Pengujian Perilaku Predator dan Anti-Predator pada Ikan Lele Dumbo (Clarias gariepinus Burchell, 1822) Transgenik F3
PENGUJIAN PERILAKU PREDATOR DAN ANTI-PREDATOR
PADA IKAN LELE (Clarias gariepinus Burchell, 1822)
TRANSGENIK F3
PUTRI WIDYAWATI
110302053
PROGRAM STUDI MANAJEMEN SUMBERDAYA PERAIRAN
FAKULTAS PERTANIAN
UNIVERSITAS SUMATERA UTARA
2015
Universitas Sumatera Utara
PENGUJIAN PERILAKU PREDATOR DAN ANTI-PREDATOR
PADA IKAN LELE (Clarias gariepinus Burchell, 1822)
TRANSGENIK F3
SKRIPSI
PUTRI WIDYAWATI
110302053
PROGRAM STUDI MANAJEMEN SUMBERDAYA PERAIRAN
FAKULTAS PERTANIAN
UNIVERSITAS SUMATERA UTARA
2015
Universitas Sumatera Utara
PENGUJIAN PERILAKU PREDATOR DAN ANTI-PREDATOR
PADA IKAN LELE (Clarias gariepinus Burchell, 1822)
TRANSGENIK F3
SKRIPSI
PUTRI WIDYAWATI
110302053
Skripsi sebagai satu diantara beberapa syarat untuk dapat memperoleh gelar
Sarjana Perikanan di Program Studi Manajemen Sumberdaya Perairan,
Fakultas Pertanian, Universitas Sumatera Utara
PROGRAM STUDI MANAJEMEN SUMBERDAYA PERAIRAN
FAKULTAS PERTANIAN
UNIVERSITAS SUMATERA UTARA
2015
Universitas Sumatera Utara
LEMBAR PENGESAHAN
Judul Penelitian
: Pengujian Perilaku Predator dan Anti-Predator pada Ikan
Lele Dumbo (Clarias gariepinus Burchell, 1822) Transgenik
F3
Nama
: Putri Widyawati
NIM
: 110302053
Program Studi
: Manajemen Sumberdaya Perairan
Disetujui Oleh:
Komisi Pembimbing
Prof. Dr. Ir. Darma Bakti, M.S
Ketua
Desrita, S.Pi., M.Si
Anggota
Huria Marnis, S.Pi., M.Si
Anggota
Mengetahui,
Dr.Ir. Yunasfi, M.Si
Ketua Program Studi Manajemen Sumberdaya Perairan
Universitas Sumatera Utara
PERNYATAAN MENGENAI SKRIPSI
DAN SUMBER INFORMASI
Saya yang bertanda tangan dibawah ini:
Nama : Putri Widyawati
NIM
: 110302053
Menyatakan bahwa skripsi yang berjudul “Pengujian Perilaku Predator dan AntiPredator pada Ikan Lele Dumbo (Clarias gariepinus Burchell, 1822) Transgenik
F3” adalah benar merupakan hasil karya saya sendiri dan belum pernah diajukan
dalam bentuk apapun kepada perguruan tinggi manapun. Semua sumber data dan
informasi yang berasal atau dikutip dari karya yang diterbitkan maupun yang tidak
diterbitkan dari penulis lain telah disebutkan dalam teks dan dicantumkan dalam
daftar pustaka di bagian akhir skripsi ini.
Medan, Agustus 2015
Putri Widyawati
NIM. 110302053
Universitas Sumatera Utara
ABSTRAK
PUTRI WIDYAWATI. Pengujian Perilaku Predator dan Anti-Predator pada Ikan
Lele Dumbo (Clarias gariepinus Burchell, 1822) Transgenik F3. Dibimbing oleh
DARMA BAKTI, DESRITA, dan HURIA MARNIS.
Ikan lele dumbo (Clarias gariepinus ) transgenik F3 yang mengandung gen
hormon pertumbuhan ikan patin siam ( Ph GH) bisa tumbuh 2 kali lebih cepat dari
ikan lele normal dalam kondisi budidaya. Namun, sebelum ikan lele dumbo
transgenik dilepaskan dan dimanfaatkan, dampak genetik terhadap lingkungan alam
harus diperiksa. Penghindaran predator merupakan salah satu ciri utama yang
menentukan ketahanan terhadap resiko lingkungan. Untuk menentukan kemampuan
dalam menghindari predator dan mengetahui parameter pertumbuhan ikan lele
dumbo transgenik, ditebar 35 ekor/akuarium ikan lele dumbo transgenik F3 dan
non-transgenik dengan pemberian makanan tambahan. Ikan lele
dumbo dengan
panjang rata-rata 4,49 ± 0,27 cm dan bobot rata-rata 0,79 ± 0,14 g ditebar sebagai
predator. Ikan lele dumbo non-transgenik memiliki mekanisme penghindaran
terhadap predator yang lebih baik daripada ikan lele dumbo transgenik. Tidak ada
perbedaan yang signifikan dalam parameter pertumbuhan antara ikan lele dumbo
transgenik F3 dan ikan lele dumbo non-transgenik di akuarium dengan pemberian
makanan tambahan. Penelitian ini menunjukkan bahwa ikan lele dumbo transgenik
dapat digunakan untuk budidaya komersial tanpa mempengaruhi lingkungan,
karena genotipe dari ikan transgenik akan menurun atau bahkan hilang.
