OPTIMASI ISOLASI DNA TANAMAN GAMBIR (uncaria gambir Roxb.) DAN SELEKSI PRIMER RAPD (Random Amplified Polymorphic DNA).

or-m\6Asrrsqr,rMe$i tAflAMAN GAMBIR
{ur6qr$

nAlD

Fnaf h\r\}lDAr{
Gfa,trtun'

sf,lr.Exsr pRrMsR

rt*rfd P&ffiph'c DNA\

.

olBn

.AOT

T'mFGITA'

,&a{ oe,.


r,dIryLTA$ PERTANTAN
UNIYERSIIIA$ ANDAI,A$

adoAl{c
2101

I

oPTlnASl ISOLASI DNA TANAMAN GAMBIIT (Un'dria
cd,rril Rorb., nA\ sFl LRSI PRIYI:R
R^"PllrRandom Ar'rnlilirJ Pol!nrorlhic

D\Al

AI]STRAK

\r'"
J
0en.l' n\l '-t 'o 'pi'

'
P
cnD .. ..o "b'
..t oi,
,",,
" ".,,'";,"
I"
r,oo
i"
;'1 B'o

'
.o'L u \r

ii,"-. "'';,,'"
r' r
'ro ''
;:,"-"" ;;
'eir
'r'p'

j-.
'..'
".
0u
i
\.
,
e,
; i ";i.; "i, ",
-oDj
'ode poo j
;,",; ";;; "n' t.'r"\r'
1'r
h rtr. r'ldrr'd'or
-"';i;;i,,
""'1,.'o
igbdi
od'D\q3R
e'!p L."n-"",,",,
"".

q D''
'r4'J.
1! \ p'
'l;;i "-"; :;:;r
",r,. ,r;
'
'eD
''
o', u\' d 'F'. ' 's/ ob' d' i
i::-.j,,,,"; I ;'. .doi '.

" ,";, l.o, .., ,, v..o 8
' \'
i.,::"r, iniAF"l- .. t e'roo ; "oJ
::,.1"",-,,

;.:"-.--"'..
.:0,:
o
;: ,i", -'; ".n ; " o - "'"

:,,',i
,,,
" ";:,;-;i ,;;;.,
* ' ."b., d" o,o'''r

,;";

,,".,";;i;;;

:;;,

;::".;'.

,i.,".d

,,,,:.

I

r""


d,i

o,n J
oL

-J
'b-

'

eJ

' DJ'' 'd ' r
Lrd'
o''iD1
d4i. .DrlTdo

'1.:,' :;": ,. i ,,', i* ' ' 's
"

t,,"'"
,:;.;"...,.',r,,-ia

Jp,

1'"
D'' "/'ar"

i; ,:":";.i:;,:;"i,";rsF"r
'..
"'.
p, c R\l'Ddriop.run
in,,- ti. cb f*r,
a

e

"\,e

ld


D rrrt o'i
.'*-ti.i' '_- tll"' o
'
eJ'd
;.iorr .', e-' oi 'm'Jdioil
",...,j,i';,;
,i"ll
ii,,.,, . .?,' , ia. . ...n,.r.,. u., ,sb-.(.,.,..,D\d
d'
... ',a ' .-''''r' '"" '-'J
lil-,.-r1 .i..
q"
D:
-1,::;"^;,"; - . 1" r., a '' 'djr' ' :(r
.:'; ,;.
i;";;;","
,,p.-r't,,tF tg.r,p\\ 1,1.,, , r,lc
,


I. PENDAHULUAN

'randd
Rubiaco€

ganbir (arn.d/u gz,brl Roxb.) lersolons kcdatm s.l!h saru fmiti

ydg nerupliu tumbuhd

perdu dcmanjat, batea bulat, bunsaya

naicmul, b.rbcntul bongkol. buah b€rbentul tapsul. biji berbenruk janrm
bcsayap. Cambn

bdyat dinmlM&b. mba

permm!. dan conpuan mrul

natu


lain untuk banm pcnymah kuln,

b.nd balu sambn, kftna

mene!tulhir nikodr (Denian dar

limi.

199,1).

Di Smatcn Bm| lebih ddi 90%

lanan

tanmu gmbir

KabupaFn Limapuldr

Kot dm


ar

sirih. Di Jeplns bahkan relah dikenbtugkd

pemen peles! rcngBotuta kiusus unluk peokoi dengd

geh; hmpu

d

terddpar di

PesGt Sclaran. Pda periode 1998-2002 reriadi

teningkald luas budiday! lldman sambir Smatcn Bd,i sebee. 46%. diD a
pldd uhu. l998lercaid Iu lohan perLn.nm gmbi I4.981ha meninsha! nanjadi

unln 2002 D€ni(ir juga dengan pmduksinya. pada pcriodc yang
sma mensalami p€ningkah ddi 6.271 ton pad! bnun 1998 nenjldi 10.729 lon
21 812 ha tada

pada

unun 2002 (Bada Pust Stathtik. I998-2002

.,

Fau!, 2005).

