological and Biotechnological Laboratories of Agricultural Faculty of
Surakarta Sebelas Maret University. The method employed in this research was
squash method in the root tip of orchid plant. Squash method was conducted in
some stages included: Pre-treated for 24 hours with 8-Hydroxiquinoline 0,002 M
at temperature of 6° C, fixed with glacial acetic acid of 45% for 2 hours,
hydrolysis with HCL 1 N in oven at 65oC for 3 minutes, coloring with acetoorcein
solution 2% for 24 hours, followed with squashing and sealing. Observation was
conducted using light microscope. The variables observed included: chromosome
number, chromosome size, chromosome size, and chromosome karyotype. The
data obtained from the result of observation was analyzed descriptively based on
observation on chromosome picture resulting from portraying, and chromosome
size and form.
The result of research showed that Paphiopedilum glaucophyllum,
Coelogyne speciosa and Dendrobium crumenatum orchids had chromosome
number similarity, n = 19, with 2n = 38. P. glaucophyllum orchid had
chromosome size ranging between 4.26 ± 014 and 9.73 ± 019 µm. C. speciosa
orchid had chromosome size ranging between 0.35 ± 0.03 and 6.30 ± 0.84 µm.
D. crumenatum orchid had chromosome size ranging between 2.46 ± 0.20 and
5.33 ± 0.02 µm. The chromosome form of P. glaucophyllum, C. speciosa and
D.crumenatum orchid was dominantly metacentric. Karyotype pattern structure of
P. glaucophylum orchid was 2n = 38 m, C. speciosa was 2n = 36 m + 2 ak and
D. crumenatum was 2n = 38 m.

xiv