Kata Kunci:
Penghindaran Predator, Clarias gariepinus , Transgenik F3,
Keamanan Lingkungan, Ph GH
Universitas Sumatera Utara
ABSTRACT
PUTRI WIDYAWATI. Testing Predator and Anti-Predator Behavior in African
Catfish (Clarias gariepinus Burchell, 1822) Transgenic F3. Under the supervision
of DARMA BAKTI, DESRITA, and HURIA MARNIS.
African catfish (Clarias gariepinus ) transgenic F3 containing Pangasius
hypothalmus growth hormone ( Ph GH) genes can growth twice the average weight
of the control population. However, before transgenic African catfish are released
and utilized, their genetic impact on the natural environment must be examined.
Predator avoidance is one of the major fitness traits determining potential
environment risk. To determine the predator avoidance ability and growth
performance of transgenic African catfish, various densities of transgenic and nontransgenic African catfish were communally stocked in 35/aquarium without
supplemental feeding. The average length of African catfish ( Clarias gariepinus )
range between 4,49 ± 0,27 cm and the average weight range between 0,79 ± 0,14 g
were stocked as predators. Non-trangenic African catfish had better predator
avoidance than transgenic African catfish. There was no significant difference in
growth performance between transgenic and non-transgenic African catfish in
aquarium without supplemental feeding. This findings indicate that transgenic
African catfish could be used for commercial aquaculture without affecting the
natural environment because the increased susceptibility of transgenic African
catfish to predators would most likely decrease or eliminate the transgenic
genotype.
Keywords:
Predator Avoidance, Clarias
Environmental Risk, Ph GH
gariepinus,
Transgenic
F3,
Universitas Sumatera Utara
RIWAYAT HIDUP
Penulis lahir di Kota Pematangsiantar, Provinsi
Sumatera Utara pada tanggal 27 Maret 1994 dari
ayahanda Suhardi dan ibunda Partiyatun. Penulis
merupakan anak pertama dari dua bersaudara.
Penulis memulai jenjang pendidikan formal di
SD SWASTA YPH, Kota Pematangsiantar sampai
tahun
2005.
Penulis
kemudian
melanjutkan
pendidikan di SMP Negeri 4 Kota Pematangsiantar (tahun 2005-2008). Tahun 2011
penulis menyelesaikan pendidikan di SMA Negeri 4 Pematangsiantar dengan
jurusan IPA. Penulis melanjutkan pendidikan di Program Studi Manajemen
Sumberdaya Perairan, Fakultas Pertanian, Universitas Sumatera Utara pada tahun
2011 melalui jalur Ujian Masuk Bersama (UMB).
Penulis aktif dalam kegiatan organisasi, yaitu sebagai anggota Ikatan
Mahasiswa Manejemen Sumberdaya Perairan (IMASPERA). Penulis juga aktif
sebagai asisten praktikum mata kuliah Ikhtiologi (tahun 2012 dan 2013), Dasar
Oseanografi dan Biologi Perikanan (tahun 2013). Pada bulan Juli - Agustus 2014
penulis melakukan Praktik Kerja Lapangan (PKL) dan pada bulan Februari – Mei
2015 penulis melakukan penelitian di Balai Penelitian Pemuliaan Ikan (BPPI)
Sukamandi, Subang – Jawa Barat .
Universitas Sumatera Utara
KATA PENGANTAR
Puji syukur penulis ucapkan kehadirat Allah SWT karena atas rahmat,
hidayah, serta karunia-Nya sehingga penulis dapat menyelesaikan skripsi yang
berjudul “Pengujian Perilaku Predator dan Anti-Predator pada Ikan Lele
Dumbo (Clarias gariepinus Burchell, 1822) Transgenik F3”.