Pesoalan mend6ar daiam pengenb CM rarieias Enqman gmrbir di
I.do.csia adrlan nasih tundahnya produktifiIls de kualitas hasil Pred*tinlas

BRmbt Sunal.Ia Add b.ruariasi. nulai drri 65,6 ks/ia sepai 412 kg/ha
(Fau42005) Olen karena itu diperlukm upaya penllidn unhrk mcndapatkM

lmmu gdbn rug

meniliki produkinl&s dan hail

y

g rinsgi. Salan sar!
pmydar icberhailo tersebut ot saal tcraeiue prd! lenedimya smbft
senetit yansrcdin dai basis senelik yog lu6. Sejaul ini dikc.al liga ripe rananran
gmbn yailu lipe Udana, Cubadair, dm tuau (Deni& du Fisi, 199,1). Kctiga riF

embir t.rsebur tellh dikenal dan dibudidar€kan peroi scjak lma. Akdr tehpi bukri
bnkli ysg ditenuhr di laDdsd nenunjuktd 6alwa ad, emp€t tip€ tsmM
gimbir. yaitu tipc UdmC. cubadal, Risu Oadane. de Riau Mancik (Fau2,.

koouitsi

pe6onal).

nchkutd kankterissi lerhadap
atan lcrapi mpaj sd ini Fbenamya bclm

Meskipun bebempa anh telan mcncoba
ketiga jenis

landan gambir

tersebui,

ida buhti hukti ilmiJn kur )!rA digu.*sn dalam pcneAolong& kLliCaienis gambiL
tcrscbut. Dcnge

denikie.

pln

yad

aFahan

kdisajenis Le6ebut hanya merupakan

. rl\xl nrla{eLrdrd;p
.arb1li,Ipe'r&n iigl
'.ra
"rrr'"ds1;.
bc rbcda sehineaa ap.t ik lsi fi kasi kan dalm spc sics tcSendiri bcl h dapal di.jaub
d

d

S.lah satu telenanM ptngeol.ngd r'a.g digunahd tui ini addrn narih
didasdkann]! Fda pcnematai ltrattcr morfoloei yme sdeal scDsitif rcrhadap

|ensinn lingkDCa Olcb krena itu dibutuhlo suaru sistem pensolons ymg
[bih $rhil de aluEt. Salah salo can unluk itu ad.lah penssolongnn densan

pamder moleluler yang diJrdke ldgsbg kep.da LomFosisi d6e nalDrial
eenerik (DNA) suatu organisnr. llerbasai kcuCgutm karaltcri$si bcrbash
molekuler Lela! bdyal dilaporkan oleh berbagai penelili anun irin: d€ngd
nrengsunakb kanktcr nblekul( bisa lebih akudl dalanr nellkukd li.dakd
perbaikd silar arau karakrer suat! indiridu. DisdtinC nu wallu yde dibutuhkm
juga lcbih cepal, siaatnya ylns lebib sabil dibddingktur den8an kan[ler norfoloai,
dimana karakrer frorfologi dipensmni oleh

hrskuqan setitamya (Jawi2001)

Selain nu aplbih sralu individu membawa perrakii llau kelnimn yang beEsal dari

ret@ya arN lcbih mudan dideleksi seoda ooletuler.
Porcosi perasunan Fnanda nrol.kuld sL'basai alal umuk nehnulan
kdakerhasi ide.liu\ ore&isnctlal dikcnalsciak lMa. Pcnanda molekuler sepeni
i$zyrn. RILP

(rz\rrrlid,.t.rd.ht

l.neth poltr arphkn), RAPD (. a.lott onplilitd

pauuorphi. DN,1). dan A!:LP @nrliJi.l faEncnt lenath polrnq?h^

)

lena

sisrcft pcnanda hnnrra tclah digunakrn scbagai Fncni ecncik dalan Fcmuliaan
r.lffan (KaBinan,l999) atlikai prattGnla butd hanya lnluk identifikasi

kmklcristik, lebrijug! balkm diaunakan unluk nrensutur li.skat tekcr^batd drar

naupun inleBpesi€s tncntu (Jmsdi, 200?) Bahlan ju8l digunar@ unluk
kepenuan penctaan lokullokus gen l1rset tn€nlu yms berkdltn dcned LmkcF
*arahcr agrononi benilai ekonqni t€nting.
Pe.inda RAID yaie dikcn$drekdr oleh lvillians. dr

al

(1990) meruFkm

srlin salu sislen penddu yds ccpai. mudal ddi remenurd biar. lans

r.lttil

V. XISIMPULAN DAN

S IA}I

5,l,K6impulan
Berdddkon

l. De

lscobd yec dilatulb dat,1 dimbil

b€bcnpa prclokol

disullo

i$lsi yos rlisunald Nrut nengisolasi DN,^

ydg diFrkenalk olch Doylc md Doyle
mnrk mcneisolsi DN dei jeinse daun la.ams

tanmd eurbir, pmrokol
(1990) dapat

bcbcnpa kesinpuld

isolasi

isolai DN,{ tmg laimya tidak dapai disunakan
utuk nmgisolai DNI taEnan gmbn.
J.nk malerial yana baik digunakm unluk toendrla&s DNA ddi leamm

