Pola Elektroforesis Protein Globulin 7S dan 11S dari Kacang Komak (Lablab purpureus (L.) sweet)

POLA ELEKTROFORESIS PROTEN GLOBULN 7S DN llS
DARI KACANG KOMAK (Lab/ab purpureus (L.) swee)

OIeh
SITIKHODIJAH
F02498020

2003
FAK ULTAS TEK NOLOGIPE RT�N
N STITUT PERTANIAN BOGOR
BOGOR

POLA ELEKTROFORESISPROTEIN GLOBULIN 7S DAN lIS
DAR! KACANG KOMAK

(Lablab pupureus (L.) sweel)

meh
SITI KIIODIJAH
F02498020


SIPSI

Sebagai salah satu syarat memperoleh gelar
SARJANA TEKNOLOGIPERTANAIAN
Pada JURUSAN TEKNOLOGIPANGAN DAN GIZI
Fakultas TeknologiPertanian
InstitutPertanian Bogor

2003
FAKULTAS TEKNOLOGIPERT�
INSTITUTPERT� BOGOR
BOGOR

Siti Khodijah. F02498020. Pola Elektroforesis Protein Globulin 78 dan lIS dari
Kacang Komak (Lab/ab
Arif Hatoyo. 2003.

purpureus (L.) weet). Dibawah bimbingan Oahul Syah dan

RN GKASAN


Metode elektroforesis digunakan secara luas dalam karakterisasi protein,
salah satunya adalah penentuan berat molekul protein. Metode yang dilakukan adalah
8DSMPAGE untuk mengetahui berat molekul subunit-subunit protein dan metode
NativeMPAGE untuk mengetahui berat molekul protein alaminya. Perbedaan metode
SOS-PAGE dengan Native-PAGE terletak pada perlakuan sampel yaitu mengalami
denaturasi pada 8DS-PAGE dan tidak mengalami denaturasi pada metode NativeM
PAGE. Perbedaan lainnya adalah penggunaan konsentrasi akrilamid dalam gel.
Umumnya Native-PAGE menggunakan konsentrasi akrilamid yang lebih kecil dari
SDS-PAGE agar pori gel yang terbentuk bran bessr. Hal ini disebabkan karena
protein yang dipisahkan berukuran besar.
Hasil yang diperoleh menunjukkan bahwa globulin 78 koak DL-40
memiliki berat molekul sekitar 183 kOa. Diduga protein alami tersebut memiliki
kompleks .'31, a�, aa'p, alP, ala', dan U3. Berat molekul subunit a, a' dan 3
secara but-turut 64, 57 dan 41 kDa. Beitn pula halnya dengan koak DL-58,
protein alami globulin 78 mei berat molekul 175 kOa, yang diduga memiliki
kompleks a'31,

.Jh. aa'3, al3,


ala', dan

.3.

Berat molekul subunit penyusunnya

tidak jauh berbeda dengan kok DL-58 yaitu snbnnit a

3

=



64 kDa, a'



58 kDa dan


41 kOa. Dari konformasi dugaan tesebut, konformasi yang paling mungkin

adalah a,a' untok kok DL-40 dan konformasi a,� untok kok DL-58.
Globulin liS kok DL-40 mei konformasi dugaan adalah (AlB I)',
(AlB,)" (A,BI). dan (A,B,). dengan berat molekol but-tut adalah 3\2, 288,
35 kDa,
252 dan 228 kDa. Subunit penyusnn globulin liS koak DL-40 adalah Al
A,
25 kDa, BI
17 kDa dan B,
\3 kDa. Pada kok DL-58 konformasi yang
diduga saa seperti kok D-58 dngan berat molekul yang berbeda yaitu









but-turut 312, 282, 264 n 234 kDa. Subunit penyusnnnya mei berat
molekol Al �35 kDa, A,



27 kDa, BI



17 kDa dan B,



12 kDa. Konformasi yang

paling mungkin dari konformai dugaan terebut saa untok kok DL-40 dan DL58 yaitu (A,BI).,
Dapat disiupulkan bahwa globulin 7S n IIS dari kacang kok memiliki
pola elekroforesis yang mirip dengan kdelai l i dapat dilihat dari konformasi
alami protein yang saa speri kdelai. Dengan demikian kacang koak memiliki
potnsi untuk menggantikan kedelai Naun perlu adnya karakterisasi protein yang

lebih luas baik meliputi siat molekuler lainnya aupun sifat fungsional, sehingga
dapat dijadikan saran untok aplikasi di indusri pangan.

INSTITUTPERTANIAN BOGOR
FAKULTAS TENOLOGIPERTANIAN

POLA ELEKTROFORESISPROTEN GLOBULN 7S DAN 11S
DARI KACANG KOMAK (Lahab pupures L.) wee)

SIPSI
Sebagai salah satu syarat memperoleh gelar
SARJANA TEKNOLOGIPERTANAIAN
Pada JURUSAN TENOLOGIPANGAN DAN GIZI
Fakultas TeknoloiPertanian
InsitutPertanian Bogor

OIeb
SITI IIODIJAII
F02498020


Dilabirkan pada tanggal14 Agustus 1979
di Majalengka

Tanggal Lulus :

Maret 2003

Jr. ArifHartoyo. MSi.