Pada kesempatan ini penulis mengucapkan terima kasih kepada Ayahanda
Suhardi dan Ibunda Partiyatun serta adik Adinda Nabillah yang selalu memberi
motivasi, dukungan, doa dan kasih sayang sehingga penulis dapat menyelesaikan
skripsi ini. Terimakasih juga penulis ucapkan kepada Bapak Prof. Dr. Ir. Darma
Bakti, M.S selaku ketua komisi pembimbing dan Ibu Desrita, S.Pi., M.Si serta Ibu
Huria Marnis S.Pi, M.Si selaku anggota komisi pembimbing yang telah banyak
memberikan bimbingan dan arahan dengan penuh kesabaran selama penelitian dan
penulisan skripsi ini. Terimakasih juga kepada Bapak Dr. Ir. Yunasfi, M.Si selaku
Ketua Program Studi Manajemen Sumberdaya Perairan, Bapak Pindi Patana, S.Hut,
M.Sc selaku Sekretaris Program Studi Manajemen Sumberdaya Perairan dan
kepada seluruh staf pengajar dan pegawai di Program Studi Manajemen
Sumberdaya Perairan Fakultas Pertanian Universitas Sumatera Utara.
Penulis mengucapkan terima kasih kepada Bapak Dr. Imron, S.Pi., M.Si
selaku Kepala Balai Penelitian Pemuliaan Ikan (BPPI) Sukamandi, Bapak Bambang
Iswanto, S.Pi., M.P selaku Koordinator Komoditas Ikan Lele Balai Penelitian
Pemuliaan Ikan (BPPI) Sukamandi, Mbak Diah, Mbak Ina dan Uni Selny yang
telah membantu di Laboratorium Fisiologi dan Genetik Ikan Balai Penelitian
Pemuliaan Ikan (BPPI) Sukamandi, serta para teknisi di hatchery ikan lele Bapak
Universitas Sumatera Utara
Pudji Suwargono, Mbak Maya Febriana Pangestika, Amd., Kang Ilmalizanri dan
Bapak Didi yang telah memberikan kesempatan kepada penulis untuk melakukan
penelitian di instansi tersebut.
Penulis
mengucapkan
terima
kasih
kepada
seluruh
teman-teman
seperjuangan angkatan 2011 khususnya Sultan Akbar Habibullah, Fery Jacksen
Sihotang Laily Dirda Fitrianingsih, Ainul Mardiah, Febrina Rahmadanti Putri, Tri
Woro Widyastuti, Meia Ester S. Ginting, Julia Syahriani Hasibuan, Kartika Dewi,
Syafrida Siregar, Khairatunnisa’, Muhammad Dafikri (MSP 2012), Anggia Dolly
(MSP 2012), Afifah Rezki Suryani (MSP 2014) serta adik-adik angkatan Program
Studi Manajemen Sumberdaya Perairan.
Penulis berharap semoga skripsi ini bermanfaat dalam pengembangan ilmu
pengetahuan, khususnya dalam bidang manajemen sumberdaya perairan.
Medan Agustus 2015
Putri Widyawati
Universitas Sumatera Utara
DAFTAR ISI
Halaman
ABSTRAK ........................................................................................................
i
ABSTRACT .....................................................................................................
ii
RIWAYAT HIDUP .........................................................................................
iii
KATA PENGANTAR ....................................................................................
iv
DAFTAR ISI ....................................................................................................
vi
DAFTAR TABEL ...........................................................................................
viii
DAFTAR GAMBAR ......................................................................................
ix
DAFTAR LAMPIRAN ..................................................................................
x
PENDAHULUAN
Latar Belakang ........................................................................................
Perumusan Masalah ................................................................................
Kerangka Pemikiran ...............................................................................
Tujuan Penelitian ....................................................................................
Manfaat Penelitian ..................................................................................
1
2
3
4
4
TINJAUAN PUSTAKA
Ikan Lele Dumbo (Clarias gariepinus ) .................................................
Teknologi Transgenesis ..........................................................................
Polymerase Chain Reaction (PCR) ......................................................
Perilaku Predator .....................................................................................
5
6
8
10
METODE PENELITIAN
Waktu dan Tempat Penelitian .................................................................
Alat dan Bahan ........................................................................................
Pemeliharaan Benih ...........................................................................
Deteksi Transgen Ph GH ...................................................................
a. Ekstraksi DNA .....................................................................
b. Amplifikasi PCR ..................................................................
c. Elektroforesis ........................................................................
Rancangan Percobaan .............................................................................
Prosedur Penelitian .................................................................................
Pemeliharaan Benih ...........................................................................
a. Hewan Uji .............................................................................
b. Pengujian Perilaku Predator dan Anti-Predator .................
12
12
12
12
12
13
13
14
14
14
14
15
Universitas Sumatera Utara
c. Parameter Pertumbuhan .......................................................
1. Pertumbuhan Panjang ......................................................
2. Pertumbuhan Bobot ........................................................
3. Tingkat Kelangsungan Hidup ........................................
d. Kualitas Air ...........................................................................
e. Analisis Data ........................................................................