Cambn. sedarslon probkol

2

gmbir adalah daun ntda dalm kondisi egd, dm jusa daun yans disimpu

I Ddi 25 pider

{opson) RAPD ymg dheleksi, 24 pnner .1mpu
nenghdilkm produt PCR denge kis.fu ot!r! $lu smpai lina naemcn.
5.2. Srrcn

fr.ndapa& hasil yus optnnal dalan isoldi DNA llnanu Banbn
dismkan mtuk memald ptu$lol isol4i DNA ydg diprkenalkr olch

t. tlnruh

Doyle and Doyle. (1990).

Rerdaqk
PCR

ydg

karalterislik junlah Fasnen dm tenrudaha skorin8 pDdut

diperoleh, maka priner-priner OPN-06, OPA'09, OPE 18. OPw-

02. OPY-08

disants

uotuk

disunJ(o dalm o,lisis k€ked6.h

tdmd

Seldjuhya untnk meni.skalkan altenatif pilihan primer yans

dapal

disbakm nal€ disanlm nnlul ndalulm seleksi priner IIAPD ymg
lebih banyal- shinssa dab ydng diperoleh dalan

eahis

kekerdbar"! akm

A.letula.

o.A

2006. Gseric

Pollrrorphic DNAS.

dile*itt ol Cal,J'.,n

Alii@

usine Rsdon Amplified

Joumal oa Biolecnnoioey 5i I 20- 122

An Michiels, w. van den Ende, M. Tucker, L. vrn tuel, md AVd laere,2003
Exlrlion oi hish quolity Benomic DNA frcm latex-onlai.ina pldls.
nalil|cal Biochenislrr.(ll5) 85-89
Bennet,

J

Daswir

dd I.

1991. Maps dd Mdk.s In Ocnon
Workshop Hmdbook. Cmt rl Rcsctrch
lndonesir l4-16 Ju.i 1991.IRRL Msila

Kusuma. 1993. Sisten .i\aha CMbir di S"natera Barat. Media
komudkdi penelilim dm pengenbosan llnman indutri no 11. Puel
pcnclitid dd pcneembansan llnme indusrri badm pencliri de
pengedbdeM p.nanian. Dcpan.ne. Pcneid:68 74

Denid, ,4

A.Fiani, I 994. Karakrcrisitik iorlologi bebedpa n.nor idahln gdnbir
PrcsidinEsenim penelilid ranlno renrpdr dan obai. Sub. Balitro Solot no

dd

Doyle. J.J. md J.L.Doylc. 1990. lelaslion of Plmt DN,{ lrom rrcsn rissuc. locus (12)i

ll

l5

El-Mez}l,

A,, Dreyer, F., Jscobs, G., Jung, C (2002). Hi8hjesolution mapping ofihe
boltinsgeneB ofsusarbeel. Tre.t Appl Ceh.l \05:100-tAs

rrauz.

ll..

2005. Ambjl (.Uhcaria aznbir (Huntct Roxb). Dald: Raih,ki.,Haguddin, Elfis, P. Hidayat. ,1. Sugiymto, dd Z. Slsil {Fns.) Kondisi
Beber4a Plam! Ndllah Konodni PenanilD Penlins Dewe Ini. PPS Unpad
KNPN Lilbans Deptan.: 167-186

lladi. Nlifi.chul dan lka Nurlaila,046 Solitot don DN,1
Herero. R.

MJ Asis.

J.A. Pim. E.A. Cdboncll Md l.

hipl/*||e

na . lipi s. id

Navdr, 1996 Cnetic divesity

in tnc otuCe subfmily ,^uimlioidero II Genedc rel aliotrshi ps
adspccies Theor /1ppl. Aeret. (91): 1327-1334

a

m

ons senera

sd A.Gen, 1992. Ahausis oJpopulal;.n lewl ru.iali.rn hy tequencihE
PCk-A plilied DN.4 /, tloelzcl. A.R (Ed.) M.tLrutar Aenetit Awltsis of
Pat dtbhs 11 Pt..tical Apptoa.r. Oxlord ljnire6iq Press. NeR York. p.

Iloelzel, AR.