Dr. Jr. nahrul Syab. MSc.

DosenPembimbing II

Dosen Pembimbing I

KATAPENGANTAR

Aku bersaksi hahwa tiada Tuhan selain Allah SWT dan Muhammad adalah
utusan-Nya. Alhamdulillab 1 Tiada kata yang paotas diungkapkan selain pujian dan
Sy>IT pada Allah atas nikmat dan karunia-Nya penulis dapat menyelesaikan tugas

akhir ini dengan lao car.
Dalam penyelesaian tugas akhlr ini penulis mendapatkan bautuan yang sangat
berharga dari berbagai pihak. Oleh karena u perkenankan penulis menyampaikan
ucapan terima kasih kepada :
l.

Bapak r. . Dahrul Syab, MSc. setaku Dosen Pembimbing I atas kesabaran
dalam membimbing penulis selama masa studi di PG dan penyelesaian tugas
akhir ini.

2.

Bapak r. f Hartoyo, Mi. selaku osn Pembimbing n atas kesabaran dalam
membimbing penulis selama penyelesaian tugas akhir ini.

3.

Bapak r. r. Suiyono, MAppSc. selaku dosen penguji yang telah meluangkan
waktunya.


4.

Ayah (AIm) (Semoga kelak Allah mempertemukan kami dalam kenikmatan-Nya)
dan Thu yang telah membesarkan dan mendidik dengan cinta dan kasih sayang
serta kakak-kakak tercinta (C'Yuyun, A'Yayan, C'Yiyin, C'Yeyen, A'Yoyon,
C'Enday dan C'Ai) yang telah memberikan perhatian dan dukungan. Tak lupa
kakak-kakak ipar (A'ung, C'Euis, K'Den� M'Madya, A'Lukman dan
K'Topik) n keponakan-keponakan yang tak dpat disebutkan satu persatu.

5,

Teh Yen yang telah meluangkan waktu mendampngi "ujian" dan r. Tauhid
atas pinjaman bukunya.

6.

Tean-tenan di QUTota A'yun dan Mbak atas kbersamaan yang indah selama
ini.

7.


Pak Wahid, Pak Rozak dan laboran-Iaboran yang lain atas bantuannya.

8.

Mbak Eno, Mas Hotib, Mas Agus, Mbak Vta, Nina dan i atas bantuan yang
sangat berharga.

9.

Sahabat-sahabat dekat Riana, , Nur, Yuliawati, Ira, Het� Et� Tet� E�
Eming, Atik, Sima, Eno, n k, atas pnnnya.

10. Tintin, Sunny, Astan, tean-ten i Lab Biokim, Yuli, Tika, Susi, teman­

tnan Kost Teratai (Nope, , Uri, Vivit, Niha, Rie, Aniah dan Ina), Teh Cuen,
Ucu, kelompok praktikum 35 (Bet� Yulia� Dni), kelompok praktikum 36
(Anis, Bahtiar, Nanang, Opk) dan tean-tean di G 3S dan 36 yang tak dapat
disebutkan satu persatu.
Penulis menyadari dalam penulisan kripsi ini masih jauh dari sempuma.

Oleh karena itu pnulis mngharapkan kritik dan saran dari berbagai pihak.

Bogor,

Maret 2003

Penulis

\I

lSI

DATAR

Halaman
KATA PENGANTAR

. . ..................... . . . . . . . . . . . . . . . . .......................................... .

DAFTAR ISI. .. ... ..... . ...... ........ ....................... .................................

iii

DAFTAR TABEL. ..................... ....................... ............ .....................

v

.

.

..

.... ........... .... .. .. ....... ..........

DAFT AR GAMBAR.......................

..

...

VI

.

DAFT AR LAPRAN. ................. . ................................. .............. .
I

PENDAHULUAN. ............... ........... ..............................................

1

B. TUJUAN PENELITIAN. . . .... . . . . . ............ .......

....... ........

2

TINJAUAN PUSTAKA...................................... ........................ ..... .

3

..

...

.

.

......

.

3

B. GLOBULN 7S DAN lIS...........................................................

5

C. ELEKTROFORESIS DALAM ANALISIS PROTEN. ...............

8

A. KACANG KOMAK.........

l.

.

A. LATARBELAKANG. ...................................................... ..........
.

I.

VII

...

..... ..... . ...... . . . . . . ............. . ..
..

.

.

.

..

.

.

..

.

..

1.

Elektroforesis. . . . . ... . . ,......................................................

8

2.

Elektroforesis Gel Poliakrilamid (PAGE). ..... .

...... . .........

9

3.

SDS-PAGE. .... . . .... . .......... . . . .... ..... .. ....... . .. . .........