Deteksi Transgen Ph GH ...................................................................
a. Hewan Uji ............................................................................
b. Ekstraksi DNA .....................................................................
c. Amplifikasi PCR ..................................................................
d. Elektroforesis .......................................................................
e. Analisis Data ........................................................................
15
15
15
16
16
17
17
17
17
18
18
19
HASIL DAN PEMBAHASAN
Hasil .........................................................................................................
Pengujian Perilaku Predator dan Anti-Predator ...............................
Kualitas Air ........................................................................................
Pembahasan .............................................................................................
Pengujian Perilaku Predator dan Anti-Predator ...............................
Kualitas Air ........................................................................................
20
20
25
26
26
29
KESIMPULAN DAN SARAN
Kesimpulan ..............................................................................................
Saran ........................................................................................................
31
31
DAFTAR PUSTAKA
LAMPIRAN
Universitas Sumatera Utara
DAFTAR TABEL
No.
1.
2.
3.
Teks
Halaman
Persentase Deteksi Transgen Benih Ikan Lele Dumbo Transgenik F3
dan Non-Transgenik ..................................................................................
21
Persentase Deteksi Transgen Predator pada Perlakuan Pengujian
Perilaku Predator dan Anti-Predator ........................................................
22
Data Kisaran Kualitas Air pada Pengujian Perilaku Predator dan AntiPredator ......................................................................................................
26
Universitas Sumatera Utara
DAFTAR GAMBAR
No.
Teks
Halaman
1.
Kerangka Pemikiran Penelitian ................................................................
4
2.
Deteksi Transgen pada Benih Ikan Lele Dumbo Transgenik F3
(Nomor 64-67, 1-2 dan 5-6 = Sampel Benih Ikan Lele Dumbo
Transgenik F3; Nomor 68-69, dan 3-4 = Sampel Predator; M adalah
Marker DNA (100 - 3.000 bp) (Vivantis); Tanda (+) adalah Kontrol
Positif (pCcBA-Ph GH) .............................................................................
20
Deteksi Transgen pada Benih Ikan Lele Dumbo Non-Transgenik
(Nomor, 89-90 dan 33-35 = Sampel Benih Ikan Lele Dumbo NonTransgenik; Nomor 87-88 dan 36-37 = Sampel Predator; M adalah
Marker DNA (100 - 3.000 bp) (Vivantis); Tanda (+) adalah Kontrol
Positif (pCcBA-Ph GH) .............................................................................
21
4.
Pertumbuhan Panjang Benih Ikan Lele Dumbo Transgenik F3 .............
22
5.
Pertumbuhan Panjang Benih Ikan Lele Dumbo Non-Transgenik ..........
23
6.
Pertumbuhan Bobot Benih Ikan Lele Dumbo Transgenik F3 ................
24
7.
Pertumbuhan Bobot Benih Ikan Lele Dumbo Non-Transgenik .............
24
8.
Tingkat Kelangsungan Hidup Benih Ikan Lele Dumbo Transgenik F3
dan Ikan Lele Dumbo Non-Transgenik pada Pengujian Perilaku
Predator dan Anti-Predator .......................................................................
25
3.
Universitas Sumatera Utara
DAFTAR LAMPIRAN
No.
Teks
Halaman
1.
Pemeliharaan Benih ................................................................................
36
2.
Prosedur Kerja ........................................................................................
37
3.
Hasil Deteksi Transgen Awal Benih Ikan Lele Dumbo Transgenik
F3 dan Non-Transgenik pada Pengujian Perilaku Predator dan AntiPredator ...................................................................................................
38
Hasil Deteksi Transgen Akhir Benih Ikan Lele Dumbo Transgenik
F3 dan Non-Transgenik pada Pengujian Perilaku Predator dan AntiPredator ...................................................................................................
40
Data Sampling Awal: Panjang dan Bobot Benih Ikan Lele Dumbo
Transgenik F3 dan Non-Transgenik ......................................................
42
Data Sampling Akhir: Panjang dan Bobot Benih Ikan Lele Dumbo
Transgenik F3 dan Non-Transgenik .....................................................
43
7.
Data Panjang dan Bobot Predator Ikan Lele Dumbo Transgenik F3 ..
45
8.
Data Panjang dan Bobot Predator Ikan Lele Dumbo Non-Transgenik
46
9.
Data Tingkat Kelangsungan Hidup Benih Ikan Lele Dumbo
Transgenik F3 dan Non-Transgenik .....................................................
47
10. Data Kualitas Air ....................................................................................
48
11. Data Analisis Sidik Ragam Parameter Pertumbuhan Benih Ikan Lele
Dumbo Transgenik F3 dan Non-Transgenik pada Pengujian Perilaku
Predator dan Anti-Predator ....................................................................
