III. HASIL PEMBAHASAN
3.1. Hasil
Hasil Isolasi Bakteri Agensia Penyebab Vibriosis Pada Udang Vannamei Litopenaeus vannamei di Pertambakan Kabupaten Kendal
No Warna Koloni
Bentuk koloni
Asal isolat Karakteristik
Koloni Kode
Isolat 1
Kuning Bulat
Hepatopankreas Cembung
JTV01 2
Kuning Pekat Bulat
Hepatopankreas Cembung
JTV02 3
Kuning Susu Bulat
Hepatopankreas Rata
JTV03 4
Kuning Pekat Bulat
Lonjong Hepatopankreas
Cembung JTV04
5 Kuning Pekat
Lonjong Hepatopankreas
Cembung JTV05
6 Kuning Muda
Bulat Hepatopankreas
Cembung JTV06
7 Kuning susu
Bulat Hepatopankreas
Cembung JTV07
8 Kuning transparan
Bulat Hepatopankreas
Cembung JTV08
9 Hitam ring kuning
Bulat Hepatopankreas
Cembung JTV09
10 Kuning Muda
Bulat Hepatopankreas
Cembung JTV10
11 Kuning
Bulat Hepatopankreas
Cembung JTV11
12 Kuning Bening
Tidak beraturan
Hepatopankreas Rata dan Halus
JTV12 13
Kuning Bening Bulat
Hepatopankreas Cembung
JTV13 14
Putih susu Tidak
beraturan Hepatopankreas
Cembung JTV14
15 Putih
Tidak beraturan
Hepatopankreas Kasar
JTV15 16
Kuning Pekat Bulat
Hepatopankreas Kasar
JTV16 17
Kuning muda Lonjong
Hepatopankreas Cekung
JTV17 18
Kuning Pekat Bulat
Hepatopankreas Rata
JTV18 19
Kuning muda Tidak
beraturan Hepatopankreas
Kasar JTV19
Dari ke 19 isolat yang menjadi causative agent vibriosis pada udang
vaname terdapat tiga bentuk koloni yaitu bulat, lonjong, dan tidak beraturan,
sedangkan warna koloni terdapat 8 warna yaitu kuning transparan, hitam ring
kuning, kuning muda, kuning, kuning bening, putih susu, putih, dan kuning
pekat.
Hasil Isolasi Bakteri Agensia Penyebab Vibriosis Pada Udang Windu Penaeus monodon di Pertambakan Wakak, Kabupaten Kendal
No Warna Koloni
Bentuk koloni Asal isolat
Karakteristik Koloni
Kode Isolat 1
Hijau Bulat
Hepatopankreas Cembung
JTW1 2
Kuning Bulat
Hepatopankreas Cembung
JTW2 3
Hitam Tak Beraturan
Hepatopankreas Kasar
JTW3 4
Kuning Tak Beraturan
Hepatopankreas Kasar
JTW4 5
Kuning Bening Bulat
Hepatopankreas Rata
JTW5 6
Kuning Bulat
Hepatopankreas Cembung
JTW6 7
Kuning Susu Bulat
Hepatopankreas Cembung
JTW7 8
Kuning Pekat Bulat
Hepatopankreas Rata
JTW8 9
Hijau pekat Bulat
Hepatopankreas Cembung
JTW9 10
Hitam Tidak Beraturan
Hepatopankreas Cembung
JTW10 11
Kuning Bulat
Hepatopankreas Cembung
JTW11 12
Hijau Muda Lonjong
Hepatopankreas Cembung
JTW12 13
Kuning Susu Tak Beraturan
Hepatopankreas Kasar
JTW13 14
Hitam Bulat
Hepatopankreas Rata
JTW14 15
Hijau Lonjong
Hepatopankreas Cembung
JTW15 16
Kuning Tak Beraturan
Hepatopankreas Rata
JTW16 17
Hitam Tak Beraturan
Hepatopankreas Kasar
JTW17 18
Kuning Lonjong
Hepatopankreas Cembung
JTW18 19
Kuning Bening Lonjong
Hepatopankreas Cembung
JTW19 20
21 22
Kuning Hitam
Kuning Bening Bulat
Lonjong Tak Beraturan
Hepatopankreas Hepatopankreas
Hepatopankreas Rata
Cembung Rata
JTW20 JTW21
JTW22
Dari ke 22 isolat agensia penyebab vibriosis pada udang windu terdapat tiga
bentuk koloni yaitu bulat, tidak beraturan, dan lonjong sedangkan warna koloni
terdapat 7 warna yaitu hijau, kuning, hitam, kuning bening, kuning susu, kuning
pekat, dan hijau pekat.
Repetitive sequence-based Polymerase Chain Reaction rep-PCR Isolat Vibrio
pada Udang Vannamei Hasil Rep-PCR diperoleh 19 isolat
vibrio. Hasil amplifikasi DNA dengan Repetitive sequence-based Polymerase
Chain Reaction rep-PCR isolat JTV 1 sampai dengan JTV 12 disajikan pada
gambar 5. Hasil Rep-PCR menunjukkan bahwa
hasil amplifikasi
DNA menggunakan
rep-PCR mampu
menghasilkan profil fingerprint yang
kompleks dan
spesifik bagi
masing-masing isolat
bakteri. Pada
gambar 5 menunjukkan bahwa isolat JTV 1, JTV 2, JTV 4, JTV 5, JTV 7, JTV 8,
JTV 9, JTV 10, JTV 11, JTV 12, memiliki profil DNA band yang mirip, terlihat pada
bp 1000, 850, 750, 700 dan 650, memiliki lima molekul DNA yang sama, sedangkan
untuk isolat JTV 3 profil DNA band nya mirip dengan profil DNA band JTV 6,
terlihat pada bp 1050, 900, 850, dan 800, memiliki 4 molekul DNA yang sama.
Gambar 5. Hasil Elektroforesis rep-PCR.
Keterangan : M: DNA marker, m: JTV 13 , n: JTV 14, o: JTV 15, p: JTV 16, q:
JTV 17, r: JTV 18, s: JTV 19.
Gambar 4. Hasil Elektroforesis rep-PCR. Keterangan : M: DNA marker, a: JTV 1 ,
b: JTV 2, c: JTV 3, d: JTV 4, e: JTV 5, f: JTV 6, g: JTV 7, h: JTV 8, i: JTV 9, j: JTV