13

4.

Nativ-PAGE. ............. .........................................................

14

5.

Pemaan Protein. . . ...... .

..

.

.

.

..

.

.

..

.

..

.

.

.

.

...

....

.

.
.

.

.

..

.

..... .. .. . ... ......... .

15

BAHAN DAN ETODOLOGI PENELTIAN. .............................. .

17

A. BAHAN DAN ALAT. .... . . . .. ..... . . .. .. . . .... . . .... ............ .

..

17

B. ETODE PENELITIAN. ... . .... ... ... .... ... ... . ... . . .. . . . . . ...

.

17

1.

Pnelitian Pendahuluan. '" ......................... ',.........................

17

2.

Pnelitian Utama. ... .... . .............. ....... .. .... . ..... . .. . ......... ....

18

a. Pembuatan serating gel. ................................................

18

h. Pembuatan stacing gel. ........... .... .... . ... ........... ... . . ...

19

Preparasi dan pemasukan sampel .............................. .......

19

d. Running eletroforesis (pemisahan proten). . ............. . ..

20

e. Pewamaan gel.................... ........ ......................................

20

f.

.............

20

g. Perhitungan berat moleul. ...............................................

21

.

.

.

.

.

_ , ........... '

.

..

.

.

.

.

.

.

, ........

.

.

.

.

.

.

.

.

.

...

.

.

.

.

.

.

...

..

.

.

....

.

..

..

.

.

.

..

c.

.

.

.

.

.

.

Pnghilangan wama. ...... . .. . ............ ... ....
.

iii

..

.

.

.

.

.

.

........

.

..

..

.

h. Kesalahan absolut penentuan berat molekul dengan
menggunakan elektroforesis. .............................
IV

v.

21

HASTL DAN PEBAHASAN. ......................................

22

A SDS-PAGE. ....................... ..........................................

22

B. NATTY.E-PAGE............................................................ .............

28

C. Konformasi Alami Globulin 78 dan l I S Kacang Konak. ...........

33

KESMPULAN. ...............................................................................

37

A. Kesimpulan. .................................................................................

37

B. Saran .................................. .........................................................

38

DAFTAR PUSTAKA.................................................................................

39

LPN.................................................................................................

42

IV

DAFfAR TABEL

Halaman
Tabel 1.

Komposisi kimia kacang komak. ..................................................

4

Tabel 2.

Komposisi a53m amino kacang koak..........................................

4

Tabel 3.

Komposisi separating

Tahel 4.

Komposisi stacking

Tabe
1 5.

Konsentrasi akrilamid uotuk pemisahan protein pada berat

gel elektroforesis. ......................................

18

gel elektroforesis. .................... ......................

18

molekul tertentu......................................... ...................................
Tabe16.

Hubungan f dengan log BM pada konsentrasi
sampel 69.58 �/sumur............... ..............................................

Tabel 7.

..........................................................................

26

Berat molekul subunit-subunt protein globulin 75
pada kedelai..................................................................................

Tabel9.

24

Referensi berat molekul subunit protein globulin 7S
dan II S kedelai

Tabe1 8,

23

26

Berat molekul subunit-subwtit protein globulin 7S
pada komak . .................. . .........................................................
"

.

.

27

Tabel lO. Berat molekul subunit-subunit protein globulin 11 S
pada kedelai...............................................................................
Tabeil l . Berat molekul subunit-subwlit protein globulin lIS
pada koak . .................... . ................................. ......................

28

28

Tabel12. Hubungan f dengan log BM pada konsentrasi 30
amid 6 %. ................... .........................................................

30

Tabel13. Berat molekul protein alami (native) globulin 7S dan lIS. ...........

32

.

Tabel14. Referensi berat molekul protein alami (native) globulin 75
dan lIS kedelai. ...........................................................................

33

Tabel15. Konfonasi dugaan globulin 7S pada komak. ...............................

34

Tabel16 . Konfonasi dugaan globulin lIS..................................................

35

v

DATAR GAM BAR

Halaman
Gambar l . Kacang konak DL-40 dan DL-58................................................

3

Gambar 2. Mekanisme pembentukan poliakrilamid. .....................................

10

Gambar 3. Elektroforeram SDS-PAGE pada konsentrasi sampel
69.58 �g!sumur . ........................................................................

23

Gambar 4. KUlva standar SDS-PAGE dengan konsentrasi sampel
69.58 �g!sumur. ..........................................................................

24

Gambar 5, Elektroforeram Native-PAGE dengan konsentrasi
akrilamid 60/0...............................................................................

30

Gambar 6. Kurva standar Native-PAGE pada konsentrasi
akrlamid 6 %..............................................................................

31

Gambar 7. Model konformasi globulin 7S t-congycinin) pada
Koak AO dan Kok DL-58.... ...........................................

36

Gambar 8. Model konformasi globulin liS (glycinin) pada
kok. ........................................................................................

I

36