50
4.
5.
6.
Universitas Sumatera Utara
PADA IKAN LELE (Clarias gariepinus Burchell, 1822)
TRANSGENIK F3
PUTRI WIDYAWATI
110302053
PROGRAM STUDI MANAJEMEN SUMBERDAYA PERAIRAN
FAKULTAS PERTANIAN
UNIVERSITAS SUMATERA UTARA
2015
Universitas Sumatera Utara
PENGUJIAN PERILAKU PREDATOR DAN ANTI-PREDATOR
PADA IKAN LELE (Clarias gariepinus Burchell, 1822)
TRANSGENIK F3
SKRIPSI
PUTRI WIDYAWATI
110302053
PROGRAM STUDI MANAJEMEN SUMBERDAYA PERAIRAN
FAKULTAS PERTANIAN
UNIVERSITAS SUMATERA UTARA
2015
Universitas Sumatera Utara
PENGUJIAN PERILAKU PREDATOR DAN ANTI-PREDATOR
PADA IKAN LELE (Clarias gariepinus Burchell, 1822)
TRANSGENIK F3
SKRIPSI
PUTRI WIDYAWATI
110302053
Skripsi sebagai satu diantara beberapa syarat untuk dapat memperoleh gelar
Sarjana Perikanan di Program Studi Manajemen Sumberdaya Perairan,
Fakultas Pertanian, Universitas Sumatera Utara
PROGRAM STUDI MANAJEMEN SUMBERDAYA PERAIRAN
FAKULTAS PERTANIAN
UNIVERSITAS SUMATERA UTARA
2015
Universitas Sumatera Utara
LEMBAR PENGESAHAN
Judul Penelitian
: Pengujian Perilaku Predator dan Anti-Predator pada Ikan
Lele Dumbo (Clarias gariepinus Burchell, 1822) Transgenik
F3
Nama
: Putri Widyawati
NIM
: 110302053
Program Studi
: Manajemen Sumberdaya Perairan
Disetujui Oleh:
Komisi Pembimbing
Prof. Dr. Ir. Darma Bakti, M.S
Ketua
Desrita, S.Pi., M.Si
Anggota
Huria Marnis, S.Pi., M.Si
Anggota
Mengetahui,
Dr.Ir. Yunasfi, M.Si
Ketua Program Studi Manajemen Sumberdaya Perairan
Universitas Sumatera Utara
PERNYATAAN MENGENAI SKRIPSI
DAN SUMBER INFORMASI
Saya yang bertanda tangan dibawah ini:
Nama : Putri Widyawati
NIM
: 110302053
Menyatakan bahwa skripsi yang berjudul “Pengujian Perilaku Predator dan AntiPredator pada Ikan Lele Dumbo (Clarias gariepinus Burchell, 1822) Transgenik
F3” adalah benar merupakan hasil karya saya sendiri dan belum pernah diajukan
dalam bentuk apapun kepada perguruan tinggi manapun. Semua sumber data dan
informasi yang berasal atau dikutip dari karya yang diterbitkan maupun yang tidak
diterbitkan dari penulis lain telah disebutkan dalam teks dan dicantumkan dalam
daftar pustaka di bagian akhir skripsi ini.
Medan, Agustus 2015
Putri Widyawati
NIM. 110302053
Universitas Sumatera Utara
ABSTRAK
PUTRI WIDYAWATI. Pengujian Perilaku Predator dan Anti-Predator pada Ikan
Lele Dumbo (Clarias gariepinus Burchell, 1822) Transgenik F3. Dibimbing oleh
DARMA BAKTI, DESRITA, dan HURIA MARNIS.
Ikan lele dumbo (Clarias gariepinus ) transgenik F3 yang mengandung gen
hormon pertumbuhan ikan patin siam ( Ph GH) bisa tumbuh 2 kali lebih cepat dari
ikan lele normal dalam kondisi budidaya. Namun, sebelum ikan lele dumbo
transgenik dilepaskan dan dimanfaatkan, dampak genetik terhadap lingkungan alam
harus diperiksa. Penghindaran predator merupakan salah satu ciri utama yang
menentukan ketahanan terhadap resiko lingkungan. Untuk menentukan kemampuan
dalam menghindari predator dan mengetahui parameter pertumbuhan ikan lele
dumbo transgenik, ditebar 35 ekor/akuarium ikan lele dumbo transgenik F3 dan
non-transgenik dengan pemberian makanan tambahan. Ikan lele
dumbo dengan
panjang rata-rata 4,49 ± 0,27 cm dan bobot rata-rata 0,79 ± 0,14 g ditebar sebagai
predator. Ikan lele dumbo non-transgenik memiliki mekanisme penghindaran
terhadap predator yang lebih baik daripada ikan lele dumbo transgenik. Tidak ada
perbedaan yang signifikan dalam parameter pertumbuhan antara ikan lele dumbo
transgenik F3 dan ikan lele dumbo non-transgenik di akuarium dengan pemberian
makanan tambahan. Penelitian ini menunjukkan bahwa ikan lele dumbo transgenik
dapat digunakan untuk budidaya komersial tanpa mempengaruhi lingkungan,
karena genotipe dari ikan transgenik akan menurun atau bahkan hilang.
Kata Kunci:
Penghindaran Predator, Clarias gariepinus , Transgenik F3,
Keamanan Lingkungan, Ph GH
Universitas Sumatera Utara
ABSTRACT
PUTRI WIDYAWATI. Testing Predator and Anti-Predator Behavior in African
Catfish (Clarias gariepinus Burchell, 1822) Transgenic F3. Under the supervision
of DARMA BAKTI, DESRITA, and HURIA MARNIS.
African catfish (Clarias gariepinus ) transgenic F3 containing Pangasius
hypothalmus growth hormone ( Ph GH) genes can growth twice the average weight
of the control population. However, before transgenic African catfish are released
and utilized, their genetic impact on the natural environment must be examined.
Predator avoidance is one of the major fitness traits determining potential
environment risk. To determine the predator avoidance ability and growth
performance of transgenic African catfish, various densities of transgenic and nontransgenic African catfish were communally stocked in 35/aquarium without
supplemental feeding. The average length of African catfish ( Clarias gariepinus )
range between 4,49 ± 0,27 cm and the average weight range between 0,79 ± 0,14 g
were stocked as predators. Non-trangenic African catfish had better predator
avoidance than transgenic African catfish. There was no significant difference in
growth performance between transgenic and non-transgenic African catfish in
aquarium without supplemental feeding. This findings indicate that transgenic
African catfish could be used for commercial aquaculture without affecting the
natural environment because the increased susceptibility of transgenic African
catfish to predators would most likely decrease or eliminate the transgenic
genotype.
Keywords:
Predator Avoidance, Clarias
Environmental Risk, Ph GH
gariepinus,
Transgenic
F3,
Universitas Sumatera Utara
RIWAYAT HIDUP
Penulis lahir di Kota Pematangsiantar, Provinsi
Sumatera Utara pada tanggal 27 Maret 1994 dari
ayahanda Suhardi dan ibunda Partiyatun. Penulis
merupakan anak pertama dari dua bersaudara.
Penulis memulai jenjang pendidikan formal di
SD SWASTA YPH, Kota Pematangsiantar sampai
tahun
2005.
Penulis
kemudian
melanjutkan
pendidikan di SMP Negeri 4 Kota Pematangsiantar (tahun 2005-2008). Tahun 2011
penulis menyelesaikan pendidikan di SMA Negeri 4 Pematangsiantar dengan
jurusan IPA. Penulis melanjutkan pendidikan di Program Studi Manajemen
Sumberdaya Perairan, Fakultas Pertanian, Universitas Sumatera Utara pada tahun
2011 melalui jalur Ujian Masuk Bersama (UMB).
Penulis aktif dalam kegiatan organisasi, yaitu sebagai anggota Ikatan
Mahasiswa Manejemen Sumberdaya Perairan (IMASPERA). Penulis juga aktif
sebagai asisten praktikum mata kuliah Ikhtiologi (tahun 2012 dan 2013), Dasar
Oseanografi dan Biologi Perikanan (tahun 2013). Pada bulan Juli - Agustus 2014
penulis melakukan Praktik Kerja Lapangan (PKL) dan pada bulan Februari – Mei
2015 penulis melakukan penelitian di Balai Penelitian Pemuliaan Ikan (BPPI)
Sukamandi, Subang – Jawa Barat .
Universitas Sumatera Utara
KATA PENGANTAR
Puji syukur penulis ucapkan kehadirat Allah SWT karena atas rahmat,
hidayah, serta karunia-Nya sehingga penulis dapat menyelesaikan skripsi yang
berjudul “Pengujian Perilaku Predator dan Anti-Predator pada Ikan Lele
Dumbo (Clarias gariepinus Burchell, 1822) Transgenik F3”.
Pada kesempatan ini penulis mengucapkan terima kasih kepada Ayahanda
Suhardi dan Ibunda Partiyatun serta adik Adinda Nabillah yang selalu memberi
motivasi, dukungan, doa dan kasih sayang sehingga penulis dapat menyelesaikan
skripsi ini. Terimakasih juga penulis ucapkan kepada Bapak Prof. Dr. Ir. Darma
Bakti, M.S selaku ketua komisi pembimbing dan Ibu Desrita, S.Pi., M.Si serta Ibu
Huria Marnis S.Pi, M.Si selaku anggota komisi pembimbing yang telah banyak
memberikan bimbingan dan arahan dengan penuh kesabaran selama penelitian dan
penulisan skripsi ini. Terimakasih juga kepada Bapak Dr. Ir. Yunasfi, M.Si selaku
Ketua Program Studi Manajemen Sumberdaya Perairan, Bapak Pindi Patana, S.Hut,
M.Sc selaku Sekretaris Program Studi Manajemen Sumberdaya Perairan dan
kepada seluruh staf pengajar dan pegawai di Program Studi Manajemen
Sumberdaya Perairan Fakultas Pertanian Universitas Sumatera Utara.
Penulis mengucapkan terima kasih kepada Bapak Dr. Imron, S.Pi., M.Si
selaku Kepala Balai Penelitian Pemuliaan Ikan (BPPI) Sukamandi, Bapak Bambang
Iswanto, S.Pi., M.P selaku Koordinator Komoditas Ikan Lele Balai Penelitian
Pemuliaan Ikan (BPPI) Sukamandi, Mbak Diah, Mbak Ina dan Uni Selny yang
telah membantu di Laboratorium Fisiologi dan Genetik Ikan Balai Penelitian
Pemuliaan Ikan (BPPI) Sukamandi, serta para teknisi di hatchery ikan lele Bapak
Universitas Sumatera Utara
Pudji Suwargono, Mbak Maya Febriana Pangestika, Amd., Kang Ilmalizanri dan
Bapak Didi yang telah memberikan kesempatan kepada penulis untuk melakukan
penelitian di instansi tersebut.
Penulis
mengucapkan
terima
kasih
kepada
seluruh
teman-teman
seperjuangan angkatan 2011 khususnya Sultan Akbar Habibullah, Fery Jacksen
Sihotang Laily Dirda Fitrianingsih, Ainul Mardiah, Febrina Rahmadanti Putri, Tri
Woro Widyastuti, Meia Ester S. Ginting, Julia Syahriani Hasibuan, Kartika Dewi,
Syafrida Siregar, Khairatunnisa’, Muhammad Dafikri (MSP 2012), Anggia Dolly
(MSP 2012), Afifah Rezki Suryani (MSP 2014) serta adik-adik angkatan Program
Studi Manajemen Sumberdaya Perairan.
Penulis berharap semoga skripsi ini bermanfaat dalam pengembangan ilmu
pengetahuan, khususnya dalam bidang manajemen sumberdaya perairan.
Medan Agustus 2015
Putri Widyawati
Universitas Sumatera Utara
DAFTAR ISI
Halaman
ABSTRAK ........................................................................................................
i
ABSTRACT .....................................................................................................
ii
RIWAYAT HIDUP .........................................................................................
iii
KATA PENGANTAR ....................................................................................
iv
DAFTAR ISI ....................................................................................................
vi
DAFTAR TABEL ...........................................................................................
viii
DAFTAR GAMBAR ......................................................................................
ix
DAFTAR LAMPIRAN ..................................................................................
x
PENDAHULUAN
Latar Belakang ........................................................................................
Perumusan Masalah ................................................................................
Kerangka Pemikiran ...............................................................................
Tujuan Penelitian ....................................................................................
Manfaat Penelitian ..................................................................................
1
2
3
4
4
TINJAUAN PUSTAKA
Ikan Lele Dumbo (Clarias gariepinus ) .................................................
Teknologi Transgenesis ..........................................................................
Polymerase Chain Reaction (PCR) ......................................................
Perilaku Predator .....................................................................................
5
6
8
10
METODE PENELITIAN
Waktu dan Tempat Penelitian .................................................................
Alat dan Bahan ........................................................................................
Pemeliharaan Benih ...........................................................................
Deteksi Transgen Ph GH ...................................................................
a. Ekstraksi DNA .....................................................................
b. Amplifikasi PCR ..................................................................
c. Elektroforesis ........................................................................
Rancangan Percobaan .............................................................................
Prosedur Penelitian .................................................................................
Pemeliharaan Benih ...........................................................................
a. Hewan Uji .............................................................................
b. Pengujian Perilaku Predator dan Anti-Predator .................
12
12
12
12
12
13
13
14
14
14
14
15
Universitas Sumatera Utara
c. Parameter Pertumbuhan .......................................................
1. Pertumbuhan Panjang ......................................................
2. Pertumbuhan Bobot ........................................................
3. Tingkat Kelangsungan Hidup ........................................
d. Kualitas Air ...........................................................................
e. Analisis Data ........................................................................
Deteksi Transgen Ph GH ...................................................................
a. Hewan Uji ............................................................................
b. Ekstraksi DNA .....................................................................
c. Amplifikasi PCR ..................................................................
d. Elektroforesis .......................................................................
e. Analisis Data ........................................................................
15
15
15
16
16
17
17
17
17
18
18
19
HASIL DAN PEMBAHASAN
Hasil .........................................................................................................
Pengujian Perilaku Predator dan Anti-Predator ...............................
Kualitas Air ........................................................................................
Pembahasan .............................................................................................
Pengujian Perilaku Predator dan Anti-Predator ...............................
Kualitas Air ........................................................................................
20
20
25
26
26
29
KESIMPULAN DAN SARAN
Kesimpulan ..............................................................................................
Saran ........................................................................................................
31
31
DAFTAR PUSTAKA
LAMPIRAN
Universitas Sumatera Utara
DAFTAR TABEL
No.
1.
2.
3.
Teks
Halaman
Persentase Deteksi Transgen Benih Ikan Lele Dumbo Transgenik F3
dan Non-Transgenik ..................................................................................
21
Persentase Deteksi Transgen Predator pada Perlakuan Pengujian
Perilaku Predator dan Anti-Predator ........................................................
22
Data Kisaran Kualitas Air pada Pengujian Perilaku Predator dan AntiPredator ......................................................................................................
26
Universitas Sumatera Utara
DAFTAR GAMBAR
No.
Teks
Halaman
1.
Kerangka Pemikiran Penelitian ................................................................
4
2.
Deteksi Transgen pada Benih Ikan Lele Dumbo Transgenik F3
(Nomor 64-67, 1-2 dan 5-6 = Sampel Benih Ikan Lele Dumbo
Transgenik F3; Nomor 68-69, dan 3-4 = Sampel Predator; M adalah
Marker DNA (100 - 3.000 bp) (Vivantis); Tanda (+) adalah Kontrol
Positif (pCcBA-Ph GH) .............................................................................
20
Deteksi Transgen pada Benih Ikan Lele Dumbo Non-Transgenik
(Nomor, 89-90 dan 33-35 = Sampel Benih Ikan Lele Dumbo NonTransgenik; Nomor 87-88 dan 36-37 = Sampel Predator; M adalah
Marker DNA (100 - 3.000 bp) (Vivantis); Tanda (+) adalah Kontrol
Positif (pCcBA-Ph GH) .............................................................................
21
4.
Pertumbuhan Panjang Benih Ikan Lele Dumbo Transgenik F3 .............
22
5.
Pertumbuhan Panjang Benih Ikan Lele Dumbo Non-Transgenik ..........
23
6.
Pertumbuhan Bobot Benih Ikan Lele Dumbo Transgenik F3 ................
24
7.
Pertumbuhan Bobot Benih Ikan Lele Dumbo Non-Transgenik .............
24
8.
Tingkat Kelangsungan Hidup Benih Ikan Lele Dumbo Transgenik F3
dan Ikan Lele Dumbo Non-Transgenik pada Pengujian Perilaku
Predator dan Anti-Predator .......................................................................
25
3.
Universitas Sumatera Utara
DAFTAR LAMPIRAN
No.
Teks
Halaman
1.
Pemeliharaan Benih ................................................................................
36
2.
Prosedur Kerja ........................................................................................
37
3.
Hasil Deteksi Transgen Awal Benih Ikan Lele Dumbo Transgenik
F3 dan Non-Transgenik pada Pengujian Perilaku Predator dan AntiPredator ...................................................................................................
38
Hasil Deteksi Transgen Akhir Benih Ikan Lele Dumbo Transgenik
F3 dan Non-Transgenik pada Pengujian Perilaku Predator dan AntiPredator ...................................................................................................
40
Data Sampling Awal: Panjang dan Bobot Benih Ikan Lele Dumbo
Transgenik F3 dan Non-Transgenik ......................................................
42
Data Sampling Akhir: Panjang dan Bobot Benih Ikan Lele Dumbo
Transgenik F3 dan Non-Transgenik .....................................................
43
7.
Data Panjang dan Bobot Predator Ikan Lele Dumbo Transgenik F3 ..
45
8.
Data Panjang dan Bobot Predator Ikan Lele Dumbo Non-Transgenik
46
9.
Data Tingkat Kelangsungan Hidup Benih Ikan Lele Dumbo
Transgenik F3 dan Non-Transgenik .....................................................
47
10. Data Kualitas Air ....................................................................................
48
11. Data Analisis Sidik Ragam Parameter Pertumbuhan Benih Ikan Lele
Dumbo Transgenik F3 dan Non-Transgenik pada Pengujian Perilaku
Predator dan Anti-Predator ....................................................................
50
4.
5.
6.
Universitas Sumatera Utara